CDT) De La Tuberculose À Madagascar
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UNIVERSITE D’ANTANANARIVO Domaine : Sciences et Technologies Mention : Physique et Applications MEMOIRE DE FIN D’ETUDE POUR L’OBTENTION DU DIPLOME DE MASTER EN SCIENCES ET TECHNIQUES EN GEOPHYSIQUE ET GEOMATIQUE Option : Géomatique Année Universitaire : 2016 - 2017 SIG, outil d’aide à la décision pour le choix d’implantation de nouveaux Centres de Diagnostic et Traitement (CDT) de la tuberculose à Madagascar Présenté le 22 Mars 2019 par : RAVAOARIMANGA Masiarivony Devant le membre du jury composé de : Président : GARO JOELSON Sebille, Maître de Conférences Rapporteur : RAKOTOMANANA Fanjasoa, Docteur, Chargée de recherche Examinateur : RAZAFINDRAKOTO Boni Gauthier, Maître de conférences 1 UNIVERSITE D’ANTANANARIVO Domaine : Sciences et Technologies Mention : Physique et Applications MEMOIRE DE FIN D’ETUDE POUR L’OBTENTION DU DIPLOME DE MASTER EN SCIENCES ET TECHNIQUES EN GEOPHYSIQUE ET GEOMATIQUE Option : Géomatique Année Universitaire : 2016 - 2017 SIG, outil d’aide à la décision pour le choix d’implantation de nouveaux Centres de Diagnostic et Traitement (CDT) de la tuberculose à Madagascar Présenté le 22 Mars 2019 par : RAVAOARIMANGA Masiarivony Devant le membre du jury composé de : Président : GARO JOELSON Sebille, Maître de Conférences Rapporteur : RAKOTOMANANA Fanjasoa, Docteur, Chargée de recherche Examinateur : RAZAFINDRAKOTO Boni Gauthier, Maître de conférences 2 i REMERCIEMENTS Je tiens à exprimer mes plus profonds remerciements à DIEU Tout Puissant qui m’a donné la santé, la force, le courage et la bénédiction durant le cursus afin que je puisse réaliser ce mémoire. Je suis profondément reconnaissante à la Direction de l’Institut Pasteur de Madagascar (IPM) d’avoir bien voulu m’accueillir dans leur établissement. Je tiens à exprimer toute ma reconnaissance et toute ma gratitude à : ➢ Docteur Laurence Baril, Chef de l’unité de l’Epidémiologie et de Recherche Clinique de l’IPM, qui m’a permis de faire mon stage dans son unité. ➢ Docteur RAKOTOSAMIMANANA Niaina, Chef de l’unité des Mycobactéries de l’IPM et Chef de service de l’unité Mycobactéries ; et Docteur RAHERISON Mamy Serge, Chef de Service de laboratoire des Mycobactéries et Programme National de Lutte contre la Tuberculose Madagascar, qui m’a accueillie avec bienveillance et amabilité à l’unité des Mycobactéries pour mener ce travail. Je tiens à exprimer mes plus profondes reconnaissances à : ➢ Monsieur RAHERIMANDIMBY Marson, Professeur Titulaire, Doyen de la Faculté des Sciences de l’Université d’Antananarivo, qui m’a permis de poursuivre mes études au sein de la Faculté des Sciences et d’avoir autorisé la présentation de ce mémoire ; ➢ Monsieur RAKOTONDRAMIARANA Hery Tiana, Maître de Conférences, Habilité Dirigé de Recherche (HDR), Responsable de la mention Physique et Applications, d’avoir accepté la présente mémoire au sein de la mention ; ➢ Monsieur GARO JOELSON Sebille, Maître de Conférences, Responsable de la Formation en Sciences et Techniques en Géophysique et Géomatique (MSTGG), qui nous fait honneur de présider les membres de Jury de cette soutenance et qui n’a pas hésité aussi à nous fournir toutes les alternatives d’approfondissement de connaissance durant ce parcours à travers les différents types de cours dispensés ; i ➢ Madame RAKOTOMANANA Fanjasoa, Docteur en Médecine, Docteur en Sciences de l’Information Géographique, Chargée de recherche, responsable du groupe Santé et GEOmatique (SaGEO) au sein de l’Unité d’Epidémiologie et de Recherche Clinique de l’IPM, et qui était aussi l’un de nos professeurs durant cette année de formation ; qui malgré ses différentes obligations, a bien voulu accepter de m’encadrer tout au long de l’élaboration de ce mémoire. Je l’en remercie très vivement ; ➢ Monsieur RAZAFINDRAKOTO Boni Gauthier, Maître de Conférences, qui a aimablement accepté de siéger parmi les membres du jury pour évaluer ce travail et pour apporter des critiques constructives y relatives ; Mes vifs remerciements à tous les enseignants de MSTGG qui se sont voués à transmettre leurs connaissances et leurs expériences et à veiller au bon déroulement de la formation ; Toute ma gratitude envers ma famille qui n’a pas cessé de m’encourager et de me soutenir tout au long de mes années d’études ; Un grand merci également à tous ceux qui, de près ou de loin qui ont contribué à l’élaboration de ce travail. ii SOMMAIRE LISTE DES FIGURES LISTE DES TABLEAUX LISTE DES ANNEXES LISTE DES ABREVIATIONS INTRODUCTION CHAPITRE I : GENERALITES I.1 Généralités sur la tuberculose I.2 Accessibilité aux soins I.3 Sciences de l’Information Géographique CHAPITRE II : METHODOLOGIE II.1 Présentation de la zone d’étude II.2 Matériels et méthodes CHAPITRE III : RESULTATS III.1 Carte de la localisation des CDT de tuberculose à Madagascar III.2 Carte de la distribution des CDT III.3 Zones dépourvues de CDT : districts d’Isandra et de Lalangina III.4 FS éligibles en CDT dans les districts d’Isandra et de Lalangina III.5 Résultat sur la classification d’image III.6 Résultats sur l’analyse de l’accessibilité physique CHAPITRE IV : DISCUSSIONS ET RECOMMANDATIONS IV.1 Sur la distribution des CDT IV.2 Sur la classification d’image IV.3 Sur l’analyse de l’accessibilité physique CONCLUSION ANNEXES iii LISTE DES FIGURES Figure 1: Carte de la localisation de Madagascar .................................................................... 12 Figure 2: Démarche à suivre pour la réalisation de l’étude ..................................................... 28 Figure 3: Carte de la localisation des CDT de tuberculose à Madagascar ............................... 29 Figure 4: Cartes de couverture en CDT: 4a) Par rapport à la norme internationale et 4b) Par rapport à la moyenne nationale ............................................................................................... 31 Figure 5: Localisation des Districts d’Isandra et Lalangina, zones dépourvues de CDT ........... 32 Figure 6: Répartition des FS dans les Districts d’Isandra et de Lalangina ................................ 33 Figure 7: Carte de l’occupation de sol pour les districts d’Isandra et de Lalangina................. 35 Figure 8: Cartes d’occupation de sol combinée : 8a) District d’Isandra, 8b) District de Lalangina ................................................................................................................................... 38 Figure 9: Couverture géographique des CSB dans le district d’Isandra: pourcentage de population desservie par les CSB en cas d’accréditation en CDT, 9a) Pour un déplacement à pied et 9b) Pour un déplacement en véhicule motorisé ......................................................... 40 Figure 10: Couverture géographique des CSB dans le district de Lalangina: pourcentage de population desservie par les CSB en cas d’accréditation en CDT, 10a) Pour un déplacement à pied et 10b) Pour un déplacement en véhicule motorisé ....................................................... 42 Figure 11: Cartes de temps de trajet pour un scénario à pied dans le district d’Isandra: 11a) Temps de trajet pour rejoindre chaque CSB, 11b) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Ambondrona et 11c) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Ambalamidera .................... 44 Figure 12: Cartes de temps de trajet pour un scénario de déplacement en véhicule motorisé dans le district d’Isandra: 12a) Temps de trajet pour rejoindre chaque CSB, 12b) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Ambondrona et 12c) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Ambalamidera ....................................................................................................................... 46 Figure 13: Cartes de temps de trajet pour un scénario de déplacement à pied dans le district de Lalangina : 13a) Temps de trajet pour rejoindre chaque CSB, 13b) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Ambatovaky et 13c) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Andranolava II ....... 48 Figure 14: Cartes de temps de trajet pour un scénario de déplacement en véhicule motorisé dans le district de Lalangina : 14a) Temps de trajet pour rejoindre chaque CSB, 14b) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Ambatovaky et 14c) Temps de trajet pour rejoindre le CSB d’Andranolava II ....................................................................................................................... 50 iv LISTE DES TABLEAUX Tableau 1: Matrice de confusion ........................................................................................................... 21 Tableau 2: Degré de signification du coefficient de Kappa ................................................................... 22 Tableau 3: Table de la classification de la couverture terrestre ........................................................... 25 Tableau 4: Scénario de déplacement à pied ......................................................................................... 26 Tableau 5: Scénario de déplacement motorisé ..................................................................................... 26 Tableau 6: Nombre de pixels pour chaque catégorie d’occupation de sol dans les zones d’entraînement et les zones test ........................................................................................................... 34 Tableau 7: Matrice de confusion de l’image classifiée montrant les erreurs de commission (EC) et d’omission (EO) ..................................................................................................................................... 36 v LISTE DES ANNEXES Annexe 1: Glossaires ..................................................................................................................