Isolement Et Caractérisation Des Saponosides De Plantes De La

Total Page:16

File Type:pdf, Size:1020Kb

Isolement Et Caractérisation Des Saponosides De Plantes De La Université de Bourgogne Ecole Doctorale E2S thèse de doctorat pour obtenir le grade de : DOCTEUR DE L’UNIVERSITÉ DE BOURGOGNE DISCIPLINE : PHARMACIE Spécialité : Pharmacognosie-Chimie des substances naturelles Présentée et soutenue publiquement le 8 Juin 2012 par : Gaoussou TIMITE TITRE : Isolement et caractérisation des saponosides de plantes de la famille des Alliaceae, caryophyllaceae et Polygalaceae et évaluation de leurs activités cytotoxiques sur cellules tumorales devant le jury composé de : Présidente : Pr. Françoise BEVALOT Université de Franche-Comté Rapporteur : Pr. Brigitte DEGUIN Université Paris Descartes Rapporteur : Pr. Elisabeth SEGUIN Université de Rouen Examinateur : Dr. Corinne GIRARD-THERNIER Université de Franche-Comté Directeur : Pr. Anne-Claire MITAINE-OFFER Université de Bourgogne Co-Encadrant : Pr. Marie-Aleth LACAILLE-DUBOIS Université de Bourgogne Année 2011-2012 Dédicaces Àmafamille Je dédie spécialement cette thèse à ma regrettée mère, Bakayoko Nohomoga,disparue trop tôt. Cette thèse représente donc l’aboutissement du soutien et des encouragements qu’elle m’a prodigués tout au long de ma scolarité. Qu’elle en soit remerciée par cette trop modeste dédicace. Mention spéciale à mon père Timité Sory pour sa patience, son soutien, ses conseils et surtout l’espoir et la confiance qu’il place en moi. Àmesfrèresetsœursettoutemafamillepourlapatienceetledévouementdontilsont fait preuve, je suis fière d’être de vous. Dédicace spéciale à mon cousin Timité Soualio surnommé VATIER,tonsoutienàtout point de vue et surtout financier a été déterminant dans la réalisation de cet objectif qui a toujours été le mien. Tu as participé à faire de moi ce que je suis aujourd’hui. Cela restera gravé à jamais dans ma mémoire, Merci. Àmesamisetautresconnaissances Àmesamis,Bakayoko Fatouma et Bakayoko Nogosotié,àlafamille Méité,jen’oublierai jamais les bons moments que nous avons passés ensemble depuis mon arrivée en France. Vous avez su à votre manière constituer une famille autour de moi. Vous m’avez affranchi de cette lourde charge qui est de vivre loin des siens. Quel bonheur ! Merci infiniment. Mention spéciale à Monsieur Binaté Abou ainsi que toute sa famille pour m’avoir hébergé et soutenu financièrement durant la période 2001-2007 à Abidjan. Si j’ai pu poursuivre mes études en France, c’est en grande partie grâce à vous, je vous remercie du fond du cœur. Très sincères remerciements à messieurs Soumahoro Karamoko, Bakayoko Losseni,vos soutiens financiers, vos encouragements durant mon cursus universitaire à Cocody (Abidjan) ont sans aucun doute contribué à la réussite de ce rêve, je vous dédie cette thèse. Enfin à toi Soumahoro Mémon, comment aurais-je pu terminer cette thèse sans tes efforts auprès du ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche scientifique ivoirien pour le renouvellement de ma bourse ? je te dois cette thèse. ii Remerciements Ce travail est le couronnement d’un processus ayant commencé en 2007/2008 grâce à l’appui des Professeurs Marie-Aleth Lacaille-Dubois (Directrice du laboratoire de Pharmacognosie et co-directeur de thèse) et Anne-Claire Mitaine-Offer (Directeur de thèse). Veuillez trouver ici l’expression de ma gratitude pour m’avoir accueilli au sein de votre laboratoire et de m’avoir donné ainsi l’opportunité d’inscription à l’Université de Bourgogne (UB). Soyez assuré de mon profond respect et de ma vive reconnaissance pour m’avoir fait bénéficier de votre expérience et de votre rigueur scientifique et professionnelle. Recevez ici mes sincères remerciements pour la confiance, les conseils que vous m’avez accordés tout au long de cette thèse. Merci également pour votre encadrement, votre disponibilité et votre gentillesse. Je n’oublie pas votre soutien moral qui m’a souvent aidé à remonter la pente dans les moments difficiles. J’exprime une grande admiration pour votre sens de travail bien fait. Je tiens enfin à remercier le laboratoire pour avoir financé en partie cette thèse, je suis reconnaissant de votre soutien durant toute la période qu’a duré la crise socio-politique dans mon pays la Côte d’Ivoire en 2010/2011. A vrai dire, je ne sais pas comment vous remercier pour tout ce que vous m’avez apporté, transmis et appris lors de cette thèse. Je remercie aussi les Professeurs Odile Chambin et Tan Kimny,tousdeuxmembresde mon comité de suivi de thèse. Ces derniers ont durant toute la durée de mon travail, établi chaque année un compte rendu exhaustif sur l’évolution de mes résultats. Ceci a permis de mettre en évidence les qualités scientifiques de mon travail. À Messieurs Jean-François Mirjolet et Olivier Duchamp de la société Oncodisign Bio- technology, j’adresse mes sincères remerciements pour leur collaboration dans la réalisation des tests de cytotoxicité. Aux Professeurs Brigitte Deguin, Elisabeth Seguin, Françoise Bevalot et au Docteur Corinne Girard,recevezmesremerciementspouravoiracceptéd’êtremembredecejury.Je vous adresse ma profonde reconnaissance pour vos remarques et conseils en vue d’améliorer ce manuscrit. Je tiens à remercier tout le personnel du laboratoire de pharmacognosie. iii Aux docteurs Nicolas Desbois et Marc Sautour,jevousremerciepourvotresoutienmoral, vos encouragements et conseils. Àmesamisetcollèguesduditlaboratoire,jeciteDebabrata Acharya, Olivier Noté, Guy Kougan, Jabrane Aymen, Manase Mahenina, Jens Linnek, Abdelmalek Rezgui, Elier Galarraga, Alida Pérez Colmenares, Bencharif Betina Soumeya,mercipour votre aide technique et scientifique et votre amitié. Au personnel technique, David Pertuit, Sandrine Pacquelet et Stephanie Masselot,mercipourvotrechaleureusecollaborationet votre aide technique. Mes remerciements vont à travers l’Université de Bourgogne au gouvernement et au peuple français qui contribuent ainsi au renforcement des capacités scientifiques et techniques des pays en développement. Je tiens vivement à remercier le gouvernement ivoirien àtraversleMinistère de l’en- seignement supérieur et de la recherche scientifique qui nous a octroyé la plus grande partie des moyens financiers nécessaires à notre formation. Àtousceuxquideprèsoudeloinontcontribuéàlaréalisationetaubondéroulementde cette thèse. Amonpèreetàmamère Amesfrèresetsœurs, et à tous mes amis iv Liste des Publications, Posters et Communication Orale Publications 1. G. Timité, A-C. Mitaine-Offer, T. Miyamoto, M. Ramezani, A. Rustaiyan, J-F. Mirjolet, O. Duchamp, M-A. Lacaille-Dubois Structure elucidation of new oleanane-type glycosides from three species of Acanthophyl- lum, Magnetic Resonance in Chemistry Volume 48, Issue 5, Page(s) :2237-2244 (2010). 2. G. Timité, A-C. Mitaine-Offer,T. Miyamoto, C. Tanaka, T. Paululat, C. De- laude, M-A. Lacaille-Dubois Presenegenin Glycosides from Securidaca welwitschii, Helvetica Chimica Acta, Volume 93, Issue 11, Page(s) :370-374 (2010). 3. G. Timité, A-C. Mitaine-Offer,T. Miyamoto, C. Tanaka, J-F. Mirjolet, O. Du- champ, M-A. Lacaille-Dubois Unusual oleanane-type saponins from Arenaria montana, Phytochemistry, Volume 72, Issue 6, Page(s) :503-507 (2011). 4. G. Timité, A-C. Mitaine-Offer,T. Miyamoto, C. Tanaka, J-F. Mirjolet, O. Du- champ, M-A. Lacaille-Dubois Structure and cytotoxicity of steroidal glycosides from Allium schoenoprasum, soumise à Food Chemistry. v Posters et Communication oral 1. 15e Forum des Jeunes Chercheurs, (Poster 1) Etude Phytochimique de deux espèces d’Acanthophyllum : Acanthophyllum sordidum et A. elatius,Dijon,25-26juin2009,France 2. 4th International Conference on Saponins, (Poster 2) Phytochemical study of Two species of Acanthophyllum : Acanthophyllum sordidum and A. elatius,Nancy,July9-11,2009,France 3. 9th International Symposium on Pharmaceutical Sciences, (Poster 3) Chemotaxonomic study of the Caryophyllaceae family : Saponins from Acanthophyllum sordidum and A. elatius,Ankara,June23-26,2009,Turkey 4. 16e forum des jeunes chercheurs, (Poster 4) Etude Chimiotaxonomique d’une espèce de Polygalaceae : Securidaca welwitschii,Besan- çon, 7-8 juin 2010, France 5. 58th International Congress and Annual Meeting of the Society for Medicinal Plant and Natural Product Research, (Poster 5) Chemotaxonomic study of the Polygalaceae family : saponins from Securidaca welwitschii, Berlin, Aug 29 - Sep 2, 2010, Germany 6. Colloque SAPONINA - utilisation des plantes à saponines dans l’agriculture et l’industrie, (Poster 6) Acylated saponins from Securidaca welwitschii, Chemillé, 13-14 Janvier 2011, France 7. 17e Forum des Jeunes Chercheurs, (Communication orale) Plantes des familles de Caryophyllaceae et Polygalaceae : Chimie extractive, chimie struc- turale et étude cytotoxique des saponinosides triterpéniques,Dijon,16-17juin2011,France vi Abréviations ADN Acide désoxyribonucléique APG Angiosperm Phylogeny Group CCM Chromatographie sur couche mince HPTLC High performance thin layer chromatography CHCl3 Chloroforme MeOH Méthanol AcOH Acide Acétique H2O Eau UV Ultraviolet VLC Chromatographie liquide sous vide MPLC Chromatographie liquide à moyenne pression HPLC Chromatographie liquide haute performance MS Spectrométrie de masse FAB Ionisation par bombardement d’atomes rapides RMN Résonance magnétique nucléaire RMN 1H Résonance magnétique nucléaire du proton RMN 13C Résonance magnétique nucléaire du carbone ppm Partie par million COSY COrrélation SpectroscopY TOCSY TOtal Correlation SpectroscopY ROESY Rotating-frame Overhauser SpectroscopY NOESY Nuclear Overhauser Effect SpectroscopY HSQC Heteronuclear Multiple Quantum Coherence HMBC Heteronuclear Multiple Bond Coherence DEPT Distortionless Enhancement by Polarization Transfer vii TMS Tétraméthylsilane
Recommended publications
  • Allium Macleanii Baker, 1883
    Allium macleanii Baker, 1883 Identifiants : 1573/allmac Association du Potager de mes/nos Rêves (https://lepotager-demesreves.fr) Fiche réalisée par Patrick Le Ménahèze Dernière modification le 30/09/2021 Classification phylogénétique : Clade : Angiospermes ; Clade : Monocotylédones ; Ordre : Asparagales ; Famille : Amaryllidaceae ; Classification/taxinomie traditionnelle : Règne : Plantae ; Sous-règne : Tracheobionta ; Division : Magnoliophyta ; Classe : Liliopsida ; Ordre : Liliales ; Famille : Amaryllidaceae ; Sous-famille : Allioideae ; Tribu : Allieae ; Genre : Allium ; Synonymes : x (=) basionym, Allium elatum Regel 1884 ; Nom(s) anglais, local(aux) et/ou international(aux) : Oriental royal Salep, royal salep , kabullök (sv) ; Note comestibilité : *** Rapport de consommation et comestibilité/consommabilité inférée (partie(s) utilisable(s) et usage(s) alimentaire(s) correspondant(s)) : Racine (bulbes : crus ou cuits [nourriture(dp*)µ/alimentµ27(+x) et/ou assaisonnement : aromate (fines-herbes et/ou{{{(dp*) condiment27(+x) aromatique{{{(dp*))]) et feuille (feuilles : idem bulbes|{{{(dp*)(27(+x)), ex. comme potherbe{{{(dp*)) comestibles.(1*) Les bulbes sont consommés crus ou cuits. Les feuilles sont consommées crues ou cuites. Les fleurs sont utilisées crues pour parfumer les salades Partie testée : bulbe{{{0(+x) (traduction automatique) Original : Bulb{{{0(+x) Taux d'humidité Énergie (kj) Énergie (kcal) Protéines (g) Pro- Vitamines C (mg) Fer (mg) Zinc (mg) vitamines A (µg) 0 0 0 0 0 0 0 (1*)Voir genre Allium pour les précautions à prendre (risques de confusion et possible toxicité à fortes doses).(1*)Voir genre Allium pour les précautions à prendre (risques de confusion et possible toxicité à fortes doses){{{(rp*). Note médicinale : ** Illustration(s) (photographie(s) et/ou dessin(s)): Page 1/3 Autres infos : Plante importante localement{{{27(+x).
    [Show full text]
  • (Curculigo Orchioides) and Salam (Eulophia Compestris) Madan B
    Int J Ayu Pharm Chem REVIEW ARTICLE www.ijapc.com e-ISSN 2350-0204 A Review Article on Species used as Musali (Curculigo orchioides) and Salam (Eulophia compestris) Madan B. Tonge* *Dept. of Dravyaguna, Govt. Ayurved College Nanded (MS), India Abstract In day to day practice when we see the market samples of Musali it creates confusion in mind; which type Musali is sold by the vendor. These days various species of plants are used as Musali in different parts of India. Traditionally, Salam and Salam panja are also used as Mushali. To rule out all these differences and arrive to a definite conclusion. This is an attempt to collect the referances from samhitas and nighantus about musali. Botanically classify the species which are used as musali. Describe all the species which are in use as musali in a systematic manner. Keywords Mushali, Shweta Musali, Salam, Talmuli Greentree Group Received 09/08/16 Accepted 29/08/16 Published 10/09/16 ________________________________________________________________________________________________________ Madan B Tonge 2016 Greentree Group © IJAPC Int J Ayu Pharm Chem 2016 Vol. 5 Issue 2 www.ijapc.com 283 [e ISSN 2350-0204] Int J Ayu Pharm Chem INTRODUCTION shwveta musali few species of asparagaceae The term musali is famous in traditional family are in use and also roots of salam Indian system of medicine. Medicine with mishri and salampanja mishri are used as musali name is known to many household in musali. The word mishri is derived from India. Most commonly used as a tonic, musali, so few people call it as salam aphrodisiac, rejuvenator for increasing musali, salam panja musali.
    [Show full text]
  • Synthesis of Cysteine Sulfoxides and Related Compounds Occurring in Wild Onions
    Synthesis of cysteine sulfoxides and related compounds occurring in wild onions Dissertation zur Erlangung des Doktorgrades der Naturwissenschaften (Dr. rer. nat.) dem Fachbereich Pharmazie der Philipps-Universität Marburg vorgelegt von Mohammad Sadegh Feizabad aus Teheran / Iran Marburg/Lahn, 2019 i Erstgutachter: Prof. Dr. Michael Keusgen Zweitgutachter: Prof. Dr. Frank Runkel Tag der Einreichung Promotion: 24.04.2019 Tag der mündlichen Promotion: 24.06.2019 ii Dedicated to my beloved parents and wife for their precious supports and gentle, who have inspired me and been the driving force throughout my life. iii Foreword The majority of the genus Allium species are known for their medicinal applications: for example, A. stipitatum shows antibiotic effects against Mycobacterium tuberculosis and some other Allium species exhibit antistaphylococcal effects. Furthermore, recent studies have provided evidence of various antifungal, antidiabetic, and anticancer effects of some Allium species. Allium is also well known in traditional medicine for its ability to cure various ailments such as wounds or acute and chronic bronchitis; additionally, alliums can be used as expectorants due to the presence of cysteine sulfoxide and its derivatives. Cysteine sulfoxides, which are some of the basic secondary compounds in Allium, have been addressed in various studies. Alliin, propiin, methin, marasmin, and thiosulfinate, all of which are alliinase substrates, are of particular interest because of their pharmaceutical effects. The enzymatic reaction that occurs during the formation of disulfides or thiosufinates results in various compounds that differ chemically, physically, and pharmaceutically.The cysteine sulfoxide recently investigated in A. giganteum, A. rarolininanum, A. rosenorum, and A. macleani species is the S-(pyrrolyl)cysteine S-oxide.
    [Show full text]
  • Tese Horace Final VESÃO 3 Jack
    HORACE JOSÉ JIMENEZ Análise Molecular in silico e Palinológica de espécies de Amaryllidaceae J. ST. - HIL Recife 2019 HORACE JOSÉ JIMENEZ ii Análise Molecular in silico e Palinológica de espécies de Amaryllidaceae J. ST. - HIL Tese apresentada ao Programa de Pós-graduação em Agronomia – Melhoramento Genético de Plantas (PPGAMGP), da Universidade Federal Rural de Pernambuco, como parte dos requisitos para obtenção do título de Doutor em Agronomia. COMITÊ DE ORIENTAÇÃO: Professor Dr. Reginaldo de Carvalho – Orientador –UFRPE Dr. Rômulo Maciel Moraes Filho – Coorientador – UFRPE Professora Dra. Luiza Suely Semen Martins – Coorientadora – UFRPE Professora Dra. Angélica Virginia Valois Montarroyos – Coorientadora – UFRPE Recife 2019 iii Dados Internacionais de Catalogação na Publicação (CIP) Sistema Integrado de Bibliotecas da UFRPE Biblioteca Central, Recife-PE, Brasil J83a José Jimenez, Horace. Análise molecular in sílico e palinológica de espécies de Amaryllidaceae J. ST. – Hil / Horace José Jimenez. – Recife, 2019. 111 f.: il. Orientador(a): Reginaldo de Carvalho. Coorientador(a): Rômulo Maciel Moraes Filho, Luiza Suely Semen Martins. Tese (Doutorado) – Universidade Federal Rural de Pernambuco, Programa de Pós-Graduação em Agronomia - Melhoramento Genético de Plantas, Recife, BR-PE, 2019. Inclui referências. 1. Amaryllidaceae 2. Bioinformática 3. Palinologia 4. Filogenia I. Carvalho, Reginaldo de, orient. II. Moraes Filho, Rômulo Maciel, coorient. III. Martins, Luiza Suely Semen, coorient. IV. Título CDD 574 iv Filho Área de Fitotecnia/DEPA/UFRPE
    [Show full text]
  • Purification Et Caractérisation Des Métabolites Secondaires Extraits De
    Purification et caractérisation des métabolites secondaires extraits de plantes de la famille des Asparagaceae et Caprifoliaceae, et évaluation de leurs activités biologiques Nampoina Andriamisaina Andriamasinoro To cite this version: Nampoina Andriamisaina Andriamasinoro. Purification et caractérisation des métabolites secondaires extraits de plantes de la famille des Asparagaceae et Caprifoliaceae, et évaluation de leurs activités biologiques. Médecine humaine et pathologie. Université Bourgogne Franche-Comté, 2018. Français. NNT : 2018UBFCE014. tel-02134104 HAL Id: tel-02134104 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02134104 Submitted on 20 May 2019 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. THESE DE DOCTORAT DE L’UNIVERSITE BOURGOGNE FRANCHE-COMTE PREPAREE AU LABORATOIRE DE PHARMACOGNOSIE PEPITE EA 4267 Ecole doctorale Environnements - Santé Doctorat de pharmacie, spécialité pharmacognosie Par Nampoina ANDRIAMISAINA ANDRIAMASINORO Purification et caractérisation des métabolites secondaires extraits de plantes de la famille des Asparagaceae et Caprifoliaceae, et évaluation de leurs activités biologiques Thèse présentée et soutenue à l’UFR des Sciences de Santé de Dijon salle R01, le 9 novembre 2018 Composition du Jury : Pr. Anne TESSIER UBFC Président Pr. Laurent POUYSEGU Université de Bordeaux Rapporteur Dr. Xavier CACHET Université Paris Descartes Rapporteur Dr.
    [Show full text]
  • Allium (Amaryllidaceae) Species in Pakistan: Two New Records and a New Species from Zhob (Balochistan)
    Pak. J. Bot., 53(5): 1759-1765, 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.30848/PJB2021-5(1) ALLIUM (AMARYLLIDACEAE) SPECIES IN PAKISTAN: TWO NEW RECORDS AND A NEW SPECIES FROM ZHOB (BALOCHISTAN) NAZAR KHAN1*, REINHARD M. FRITSCH2, AMIR SULTAN3 AND TAHIR KHAN4 1Department of Botany, Government Degree College, Zhob, Balochistan, Pakistan 2Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research, Gatersleben, Germany 3National Herbarium, National Agricultural Research Centre, Islamabad, Pakistan 4Army Public School and College, Zhob, Balochistan, Pakistan *Corresponding author’s email: [email protected] Abstract Allium caroli-henrici, A. registanicum are newly recorded from Zhob district of Pakistan, and a new species Allium zhobicum is described and illustrated. The new species belongs to Allium subg. Melanocrommyum sect. Thaumasioprason and is characterized by rounded bulbs with coriaceous outer tunics, entire to papillate linear leaves, lilac to white scarcely recurved, elliptical linear to oblong tepals and a six-lobed ovary with exserted stigma and violet style. The key to Allium species in Flora of Pakistan is amended including the diagnostic characters of the newly recorded species. Key words: Allium zhobicum, Allium caroli-henrici, Allium registanicum, taxonomy, description, distribution, SW Asia Introduction Diagnosis: The shape of ovary is most similar to A. mirum Wendelbo, but this species has papery outer bulb Allium L is a genus with currently more than 980 tunics and up to 8cm broad, elliptical leaves, a accepted species making it one of the largest campanulate perigonium, up to 3 cm long pedicels, and monocotyledonous genera of the world (Govaerts et al., longer obovate tepals of brown purple colour.
    [Show full text]
  • Nieuwe Oogst
    NIEUWE OOGST CATALOGUS 2019 NIJSSEN BULBS HEEMSTEDE WWW.NIJSSENBULBS.NL Afbeelding omslag: Allium ‘Mount Everest’, zie pagina 24. Fotografie: Gert-Pieter Nijssen en vele enthousiaste kwekers, waarvoor mijn dank. Deze uitgave kwam tot stand door samenwerking tussen: Tekst: Gert-Pieter Nijssen en archief Peter C. Nijssen Lithografie/Produktie: LNO drukkerij, Zierikzee. Niets uit deze uitgave mag worden vermenigvuldigd en/of openbaar gemaakt door middel van druk, fotokopie, microfilm of op welke wijze ook, zonder voorafgaande toestemming van Nijssen Bulbs Heemstede. Lichte kleurafwijkingen van foto’s en eventuele zet- of drukfouten in de catalogus voorbehouden. Een bezoek aan ons plantencentrum in Heemstede is altijd de moeite waard. Adres: Sportparklaan 25A, 2103 VR Heemstede. Voor actuele openingstijden kijk op: www.nijssenbulbs.nl Maakt u gebruik van het openbaar vervoer: Vanaf station Heemstede-Aerdenhout, stadsbus 4 richting Heemstede. Na ongeveer zes minuten uitstappen bij halte Glipperdreef/Begraafplaats. Nog ongeveer vijf minuten lopen in zuidelijke richting, na ong. 200 meter linksaf, de Sportparklaan in. Het plantencentrum bevindt zich aan de linkerzijde, schuin tegenover het zwembad. Algemene voorwaarden Nijssen Bulbs Heemstede Deze kunt u raadplegen op www.nijssenbulbs.nl, maar sturen wij u ook, op verzoek, kosteloos toe. Prijs catalogus ¤ 10.00 voor Nederland, overige landen binnen de E.U. ¤ 15.00 Bol- en Knolgewassen Een Nieuwe Oogst Nijssen Bulbs Heemstede Bijzondere bol- en knolgewassen Sportparklaan 25a 2103 VR HEEMSTEDE Tel.: 023 - 5471056 Correspondentie-adres: Postbus 653 2100 AR HEEMSTEDE www.nijssenbulbs.nl [email protected] Catalogus 2019 Catalogus 1 Bij-vriendelijke bloembollenpakketten Het belang van biodiversiteit en planten in de tuin waarvan o.a.
    [Show full text]
  • Caracterizações Morfológica E Química Da Água De Coco De
    VOL. 16, NUM. 6 2020 www.scientiaplena.org.br doi: 10.14808/sci.plena.2020.060202 Comparative genomics plastomes of the Amaryllidaceae family species Genômica comparativa de plastomas de espécies da família Amaryllidaceae H. J. Jimenez1; A. D. F. da Silva1*; L. S. S. Martins2; R. de Carvalho2; R. M. de Moraes Filho1 1Programa de Pós Graduação em Melhoramento Genético de Plantas, Departamento de Agronomia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, 52171-900, Recife – PE, Brasil. 2Programa de Pós Graduação em Melhoramento Genético de Plantas, Departamento de Biologia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, 52171-900, Recife – PE, Brasil. * [email protected] (Recebido em 07 de fevereiro de 2020; aceito em 19 de junho de 2020) The genus Allium covers more than 800 species, signaling among the largest among monocotyledons. The genus contains many economically important species, including garlic, leeks, onions, chives and Chinese chives. Due to the high conservation of chloroplast genomes compared to nuclear genomes and mitochondrial genome, sequence of chloroplasts in Amaryllidaceae have been consistently used for species identification and various in silico programs and strategies have been used to identify, characterize and compare plastid genome regions. Plastome from 15 species of the Amaryllidaceae family revealed similarity in both sequences and in the organization of their gene regions. The base pairs (bp) number ranged from 145,819 (A. paradoxum) to 159,125 (A. ursinum). In respect the GC content, the species presented a variation between 36.7% (A. schoenoprasum and A. sativum) and 37.5% (A. coddii) and the gene space ranged from 84.760 (A. paradoxum) to 94.766 (A.
    [Show full text]
  • Geographic Relations and Morphological Variation Inside Molecular Clades of Central Asian Allium Species of Subg
    ZOBODAT - www.zobodat.at Zoologisch-Botanische Datenbank/Zoological-Botanical Database Digitale Literatur/Digital Literature Zeitschrift/Journal: Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" Jahr/Year: 2012 Band/Volume: 148_149 Autor(en)/Author(s): Fritsch Reinhard M. Artikel/Article: Geographic relations and morphological variation inside molecular clades of Central Asian Allium species of subg. Melanocrommyum (Amaryllidaceae). 245-263 © Zool.-Bot. Ges. Österreich, Austria; download unter www.biologiezentrum.at Verh. Zool.-Bot. Ges. Österreich 148/149, 2012, 245–263 Geographic relations and morphological variation inside molecular clades of Central Asian Allium * species of subg. Melanocrommyum (Amaryllidaceae) ) 1) Reinhard M. FRITSCH Molecular investigations using Internal Transcribed Spacer (ITS) sequences yieldied a dendrogram presenting about 40 well-separated clades but without resolving the phylo- genetic relations of most of these clades. Many clades are composed of several species and subspecies differing morphologically and by geographic origin. About 30 of these clades are described in detail. They comprise about 70 Central Asian species and sub- species which are morphologically characterized. Their phenetic relations to taxa of the same and other clades as well as their current taxonomic affiliation are also discussed. FRITSCH R. M., 2012: Geographische Beziehungen und morphologische Variabi- lität innerhalb von molekularen Clades mittelasiatischer Allium-Arten des subg. Melanocrommyum (Amaryllidaceae). Eine molekulare Analyse der ITS-Sequenzen ergab ein Dendrogramm mit etwa 40 gut getrennten Clades, ohne deren phylogenetischen Beziehungen zueinander klären zu können. Viele Clades enthalten mehrere morphologisch gut trennbare Arten und Unterarten unterschiedlicher geographischer Herkunft. Näher charakterisiert werden etwa 30 dieser Clades, die etwa 70 Taxa aus Mittelasien umfassen.
    [Show full text]
  • Agrobiodiversity Hotspots in India: Conservation and Benefit Sharing Volume II
    Agrobiodiversity Hotspots in India: Conservation and Benefit Sharing Volume II M.P. Nayar, A.K. Singh, K.Narayanan Nair Protection of Plant Varieties and Farmers’ Rights Authority Government of India New Delhi Agrobiodiversity Hotspots in India: Conservation and Benefit Sharing Volume II © PPV & FR Authority, 2009 Final Report of the Task Force 06/2007 constituted by the PPV & FRA, vide OM No. PPV & FRA/6-22/07/1312, dated October, 08, 2007 to identify the Agrobiodiversity hotspots in India for purposes of the 'National Gene Fund' usage. Published by: PPV & FR Authority, NASC Complex, D.P.S. Marg, New Delhi-110012 ISBN-978-81-908786-0-9 ISBN-978-81-908786-2-3 Citation: Nayar M.P., Singh A.K. and Nair, K.N. 2009. Agrobiodiversity Hotspots in India : Conservation and Benefit Sharing, Vol. II, i-xii+ total pages 309 Photo credits: Dr. D. C. Bhandari, Dr. D. K. Hore, Dr. K. Narayanan Nair, Dr. M. P. Nayar, Dr. M. Sabu, Dr. M. Sanjappa, Dr. S. K. Sharma, Dr. D. K. Singh. Dr. S. R. Yadav, Dr. S. Maiti. Reviewing Scientists: Dr. Bhag Mal, Honorary Fellow, Bioversity International- India, New Delhi Dr. R. S. Rana, Former Director, National Bureau of Plant Genetic Resources, New Delhi Cover page photographs (clockwise from top left) : l Pepper (Piper longum)- endemic to Malabar Agrobiodiversity Region l Karonda (Carissa carandas)- an important minor fruit l The blue Star Lily (Nymphea nouchali)- widely found in water bodies l Brinjal (Lycopersicon esculentum)- local variety grown in NE India l Farmers harvesting Bach (Acorus calamus)-an important medicinal plant.
    [Show full text]
  • Phylogenetic Relationships and Diversification Processes in Allium Subgenus Melanocrommyum
    Phylogenetic relationships and diversification processes in Allium subgenus Melanocrommyum Dissertation zur Erlangung des akademischen Grades doctor rerum naturalium (Dr. rer. Nat.) Vorgelegt der Naturwissenschaftlichen Fakultät I – Biowissenschaften – der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg von Frau M. Sc Maia Gurushidze geb. am 11.09.1976 in Kvareli, Georgien Gutachter: 1. Prof. Dr. Martin Röser, MLU Halle-Wittenberg 2. Prof. Dr. Joachim W. Kadereit, Universität Mainz 3. Dr. Frank R. Blattner, IPK Gatersleben Halle (Saale), 19.05.2009 Nothing in biology makes sense except in the light of evolution T. Dobzhansky Everything makes a lot more sense in the light of phylogeny J. C. Avise Contents 1. Introduction 5 1.1. Why phylogeny matters 6 1.2. Plant species-level systematics 7 1.3 Phylogenetic inference 7 Distance methods 7 Maximum parsimony methods 8 Maximum likelihood and Bayesian methods 8 Bootstrap confidence for phylogenetic trees 9 Networks – genealogical methods 12 1.4 Molecular clock 13 Nonparametric rate smoothing (NPRS) 13 Penalized likelihood (PL) 13 1.5 Study group – Allium subgenus Melanocrommyum 14 Taxonomic history and systematics 14 Geographical distribution and ecology 17 Phylogenetic relationships within the subgenus 18 Karyology and ploidy level 19 2. Phylogenetic analysis of nuclear rDNA ITS sequences of the subgenus Melanocrommyum infers cryptic species and demands a new sectional classification 21 2.1 Introduction 21 2.2 Materials and methods 21 Plant Material 21 Anatomy of septal nectaries 22 Molecular methods 23 Data analyses 24 2.3 Results 25 Characteristics of the ITS region and phylogenetic analyses 25 RAPD analysis 30 Anatomy of septal nectaries 30 2.4 Discussion 31 Variation at the ITS locus 31 Divergent ITS types within species and individuals 32 RAPD analysis 33 ITS phylogeny and incongruence with taxonomic classification 33 Reasons for the molecular-taxonomical discordance 37 Nectary types 38 2.5 Conclusions 38 1 3.
    [Show full text]
  • Bioactive Compounds of Allium Species 14 Rajeev Bhat
    Bioactive Compounds of Allium Species 14 Rajeev Bhat Contents 1 Introduction .................................................................................. 278 2 Botanical Distribution and Bioactive Compounds ......................................... 278 3 Bioactivity ................................................................................... 281 3.1 Antioxidant Activity ................................................................... 281 3.2 Anticancer Activity .................................................................... 283 3.3 Antimicrobial Activity ................................................................ 284 3.4 Antihyperlipidemic/Anti-hypercholesterolemic Activity ............................. 285 3.5 Other Bioactivities .................................................................... 285 4 Toxicity...................................................................................... 286 5 Conclusions .................................................................................. 287 References ....................................................................................... 287 Abstract Evaluation of different plant species of Allium has resulted in identification of several bioactive constituents/phytochemicals. Some of the bioactive phytochemical constituents include organosulfur compounds, thiosulfinates, polysulfanes, polyphenols, tannins, flavonoids, alkaloids, saponins, fructans, fructo-oligosaccharides, essential oils, amino acids, vitamins, pigments, and much more. Traditionally, majority
    [Show full text]