Le Paludisme, Une Maladie Endémique En Voie D'élimination En
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Université de La Réunion Ecole Doctorale Lettres et Sciences Humaines UMR 228 ESPACE-DEV Thèse de Doctorat en Géographie Recul et persistance du paludisme en Union des Comores : une approche géographique pour déterminer l’importance des facteurs environnementaux et sociaux dans son maintien Présentée et soutenue publiquement par : ARTADJI ATTOUMANE Le 8 Février 2019 La Réunion Membres du jury : Jean Gaudart, Professeur, PU-PH, Université Aix-Marseille, rapporteur Annelise Tran, Directrice de recherche, HDR, CIRAD, rapporteur Gwenaëlle Pennober, Professeur, Université de La Réunion, directrice Eric Cardinale, Directeur de recherche, HDR, CIRAD, co-directeur Vincent Herbreteau, Chargé de recherche, IRD, encadrant Morgan Mangeas, Chargé de recherche, HDR, IRD, examinateur Silai Rahamatou, Parasitologue, PNLP Comores, invitée ii Remerciements Mes sincères remerciements s’adressent, en premier lieu, aux encadrants scientifiques de ce travail ; Gwenaëlle PENNOBER (directrice), Eric CARDINALE (codirecteur) et Vincent HERBRETEAU (coordinateur scientifique) pour l’accompagnement pédagogique et technique et la confiance témoignée à mon égard. Je me permets de remercier, particulièrement, Vincent HERBRETEAU qui n’a ménagé aucun effort pour l’aboutissement de cette thèse. Votre plein investissement sur l’élaboration des projets, sur l’obtention de ma bourse de thèse, sur l’organisation des missions de terrain aux Comores et votre appui didactique m’ont été d’une importance capitale pour mener à bien ce projet. Je souhaiterais vous remercier pour m’avoir accompagné dans mon installation sur l’île de la Réunion. Je souhaiterais vivement remercier Dr Afane Bacar et Madame Rahamatou Silai pour l’encadrement technique de cette thèse. En deuxième lieu, je souhaiterais remercier sincèrement toutes les institutions qui ont apporté leur soutien financier : l’Institut de Recherche pour le Développement (IRD) pour la bourse ARTS (Allocation de Recherche pour une Thèse au Sud), la Préfecture de La Réunion et le Fonds de Coopération Régionale pour le financement du projet « GeoH2O-Comores » et l’Université de La Réunion et l’UMR ESPACE-DEV pour m’avoir accueilli dans leur équipe à la Station SEAS-OI et pour le financement des missions et la participation aux conférences. D’autres institutions ont aussi contribué pour que je puisse prendre part à des conférences scientifiques, notamment l’Ambassade de France en Afrique du Sud, La COI (Commission de l’Océan Indien) à travers le projet « One health OI », les comités d’organisation de la conférence GEOBIA et du Congrès Européen de Médecine tropicale et de Santé Internationale (ECTMIH). J’adresse mes sincères remerciements aux rapporteurs et aux examinateurs de cette thèse qui ont bien voulu assurer le jury de ce travail. Je souhaiterais remercier toutes les institutions qui ont apporté un appui pour le bon déroulement de cette thèse, notamment : la Direction Générale de la Santé et le Programme National de Lutte contre le paludisme pour avoir fourni les données épidémiologiques et cliniques et appuyé le déroulement du projet « GeoH2O-Comores » ; iii l’Institut National de la Statistique et des Etudes Economiques et Démographiques pour avoir fourni les données démographiques ; l’Agence Nationale de l’Aviation Civile et de la Météorologie pour avoir mis à disposition des données météorologiques ; l’équipe de la Surveillance intégrée des Maladies et Ripostes (Dr Mohamed Sainda) pour la mise à disposition des données sur les maladies liées à l’eau et le paludisme aux Comores ; la Station de Surveillance de l’Environnement Assistée par Satellite pour l’Ocean Indien (SEAS-OI) pour avoir fourni les images satellite. Mes remerciements vont à l’endroit de Christophe Révillion, Phillipe Rouet et Didier Bouche pour leur soutien méthodologique et technique. Je n’oublierais pas de remercier les collègues de la Station SEAS-OI pour leur accueil et l’ambiance collégiale notamment Pierre Tessier, Stephane Guyard, Matthias Belus, Guy Boussougou Boussougou, Mathilde André, Jérémy Commins, Annabel Céleste pour ne citer que ceux-là. Mes vifs remerciements s’adressent à l’endroit de Dr Aboubacar Said Anli, Dr Mohamed Hafidhou, Dr Marie Anne, Dr Abdali Mari, Dr Faouzou Aboubacar et Msaidié Mohamed pour leurs collaborations dans l’organisation des missions aux Comores. Je n’oublierais pas de remercier également les collègues du PNLP, notamment Madame Astafieva Marina, Dr Amina Yssouf, Ali Toilibou, Ahamadi Daroueche pour ne citer que ceux-là. Je ne manquerais pas de remercier les personnes qui m’ont accompagné dans ma vie sur l’île de La Réunion notamment la famille de Mohamed Chinoi, la famille de mademoiselle Asma Mnemoi Hassani, la famille de madame Guy Zelma et mes collègues étudiants comoriens (Anziz Mohamed Abdou, Nasserdine Rachad et Hachim Said Ahmed). J’adresse mes chaleureux remerciements à mes parents et à tous les membres de ma famille qui se trouvent aux Comores, à Mayotte, à Marseille et à Paris pour leur soutien moral. Mes remerciements vont également à mes beaux parents et à ma belle famille. Je dédie cette thèse à deux femmes (Madame Habiba Abdou et Madame Fourahati Ahamda Moi Mtsahoi) qui m’ont apporté le réconfort, le courage et l’énergie nécessaire pour continuer iv à travailler jour et nuit afin d’aboutir à ce titre de Docteur. Vous avez su être patientes durant mon absence, mais aussi durant les moments difficiles. v J’ai une pensée profonde à mon cousin Fakri Mhoma Sabitte, mort du paludisme en 2004 à l’âge de 10 ans. J’ai partagé avec toi le même lit et les meilleurs moments de la vie. C’est pour toi que j’ai réalisé cette thèse pour contribuer à son élimination. vi Table des matières REMERCIEMENTS ------------------------------------------------------------------------------------------------------- III TABLE DES MATIERES ------------------------------------------------------------------------------------------------ VII INTRODUCTION GENERALE ------------------------------------------------------------------------------------------- 1 CHAPITRE 1 : LE PALUDISME, UNE MALADIE ENDEMIQUE EN VOIE D’ELIMINATION EN UNION DES COMORES ---------------------------------------------------------------------------------------------------- 8 1.1 DE L’ARCHIPEL DES COMORES A L’UNION DES COMORES ------------------------------------------------------- 10 1.1.1 Trois îles volcaniques à contraintes orographiques différentes ----------------------------------------- 11 1.1.2 Un climat tropical humide favorable à la transmission des maladies vectorielles ------------------- 18 1.1.3 Une colonisation précoce et une population toujours en forte croissance ----------------------------- 23 1.2 OFFRE, ACCES ET RECOURS AUX SOINS DANS L’UNION DES COMORES : DES INEGALITES ENCORE FORTES 34 1.2.1 Une organisation administrative complexe ----------------------------------------------------------------- 35 1.2.1.1 Administration nationale ------------------------------------------------------------------------------- 35 1.2.1.2 Administration régionale ------------------------------------------------------------------------------- 36 1.2.2 Une offre de soins variée et un accès souvent difficile --------------------------------------------------- 37 1.2.2.1 Organisation de l’offre de soins ----------------------------------------------------------------------- 37 1.2.2.2 Une offre de soins publics importante mais inégale ----------------------------------------------- 39 1.2.2.3 Une offre de soins privés concentrée dans les centres urbains----------------------------------- 44 1.2.3 Un recours aux soins inégal ----------------------------------------------------------------------------------- 45 1.2.4 Situation sanitaire ----------------------------------------------------------------------------------------------- 46 1.2.4.1 Maladies transmissibles et non transmissibles ----------------------------------------------------- 46 1.3 L’ELIMINATION DU PALUDISME, UN DEFI DE SANTE AUX COMORES ET DANS LE MONDE ------------------- 49 1.3.1 État du paludisme dans le monde ---------------------------------------------------------------------------- 49 1.3.2 Historique du paludisme aux Comores ---------------------------------------------------------------------- 54 1.3.3 La lutte contre le paludisme : un engagement du gouvernement comorien --------------------------- 62 CHAPITRE 2 : ÉPIDEMIOLOGIE SPATIALE DU PALUDISME EN UNION DES COMORES --- 75 2.1 INTRODUCTION ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- 76 2.2 METHODOLOGIES ------------------------------------------------------------------------------------------------------- 77 2.2.1 Mise en place d’une base de données épidémiologique et démographique --------------------------- 77 2.2.2 Échelles d’étude et sources des données -------------------------------------------------------------------- 80 2.2.3 Cartographies et analyses statistiques ----------------------------------------------------------------------- 81 2.2.3.1 Cartographies de la prévalence, de l’incidence du paludisme et des actions de lutte -------- 81 2.2.3.2 Analyses statistiques ------------------------------------------------------------------------------------ 81 2.3 RESULTATS -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 82 2.3.1 Prévalence du paludisme en milieu hospitalier ------------------------------------------------------------ 82 2.3.2 Evolution du diagnostic, du traitement des