1

IDENTIFIKASI BAKTERI Salmonella sp. DAN Escherichia coli PADA GADO-GADO, SIOMAY, DAN DI SEKITAR KAMPUS UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

SKRIPSI

Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat Mencapai Derajat Sarjana Strata Satu (S-1)

Oleh:

ANA FITRIYANI 1001070001

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO 2014

2

ii

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

3

iii

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

4

iv

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

5

MOTTO

Tugas kita bukanlah untuk berhasil. Tugas kita adalah untuk mencoba karena di dalam mencoba itulah kita menemukan dan belajar membangun kesempatan untuk berhasil (Mario Teguh)

Selesai (dari suatu urusan) kerjakanlah dengan sungguh-sungguh urusan yang lain

(QS. Al-Insyirah : 6-7)

Kesalahan dan kegagalan adalah pemberitahuan kita memperbaiki diri dan cara-cara kita yang akan kita temui dalam upaya mewujudkan kelas-kelas kepemimpinan yang lebih tinggi pada diri kita. Kesalahan dan kegagalan sama sekali bukanlah tanda untuk berhenti (Mario Teguh)

Tuntutlah ilmu, sesungguhnya menuntut ilmu adalah pendekatan diri kepada

Allah Azza wajalla, dan mengajarkannya kepada orang yang tidak mengetahuinya adalah sodaqoh. Sesungguhnya ilmu pengetahuan menempatkan orangnya, dalam kedudukan terhormat dan mulia (tinggi). Ilmu pengetahuan adalah keindahan bagi ahlinya di dunia dan di akhirat. (HR. Ar-Rabii')

v

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

6

PERSEMBAHAN

Skripsi ini penulis persembahkan kepada:

1. Bapak dan Ibu tercinta, yang senantiasa tak henti-hentinya memberikan kasih

sayang yang tulus dan sempurna, doa, motivasi, perhatian serta materi yang tak

terhingga sehingga saya dapat menyelesaikan skripsi ini.

2. Kakakku (Aris Mudzakir & Ida Nurul Khotijah) yang selalu memberikan

semangat, sehingga membuatku yakin akan kemampuanku menyelesaikan

skripsi ini.

3. Teman-teman yang senantiasa menemani dalam suka maupun duka.

vi

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

7

IDENTIFIKASI BAKTERI Salmonella sp. DAN Escherichia coli PADA BUMBU GADO-GADO, SIOMAY, DAN CILOK DI SEKITAR KAMPUS UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

Oleh: ANA FITRIYANI 1001070001

ABSTRAK

Penelitian yang berjudul Identifikasi bakteri Salmonella sp. dan Escherichia coli pada bumbu gado-gado, siomay dan cilok disekitar kampus Universitas Muhammadiyah Purwokerto bertujuan untuk mengetahui adanya bakteri Salmonella sp. dan Escherichia coli yang terdapat pada bumbu gado-gado, siomay, dan cilok yang disediakan pedagang kaki lima disekitar kampus Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Januari-Maret 2014 di Laboratorium Mikrobiologi Progam Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Metode yang digunakan yaitu metode survey, kemudian data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif. Sampel diambil di pedagang kaki lima di sekitar kampus Universitas Muhammadiyah Purwokerto, dan pengambilan sampel dilakukan sebanyak 3 kali dengan rentang waktu satu bulan. Sampel yang digunakan adalah bumbu dari gado-gado, siomay dan cilok. Uji Escherichia coli dilakukan dengan 3 tahap yaitu uji penduga, uji penguat, dan uji pelengkap. Sedangkan uji Salmonella meliputi pre-enrichment, enrichment, penanaman pada medium selektif dan tahap konfirmasi. Hasil uji tersebut akan diidentifikasi dengan melihat karakteristik makroskopis dan mikroskopis serta serangkaian uji biokimia dari sel bakteri tersebut. Hasil identifikasi dicocokkan dengan buku identifikasi bakteri Bergey‟s of Determinative Bakteriology (Holt, et al., 1994). Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 2 genus yaitu Escherichia coli dan Aerobacter yang semuanya bakteri Gram negatif dan dalam penelitian ini tidak ditemukan bakteri Salmonella sp.

Kata Kunci: Bumbu gado-gado, Cilok, Escherichia coli, Identifikasi, Salmonella sp., Siomay.

vii

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

8

UCAPAN TERIMAKASIH

Assalamu‟alaikum wr.wb

Alhamdulillahirobil „alamin

Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT karena rahmat, taufik dan hidayahnya yang senantiasa tercurah kepada segenap hamba-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Selama penulisan skripsi ini, penulis banyak mendapat dukungan, dorongan, serta bimbingan dari berbagai pihak.

Maka dari itu, pada kesempatan ini penulis menyampaikan ucapan terima kasih kepada Bapak Drs. Heri Maryanto, M.Si dan Ibu Dini Siswani Mulia, M.Si selaku pembimbing skripsi ini.

Selain itu penulis menyampaikan terimakasih kepada :

1. Drs. Akhmad, M.Si selaku Dekan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan

Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

2. Drs. Arief Husin, M.Si. selaku Ketua Program Studi Pendidikan Biologi

Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah

Purwokerto.

3. Kurniawan, S.Si selaku laboran Mikrobiologi Universitas Muhammadiyah

Purwokerto

4. Bapak dan Ibu tercinta yang senantiasa memberikan doa dan curahan kasih

sayang kepada penulis sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan

baik. Aku bangga memiliki orang tua seperti kalian.

5. Kakak tersayang yang selalu memberikan doa dan semangat.

viii

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

9

6. Teman seperjuangan (Ani & Citra), terimakasih atas bimbingannya.

7. Teman-teman Pendidikan Biologi angkatan ‟10 (Advi, Fadli, Dika, Lili, Febri,

Nurul, Nengsih, Dina, Dini, Mey dan Fatimah), terimakasih atas bantuan dan

arahan kepada penulis dalam melaksanakan penelitian. Semoga kebaikan

kalian dilipatgandakan oleh Alloh SWT.

8. Teman-teman Pelangi 3 tercinta (Isna, Vita, Anteng, Ana, Lisa). Bagiku kalian

adalah saudaraku.

9. Semua pihak yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu yang telah

membantu dalam penyusunan skripsi ini.

Penulis menyadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan. Oleh karena itu penulis mengharapkan saran dan kritik yang bersifat membangun demi perbaikan di masa yang akan datang, penulis berharap skripsi ini bermanfaat bagi semua pihak yang membutuhkan.

Semoga Alloh SWT memberikan balasn yang setimpal atas kebaikan dan bantuan yang telah penulis terima.

Purwokerto, Agustus 2014

Penulis

ix

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

10

DAFTAR ISI

Halaman

UCAPAN TERIMA KASIH ...... viii

DAFTAR ISI ...... x

DAFTAR TABEL ...... Xiii

DAFTAR GAMBAR ...... xiv

DAFTAR LAMPIRAN ...... Xv

BAB I PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang Masalah ...... 1

1.2 Rumusan Masalah ...... 4

1.3 Tujuan Penelitian ...... 4

1.4 Manfaat Penelitian ...... 4

BAB II TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Makanan Jajanan ...... 5

2.2 Keamanan Pangan ...... 6

2.3 Bakteri Dalam Makanan ...... 8

2.4 Bakteri Salmonella sp ...... 12

2.5 Bakteri Escherchia coli ...... 15

2.6 Identifikasi ...... 18 ...

BAB III METODE PENELITIAN

3.1 Lokasi dan Tempat ...... 20

3.2 Alat dan Bahan ...... 20

3.3 Metode Penelitian ...... 21

x

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

11

3.4 Cara Kerja ...... 21 .....

3.4.1 Pengambilan Sampel ...... 21......

3.4.2 Pembuatan Medium ...... 21

3.4.2.1 Medium Uji lactose broth (LB) ...... 21

3.4.2.2 Medium Uji Escherichia coli broth (ECB) ...... 22

3.4.2.3 Medium Uji eosin methylen blue (EMBA) ...... 22

3.4.2.4 Medium Uji selenite cystein broth (SCB) ...... 22

3.4.2.5 Medium Uji Salmonella shigella agar (SSA) ...... 23

3.4.2.6 Medium Uji triple sugar iron agar (TSIA)...... 23

3.4.2.7 Medium nutrient agar (NA)...... 23

3.4.2.8 Medium Uji Sulfide indole motility (SIM) ...... 24

3.4.2.9 Medium Uji protease (MR_VP) ...... 24

3.4.2.10 Medium Uji simon citrate agar...... 24

3.4.3 Analisa Mikrobiologi ...... 25......

3.4.5.1 Preparasi Sampel ...... 25 .....

3.4.5.2 Analisa Escherichia coli ...... 25

3.4.5.3 Analisa Salmonella sp ...... 26

3.4.4 Pemeliharaan ...... 28

3.4.5 Pengamatan Karakteristik Bakteri ...... 28

3.4.5.1 Pengamatan Karakteristik Makroskopis Bakteri ...... 28

3.4.5.2 Pengamatan karakteristik Makroskopis bakteri ...... 28

3.4.6 Identifikasi Bakteri ...... 33

3.4.7 Parameter yang Diamati ...... 33 ......

3.4.8 Analisis Data ...... 33

xi

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

12

BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN

4.1 Hasil Penelitian ...... 34

4.1.1 Hasi Isolasi Baktri ...... 34

4.1.2 Hasil Pengamatan Karakteristik Makroskopis Bakteri ...... 35

4.1.3 Hasil Pengamatan Karakteristik Mikroskopis Bakteri ...... 36

4.1.4 Hasil Uji Biokimia ...... 36

4.1.5 hasil Identifikasi ...... 41

4.1.5.1 Genus Escherichia coli ...... 42

4.1.5.2 Genus Aerobacter...... 43 ....

4.2 Pembahasan ...... 44 .

4.2.1 Hasil Analisa Mikrobiologi ...... 45 .

4.2.2 Hasil Analisa Escherichia coli ...... 45

4.2.3 Hasil Analisa Salmonella sp ...... 48

4.2.4 Hasil Pewarnaan Gram ...... 49 ......

4.2.5 Hasil Uji Biokimia ...... 51

BAB V KESIMPULAN DAN SARAN 58

5.1 Kesimpulan ...... 58 ..

5.2 Saran ...... 5...... 8

DAFTAR PUSTAKA ...... 59

LAMPIRAN – LAMPIRAN ...... 62

xii

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

13

DAFTAR TABEL

Halaman Tabel 4.1 Kode isolat yang berhasil diisolasi dari bumbu gado-gado, 34 siomay, dan cilok ......

Tabel 4.2 Hasil pengamatan karakteristik mikroskopis isolate ...... 36

Tabel 4.3 Hasil uji biokimia isolat-isolat yang diperoleh dari sampel 36 bumbu gado-gado, siomay, dan cilok ......

Tabel 4.4 Hasil identifikasi genus Escherichia ...... 42

Tabel 4.5 Hasil identifikasi genus Aerobacter ...... 44

Tabel 4.6 Tabel isolat bakteri hasil identifikasi ...... 45

xiii

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

14

DAFTAR GAMBAR

Halaman Gambar 4.1 Hasil pengamatan karakteristik mikroskopis bakteri ...... 35

Gambar 4.2 Hasil uji TSIA ...... 37

Gambar 4.3 Hasil uji indol ...... 38

Gambar 4.4 Hasil uji methyl red ...... 39

Gambar 4.5 Hasil Voges proskauer ...... 40

Gambar 4.6 Hasil uji sitrat ...... 41

Gambar 4.7 Reaksi penguraian tryptophan oleh enzim tryptophase ...... 53

Gambar 4.8 Persamaan reaksi hidrolisis glukosa ...... 54

Gambar 4.9 (1) Persamaan reaksi fermentasi karbohidrat ...... 55

Gambar 4.9 (2) Persamaan reaksi perubahan warna pada medium uji VP 55

Gambar 4.10 (1) Reaksi (1) Fermentasi asam sitrat ...... 57

Gambar 4.10 (2) Reaksi (II) Fermentasi asam sitrat ...... 57

xiv

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014

15

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman Lampiran 1 Isolat-isolat bakteri ...... 62

Lampiran 2 Tabel isolat bakteri hasil identifikasi ...... 63

Lampiran 3 Pengamatan mikroskopis bakteri ...... 64

xv

Identifikasi Bakteri Salmonella..., Ana Fitriyani, FKIP UMP, 2014