108 Acremonium-Подобные Грибы

Total Page:16

File Type:pdf, Size:1020Kb

108 Acremonium-Подобные Грибы Acremonium-подобные грибы: разнообразие таксонов Е.Ю. Благовещенская, Н.И.Блум Московский Государственный университет имени М.В. Ломоносова [email protected] Acremonium Link — это анаморфный род порядка Hypocreales, широко представленный в природе и имеющий очень большое практическое значение, особенно для медицинской микологии. Бедность морфологии неоднократно приводила (и приводит) к существенным проблемам при идентификации изолятов и различным таксономическим конфузам. Наиболее знаменитым из них, конечно же, является само существование этого рода, так как многие виды акремониев и по сегодняшний день фигурируют в работах как виды другого рода — рода Cephalosporium Corda — который еще полвека назад был признан nomen confusum (Gams, 1968). Основная часть видов этого рода перешла в род Acremonium, а затем и в другие таксоны сумчатых грибов. Тем не менее, в настоящий момент времени в базах Index Fungorum и MycoBank около двадцати видов рода Cephalosporium снова имеют статус леги-тимных, причем некоторый абсурд ситуации добавляет то, что род Cephalosporium в базе Index Fungorum по-прежнему указан как синонимичный роду Acremonium. Таким образом, ситуация остается весьма запутанной. В русскоязычной литературе проблемное положение акремониеподобных грибов вообще практически не освещалось за небольшим исключением (Тарасов, 1976; Налепина и Тарасов, 1987). В нашей работе мы постараемся восполнить этот пробел и привести обзор современного положения Acremonium spp. и схожих видов. Для облегчения восприятия мы приводим в алфавитном порядке список наиболее важных терминов, используемых в ли-тературе при описании таксонов с пояснениями и схематическими иллюстрациями (рис. 1). Термины, используемые при описании таксонов Аделофиалида — редуцированная фиалида в виде слабо дифференцированного ответ-вления от основной клетки (рис. 1, d); септы, отделяющей аделофиалиду от подлежащей гифы, не формируется. Характерная особенность — хорошо выраженный воротничок. Афанофиалида — фиалида, редуцированная до одной шейки (рис. 1, f); обычно их бывает несколько на одну клетку подлежащей гифы. Вертицеллятное ветвление конидиеносцев — такое ветвление, при котором главная и боковые оси имеют примерно одинаковую длину (sensu Gams, 1971). Головка конидий — шаровидная структура, возникающая на фиалиде из конидий, склеенных общей слизью (рис. 1, i). Извилистая фиалида или фиалида с извилистой клеточной стенкой — фиалида, верхняя часть которой имеет характерный искривленный контур (рис. 1, g). Ортофиалиды или ортотропные фиалиды — фиалиды, ориентированные перпендику-лярно гифе, на которой они расположены (рис. 1, b). Периклинальное утолщение клеточной стенки фиалиды — увеличение толщины клеточ-ной стенки фиалиды в верхней ее части (рис. 1, h). Плагиофиалиды или плагиотропные фиалиды — фиалиды, образующие острый угол с подлежащей гифой (рис. 1, c). Обычно возникают непосредственно под септой. Разъединенная (disconnected) цепочка конидий — такая цепочка, где конидии не имеют специальных коннективов и сравнительно легко разъединяются (рис. 1, j). Рацемозное ветвление конидиеносцев — такое ветвление, при котором боковые ветви короче, чем главная ось (sensu Gams, 1971). 108 Рис. 1. Различные варианты строения фиалид a – c. Ориентация фиалид по отношению к гифе: a — телофиалида, b — ортофиалида, c — плагиофиалида. d – h. Нестандартные фиалиды: d — аделофиалида, e — схизофиалида, f — афанофиалиды, g — извилистая фиалида, h — фиалида с периклинальным утолщением клеточной стенки. i – l. Расположение формирующихся на фиалидах конидий: i — головка конидий, j — разъединенная цепочка конидий, k — соединенная цепочка конидий, l — строение клеточной стенки конидии в соединенной цепочке (первичная стенка на обоих концах конидии утолщена). Соединенная (connected) цепочка конидий — такая цепочка, где первичная клеточная стенка формирует особое утолщение с обеих сторон конидии, образуя, таким образом, коннективы (рис. 1, k, l). Схизофиалида (шизофиалида) — ветвящаяся фиалида (рис. 1, e); дополнительных септ при этом не образуется. Телофиалида — фиалида, имеющая верхушечное расположение. Фактически, это апикальная клетка гифы, ставшая конидиогенной (рис. 1, a). Фиалида — бутылковидная конидиогенная клетка, формирующая базипетальную цепочку конидий. Фиалоконидии относятся к энтеробластическим конидиям, то есть в построении клеточной стенки спор участвует только внутренний слой клеточной стенки материнской клетки. По расположению на мицелии различают орто- и плагиофиалиды. Цепочка конидий — структура, состоящая из последовательно соединенных конидий. Различают т.н. разъединенные (рис. 1, j) и соединенные (рис. 1, k) цепочки. Цимозное ветвление конидиеносцев — такое ветвление, при котором боковые ветви длиннее, чем главная ось (sensu Gams, 1971). 109 Предыстория вопроса: от Корда до Гамса В связи с указанными выше обстоятельствами, мы начнем историю изучения акремониев именно с описания рода Cephalosporium. Впервые род Cephalosporium был описан в 1839 году чешским микологом Августом Карлом Йозефом Корда в книге «Icones Fungorum hucusque Cognitorum» (Corda, 1839). В описании рода характерными чертами являются отсутствие септ, простые конидиеносцы (в оригинале — спороносцы), заканчива-ющиеся головкой из одноклеточных спор. В этой работе описано два вида: типовой — C. acremonium Corda, выделенный с разлагающихся останков насекомых, ранее хранившихся в спирту, и С. macrocarpum Corda, найденный в разлагающихся семенах конопли. На основе описания, изображений (рис. 2) и экологии описанных видов Вальтер Гамс посчитал, что, скорее всего, Август Корда наблюдал какие-то виды зигомицетного рода Mortierella (Gams, 1967; Gams, 1971). Рис. 2. Иллюстрации к роду Cephalosporium из книги «Icones Fungorum hucusque Cognitorum» (Corda, 1839) Спустя 24 года немецкий врач и ботаник Георг Фрезениус в третьем выпуске своего многотомного труда «Beiträge zur Mykologie» (Fresenius, 1863), представил более подробное описание гриба, найденного на разлагающихся листьях кукурузы и отнесенного им к C. acremonium: «Белая нежная плесень. Мицелий ползучий и ветвящийся, даже при большом увеличении не удается отметить четкой септированности… Спороносцы без перегородок, иногда в основании заметно расширенные, к вершине постепенно шиловидно заостряются и несут круглую головку из многочисленных спор, склеенных посредством слизи. Спороносцы отходят поодиночно или в мутовке… Споры значительно варьируют по форме и размеру; размеры спор 1/300 – 1/700 мм». К сожалению, гербарного материала описанной культуры гриба не сохранилось, но, судя по описанию и рисункам, можно предположить, что описанный гриб является Acremonium furcatum (Moreau & V. Moreau) ex W. Gams (Gams, 1971). И сам Георг Фрезениус упоминает, что данный гриб имеет большое сходство с Acremonium Link, от которого его отличает только наличие спор собранных в головки (Fresenius, 1863), в то время как в первоначальном описании рода Acremonium спороносцы несут на конце только одну спору. 110 В течение последующих лет в рамках рода Cephalosporium было описано около 150 видов, в том числе и отечественными учеными, например: Cephalosporium atrum (Corda) Pidopl. и Cephalosporium oudemansii Pidopl. (Пидопличко, 1953), Cephalosporium euonymi Orlova (Орлова и Голодная, 1959), Cephalosporium viride Grebenjuk (Гребенюк, 1971). Реаль-ное количество видов, с которыми микологи-систематики могли работать, было значительно меньше, так как больше половины из описанных видов не были представлены в коллекциях типовыми культурами и не были доступны для изучения. Первую значительную попытку обобщить разрозненные сведения о грибах рода Cepha- losporium предприняла американская ученая Элизабет Пинкертон в 1936 году (Pinkerton, 1936). В своей работе она провела детальный анализ как макро- и микроморфологических, так и физиологических особенностей (реакции на кислотность среды) 17 типовых штаммов мицелиальных грибов как рода Cephalosporium, так близких к нему родов. Для изученных видов был приведен ключ для определения, опирающийся на различия штаммов по внешнему виду колоний, характеру ветвления конидиеносцев и по размеру конидий, а также подробное описание с иллюстрациями. Следующая попытка упорядочить грибы, описанные как Cephalosporium, была предпринята в 1963 году (Durrell, 1963, цит. по Gams, 1971), но классификация изученных видов предложена не была. В 1966 г. индийские ученые на основе изучения 29 видов предложили разделить род Cephalosporium на четыре группы по цвету колонии (Sukapure and Thirumalachar, 1966). Внутри каждой группы они разделяли виды и разновидности по размеру и форме конидий, по цвету и характеру роста воздушного мицелия. Кроме того, в работе этих авторов впервые был поднят вопрос о том, что, вероятно, помещение некоторых видов в род Cephalosporium ошибочно. В частности они подчер-кивали, что микроконидиальные стадии Fusarium spp. часто принимают за Cephalosporium, таким образом, виды с многоклеточными макроконидиями, как, например, C. pammmelli Buchanan и C. dieffenbachiae Linn было бы целесообразно относить к роду Fusarium Link. В 1968 году Вальтер Гамс, изучая культуры гриба Acremonium alternatum Link, отметил, что в отличие от первого описания культуры (Corda, 1839) для штаммов этого рода возможно образование конидий не только в цепочках, но и в головках со множеством переходных форм. Таким образом, формирование конидий в цепочках переставало быть признаком рода Acremonium (Gams, 1968). Наблюдение спор в головках привело к выводу, что многими учеными в рамках рода Cephalosporium были описаны виды, которые на самом деле должны были быть отнесены к роду Acremonium
Recommended publications
  • Aspergillus Subgenus Polypaecilum from the Built Environment
    available online at www.studiesinmycology.org STUDIES IN MYCOLOGY 88: 237–267 (2017). Aspergillus subgenus Polypaecilum from the built environment J.B. Tanney1,2*,5, C.M. Visagie1,3,4*,5, N. Yilmaz1,3, and K.A. Seifert1,3 1Ottawa Research and Development Centre, Biodiversity (Mycology and Microbiology), Agriculture and Agri-Food Canada, 960 Carling Avenue, Ottawa, Ontario K1A 0C6, Canada; 2Institut de Biologie Integrative et des Systemes (IBIS), Universite Laval, Quebec G1V 0A6, Canada; 3Department of Biology, University of Ottawa, 30 Marie Curie, Ottawa, Ontario, K1N 6N5, Canada; 4Biosystematics Division, ARC-Plant Health and Protection, P/BagX134, Queenswood, 0121 Pretoria, South Africa *Correspondence: J.B. Tanney, [email protected]; C.M. Visagie, [email protected] 5The first two authors contributed equally to this work and share the first authorship Abstract: Xerophilic fungi, especially Aspergillus species, are prevalent in the built environment. In this study, we employed a combined culture-independent (454- pyrosequencing) and culture-dependent (dilution-to-extinction) approach to investigate the mycobiota of indoor dust collected from 93 buildings in 12 countries worldwide. High and low water activity (aw) media were used to capture mesophile and xerophile biodiversity, resulting in the isolation of approximately 9 000 strains. Among these, 340 strains representing seven putative species in Aspergillus subgenus Polypaecilum were isolated, mostly from lowered aw media, and tentatively identified based on colony morphology and internal transcribed spacer rDNA region (ITS) barcodes. Further morphological study and phylogenetic analyses using sequences of ITS, β-tubulin (BenA), calmodulin (CaM), RNA polymerase II second largest subunit (RPB2), DNA topoisomerase 1 (TOP1), and a pre-mRNA processing protein homolog (TSR1) confirmed the isolation of seven species of subgenus Polypaecilum, including five novel species: A.
    [Show full text]
  • Taxonomy and Evolution of Aspergillus, Penicillium and Talaromyces in the Omics Era – Past, Present and Future
    Computational and Structural Biotechnology Journal 16 (2018) 197–210 Contents lists available at ScienceDirect journal homepage: www.elsevier.com/locate/csbj Taxonomy and evolution of Aspergillus, Penicillium and Talaromyces in the omics era – Past, present and future Chi-Ching Tsang a, James Y.M. Tang a, Susanna K.P. Lau a,b,c,d,e,⁎, Patrick C.Y. Woo a,b,c,d,e,⁎ a Department of Microbiology, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong, Hong Kong b Research Centre of Infection and Immunology, The University of Hong Kong, Hong Kong c State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases, The University of Hong Kong, Hong Kong d Carol Yu Centre for Infection, The University of Hong Kong, Hong Kong e Collaborative Innovation Centre for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The University of Hong Kong, Hong Kong article info abstract Article history: Aspergillus, Penicillium and Talaromyces are diverse, phenotypically polythetic genera encompassing species im- Received 25 October 2017 portant to the environment, economy, biotechnology and medicine, causing significant social impacts. Taxo- Received in revised form 12 March 2018 nomic studies on these fungi are essential since they could provide invaluable information on their Accepted 23 May 2018 evolutionary relationships and define criteria for species recognition. With the advancement of various biological, Available online 31 May 2018 biochemical and computational technologies, different approaches have been adopted for the taxonomy of Asper- gillus, Penicillium and Talaromyces; for example, from traditional morphotyping, phenotyping to chemotyping Keywords: Aspergillus (e.g. lipotyping, proteotypingand metabolotyping) and then mitogenotyping and/or phylotyping. Since different Penicillium taxonomic approaches focus on different sets of characters of the organisms, various classification and identifica- Talaromyces tion schemes would result.
    [Show full text]
  • Rare Fungal Infection Linked to a Case of Juvenile Arthritis
    Open Access Case Report DOI: 10.7759/cureus.3229 Rare Fungal Infection Linked to a Case of Juvenile Arthritis Karin Ried 1 , Peter Fakler 1 1. NIIM Research, National Institute of Integrative Medicine, Melbourne, AUS Corresponding author: Karin Ried, [email protected] Abstract Juvenile arthritis with unknown disease etiology is also known as juvenile idiopathic arthritis. Symptoms include joint pain, swelling, and stiffness, and standard treatment involves immunosuppressant medication. Here we present a case of juvenile idiopathic arthritis with severe malnutrition and worsening of symptoms, which restrained a nine-year-old girl to a wheelchair with minimal movement capacity and low energy during standard immunosuppressant therapies over the course of three years. Our innovative Pathogen Blood Test combining cytology-based microscopy and genetic analysis using a pan-fungal primer assay and sequencing identified a systemic fungal infection with Sagenomella species, closely related to Aspergillus, and a soil-dwelling highly pathogenic fungus, which had previously been linked to a fatal veterinary case of arthritis and malnutrition. Our test results encouraged a radical change of the patient’s treatment plan, including cessation of the regular immunosuppressants, including steroids, over six months. The patient made a progressive recovery, including complete reversion of the previously swollen and painful joints, development of a good appetite, and return to liveliness. Within the year of change from immunosuppressants to immune-supportive integrative nutritional therapies, including regular intravenous vitamin C, and oral vitamin D, as well as gentle aqua- and physiotherapy, the patient started to gain weight including muscle mass and regained strength and movement in the hands, arms, and legs.
    [Show full text]
  • Fungal Keratitis Caused by a New Filamentous Hyphomycete Sagenomella Keratitidis
    Botanical Studies (2009) 50: 331-335. microbioloGY Fungal keratitis caused by a new filamentous hyphomycete Sagenomella keratitidis Huei-MeiHSIEH1,Yu-MingJU1,Po-RenHSUEH2,Hsiu-YiLIN3,Fung-RongHU3,andWei-Li CHEN3,* 1Institute of Plant and Microbial Biology, Academia Sinica, Taipei, Taiwan 2Department of Internal Medicine, National Taiwan University Hospital, Taipei, Taiwan 3Department of Ophthalmology, National Taiwan University Hospital, Taipei, Taiwan (ReceivedOctober6,2008;AcceptedMarch4,2009) ABSTRACT. Apreviouslyundescribedhyphomycetousfunguswasisolatedfromkeratitisdevelopedina softcontact-lenswearer.Itgrowsextremelyslowlyonvariousculturemedia.Itsphialide-likeconidiophores lacking an abrupt inflation and catenate, hyaline ameroconidia lead us to consider the fungus a species of the genusSagenomella. Keywords:Keratitis;Hyphomycetes;Sagenomellakeratitidis;Taxonomy. INTRODUCTION Conidiophoresandconidiawereexaminedbylight microscopy(LM)andscanningelectronmicroscopy Useofsoftcontactlenseshasbeenassociatedwith (SEM).Materialwasmountedinwaterforexaminationby the potential risk of developing microbial keratitis LMwithaLEICA/LEITZDMRBmicroscopeequipped (Donzis et al., 1987;Wilhelmus, 1987; Gray et al., with differential interference contrast optics. SEM 1995;Fongetal.,2004).However,previousreports observationsweremadebyPHILIPS(FEI)QUANTA oncontactlensassociatedfungalkeratitisshowedlow 200fittedwithPolaronPP2000Tcryo-SEMsystem prevalence(Yamaguchietal.,1984;Donzisetal.,1987; (QuorumTechnologies,UK).SamplesforSEMwere Wilhelmus,1987;Wilhelmusetal.,1988;Kirschand
    [Show full text]
  • Phylogeny and Nomenclature of the Genus Talaromyces and Taxa Accommodated in Penicillium Subgenus Biverticillium
    available online at www.studiesinmycology.org StudieS in Mycology 70: 159–183. 2011. doi:10.3114/sim.2011.70.04 Phylogeny and nomenclature of the genus Talaromyces and taxa accommodated in Penicillium subgenus Biverticillium R.A. Samson1, N. Yilmaz1,6, J. Houbraken1,6, H. Spierenburg1, K.A. Seifert2, S.W. Peterson3, J. Varga4 and J.C. Frisvad5 1CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre, Uppsalalaan 8, 3584 CT Utrecht, The Netherlands; 2Biodiversity (Mycology), Eastern Cereal and Oilseed Research Centre, Agriculture & Agri-Food Canada, 960 Carling Ave., Ottawa, Ontario, K1A 0C6, Canada, 3Bacterial Foodborne Pathogens and Mycology Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, 1815 N. University Street, Peoria, IL 61604, U.S.A., 4Department of Microbiology, Faculty of Science and Informatics, University of Szeged, H-6726 Szeged, Közép fasor 52, Hungary, 5Department of Systems Biology, Building 221, Technical University of Denmark, DK-2800, Kgs. Lyngby, Denmark; 6Microbiology, Department of Biology, Utrecht University, Padualaan 8, 3584 CH Utrecht, The Netherlands. *Correspondence: R.A. Samson, [email protected] Abstract: The taxonomic history of anamorphic species attributed to Penicillium subgenus Biverticillium is reviewed, along with evidence supporting their relationship with teleomorphic species classified inTalaromyces. To supplement previous conclusions based on ITS, SSU and/or LSU sequencing that Talaromyces and subgenus Biverticillium comprise a monophyletic group that is distinct from Penicillium at the generic level, the phylogenetic relationships of these two groups with other genera of Trichocomaceae was further studied by sequencing a part of the RPB1 (RNA polymerase II largest subunit) gene. Talaromyces species and most species of Penicillium subgenus Biverticillium sensu Pitt reside in a monophyletic clade distant from species of other subgenera of Penicillium.
    [Show full text]
  • A Worldwide List of Endophytic Fungi with Notes on Ecology and Diversity
    Mycosphere 10(1): 798–1079 (2019) www.mycosphere.org ISSN 2077 7019 Article Doi 10.5943/mycosphere/10/1/19 A worldwide list of endophytic fungi with notes on ecology and diversity Rashmi M, Kushveer JS and Sarma VV* Fungal Biotechnology Lab, Department of Biotechnology, School of Life Sciences, Pondicherry University, Kalapet, Pondicherry 605014, Puducherry, India Rashmi M, Kushveer JS, Sarma VV 2019 – A worldwide list of endophytic fungi with notes on ecology and diversity. Mycosphere 10(1), 798–1079, Doi 10.5943/mycosphere/10/1/19 Abstract Endophytic fungi are symptomless internal inhabits of plant tissues. They are implicated in the production of antibiotic and other compounds of therapeutic importance. Ecologically they provide several benefits to plants, including protection from plant pathogens. There have been numerous studies on the biodiversity and ecology of endophytic fungi. Some taxa dominate and occur frequently when compared to others due to adaptations or capabilities to produce different primary and secondary metabolites. It is therefore of interest to examine different fungal species and major taxonomic groups to which these fungi belong for bioactive compound production. In the present paper a list of endophytes based on the available literature is reported. More than 800 genera have been reported worldwide. Dominant genera are Alternaria, Aspergillus, Colletotrichum, Fusarium, Penicillium, and Phoma. Most endophyte studies have been on angiosperms followed by gymnosperms. Among the different substrates, leaf endophytes have been studied and analyzed in more detail when compared to other parts. Most investigations are from Asian countries such as China, India, European countries such as Germany, Spain and the UK in addition to major contributions from Brazil and the USA.
    [Show full text]
  • UC Riverside Electronic Theses and Dissertations
    UC Riverside UC Riverside Electronic Theses and Dissertations Title Above- and Below-Ground Consequences of Woody Plant Range Expansion in Alpine Ecosystems Permalink https://escholarship.org/uc/item/1644v6c0 Author Collins, Courtney Grace Publication Date 2019 Peer reviewed|Thesis/dissertation eScholarship.org Powered by the California Digital Library University of California UNIVERSITY OF CALIFORNIA RIVERSIDE Above- and Below-Ground Consequences of Woody Plant Range Expansion in Alpine Ecosystems A Dissertation submitted in partial satisfaction of the requirements for the degree of Doctor of Philosophy in Plant Biology by Courtney Grace Collins September 2019 Dissertation Committee: Dr. Jeffrey Diez, Chairperson Dr. Emma Aronson Dr. Jason Stajich Dr. Marko Spasojevic Copyright by Courtney Grace Collins 2019 The Dissertation of Courtney Grace Collins is approved: Committee Chairperson University of California, Riverside Acknowledgements I would like to thank my dissertation advisor and mentor, Dr. Jeffrey Diez for his unwavering support, valuable advice, encouragement and trust in my abilities. Thank you for challenging me to think bigger and shoot higher than I thought I could, for giving me the space and autonomy to follow my research interests, even when they were outside of your own, and for always being available when I needed help. I also thank the members of my dissertation committee, Dr. Emma Aronson, Dr. Jason Stajich, and Dr. Marko Spasojevic, who have all provided invaluable feedback, guidance, and research collaboration over my 5 years at UCR. I thank my graduate academic advisors Dr. Linda Walling, Dr. Norm Ellstrand, and Dr. Amy Litt as well as Laura McGeehan for their time and resources which were critical to my success.
    [Show full text]
  • Phylogeny of Penicillium and the Segregation of Trichocomaceae Into Three Families
    available online at www.studiesinmycology.org StudieS in Mycology 70: 1–51. 2011. doi:10.3114/sim.2011.70.01 Phylogeny of Penicillium and the segregation of Trichocomaceae into three families J. Houbraken1,2 and R.A. Samson1 1CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre, Uppsalalaan 8, 3584 CT Utrecht, The Netherlands; 2Microbiology, Department of Biology, Utrecht University, Padualaan 8, 3584 CH Utrecht, The Netherlands. *Correspondence: Jos Houbraken, [email protected] Abstract: Species of Trichocomaceae occur commonly and are important to both industry and medicine. They are associated with food spoilage and mycotoxin production and can occur in the indoor environment, causing health hazards by the formation of β-glucans, mycotoxins and surface proteins. Some species are opportunistic pathogens, while others are exploited in biotechnology for the production of enzymes, antibiotics and other products. Penicillium belongs phylogenetically to Trichocomaceae and more than 250 species are currently accepted in this genus. In this study, we investigated the relationship of Penicillium to other genera of Trichocomaceae and studied in detail the phylogeny of the genus itself. In order to study these relationships, partial RPB1, RPB2 (RNA polymerase II genes), Tsr1 (putative ribosome biogenesis protein) and Cct8 (putative chaperonin complex component TCP-1) gene sequences were obtained. The Trichocomaceae are divided in three separate families: Aspergillaceae, Thermoascaceae and Trichocomaceae. The Aspergillaceae are characterised by the formation flask-shaped or cylindrical phialides, asci produced inside cleistothecia or surrounded by Hülle cells and mainly ascospores with a furrow or slit, while the Trichocomaceae are defined by the formation of lanceolate phialides, asci borne within a tuft or layer of loose hyphae and ascospores lacking a slit.
    [Show full text]
  • Supplement Hoenigl TLID 2021 Global Guideline for the Diagnosis
    Supplementary appendix This appendix formed part of the original submission and has been peer reviewed. We post it as supplied by the authors. Supplement to: Hoenigl M, Salmanton-García J, Walsh TJ, et al. Global guideline for the diagnosis and management of rare mould infections: an initiative of the European Confederation of Medical Mycology in cooperation with the International Society for Human and Animal Mycology and the American Society for Microbiology. Lancet Infect Dis 2021; published online Feb 16. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30784-2. 1 Global guideline for the diagnosis and management of rare 2 mold infections: An initiative of the ECMM in cooperation 3 with ISHAM and ASM* 4 5 Authors 6 Martin Hoenigl (FECMM)1,2,3,54,55#, Jon Salmanton-García4,5,30,55, Thomas J. Walsh (FECMM)6, Marcio 7 Nucci (FECMM)7, Chin Fen Neoh (FECMM)8,9, Jeffrey D. Jenks2,3,10, Michaela Lackner (FECMM)11,55, Ro- 8 sanne Sprute4,5,55, Abdullah MS Al-Hatmi (FECMM)12, Matteo Bassetti13, Fabianne Carlesse 9 (FECMM)14,15, Tomas Freiberger16, Philipp Koehler (FECMM)4,5,17,30,55, Thomas Lehrnbecher18, Anil Ku- 10 mar (FECMM)19, Juergen Prattes (FECMM)1,55, Malcolm Richardson (FECMM)20,21,55,, Sanjay Revankar 11 (FECMM)22, Monica A. Slavin23,24, Jannik Stemler4,5,55, Birgit Spiess25, Saad J. Taj-Aldeen26, Adilia Warris 12 (FECMM)27, Patrick C.Y. Woo (FECMM)28, Jo-Anne H. Young29, Kerstin Albus4,30,55, Dorothee Arenz4,30,55, 13 Valentina Arsic-Arsenijevic (FECMM)31,54, Jean-Philippe Bouchara32,33, Terrence Rohan Chinniah34, Anu- 14 radha Chowdhary (FECMM)35, G Sybren de Hoog (FECMM)36, George Dimopoulos (FECMM)37, Rafael F.
    [Show full text]
  • Phylogeny, Identification and Nomenclature of the Genus Aspergillus
    available online at www.studiesinmycology.org STUDIES IN MYCOLOGY 78: 141–173. Phylogeny, identification and nomenclature of the genus Aspergillus R.A. Samson1*, C.M. Visagie1, J. Houbraken1, S.-B. Hong2, V. Hubka3, C.H.W. Klaassen4, G. Perrone5, K.A. Seifert6, A. Susca5, J.B. Tanney6, J. Varga7, S. Kocsube7, G. Szigeti7, T. Yaguchi8, and J.C. Frisvad9 1CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre, Uppsalalaan 8, NL-3584 CT Utrecht, The Netherlands; 2Korean Agricultural Culture Collection, National Academy of Agricultural Science, RDA, Suwon, South Korea; 3Department of Botany, Charles University in Prague, Prague, Czech Republic; 4Medical Microbiology & Infectious Diseases, C70 Canisius Wilhelmina Hospital, 532 SZ Nijmegen, The Netherlands; 5Institute of Sciences of Food Production National Research Council, 70126 Bari, Italy; 6Biodiversity (Mycology), Eastern Cereal and Oilseed Research Centre, Agriculture & Agri-Food Canada, Ottawa, ON K1A 0C6, Canada; 7Department of Microbiology, Faculty of Science and Informatics, University of Szeged, H-6726 Szeged, Hungary; 8Medical Mycology Research Center, Chiba University, 1-8-1 Inohana, Chuo-ku, Chiba 260-8673, Japan; 9Department of Systems Biology, Building 221, Technical University of Denmark, DK-2800 Kgs. Lyngby, Denmark *Correspondence: R.A. Samson, [email protected] Abstract: Aspergillus comprises a diverse group of species based on morphological, physiological and phylogenetic characters, which significantly impact biotechnology, food production, indoor environments and human health. Aspergillus was traditionally associated with nine teleomorph genera, but phylogenetic data suggest that together with genera such as Polypaecilum, Phialosimplex, Dichotomomyces and Cristaspora, Aspergillus forms a monophyletic clade closely related to Penicillium. Changes in the International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants resulted in the move to one name per species, meaning that a decision had to be made whether to keep Aspergillus as one big genus or to split it into several smaller genera.
    [Show full text]
  • Rasamsonia Composticola, a New Thermophilic Species Isolated from Compost in Yunnan, China
    Mycol Progress DOI 10.1007/s11557-012-0827-9 ORIGINAL ARTICLE Rasamsonia composticola, a new thermophilic species isolated from compost in Yunnan, China Yuan-Ying Su & Lei Cai Received: 3 March 2012 /Revised: 3 May 2012 /Accepted: 10 May 2012 # German Mycological Society and Springer 2012 Abstract Rasamsonia composticola sp. nov. is described, have a maximum growth temperature at or above 50 °C and illustrated, and compared with similar taxa. This species a minimum temperature of growth at or above 20 °C are produces globose to ellipsoid ascomata, spherical asci borne considered thermophilic, and those that have a thermal in short chains and globose, 1-celled ascospores, typical of maximum near 50 °C and a minimum well below 20 °C Rasamsonia. Anamorph on CYA, MEA, and PDA produces are thermotolerant (Cooney and Emerson 1964). Taxonom- verrucose, rough-walled conidiophores, and hyaline and ically, thermophiles constitute a heterogeneous group cylindrical conidia. This novel species is thermophilic with (Mouchacca 1997, 2007; Salar and Aneja 2007). Thermo- optimal growth temperature of 45–50 °C, and minimum philic fungi are important natural bio-resources capable of growth temperature of 30 °C. Phylogenetic analyses based producing thermo-stable enzymes, which are industrially on combined ITS rDNA, partial calmodulin, and β-tubulin important (Maheshwari et al. 2000). sequences, and combined partial RPB2, Tsr1, and Cct8 gene Houbraken et al. (2012) introduced Rasamsonia, with the sequences were conducted. Both confirmed the generic type species R. emersonii based on a polyphasic study of placement in Rasamsonia and showed its close phylogenetic thermotolerant and thermophilic species in Trichocomaceae. relationships to several species in the genus, such as R.
    [Show full text]
  • Diversity and Effects of the Fungal Endophytes of the Liverwort Marchantia Polymorpha
    Diversity and Effects of the Fungal Endophytes of the Liverwort Marchantia polymorpha by Jessica Marie Nelson Department of Biology Duke University Date:_______________________ Approved: ___________________________ Arthur Jonathan Shaw, Supervisor ___________________________ Rytas Vilgalys ___________________________ François Lutzoni ___________________________ Fred S. Dietrich ___________________________ Paul S. Manos Dissertation submitted in partial fulfillment of the requirements for the degree of Doctor of Philosophy in the Department of Biology in the Graduate School of Duke University 2017 i v ABSTRACT Diversity and Effects of the Fungal Endophytes of the Liverwort Marchantia polymorpha by Jessica Marie Nelson Department of Biology Duke University Date:_______________________ Approved: ___________________________ Arthur Jonathan Shaw, Supervisor ___________________________ Rytas Vilgalys ___________________________ François Lutzoni ___________________________ Fred S. Dietrich ___________________________ Paul S. Manos An abstract of a dissertation submitted in partial fulfillment of the requirements for the degree of Doctor of Philosophy in the Department of Biology in the Graduate School of Duke University 2017 i v Copyright by Jessica Marie Nelson 2017 Abstract Fungal endophytes are ubiquitous inhabitants of plants and can have a wide range of effects on their hosts, from pathogenic to mutualistic. These fungal associates are important drivers of plant success and therefore contribute to plant community structure. The majority of endophyte studies have focused on seed plants, but in order to understand the dynamics of endophytes at the ecosystem scale, as well as the evolution of these fungal associations, investigations are also necessary in earlier-diverging clades of plants, such as the non-vascular bryophytes (mosses, liverworts, and hornworts). This dissertation presents a survey of the diversity of fungal endophytes found in the liverwort Marchantia polymorpha L.
    [Show full text]