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MINISTERIO DE MEDIO AMBIENTEY MEDIO RURALY MARINO SOCIEDAD ESPAÑOLA DE FITOPATOLOGÍA PATÓGENOS DE PLANTAS DESCRITOS EN ESPAÑA 2ª Edición COLABORADORES Elena González Biosca Vicente Pallás Benet Ricardo Flores Pedauye Dirk Jansen José Luis Palomo Gómez José María Melero Vara Miguel Juárez Gómez Javier Peñalver Navarro Vicente Pallás Benet Alfredo Lacasa Plasencia Ramón Peñalver Navarro Amparo Laviña Gomila Ana María Pérez-Sierra Francisco J. Legorburu Faus Fernando Ponz Ascaso Pablo Llop Pérez ASESORES María Dolores Romero Duque Pablo Lunello Javier Romero Cano María Ángeles Achón Sama Jordi Luque i Font Luis A. Álvarez Bernaola Montserrat Roselló Pérez Ester Marco Noales Remedios Santiago Merino Miguel A. Aranda Regules Vicente Medina Piles Josep Armengol Fortí Felipe Siverio de la Rosa Emilio Montesinos Seguí Antonio Vicent Civera Mariano Cambra Álvarez Carmina Montón Romans Antonio de Vicente Moreno Miguel Cambra Álvarez Pedro Moreno Gómez Miguel Escuer Cazador Enrique Moriones Alonso José E. García de los Ríos Jesús Murillo Martínez Fernando García-Arenal Jesús Navas Castillo CORRECTORA DE Pablo García Benavides Ventura Padilla Villalba LA EDICIÓN Ana González Fernández Ana Palacio Bielsa María José López López Las fotos de la portada han sido cedidas por los socios de la Sociedad Española de Fitopatolo- gía, Dres. María Portillo, Carolina Escobar Lucas y Miguel Cambra Álvarez Secretaría General Técnica: Alicia Camacho García. Subdirector General de Información al ciu- dadano, Documentación y Publicaciones: José Abellán Gómez. Director del Centro de Publica- ciones: Juan Carlos Palacios López. Jefa del Servicio de Producción y Edición: Mª Dolores López Hernández. Coordinadores: Paloma Melgarejo Nárdiz, José García-Jiménez, María Concepción Jordá Gutiérrez, María Milagros López González, María Fe Andrés Yebes y Núria Durán-Vila Edita: © Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino Secretaría General Técnica Centro de Publicaciones Distribución y venta Paseo de la Infanta Isabel, I Teléfono: 91 347 55 51 - 91 347 55 41 Fax: 91 347 57 22 Plaza San Juan de la Cruz, s/n Teléfono: 91 597 60 81 Fax: 91 597 66 01 Maquetación, impresión y encuadernación Servicios Gráficos Kenaf, s.l. Tienda virtual: www.marm.es e-mail: [email protected] NIPO: 770-09-108-9 ISBN: 84-491-0403-3 1ª Edición agotada ISBN: 978-84-491-0954-6 2ª Edición Depósito Legal: M-3392-2010 Catálogo General de publicaciones oficiales: http://www.060.es (servicios en línea / oficina virtual / Publicaciones) Datos técnicos: Formato: 17x24 cm. Caja de texto 13,6x19 cm. Composición: 1 columna. Tipografía: Times New Roman a cpo 11 y 14. Encuadernación: cosido a hilo. Cubierta: cartulina gráfica reciclada 300 gr., impresa 4 tintas más plastificado mate 1 cara. Papel interior: 60% fibras recicladas, 40% fibras vírgenes FSC, 100 gramos 4 Prólogo Esta segunda edición del libro “Patógenos de plantas descritos en España” tiene como ob- jetivo actualizar la primera edición publicada en 1999, con los nuevos patógenos detec- tados desde entonces, completando la lista, su descripción, huéspedes afectados, enfermedades que causan y su distribución geográfica, sustentándose en referencias su- ficientemente acreditadas. El libro contribuye a potenciar una de las líneas principales de difusión del conocimiento fitopatológico de la Sociedad Española de Fitopatología basada en publicaciones mono- gráficas y consolida nuestra intensa actividad editorial. Se trata de un manual de consulta de gran utilidad para técnicos, investigadores científi- cos, estudiantes y gestores de las administraciones públicas relacionados directa o indi- rectamente con la Sanidad y Protección Vegetal. El rigor en su preparación está acreditado por los editores y asesores consultados, que son reconocidos especialistas en los diversos patógenos, así como por la supervisión realizada por el Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino. Emilio Montesinos Seguí Presidente de la Sociedad Española de Fitopatología (2004-2008) 5 Nota de los coordinadores Los editores-coordinadores de esta nueva versión actualizada del libro “Patógenos de plantas descritos en España” nos propusimos poner al día dicho catálogo finalizado en 1998 y presentamos el resultado conseguido. Como se indicaba en el prefacio del libro anterior, el criterio de selección de los patóge- nos que figuraban allí fue muy restrictivo, ya que se exigía que todos los patógenos hu- bieran sido descritos en revistas científicas con Comité de redacción. Por no cumplir este requisito, un gran número de organismos presentes en nuestro país no figuraron en dicha versión. El número de patógenos que se incluye en esta segunda edición es mucho más elevado que en la primera: el número de virus ha pasado de 63 en la edición anterior a 103 en la presente, el de viroides de 12 a 37, las bacterias de 30 a 50, los mollicutes de 7 a 8, los hongos de 271 a 412 y los nematodos de 35 a 48. Este sustancial incremento responde a varias causas. Por un lado, en los últimos años se ha incrementado el número de labo- ratorios españoles que realizan y publican los resultados de sus diagnósticos y, por ello, también el número de citas de nuevos organismos. Por otro, el criterio de inclusión de pa- tógenos se ha ampliado, ya que se ha considerado que también deben incluirse aquellos cuya descripción figuraba en tesis, publicaciones científicas y de divulgación, aportacio- nes a Congresos y en otros medios accesibles públicamente y que permitían una identi- ficación completa y válida, a juicio de los respectivos editores. En lo que respecta al apartado de Hongos, éstos han sido considerados en un sentido am- plio, incluyendo en el catálogo todos los organismos incluidos tradicionalmente dentro de los hongos aunque actualmente se incluyan en Reinos distintos (vgr. Pythium, Phytoph- thora y mildius, actualmente en el Reino Chromista o Plasmodiophora, del Reino Proto- zoa). A diferencia de la edición anterior en que aparecían por grupos taxonómicos, en la presente edición aparecen por orden alfabético y dentro de la ficha se señala el grupo ta- xonómico al que pertenece. Aunque el patógeno en la publicación española apareciese con otro nombre, se ha tomado como nombre correcto del hongo el que aparece en la página web del CABI Bioscience Databases (http://www.indexfungorum.org), y para bacterias el que aparece en http://www.bacterio.cict.fr. En la mayoría de los casos se incluyen tam- bién sus sinónimos. 7 Los nematodos han sido abordados de una manera diferente a la edición anterior: mien- tras allí aparecían agrupados por géneros, en esta edición se describe cada especie pató- gena por separado. También se ha modificado ligeramente el formato de cada ficha, y además, a fin de facili- tar al lector información sobre las características del patógeno, junto a la bibliografía que lo describe en España se ha procurado adjuntar alguna referencia básica de su descripción (generalmente la ficha de CMI Descriptions of Pathogenic Fungi and Bacteria). Se han limitado las referencias a un número máximo de diez por patógeno. En aquellos casos en que la bibliografía española es amplia se ha procurado reducirlas a aquellas que se refieren a su diagnóstico y epidemiología en España. Hemos intentado, y esperamos ha- berlo conseguido, que sean todos los que están, pero sabemos que no están todos los que son. Por un lado, aún hay patógenos correctamente identificados en España, pero que no cumplen con los criterios acordados para ser incluidos en este libro. Por otro lado, los pa- tógenos que se han recogido corresponden a aquellos citados en España hasta 2005 (en el caso de bacterias) ó 2004 (resto de patógenos), años en los que los distintos editores fina- lizaron el manuscrito de esta obra. Por ello, lamentamos que por distintos problemas aje- nos a nuestra voluntad, el trabajo no haya visto la luz hasta varios años más tarde y que por ello, desde el momento de su aparición, ya no esté actualizado. Los editores queremos agradecer la confianza y paciencia de las diferentes Juntas Direc- tivas de la Sociedad Española de Fitopatología y de sus Presidentes que han apoyado este trabajo, así como el esfuerzo de todos los asesores y colaboradores que nos han sumi- nistrado la información necesaria para su redacción. Esperamos no haber olvidado a nin- guno, pero si así ha sido, pedimos disculpas. Agradecemos al Ministerio de Medio Ambiente y Medio Rural y Marino su favorable aco- gida para la publicación conjunta de esta reedición. Asimismo queremos agradecer la labor de María José López, que ha sido fundamental en la ejecución material de este catálogo. También es necesario recordar que un libro con tan elevado número de patógenos y de referencias suele contener errores, y éste no va a ser una excepción. Por ello agradecere- mos a los lectores que nos las señalen porque, al terminar esta versión, somos conscien- tes de que pronto habrá que preparar una nueva edición actualizada. Mientras tanto, esperamos que tenga una favorable acogida entre los fitopatólogos y que resulte muy útil para todos. Los coordinadores 8 Índice Virus Alfalfa mosaic virus (Virus del mosaico de la alfalfa) . 57 Apple chlorotic leaf spot virus (Virus de las manchas cloróticas del manzano) . 58 Apple mosaic virus (Virus del mosaico del manzano) . 60 Apple stem grooving virus (Virus de la madera asurcada del manzano) . 62 Apple stem pitting virus (Virus de la madera estriada del manzano) . 63 Artichoke latent virus (Virus latente de la alcachofa). 64 Banana streak virus (Virus del rayado del banano) . 66 Barley mild mosaic virus (Virus del mosaico suave de la cebada) . 67 Barley stripe mosaic virus (Virus del mosaico rayado de la cebada) . 69 Barley yellow dwarf virus (Virus del enanismo amarillo de la cebada). 70 Barley yellow mosaic virus (Virus del mosaico amarillo de la cebada). 72 Bean common mosaic necrosis virus (Virus de la necrosis del mosaico común de la judía). 73 Bean common mosaic virus (Virus del mosaico común de la judía) .
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    Building evidence for conservaton globally Journal of Threatened Taxa ISSN 0974-7907 (Online) ISSN 0974-7893 (Print) 26 November 2019 (Online & Print) PLATINUM Vol. 11 | No. 14 | 14787–14926 OPEN ACCESS 10.11609/jot.2019.11.14.14787-14926 J TT www.threatenedtaxa.org ISSN 0974-7907 (Online); ISSN 0974-7893 (Print) Publisher Host Wildlife Informaton Liaison Development Society Zoo Outreach Organizaton www.wild.zooreach.org www.zooreach.org No. 12, Thiruvannamalai Nagar, Saravanampat - Kalapat Road, Saravanampat, Coimbatore, Tamil Nadu 641035, India Ph: +91 9385339863 | www.threatenedtaxa.org Email: [email protected] EDITORS English Editors Mrs. Mira Bhojwani, Pune, India Founder & Chief Editor Dr. Fred Pluthero, Toronto, Canada Dr. Sanjay Molur Mr. P. Ilangovan, Chennai, India Wildlife Informaton Liaison Development (WILD) Society & Zoo Outreach Organizaton (ZOO), 12 Thiruvannamalai Nagar, Saravanampat, Coimbatore, Tamil Nadu 641035, Web Design India Mrs. Latha G. Ravikumar, ZOO/WILD, Coimbatore, India Deputy Chief Editor Typesetng Dr. Neelesh Dahanukar Indian Insttute of Science Educaton and Research (IISER), Pune, Maharashtra, India Mr. Arul Jagadish, ZOO, Coimbatore, India Mrs. Radhika, ZOO, Coimbatore, India Managing Editor Mrs. Geetha, ZOO, Coimbatore India Mr. B. Ravichandran, WILD/ZOO, Coimbatore, India Mr. Ravindran, ZOO, Coimbatore India Associate Editors Fundraising/Communicatons Dr. B.A. Daniel, ZOO/WILD, Coimbatore, Tamil Nadu 641035, India Mrs. Payal B. Molur, Coimbatore, India Dr. Mandar Paingankar, Department of Zoology, Government Science College Gadchiroli, Chamorshi Road, Gadchiroli, Maharashtra 442605, India Dr. Ulrike Streicher, Wildlife Veterinarian, Eugene, Oregon, USA Editors/Reviewers Ms. Priyanka Iyer, ZOO/WILD, Coimbatore, Tamil Nadu 641035, India Subject Editors 2016-2018 Fungi Editorial Board Ms. Sally Walker Dr.
  • Genetic Compositions of Broad Bean Wilt Virus 2 Infecting Red Pepper in Korea

    Genetic Compositions of Broad Bean Wilt Virus 2 Infecting Red Pepper in Korea

    Plant Pathol. J. 29(3) : 274-284 (2013) http://dx.doi.org/10.5423/PPJ.OA.12.2012.0190 The Plant Pathology Journal pISSN 1598-2254 eISSN 2093-9280 © The Korean Society of Plant Pathology Open Access Genetic Compositions of Broad bean wilt virus 2 Infecting Red Pepper in Korea Hae-Ryun Kwak1,3, Mi-Kyeong Kim1, Moon Nam1, Jeong-Soo Kim1, Kook-Hyung Kim2, Byeongjin Cha3* and Hong-Soo Choi1* 1Crop Protection Division, National Academy of Agricultural Science, Suwon 441-707, Korea 2Department of Agricultural Biotechnology, Plant Genomics and Breeding Institute, Seoul National University, Seoul 151-921, Korea 3Department of Plant Medicine, Chungbuk National University, Cheongju 361-763, Korea (Received on December 23, 2012; Revised on March 6, 2013; Accepted on March 13, 2013) The incidence of Broad bean wilt virus 2 (BBWV2) on virus 2 (BBWV2) (Kobayashi et al., 2003; Uyemoto et al., red pepper was investigated using the samples obtained 1974). Although they show the similar genome structures from 24 areas of 8 provinces in Korea. Two hundred and functions, the nucleotide (nt) sequence identity between and five samples (79%) out of 260 collected samples them was limited (39% − 67%). The genome is composed were found to be infected with BBWV2. While the of two single stranded positive-sense RNA molecules, single infection rate of BBWV2 was 21.5%, the co- RNA-1 and RNA-2, that are encapsidated separately into infection rate of BBWV2 with Cucumber mosaic virus, icosahedral virions (Lisa et al., 1996). Although BBWV1 Pepper mottle virus, Pepper mild mottle virus and/or Potato virus Y was 78.5%.
  • Sequencing Abstracts Msa Annual Meeting Berkeley, California 7-11 August 2016

    Sequencing Abstracts Msa Annual Meeting Berkeley, California 7-11 August 2016

    M S A 2 0 1 6 SEQUENCING ABSTRACTS MSA ANNUAL MEETING BERKELEY, CALIFORNIA 7-11 AUGUST 2016 MSA Special Addresses Presidential Address Kerry O’Donnell MSA President 2015–2016 Who do you love? Karling Lecture Arturo Casadevall Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health Thoughts on virulence, melanin and the rise of mammals Workshops Nomenclature UNITE Student Workshop on Professional Development Abstracts for Symposia, Contributed formats for downloading and using locally or in a Talks, and Poster Sessions arranged by range of applications (e.g. QIIME, Mothur, SCATA). 4. Analysis tools - UNITE provides variety of analysis last name of primary author. Presenting tools including, for example, massBLASTer for author in *bold. blasting hundreds of sequences in one batch, ITSx for detecting and extracting ITS1 and ITS2 regions of ITS 1. UNITE - Unified system for the DNA based sequences from environmental communities, or fungal species linked to the classification ATOSH for assigning your unknown sequences to *Abarenkov, Kessy (1), Kõljalg, Urmas (1,2), SHs. 5. Custom search functions and unique views to Nilsson, R. Henrik (3), Taylor, Andy F. S. (4), fungal barcode sequences - these include extended Larsson, Karl-Hnerik (5), UNITE Community (6) search filters (e.g. source, locality, habitat, traits) for 1.Natural History Museum, University of Tartu, sequences and SHs, interactive maps and graphs, and Vanemuise 46, Tartu 51014; 2.Institute of Ecology views to the largest unidentified sequence clusters and Earth Sciences, University of Tartu, Lai 40, Tartu formed by sequences from multiple independent 51005, Estonia; 3.Department of Biological and ecological studies, and for which no metadata Environmental Sciences, University of Gothenburg, currently exists.