Role of Focal Adhesion Kinase in the Invasive Phenotype of Small-Cell Lung Cancer
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Role of Focal Adhesion Kinase in the invasive phenotype of small-cell lung cancer Frank ABOUBAKAR NANA Thesis submitted to the Faculty of Biomedical Sciences of Université catholique de Louvain in partial fulfilment of the requirements for the Degree of Doctor of Philosophy in Biomedical and Pharmaceutical Sciences Private defense on April 1st 2020 Promotor: Professor Sebahat OCAK, UCLouvain, Secteur des Sciences de la Santé, Institut de Recherche Expérimentale et Clinique (IREC), Pole of Pneumology, ENT and Dermatology (PNEU) & CHU UCLouvain Namur (Godinne Site), Division of Pneumology, Belgium Co-promotor: Professor Charles PILETTE, UCLouvain, Secteur des Sciences de la Santé, IREC, PNEU & Cliniques universitaires St-Luc, Division of Pneumology, Belgium MEMBERS OF THE JURY President: Professor Jean-Pascal MACHIELS, UCLouvain, Secteur des Sciences de la Santé, IREC, Molecular Imaging, Radiotherapy and Oncology (MIRO) & Cliniques universitaires St-Luc, Division of Medical Oncology, Belgium Members: Professor Anabelle DECOTTIGNIES, UCLouvain, Genetic and Epigenetic Alterations of Genomes, de Duve Institute, Faculty of Pharmacy and Biomedical Sciences, Belgium Professor Olivier FERON, UCLouvain, IREC, Pole of Pharmacology and Therapeutics (FATH), Faculty of Pharmacy and Biomedical Sciences, Belgium Invited members: Professor David PLANCHARD, Université Paris-Saclay, Department of Medical Oncology, Gustave Roussy, Villejuif, France Professor Karim VERMAELEN, Universiteit Ghent, Department of Pulmonary Medicine - Tumor Immunology Laboratory,-Belgium 2 Acknowledgments « J'ai répondu qu'on ne changeait jamais de vie, qu'en tout cas toutes se valaient et que la mienne ici ne me déplaisait pas du tout ». L'étranger de Albert Camus (1942). Madame Wollanders à qui j’exprime ma grande gratitude pour m’avoir accompagné tout au long de ma thèse sur le plan organisationnel et administratif avec une réactivité, une disponibilité et une efficacité hors norme. Merci aux membres du comité d’accompagnement et aux membres du jury pour leur revue sans complaisance, pointilleuse et constructive qui donne une valeur précieuse à ce travail. Au Professeur Yves Sibille Merci d’avoir décelé, initié et partagé avec moi cette idée de la recherche fondamentale comme arme supplémentaire aux soins apportés aux patients dans notre pratique médicale. Vous avez su m’orienter vers les bonnes personnes avec lesquelles j’ai pu mener à bien ce projet. Mon seul petit regret, c’est de ne pas avoir eu l’opportunité de défendre cette thèse avant votre éméritat. Au Professeur Sebahat Ocak Chère Sebahat, merci pour l’honneur que vous m’avez accordé en me prenant sous votre aile et en acceptant de diriger ma thèse. Je vous serai toujours reconnaissant de votre bienveillance, votre sens aigu du détail, vos critiques constructives et le respect que vous m’accordez sur chacun de nos échanges. Veuillez trouver l’expression de mon profond respect, ma grande estime et mes sincères remerciements. Au Professeur Charles Pilette Cher Charles, votre calme britannique, votre sens aigu du détail, votre humour et votre grande sagesse ainsi que vos conseils précieux m’ont tout de suite donné un sentiment de sécurité et de protection dans votre laboratoire. Le soutien indéfectible que vous témoignez au laboratoire s’est poursuivi jusqu’en clinique où vous avez été le plus grand artisan pour que je puisse rejoindre l’équipe de pneumologie clinique. Ceci sans doute en raison de votre thème de prédilection : la recherche translationnelle dont nous partageons l’intérêt et que j’ai eu l’occasion de parfaire dans l’une des plus grandes équipes au monde en la matière grâce à l’aide de Sebahat. Mes sincères remerciements. Cette période au laboratoire a surtout été une opportunité de rencontrer des personnes formidables sans lesquelles ce travail n’aurait sans doute jamais vu le jour. Cela a aussi rendu cette période de ma vie enrichissante. Seul le plus grand auteur contemporain et prix Nobel de littérature l’exprime le mieux dans « Ville triste » (1975) : « Il y a des êtres mystérieux, toujours les mêmes, qui se tiennent en sentinelles à chaque carrefour de notre vie. » Patrick Modiano. 3 Marylène, avec qui je partage ce travail grâce à son soutien émotionnel, psychologique, et sur les travaux de recherche. Tu ne m’as jamais lâché même dans mes idées absurdes. Nous avons même réussi à réanimer des membranes de western blot rongées par l’acide. Mille mercis et du fond du cœur. J’ai eu de la chance de t’avoir rencontré. Merci aux conseils de Bruno, Maha et Sébastien. Je remercie la douce et adorable Amandine, l’espiègle Diana. Mes voisins de bureau successifs John, François qui ne sont pas aussi difficiles à vivre que moi. Je n’oublie pas Charlotte et sa simplicité, Thomas et ses milliards de neurones effervescents et sa sympathie. Marie, sans doute la plus intelligente d’entre nous. Je remercie aussi mes compères du laboratoire et en clinque, Antoine, Sophie et Ludovic Je ne remercierai jamais assez Caroline, Chantal, Michèle de la plateforme 2IP qui m’ont suivi dans tous mes projets et apporté de l’aide dans toutes mes idées folles, irréalisables au départ mais accomplies finalement. Je remercie aussi Isabelle, Philippe, Anne-Thérèse V., Anne-Thérèse P., Najet, Anne, Mélanie, François, Eléonore, Johan, Kate, Fairouz. Merci à Jérôme pour ton aide précieuse, ta disponibilité et ta gentillesse. A nos prochaines collaborations. Mes remerciements à Bertrand de la plateforme du CTMA, à Nicolas et Aurélie qui m’ont été d’une aide précieuse sur le développement du marquage multiplex en immunofluorescence. Je remercie tous mes collègues de l’équipe de pneumologie qui m’ont accueilli en clinique, le chef de service T. Pieters, mes supporters et soutiens : Françoise, Antoine, Giuseppe, Benny. Mon voisin et confident et sage Philippe. Ma collègue de bureau Sophie. Merci aux infirmières du plateau technique, Mélanie, Bahiya, Brigitte, Laurence pour leur accessibilité, leur compétence et leur souci des soins apportés aux patients dans le contexte particulier et stressant des techniques pneumologiques. J’admire votre dévouement et vos qualités humaines. Vanessa, Irina, Sandra regroupées dans le bureau de « la bienveillance », accueillant tout en gardant votre bonne humeur. A Sylvie notre coordinatrice de soins en oncologie thoracique et à nos infirmières de l’unité d’hospitalisation. A toute l’équipe de fonction respiratoire, Zakia, Joachim, Jesus, Cécile. A toute notre équipe du secrétariat, Catherine, Alexia, Jennifer et surtout Anne-Sophie qui est toujours là pour m’apporter son aide sans compter, même pendant ses congés. Merci à l’équipe de kiné : Ines et surtout à mon ami Gregory pour son énorme cœur sur la main. Merci pour ta relecture et ton regard aiguisé sur mon manuscrit. Merci à Valérie, mon binôme en oncologie thoracique qui m’a tout de suite accueilli dès le premier jour et qui me témoigne sa confiance et son profond respect. Tu es une femme exceptionnelle, et une chirurgienne hors pair que j’admire sincèrement. Delphine, merci pour ta disponibilité, ton écoute, ta bienveillance envers moi malgré les 100 coups de fils par jour. Merci à Benoit et Nadia pour nos échanges et votre expertise. Grâce à vous quatre, ma vie dans l’institution est plus aisée et mes projets de recherche ont pu se poursuivre. Je ne peux terminer cet exercice de mémoire sans remercier ma deuxième famille professionnelle où j’ai appris ce métier dans des conditions exceptionnelles dans l’une des meilleures équipes qui pratique de la médecine de précision au monde tout 4 en préservant l’humanité qui est indispensable quand on s’occupe du cancer le plus mortel. Merci à Benjamin et David de m’avoir réservé un accueil singulier et intégré dans votre équipe remarquable dès mon premier jour. Merci de continuer à m’aider à grandir. Merci à Laura, Thierry, Anas, Laetitia, Céline, Marie et toute l’équipe du comité 031 de Gustave Roussy et du centre chirurgical Marie-Lannelongue. Merci à mes collègues du service de pneumologie de CHU UCLouvain Namur site de Godinne, plus particulièrement Lionel Pirard et Fabrice Duplaquet pour leur aide pour nos projets de recherche. Il en est de même pour l’équipe de biobanque du CHU UCLouvain Namur site de Godinne qui m’a énormément aidé durant toute ma thèse et qui continue à être disponible pour moi en y mettant tout son cœur : Fabienne, Laurence, Sophie et Laure. Je remercie aussi l’équipe de pneumologie de l’hôpital Saint Luc Bouge qui a accompagné mes premiers pas de médecin avec beaucoup de bienveillance. Merci particulier à Richard Frognier, Pierre Bachez et Pascal Legros. Remerciements personnels A mes parents, mes sœurs et ma partenaire de vie Merci pour votre amour inconditionnel. Maman, à ta force de caractère, ta bienveillance et ton courage. Grace à toi je suis devenu la personne authentique que je suis aujourd’hui. A Mireille, ma deuxième maman. Pour tes encouragements ton soutien moral, financier durant ces interminables années de médecine puis cette thèse de sciences qui voit enfin le jour. Merci à toi et Hugo pour les déménagements de kot à chaque début et fin d’année. A Germaine, Sandrine : mon plus grand bonheur est de voir dans votre regard l’estime et la fierté que vous me témoignez. A mon père et mon petit frère, les figures masculines de ma vie dont les souvenirs heureux résonnent et demeurent intacts comme « une madeleine de Proust » comme si c’était hier. A Amélie, mon âme sœur, la grande source de joie de mon existence qui partage mes doutes au quotidien. Tu es la personne qui a le plus subi cette thèse à cause de mes longues journées, mes weekends passés au laboratoire, à venir me chercher au laboratoire à 23h après ta journée de travail, même en étant enceinte. J’espère que notre fils qui est plus jeune que cette thèse apprenne de ta formidable personnalité et de ton intelligence.