DOCSLIB.ORG

Algoritm De Traducere În Limba Română Pentru Terminologia Histologica Și

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text
Algoritm De Traducere În Limba Română Pentru Terminologia Histologica Și Universitatea de Medicină și Farmacie “Carol Davila”, București Facultatea de Medicină LUCRARE DE LICENŢĂ “Algoritm de traducere în limba română pentru Terminologia Histologica și utilitare de mentenanță pentru un vocabular controlat” Coordonator științific: Conf. Univ. Dr. Luminița Iliuță Îndrumător: Asist. Univ. Dr. Marius Rac-Albu Absolvent Loredana Cîrstea 2014 DECLARAŢIE Subsemnata Loredana Cîrstea, absolventă a Facultăţii de Medicină din cadrul Universității de Medicină și Farmacie “Carol Davila,”, București, declar pe propria răspundere că lucrarea de licenţă cu titlul „Algoritm de traducere în limba română pentru Terminologia Histologica și utilitare de mentenanță pentru un vocabular controlat” este rezultatul muncii mele, pe baza cercetărilor mele şi pe baza informaţiilor obţinute din surse, inclusiv de pe Internet, care au fost citate şi indicate, conform normelor etice, în note şi în bibliografie. Declar că nu am folosit în mod tacit sau ilegal munca altora şi că nici o parte din lucrare nu încalcă drepturile de proprietate intelectuală ale cuiva, persoană fizică sau juridică. Declar că lucrarea nu a mai fost prezentată sub această formă vreunei instituţii de învăţământ superior din ţară sau străinătate în vederea obţinerii unui grad sau titlu ştiinţific ori didactic. București, 01.09.2014 Absolvent Loredana Cîrstea Cuprins Introducere ………………………………………………………………….. 5 Capitolul 1 - Transformarea mediului online într-un instrument științific de vizualizare, structurare și analiză a datelor …………………………………. 9 1.1. Conceptul de Semantic Web …………………………………………. 9 1.2. Software Liber și Date Deschise - bază pentru dezvoltarea cercetării științifice ……………………………………………………………… 11 1.3. Ontologii și computabilitate - bază pentru Semantic Web …………… 14 Capitolul 2 - O privire spre viitorul unei medicini computabile ……………. 17 Capitolul 3 - Ontologii medicale ……………………………………………. 19 3.1. Proiecte internaționale existente și în curs de dezvoltare …………….. 19 3.2. Ontologii și terminologii morfologice umane ………………………... 21 3.3. Terminologia Histologica și computabilitatea intrinsecă …………….. 24 Capitolul 4 - Limbajul R în cercetarea științifică și necesitatea computabilității calitative …………………………………………………… 26 Capitolul 5 - Alegerea temei ………………………………………………… 27 Capitolul 6 - Materiale și metode …………………………………………… 29 6.1. Ipoteză ………………………………………………………………… 29 6.2. Intenție ………………………………………………………………… 29 6.3. Materiale ………………………………………………………………. 30 6.4. Metode ………………………………………………………………… 34 Capitolul 7 – Rezultate ………………………………………………………. 45 7.1. Analiza lexicală a termenilor românești utilizați ……………………… 45 7.2. Rezultatele algoritmului de creare automată a corespondențelor dintre cuvintele latine și cele în limba română prin metoda distanței Levenshtein …………………………………………………………..... 46 7.3. Rezultatele algoritmului de creare automată a unei traduceri computabile în limba română prin metoda distanței Levenshtein …….. 47 7.4.Compararea variantelor de traducere ………………………………….. 48 Capitolul 8 - Discuții ………………………………………………………… 60 8.1. Interpretarea rezultatelor ……………………………………………… 60 8.2. Observații și discuții pe marginea celor 500 de concepte histologice … 61 8.2.1. Probleme legate de termenii oficiali ai Terminologia Histologica .. 61 8.2.2. Probleme legate de inconsecvența cuvintelor folosite în traducerile din limba română ………………………………………………… 61 8.2.3. Probleme legate de diferențele semantice dintre sensul latin și sensul în limba română ………………………………………….. 62 8.2.4. Probleme legate de definirea diferită a conceptelor în TH versus limba română ……………………………………………………... 62 8.2.5. Probleme legate de folosirea preponderentă a eponimelor în publicațiile românești …………………………………………….. 63 8.2.6. Probleme legate de multitudinea formelor utilizate în limba română ……………………………………………………………. 64 8.2.7. Probleme legate de lipsa de diferențiere pe concepte ale unor termeni identici ca formă …………………………………………. 64 8.3. Interpretare personală a potențialului de computabilitate pentru termenii histologici ……………………………………………………... 65 8.3.1. Criterii de computabilitate a termenilor …………………………... 65 8.3.2. Limba latină - limbă computabilă ………………………………… 66 8.3.3. Efectele computabilității …………………………………………. 67 8.4. Recomandări de extensie ………………………………………………. 68 Concluzii ……………………………………………………………………… 69 Bibliografie …………………………………………………………………… 70 Anexa 1 ……………………………………………………………………….. 77 Anexa 2 ……………………………………………………………………….. 94 Anexa 3 ……………………………………………………………………….. 94 Anexa 4 ……………………………………………………………………….. 95 Anexa 5 ……………………………………………………………………….. 96 Cuvinte cheie …………………………………………………………………. 97 Introducere Scopul prezentei lucrări este acela de a oferi un instrument de utilizare și menținere a Terminologia Histologica (TH), publicată de Federația Internațională a Asociațiilor de Anatomiști (International Federation of Associations of Anatomists - IFAA) (19), într-un format de tip vocabular controlat, contribuind la dezvoltarea proceselor de analiză calitativă a datelor și de indexare a acestora pe entitățile descrise. Pentru demonstrarea procesului, lucrarea de față propune de asemenea, o abordare lingvistico-funcțională pentru traducerea semi-automată a termenilor latini din TH în limba română, utilizând un lot de 500 de concepte. Conceptele au fost traduse utilizând termeni- sinonime din cinci publicații românești. A fost utilizată metoda Levenshtein pentru calcularea diferențelor dintre două șiruri de caractere, în scopul comparării termenilor și cuvintelor, pentru alegerea celui mai potrivit din punct de vedere al computabilității și pentru realizarea corespondențelor automate dintre cuvintele latine și cele în limba română după extragerea acestora din termeni. Motorul de traducere Google Translate1 a fost folosit în crearea a patru variante de traducere bazale și în procesul de creare automată a corespondențelor dintre cuvinte, fiind cel mai dezvoltat și accesibil utilitar de acest gen. Algoritmul va fi prezentat în integralitate în cadrul subcapitolului 6.4. Metode. Variantele de traducere rezultate au fost comparate calculând gradul de computabilitate și eficiență. Instrumentul de mentenanță, analiză și utilizare al ontologiei alcătuite astfel este creat în limbajul R pentru analize statistice (39), folosind interfața RStudio2. Adițional, lucrarea furnizează recomandări pentru crearea ontologiilor folosind computabilitatea morfo-semantică, în vederea realizării unui sistem automat de detectare a relațiilor dintre termeni. Lucrarea de față nu își propune prezentarea unei traduceri perfecte în limba română a celor 500 de termeni, ci dorește mai degrabă să accentueze necesitatea integrării principiilor semantice computaționale în procesul creării acestei traduceri perfecte - ce rămâne în sarcina histologilor și a lingviștilor. În concluzie, scopul lucrării este cel de a aduce în prim plan recomandările (internaționale și personale ) și tendințele bioinformaticii semantice, cu înfățișarea unui instrument de facilitare a întreținerii terminologiilor din punct de vedere computațional și semantic. 1 https://translate.google.com/ 2 http://www.rstudio.com/products/rstudio/download/ 5 Obiectivele generale sunt prezentarea contextului internațional referitor la conceptul de Semantic Web, împreună cu dezvoltarea bioinformaticii semantice, trecerea în revistă a proiectelor existente sau în curs de dezvoltare din aceste domenii, prezentarea standardelor folosite pentru alcătuirea ontologiilor, relevarea aplicațiilor și efectelor ce decurg din dezvoltarea bioinformaticii semantice, prezentarea terminologiei internaționale oficiale pentru domeniul histologiei și citologiei așa cum este astăzi, propunerea alinierii acestei terminologii la standardele bioinformaticii semantice, propunerea unor standarde semantice complementare dar specifice domeniului histologic, acătuirea unui utilitar de mentenanță și utilizare a unei ontologii (set de primitive reprezentaționale precum atribute, clase, relații între membrii claselor etc., prin care se modelează un domeniu de cunoaștere (16)) în limbajul R, cu demonstrarea unui algoritm de traducere semi-automată în limba română a TH bazată pe standarde de computabilitate (500 de concepte din cei 4254 ai TH), compararea computabilității acesteia cu variante obținute prin alte metode de traducere automată și cu traducerea uzuală în limba română a termenilor histologici echivalenți - așa cum sunt utilizați în prezent în mod nestandardizat -, demonstrarea eficienței și computabilității variantei personale de traducere, deschiderea acesteia către peer-review cu transformarea tuturor datelor în date deschise. Prelucrarea și analizarea datelor s-a realizat folosind limbajul R. În plus, lucrarea de față conține drept rezultat un pachet de cod în limbajul R care asigură managementul terminologiei. Acest instrument este primul de acest gen, oferind posibilitatea unei analize calitative a termenilor științifici și indexarea datelor prelucrate în R pe un vocabular controlat. Printre obiectivele adiționale ale prezentei lucrări se numără și prezentarea unui mod de lucru transparent pentru activitățile academice de cercetare, ce include trecerea la date deschise și realizarea unei integrări a științei medicale cu noțiunile de prelucrare a informației cu ajutorul sistemelor automate de calcul, integrare ce cade în domeniul bioinformaticii semantice în acest caz. Motivația alegerii acestei teme este legată de dorința îmbinării științelor medicale cu informatica, de posibilitatea creării unui sistem realmente utilizabil pentru dezvoltarea bioinformaticii semantice în domeniul
Load more

Recommended publications
  • Te2, Part Iii
    TERMINOLOGIA EMBRYOLOGICA Second Edition International Embryological Terminology FIPAT The Federative International Programme for Anatomical Terminology A programme of the International Federation of Associations of Anatomists (IFAA) TE2, PART III Contents Caput V: Organogenesis Chapter 5: Organogenesis (continued) Systema respiratorium Respiratory system Systema urinarium Urinary system Systemata genitalia Genital systems Coeloma Coelom Glandulae endocrinae Endocrine glands Systema cardiovasculare Cardiovascular system Systema lymphoideum Lymphoid system Bibliographic Reference Citation: FIPAT. Terminologia Embryologica. 2nd ed. FIPAT.library.dal.ca. Federative International Programme for Anatomical Terminology, February 2017 Published pending approval by the General Assembly at the next Congress of IFAA (2019) Creative Commons License: The publication of Terminologia Embryologica is under a Creative Commons Attribution-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-ND 4.0) license The individual terms in this terminology are within the public domain. Statements about terms being part of this international standard terminology should use the above bibliographic reference to cite this terminology. The unaltered PDF files of this terminology may be freely copied and distributed by users. IFAA member societies are authorized to publish translations of this terminology. Authors of other works that might be considered derivative should write to the Chair of FIPAT for permission to publish a derivative work. Caput V: ORGANOGENESIS Chapter 5: ORGANOGENESIS
    [Show full text]
  • Microanatomy of Muscles
    Microanatomy of Muscles Anatomy & Physiology Class Three Main Muscle Types Objectives: By the end of this presentation you will have the information to: 1. Describe the 3 main types of muscles. 2. Detail the functions of the muscle system. 3. Correctly label the parts of a myocyte (muscle cell) 4. Identify the levels of organization in a skeletal muscle from organ to myosin. 5. Explain how a muscle contracts utilizing the correct terminology of the sliding filament theory. 6. Contrast and compare cardiac and smooth muscle with skeletal muscle. Major Functions: Muscle System 1. Moving the skeletal system and posture. 2. Passing food through the digestive system & constriction of other internal organs. 3. Production of body heat. 4. Pumping the blood throughout the body. 5. Communication - writing and verbal Specialized Cells (Myocytes) ~ Contractile Cells Can shorten along one or more planes because of specialized cell membrane (sarcolemma) and specialized cytoskeleton. Specialized Structures found in Myocytes Sarcolemma: The cell membrane of a muscle cell Transverse tubule: a tubular invagination of the sarcolemma of skeletal or cardiac muscle fibers that surrounds myofibrils; involved in transmitting the action potential from the sarcolemma to the interior of the myofibril. Sarcoplasmic Reticulum: The special type of smooth endoplasmic Myofibrils: reticulum found in smooth and a contractile fibril of skeletal muscle, composed striated muscle fibers whose function mainly of actin and myosin is to store and release calcium ions. Multiple Nuclei (skeletal) & many mitochondria Skeletal Muscle - Microscopic Anatomy A whole skeletal muscle (such as the biceps brachii) is considered an organ of the muscular system. Each organ consists of skeletal muscle tissue, connective tissue, nerve tissue, and blood or vascular tissue.
    [Show full text]
  • The Interaction of the Thyroid Gland, Pineal Gland and Immune System in Chicken
    Vol. 6, Suppl. 2 79 The interaction of the thyroid gland, pineal gland and immune system in chicken Mykola E. Dzerzhynsky1, Olga I. Gorelikova, Andriy S. Pustovalov Department of Cytology, Histology and Development Biology, Kiev, Taras Shevchenko National University, Kiev, Ukraine Received: 7 October 2005; accepted: 15 September 2006 SUMMARY The interaction of immunological system, thyroid and pineal gland was studied in 5-week old males of Gallus domesticus. Several morphometri- cal parameters in pineal and thyroid glands were measured after bird im- munization with human red blood cells and/or treatment with melatonin or seduxen, a melatonin receptor blocker. The peak of the thyroid activity was found on Day 7 after immunization. The immune system appears to directly activate the thyroid gland only in the presence of certain level of melatonin. We suggest that the melatonin mechanism of action includes the enhancement of thyroid gland sensitivity to immune factors. Seduxen prevented the stimulatory influence of the immune system on the thyroid gland. Reproductive Biology 2006, 6, Suppl. 2:79–85. Key words: thyroid gland, immunization, pineal gland, melatonin, seduxen 1Corresponding author: Department of Cytology, Histology and Development Biology, Kiev, Taras Shevchenko National University, 64 Volodomyrska Str, 01033 Kiev, Ukraine; e-mail: [email protected] Copyright © 2006 by the Society for Biology of Reproduction 80 Immune-thyroid-pineal interactions in chicken INTRODUCTION Interrelationships of the endocrine, nervous and immune systems attract a lot of scientific attention [3]. Thyroid hormones (thyroxine: T4; triio- dothyronine), in addition to involvement in controlling energy production and protein and carbohydrate metabolism, stimulate the metamorphosis of lower vertebrates, control tissue growth and development, intensify oxida- tion and heat production as well as influence the functioning of the nervous system.
    [Show full text]
  • Skates and Rays Diversity, Exploration and Conservation – Case-Study of the Thornback Ray, Raja Clavata
    UNIVERSIDADE DE LISBOA FACULDADE DE CIÊNCIAS DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA ANIMAL SKATES AND RAYS DIVERSITY, EXPLORATION AND CONSERVATION – CASE-STUDY OF THE THORNBACK RAY, RAJA CLAVATA Bárbara Marques Serra Pereira Doutoramento em Ciências do Mar 2010 UNIVERSIDADE DE LISBOA FACULDADE DE CIÊNCIAS DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA ANIMAL SKATES AND RAYS DIVERSITY, EXPLORATION AND CONSERVATION – CASE-STUDY OF THE THORNBACK RAY, RAJA CLAVATA Bárbara Marques Serra Pereira Tese orientada por Professor Auxiliar com Agregação Leonel Serrano Gordo e Investigadora Auxiliar Ivone Figueiredo Doutoramento em Ciências do Mar 2010 The research reported in this thesis was carried out at the Instituto de Investigação das Pescas e do Mar (IPIMAR - INRB), Unidade de Recursos Marinhos e Sustentabilidade. This research was funded by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT) through a PhD grant (SFRH/BD/23777/2005) and the research project EU Data Collection/DCR (PNAB). Skates and rays diversity, exploration and conservation | Table of Contents Table of Contents List of Figures ............................................................................................................................. i List of Tables ............................................................................................................................. v List of Abbreviations ............................................................................................................. viii Agradecimentos ........................................................................................................................
    [Show full text]
  • Hearing Loss Epidemic the Hair Cell
    Hearing loss epidemic One in ten (30 million) Americans has hearing loss FUTURE THERAPIES FOR INNER - Causes include heredity, aging, noise exposure, disease EAR REGENERATION - Number is expected to double by 2030 Hearing loss is the #1 birth defect in America Albert Edge - 1 in 1000 newborns is born profoundly deaf Harvard Medical School - 2-3/1000 will have partial/progressive hearing loss Massachusetts Eye and Ear Infirmary Hearing loss prevalence increases with age - 1 in 3 over 65 years has significant hearing loss - Among seniors, hearing loss is the 3rd most prevalent condition 2 The inner ear The hair cell Auditory Hair Bundle Nerve Middle Ear Sensory hairs vibrate, "tip-links"open ion channels into hair cell Ions flow into hair cell, Inner Ear changing its electrical potential Hair External Ear Cells 3 4 1 The nerve fiber Sensorineural hearing loss: Hair cells and nerve fibers Cochlear Implant can directly stimulate Electric potential causes chemical neurotransmitter release from synapse Sensory Cell Loss NeurotransmitterNeurotransmitter diffuses to nerve fiber and excites electrical activity in the form of action potentials Hair Cell Nerve Fiber Loss 5 6 Regeneration of hair cells in chick inner ear Can stem cell-derived inner ear progenitors replace lost hair cells in vivo (and restore hearing)? Normal Hair Cells Damaged Hair Cells Regenerated Hair Cell Bundles Li et al., TMM (2004) 2 Approaches to regenerating inner ear cells Gene therapy I. Generation of inner ear cells by gene therapy • New hair cells: transfer Atoh1 gene II.
    [Show full text]
  • Vocabulario De Morfoloxía, Anatomía E Citoloxía Veterinaria
    Vocabulario de Morfoloxía, anatomía e citoloxía veterinaria (galego-español-inglés) Servizo de Normalización Lingüística Universidade de Santiago de Compostela COLECCIÓN VOCABULARIOS TEMÁTICOS N.º 4 SERVIZO DE NORMALIZACIÓN LINGÜÍSTICA Vocabulario de Morfoloxía, anatomía e citoloxía veterinaria (galego-español-inglés) 2008 UNIVERSIDADE DE SANTIAGO DE COMPOSTELA VOCABULARIO de morfoloxía, anatomía e citoloxía veterinaria : (galego-español- inglés) / coordinador Xusto A. Rodríguez Río, Servizo de Normalización Lingüística ; autores Matilde Lombardero Fernández ... [et al.]. – Santiago de Compostela : Universidade de Santiago de Compostela, Servizo de Publicacións e Intercambio Científico, 2008. – 369 p. ; 21 cm. – (Vocabularios temáticos ; 4). - D.L. C 2458-2008. – ISBN 978-84-9887-018-3 1.Medicina �������������������������������������������������������������������������veterinaria-Diccionarios�������������������������������������������������. 2.Galego (Lingua)-Glosarios, vocabularios, etc. políglotas. I.Lombardero Fernández, Matilde. II.Rodríguez Rio, Xusto A. coord. III. Universidade de Santiago de Compostela. Servizo de Normalización Lingüística, coord. IV.Universidade de Santiago de Compostela. Servizo de Publicacións e Intercambio Científico, ed. V.Serie. 591.4(038)=699=60=20 Coordinador Xusto A. Rodríguez Río (Área de Terminoloxía. Servizo de Normalización Lingüística. Universidade de Santiago de Compostela) Autoras/res Matilde Lombardero Fernández (doutora en Veterinaria e profesora do Departamento de Anatomía e Produción Animal.
    [Show full text]
  • Cell Structure and Function
    BIOLOGY Chapter 4: pp. 59-84 10th Edition Cell Structure and S. Sylvia Function Plasma membrane: outer surface that Ribosome: Fimbriae: regulates entrance site of protein synthesis hairlike bristles that and exit of molecules allow adhesion to Mader the surfaces Inclusion body: Conjugation pilus: stored nutrients for elongated, hollow later use appendage used for DNA transfer to other Nucleus: Mesosome: bacterial cells plasma membrane Cytoskeleton: maintains cell that folds into the Nucleoid: shape and assists cytoplasm and location of the bacterial movement of increases surface area chromosome cell parts: Endoplasmic Plasma membrane: reticulum: sheath around cytoplasm that regulates entrance and exit of molecules Cell wall: covering that supports, shapes, and protects cell Glycocalyx: gel-like coating outside cell wall; if compact, called a capsule; if diffuse, called a slime layer Flagellum: rotating filament present in some bacteria that pushes the cell forward *not in plant cells PowerPoint® Lecture Slides are prepared by Dr. Isaac Barjis, Biology Instructor 1 Copyright © The McGraw Hill Companies Inc. Permission required for reproduction or display Outline Cellular Level of Organization Cell theory Cell size Prokaryotic Cells Eukaryotic Cells Organelles Nucleus and Ribosome Endomembrane System Other Vesicles and Vacuoles Energy related organelles Cytoskeleton Centrioles, Cilia, and Flagella 2 Cell Theory Detailed study of the cell began in the 1830s A unifying concept in biology Originated from the work of biologists Schleiden and Schwann in 1838-9 States that: All organisms are composed of cells German botanist Matthais Schleiden in 1838 German zoologist Theodor Schwann in 1839 All cells come only from preexisting cells German physician Rudolph Virchow in 1850’s Cells are the smallest structural and functional unit of organisms 3 Organisms and Cells Copyright © The McGraw-Hill Companies, Inc.
    [Show full text]
  • Modelling Breast Epithelial-Endothelial Interaction in Three-Dimensional Cell Culture
    Modelling breast epithelial-endothelial interaction in three-dimensional cell culture A thesis submitted for the degree of Master of Science Sævar Ingþórsson Department of Medicine University of Iceland Instructors and Masters Project Committee: Þórarinn Guðjónsson, Ph.D Magnús Karl Magnússon, MD Kristján Leósson, Ph.D Reykjavik, Iceland September 2008 Samspil æðaþels og eðlilegs og illkynja þekjuvefjar úr brjóstkirtli í þrívíðri frumurækt Ritgerð til meistaragráðu Sævar Ingþórsson Háskóli Íslands Læknadeild Leiðbeinendur og meistaranámsnefnd: Þórarinn Guðjónsson, Ph.D Magnús Karl Magnússon, MD Kristján Leósson, Ph.D Reykjavík, September 2008 Ágrip Brjóstkirtillinn samanstendur af tveimur megingerðum þekjuvefsfruma, kirtilþekju- og vöðvaþekjufrumum. Saman mynda þessar frumugerðir hina greinóttu formgerð brjóstkirtilsins. Kirtilvefurinn er umlukinn æðaríkum stoðvef sem inniheldur margar mismunandi frumugerðir, þ.m.t. bandvefsfrumur og æðaþelsfrumur. Þroskun og sérhæfing kirtilsins er mjög háð samskiptum hans við millifrumuefni brjóstsins og frumur stoðvefjarins. Mest áhersla hefur verið lögð á rannsóknir á bandvefsfrumum í þessu tilliti, en minni athygli beint að æðaþelsfrumum, sem voru lengi taldar gegna því hlutverki einu að miðla súrefni og næringu um líkamann. Á síðustu árum hefur verið sýnt fram á að nýmyndun æða í krabbameinsæxlum spili stórt hlutverk í framþróun æxlisvaxtar og hefur það verið tengt slæmum horfum. Nýlegar rannsóknir hafa sýnt fram á mikilvægt hlutverk æðaþels í þroskun og sérhæfingu ýmissa líffæra, til dæmis í heila, lifur og beinmerg sem og í framþróun krabbameins. Nýleg þekking bendir einnig til mikilvægra áhrifa æðaþels á þroskun eðlilegs og illkynja brjóstvefjar. Markmið verkefnisins er að kanna áhrif brjóstaæðaþels á eðlilegar og illkynja brjóstaþekjufrumulínur og nota til þess þrívíð ræktunarlíkön sem þróuð voru á rannsóknastofunni, sem og að endurbæta þessi líkön til frekari rannsókna á samskiptum æðaþels og þekjufruma.
    [Show full text]
  • Cells of Adult Brain Germinal Zone Have Properties Akin to Hair Cells and Can Be Used to Replace Inner Ear Sensory Cells After Damage
    Cells of adult brain germinal zone have properties akin to hair cells and can be used to replace inner ear sensory cells after damage Dongguang Weia,1, Snezana Levica, Liping Niea, Wei-qiang Gaob, Christine Petitc, Edward G. Jonesa, and Ebenezer N. Yamoaha,1 aDepartment of Anesthesiology and Pain Medicine, Center for Neuroscience, Program in Communication and Sensory Science, University of California, 1544 Newton Court, Davis, CA 95618; bDepartment of Molecular Biology, Genentech, Inc., South San Francisco, CA 94080; and cUnite´deGe´ne´ tique et Physiologie de l’Audition, Unite´Mixte de Recherche S587, Institut National de la Sante´et de la Recherche Me´dicale-Universite´Paris VI, Colle`ge de France, Institut Pasteur, 25 Rue du Dr Roux, 75724 Paris, Cedex 15, France Edited by David Julius, University of California, San Francisco, CA, and approved October 27, 2008 (received for review August 15, 2008) Auditory hair cell defect is a major cause of hearing impairment, often and have an actin-filled process as in the HCs. Thus, we surmise that leading to spiral ganglia neuron (SGN) degeneration. The cell loss that cells of the adult forebrain germinal zone might be potential follows is irreversible in mammals, because inner ear hair cells (HCs) candidate cells to be used autologously for the replacement of have a limited capacity to regenerate. Here, we report that in the nonrenewable HCs and SGNs. adult brain of both rodents and humans, the ependymal layer of the Ependymal cells adjacent to the spinal canal proliferate exten- lateral ventricle contains cells with proliferative potential, which sively upon spinal cord injuries (16, 17).
    [Show full text]
  • Smelling Better with Chloride COMMENTARY Stephan Fringsa,1
    COMMENTARY Smelling better with chloride COMMENTARY Stephan Fringsa,1 The sense of smell and its astonishing performance coding is the solution to the problem of low-selectivity pose biologists with ever new riddles. How can the receptors (2). system smell almost anything that gets into the nose, However, the necessity to operate OSNs with fuzzy distinguish it from countless other odors, memorize odorant receptors creates another problem, as it limits it forever, and trigger reliably adequate behavior? the efficacy of the transduction process. OSNs trans- Among the senses, the olfactory system always duce chemical signals through a metabotropic path- seems to do things differently. The olfactory sensory way (Fig. 1A). Such pathways translate external stimuli neurons (OSNs) in the nose were suggested to use an into cellular responses by G-protein–coupled recep- unusual way of signal amplification to help them in tors. Their efficacy depends on the duration of recep- responding to weak stimuli. This chloride-based tor activity: the longer the receptor is switched on, the mechanism is somewhat enigmatic and controversial. more G protein can be activated. This is well studied in A team of sensory physiologists from The Johns photoreceptors, where the rhodopsin molecule may Hopkins University School of Medicine has now de- stay active for more than a second after absorbing a veloped a method to study this process in detail. photon. Within this time, it can activate hundreds of G Li et al. (1) demonstrate how OSNs amplify their proteins, one after the other, thus eliciting a robust electrical response to odor stimulation using chlo- cellular response to a single photon.
    [Show full text]
  • Gli1+ Pericyte Loss Induces Capillary Rarefaction and Proximal Tubular Injury
    BRIEF COMMUNICATION www.jasn.org Gli1+ Pericyte Loss Induces Capillary Rarefaction and Proximal Tubular Injury † ‡ ‡ ‡ Rafael Kramann,* Janewit Wongboonsin, § Monica Chang-Panesso, Flavia G. Machado, and ‡ Benjamin D. Humphreys *Renal Division, Brigham and Women’s Hospital, Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts; †Division of Nephrology and Clinical Immunology, RWTH Aachen University Medical Faculty, RWTH Aachen University, Aachen, Germany; ‡Division of Nephrology, Department of Medicine, Washington University School of Medicine in St. Louis, St. Louis, Missouri; and §Department of Medicine, Siriraj Hospital, Mahidol University, Bangkok, Thailand ABSTRACT Peritubular capillary rarefaction is hypothesized to contribute to the increased risk of after AKI, and whether pericyte loss is future CKD after AKI. Here, we directly tested the role of Gli1+ kidney pericytes in the sufficient to induce peritubular capillary maintenance of peritubular capillary health, and the consequences of pericyte loss loss and altered morphology. during injury. Using bigenic Gli1-CreERt2; R26tdTomato reporter mice, we observed We genetically labeled pericytes using increased distance between Gli1+ pericytes and endothelial cells after AKI (mean6 Gli1-CreERt2 mice crossed against SEM: 3.360.1 mm before injury versus 12.560.2 mm after injury; P,0.001). Using a the R26tdTomato reporter mouse (Gt genetic ablation model, we asked whether pericyte loss alone is sufficient for capillary (ROSA)26Sortm9(CAF-tdTomato)Hze/J; destabilization. Ten days after pericyte ablation, we observed endothelial cell damage Figure 1A). After tamoxifen injection, mice by electron microscopy. Furthermore, pericyte loss led to significantly reduced capil- were subjected to severe unilateral ische- lary number at later time points (mean6SEM capillaries/high-power field: 67.664.7 in mia reperfusion injury (IRI; 28-minute control versus 44.164.8 at 56 days; P,0.05) and increased cross-sectional area (mean6 clamp).
    [Show full text]
  • Sweat Gland Myoepithelial Cell Differentiation
    Journal of Cell Science 112, 1925-1936 (1999) 1925 Printed in Great Britain © The Company of Biologists Limited 1999 JCS4638 Human sweat gland myoepithelial cells express a unique set of cytokeratins and reveal the potential for alternative epithelial and mesenchymal differentiation states in culture Margarete Schön1,*, Jennifer Benwood1, Therese O’Connell-Willstaedt2 and James G. Rheinwald1,2,‡ 1Division of Dermatology/Department of Medicine, Brigham and Women’s Hospital, and 2Division of Cell Growth and Regulation, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA *Present address: Department of Dermatology, Heinrich-Heine University, Moorenstrasse 5, 40225 Düsseldorf, Germany ‡Author for correspondence (e-mail: [email protected]) Accepted 9 April; published on WWW 26 May 1999 SUMMARY We have characterized precisely the cytokeratin expression myoepithelial cells, a constituent of secretory glands. pattern of sweat gland myoepithelial cells and have Immunostaining of skin sections revealed that only sweat identified conditions for propagating this cell type and gland myoepithelial cells expressed the same pattern of modulating its differentiation in culture. Rare, unstratified keratins and α-sma and lack of E-cadherin as the cell type epithelioid colonies were identified in cultures initiated we had cultured. Interestingly, our immunocytochemical from several specimens of full-thickness human skin. These analysis of ndk, a skin-derived cell line of uncertain cells divided rapidly in medium containing serum, identity, suggests that this line is of myoepithelial origin. epidermal growth factor (EGF), and hydrocortisone, and Earlier immunohistochemical studies by others had found maintained a closely packed, epithelioid morphology when myoepithelial cells to be K7-negative.
    [Show full text]