100% 50% 0% Bos Taurus:30 Bos:30 Bovinae:30 Ovis Aries
Total Page:16
File Type:pdf, Size:1020Kb
100% 50% 0% Cloning vector pSTn5-KM:1 Cloning vector pET-Int:2 Expression vector pNIC-NHT-CTB:1 Expression vector L190-2:1 MoClo level 0 destination vector pL0-SC:1 synthetic construct:3 Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1:1 Deep-sea thermophilic phage D6E:5 Geobacillus virus E2:3 Myoviridae:1 Bacillus phage SIOphi:1 Lambdalikevirus:1 Enterobacteria phage HK630:1 Caudovirales:18 Mycobacterium phage SiSi:1 Propionibacterium phage P100_1:3 Propionibacterium phage P105:2 Siphoviridae:17 Propionibacterium phage P101A:1 Propionibacterium phage P9.1:1 Viruses:31 Staphylococcus phage StB20:2 Mycobacterium phage Charlie:1 Lactococcus phage 949:1 Propionibacterium phage PAS50:1 Staphylococcus phage CNPH82:1 Propionibacterium phage PA6:1 Staphylococcus phage 53 sensu lato:1 Retroviridae:1 Orthoretrovirinae:1 Gammaretrovirus:1 Murine leukemia virus:1 Paramecium bursaria Chlorella virus Can18-4:1 Phycodnaviridae:2 Chlorovirus:2 Chlorella virus:1 Microviridae:1 Microvirus:1 Enterobacteria phage phiX174 sensu lato:1 Chlamydiae/Verrucomicrobia group:2 Verrucomicrobia:2 Verrucomicrobiae:2 Verrucomicrobiales:2 Verrucomicrobiaceae:2 Akkermansia:2 Akkermansia muciniphila:2 Candidatus Amoebophilus:1 Candidatus Amoebophilus asiaticus:1 Niastella:2 Niastella koreensis:2 Chitinophaga:1 Chitinophaga pinensis:1 Sphingobacteriia:5 Sphingobacteriales:5 Sphingobacteriaceae:1 Solitalea:1 Solitalea canadensis:1 Bacteroidetes/Chlorobi group:21 Bacteroidetes:21 Saprospiraceae:1 Saprospira:1 Saprospira grandis:1 Polaribacter:1 Polaribacter sp. MED152:1 Flavobacterium:1 Flavobacterium columnare:1 Flavobacteriia:5 Flavobacteriales:5 Flavobacteriaceae:5 Capnocytophaga:1 Capnocytophaga canimorsus:1 Cellulophaga:2 Cellulophaga lytica:2 Porphyromonas:1 Porphyromonas gingivalis:1 Porphyromonadaceae:2 Odoribacter:1 Odoribacter splanchnicus:1 Bacteroidia:6 Bacteroidales:6 Prevotellaceae:3 Prevotella:3 Prevotella melaninogenica:3 Bacteroidaceae:1 Bacteroides:1 Bacteroides xylanisolvens:1 uncultured Cytophagia bacterium:1 Cytophagia:4 Emticicia:1 Emticicia oligotrophica:1 Cytophagales:3 Cytophagaceae:3 Spirosoma:1 Spirosoma linguale:1 Cytophaga:1 Cytophaga hutchinsonii:1 uncultured bacterium HF130_01F24:1 uncultured bacterium 164:1 uncultured bacterium:9 Deinococcus-Thermus:1 Deinococci:1 Deinococcales:1 Trueperaceae:1 Truepera:1 Truepera radiovictrix:1 Chloroflexi:1 Thermomicrobia:1 Sphaerobacteridae:1 Sphaerobacterales:1 Sphaerobacterineae:1 Sphaerobacteraceae:1 Sphaerobacter:1 Sphaerobacter thermophilus:1 Thermodesulfobacteria:1 Thermodesulfobacteria:1 Thermodesulfobacteriales:1 Thermodesulfobacteriaceae:1 Thermodesulfobacterium:1 Thermodesulfobacterium geofontis:1 Aquificae:1 Aquificae:1 Desulfurobacteriales:1 Desulfurobacteriaceae:1 Desulfurobacterium:1 Desulfurobacterium thermolithotrophum:1 Synergistetes:1 Synergistia:1 Synergistales:1 Synergistaceae:1 Thermanaerovibrio:1 Thermanaerovibrio acidaminovorans:1 Stanieria:2 Stanieria cyanosphaera:2 Pleurocapsales:4 Chroococcidiopsis thermalis:1 Chroococcidiopsis:2 uncultured Chroococcidiopsis sp.:1 Anabaena:1 Anabaena cylindrica:1 Nostocales:3 Nostocaceae:3 Trichormus:1 Trichormus azollae:1 Nostoc:1 Nostoc sp. PCC 7120:1 Cyanobacteria:15 Halothece:2 Halothece sp. PCC 7418:2 Chroococcales:4 Cyanobacterium:1 Cyanobacterium aponinum:1 Chamaesiphon:1 Chamaesiphon minutus:1 Oscillatoriophycideae:8 Geitlerinema:1 Geitlerinema sp. PCC 7407:1 Oscillatoriales:4 Leptolyngbya boryana:2 Leptolyngbya:3 Leptolyngbya sp. PCC 7410:1 Planctomycetes:1 Planctomycetia:1 Planctomycetales:1 Planctomycetaceae:1 Gemmata:1 Gemmata obscuriglobus:1 Desulfovibrionales:3 Desulfovibrionaceae:3 Lawsonia:3 Lawsonia intracellularis:3 Deltaproteobacteria:5 uncultured myxobacterium HF0010_08B07:1 Myxococcales:2 delta/epsilon subdivisions:8 Sorangiineae:1 Polyangiaceae:1 Sorangium:1 Sorangium cellulosum:1 Campylobacter coli:1 Epsilonproteobacteria:3 Campylobacterales:3 Campylobacteraceae:3 Campylobacter:3 Campylobacter jejuni:2 Campylobacter jejuni subsp. doylei:2 Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063:1 Candidatus Pelagibacter:2 Candidatus Pelagibacter ubique:1 Caulobacterales:2 Caulobacteraceae:2 Phenylobacterium:2 Phenylobacterium zucineum:2 Rhizobiaceae:1 Candidatus Liberibacter:1 Liberibacter crescens:1 Methylocystaceae:1 Methylocystis:1 Methylocystis sp. SC2:1 Bradyrhizobiaceae:1 Rhodopseudomonas:1 Rhodopseudomonas palustris:1 Rhizobiales:8 Bartonella vinsonii:1 Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii:1 Bartonella quintana:1 Alphaproteobacteria:17 Bartonellaceae:5 Bartonella:5 Bartonella schoenbuchensis:1 Bartonella sp. BR10:1 Bartonella bacilliformis:1 Ketogulonicigenium:1 Ketogulonicigenium vulgare:1 Rhodobacterales:2 Rhodobacteraceae:2 Ruegeria:1 Ruegeria sp. TM1040:1 Zymomonas:1 Zymomonas mobilis:1 Zymomonas mobilis subsp. pomaceae:1 Sphingomonadales:2 Sphingomonadaceae:2 Sphingomonas:1 Sphingomonas sp. KT0216:1 unknown marine alpha proteobacterium JP22.1:1 Simiduia:1 Simiduia agarivorans:1 uncultured gamma proteobacterium HF0130_23I23:1 Calyptogena okutanii thioautotrophic gill symbiont:7 Candidatus Ruthia magnifica:2 Candidatus Baumannia cicadellinicola:2 Frischella:1 Frischella perrara:1 Orbales:2 Orbaceae:2 Gilliamella:1 Gilliamella apicola:1 Xanthomonadales:2 Xanthomonadaceae:2 Xylella:2 Xylella fastidiosa:2 Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa:2 Chromatiales:1 Chromatiaceae:1 Nitrosococcus:1 Nitrosococcus halophilus:1 Legionella pneumophila:7 Legionella pneumophila subsp. pneumophila:7 Legionellales:13 Legionellaceae:13 Legionella:13 Legionella longbeachae:6 Aeromonadales:3 Aeromonadaceae:3 Aeromonas:3 Aeromonas hydrophila:3 Halomonadaceae:1 Candidatus Portiera:1 Candidatus Portiera aleyrodidarum:1 Alcanivoracaceae:2 Kangiella:2 Kangiella koreensis:2 Oceanospirillales:13 Oleispira:4 Oleispira antarctica:4 Proteobacteria:509 Thalassolituus:1 Thalassolituus oleivorans:1 Oceanospirillaceae:10 Marinomonas posidonica:3 Marinomonas:5 Marinomonas mediterranea:1 Marinomonas sp. MWYL1:1 Cardiobacteriales:5 Cardiobacteriaceae:5 Dichelobacter:5 Dichelobacter nodosus:5 Francisella noatunensis:1 Francisella noatunensis subsp. orientalis:1 Francisellaceae:11 Francisella:11 Francisella tularensis subsp. holarctica:1 Francisella tularensis subsp. novicida:5 Francisella tularensis:10 Bacteria:2117 Gammaproteobacteria:267 Francisella tularensis subsp. mediasiatica:1 Francisella tularensis subsp. tularensis:3 Thiotrichales:23 Cycloclasticus zancles:3 Cycloclasticus:4 Cycloclasticus sp. P1:1 Methylophaga nitratireducenticrescens:3 Piscirickettsiaceae:12 Methylophaga:5 Methylophaga frappieri:2 Thioalkalimicrobium:2 Thioalkalimicrobium cyclicum:2 Thiomicrospira:1 Thiomicrospira crunogena:1 Glaciecola:4 Glaciecola psychrophila:4 Alteromonadaceae:5 Alteromonas:1 Alteromonas macleodii:1 Psychromonas sp. CNPT3:1 Psychromonadaceae:3 Psychromonas:3 Psychromonas ingrahamii:2 Shewanella baltica:3 Alteromonadales:22 Shewanella piezotolerans:1 Shewanella pealeana:1 Shewanellaceae:10 Shewanella:10 Shewanella putrefaciens:2 Shewanella frigidimarina:2 Shewanella denitrificans:1 Colwelliaceae:4 Colwellia:4 Colwellia psychrerythraea:4 Aliivibrio salmonicida:4 Aliivibrio:7 Aliivibrio fischeri:3 Photobacterium damselae:2 Photobacterium damselae subsp. damselae:2 Photobacterium:6 Vibrionales:19 Vibrionaceae:19 Photobacterium profundum:4 Vibrio alginolyticus:1 Vibrio anguillarum:2 Vibrio:6 Vibrio cholerae:1 Vibrio splendidus:1 Vibrio agarivorans:1 Pseudomonas putida:1 Pseudomonas stutzeri:1 Pseudomonadaceae:4 Pseudomonas:4 Pseudomonas fulva:1 Pseudomonas aeruginosa:1 Psychrobacter sp. G:2 Pseudomonadales:34 Psychrobacter:4 Psychrobacter cryohalolentis:2 Acinetobacter calcoaceticus:3 Acinetobacter oleivorans:3 Moraxellaceae:30 Acinetobacter:23 Acinetobacter baumannii:13 Acinetobacter sp. ADP1:4 Moraxella:3 Branhamella:3 Moraxella catarrhalis:3 Escherichia:1 Escherichia coli:1 Klebsiella:1 Klebsiella oxytoca:1 Candidatus Aschnera:1 Candidatus Aschnera chinzeii:1 Serratia:2 Serratia symbiotica:2 Candidatus Blochmannia chromaiodes:1 Candidatus Blochmannia:2 Candidatus Blochmannia vafer:1 Arsenophonus:11 Arsenophonus nasoniae:11 Candidatus Ishikawaella:4 Candidatus Ishikawaella capsulata:4 Dickeya:2 Dickeya dadantii:2 Yersinia:1 Yersinia pseudotuberculosis:1 Proteus:7 Proteus mirabilis:7 Salmonella enterica subsp. enterica:2 Salmonella:3 Salmonella enterica:3 Salmonella enterica subsp. arizonae:1 Candidatus Hamiltonella:3 Candidatus Hamiltonella defensa:3 Enterobacteriales:55 Enterobacteriaceae:55 Xenorhabdus:4 Xenorhabdus nematophila:4 Photorhabdus asymbiotica:3 Photorhabdus:4 Photorhabdus luminescens:1 Photorhabdus luminescens subsp. laumondii:1 Buchnera:8 Buchnera aphidicola:8 secondary endosymbiont of Glycaspis brimblecombei:1 Mannheimia:2 Mannheimia haemolytica:2 Bibersteinia:6 Bibersteinia trehalosi:6 Actinobacillus:2 Actinobacillus suis:2 Pasteurella:4 Pasteurella multocida:4 Pasteurella multocida subsp. multocida:2 Gallibacterium:7 Gallibacterium anatis:7 Pasteurellales:62 Pasteurellaceae:62 Aggregatibacter actinomycetemcomitans:3 Aggregatibacter:6 Aggregatibacter aphrophilus:3 Histophilus:2 Histophilus somni:2 Avibacterium:1 Avibacterium paragallinarum:1 Haemophilus parainfluenzae:4 Haemophilus influenzae:14 Haemophilus:32 Haemophilus parasuis:6 Haemophilus ducreyi:8 beta proteobacterium CB:2 Candidatus Profftella:10 Candidatus Profftella armatura:10 Kinetoplastibacterium blastocrithidii:7 Candidatus Kinetoplastibacterium galatii:1 Kinetoplastibacterium:22 Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii:2 Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii:2 Candidatus Kinetoplastibacterium