Genotypes of cultivars and native species by CAPS marker as Rank A Z: 213 CAPS marker and 37 cultivars and native species CAPS marker Target of genome AGI map info Native species or hybrid cultivar/ Cultivar number/ Seed parent/ Pollen parent/ Species or cultivar name/ Scientific name y Haploid Native specie (Funder) Native speices (Hybrid) Hybrid cutivar Other native speices CV16 CV04 CV08 CV09 CV10 CV11 CV12 CV13 CV23 CV14 CV03 CV15 CV05 CV17 CV18 CV19 CV20 CV21 CV22 CV24 CV25 CV26 CV27 CV28 CV29 CV30 CV31 CV32 CV34 CV35 CV36 CV37 CV38 CV01 CV02 CV06 CV07 CV08 Willowleaf y CV03 CV11 CV05 CV05 CV05 CV05 CV05 CV23 CV23 CV05 CV05 CV05 CV04 CV03 CV03 CV17 E-647 y CV03 CV03CV11 CV05CV03 CV05CV17 CV10 CV04 CV04 Willowleaf y CV17 CV12 CV12 CV12 CV04 CV13 CV13 CV24 CV25 CV03 CV15 CV15 CV17 CV12 CV03 CV12 (CV23CV13)CV15 CV24CV15 Murcot y Sweet Satusma Locus name Restriction Enzyme Transcript ID Scaffold Start End AGI_LG AGI_cM Clementine Mato Naga Buddha's Kishu Kunenbo King Dancy Willowleaf x (Miyagawa- Clementine Encore Amaka Youkou Shiranuhi Harumi Nishinokaori Mineola Seminole Seihou Akemi Tsunokaori Ariake Nankou Mihocole Harayaka Harehime Hayaka Southern Red Amakusa Setoka Tachibana Koji haploid buntan (Dancan) kinkan hand (Trovita) wase)

C. Citrus C. Fortunell C. C. nobilis C. C. clementina sinensis kinokuni C. grandis C. nobilis C. paradisi C. deliciosa C. clementina a C. tachibana leiocarpa Lour. var. reticulata tangerina C. unshiu Marc. C. medica L. hort. ex (L.) hort. ex Osbeck Lour. Macf. Tenore hort. ex Tanaka margaria Tanaka hort. ex knip Tanaka Blanco Tanaka Tanaka Osbeck Tanaka Swingle Tanaka Al0630 Dra1 Ciclev10008681m 1 487,184 489,198 a ab ab bb ab bb ab ab ab ab aa ab aa bb ab ab ab aa aa ab aa aa aa aa bb aa ab ab - - - - - bb bb bb bb Tf0226 Pvu2 Ciclev10008836m 1 526,813 529,150 a aa ab - ab bb ab ab aa ab aa ab aa bb ab ab ab aa aa ab aa aa aa aa ab aa ab ab aa aa ab ab aa sp aa aa aa Cp0741 Hinc2 Ciclev10008230m 1 3,746,864 3,749,903 AGI-01 75.96 a ab ab ab ab aa aa aa ab ab bb aa ab aa aa aa aa aa ab ab ab ab bb ab aa ab ab aa bb ab ab aa aa sp aa aa ab Bf0011 Xba1 Ciclev10008900m 1 4,722,889 4,726,339 AGI-01 67.33 b ab ab aa ab ab bb bb aa bb aa bb ab bb ab bb bb bb ab ab ab ab aa ab bb ab ab bb aa ab ab bb ab aa aa ab ab Mf0033 Rsa1 Ciclev10010044m 1 6,227,617 6,228,389 AGI-01 62.57 b ab ab ab ab ab bb bb ab bb aa bb ab bb ab bb bb bb ab ab ab ab aa ab bb ab ab bb - - - - - bb sp bb bb Cp2210 Hha1 Ciclev10007886m 1 8,125,279 8,130,885 b ab ab ab ab aa ab ab ab ab aa ab ab aa aa ab ab ab ab aa ab ab aa ab ab aa aa ab aa aa aa ab ab - aa ab ab Cp1624 Msp1 Ciclev10008537m 1 18,068,297 18,070,262 AGI-01 58.42 b ab ab ab ab aa ab ab ab ab aa ab ab aa aa ab bb ab bb aa ab ab ab ab aa aa aa ab ab aa aa ab ab bb bb bb ab Bf0036 Msp1 Ciclev10008751m 1 22,840,947 22,844,111 AGI-01 29.14 b ab ab aa ab ab ab ab aa aa aa bb ab ab ab bb bb ab bb aa ab ab ab ab ab ab aa aa ab ab aa ab ab aa bb ab aa Al0636 EcoR1 Ciclev10007493m 1 23,776,796 23,782,088 AGI-01 27.49 b ab aa bb aa aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa ab ab ab bb aa aa ab ab ab aa aa aa aa ab aa aa ab ab sp aa aa aa Tf0168 Rsa1 Ciclev10007563m 1 24,898,769 24,905,716 AGI-01 25.75 a bb aa - ab ab ab ab bb ab ab bb bb - bb bb bb bb bb ab - bb bb bb bb ab ab ab ab ab ab bb bb bb bb ab bb Wy0028 Dra1 Ciclev10007806m 1 25,001,341 25,004,726 AGI-01 26.17 b ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa ab ab ab aa ab aa ab bb aa aa ab ab ab - ab ab aa ab aa aa ab ab aa ab aa aa Mf0086 Dra1 Ciclev10009756m 1 25,592,494 25,593,617 AGI-01 26.43 a ab aa bb aa aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa ab aa ab bb aa aa aa ab ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab bb aa ab ab Cp1998 Mlu1 Ciclev10009395m 1 25,761,570 25,764,926 a bb aa bb ab ab ab ab bb ab ab bb ab ab ab bb bb ab bb ab bb ab bb bb bb ab ab ab ab ab ab bb bb bb bb ab bb Al0407 Hind3 Ciclev10009315m 1 26,576,059 26,578,193 AGI-01 31.24 a ab aa bb aa aa aa aa ab aa aa aa ab aa aa ab aa aa ab aa aa aa ab ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab bb bb aa aa If0008 Hind3 Ciclev10009315m 1 26,576,059 26,578,193 a ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa aa ab aa aa ab aa aa ab aa aa aa ab ab ab aa aa aa - - - - - bb bb aa aa Tf0163 Pvu2 Ciclev10010423m 1 26,740,822 26,744,016 AGI-01 31.24 a ab aa - aa aa aa aa ab aa aa aa ab - aa ab aa aa ab aa - aa ab ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa ab Cp0632 Hind3 Ciclev10007941m 1 27,698,934 27,703,620 AGI-08 56.72 b ab aa ab ab aa aa aa ab aa ab aa ab aa aa ab aa aa ab aa ab aa ab bb ab aa ab aa ab aa aa ab ab bb bb aa ab Cp0671 Msp1 Ciclev10009489m 1 28,353,948 28,356,507 AGI-01 36.11 a ab aa ab ab aa aa aa ab aa ab aa ab aa aa aa aa aa ab aa ab aa ab bb ab aa ab aa ab aa aa ab ab sp aa aa aa Tf0264 Hha1 Ciclev10015873m 2 248,256 250,675 AGI-06 103.73 a aa ab - aa ab aa aa aa aa ab aa ab - ab ab aa aa ab aa aa aa ab bb aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa Ks9005 Msp1 Ciclev10015338m 2 290,799 294,122 AGI-02 13.65 a ab ab ab ab aa aa aa ab aa ab aa bb aa ab ab ab ab bb ab ab bb bb ab ab ab ab aa aa ab aa ab ab aa bb ab sp Ks9003 Msp1 Ciclev10014733m 2 8,436,110 8,440,408 a ab aa ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab aa aa - - - - - bb bb bb ab Tf0042.2 Hha1 Ciclev10016820m 2 9,338,651 9,341,271 a aa ab - aa aa aa aa aa aa aa ab aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa ab aa aa aa ab aa bb ab ab Cp1880 Nde2 Ciclev10016235m 2 9,351,630 9,354,621 a ab ab bb aa bb bb bb bb ab aa ab aa bb ab ab ab ab aa bb bb ab ab aa ab aa ab bb ab ab bb ab bb sp bb bb bb Ov0422 Hha1 Ciclev10016314m 2 11,071,587 11,074,479 a ab aa bb aa aa aa aa bb aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab aa aa aa aa aa aa - - - - - bb bb aa ab Cp1885 Nde2 Ciclev10014471m 2 11,418,331 11,422,116 b ab ab sp ab aa ab ab aa aa ab ab ab aa aa aa ab aa ab ab ab aa bb ab ab bb aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab aa Cp1216 Hinf1 Ciclev10017113m 2 12,112,790 12,113,903 AGI-06 76.91 b ab aa aa aa bb ab ab aa aa aa ab ab ab aa ab bb ab ab aa aa aa ab aa ab ab aa bb ab ab ab aa ab aa aa aa ab Fb0301 Hinc2 Ciclev10014804m 2 14,143,537 14,146,003 AGI-06 92.73 a ab ab bb ab aa aa aa bb aa ab aa ab aa ab ab aa aa ab ab ab bb aa ab aa aa ab aa - - - - - aa aa aa aa Ov0403 Hha1 Ciclev10016280m 2 23,891,814 23,893,095 AGI-06 61.78 a ab aa bb ab aa aa aa bb aa aa aa ab aa aa aa ab ab aa ab ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa - ab ? bb bb aa ab Al0635 Msp1 Ciclev10015354m 2 26,435,540 26,438,838 AGI-06 69.20 a ab aa bb ab ab aa aa bb aa aa aa ab aa aa aa ab ab aa ab ab aa ab aa aa aa aa aa - - - - - aa aa aa aa Al0224 Hind3 Ciclev10015872m 2 26,630,154 26,632,900 AGI-06 67.12 a ab ab bb ab ab aa aa bb ab aa ab ab ab ab aa ab ab aa ab ab aa ab aa ab ab ab aa ab aa - ab ab bb bb bb bb Cp0431 HInf1 Ciclev10015731m 2 27,084,177 27,089,027 AGI-06 60.66 b ab aa aa aa aa bb ab aa ab aa ab aa aa aa ab ab ab ab ab ab ab ab aa ab aa aa ab aa ab - aa aa aa aa aa ab Al0602 Msp1 Ciclev10017248m 2 27,141,148 27,141,869 a ab aa bb ab ab aa aa bb aa aa aa ab aa aa aa ab ab aa ab ab aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa ab aa aa - aa aa Tf0343 Rsa1 Ciclev10016587m 2 29,204,680 29,206,501 AGI-06 44.39 - bb aa - ab ab ab ab bb aa aa ab ab aa aa - bb ab ab ab ab aa ab aa ab aa aa ab aa ab aa ab ab ab bb aa - Ov0412 Rsa1 Ciclev10015053m 2 31,036,088 31,038,222 AGI-06 42.11 b bb aa bb ab ab ab ab bb ab aa bb ab ab ab bb bb ab ab ab ab aa ab aa bb ab aa bb ab ab aa bb ab bb bb bb bb Tf0432 Rsa1 Ciclev10016685m 2 31,420,457 31,425,299 AGI-06 38.96 - ab aa - ab ab ab ab aa aa aa ab ab aa aa bb bb ab ab aa - aa ab aa bb aa aa - ab ab aa ab ab aa aa aa ab Wy0056 Hae3 Ciclev10014198m 2 31,740,431 31,747,095 AGI-06 36.79 b ab bb ab ab ab bb bb ab bb ab bb bb bb bb bb bb bb bb bb bb bb bb ab bb bb bb bb ab bb bb ab bb ab bb bb bb Al0633 Msp1 Ciclev10015092m 2 33,837,403 33,842,156 b bb aa bb ab ab ab ab bb aa aa ab ab ab aa bb bb ab ab ab ab ab ab ab bb ab ab ab ab ab bb bb bb aa aa aa aa Cp0537 BamH1 Ciclev10016779m 2 34,189,216 34,193,815 AGI-06 25.93 b bb aa bb ab ab ab ab bb aa aa ab ab ab aa bb ab bb ab ab ab ab ab ab bb ab ab ab ab ab bb bb bb aa bb aa ab Cp0537 Hha1 Ciclev10016779m 2 34,189,216 34,193,815 AGI-06 25.93 b ab bb bb ab ab ab ab bb bb bb ab ab ab bb aa ab aa ab bb bb ab ab ab ab ab ab ab ab ab aa ab aa bb bb bb ab Tf0344 Xba1 Ciclev10016433m 2 34,624,236 34,631,123 AGI-06 24.22 - ab bb - ab ab ab ab bb bb bb ab ab ab bb - aa ab ab bb bb ab ab ab ab ab ab ab ab - ab ab aa bb bb bb - Cp0384 Hae3 Ciclev10015162m 2 35,422,598 35,425,980 AGI-06 19.00 b aa bb aa ab ab aa ab aa bb bb ab ab ab bb aa ab - ab ab ab ab ab ab aa ab ab ab ab ab aa aa aa - - bb ab Tf0119 Hinc2 Ciclev10014416m 2 35,564,238 35,570,619 AGI-06 19.00 a aa bb aa ab aa ab ab aa bb bb ab ab ab bb aa ab aa ab ab ab aa ab ab aa ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa bb ab Vt0001 EcoR1 Ciclev10014290m 2 35,624,935 35,628,855 AGI-06 16.33 b aa bb aa ab ab ab ab aa bb bb ab ab ab bb aa aa ab ab ab ab aa ab ab aa ab ab ab ab bb bb ab ab aa aa bb ab Cp0635 Dra1 No annotation 2 35,637,132 35,637,288 AGI-06 17.03 b aa bb aa ab ab ab ab aa bb bb ab ab ab bb aa ab aa ab ab ab aa ab ab aa ab ab ab ab ab aa aa aa bb bb bb ab Gn0073 Sty1 Ciclev10014770m 2 35,895,662 35,898,841 AGI-06 12.40 a aa bb aa ab ab aa ab aa bb bb ab ab ab bb aa aa ab ab ab ab aa ab ab aa ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa bb ab Al0320.2 Hind3 Ciclev10020878m 3 541,575 543,121 b ab bb aa ab aa aa bb ab bb ab ab ab ab ab ab ab ab bb ab ab ab aa ab bb aa ab aa - - - - - aa aa bb ab Mf0039 Hinf1 No annotation 3 1,635,255 1,636,043 AGI-05 5.51 a aa bb aa ab aa ab ab aa bb ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa ab aa Lp0021 Dra1 Ciclev10021502m 3 1,771,668 1,774,647 a ab aa ab ab - ab ab aa aa ab ab ab ab ab ab aa ab aa aa ab aa ab ab aa ab ab bb - - - - - aa aa aa aa Tf0152 Hind3 Ciclev10021000m 3 2,002,427 2,008,126 AGI-05 8.51 a aa ab - bb aa aa aa aa aa aa aa aa - aa aa aa aa aa aa - aa aa aa aa aa aa - aa aa - aa aa - - ab aa Al0637 Hha1 Ciclev10019147m 3 2,939,620 2,941,934 a ab aa bb ab ab ab ab ab aa ab aa ab bb ab ab aa ab aa ab ab ab ab ab aa ab bb bb - - - - - aa - aa ab Al0318 Hha1 Ciclev10021392m 3 3,006,218 3,008,357 a aa ab aa aa ab aa aa aa bb ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa - - - - - aa sp ab aa Cp1598 Msp1 Ciclev10021001m 3 3,802,387 3,805,494 AGI-05 12.72 b ab ab ab aa ab ab ab - aa ab ab ab aa ab ab ab ab bb ab ab ab ab ab ab ab aa aa ab ab ab ab ab aa - ab ab Cp2229 Hind3 Ciclev10022058m 3 4,117,485 4,120,274 AGI-05 27.14 b ab ab aa aa ab ab ab aa bb ab bb ab aa ab ab ab ab bb ab aa ab aa ab bb ab aa aa ab ab aa ab ab aa aa bb bb Tf0294 EcoR5 Ciclev10021365m 3 4,794,701 4,799,518 AGI-05 27.14 b ab ab - aa ab ab ab aa bb ab bb ab aa ab ab ab ab ab ab aa ab aa ab bb ab aa aa ab ab aa ab aa aa aa bb bb Wy0018 Pvu2 Ciclev10021374m 3 5,318,874 5,321,054 AGI-05 29.03 a ab ab bb bb ab ab ab bb aa ab aa ab bb ab ab ab ab ab ab bb ab bb ab aa ab bb bb ab ab bb ab bb bb sp aa ab Tf0420 Hae3 Ciclev10022018m 3 6,602,994 6,605,239 AGI-05 37.10 a aa bb - ab - ab ab aa ab ab ab aa aa aa ab aa aa aa aa ab aa ab aa ab aa aa ab aa bb aa aa aa aa aa ab aa Cp2208 Hae3 Ciclev10021564m 3 7,420,176 7,425,027 a aa bb aa ab ab ab aa aa ab ab ab aa aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa ab aa bb aa aa aa - aa sp ab Tf0376 Hha1 Ciclev10022680m 3 8,528,292 8,529,236 AGI-05 41.85 a ab aa - ab ab aa aa bb aa ab aa ab ab bb ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab aa ab bb bb ab sp aa aa Tf0001.2 Msp1 Ciclev10020248m 3 8,647,529 8,652,282 AGI-05 41.89 a ab aa - ab ab aa aa bb aa ab aa ab ab bb ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab ab aa bb bb bb aa aa aa aa Tf0268 Hind3 Ciclev10021157m 3 10,140,904 10,142,752 AGI-05 43.80 - ab aa - ab ab aa aa ab aa ab aa ab ab bb ab ab ab ab ab aa ab ab ab - ab ab ab ab aa bb bb ab aa bb aa aa Vt0011 Hinc2 Ciclev10021162m 3 12,984,411 12,986,574 AGI-05 41.31 b ab ab aa ab aa ab bb aa ab aa ab ab aa aa aa aa aa aa ab ab bb ab ab ab ab aa ab - - - - - aa aa aa aa Cp1627 Hae3 Ciclev10022024m 3 13,309,398 13,310,636 AGI-05 41.27 a aa aa sp ab aa aa aa sp aa ab aa ab aa ab ab ab ab ab aa aa aa ab ab aa ab ab aa ab aa aa ab ab bb bb aa aa Fb0364 Nde2 Ciclev10022215m 3 13,810,497 13,813,004 AGI-05 41.31 b ab ab bb ab bb aa aa aa aa aa ab ab ab aa ab ab ab aa ab ab bb ab ab ab ab ab ab - - - - - aa aa ab ab Tf0153 Hae3 Ciclev10022594m 3 16,957,427 16,959,735 AGI-05 41.27 b ab aa - ab aa aa aa bb aa ab ab ab aa ab ab ab ab bb ab ab aa ab ab ab ab ab aa ab aa ab ab ab bb aa aa aa Tf0154 Hae3 Ciclev10022594m 3 16,957,427 16,959,735 b ab aa - ab aa aa aa bb aa ab ab ab aa ab ab ab ab bb ab ab aa ab ab ab ab ab aa ab aa ab ab ab bb aa aa aa Mf0012 Rsa1 Ciclev10019300m 3 26,517,176 26,525,778 b ab aa bb ab ab ab aa bb aa aa ab ab aa aa aa aa ab ab - ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa ab ab aa sp aa aa Ov0503 Hae3 Ciclev10020582m 3 28,382,218 28,386,683 b ab aa aa ab aa aa aa aa aa ab ab ab aa ab aa ab ab bb aa aa ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa ab ab aa aa aa aa Tf0012 Msp1 Ciclev10018673m 3 37,601,493 37,607,586 AGI-05 47.17 b ab aa ab aa ab ab ab ab aa aa ab aa ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa ab ab ab aa ab sp sp aa aa Lp0133 Msp1 Ciclev10021187m 3 39,657,613 39,660,222 AGI-05 48.59 b ab aa ab ab aa aa aa ab aa ab ab ab aa ab aa ab ab bb aa ab ab bb ab ab bb ab aa - - - - - bb - aa aa Tf0368 Rsa1 Ciclev10020717m 3 40,963,774 40,965,744 AGI-05 48.59 b ab aa - ab aa aa aa ab aa ab ab ab aa ab aa ab ab bb aa ab ab bb ab ab bb ab aa aa aa ab ab ab bb bb aa aa Cp0781 Xba1 Ciclev10021469m 3 41,043,663 41,046,480 AGI-05 50.29 b ab aa - ab ab aa aa ab aa ab bb ab aa ab aa ab ab bb aa ab ab bb ab bb bb ab aa aa aa aa ab ab bb aa aa aa Ov0005 Hinc2 Ciclev10019557m 3 41,636,616 41,641,083 AGI-05 47.99 a aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa bb - ab aa Tf0256 Rsa1 Ciclev10021699m 3 43,420,187 43,422,432 AGI-05 52.31 b ab aa - ab ab aa aa ab aa ab ab ab - aa aa ab ab bb aa ab ab bb ab bb bb ab aa aa aa aa ab ab bb sp aa ab Tf0036 Hinf1 Ciclev10022032m 3 43,850,269 43,852,816 AGI-05 53.26 a ab bb - ab aa bb bb ab bb ab ab ab ab ab - ab ab aa bb ab ab aa ab - aa ab bb bb bb bb ab ab bb bb bb - Tf0300 BamH1 Ciclev10022370m 3 43,862,440 43,863,744 AGI-05 54.73 b ab aa - ab ab aa aa ab aa ab ab ab ab ab ab ab ab bb aa ab ab bb ab bb bb ab aa aa aa aa ab ab bb bb aa ab Al0309 Rsa1 Ciclev10022019m 3 44,900,059 44,900,865 a aa aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa ab ab ab ab ab aa ab aa aa ab aa ab aa ab ab aa - - - - - bb bb aa aa Mf0041 Pvu2 Ciclev10022012m 3 45,076,821 45,080,633 AGI-05 56.53 a ab ab aa aa ab - ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa ab ab aa aa ab aa aa aa ab - - - - - aa aa aa aa Tf0184 EcoR1 Ciclev10019968m 3 45,393,857 45,398,298 AGI-05 57.95 b aa aa - ab ab aa aa ab aa ab aa ab - ab ab ab ab ab aa - ab bb ab aa aa ab aa ab aa ab ab ab aa bb aa ab Mf0055 Hinc2 Ciclev10022212m 3 45,551,345 45,552,620 AGI-05 57.95 a aa aa bb ab ab aa aa ab aa ab aa ab aa ab ab ab ab ab aa ab ab bb ab aa aa ab aa - - - - - aa bb aa aa Cp1427 Hind3 Ciclev10021746m 3 45,576,863 45,579,197 AGI-05 58.92 a aa ab ab ab ab aa aa ab aa bb aa ab aa ab ab ab ab ab aa ab ab bb ab aa ab ab aa bb ab ab ab ab bb aa sp bb Tf0419 Pvu2 Ciclev10019228m 3 47,476,188 47,479,361 b ab aa - aa ab ab ab ab ab aa bb aa aa aa aa ab aa ab ab ab aa aa aa bb ab aa ab aa aa ab ab aa sp aa aa aa Tf0293 Hind3 Ciclev10019219m 3 49,031,441 49,035,202 a ab aa - aa aa aa aa aa aa aa ab ab aa aa aa ab ab aa aa aa ab aa ab ab ab aa aa aa aa aa aa aa sp sp aa aa Fb0144 NC Ciclev10019665m 3 50,861,813 50,866,146 AGI-05 107.81 b ab bb bb bb bb ab ab bb bb bb - ab bb bb bb aa ab bb ab bb aa bb bb bb bb bb ab - - - - - sp sp bb bb Al0524 Hha1 Ciclev10031723m 4 115,362 118,025 AGI-07 5.97 b ab ab SP ab aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa - bb ab aa aa ------bb aa aa Cp1584 Msp1 Ciclev10031523m 4 201,556 204,527 b ab ab ab ab aa ab bb ab aa aa ab aa aa aa ab aa aa ab ab ab aa ab aa bb ab aa ab ab ab ab ab aa - sp ab ab Tf0410 Msp1 Ciclev10032838m 4 213,798 215,848 AGI-07 6.15 - ab ab - - aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa - aa aa ab aa aa aa aa aa bb ab aa aa ab aa ab ab aa aa aa aa bb Ov0507 Xba1 Ciclev10031860m 4 642,157 644,823 b ab ab ab ab aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa bb ab aa aa aa aa ab ab aa aa aa aa aa Al0617 EcoR5 Ciclev10033546m 4 1,021,179 1,023,023 AGI-07 8.55 b ab ab bb ab aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab - aa aa aa aa bb ab aa aa - - - - - aa - aa aa Ov0002 Hinf1 Ciclev10032770m 4 2,422,861 2,424,838 AGI-07 13.66 b ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa bb ab aa aa aa aa ab ab aa aa sp aa aa Al0331 Sty1 Ciclev10033190m 4 8,406,632 8,407,188 a ab aa bb aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa bb bb bb bb Al0206 Hae3 Ciclev10032727m 4 12,309,480 12,311,438 AGI-07 38.57 a ab aa bb aa ab ab ab ab bb aa aa aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa ab aa aa bb - - - - - bb - bb bb Tf0267 Pvu2 Ciclev10031834m 4 12,571,526 12,575,185 AGI-07 37.80 a ab aa - aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa sp bb aa aa Cp1279 Hind3 Ciclev10031414m 4 12,900,777 12,903,692 AGI-07 40.18 a ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa - aa ab Tf0318 Hinc2 Ciclev10031873m 4 13,751,433 13,754,767 AGI-07 37.47 a ab aa - aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa bb bb bb bb Bf0136 Hha1 No annotation 4 15,056,834 15,058,632 a ab aa bb aa aa aa aa bb aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa Edw001 Hae3 Ciclev10033829m 4 16,223,771 16,226,683 a ab bb aa bb bb bb bb aa bb bb bb ab bb ab bb bb ab ab ab ab ab ab ab ab bb bb bb ab bb bb bb bb bb sp bb ab Gn0040 Hae3 Ciclev10033176m 4 16,232,756 16,233,365 AGI-07 43.54 a ab bb aa bb bb bb bb aa bb bb bb ab bb ab bb ab bb ab ab ab ab ab ab ab bb bb bb bb bb bb bb bb bb sp bb bb Tf0090 Dra1 Ciclev10031135m 4 16,519,046 16,521,918 - ab bb - bb bb bb bb aa bb bb bb ab bb ab - ab bb ab ab ab ab ab ab ab bb bb bb ab bb bb bb bb bb aa bb ab Tf0090 Xba1 Ciclev10031135m 4 16,519,046 16,521,918 - ab aa - aa aa aa aa bb aa aa aa ab aa ab - ab aa ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa Ov0505 NC Ciclev10031252m 4 16,626,338 16,629,094 a ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa ab aa ab aa ab aa ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa - - - - - aa aa aa aa Mf0097 Dra1 No annotation 4 18,074,474 18,074,797 AGI-07 44.66 a ab aa bb aa aa aa aa bb aa aa aa ab aa ab aa ab aa ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa ab aa bb bb aa ab Tf0165 Dra1 Ciclev10031793m 4 19,605,473 19,608,059 AGI-07 55.50 a ab aa - aa aa aa aa bb aa aa aa ab - ab aa ab aa ab ab - ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa ab aa bb bb ab aa Tf0337 Hae3 Ciclev10031846m 4 19,635,415 19,637,061 AGI-07 54.87 a ab ab - aa ab ab bb bb aa aa ab ab ab ab aa bb aa ab bb bb ab bb ab aa aa ab aa aa ab ab bb ab bb bb bb bb Cp0675 Msp1 Ciclev10030633m 4 20,294,240 20,301,426 AGI-07 59.79 a ab aa bb aa aa aa aa bb aa aa aa ab aa ab aa aa ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa bb aa aa Tf0148 Hae3 Ciclev10032816m 4 20,998,708 21,001,535 AGI-07 64.81 a ab aa - aa aa aa aa bb aa aa aa ab - ab aa ab - ab ab - ab ab ab aa aa aa aa aa aa aa ab aa sp sp aa aa Tf0005.2 Hae3 Ciclev10032578m 4 21,042,049 21,048,279 - ab ab - aa aa aa aa bb aa aa aa ab aa ab - ab aa ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa aa ab aa bb bb ab ab Tf0227 Msp1 Ciclev10031750m 4 21,666,061 21,671,693 AGI-08 35.93 a ab bb ab bb bb bb ab ab ab bb ab bb ab ab bb bb bb bb ab - ab bb bb aa bb ab bb bb bb ab bb ab aa bb bb bb Cp0452 EcoR1 Ciclev10030661m 4 23,575,399 23,582,495 AGI-07 75.35 a aa ab aa ab aa aa aa aa aa ab aa ab aa aa aa ab ab ab aa aa ab ab ab aa aa ab aa bb ab aa aa aa - aa aa aa Gn0048 Pvu2 Ciclev10032275m 4 23,695,766 23,697,703 AGI-07 74.23 a ab aa ab aa ab aa aa ab aa aa aa ab ab ab ab aa aa ab ab ab ab aa ab aa aa aa ab ab aa ab ab ab aa aa aa aa Tf0198 Pvu2 Ciclev10032275m 4 23,695,766 23,697,703 a ab aa - aa ab aa aa ab aa aa aa ab - ab ab aa aa ab ab - ab aa ab aa aa aa ab aa aa ab ab ab aa aa aa aa Fb0343 Msp1 Ciclev10033061m 4 25,059,045 25,061,910 b bb aa bb aa - ab ab bb aa aa ab ab ab ab bb ab aa ab ab bb ab ab ab ab aa aa bb - - - - - bb sp aa ab Ov0111 Hha1 Ciclev10000069m 5 8,532,280 8,539,677 AGI-09 85.81 a ab aa bb ab aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab aa aa - - - - - bb sp aa ab Cp2232 Hinf1 Ciclev10002687m 5 17,809,523 17,810,742 AGI-02 22.44 b ab ab ab aa ab ab bb ab bb aa bb aa ab ab ab aa ab aa ab ab aa ab aa bb ab aa bb ab aa ab? ab aa aa aa bb aa Cp0419 NC Ciclev10002215m 5 28,815,314 28,816,638 AGI-09 88.74 b aa aa aa aa aa ab ab aa aa aa ab aa aa aa ab ab ab aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa Tf0093.2 Msp1 Ciclev10002569m 5 29,413,143 29,414,562 AGI-09 86.51 b aa aa - aa aa aa - aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa - aa aa aa aa bb aa aa aa Tf0393 Msp1 Ciclev10002569m 5 29,413,143 29,414,562 b aa aa - aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa bb aa aa aa Ov0404 EcoR5 Ciclev10002415m 5 29,768,091 29,769,281 a ab aa bb aa aa aa aa aa aa aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa bb Ov0118 Dra1 Ciclev10001621m 5 34,294,853 34,297,359 AGI-04 34.84 b ab bb aa ab bb bb bb ab bb ab bb ab bb bb bb bb bb bb bb bb bb bb ab bb bb ab bb ab bb bb bb bb aa aa aa bb Tf0151 Rsa1 Ciclev10002917m 5 35,357,333 35,359,897 AGI-09 60.53 a aa ab - ab bb ab aa aa aa aa ab aa - ab ab ab aa aa aa - aa aa aa aa ab ab ab aa ab ab aa aa aa aa bb ab Cp1162 Msp1 Ciclev10001345m 5 35,908,181 35,912,917 AGI-09 53.23 b ab ab aa ab ab bb ab aa ab aa ab aa ab ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa bb ab aa ab ab ab ab - aa - - aa aa Wy0030 Rsa1 Ciclev10001854m 5 36,229,310 36,230,518 AGI-09 53.21 a ab aa bb ab aa aa aa bb aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab ab aa ab ab aa - - - - - ab bb aa aa Ov0407 Msp1 Ciclev10000563m 5 37,043,417 37,051,080 AGI-09 46.10 b ab bb aa ab bb bb bb aa bb ab bb ab bb bb bb bb bb ab ab ab ab ab ab bb bb bb bb - - - - - bb bb bb ab Wy0003 Msp1 Ciclev10001202m 5 37,189,653 37,192,231 AGI-09 46.82 b bb ab bb ab bb bb ab bb ab aa bb ab bb ab ab ab ab ab bb bb ab ab ab bb ab ab bb aa ab bb ab aa bb sp bb ab If0211 Pvu2 No annotation 5 38,520,908 38,522,118 AGI-09 47.41 a ab bb aa ab bb bb bb aa bb ab ab ab bb bb bb bb bb ab ab ab ab ab ab ab aa bb bb ab ? bb bb bb - - bb bb Mf0003 Nde2 No annotation 5 38,780,948 38,789,916 b ab ab bb ab ab ab aa bb aa ab ab ab aa aa aa ab aa ab ab ab ab ab ab ab bb aa aa - - - - - aa bb aa aa If0220 Msp1 Ciclev10001084m 5 39,480,647 39,484,776 - ab aa ab aa bb aa aa ab aa aa aa aa - aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa ab aa aa - - - Gn0021 Hae3 Ciclev10000597m 5 39,630,111 39,635,609 AGI-09 42.62 a aa bb aa ab ab ab bb aa ab ab ab ab bb bb bb ab bb ab ab ab ab ab ab aa aa bb bb - - - - - aa aa aa aa If0208 Hinf1 Ciclev10001680m 5 40,628,244 40,630,241 AGI-09 39.30 a ab bb aa ab bb bb bb aa bb ab ab ab bb bb bb bb bb ab ab ab ab ab ab ab aa bb bb ab bb ab bb bb sp aa bb ab Cp0506 Hha1 Ciclev10001978m 5 40,832,603 40,834,625 AGI-09 38.66 b ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa bb aa - Al0618 Hha1 Ciclev10000916m 5 40,872,793 40,877,775 AGI-09 38.00 a ab ab aa ab ab ab aa aa bb ab ab aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa ab ab aa aa - - - - - aa bb bb bb Vs0003 BamH1 No annotation 5 41,498,209 41,498,757 AGI-09 35.31 b ab aa bb ab aa aa aa bb aa ab ab ab aa aa aa aa ab ab ab ab ab aa ab ab bb aa aa - - - - - bb bb aa ab Vs0003 Hinf1 No annotation 5 41,498,209 41,498,757 AGI-09 35.31 b ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa ab aa ab ab ab ab aa ab ab ab aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa Al0639 Pvu2 Ciclev10001091m 5 41,703,787 41,708,779 AGI-01 70.49 b ab bb bb ab ab bb bb ab bb aa bb ab bb ab bb bb bb ab ab ab ab aa ab bb ab ab bb aa ab ab bb ab - bb bb bb Cp1308 Hind3 Ciclev10011420m 6 6,329,421 6,335,005 AGI-04 101.20 a aa bb aa aa aa aa aa aa aa ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa aa ab aa ab aa ab ab aa ab ab ab aa ab ab aa bb ab Cp1308 Rsa1 Ciclev10011420m 6 6,329,421 6,335,005 AGI-04 101.20 a ab aa ab bb ab aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa ab aa aa ab aa bb aa bb ab Mf0076 BamH1 Ciclev10012554m 6 11,704,199 11,706,676 AGI-08 93.62 a aa aa bb ab ab aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa - - - - - sp bb aa ab Mf0072 Hae3 Ciclev10013297m 6 13,750,671 13,752,605 AGI-04 91.10 a aa ab bb aa ab aa aa aa aa ab aa ab aa aa aa ab aa aa aa aa ab aa ab - ab ab aa - - - - - sp - aa ab Tf0315 Hinf1 Ciclev10012089m 6 14,087,181 14,090,115 AGI-08 93.66 a ab aa - aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa bb bb aa aa Tf0311 Dra1 Ciclev10011596m 6 15,932,016 15,936,176 AGI-08 91.89 - aa ab - aa aa aa ab aa aa ab aa ab aa aa - ab aa aa ab ab bb aa ab aa ab ab aa aa ab ab aa ab aa bb ab ab Ov0419 Dra1 Ciclev10011593m 6 16,709,179 16,712,039 - ab aa bb aa ab aa aa ab aa aa - aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ------aa aa Al0402 Hae3 No annotation 6 17,102,392 17,102,510 AGI-08 81.19 b bb aa aa ab aa bb ab bb aa ab ab ab aa aa bb ab ab ab ab ab aa bb ab ab aa aa ab ab ab aa ab ab aa aa aa aa Ov0408 Hinc2 Ciclev10011522m 6 18,491,789 18,493,623 a aa ab - ab aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa - aa aa ab aa aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa Al0625 pvu2 No annotation 6 18,572,781 18,573,119 AGI-04 66.46 b ab aa bb aa ab aa aa ab aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab - - - - - bb bb aa ab Ov0117 Dra1 Ciclev10010926m 6 19,105,139 19,113,780 AGI-04 66.46 b ab aa bb aa ab ab ab ab aa aa ab aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab aa aa aa bb bb aa ab Cp0895 Xba1 Ciclev10011406m 6 19,241,700 19,246,874 AGI-04 67.38 b aa aa ab aa aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa Cp1798 Msp1 Ciclev10012134m 6 20,319,677 20,323,198 AGI-04 60.29 a ab aa ab aa ab ab ab ab aa aa ab aa aa aa aa aa ab aa ab aa aa aa aa ab ab aa aa aa ab ab ab aa bb sp aa aa Mf0092 Hha1 Ciclev10012056m 6 21,137,783 21,142,157 AGI-04 59.19 a ab ab aa ab aa aa ab ab ab aa ab ab ab aa aa aa aa ab ab bb bb bb aa ab aa ab ab aa aa ab aa aa - aa aa aa Ov0020 Hinf1 Ciclev10011842m 6 21,598,429 21,600,967 AGI-04 55.15 b bb ab bb ab bb bb bb bb bb aa - ab bb ab ab ab ab ab bb bb bb bb ab bb ab ab bb aa ab bb ab bb bb bb bb bb Cp1361 BamH1 Ciclev10013042m 6 21,714,716 21,717,652 AGI-04 52.74 a ab aa ab ab aa ab - ab bb aa ab ab ab aa ab ab aa ab aa ab ab ab ab bb aa ab ab aa aa aa aa ab - - ab ab Tf0021 Msp1 Ciclev10011169m 6 21,905,557 21,908,832 b ab aa ab aa ab ab ab ab aa aa ab aa ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa ab aa aa ab ab ab aa ab sp sp aa aa Tf0056 Hinc2 Ciclev10012265m 6 22,305,922 22,308,021 AGI-04 49.23 b ab aa ab aa ab ab ab ab aa aa ab ab ab ab aa aa ab aa ab aa ab ab ab aa ab aa ab aa aa ab ab aa aa aa aa aa Cp2026 Rsa1 Ciclev10011534m 6 23,506,491 23,509,585 AGI-04 43.24 b ab aa - aa ab ab aa ab aa aa ab ab ab ab aa ab ab aa ab aa ab ab ab aa ab aa ab aa aa ab ab aa aa aa aa aa Tf0386 Msp1 Ciclev10012022m 6 23,593,516 23,595,492 AGI-04 41.37 b ab aa - aa ab ab aa ab aa aa ab ab bb ab aa ab ab aa ab aa ab ab ab aa ab ab ab aa aa ab ab ab bb bb aa aa Al0313 Xba1 Ciclev10011272m 6 23,966,039 23,969,583 AGI-04 38.15 b ab aa bb aa aa ab aa ab aa aa ab ab ab aa aa ab ab aa ab ab ab ab ab aa ab ab aa - - - - - aa aa aa aa Gn0051 Hae3 Ciclev10011780m 6 24,082,263 24,084,635 AGI-04 39.51 a ab ab ab bb - ab bb ab ab ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab ab ab ab aa bb ab ab ab aa bb bb aa ab aa aa aa aa Tf0364 Hinf1 Ciclev10011266m 6 24,606,501 24,612,654 AGI-04 37.10 a ab ab - bb ab ab bb ab bb ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab ab ab ab aa bb ab ab ab ab bb bb aa ab aa aa ab ab Wy0040 Msp1 Ciclev10011622m 6 25,349,417 25,351,949 a ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa aa ab aa aa aa ab aa aa ab ab bb ab ab aa aa aa aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa Tf0032 Msp1 Ciclev10026014m 7 94,155 97,631 AGI-02 78.53 a ab aa bb - ab aa aa bb - ab ab ab aa ab aa ab aa ab ab ab aa aa aa ab bb aa aa ab aa aa aa aa bb bb aa aa Cp1709 Rsa1 Ciclev10025382m 7 1,450,748 1,452,915 b ab aa ab ab ab aa aa ab aa ab ab ab aa ab aa aa ab ab ab ab bb aa aa ab bb aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa Cp2262 Msp1 Ciclev10026121m 7 1,870,933 1,874,304 a ab ab ab ab ab ab ab ab ab aa ab aa ab ab ab aa ab ab ab aa aa aa aa ab aa ab bb ab ab - ab bb aa aa ab ab Tf0326 Hha1 Ciclev10024695m 7 2,501,520 2,509,737 AGI-02 69.93 - ab aa - ab bb aa aa ab ab ab ab ab ab bb - ab aa ab ab ab bb aa aa ab bb ab ab ab aa ab aa bb bb bb - - Cp2263 Dra1 Ciclev10026034m 7 2,586,384 2,588,513 AGI-02 70.08 b ab aa ab ab ab aa aa - aa ab ab ab aa ab aa aa ab ab ab ab bb aa aa ab bb aa aa ab aa aa aa aa - sp aa aa Cp1716 Rsa1 Ciclev10026303m 7 2,607,670 2,609,433 AGI-02 70.07 b ab aa ab ab ab aa aa ab aa ab ab ab aa ab aa aa ab ab ab ab bb aa aa ab bb aa aa ab aa aa aa aa sp - aa aa Tf0259 Pvu2 Ciclev10026107m 7 3,674,156 3,676,384 AGI-02 67.67 a ab aa - ab ab aa aa ab aa ab aa aa - aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa Mf0094 Msp1 Ciclev10026594m 7 3,721,375 3,722,616 AGI-02 67.67 a ab aa bb ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab ab aa aa - - - - - ab bb ab ab Lp0126 BamH1 Ciclev10025164m 7 3,946,818 3,949,964 AGI-02 65.30 a aa bb aa ab aa aa ab aa ab ab aa ab ab aa ab aa ab aa aa aa aa ab bb aa aa ab aa - - - - - aa aa ab bb Cp1738 Rsa1 Ciclev10025941m 7 5,388,458 5,389,981 a ab aa ab ab ab aa aa ab - ab aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab ab ab aa ab ab aa ab aa aa aa aa aa Lp0108 Hinf1 Ciclev10026340m 7 5,554,619 5,556,993 a ab aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab aa ab ab ab aa - - - - - bb bb ab ab Cp0321 Hind3 Ciclev10026722m 7 8,898,626 8,899,984 b ab bb ab ab bb bb bb ab bb ab bb aa bb ab ab ab ab aa ab ab aa aa ab ab ab ab bb ab ab bb ab ab ab ab bb ab Cp0321 Msp1 Ciclev10026722m 7 8,898,626 8,899,984 a ab aa ab ab aa aa aa ab aa ab aa bb aa ab ab ab ab bb ab ab bb bb ab ab ab ab aa ab ab aa ab ab aa aa aa ab Tf0454 Dra1 Ciclev10027306m 7 16,108,723 16,113,463 AGI-02 21.10 - ab aa - aa - ab ab ab - aa bb aa aa aa ab ab aa aa ab aa aa aa aa ab ab aa ab aa aa ab ab aa aa aa - - Al0329 Msp1 Ciclev10025866m 7 17,201,236 17,204,282 AGI-02 25.16 b ab aa aa aa ab ab ab ab bb aa bb ab bb bb bb ab bb aa ab aa aa aa ab bb ab ab bb ab aa bb ab bb sp sp aa aa Mf0090 Msp1 Ciclev10025866m 7 17,201,236 17,204,282 AGI-02 25.87 a ab bb bb bb ab ab ab ab aa bb aa ab aa aa aa ab aa bb ab bb bb bb ab aa ab ab aa - - - - - bb - bb bb Cp1697 Nde2 Ciclev10028645m 8 966,124 968,846 AGI-02 73.77 a aa ab aa aa ab ab ab aa ab ab ab aa ab ab aa ab ab aa ab ab aa ab aa ab ab aa ab ab ab ab aa aa - bb bb bb Al0517 Sty1 Ciclev10028293m 8 2,572,439 2,574,295 AGI-08 74.02 b ab aa aa aa ab bb bb ab ab aa bb aa ab ab ab ab ab ab ab ab aa ab aa ab ab aa ab - - - - - aa aa aa aa Tf0250 Hind3 Ciclev10028849m 8 2,697,793 2,701,440 AGI-08 73.11 - ab ab - aa aa aa aa aa ab ab aa ab aa aa - aa aa aa aa aa ab aa ab ab aa aa aa ab aa aa aa ab aa aa aa aa Tf0250 Msp1 Ciclev10028849m 8 2,697,793 2,701,440 AGI-08 73.11 - ab ab - ab ab aa aa ab ab bb aa bb ab ab - ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab bb ab bb ab bb ab bb sp aa aa aa Tf0431 Msp1 Ciclev10028849m 8 2,697,793 2,701,440 - ab ab - ab - aa aa ab ab bb aa bb ab ab ab ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab bb ab bb ab bb ab bb bb aa aa aa Al0240 BamH1 Ciclev10028497m 8 8,033,465 8,038,415 AGI-08 53.87 a aa aa aa ab ab aa aa aa aa ab aa ab aa ab ab ab aa ab aa aa aa aa ab aa ab ab aa - - - - - bb aa aa aa Ov0314 Hha1 Ciclev10029386m 8 8,176,371 8,177,435 AGI-08 56.72 a aa aa bb ab ab aa aa ab aa ab aa ab aa ab ab ab aa ab ab ab ab ab ab aa ab ab aa - - - - - aa aa aa aa Cp2237 BamH1 Ciclev10028314m 8 13,190,041 13,194,829 AGI-08 55.97 a ab aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa bb aa ab ab ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab ab aa bb ab ab ab bb aa sp aa aa Tf0013 Rsa1 Ciclev10027769m 8 13,408,610 13,413,938 AGI-08 56.12 b ab aa ab ab ab aa aa ab aa ab aa bb aa ab ab ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab ab aa bb ab ab ab bb bb bb aa aa Tf0290 EcoR5 Ciclev10029354m 8 18,064,761 18,071,003 AGI-08 57.80 - ab aa - ab ab aa aa ab aa ab aa bb aa ab - ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab ab aa bb ab ab ab bb bb bb aa aa Wy0039 EcoR5 Ciclev10028965m 8 18,824,262 18,825,514 AGI-08 45.28 a ab aa ab ab ab aa aa ab ab ab ab bb ab bb ab ab ab ab ab ab bb ab bb bb ab bb aa ab ab ab ab bb bb bb aa ab Al0411 Hae3 Ciclev10029439m 8 19,760,077 19,761,961 AGI-08 40.86 b ab aa ab aa ab ab aa ab bb aa bb aa ab aa ab ab aa ab ab ab ab aa aa bb ab aa ab ------aa ab ab Ov0125 Hae3 Ciclev10028359m 8 20,352,232 20,354,410 AGI-08 41.40 b ab aa ab aa aa aa ab ab ab aa ab aa ab ab aa aa aa aa ab ab ab aa aa bb aa ab aa - - - - - aa aa aa aa Tf0150 Hinf1 Ciclev10028292m 8 22,191,056 22,193,554 AGI-08 25.22 a aa aa - ab ab aa aa aa aa ab aa ab - ab ab aa aa ab aa - aa aa ab aa ab aa ab ab ab aa aa aa aa bb aa aa Ov0324 Hha1 Ciclev10030198m 8 22,575,845 22,578,398 b ab aa ab aa aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa ab ab ab aa aa ab ab aa aa ab aa aa - - - - - aa aa aa aa Fb0159 Hinc2 Ciclev10028241m 8 23,456,630 23,459,052 AGI-08 13.50 b bb ab bb ab aa aa aa bb aa ab ab ab aa aa aa ab ab ab ab ab bb ab ab ab ab ab aa ab aa bb ab bb sp sp bb bb Lp0119 Hae3 Ciclev10028631m 8 24,315,720 24,317,671 AGI-08 8.54 b ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa - aa aa ab Cp2188 Nde2 Ciclev10028997m 8 24,666,729 24,669,708 AGI-08 2.19 a ab aa bb ab ab aa aa bb aa aa aa ab ab aa aa ab ab ab ab ab bb bb aa aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa Mf0079 Hind3 Ciclev10028839m 8 24,721,937 24,724,569 AGI-08 3.41 b ab aa bb ab bb ab ab bb ab aa ab ab bb ab ab ab bb ab ab ab bb bb aa ab aa ab ab ab ab aa ab bb bb bb ab ab Tf0275 Pvu2 Ciclev10006256m 9 955,176 957,425 AGI-03 11.50 a ab aa - aa aa aa aa aa aa aa ab ab - aa ab ab aa ab aa aa aa aa ab ab aa aa aa ab aa ab aa ab aa aa aa aa Cp1523 Hind3 Ciclev10005519m 9 1,356,758 1,359,310 AGI-03 12.61 a ab aa ab aa aa aa aa aa aa aa ab ab aa aa ab ab ab ab aa aa aa aa ab ab aa aa aa ab aa ab aa ab - aa aa aa Cp1031 Hha1 Ciclev10005224m 9 2,324,313 2,328,666 AGI-03 18.61 a ab aa ab ab aa aa aa ab aa aa aa ab - aa ab ab ab ab aa aa ab aa ab - aa aa aa ab aa aa aa ab sp - aa aa Al0415 EcoR1 Ciclev10004660m 9 2,732,900 2,738,896 AGI-03 24.89 b aa bb aa bb ab aa ab aa ab bb aa ab ab ab ab aa aa ab ab aa ab ab ab aa ab bb aa bb ab bb ab ab aa aa ab ab Cp1925 Hinf1 Ciclev10005182m 9 3,115,971 3,120,271 AGI-03 24.46 a ab ab ab bb ab aa ab ab aa ab - bb ab ab ab ab ab bb ab aa bb ab bb ab ab ab aa bb aa bb ab bb aa aa aa aa Wy0012 Dra1 Ciclev10004385m 9 4,888,531 4,892,972 a ab aa bb ab ab ab aa bb aa aa ab ab aa aa aa ab ab ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa aa ab aa aa aa aa Lp0041 Dra1 Ciclev10006136m 9 6,354,796 6,356,630 b ab aa bb ab ab ab aa bb aa aa ab ab aa aa aa aa ab ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa - - - - - bb bb aa ab Al0413 Msp1 Ciclev10004620m 9 7,579,900 7,583,093 AGI-03 46.20 b ab aa ab ab ab ab aa bb aa aa ab ab aa aa aa aa ab ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa ab ab bb bb ab ab Wy0032 Hha1 Ciclev10005365m 9 10,357,084 10,359,834 AGI-03 46.12 b ab aa bb ab ab ab aa bb aa aa ab ab aa aa aa aa ab ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa aa aa aa ab ab bb bb ab aa Ov0104 Hae3 Ciclev10004850m 9 13,440,332 13,442,904 AGI-08 56.72 b ab aa bb ab ab aa aa ab aa ab aa bb aa ab ab ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab ab aa bb ab ab ab bb bb bb bb bb Cp1034 Dra1 Ciclev10005575m 9 21,107,894 21,109,983 AGI-03 46.76 - ab aa bb ab bb ab - bb aa aa - ab - - aa ab aa ab ab ab ab ab - ab ab - - ab ab ab ab ab sp sp - - Al0302 Hind3 Ciclev10004372m 9 25,073,693 25,080,376 AGI-03 48.38 - aa ab aa ab ab ab bb aa ab ab aa ab ab ab bb bb ab ab ab ab ab ab ab aa aa bb ab ab ab ab ab bb ab aa bb ab Ks9011 Hha1 Ciclev10004755m 9 28,984,972 28,989,373 a aa ab ab aa aa ab ab ab aa ab aa aa aa aa aa ab ab aa aa ab aa ab aa aa ab ab ab bb bb bb aa ab bb bb ab ab Ks9010 Msp1 Ciclev10007188m 9 29,460,866 29,463,385 AGI-04 62.50 b ab aa aa aa ab ab ab aa aa aa ab aa ab aa aa ab aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab ab - - - - - aa aa aa aa If0223 HInd3 AGI-02 76.17 b ab aa ab ab ab ab aa ab ab ab ab ab aa ab ab bb aa ab ab ab aa aa aa ab bb aa ab - - - - - sp bb aa ab Gn0009 BamH1 AGI-04 57.37 b bb ab bb ab bb bb bb bb bb aa bb ab bb ab ab ab ab ab bb bb bb bb aa bb ab ab bb - - - - - bb sp bb bb Gn0031 EcoR5 AGI-08 37.71 a aa ab aa ab ab aa - aa aa ab aa ab aa ab ab ab aa ab aa aa aa ab aa - ab ab aa - - - - - aa aa aa aa Cp1366 Hae3 b ab aa bb ab ab ab aa bb aa aa ab ab aa aa aa ab aa ab ab ab ab ab ab ab aa aa aa ab aa aa ab ab aa sp sp aa Gn0029 Hinf1 b ab ab bb ab aa ab bb ab bb ab ab aa ab ab aa aa ab aa bb bb ab ab ab bb aa ab ab aa aa ab aa ab aa aa ab aa Gn0041 Taq1 b ab ab ab ab ab ab ab ab aa aa ab ab ab ab ab bb ab bb ab ab ab ab ab bb ab ab aa - - - - - aa aa ab aa Gn0082 Msp1 a ab aa bb aa aa aa aa ab aa aa ab ab aa aa aa aa aa aa aa aa aa aa ab ab ab aa aa - - - - - aa aa aa aa z Rank A markers are the most available becouse they are stable and no discrepancy in heredity. '_' means no data y Tanaka's system is used for scientific name. 'sp' means spcific band. x This willowleaf is Okitsu strain. The genotypes are different from genotypes of the willowleaf as parent of ʻEncoreʼ and clementine,