Recherche De Facteurs Associés À La Maladie D'alzheimer Par
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UNIVERSITE DE LILLE ÉCOLE DOCTORALE BIOLOGIE SANTE FACULTE DE MEDECINE HENRI WAREMBOURG ANNEE 2019 THESE SCIENTIFIQUE POUR L’OBTENTION DU GRADE DE DOCTEUR DE L’UNIVERSITE DE LILLE Recherche de facteurs associés à la maladie d’Alzheimer par réutilisation de base de données massives Présentée et soutenue publiquement le 9 janvier 2019 à 11 heures au Pôle Formation Par Michaël ROCHOY JURY Président Monsieur le Professeur Gilles CHATELLIER Rapporteurs Monsieur le Professeur Pierre KROLAK-SALMON Madame le Professeur Lamiae GRIMALDI-BENSOUDA Examinatrice Madame le Professeur Florence PASQUIER Directeurs de thèse Monsieur le Professeur Régis BORDET Monsieur le Professeur Emmanuel CHAZARD Avertissement La Faculté de médecine, l’École Doctorale et l’Université de Lille n’entendent donner aucune approbation aux opinions émises dans les thèses. Celles-ci sont propres à leurs auteurs. Remerciements A mon Président de jury, Monsieur le Professeur Gilles CHATELLIER Professeur des Universités Biostatistiques et informatique médicale Unité de recherche INSERM CIC 1418 - Pathologies cardiovasculaires, rénales, endocriniennes Université Paris Descartes Praticien hospitalier Département d’informatique médicale, biostatistiques et santé publique Hôpital Européen Georges Pompidou, AP-HP, Paris Ouest Vous me faites l’honneur de juger mon travail et présider le jury de cette thèse. Je vous remercie pour votre disponibilité et l’amabilité que vous avez eue à mon égard lors de nos précédents échanges. Veuillez trouver ici la marque de mon sincère respect. A mes rapporteurs, Monsieur le Professeur Pierre KROLAK-SALMON Professeur des Universités - Praticien Hospitalier Neurologue et gériatre Directeur médical de l’Institut du vieillissement Responsable du Centre Mémoire de Ressource et de Recherche de Lyon Responsable du Centre de Recherche Clinique « Vieillissement - Cerveau - Fragilité » Président de la Fédération Nationale des CMRR Hospices civils de Lyon - Université de Lyon Vous avez suivi mon travail au fil des comités de suivi et me faites l’honneur ce jour de le juger. Je vous remercie pour votre disponibilité et le temps que vous avez la gentillesse de me consacrer. Veuillez trouver ici l’expression de ma profonde gratitude. Madame le Professeur Lamiae GRIMALDI-BENSOUDA Professeur des Universités Pharmacologie clinique, Faculté des Sciences de la Santé Simone Veil Université Versailles Saint-Quentin en Yvelines Honorary Associate Professor Pharmacoepidemiology, London School of Hygiene and Tropical Medicine Londres, Royaume-Uni Praticien hospitalier Service de pharmacologie toxicologie, UF Pharmaco-épidémiologie Hôpital Raymond Poincaré, Assistance Publique des Hôpitaux de Paris Responsable de l'Unité de Recherche Clinique des Hôpitaux universitaires Paris Ile de France Ouest Assistance Publique des Hôpitaux de Paris Vous avez accepté de consacrer du temps à lire, commenter et venir juger mon travail. Veuillez trouver ici mes plus francs remerciements pour cet honneur et pour votre disponibilité lors de nos précédents échanges. A mon Examinatrice, Madame le Professeur Florence PASQUIER Professeur des Universités Neurologie Unité de recherche INSERM U1171 (troubles cognitifs, dégénératifs et vasculaires) Coordonnatrice du Centre Mémoire de Ressources et de Recherche (CMRR) de Lille- Bailleul Université de Lille Praticien hospitalier Chef du service de neurologie CHU de Lille Chevalier de la Légion d’Honneur Vous m’honorez de votre présence au sein de ce jury. Je vous remercie pour les agréables échanges que nous avons eus et pour le temps que vous m’accordez. Veuillez trouver ici l’expression de ma considération distinguée. A mon co-directeur de thèse, Monsieur le Professeur Régis BORDET Professeur des universités Pharmacologie fondamentale et clinique Directeur de l’unité de recherche U1171 (troubles cognitifs, dégénératifs et vasculaires) Directeur général de l’I-Site Lille Président de la sous-section CNU 48.03 Université de Lille Praticien hospitalier Chef du service de Pharmacologie Médicale Directeur du centre régional de pharmacovigilance et du centre d’évaluation et d’information sur la pharmacodépendance CHU de Lille Officier dans l’Ordre des Palmes Académiques Vous m’avez accueilli dans votre service en tant qu’étudiant hospitalier, interne, étudiant en DESC de pharmacologie, master 2 et enfin thèse d’université. Je garde au fil des années un plaisir intact à travailler à vos côtés. Je vous remercie pour vos précieux conseils, et votre présence au sein de ce jury. A mon co-directeur de thèse, Monsieur le Professeur Emmanuel CHAZARD Professeur des Universités Biostatistiques, Informatique médicale et technologies de communication Directeur du CERIM, centre d’études et de recherche en informatique médicale EA2694 santé publique, épidémiologie et qualité des soins Université de Lille Praticien hospitalier Service Méthodologie, Biostatistiques, Gestion de données, Archives CHU de Lille Vous m’avez donné accès à la base nationale du PMSI et m’avez guidé dans son utilisation. Vous m’avez apporté de nouveaux éléments de rigueur et de méthodologie de travail qui me serviront pour l’ensemble de mes futurs travaux académiques et au quotidien. Les échanges et les heures passées à vos côtés ont été enrichissants. Merci pour le temps que vous m’avez consacré et pour votre présence au sein de ce jury. Mes remerciements vont également à celles et ceux qui ont participé à l’initiation de ce projet en décembre 2015, notamment Sophie Gautier, Johana Béné et Louise Gaboriau de l’équipe de pharmacovigilance de Lille. Merci à Jonathan Favre et Thibault Puszkarek qui se sont également intéressés à cette thèse au fil des 3 années écoulées. Désolé si j’ai un peu radoté à propos de deadlines, publications, projets ou articles, dans un train, une voiture ou un salon : tout ça prend bientôt fin (pour l’instant). Alina Amariei et le Docteur Laurent Plancke ont analysé à notre demande les données de la CPAM concernant le remboursement des médicaments dans le Nord-Pas-de-Calais. Louis Rousselet a réalisé les cartes géographiques. Vincent Rivas a participé à la synthèse des revues systématiques de la littérature sur les facteurs associés à la maladie ou démence d’Alzheimer. Magalie Vasseur a participé à la rédaction de l’annexe sur les traitements. Nadia Frezel a relu les parties sur les diagnostics et traitements et Véréna Bourbia a relu une version presque finale du travail ; elles ont participé à éliminer de ce travail les dernières coquilles, avant celles qui apparaitront sournoisement dans le texte pendant l’impression. Qu’ils soient tous ici remerciés de leur aide précieuse. Toute ma gratitude va à Alexandra Elbakyan pour son audace, son courage et sa ténacité, sans lesquels il serait impossible de tant creuser nos recherches bibliographiques. Hors du domaine médical, je remercie mes amis de la musique (Béatrice, Sylvain, Fabrice et l’harmonie d’Outreau), d’enfance (Yann V., Guillaume, Nadia, Thomas, Yann D., etc.), de Netophonix (François, Serge, Nicolas, Anthony, etc.) et de Twitter pour les amusants moments qui ont égayé ces 3 années… et continueront à égayer les suivantes ! Il est amusant de soutenir ce travail le 9.1.19.11h (911, 911…) alors qu’il n’a rien d’un travail « d’urgence », ni dans le fond, ni dans la forme : il aura fallu pour ces recherches, et les autres, consacrer de nombreux week-ends, soirées et vacances. Merci à tous les membres de ma famille et de ma belle-famille qui ont accepté d’avoir régulièrement affaire à quelqu’un présent par le corps mais pas par l’esprit. Je me redéfantômerai en 2019. Le présent travail sera soutenu devant plusieurs membres de la famille, belle-famille et amis… Merci à ceux qui auront pu faire le déplacement. Merci Mémère et Alice pour vos présences quasi-quotidiennes ; merci à mes beaux-parents, beau-frère, tantes, oncles, cousines, cousins et leurs enfants pour leur disponibilité, les sympathiques moments partagés qui permettent de continuer dans la bonne humeur. Merci d’être là, merci pour votre temps. Du temps, il en a fallu pour cumuler l’activité clinique au cabinet, la thèse, les autres projets de recherche et d’enseignement, les loisirs et la vie personnelle. Or, le temps est une denrée rare et précieuse… Merci à Maman et Ghyslain qui m’en ont donné en si grande quantité ; merci pour votre soutien et votre aide inconditionnels, merci pour votre présence, merci infiniment pour les travaux au cabinet réalisés pendant mes absences. Enfin, merci à Mathilde, comme toujours, pour tout. Un mariage, deux déménagements et deux GR séparent mes deux thèses, mais tu restes au croisement de tout ce que j’ai pu évoquer plus haut et plus loin - amitié, soutien, ludisme, bienveillance et amour. Comme la précédente, cette thèse a été imprimée par Doc’Ethique (Boulogne-sur-mer) sur papier recyclé. Sigles 3C Three-Cities study (Bordeaux, Dijon, Montpellier) 6-CIT Six-item Cognitive Impairment Test ACE-R Addenbrooke’s Cognitive Examination-Revised ADAS Alzheimer’s Disease Assessment Scale ADL Activities of Daily Living ADRQL Alzheimer’s Disease Related Quality of Life ALD Affection Longue Durée AMI Aging Multidisciplinary Investigation AMT Abbreviated Mental Test ATIH Agence technique d'information hospitalière APP Amyloid Precursor Protein AVC Accident vasculaire cérébral BAC40 Batterie Cognitive sur 40 points BCRS Brief Cognitive Rating Scale BV Behavioural Variant (dégénérescence lobaire fronto-temporale) CCAM Classification Commune des Actes MédicauX CFAS Cognitive Function and Ageing Studying CIM Classification