Informe Técnico Semanal #12 COVID - Chocó: lecciones después del primer pico

Grupo Análisis de Datos COVID-CHOCÓ

16 septiembre, 2020

Nota: Este informe tiene datos de vigilancia de casos notificados hasta el día 2020-09-10 con varias bases de datos actualizadas hasta el 2020-09-14 Nombres de los integrantes del Grupo Análisis de datos COVID-CHOCÓ al final del documento

1. Incidencia de casos y fallecimientos

1.1 Incidencia de casos COVID-19 por semana en Chocó Se ha observado un comportamiento fluctuante en la incidencia de casos, con una tendencia global ala disminución en las últimas semanas.

400 rezago

300

200

100 Número semanal de casos 0

2020−01−062020−01−132020−01−202020−01−272020−02−032020−02−102020−02−172020−02−242020−03−022020−03−092020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−212020−09−28 Fecha Inicio Síntomas (Sintomáticos)| Fecha de Notificación (Asintomáticos)

1 100

50 Número diario de casos 0

2019−12−302020−01−062020−01−132020−01−202020−01−272020−02−032020−02−102020−02−172020−02−242020−03−022020−03−092020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha Inicio Síntomas (Sintomáticos)| Fecha de Notificación (Asintomáticos)

2 1.2 Fallecimientos por COVID-19 por semana en Chocó El mayor de número de muertes registradas se evidencia entre el 8 de junio y el 27 de julio. En las últimas semanas continúa aumentando el número de muertes sospechosas.

20

15

10

5 Número semanal de muertes

0

2020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha de muerte

COVID Confirmado COVID Confirmado + Otra Causa COVID Sospechoso

3 1.3.1 Lugar de fallecimientos por COVID-19 de personas residentes en Chocó Aunque Medellín continúa siendo la segunda ciudad donde más se regitraron fallecidos por ser el principal sitio de referencia para el departamento, la mayoría de los fallecimientos se registran en el municipio de Quibdó.

ALTO BAUDO APARTADO BAHIA SOLANO BOGOTA, D.C. BOJAYA 12.5 10.0 7.5 5.0 2.5 0.0 CALI CONDOTO ENVIGADO MEDELLIN 12.5 10.0 7.5 5.0 2.5 0.0 MONTERIA NUQUI PEREIRA QUIBDO RIONEGRO 12.5 10.0 7.5 5.0 2.5

Número semanal de muertes 0.0 TADO TURBO ZIPAQUIRA 12.5 10.0 7.5 2020−05−112020−06−082020−07−062020−08−032020−08−312020−05−112020−06−082020−07−062020−08−032020−08−31 5.0 2.5 0.0

2020−05−112020−06−082020−07−062020−08−032020−08−312020−05−112020−06−082020−07−062020−08−032020−08−312020−05−112020−06−082020−07−062020−08−032020−08−31 Fecha de muerte

COVID Confirmado COVID Confirmado + Otra Causa COVID Sospechoso

4 1.3.2. Lugar de fallecimientos por COVID-19 de personas residentes en Chocó

ENVIGADO ENVIGADO 1%

CONDOTO CONDOTO 1%

CALI CALI 1%

BOJAYA BOJAYA 1%

BOGOTA, D.C. BOGOTA, D.C. 1%

ALTO BAUDO ALTO BAUDO 1%

ZIPAQUIRA ZIPAQUIRA 1%

RIONEGRO RIONEGRO 1%

NUQUI NUQUI 1%

BAHIA SOLANO BAHIA SOLANO 1%

TADO TADO 2%

PEREIRA PEREIRA 2%

MONTERIA MONTERIA 2%

ISTMINA ISTMINA 2%

APARTADO APARTADO 2%

TURBO TURBO 4%

MEDELLIN MEDELLIN 21%

QUIBDO QUIBDO 56%

0 25 50 75 0 20 40 60 Número Muertes Proporción (%) de Muertes

5 1.4 Distribución de Origen de los Casos y fallecimientos en Chocó Hasta este corte, en los municipios de Río Quito, Quibdó y Unión Panamericana se registraron el mayor número de fallecimientos por número de habitantes. De los casos confirmados, el mayor porcentaje de fallecidos se regitró en, su orden, Nóvita, Río Iró y Bojayá. Acorde con el comportamiento epidemiológico a nivel nacional, el mayor número de muertes se registró en las personas mayores de 60 años, mientras que el mayor número de casos se presentó en el grupo de edad entre los 25 y los 40 años.

Río Iró Nuquí Bojayá Carmen del Darién Nóvita Bagadó Lloró Río Iró Carmen del Darién Lloró Condoto Condoto Bojayá Río Quito Atrato Unión Panamericana Nóvita Bagadó Unión Panamericana Tadó Acandí Nuquí Tadó Acandí Riosucio Riosucio Río Quito Quibdó Quibdó 0 1000 2000 0 25 50 75 100 Casos Fallecimientos

Carmen del Darién Carmen del Darién Bojayá Nuquí Lloró Bagadó Nóvita Riosucio Río Iró Condoto Condoto Bojayá Riosucio Lloró Tadó Atrato Río Quito Nóvita Bagadó Tadó Nuquí Acandí Atrato Río Iró Acandí Unión Panamericana Unión Panamericana Quibdó Quibdó Río Quito 0 50 100 150 200 0 2 4 6 8 Casos Por 10.000 habitantes Muertes Por 10.000 habitantes

Nuquí 400 Bagadó Quibdó Casos Atrato Acandí 300 Fallecimientos Riosucio Carmen del Darién Tadó 200 Unión Panamericana Condoto Río Quito 100 Lloró Bojayá Río Iró Nóvita 0 0 10 20 0 25 50 75 100 CFR (%) Edad

6 1.5 Número reproductivo efectivo COVID-19 en Chocó El número reproductivo efectivo (Rt) continúa por debajo de 1, lo que es compatible con un escenario de supresión. Solo se puede estimar hasta la fecha 2020-08-26 dado que hay un rezago aproximado de 15 días. CHOCO ( n=3851) 5

4

3 R (última semana) = 0.74 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.1 Número reproductivo efectivo COVID-19 en Quibdó QUIBDO ( n=2594) 5

4

3 R (última semana) = 0.79 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.2 Número reproductivo efectivo COVID-19 Istmina

7 ITSMINA ( n=178) 5

4

3 R (última semana) = 0.77 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.3 Número reproductivo efectivo COVID-19 Riosucio RIOSUCIO ( n=112) 5

4

3 R (última semana) = 0.47 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.4 Número reproductivo efectivo COVID-19 Carmen de Atrato

8 ( n=189) 5

4

3 R (ultima semana) = 0.77 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.6 Número reproductivo efectivo COVID-19 en Nuquí BAGADO ( n=61) 5

4

3 R (ultima semana) = 2.54 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.7 Número reproductivo efectivo COVID-19 en Acandí

9 ACANDI ( n=95) 5

4

3 R (ultima semana) = 1.07 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

1.5.5 Número reproductivo efectivo COVID-19 en Nuquí NUQUI ( n=95) 5

4

3 R (ultima semana) = 1.11 R(t) 2 zona de peligro 1 zona de mitigación zona de supresión 0

2020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

10 2. Rastreo de casos y contactos en Chocó

2.1 Análisis de rastreo de casos en Chocó La proporción de casos en estudio, continua siendo mayor que la proporción de casos relacionados. Esto evidencia las debilidades que persisten en los sistemas de información y vigilancia epidemiológica.

Relacionado En estudio

1.00

0.75

0.50 cases

0.25

0.00

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha

Idealmente, se espera que la proporción de casos identificados en su etapa asintomática crezca con el tiempo. Aunque se han hecho esfuerzos para aumentar las acciones de vigilancia en salud pública (búsquedas activas comunitarias, ivestigaciones epidemiológicas de campo, búsquedas activas institucionales,etc.), se continúa evidenciando una proporción de casos sin información.

asintomático Sin información sintomático

1.00

0.75

0.50 cases

0.25

0.00

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha

11 asintomático Sin información sintomático

100

cases 50

0

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha

2.2 Proporción de conglomerados en Chocó En total se han identificado 12 categorias de conglomerados.

1.00

AERONAUTICA 0.75 CARCEL CENTROS DE RECUPERACIÓN NUTRICIONAL COMERCIO COMUNITARIO EMPRESAS PRIVADAS 0.50 GERIATRICO HOSPITAL INDIGENAS INSTITUCIONES PÚBLICAS 0.25 MILITARES POLICIA NA

0.00 Proporción de casos en conglomerados por semana Proporción de casos en conglomerados

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha notificación

2.3 Epicurvas de conglomerados en Chocó

12 AERONAUTICA CARCEL CENTROS DE RECUPERACIÓN NUTRICIONAL COMERCIO 1.00 2.0 60 9 0.75 1.5 40 0.50 1.0 6 0.25 20 0.5 3 0.00 0 0.0 0 COMUNITARIO EMPRESAS PRIVADAS GERIATRICO HOSPITAL 8 6 40 30 6 30 4 20 20 4 10 2 10 2 0 0 0 0 INDIGENAS INSTITUCIONES PÚBLICAS MILITARES POLICIA 30 8 50 60 40 20 6 30 40 4 20 10 20 2 10 0 0 0 0 NA 400 PNúmero de casos en conglomerados por semana PNúmero de casos en conglomerados

300 2020−04−062020−04−202020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−09−212020−04−062020−04−202020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−09−212020−04−062020−04−202020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−09−21 200 100 0

2020−04−062020−04−202020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−09−21 Fecha notificación

2.4 Búsqueda activa en Chocó

13 Busqueda activa Notificación Rutinaria NA

1.00

0.75

0.50 cases

0.25

0.00

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha

Busqueda activa Notificación Rutinaria NA

100 cases

50

0

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha

14 3. Movilidad

3.1 Análisis de movilidad de Google en Chocó

residencial tiendas/farmacias trabajo transito

Choco

0

−25

−50 cambio proporcional en la movilidad

−75

2020−03−23 2020−04−06 2020−04−20 2020−05−04 2020−05−18 2020−06−01 2020−06−15 2020−06−29 2020−07−13 2020−07−27 2020−08−10 2020−08−24 2020−09−07 2020−09−21

15 Movilidad de Google en Chocó y otros departamentos Según los datos de Google, el tránsito vehicular presenta un aumento significativo en las últimas semanas.

residencial tiendas/farmacias trabajo transito

Choco

30

0

−30

−60

Antioquia Valle del Cauca

30

0

−30

−60

grocery_and_pharmacy_smoothed Cauca Narino

30

0

−30

−60

2020−03−232020−04−062020−04−202020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−09−212020−03−232020−04−062020−04−202020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−09−21

16 4. Capacidad hospitalaria

4.1 Disponibilidad y ocupación del total de camas UCIs en el Departamento del Chocó El 19 de Abril se registró el primer caso en el departamento del Chocó hospitalizado en UCI por sospecha de COVID-19. Entre mediados del mes de junio y finales del mes de julio se registró la mayor ocupación de cuidados intensivos para pacientes con diagnóstico confirmado y con sospecha de COVID-19. Después del 27 de julio, se evidencia disminución de la ocupación de UCI y aumento en la proporción de ocupación de UCI de pacientes con otras patologías y sospecha de COVID-19, con relación a los casos confirmados.

covid_conf covid_sospechoso NO_covid Total

Disponibilidad total camas UCI

30

20

10

0

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21

Ocupación UCI Número de camas 40

30

20

10

0

2020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−21 Fecha de Medición

4.2 Disponibilidad y ocupación de UCIs en la Nueva ESE Hospital San Francisco de Asís En el Hospital San Francisco de Asís, tanto en cuidados intermedios como en UCI, el mayor número de camas ha estado ocupado por casos sospechosos, lo cual sugiere falta de oportunidad diagnóstica. En las últimas semanas se evidencia una mayor ocupación de camas por patología general y por casos no COVID-19

17 covid_conf covid_sospechoso NO_covid Total

Disponibilidad total camas Disponibilidad total camas Disponibilidad total camas Area Asilamiento UC Intermedia UCI 30 3

10 20 2

5 10 1

0 0 0

2020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−14

Ocupación Ocupación Ocupación Area Asilamiento UC Intermedia UCI Número de camas 4

20 7.5 3 15 5.0 2 10

2.5 5 1

0 0 0.0

2020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−09−212020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−142020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−14 Fecha de Medición

18 5. Toma de muestras para COVID en el Chocó

El mayor número de muestras se tomó entre junio y julio (más de 2,500 pruebas semanales). En el último més se han tomado alrededor de 700 muestras por semana.

5.1 Número de muestras para COVID en Chocó

2500

2000 Resultado EN PROCESAMIENTO 1500 INDETERMINADO

1000 NEGATIVO NO PROCESADAS POR FALLAS PRE−ANALITICAS 500 POSITIVO

0 Número de muestras por semana Número de muestras

2020−03−022020−03−092020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−14 Fecha de toma de muestra

5.2 Proporción de muestras para COVID en Chocó

1.00 Resultado 0.75 EN PROCESAMIENTO INDETERMINADO 0.50 NEGATIVO NO PROCESADAS POR FALLAS PRE−ANALITICAS 0.25 POSITIVO

0.00 Proporción de muetras por Semana Proporción de muetras

2020−03−022020−03−092020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−14 Fecha de toma de muestra

5.3 Número de muestras tomadas por cada Empresa Administradora de Planes de Beneficios -EAPB Entre los meses de mayo y julio, la mayor cantidad de muestras fueron realizadas por los entes territoriales (Secretaría de salud municipal de Quibdó y Secretaría de salud departamental). En las últimas semanas se destaca un aumento en la proporción de muestras tomadas por parte de las EAPBs, principalmente Comfachocó, Nueva EPS y Comparta.

19 2500 EAPB

a.Secretaría Salud AMBUQ 2000 COMFACHOCO COMPARTA COOMEVA 1500 F.MILITARES MEDIMAS

1000 NUEVA EPS POLICIA SALUD TOTAL 500 SANITAS Número de muestras por semana Número de muestras SURA z.Otras 0 NA

2020−03−022020−03−092020−03−162020−03−232020−03−302020−04−062020−04−132020−04−202020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−072020−09−14 Fecha de toma de muestra

5.4 Proporción de muestras tomadas por cada EAPBs

1.00 EAPB

a.Secretaría Salud AMBUQ

0.75 COMFACHOCO COMPARTA COOMEVA F.MILITARES

0.50 MEDIMAS NUEVA EPS POLICIA SALUD TOTAL 0.25 SANITAS

Proporción Muestras Por Semana Por Proporción Muestras SURA z.Otras NA 0.00

2020−02−292020−03−032020−03−062020−03−092020−03−122020−03−152020−03−182020−03−212020−03−242020−03−272020−03−302020−04−022020−04−052020−04−082020−04−112020−04−142020−04−172020−04−202020−04−232020−04−262020−04−292020−05−022020−05−052020−05−082020−05−112020−05−142020−05−172020−05−202020−05−232020−05−262020−05−292020−06−012020−06−042020−06−072020−06−102020−06−132020−06−162020−06−192020−06−222020−06−252020−06−282020−07−012020−07−042020−07−072020−07−102020−07−132020−07−162020−07−192020−07−222020−07−252020−07−282020−07−312020−08−032020−08−062020−08−092020−08−122020−08−152020−08−182020−08−212020−08−242020−08−272020−08−302020−09−022020−09−052020−09−082020−09−112020−09−14 Fecha de toma de muestra

5.5 Positividad de muestras en el departamento del Chocó Durante el primer pico el índice de positividad ha oscilado entre 10 y 35%. En las últimas semanas, se ha mantenido entre 10 y 15%.

20 50 50%

40

30 25% 20 positividad

10 10%

0

2020−04−272020−05−042020−05−112020−05−182020−05−252020−06−012020−06−082020−06−152020−06−222020−06−292020−07−062020−07−132020−07−202020−07−272020−08−032020−08−102020−08−172020−08−242020−08−312020−09−07 Fecha

Muestras tomadas en cada municipio del Chocó Los municipios que han registrado el mayor número de muestras tomadas son Quibdó,Istmina, Unión Panamericana, Medio San Juán y Cértegui.

21 * PROCEDENCIA DESCONOCIDA ACANDI ALTO BAUDO (PIE DE PATO) ATRATO 1.00 30 0.75 100 90 20 0.50 60 50 0.25 10 30 0.00 0 0 0 BAGADO BAHIA SOLANO (MUTIS) BAJO BAUDO (PIZARRO) BOJAYA (BELLAVISTA) 250 1.00 200 0.75 20 100 150 0.50 50 100 10 50 0.25 0 0 0.00 0 CANTON DE SAN PABLO (MANAGRU) CARMEN DEL DARIEN CERTEGUI CONDOTO

60 20 40 30 15 30 40 20 10 20 20 5 10 10 0 0 0 0 EL CARMEN DE ATRATO ITSMINA LLORO 30 400 1.00 300 100 20 0.75 200 0.50 50 10 100 0.25 0 0 0 0.00 MEDIO BAUDO (BOCA DE PEPE) NOVITA NUQUI 150 250 60 200 Total Muestras Procesadas Muestras Total 40 100 40 150 20 50 100 20 50 0 0 0 0 QUIBDO RIO IRO RIOQUITO RIOSUCIO 1500 30 40 75 1000 20 30 50 20 10 500 25 10 0 0 0 0 SIPI TADO UNGUIA UNION PANAMERICANA 1.00 2.0 100 0.75 200 1.5 75 150 0.50 100 1.0 50 0.25 50 0.5 25 0.00 0 0.0 0

2020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−07 2020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−07 2020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−07 Fecha de toma de muestra

5.6 Positividad de muestras en municipios del Chocó

22 * PROCEDENCIA DESCONOCIDA ACANDI ALTO BAUDO (PIE DE PATO) ATRATO 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25% 10% 10% 10% 10% 0 BAGADO BAHIA SOLANO (MUTIS) BAJO BAUDO (PIZARRO) BOJAYA (BELLAVISTA) 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25% 10% 10% 10% 10% 0 CANTON DE SAN PABLO (MANAGRU) CARMEN DEL DARIEN CERTEGUI CONDOTO 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25% 10% 10% 10% 10% 0 EL CARMEN DE ATRATO ITSMINA LLORO MEDIO ATRATO 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25%

Positividad 10% 10% 10% 10% 0 MEDIO BAUDO (BOCA DE PEPE) MEDIO SAN JUAN NOVITA NUQUI 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25% 10% 10% 10% 10% 0 QUIBDO RIO IRO RIOQUITO RIOSUCIO 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25% 10% 10% 10% 10% 0 SIPI TADO UNGUIA UNION PANAMERICANA 100 75 50 50% 50% 50% 50% 25 25% 25% 25% 25% 10% 10% 10% 10% 0

2020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−072020−05−042020−05−182020−06−012020−06−152020−06−292020−07−132020−07−272020−08−102020−08−242020−09−07 Fecha

23 6. Resumen de Intervenciones

Chocó Quibdó Otros Municipios

Suspensión de eventos > 20 p Suspensión clases Plan de contingencia Decreto de movilidad Decreto 0128 toque de queda 8pm − 5am Decreto 0090 varuos cierres Cuarentena Nacional Distanciamiento Social Creación puestos de control Apertura económica Aislamiento social y preventivo Actividad física niños y adultos < 60 Actividad física adultos > 60 095 Pico y cédula 0106 Pico y cédula

Suspencion LDSP muestras Primer lab RT−PCR PRASS Introducción Prueba Ag Inicio Sala Situacional Rastreo, Testeo, Seg Est Camara de comercio Testeo Masivo ERI Subregionales 2,250 muestras ERI Quibdó( 1,400 muestras ) ERI Conglomerados institucionales y comunitarios

Instalacion Puntos de lavado de manos Instalación Puesto de Mando Unificado Comunicación del Riesgo Capacitacion a lideres Campaña de concientización #Unidossalvamosvidas

Vig Epi Comunutaria Sala Situacional Grupo Analisis Modelamiento COVID−19 Gestión Creación Comité PCM Apoyo SIEDITER−pacifico Task

UCI (32) , VM (23), camas (60), hosp(129) Capacidad hospitalaria UCI (24) , VM (23), camas(49), hosp (129) abr. may. jun. jul. ago. sept. Fecha

24 Conclusiones

Transmisión • Desde la semana del 8 de junio se evidencia un descenso del Rt en el departamento, que hasta ese entonces se encontraba en zona de peligro. Posteriormente el descenso se hace progresivo y desde la semana del 6 de julio se ha evidenciado un número reproductivo efectivo en niveles de supresión (Rt actual=0.74), en la última medición confiable (es decir, hasta el 2020-09-01). Esto puede estar explicado por la gestión queserealizó ante Gobierno nacional solicitando ampliación de medidas en la semana del 19 de junio, la implementación de la estrategia PRASS en el municipio de Quibdó a partir del 30 de junio, el despliegue de los Equipos de Respuesta Inmediata Subregional de la secretaría de salud departamental (ver gráfica 6) • Actualmente la estrategia nacional de intervención se centra en el aislamiento selectivo con distanciamiento individual responsable que debe contar con el compromiso de las EAPBs y los entes territoriales para el garantizar el rastreo y seguimiento oportuno y efectivo de casos. A través de la estrategia de vigilancia comunitaria sindrómica a implementar en 11municipios del Departamento del Chocó (Bagadó, Riosucio, Bajo Baudó, Tadó, Istmina, Carmen de Atrato, Alto Baudó, Juradó, Acandí, Quibdó y Bojayá), se fortalecerá detección temprana, repuesta oportuna y comunicación del riesgo frente a eventos de interés en salud pública priorizados. • La mayoría de los municipios evaluados están en una mejor zona en comparación con las semanas anteriores. Actualmente, hay un rezago de datos de cerca de 15 días, lo cual dificulta tener estimaciones de Rt más actualizadas. Bagadó continúa siendo el único municipio con Rt > 1; sin embargo, se observa un bajo número de muestras, no solo en este municipio sino en la mayoría, lo que genera mayor incertidumbre en las estimaciones. Movilidad Según los datos de movilidad de Google, se evidencia un marcado incremento en las últimas semanas, princi- palmente vehicular, tendencia que coincide con la apertura, con el comportamiento de movilidad observado en otros departamentos y con la observación empírica en el territorio. Sin embargo, los datos provenientes de la Policía regional no coinciden con esta realidad, lo que puede obedecer a cambios en la metodología de recolección, validación y consolidación de estos. Se reincorporará esta fuente a los informes, una vez validada la calidad del dato con las personas responsables de la Policía. Rastreo y Muestras • En el primer pico epidémico evidenciamos, no solo desborde de la capacidad hospitalaria, sino también de los sistemas de información y vigilancia epidemiológica. Se evidencia una desproporción en el número de casos sin información, al igual que el número de casos en estudio, por lo que se hace prioritario seguir fortaleciendo los sistemas de información, maximizar el rastreo, identificación de conglomerados y el análisis oportuno de la información para direccionar la respuesta. • A partir de datos de SISMUESTRAS, se observa que el Departamento del Chocó ha logrado realizar tomas de muestras de hasta 2500 en una semana, pero en las últimas dos semanas el promedio ha sido alrededor de 700 muestras, lo cual es un cambio notorio en la estrategia de testeo. Adicionalmente, persiste el problema de los datos desactualizados en SISMUESTRAS (son confiables hasta el 31 de agosto y a partir de esa fecha sólo hay información de positivos). Se han hecho esfuerzos por buscar datos de otras fuentes para complementar la información existente y ya se tienen los datos de SIVIGILA, pero sólo tiene datos de muestras tomadas y muestras positivas. Para el próximo informe se tiene planeado incluirlos en el análisis, aunque cabe mencionar que hay desactualización de los datos en ambas plataformas. • Al 15 de septiembre de 2020, había un represamiento de 541 muestras en espera de resultados, de las cuales 185 están en el INS y por enviar para procesamiento 64. • Las actividades de asistencia técnica a los municipios deben revisarse para verificar si las EAPBs están haciendo el trabajo de PRASS desde el operador de cada municipio. • En la ocupación de UCI del Departamento, que extiende la información anterior del Hospital San Francisco de Asís a todo el Departamento, se observa un pico de ocupación que rebasa la capacidad instalada entre

25 mediados del mes de junio y la semana del 20 de julio. Esta capacidad varía a través del tiempo por complicaciones en cuanto a personal, plantas de oxígeno, etc., que hace algunas camas no estén disponibles temporalmente. Se observa una tendencia a la baja en la ocupación de camas UCI de COVID-19 sospechosos y confirmados, predominando la ocupación por otras patologías en las últimas semanas. Se observa además una reducción en la ocupación de UCIs y hospitalización en el Departamento. Esto coincide con el descenso de los casos nuevos y el rol que vienen cumpliendo algunas EAPBs en garantizar la oportunidad diagnóstica. • La ocupación de casos no COVID se ve reflejada desde el 30 de julio y no antes porque está información no está disponible a nivel del departamento. Se están haciendo esfuerzos por reconstruir estos datos e incluirlos. Mortalidad • El comportamiento de muertes y casos coincide con el nacional y global en cuanto a grupos etarios. Dada la limitación en cuanto a la oportunidad de datos de diagnóstico, es importante continuar la vigilancia estricta y análisis de las muertes, las cuales, por ahora, son el dato más confiable para analizar el avance de la epidemia. • Las unidades de análisis muestran una tendencia al descenso de las muertes en el departamento; más del 50% de las muertes acumuladas han ocurrido en Quibdó́. Las personas parecen haber disminuido el desplazamiento a otras ciudades para buscar atención médica. Actualmente, Chocó reporta un total de 164 muertes acumuladas relacionadas con COVID, de las cuales 149 son COVID confirmadas, 9 son con COVID, pero por otra causa y 6 son en casos sospechosos.

Grupo de Trabajo

Grupo Análisis de datos COVID-CHOCÓ

• Silvia Quiroz Mena (Universidad Tecnológica del Chocó) • Nayade Córdoba (Secretaría de Salud Municipal de Quibdó) • Yaicira Maturana (Secretaría de Salud Municipal de Quibdó) • Luisa Carolina Garcés (Secretaría de Salud Departamental del Chocó) • Carmen Pedroza (Secretaría de salud Departamental del Chocó) • Gloria Prado Pino (Organización Panamericana de la Salud) • Jorge Torres Gil (Profesional de la salud independiente) • Yessyrys Mena (Profesional de la salud independiente) • Deiner Mena Waldo (Universidad Tecnológica del Chocó) • Estudiantes del programa de Enfermería Universidad Tecnológica del Chocó • Equipos de vigilancia epidemiologíca departamental y municipal • Angie Méndez (Instituto Nacional de Salud) • Alexander Trilleras (Instituto Nacional de Salud) • Diego Lucumí (Universidad de Los Andes) • Zulma M Cucunubá (Imperial College London)

Instituciones Aliadas (entrega de información y discusiones)

• Jesús Delgado (Secretario de Salud Municipal de Quibdó) • Naudy Ortega Úsuga (Secretaria de Salud del departamento del Chocó) • Policía Nacional Regional del Chocó • IPSs y EAPBs del departamento del Chocó

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