DOCSLIB.ORG

AR 2008 Italiano 09-09.Indd

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text
AR 2008 Italiano 09-09.Indd Fondazione Edmund Mach IASMA Centro Sperimentale COPERTINA Vista della Piana Rotaliana da una delle torri micrometeorologiche attive nei principali ecosistemi vegetali sul territorio trentino. Queste stazioni consentono di migliorare la conoscenza dei meccanismi dei cicli del carbonio e dell’azoto, necessaria a adempiere agli obblighi imposti dal protocollo di Kyoto. FONDAZIONE EDMUND MACH Presidente Giovanni Gius Direttore Generale Alessandro Carlo Dini CENTRO SPERIMENTALE Dirigente Roberto Viola Relazioni Scientifi che Floriana Marin Amministrazione Roberto Maffei, Luigi Conter Segreteria Elisabetta Esposito Telefono: +39 0461 615427 - Fax: +39 0461 650956 Web: http://research.iasma.it e-mail: [email protected] Annual Report IASMA Centro Sperimentale 2008 © 2009 Fondazione Edmund Mach, Via E. Mach 1 – 38010 San Michele all’Adige (TN), Italia È vietata la riproduzione in qualsiasi forma Caporedattore Roberto Viola Comitato editoriale Claudio Ioriatti, Fulvio Mattivi, Annapaola Rizzoli, Nico Salmaso, Marco Stefanini, Riccardo Velasco Redazione Floriana Marin, Lucia Martinelli Fotografi e Gianni Zotta; Palma & Associati still life; archivio IASMA; archivio SafeCrop; archivio CSBT; AB Applied Biosystems; N. Angeli; P. Fontana, p. 73, Fig. 1; S. Gottardi, p. 96; DM Rizzo, p. 65, Fig. 3; Gianfranco Scieghi, p. 91 Progetto grafi co e realizzazione esecutiva Palma & Associati Stampa Litotipografi a Alcione ISSN 1974-5869 PARTE 1 | PREFAZIONE INDICE Presidente della Fondazione Edmund Mach 7 Dirigente del Centro Sperimentale 9 L’Istituto 10 Il Centro Sperimentale 14 PARTE 2 | DIPARTIMENTI Dipartimento Qualità Agro Alimentare 19 Tracciabilità geografi ca di oli extravergine di oliva nazionali ed europei 21 Metodi sensoriali classici e approcci innovativi di data mining per la classifi cazione di formaggi tipici 23 Biodiversità batterica nei latti del Trentino e impiego di ceppi autoctoni come colture d’integrazione 25 nella produzione dei formaggi nostrani In evidenza 27 Strumenti e apparecchiature 29 Dipartimento Valorizzazione delle Risorse Produttive 30 Il bi-asse: un sistema alternativo di allevamento del melo 32 Germoplasma di piccoli frutti 34 Applicazione della Texture Analysis in viticoltura: effetti del genotipo e delle pratiche colturali 36 In evidenza 39 Strumenti e apparecchiature 41 Dipartimento Biologia e Genetica Molecolare 42 Le basi per un miglioramento genetico di successo: dal genoma al campo 44 Variazione dell’espressione aromatica in due cloni di Chardonnay 46 Sviluppo di un’analisi affi dabile per quantifi care i geni esogeni in planta 49 La via di sintesi e di trasduzione del segnale dell’etilene in vite: il suo ruolo nello sviluppo della bacca 51 In evidenza 53 Strumenti e apparecchiature 55 Dipartimento Valorizzazione delle Risorse Naturali 56 Modelli per la stima dell’impatto del riscaldamento globale sulla fenologia della vite in Trentino 59 L’ozono troposferico in Trentino: è un problema per le foreste? 61 Interazioni tra patogeni forestali e cambiamenti climatici 64 Sostenibilità energetica ed ambientale di un’azienda agricola di montagna 66 In evidenza 68 Strumenti e apparecchiature 69 Dipartimento Protezione delle Piante 71 Studi morfo-funzionali sulla comunicazione olfattiva di Apis mellifera L. ed altre specie di apoidei 73 Screening in vitro per la resistenza ad Apple proliferation in melo 75 Un metodo innovativo basato sulla degradazione dell’acido nicotinico per la selezione di microorganismi 77 antagonisti contro il colpo di fuoco In evidenza 80 Strumenti e apparecchiature 82 Centro di ecologia alpina 83 Il rapporto uomo-ambiente: i sistemi socio-ecologici 85 Remote sensing e ricerca ambientale 87 Cambiamenti globali e malattie emergenti trasmesse all’uomo dalla fauna selvatica nelle Alpi 90 Flussi di gas serra negli ecosistemi forestali 92 Genetica della conservazione 94 In evidenza 96 Strumenti e apparecchiature 98 PARTE 2 | SERVIZI DI ANALISI Servizi e consulenze 100 PARTE 3 | INFORMAZIONI Progetti di ricerca 103 Affi liazioni a società scientifi che 110 Presenza nei comitati editoriali di riviste scientifi che 112 Riconoscimenti 113 Tesi accademiche discusse nel 2008 113 Pubblicazioni 2008 115 Staff 137 COME RAGGIUNGERE SAN MICHELE ALL’ADIGE 147 RINGRAZIAMENTI 149 Annual Report IASMA Centro Sperimentale 2008 5 6 Annual Report IASMA Centro Sperimentale 2008 PARTE 1 | PREFAZIONE Giovanni Gius È con orgoglio che presentiamo per il terzo anno consecutivo l’Annual Report, una ricca selezione dei lavori e delle attività svolte nel corso del 2008 dal Centro Sperimentale della Fondazione Edmund Mach - IASMA. Anche questa terza edizione è ricca di contenuti e spunti scientifi ci, a testimonianza dell’intensa attività di ricerca realizzata dalla Fondazione Edmund Mach. Un istituto che nel tempo ha saputo crescere ed evolvere. Seicentosessantanove persone tra dipendenti e collaboratori e un compendio immobiliare che si estende su una superfi cie di 24 mila metri quadrati. Numeri importanti e una storia importante. Quest’anno va segnalato un ulteriore passaggio del nostro ente all’interno di un percorso iniziato con la trasformazione in fondazione privata. Il primo gennaio 2009 è entrato in funzione il nuovo regolamento organizzativo il cui aspetto più evidente consiste nella separazione tra ricerca e sperimentazione. I centri hanno cambiato denominazione e competenze, acquisendo maggior snellezza operativa che, per l’Istituto, signifi ca rapportarsi meglio alle esigenze del territorio nell’ambito della ricerca, della formazione e della consulenza tecnica. Il nuovo assetto consentirà inoltre, soprattutto per le attività di ricerca e innovazione, di inserire San Michele in una rete nazionale e internazionale di enti attivi in questi settori. Passato e futuro, tradizione e innovazione, ricordi e progetti, questo, mi preme ripeterlo, il non sempre facile equilibrio che è stato alla base delle scelte importanti nella vita recente dell’Istituto. Per quanto riguarda il futuro l’impegno è quello di proseguire su questa strada: il Centro Ricerca e Innovazione continuerà ad operare, da un lato, mantenendo vivo il legame con il Trentino e, dall’altro, valorizzando e potenziando ancora di più il carattere di eccellenza che già ora contraddistingue l’attività di questa struttura. Vorrei sottolineare che è dalle esigenze specifi che del territorio trentino che nascono le attività di ricerca; ovvero, è dai bisogni concreti dell’agricoltura trentina che partono le idee e le proposte che poi si concretizzano in progetti internazionali e che, sviluppandosi ad alti livelli, portano a risultati di forte impatto e interesse internazionale. Ecco allora che l’Annual Report diventa lo specchio ed il testimone di un lavoro di squadra che ha portato e porterà sempre più – mi auguro- la ricerca di San Michele in tutto il mondo attraverso collaborazioni, partnership, incontri a vario titolo e scambi di ricercatori. Desidero, infi ne, complimentarmi con tutti coloro che, a diverso titolo, prestano la loro attività e dedicano le proprie energie all’interno del Centro Sperimentale della Fondazione-Istituto Agrario. Un pensiero particolare a coloro che si sono adoperati nella realizzazione di questa pubblicazione. A tutti il ringraziamento mio personale e dell’intero consiglio di amministrazione. Dott. Giovanni Gius Presidente della Fondazione Edmund Mach Annual Report IASMA Centro Sperimentale 2008 7 8 Annual Report IASMA Centro Sperimentale 2008 PARTE 1 | PREFAZIONE Roberto Viola L’ anno di avvio della Fondazione Edmund Mach si è presentato ricco di sfi de e opportunità per il Centro Sperimentale IASMA. Un notevole sforzo strategico è stato dispiegato per la ridefi nizione di obiettivi, ruoli e competenze necessari alla riorganizzazione complessiva delle attività della Fondazione completata nel Dicembre 2008. Il processo di ristrutturazione ha portato alla costituzione del Centro Ricerca e Innovazione, reso operativo il 1° Gennaio 2009, ove sono confl uite le attività di ricerca del Centro Sperimentale. La performance scientifi ca del Centro ha proseguito anche per il 2008 su direttrici di continuo miglioramento qualitativo. Le pubblicazioni su riviste scientifi che internazionali (ISI) sono aumentate del 55% rispetto all’anno precedente. Contemporaneamente, sul fronte dell’impatto e delle ricadute della ricerca è aumentato il bagaglio di assetti intellettuali e si è intensifi cata l’attività di miglioramento varietale fi nalizzata alla sostenibilità del settore frutticolo e viticolo. In questo contesto s’inserisce la costituzione del Consorzio Innovazione Frutta che coinvolge diversi stakeholders territoriali ed è fi nalizzato a valorizzare i programmi di miglioramento genetico di IASMA. Sono proseguiti gli investimenti in risorse umane e piattaforme tecnologiche nei settori della genetica e genomica agraria, della fi tochimica applicata a nutrizione e tracciabilità e delle scienze applicate all’ambiente. Proprio in riferimento a quest’ultimo settore, uno degli eventi più signifi cativi dell’anno ha riguardato l’integrazione, nel Centro Sperimentale IASMA, del Centro di Ecologia Alpina (CEA) – fi no al dicembre 2007 ente funzionale della Provincia autonoma di Trento. La sinergia tra il CEA, focalizzato sulle tematiche di conservazione degli ecosistemi alpini, e il Dipartimento Valorizzazione Risorse Naturali IASMA rappresenta per la Fondazione un bagaglio di risorse e competenze di ricerca in campo ambientale unico nel suo genere. Questo ci consentirà di portare un contributo signifi cativo di ricerca e innovazione su problematiche d’interesse prioritario:
Load more

Recommended publications
  • Evaluation of the Oenological Suitability of Grapes Grown Using Biodynamic Agriculture: the Case of a Bad Vintage R
    Journal of Applied Microbiology ISSN 1364-5072 ORIGINAL ARTICLE Evaluation of the oenological suitability of grapes grown using biodynamic agriculture: the case of a bad vintage R. Guzzon1, S. Gugole1, R. Zanzotti1, M. Malacarne1, R. Larcher1, C. von Wallbrunn2 and E. Mescalchin1 1 Edmund Mach Foundation, San Michele all’Adige, Italy 2 Institute for Microbiology and Biochemistry, Hochschule Geisenheim University, Geisenheim, Germany Keywords Abstract biodynamic agriculture, FT-IR, grapevine, wine microbiota, yeast. Aims: We compare the evolution of the microbiota of grapes grown following conventional or biodynamic protocols during the final stage of ripening and Correspondence wine fermentation in a year characterized by adverse climatic conditions. Raffaele Guzzon, Edmund Mach Foundation, Methods and Results: The observations were made in a vineyard subdivided Via E. Mach 1, San Michele all’Adige, Italy. into two parts, cultivated using a biodynamic and traditional approach in a E-mail: [email protected] year which saw a combination of adverse events in terms of weather, creating 2015/1999: received 11 June 2015, revised the conditions for extensive proliferation of vine pests. The biodynamic 12 November 2015 and accepted approach was severely tested, as agrochemicals were not used and vine pests were 14 November 2015 counteracted with moderate use of copper, sulphur and plant extracts and with intensive use of agronomical practices aimed at improving the health of the doi:10.1111/jam.13004 vines. Agronomic, microbiological and chemical testing showed that the response of the vineyard cultivated using a biodynamic approach was comparable or better to that of vines cultivated using the conventional method.
    [Show full text]
  • A Comparative Study of Plant-Pathogen Interaction In
    UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI UDINE Sede convenzionata: Fondazione Edmund Mach Corso di Dottorato di Ricerca in Scienze e Biotecnologie Agrarie Ciclo XXIX TESI DI DOTTORATO DI RICERCA A comparative study of plant-pathogen interaction in different genotypes and organs of grapevine (Vitis spp.), based on optimized and new screening methods for resistance to downy mildew (Plasmopara viticola - Berk. & Curt.) Coordinator: Prof. Giuseppe Firrao Supervisor: Dr. Riccardo Velasco Co-supervisors: Dr. Silvia Vezzulli PhD student: Prof. Rita Musetti Daniele Buonassisi ANNO ACCADEMICO 2016/2017 Ho domandato, allora: "Signore, Tu avevi detto che saresti stato con me in tutti i giorni della mia vita, ed io ho accettato di vivere con te, perché mi hai lasciato solo proprio nei momenti più difficili?" Ed il Signore rispose: "Figlio mio, Io ti amo e ti dissi che sarei stato con te e che non ti avrei lasciato solo neppure per un attimo: i giorni in cui tu hai visto solo un'orma sulla sabbia, sono stati i giorni in cui ti ho portato in braccio". (L’orma sulla sabbia) Index i) INDEX i) INDEX ....................................................................................................................................................... 3 ii) ABSTRACT ............................................................................................................................................. 6 CHAPTER 1 .................................................................................................................................................... 8 GENERAL
    [Show full text]
  • The Grapevine Vvibzipc22 Transcription Factor Is Involved in the Regulation of Flavonoid Biosynthesis
    Journal of Experimental Botany, Vol. 67, No. 11 pp. 3509–3522, 2016 doi:10.1093/jxb/erw181 Advance Access publication 18 May 2016 This paper is available online free of all access charges (see http://jxb.oxfordjournals.org/open_access.html for further details) RESEARCH PAPER The grapevine VvibZIPC22 transcription factor is involved in the regulation of flavonoid biosynthesis Giulia Malacarne1,*, Emanuela Coller1, Stefan Czemmel2, Urska Vrhovsek1, Kristof Engelen1, Vadim Goremykin1, Jochen Bogs2,3 and Claudio Moser1 1 Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, Via E. Mach 1, 38010 S. Michele all’Adige, Trento, Italy 2 Centre for Organismal Studies Heidelberg, University of Heidelberg, Im Neuenheimer Feld 360, D-69120 Heidelberg, Germany Downloaded from 3 Studiengang Weinbau und Oenologie, Dienstleistungszentrum Laendlicher Raum Rheinpfalz, Breitenweg 71, D-67435 Neustadt, Germany * Correspondence: [email protected] http://jxb.oxfordjournals.org/ Received 11 December 2015; Accepted 11 April 2016 Editor: Qiao Zhao, Tsinghua University Abstract In grapevine, flavonoids constitute one of the most abundant subgroups of secondary metabolites, influencing the at Biblioteca Fondazione Edmund Mach on August 28, 2016 quality, health value, and typicity of wines. Their synthesis in many plant species is mainly regulated at the transcrip- tional level by modulation of flavonoid pathway genes either by single regulators or by complexes of different regu- lators. In particular, bZIP and MYB factors interact synergistically in the recognition of light response units present in the promoter of some genes of the pathway, thus mediating light-dependent flavonoid biosynthesis. We recently identified VvibZIPC22, a member of clade C of the grapevine bZIP family, in a quantitative trait locus (QTL) specifi- cally associated with kaemperol content in mature berries.
    [Show full text]
  • Clarifying Agents and 3-Sulfanylhexanol Precursors in Grape Juice
    SHORT COMMUNICATION CLARIFYING AGENTS AND 3-SULFANYLHEXANOL PRECURSORS IN GRAPE JUICE T. ROMÁN, R. LARCHER, D. SLAGHENAUFI, L. TONIDANDEL, S. MOSER and G. NICOLINI* Unità Chimica Vitienologica e Agroalimentare, Centro Trasferimento Tecnologico - Fond. Edmund Mach, Via E. Mach 1, 38010 San Michele all’Adige, TN, Italy *Corresponding author. [email protected] ABSTRACT We evaluated the impact of a number of clarifying agents on the concentration of S-3- (hexan-1-ol)-L-cysteine (Cys-3SH) and S-3-(hexan-1-ol)-L-glutathione (GSH-3SH). 19 clear grape juices were spiked with a grape skin tannin rich in Cys-3SH and GSH-3SH. Juices were then treated with Na-bentonite, PVPP or charcoal (1 g/L) and cold settled. The concentration of precursors was measured and compared to the corresponding untreated control juices in the devatted samples. Cys-3SH and GSH-3SH were analysed using UHPLC-MS/MS and accuracy was guaranteed with deuterated internal standards. Only charcoal caused a statistically significant depletion of both precursors, quantitatively limited even at the highest dose adopted. Technologically, the clarifiers used in juice affected the thiol precursors in a marginal manner. Keywords: bentonite, charcoal, grape juice, polyvinylpolypyrrolidone, varietal thiols ! Ital. J. Food Sci., vol 28, 2016 - 744 1. INTRODUCTION S-3-(hexan-1-ol)-l-cysteine (Cys-3SH) and S-3-(hexan-1-ol)-l-glutathione (GSH-3SH) are precursors, present in grapes and/or formed in juice (TOMINAGA and DUBOURDIEU, 2000; PEYROT DES GACHONS et al., 2002; SCHNEIDER et al., 2006; FEDRIZZI et al., 2009; ROLAND et al., 2011a), of 3-sulfanylhexanol (3SH), responsible - together with its acetate - for the tropical and grapefruit-like fruity notes produced during fermentation by some yeast strains having lyase activity (RONCORONI et al., 2011; WINTER et al., 2011).
    [Show full text]
  • Atti Proceedings
    QUINTO CONGRESSO INTERNAZIONALE SULLA VITICOLTURA DI MONTAGNA E IN FORTE PENDENZA FIFTH INTERNATIONAL CONGRESS ON MOUNTAIN AND STEEP SLOPE VITICULTURE Conegliano (Treviso-Veneto) – Italia 29 marzo - 1 aprile 2017 " Le viticolture estreme: valori, bellezze, alleanze, fragilità" 1 "Extreme viticulture: values, beauties, alliances, vulnerabilities” ATTI PROCEEDINGS POSTER POSTER ISBN - 9788890233036 PATRONAGE: QUINTO CONGRESSO INTERNAZIONALE SULLA VITICOLTURA DI MONTAGNA E IN FORTE PENDENZA FIFTH INTERNATIONAL CONGRESS ON MOUNTAIN AND STEEP SLOPE VITICULTURE Sessione I Session I 2 Pratiche agronomiche e ambientamento climatico dei vitigni nella viticoltura di montagna Agronomic practices and varietal climate adaptation in mountain and steep slope vineyards PATRONAGE: Pre-harvest techniques to control ripening dynamic of Sauvignon blanc grapes cultivated in mountain area: first results Tononi M., Wenter A., Zanotelli D. and Andreotti C. Free University of Bozen-Bolzano, Faculty of Science and Technology, P.zza Universitá 5, 39100 Bolzano-Bozen, Italy Abstract The effects induced by climatic changes have become more and more evident in wine regions located in mountain areas during the last years. The trend toward an increasing warming of the temperature is determining new ripening dynamics of grape berries that often lead to excessive sugar accumulation in fruits and alcohol development in wines. This fact somehow conflicts with the actual trend of wine markets that is increasingly asking for fresh, easy-to-drink, low alcohol wines. Moreover, other important quality traits of grapes and wines such as color, aroma, acidity and pH are detrimentally affected by ripening processes that occur largely during the hottest period of the season. Against this background, we aimed with this work to investigate the potentiality of different canopy management techniques to control and postpone the ripening process of Sauvignon blanc grapes.
    [Show full text]
  • Mining Grapevine Downy Mildew Susceptibility Genes: a Resource for Genomics-Based Breeding and Tailored Gene Editing
    biomolecules Article Mining Grapevine Downy Mildew Susceptibility Genes: A Resource for Genomics-Based Breeding and Tailored Gene Editing Carlotta Pirrello 1,2 , Tieme Zeilmaker 3, Luca Bianco 1 , Lisa Giacomelli 1,3, Claudio Moser 1 and Silvia Vezzulli 1,* 1 Research and Innovation Centre, Edmund Mach Foundation, Via E. Mach 1, 38010 San Michele all’Adige, Italy; [email protected] (C.P.); [email protected] (L.B.); [email protected] (L.G.); [email protected] (C.M.) 2 Department of Agricultural, Food, Environmental and Animal Sciences, University of Udine, Via delle Scienze 206, 33100 Udine, Italy 3 SciENZA Biotechnologies B.V., Sciencepark 904, 1098 XH Amsterdam, The Netherlands; [email protected] * Correspondence: [email protected]; Tel.: +39-0461-615387 Abstract: Several pathogens continuously threaten viticulture worldwide. Until now, the investiga- tion on resistance loci has been the main trend to understand the interaction between grapevine and the mildew causal agents. Dominantly inherited gene-based resistance has shown to be race-specific in some cases, to confer partial immunity, and to be potentially overcome within a few years since its introgression. Recently, on the footprint of research conducted in Arabidopsis, putative genes associated with downy mildew susceptibility have been discovered also in the grapevine genome. In this work, we deep-sequenced four putative susceptibility genes—namely VvDMR6.1, VvDMR6.2, VvDLO1, VvDLO2—in 190 genetically diverse grapevine genotypes to discover new sources of Citation: Pirrello, C.; Zeilmaker, T.; Bianco, L.; Giacomelli, L.; Moser, C.; broad-spectrum and recessively inherited resistance. Identified Single Nucleotide Polymorphisms Vezzulli, S.
    [Show full text]
  • 2015/2016 Agriculture Food Environment
    RESEARCH AND INNOVATION CENTRE 2015/2016 AGRICULTURE FOOD ENVIRONMENT RESEARCH AND INNOVATION CENTRE 2015/2016 AGRICULTURE FOOD ENVIRONMENT EDITORIAL BOARD Gianfranco Anfora, Claudio Donati, Emanuele Eccel, Flavia Gasperi, Floriana Marin, Annapaola Rizzoli, Duccio Rocchini, Riccardo Velasco DATA, INFORMATION AND PUBBLICATIONS BY Biblioteca FEM EDITORS Floriana Marin, Emanuele Eccel, Cristina Castellani, Alessandro Gretter ENGLISH REVIEWER Giovanna Flaim, Heidi Hauffe, Kieran Tuohy EDITORIAL PROJECT AND DESIGN IDESIA - www.idesia.it ISSN 2282-1341 © 2017, Fondazione Edmund Mach Via Edmund Mach 1, 38010 San Michele a/A (Trento) www.fmach.it INDEX RESEARCH AND INNOVATION CENTRE REPORT 2015/2016 Presentation - Fondazione Edmund Mach: the right place to “think locally, act globally” 5 Fondazione Edmund Mach: an innovative organization that integrates research and education 7 The Research and Innovation Centre: the first Italian “One Health Centre” 8 The new Scientific Committee of the Fondazione Mach 9 The structure of the Research and Innovation Centre 11 Department of Genomics and Biology of Fruit Crops (DGBPF) 12 Department of Food Quality and Nutrition (DQAN) 13 Department of Sustainable Ecosystems and Bioresources (DASB) 14 Department of Biodiversity and Molecular Ecology (DBEM) 16 Computational Biology Unit 17 The PhD School (FIRS>T) 18 FEM Campus 18 The Agriculture, Food, Environment Center (C3A) 19 AGRICULTURE 21 Unraveling the dynamics in the agro(micro)biome for a more sustainable crop production 22 The past, present, and future of
    [Show full text]
  • Breeding and Deployment Guidelines for Durable Resistance To
    Breeding and deployment guidelines for durable resistance to Melampsora laricipopulina leaf-rust in interspecific hybrid poplars Arnaud Dowkiw, Marijke Steenackers, Bart de Cuyper, Catherine Bastien To cite this version: Arnaud Dowkiw, Marijke Steenackers, Bart de Cuyper, Catherine Bastien. Breeding and deployment guidelines for durable resistance to Melampsora laricipopulina leaf-rust in interspecific hybrid poplars. Final Conference Noveltree ”Tree Breeding, Genomics and Evolutionary Biology”, Oct 2012, Helsinki, Finland. hal-01268727 HAL Id: hal-01268727 https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01268727 Submitted on 3 Jun 2020 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. 1 Table of Contents SESSIONS 1‐4: LIST OF ORAL PRESENTATIONS AND POSTERS Session 1: Traits for adaptation/Looking for the adaptive response Invited talk Disentangling the roles of history and local selection in shaping clinal variation of allele frequencies and gene expression in spruce species. Lascoux M ........................................................................................................................................................... 7 Oral presentations Population genetic structure, plant material certification and climate adaptation in maritime pine breeding zones. Jaramillo‐Correa JP et al. ................................................................................................................................... 8 Genome‐wide SNP detection and genetic population inferences on 52 P. nigra genotypes resequenced by next‐generation sequencing. Giacomello S et al.
    [Show full text]
  • Conference Program
    Host: Maurizio UGLIANO, Università di Verona Co-Hosts: Fulvio MATTIVI, Fondazione Edmund Mach; Luca ROLLE, Università di Torino CONFERENCE PROGRAM SCIENTIFIC PARTNERS SPONSORS Secretariat [email protected] final – p. 1 WEDNESDAY JUNE 23rd 8:30 CEST Welcome messages Grapevine diversity and viticultural practices for sustainable grape growing TOPIC Chairpersons: Cornelis “Kees” Van Leeuwen, Sara Zenoni 1 Session coordination: Maurizio Ugliano 9:15 Keynote Speaker Steve TYERMAN - Faculty of Sciences, The University of Adelaide (Australia) Late ripening cell death and shrivel in Shiraz 9:45 Joanna GAMBETTA - Charles Sturt University - Faculty of Science; University of Adelaide, School of Agriculture, Food and Wine; South Australian Research and Development Institute (Australia) (5:45 pm Defoliation timing impacts berry secondary metabolites and sunburn damage AEST) 10:00 Ross SANDERS - Australian Research Council Training Centre for Innovative Wine Production, The University of Adelaide, and Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO) (5:30 pm Agriculture and Food (Australia) ACST) Within-vineyard spatial variation impacts methoxypyrazine accumulation in the rachis of cabernet sauvignon 10:15 Jochen VESTNER - Institute for Viticulture and Oenology, DLR Rheinpfalz, Neustadt an der Weinstraße (Germany) Sensory and chemical phenotyping of wines from a F1 grapevine population 10:30 Gabriel DOURNES - SPO, Univ Montpellier, INRAE, Institut Agro, Montpellier (France) First characterization of thiol precursors in Colombard
    [Show full text]
  • An Evaluation of the Pacbio RS Platform for Sequencing and De Novo Assembly of a Chloroplast Genome
    An evaluation of the PacBio RS platform for sequencing and de novo assembly of a chloroplast genome Ferrarini et al. Ferrarini et al. BMC Genomics 2013, 14:670 http://www.biomedcentral.com/1471-2164/14/670 Ferrarini et al. BMC Genomics 2013, 14:670 http://www.biomedcentral.com/1471-2164/14/670 RESEARCH ARTICLE Open Access An evaluation of the PacBio RS platform for sequencing and de novo assembly of a chloroplast genome Marco Ferrarini1†, Marco Moretto1†, Judson A Ward2, Nada Šurbanovski1, Vladimir Stevanović3, Lara Giongo1, Roberto Viola1, Duccio Cavalieri1, Riccardo Velasco1, Alessandro Cestaro1 and Daniel J Sargent1* Abstract Background: Second generation sequencing has permitted detailed sequence characterisation at the whole genome level of a growing number of non-model organisms, but the data produced have short read-lengths and biased genome coverage leading to fragmented genome assemblies. The PacBio RS long-read sequencing platform offers the promise of increased read length and unbiased genome coverage and thus the potential to produce genome sequence data of a finished quality containing fewer gaps and longer contigs. However, these advantages come at a much greater cost per nucleotide and with a perceived increase in error-rate. In this investigation, we evaluated the performance of the PacBio RS sequencing platform through the sequencing and de novo assembly of the Potentilla micrantha chloroplast genome. Results: Following error-correction, a total of 28,638 PacBio RS reads were recovered with a mean read length of 1,902 bp totalling 54,492,250 nucleotides and representing an average depth of coverage of 320× the chloroplast genome.
    [Show full text]
  • Apple Proliferation. a Joint Review
    A APPLE PROLIFERATION A JOINT REVIEW Edited by KATRIN JANIK DANA BARTHEL TIZIANA OPPEDISANO GIANFRANCO ANFORA A APPLE PROLIFERATION A JOINT REVIEW Edited by KATRIN JANIK DANA BARTHEL TIZIANA OPPEDISANO GIANFRANCO ANFORA The work was performed as part of the APPL2.0, APPLClust, APPLIII and the SCOPAZZI- FEM projects and was funded by the Autonomous Province of Bozen/Bolzano, Italy, the South Tyrolean Apple Consortium, and the Association of Fruit and Vegetable Producers in Trentino (APOT). APPLE PROLIFERATION. A JOINT REVIEW © 2020 Fondazione Edmund Mach, Via E. Mach 1, 38098 San Michele all’Adige (TN) - Laimburg Research Centre, Laimburg 6, 39040 Ora (BZ). All rights reserved. No part of this publication may be reproduced, in any form or by any means, without prior permission. TEXTS Dana Barthel, Stefanie Fischnaller, Thomas Letschka, Katrin Janik, Cecilia Mittelberger, Sabine Öttl, Bernd Panassiti - Laimburg Research Centre, Ora (Italy) Gino Angeli, Mario Baldessari, Pier Luigi Bianchedi, Andrea Campisano, Laura Tiziana Covelli, Gastone Dallago, Claudio Ioriatti, Valerio Mazzoni, Mirko Moser, Federico Pedrazzoli, Omar Rota-Stabelli, Tobias Weil - Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige (Italy) Tiziana Oppedisano - Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige (Italy) / University of Molise Gianfranco Anfora - Center Agriculture Food Environment (C3A), University of Trento / Innovation and Research Centre, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige (Italy) Wolfgang Jarausch - AlPlanta, Neustadt an der Weinstraße (Germany) Josef
    [Show full text]
  • Aglianico from Wikipedia, the Free Encyclopedia
    Aglianico From Wikipedia, the free encyclopedia Aglianico (pronounced [aʎˈʎaːniko], roughly "ahl-YAH-nee- koe") is a black grape grown in the Basilicata and Campania Aglianico regions of Italy. The vine originated in Greece and was Grape (Vitis) brought to the south of Italy by Greek settlers. The name may be a corruption of vitis hellenica, Latin for "Greek vine."[1] Another etymology posits a corruption of Apulianicum, the Latin name for the whole of southern Italy in the time of ancient Rome. During this period, it was the principal grape of the famous Falernian wine, the Roman equivalent of a first-growth wine today. Contents Aglianico from Taurasi prior to veraison Color of Black 1 History berry skin 2 Relationship to other grapes Also called Gnanico, Agliatica, Ellenico, 3 Wine regions Ellanico and Uva Nera 3.1 Other regions Origin Greece 4 Viticulture Notable Taurasi, Aglianico del Vulture 5 Wine styles wines 6 Synonyms Hazards Peronospera 7 References History The vine is believed to have first been cultivated in Greece by the Phoceans from an ancestral vine that ampelographers have not yet identified. From Greece it was brought to Italy by settlers to Cumae near modern-day Pozzuoli, and from there spread to various points in the regions of Campania and Basilicata. While still grown in Italy, the original Greek plantings seem to have disappeared.[2] In ancient Rome, the grape was the principal component of the world's earliest first-growth wine, Falernian.[1] Ruins from the Greek Along with a white grape known as Greco (today grown as Greco di Tufo), the grape settlement of Cumae.
    [Show full text]