Supplementary File S4. Genes within each module Mackay et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id ESR1.1 -1 991 CDC20 ILMN_1663390 -1 1476 CSTB ILMN_1761797 -1 1503 CTPS ILMN_1783285 1 3708 ITPR1 ILMN_1789505 -1 4281 MID1 ILMN_1761858 -1 4781 NFIB ILMN_1778991 -1 5433 POLR2D ILMN_1792672 1 5684 PSMA3 ILMN_1694931 -1 6317 SERPINB3 ILMN_1703855 -1 6446 SGK ILMN_1702487 -1 7159 TP53BP2 ILMN_1779706 1 7251 TSG101 ILMN_1747146 -1 8208 CHAF1B ILMN_1674231 -1 8543 LMO4 ILMN_1703487 -1 9353 SLIT2 ILMN_1676449 -1 10200 MPHOSPH6 ILMN_1746682 -1 10982 MAPRE2 ILMN_1695276 -1 25925 ZNF521 ILMN_1679747 -1 27436 EML4 ILMN_1718297 1 55970 GNG12 ILMN_1673380 1 56204 KIAA1370 ILMN_1700733 1 56890 MDM1 ILMN_1750703 -1 56942 C16orf61 ILMN_1783333 -1 58528 RRAGD ILMN_1699772 1 5825 ABCD3 ILMN_1674032 1 36 ACADSB ILMN_1740920 -1 92 ACVR2A ILMN_1670912 -1 8038 ADAM12 ILMN_1705689 -1 60312 AFAP ILMN_1701998 1 3899 AFF3 ILMN_1775235 1 10551 AGR2 ILMN_1814151 -1 55966 AJAP1 ILMN_1723521 -1 122481 AK7 ILMN_1684305 1 11215 AKAP11 ILMN_1693220 1 9068 ANGPTL1 ILMN_1669773 -1 26057 ANKRD17 ILMN_1712019 -1 163782 ANKRD38 ILMN_1776936 1 10053 AP1M2 ILMN_1705861 1 63941 APBA2BP ILMN_1749738 -1 147495 APCDD1 ILMN_1656951 1 51074 APIP ILMN_1793598 1 367 AR ILMN_1767351 1 9828 ARHGEF17 ILMN_1754562 1 403 ARL3 ILMN_1780444 1 9915 ARNT2 ILMN_1718046 1 22901 ARSG ILMN_1720604 -1 419 ART3 ILMN_1693218 1 427 ASAH1 ILMN_1684054 -1 84002 B3GNT5 ILMN_1702609 -1 25825 BACE2 ILMN_1669323 -1 11176 BAZ2A ILMN_1676318 -1 8424 BBOX1 ILMN_1734929 -1 637 BID ILMN_1763386 1 8548 BLZF1 ILMN_1669140 -1 25798 BRI3 ILMN_1781580 1 8945 BTRC ILMN_1815718 -1 221061 FAM171A1 ILMN_1749868 1 84229 CCDC135 ILMN_1712067 1 80169 C17orf68 ILMN_1755711 -1 29919 C18orf8 ILMN_1719097 1 81563 C1orf21 ILMN_1797735 -1 114897 C1QTNF1 ILMN_1694608 1 55614 KIF16B ILMN_1772786 -1 140862 C20orf82 ILMN_1772869 1 79669 C3orf52 ILMN_1672969 1 79624 C6orf211 ILMN_1798108 1 80129 C6orf97 ILMN_1772588 -1 761 CA3 ILMN_1740996 -1 794 CALB2 ILMN_1748840 1 842 CASP9 ILMN_1718070 1 51019 CCDC53 ILMN_1715569 -1 6362 CCL18 ILMN_1654411 1 1026 CDKN1A ILMN_1784602 1 84181 CHD6 ILMN_1781816 1 1124 CHN2 ILMN_1774110 -1 9435 CHST2 ILMN_1794011 1 64084 CLSTN2 ILMN_1731237 1 1191 CLU ILMN_1724895 -1 112616 CMTM7 ILMN_1698934 -1 169044 COL22A1 ILMN_1784532 -1 51692 CPSF3 ILMN_1808458 -1 64764 CREB3L2 ILMN_1751097 1 1387 CREBBP ILMN_1809583 1 1396 CRIP1 ILMN_1742350 -1 8531 CSDA ILMN_1782788 -1 1439 CSF2RB ILMN_1798475 -1 1466 CSRP2 ILMN_1660806 1 8722 CTSF ILMN_1750122 -1 1521 CTSW ILMN_1794364 -1 55917 CTTNBP2NL ILMN_1719517 -1 10659 CUGBP2 ILMN_1668652 -1 6387 CXCL12 ILMN_1791447 1 90736 FAM104B ILMN_1705848 -1 10046 CXorf6 ILMN_1680856 1 124637 CYB5D1 ILMN_1670925 1 51706 CYB5R1 ILMN_1729237 -1 1612 DAPK1 ILMN_1708340 1 51164 DCTN4 ILMN_1741564 -1 23586 DDX58 ILMN_1797001 1 26063 DECR2 ILMN_1783337 -1 163259 DENND2C ILMN_1815035 1 51635 DHRS7 ILMN_1807455 1 1741 DLG3 ILMN_1811515 1 56521 DNAJC12 ILMN_1803073 1 7802 DNALI1 ILMN_1745501 -1 26010 DNAPTP6 ILMN_1683678 -1 1788 DNMT3A ILMN_1676128 -1 1807 DPYS ILMN_1749324 -1 1824 DSC2 ILMN_1782125 -1 1827 RCAN1 ILMN_1814135 -1 1830 DSG3 ILMN_1655468 -1 56940 DUSP22 ILMN_1801331 -1 1870 E2F2 ILMN_1777233 -1 1871 E2F3 ILMN_1652143 -1 1906 EDN1 ILMN_1682775 -1 1956 EGFR ILMN_1798975 1 1964 EIF1AX ILMN_1808344 -1 9470 EIF4E2 ILMN_1738326 -1 2001 ELF5 ILMN_1813270 1 60481 ELOVL5 ILMN_1712533 -1 2019 EN1 ILMN_1709593 1 955 ENTPD6 ILMN_1677955 1 2046 EPHA8 ILMN_1756989 -1 2064 ERBB2 ILMN_1694303 1 2099 ESR1 ILMN_1678535 -1 10205 MPZL2 ILMN_1752932 -1 2131 EXT1 ILMN_1794343 -1 2173 FABP7 ILMN_1804948 -1 57488 FAM62B ILMN_1807761 -1 2195 FAT ILMN_1754795 -1 2199 FBLN2 ILMN_1774602 1 2203 FBP1 ILMN_1728799 -1 114907 FBXO32 ILMN_1703955 1 2263 FGFR2 ILMN_1682270 1 163486 DENND1B ILMN_1763654 1 55638 FLJ20366 ILMN_1738989 -1 79919 FLJ22671 ILMN_1665471 -1 153830 RNF145 ILMN_1719951 1 132720 C4orf32 ILMN_1700257 -1 151195 CCNYL1 ILMN_1810069 -1 346689 FLJ44186 ILMN_1807691 1 2321 FLT1 ILMN_1705002 1 2330 FMO5 ILMN_1811632 -1 84624 FNDC1 ILMN_1734653 1 3169 FOXA1 ILMN_1766650 -1 2295 FOXF2 ILMN_1683960 -1 53826 FXYD6 ILMN_1768812 -1 2533 FYB ILMN_1796537 -1 2564 GABRE ILMN_1784706 1 2593 GAMT ILMN_1794595 1 2625 GATA3 ILMN_1727652 -1 115361 GBP4 ILMN_1771385 -1 2707 GJB3 ILMN_1652390 -1 2709 GJB5 ILMN_1735365 1 26035 GLCE ILMN_1714349 -1 2719 GPC3 ILMN_1799759 1 23171 GPD1L ILMN_1694106 1 2850 GPR27 ILMN_1744034 1 27198 GPR81 ILMN_1811272 -1 51704 GPRC5B ILMN_1786034 -1 63940 GPSM3 ILMN_1662799 -1 2886 GRB7 ILMN_1740762 1 79774 GRTP1 ILMN_1745068 1 51440 HPCAL4 ILMN_1736976 -1 3294 HSD17B2 ILMN_1808713 -1 3455 IFNAR2 ILMN_1791057 1 3480 IGF1R ILMN_1721653 -1 3600 IL15 ILMN_1724181 -1 3559 IL2RA ILMN_1683774 -1 9235 IL32 ILMN_1778010 -1 10527 IPO7 ILMN_1682647 -1 79192 IRX1 ILMN_1735353 1 10265 IRX5 ILMN_1757736 -1 3680 ITGA9 ILMN_1813117 -1 3689 ITGB2 ILMN_1654396 1 3712 IVD ILMN_1724207 1 126823 KLHDC9 ILMN_1701918 -1 3783 KCNN4 ILMN_1726320 1 200845 KCTD6 ILMN_1800942 -1 11015 KDELR3 ILMN_1722820 1 9812 KIAA0141 ILMN_1762990 -1 9914 KIAA0703 ILMN_1785413 1 57148 KIAA1219 ILMN_1733115 1 26128 KIAA1279 ILMN_1745813 1 57535 KIAA1324 ILMN_1771482 1 222223 KIAA1324L ILMN_1652371 -1 55582 KIF27 ILMN_1692572 1 11127 KIF3A ILMN_1653385 -1 3801 KIFC3 ILMN_1715900 -1 51621 KLF13 ILMN_1679929 -1 688 KLF5 ILMN_1770293 -1 5655 KLK10 ILMN_1688205 -1 25818 KLK5 ILMN_1718731 -1 5653 KLK6 ILMN_1780255 -1 5650 KLK7 ILMN_1745570 -1 3872 KRT17 ILMN_1666845 -1 25984 KRT23 ILMN_1791545 -1 3852 KRT5 ILMN_1801632 -1 3854 KRT6B ILMN_1721354 -1 8942 KYNU ILMN_1746517 -1 27074 LAMP3 ILMN_1719734 -1 93273 LEMD1 ILMN_1785444 1 80774 LIMD2 ILMN_1673867 -1 3985 LIMK2 ILMN_1660624 1 89782 LMLN ILMN_1815716 -1 197135 LOC197135 ILMN_1803596 -1 57228 LOC57228 ILMN_1804415 1 90355 C5orf30 ILMN_1677292 -1 84171 LOXL4 ILMN_1754174 1 987 LRBA ILMN_1652160 1 26018 LRIG1 ILMN_1707342 1 90506 LRRC46 ILMN_1768818 -1 56262 LRRC8A ILMN_1739840 -1 84230 LRRC8C ILMN_1765855 1 4049 LTA ILMN_1666732 1 10916 MAGED2 ILMN_1683576 -1 84441 MAML2 ILMN_1765729 1 9053 MAP7 ILMN_1712719 1 4137 MAPT ILMN_1710903 1 375449 LOC375449 ILMN_1738438 1 92014 MCART1 ILMN_1772492 -1 51102 MECR ILMN_1683160 -1 4240 MFGE8 ILMN_1756071 -1 6157 RPL27A ILMN_1716740 1 79083 MLPH ILMN_1795342 -1 4322 MMP13 ILMN_1771030 -1 4316 MMP7 ILMN_1685403 1 51073 MRPL4 ILMN_1804207 1 10884 MRPS30 ILMN_1726743 1 4604 MYBPC1 ILMN_1752075 -1 4643 MYO1E ILMN_1773342 1 9 NAT1 ILMN_1688071 1 115677 NOSTRIN ILMN_1783665 -1 4860 NP ILMN_1777534 -1 8828 NRP2 ILMN_1787190 1 9369 NRXN3 ILMN_1720935 -1 79902 NUP85 ILMN_1669635 1 78990 OTUB2 ILMN_1799198 -1 286530 P2RY8 ILMN_1768284 -1 11240 PADI2 ILMN_1771223 1 56924 PAK6 ILMN_1708223 1 56288 PARD3 ILMN_1710524 1 5092 PCBD1 ILMN_1795906 1 54039 PCBP3 ILMN_1687216 1 648 BMI1 ILMN_1700915 1 5046 PCSK6 ILMN_1802550 -1 5156 PDGFRA ILMN_1681949 1 27152 INTU ILMN_1716564 1 5570 PKIB ILMN_1768268 1 5327 PLAT ILMN_1738742 -1 5337 PLD1 ILMN_1719696 -1 5341 PLEK ILMN_1795762 -1 57480 PLEKHG1 ILMN_1805606 -1 5351 PLOD1 ILMN_1684391 1 5357 PLS1 ILMN_1759206 1 25885 POLR1A ILMN_1780758 -1 10891 PPARGC1A ILMN_1750062 -1 5475 PPEF1 ILMN_1652017 1 5509 PPP1R3D ILMN_1781198 1 5521 PPP2R2B ILMN_1660732 -1 639 PRDM1 ILMN_1655077 -1 5549 PRELP ILMN_1707380 1 57580 PREX1 ILMN_1777342 -1 8842 PROM1 ILMN_1786720 -1 23362 PSD3 ILMN_1717477 -1 140885 PTPNS1 ILMN_1758146 1 5860 QDPR ILMN_1672443 1 9135 RABEP1 ILMN_1719622 -1 5918 RARRES1 ILMN_1800091 -1 83937 RASSF4 ILMN_1690566 -1 6091 ROBO1 ILMN_1806790 -1 54763 ROPN1 ILMN_1668766 1 55086 CXorf57 ILMN_1703279 1 6123 RPL3L ILMN_1775175 1 9252 RPS6KA5 ILMN_1657515 -1 6251 RSU1 ILMN_1721657 -1 6273 S100A2 ILMN_1725852 -1 6279 S100A8 ILMN_1729801 -1 6304 SATB1 ILMN_1690646 1 51097 SCCPDH ILMN_1795839 1 57758 SCUBE2 ILMN_1684085 1 7869 SEMA3B ILMN_1653501 1 6405 SEMA3F ILMN_1761540 -1 123228 SENP8 ILMN_1767690 -1 23157 Sep-06 ILMN_1661342 -1 10801 Sep-09 ILMN_1769118 -1 5271 SERPINB8 ILMN_1718960 -1 5270 SERPINE2 ILMN_1655595 1 29946 SERTAD3 ILMN_1801934 1 389376 SFTPG ILMN_1703864 -1 399694 SHC4 ILMN_1807050 -1 55423 SIRPB2 ILMN_1771801 -1 56833 SLAMF8 ILMN_1667224 -1 6565 SLC15A2 ILMN_1706040 1 6512 SLC1A7 ILMN_1704629 1 6584 SLC22A5 ILMN_1699357 -1 60386 SLC25A19 ILMN_1666553 -1 7782 SLC30A4 ILMN_1653098 -1 10237 SLC35B1 ILMN_1727840 1 25800 SLC39A6 ILMN_1750394 -1 8884 SLC5A6 ILMN_1741054 1 6542 SLC7A2 ILMN_1781400 -1 6608 SMO ILMN_1782098 -1 64750 SMURF2 ILMN_1675429 -1 6627 SNRPA1 ILMN_1715179 1 28966 SNX24 ILMN_1795666 -1 6648 SOD2 ILMN_1775672 -1 6667 SP1 ILMN_1676010 -1 23648 SSBP3 ILMN_1814165 -1 8082 SSPN ILMN_1775486 -1 6489 ST8SIA1 ILMN_1664859 1 8614 STC2 ILMN_1691884 1 27148 STK36 ILMN_1693538 -1 23208 SYT11 ILMN_1789954 1 23158 TBC1D9 ILMN_1703891 -1 6934 TCF7L2 ILMN_1672486 -1 6999 TDO2 ILMN_1716859 1 7031 TFF1 ILMN_1722489 -1 7046 TGFBR1 ILMN_1797611 1 7057 THBS1 ILMN_1686116 1 79875 THSD4 ILMN_1746737 -1 7077 TIMP2 ILMN_1670054 1 283578 TMED8 ILMN_1676670 1 161291 TMEM30B ILMN_1752935 1 283131 TncRNA ILMN_1657920 -1 10673 TNFSF13B ILMN_1758418 -1 23321 TRIM2 ILMN_1745079 -1 23650 TRIM29 ILMN_1657766 1 142940 TRUB1 ILMN_1744574 1 27075 TSPAN13 ILMN_1669881 1 151613 TTC14 ILMN_1696757 1 54902 TTC19 ILMN_1781260 -1 57217 TTC7A ILMN_1732535 -1 10537 UBD ILMN_1678841 1 11274 USP18 ILMN_1740200 -1 51442 VGLL1 ILMN_1703146 -1 7472 WNT2 ILMN_1694011 1 7473 WNT3 ILMN_1784840 1 7490 WT1 ILMN_1802174 -1 57510 XPO5 ILMN_1759495 1 22882 ZHX2 ILMN_1792951 1 57336 ZNF287 ILMN_1693597 -1 10320 ZNFN1A1 ILMN_1676575 Symmans et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id SET 1 27075 TSPAN13 ILMN_1669881 -1 5613 PRKX ILMN_1786834 1 51133 KCTD3 ILMN_1800220 -1 8690 JRKL ILMN_1776140 -1 2744 GLS ILMN_1798791 1 2593 GAMT ILMN_1794595 -1 2950 GSTP1 ILMN_1679809 -1 4783 NFIL3 ILMN_1707312 -1 8543 LMO4 ILMN_1703487 1 323 APBB2 ILMN_1716790 1 7905 REEP5 ILMN_1758941 1 9 NAT1 ILMN_1688071 1 23030 JMJD2B ILMN_1720531 1 1396 CRIP1 ILMN_1742350 1 1602 DACH1 ILMN_1755741 1 4059 BCAM ILMN_1770421 1 55686 DSU ILMN_1713679 1 9687 GREB1 ILMN_1721170 1 23116 KIAA0423 ILMN_1778876 -1 3475 IFRD1 ILMN_1667561 1 18 ABAT ILMN_1805104 -1 9444 QKI ILMN_1690476 1 5087 PBX1 ILMN_1784678 -1 3783 KCNN4 ILMN_1726320 -1 5918 RARRES1 ILMN_1800091 -1 23650 TRIM29 ILMN_1657766 1 36 ACADSB ILMN_1740920 1 2625 GATA3 ILMN_1727652 -1 1612 DAPK1 ILMN_1708340 -1 1001 CDH3 ILMN_1704294 -1 3930 LBR ILMN_1724240 1 253782 LASS6 ILMN_1767662 -1 2882 GPX7 ILMN_1726030 -1 10123 ARL4C ILMN_1768391 -1 1824 DSC2 ILMN_1782125 1 6584 SLC22A5 ILMN_1699357 -1 2023 ENO1 ILMN_1710756 1 11059 WWP1 ILMN_1692092 1 388 RHOB ILMN_1802205 -1 10950 BTG3 ILMN_1707339 1 3572 IL6ST ILMN_1797861 -1 50649 ARHGEF4 ILMN_1666076 -1 26227 PHGDH ILMN_1704537 1 6500 SKP1A ILMN_1711766 1 79641 ROGDI ILMN_1722738 1 7009 TEGT ILMN_1693311 -1 114908 TMEM123 ILMN_1724139 -1 23175 LPIN1 ILMN_1671554 1 115 ADCY9 ILMN_1654287 1 10451 VAV3 ILMN_1657679 1 57613 KIAA1467 ILMN_1668619 -1 23321 TRIM2 ILMN_1745079 1 1153 CIRBP ILMN_1674661 1 9778 KIAA0232 ILMN_1795704 -1 55144 LRRC8D ILMN_1782878 1 55638 FLJ20366 ILMN_1738989 1 7869 SEMA3B ILMN_1653501 -1 3945 LDHB ILMN_1728132 1 7494 XBP1 ILMN_1710675 1 79875 THSD4 ILMN_1746737 1 92579 G6PC3 ILMN_1806962 -1 1871 E2F3 ILMN_1652143 1 51097 SCCPDH ILMN_1795839 1 4832 NME3 ILMN_1669456 1 3667 IRS1 ILMN_1759232 -1 6868 ADAM17 ILMN_1765779 1 23428 SLC7A8 ILMN_1807894 1 79921 TCEAL4 ILMN_1748625 -1 8440 NCK2 ILMN_1724718 -1 9448 MAP4K4 ILMN_1797745 1 80129 C6orf97 ILMN_1772588 1 8204 NRIP1 ILMN_1718629 1 5914 RARA ILMN_1659206 1 51466 EVL ILMN_1730622 1 26018 LRIG1 ILMN_1707342 1 4137 MAPT ILMN_1710903 1 57535 KIAA1324 ILMN_1771482 1 7357 UGCG ILMN_1736939 1 90196 SYS1 ILMN_1756590 -1 29015 SLC43A3 ILMN_1658407 1 10551 AGR2 ILMN_1814151 1 689 BTF3 ILMN_1676221 -1 23603 CORO1C ILMN_1745954 -1 55689 YEATS2 ILMN_1676899 1 7162 TPBG ILMN_1756230 -1 23683 PRKD3 ILMN_1703196 -1 5610 EIF2AK2 ILMN_1706502 -1 56935 C11orf75 ILMN_1798270 -1 5912 RAP2B ILMN_1677590 1 54681 PH-4 ILMN_1672122 1 80736 SLC44A4 ILMN_1730977 1 25800 SLC39A6 ILMN_1750394 -1 83439 TCF7L1 ILMN_1733841 -1 3159 HMGA1 ILMN_1693560 1 90355 C5orf30 ILMN_1677292 1 9254 CACNA2D2 ILMN_1711049 1 5167 ENPP1 ILMN_1700888 1 987 LRBA ILMN_1652160 -1 123 ADFP ILMN_1660332 1 3295 HSD17B4 ILMN_1673795 1 10560 SLC19A2 ILMN_1729594 -1 51029 C1orf121 ILMN_1660840 1 2066 ERBB4 ILMN_1661857 1 51706 CYB5R1 ILMN_1729237 1 79083 MLPH ILMN_1795342 -1 55975 KLHL7 ILMN_1674458 1 1345 COX6C ILMN_1654151 -1 56888 KCMF1 ILMN_1669669 -1 4651 MYO10 ILMN_1703576 -1 246243 RNASEH1 ILMN_1726783 1 7031 TFF1 ILMN_1722489 1 51340 CRNKL1 ILMN_1768640 1 56917 MEIS3 ILMN_1779997 -1 11329 STK38 ILMN_1799153 1 8382 NME5 ILMN_1784783 -1 2296 FOXC1 ILMN_1743864 1 23158 TBC1D9 ILMN_1703891 1 9135 RABEP1 ILMN_1719622 -1 5214 PFKP ILMN_1805737 1 64084 CLSTN2 ILMN_1731237 1 7090 TLE3 ILMN_1716928 -1 5690 PSMB2 ILMN_1764794 -1 6715 SRD5A1 ILMN_1793241 1 51604 PIGT ILMN_1738759 1 54463 FLJ20152 ILMN_1811330 1 79818 ZNF552 ILMN_1700563 1 771 CA12 ILMN_1720998 1 8416 ANXA9 ILMN_1755721 1 3480 IGF1R ILMN_1721653 -1 8842 PROM1 ILMN_1786720 -1 4281 MID1 ILMN_1761858 1 10916 MAGED2 ILMN_1683576 -1 11240 PADI2 ILMN_1771223 1 10974 C10orf116 ILMN_1680110 1 79624 C6orf211 ILMN_1798108 1 2674 GFRA1 ILMN_1725678 1 7033 TFF3 ILMN_1811387 1 2203 FBP1 ILMN_1728799 -1 27074 LAMP3 ILMN_1719734 1 107 ADCY1 ILMN_1742073 1 56521 DNAJC12 ILMN_1803073 1 6405 SEMA3F ILMN_1761540 1 403 ARL3 ILMN_1780444 1 9674 KIAA0040 ILMN_1797191 -1 53335 BCL11A ILMN_1698224 1 3708 ITPR1 ILMN_1789505 1 64087 MCCC2 ILMN_1769264 1 8073 PTP4A2 ILMN_1688490 1 8553 BHLHB2 ILMN_1768534 -1 221061 FAM171A1 ILMN_1749868 -1 6732 SRPK1 ILMN_1798804 1 3169 FOXA1 ILMN_1766650 -1 64943 NT5DC2 ILMN_1708743 -1 4904 YBX1 ILMN_1669424 1 5104 SERPINA5 ILMN_1759910 1 57496 MKL2 ILMN_1690807 -1 4953 ODC1 ILMN_1748591 1 9338 TCEAL1 ILMN_1742341 1 4602 MYB ILMN_1711894 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id ESR1.2 1 2099 ESR1 ILMN_1678535 1 23158 TBC1D9 ILMN_1703891 1 2625 GATA3 ILMN_1727652 1 771 CA12 ILMN_1720998 1 3169 FOXA1 ILMN_1766650 1 4602 MYB ILMN_1711894 1 7802 DNALI1 ILMN_1745501 1 18 ABAT ILMN_1805104 1 7494 XBP1 ILMN_1710675 1 57758 SCUBE2 ILMN_1684085 1 2066 ERBB4 ILMN_1661857 1 9 NAT1 ILMN_1688071 1 10551 AGR2 ILMN_1814151 1 987 LRBA ILMN_1652160 1 56521 DNAJC12 ILMN_1803073 1 2203 FBP1 ILMN_1728799 1 51466 EVL ILMN_1730622 -1 51442 VGLL1 ILMN_1703146 1 57496 MKL2 ILMN_1690807 1 7031 TFF1 ILMN_1722489 1 1153 CIRBP ILMN_1674661 -1 26227 PHGDH ILMN_1704537 -1 6648 SOD2 ILMN_1775672 1 55638 FLJ20366 ILMN_1738989 -1 221061 FAM171A1 ILMN_1749868 1 7033 TFF3 ILMN_1811387 -1 53335 BCL11A ILMN_1698224 1 79818 ZNF552 ILMN_1700563 1 57613 KIAA1467 ILMN_1668619 1 8416 ANXA9 ILMN_1755721 1 582 BBS1 ILMN_1800590 1 54463 FLJ20152 ILMN_1811330 1 55733 HHAT ILMN_1693853 1 2674 GFRA1 ILMN_1725678 -1 4478 MSN ILMN_1659895 1 51097 SCCPDH ILMN_1795839 1 54502 FLJ20273 ILMN_1689046 1 26018 LRIG1 ILMN_1707342 1 55793 FAM63A ILMN_1689552 -1 3868 KRT16 ILMN_1736760 1 54961 SSH3 ILMN_1755234 1 60481 ELOVL5 ILMN_1712533 1 3667 IRS1 ILMN_1759232 -1 83439 TCF7L1 ILMN_1733841 -1 10950 BTG3 ILMN_1707339 1 3572 IL6ST ILMN_1797861 -1 4783 NFIL3 ILMN_1707312 1 51161 C3orf18 ILMN_1728581 -1 2296 FOXC1 ILMN_1743864 -1 6664 SOX11 ILMN_1773459 -1 5613 PRKX ILMN_1786834 -1 8543 LMO4 ILMN_1703487 1 55686 DSU ILMN_1713679 1 8100 TTC10 ILMN_1669366 -1 2617 GARS ILMN_1771026 -1 3945 LDHB ILMN_1728132 1 8382 NME5 ILMN_1784783 1 10614 HEXIM1 ILMN_1685115 1 9633 MTL5 ILMN_1661778 -1 2568 GABRP ILMN_1689146 1 23324 MAN2B2 ILMN_1768510 -1 55765 C1orf106 ILMN_1713952 1 5104 SERPINA5 ILMN_1759910 1 5174 PDZK1 ILMN_1708341 1 56674 TMEM9B ILMN_1689979 -1 1054 CEBPG ILMN_1716766 1 9120 SLC16A6 ILMN_1729691 1 79641 ROGDI ILMN_1722738 1 23303 KIF13B ILMN_1686562 -1 2173 FABP7 ILMN_1804948 1 23171 GPD1L ILMN_1694106 1 9674 KIAA0040 ILMN_1797191 1 27134 TJP3 ILMN_1659610 1 79921 TCEAL4 ILMN_1748625 1 54898 ELOVL2 ILMN_1716843 1 1345 COX6C ILMN_1654151 -1 5937 RBMS1 ILMN_1762568 1 400451 LOC400451 ILMN_1652797 -1 3898 LAD1 ILMN_1782389 1 2530 FUT8 ILMN_1741422 1 51306 C5orf5 ILMN_1673478 1 25837 RAB26 ILMN_1790317 -1 10982 MAPRE2 ILMN_1695276 1 1632 DCI ILMN_1803485 1 7905 REEP5 ILMN_1758941 1 1101 CHAD ILMN_1700652 1 323 APBB2 ILMN_1716790 1 28958 CCDC56 ILMN_1789786 -1 1476 CSTB ILMN_1761797 -1 9435 CHST2 ILMN_1794011 -1 7371 UCK2 ILMN_1768662 1 2737 GLI3 ILMN_1685871 -1 8685 MARCO ILMN_1731503 1 3295 HSD17B4 ILMN_1673795 -1 11013 TMSL8 ILMN_1681737 1 51604 PIGT ILMN_1738759 -1 6663 SOX10 ILMN_1653750 -1 85377 MICALL1 ILMN_1671242 1 58495 OVOL2 ILMN_1724832 1 11001 SLC27A2 ILMN_1700831 -1 25841 ABTB2 ILMN_1753370 1 64080 RBKS ILMN_1732127 -1 375035 SFT2D2 ILMN_1668378 -1 10479 SLC9A6 ILMN_1677829 1 5002 SLC22A18 ILMN_1815581 -1 8645 KCNK5 ILMN_1766918 1 79885 HDAC11 ILMN_1684690 -1 11254 SLC6A14 ILMN_1745770 1 122616 C14orf79 ILMN_1686082 -1 79650 C16orf57 ILMN_1765880 -1 23321 TRIM2 ILMN_1745079 1 23327 NEDD4L ILMN_1733627 1 22977 AKR7A3 ILMN_1676592 -1 8581 LY6D ILMN_1814270 -1 8842 PROM1 ILMN_1786720 -1 4953 ODC1 ILMN_1748591 -1 55544 RBM38 ILMN_1727353 1 55663 ZNF446 ILMN_1743767 1 27124 PIB5PA ILMN_1777644 -1 6715 SRD5A1 ILMN_1793241 1 51809 GALNT7 ILMN_1670748 1 89927 C16orf45 ILMN_1687821 -1 1827 RCAN1 ILMN_1814135 1 51706 CYB5R1 ILMN_1729237 -1 3383 ICAM1 ILMN_1812226 -1 5806 PTX3 ILMN_1692719 1 9501 RPH3AL ILMN_1693717 -1 3613 IMPA2 ILMN_1727639 1 7568 ZNF20 ILMN_1670377 -1 6280 S100A9 ILMN_1714991 -1 22929 SEPHS1 ILMN_1673369 1 81563 C1orf21 ILMN_1797735 1 1389 CREBL2 ILMN_1660223 -1 1410 CRYAB ILMN_1729216 1 10884 MRPS30 ILMN_1726743 1 55614 KIF16B ILMN_1772786 -1 1824 DSC2 ILMN_1782125 -1 7851 MALL ILMN_1754766 1 2743 GLRB ILMN_1669631 1 427 ASAH1 ILMN_1684054 1 5241 PGR ILMN_1811014 1 51364 ZMYND10 ILMN_1790574 1 6926 TBX3 ILMN_1713449 -1 8531 CSDA ILMN_1782788 -1 23 ABCF1 ILMN_1763875 1 819 CAMLG ILMN_1714599 1 2947 GSTM3 ILMN_1736184 1 5825 ABCD3 ILMN_1674032 1 5860 QDPR ILMN_1672443 -1 59342 SCPEP1 ILMN_1767470 -1 51806 CALML5 ILMN_1749118 1 79603 LASS4 ILMN_1748057 1 21 ABCA3 ILMN_1742051 1 54847 SIDT1 ILMN_1795118 1 8537 BCAS1 ILMN_1776647 -1 10874 NMU ILMN_1740250 -1 54149 C21orf91 ILMN_1698166 -1 9929 JOSD1 ILMN_1798536 -1 5317 PKP1 ILMN_1663454 -1 7388 UQCRH ILMN_1792138 -1 64764 CREB3L2 ILMN_1751097 1 10127 ZNF263 ILMN_1692620 1 80347 COASY ILMN_1753498 1 126353 C19orf21 ILMN_1683905 1 50865 HEBP1 ILMN_1802557 1 54812 AFTPH ILMN_1795996 1 64087 MCCC2 ILMN_1769264 -1 8884 SLC5A6 ILMN_1741054 1 5269 SERPINB6 ILMN_1712400 -1 4321 MMP12 ILMN_1680512 -1 8190 MIA ILMN_1745077 -1 6769 STAC ILMN_1774127 1 51368 TEX264 ILMN_1781623 1 23541 SEC14L2 ILMN_1684211 1 9185 REPS2 ILMN_1656934 1 185 AGTR1 ILMN_1814327 -1 7368 UGT8 ILMN_1758816 1 399665 C9orf132 ILMN_1745112 1 12 SERPINA3 ILMN_1788874 -1 55975 KLHL7 ILMN_1674458 1 25864 ABHD14A ILMN_1794213 -1 4851 NOTCH1 ILMN_1729161 1 9091 PIGQ ILMN_1701413 -1 1299 COL9A3 ILMN_1740155 1 2800 GOLGA1 ILMN_1806301 -1 8326 FZD9 ILMN_1704398 -1 6376 CX3CL1 ILMN_1654072 1 8399 PLA2G10 ILMN_1762561 1 5327 PLAT ILMN_1738742 1 22885 ABLIM3 ILMN_1656940 1 11094 C9orf7 ILMN_1814856 -1 5321 PLA2G4A ILMN_1764157 -1 57348 TTYH1 ILMN_1685569 1 123872 LRRC50 ILMN_1776967 1 10421 CD2BP2 ILMN_1807264 -1 5971 RELB ILMN_1811258 1 6833 ABCC8 ILMN_1767129 1 11122 PTPRT ILMN_1698885 -1 23650 TRIM29 ILMN_1657766 1 79629 OCEL1 ILMN_1757388 1 8722 CTSF ILMN_1750122 -1 57110 HRASLS ILMN_1655867 1 6697 SPR ILMN_1705849 -1 2919 CXCL1 ILMN_1787897 1 27250 PDCD4 ILMN_1768004 1 23245 ASTN2 ILMN_1744118 1 10265 IRX5 ILMN_1757736 -1 2824 GPM6B ILMN_1704665 -1 10644 IGF2BP2 ILMN_1702447 -1 7436 VLDLR ILMN_1675092 -1 25825 BACE2 ILMN_1669323 1 10827 C5orf3 ILMN_1675701 -1 4828 NMB ILMN_1683940 1 6720 SREBF1 ILMN_1663035 -1 10477 UBE2E3 ILMN_1669553 -1 3066 HDAC2 ILMN_1767747 1 55224 ETNK2 ILMN_1800130 -1 875 CBS ILMN_1804735 -1 3872 KRT17 ILMN_1666845 1 753 C18orf1 ILMN_1777436 -1 136 ADORA2B ILMN_1703946 1 2013 EMP2 ILMN_1671270 1 1917 EEF1A2 ILMN_1811315 -1 3576 IL8 ILMN_1666733 -1 419 ART3 ILMN_1693218 1 55650 PIGV ILMN_1762993 1 23107 MRPS27 ILMN_1711414 -1 25818 KLK5 ILMN_1718731 1 8309 ACOX2 ILMN_1685703 1 1047 CLGN ILMN_1658635 1 10002 NR2E3 ILMN_1699266 -1 60487 C6orf75 ILMN_1805481 -1 10656 KHDRBS3 ILMN_1691747 -1 55240 STEAP3 ILMN_1746926 1 3315 HSPB1 ILMN_1674236 1 10273 STUB1 ILMN_1756126 -1 2171 FABP5 ILMN_1696302 1 55184 C20orf12 ILMN_1664242 1 5783 PTPN13 ILMN_1652805 1 1877 E4F1 ILMN_1720287 1 11098 PRSS23 ILMN_1797776 1 10202 DHRS2 ILMN_1725726 1 80223 RAB11FIP1 ILMN_1779426 -1 79627 OGFRL1 ILMN_1715809 -1 6948 TCN2 ILMN_1740572 -1 3097 HIVEP2 ILMN_1745447 -1 8985 PLOD3 ILMN_1714350 -1 3892 KRTHB6 ILMN_1811984 -1 10575 CCT4 ILMN_1776073 1 51004 COQ6 ILMN_1783985 -1 4071 TM4SF1 ILMN_1770338 1 1718 DHCR24 ILMN_1725510 -1 1381 CRABP1 ILMN_1658040 1 9368 SLC9A3R1 ILMN_1680925 1 92104 FLJ13946 ILMN_1735822 1 9518 GDF15 ILMN_1763658 -1 6364 CCL20 ILMN_1657234 1 3306 HSPA2 ILMN_1766499 -1 79605 PGBD5 ILMN_1733831 -1 23336 DMN ILMN_1712075 -1 1356 CP ILMN_1739608 -1 54619 CCNJ ILMN_1813431 -1 9200 PTPLA ILMN_1725791 -1 51302 CYP39A1 ILMN_1680417 1 5191 PEX7 ILMN_1729650 -1 706 TSPO ILMN_1754663 -1 7159 TP53BP2 ILMN_1779706 1 55218 EXDL2 ILMN_1771689 1 79669 C3orf52 ILMN_1672969 1 10140 TOB1 ILMN_1672004 1 11226 GALNT6 ILMN_1677574 1 6652 SORD ILMN_1692517 -1 3418 IDH2 ILMN_1751753 -1 10200 MPHOSPH6 ILMN_1746682 -1 7345 UCHL1 ILMN_1757387 -1 6564 SLC15A1 ILMN_1652857 1 54458 PRR13 ILMN_1795944 1 51103 NDUFAF1 ILMN_1754421 1 11042 SMA5 ILMN_1770444 1 10040 TOM1L1 ILMN_1802642 -1 1117 CHI3L2 ILMN_1705078 1 112398 EGLN2 ILMN_1768773 -1 9258 MFHAS1 ILMN_1745686 -1 2982 GUCY1A3 ILMN_1808590 -1 688 KLF5 ILMN_1770293 1 1960 EGR3 ILMN_1807638 1 7993 UBXD6 ILMN_1731891 1 25823 TPSG1 ILMN_1769219 1 4485 MST1 ILMN_1707464 1 23528 ZNF281 ILMN_1802758 -1 1672 DEFB1 ILMN_1686573 -1 28960 DCPS ILMN_1740737 -1 5268 SERPINB5 ILMN_1793888 1 55450 CAMK2N1 ILMN_1794863 -1 6261 RYR1 ILMN_1682062 -1 2627 GATA6 ILMN_1695041 -1 57180 ACTR3B ILMN_1787513 1 4036 LRP2 ILMN_1723443 1 29116 MYLIP ILMN_1656111 -1 57211 GPR126 ILMN_1658815 1 4435 CITED1 ILMN_1691641 -1 54913 RPP25 ILMN_1695271 -1 9982 FGFBP1 ILMN_1785404 -1 11170 FAM107A ILMN_1743445 -1 3294 HSD17B2 ILMN_1808713 1 6583 SLC22A4 ILMN_1685057 1 79170 ATAD4 ILMN_1748970 -1 79745 CLIP4 ILMN_1759792 -1 6723 SRM ILMN_1661337 1 1360 CPB1 ILMN_1685174 1 5016 OVGP1 ILMN_1734542 -1 5271 SERPINB8 ILMN_1718960 1 347902 AMIGO2 ILMN_1725896 1 79719 FLJ11506 ILMN_1654194 1 55258 FLJ10916 ILMN_1670476 -1 8563 THOC5 ILMN_1773496 1 83464 APH1B ILMN_1767816 -1 23532 PRAME ILMN_1700031 1 6834 SURF1 ILMN_1663407 1 6019 RLN2 ILMN_1748529 1 214 ALCAM ILMN_1670870 1 55333 SYNJ2BP ILMN_1697793 -1 10525 HYOU1 ILMN_1673649 1 2232 FDXR ILMN_1799319 -1 274 BIN1 ILMN_1674160 1 10307 APBB3 ILMN_1740772 -1 8986 RPS6KA4 ILMN_1756204 -1 56938 ARNTL2 ILMN_1798064 -1 9510 ADAMTS1 ILMN_1673566 -1 2770 GNAI1 ILMN_1742044 1 4350 MPG ILMN_1732821 1 863 CBFA2T3 ILMN_1775637 1 2891 GRIA2 ILMN_1683504 1 10309 CCNU ILMN_1676631 -1 7037 TFRC ILMN_1674243 -1 3574 IL7 ILMN_1705769 1 55293 UEV3 ILMN_1711452 1 27165 GLS2 ILMN_1709771 1 55188 RIC8B ILMN_1663532 -1 11202 KLK8 ILMN_1735700 1 51181 DCXR ILMN_1681437 -1 827 CAPN6 ILMN_1782654 -1 390 RND3 ILMN_1759513 -1 54438 GFOD1 ILMN_1778240 1 10079 ATP9A ILMN_1799232 1 4285 MIPEP ILMN_1669070 -1 8324 FZD7 ILMN_1746341 1 9052 GPRC5A ILMN_1682599 -1 9508 ADAMTS3 ILMN_1703803 1 10519 CIB1 ILMN_1656899 1 7138 TNNT1 ILMN_1717297 1 51735 RAPGEF6 ILMN_1725992 -1 2591 GALNT3 ILMN_1671039 -1 2348 FOLR1 ILMN_1661733 1 2954 GSTZ1 ILMN_1684168 -1 23318 ZCCHC11 ILMN_1655137 1 10267 RAMP1 ILMN_1764754 -1 25984 KRT23 ILMN_1791545 -1 6496 SIX3 ILMN_1727537 1 786 CACNG1 ILMN_1724306 1 22976 PAXIP1 ILMN_1680193 1 283232 TMEM80 ILMN_1689868 1 629 CFB ILMN_1774287 1 7286 TUFT1 ILMN_1781374 -1 5562 PRKAA1 ILMN_1783889 1 9851 KIAA0753 ILMN_1680010 1 79622 C16orf33 ILMN_1801118 1 55316 RSAD1 ILMN_1809963 -1 6271 S100A1 ILMN_1653494 1 55859 BEX1 ILMN_1702637 -1 3595 IL12RB2 ILMN_1743455 -1 2861 GPR37 ILMN_1668271 -1 55506 H2AFY2 ILMN_1705570 1 64215 DNAJC1 ILMN_1683234 -1 3096 HIVEP1 ILMN_1735548 1 23059 CLUAP1 ILMN_1800993 1 79602 ADIPOR2 ILMN_1750651 1 56683 C21orf59 ILMN_1776147 -1 22943 DKK1 ILMN_1773337 -1 6277 S100A6 ILMN_1713636 -1 65983 GRAMD3 ILMN_1734007 1 4255 MGMT ILMN_1795639 1 10406 WFDC2 ILMN_1706612 1 23552 CCRK ILMN_1806176 1 9722 NOS1AP ILMN_1710315 1 23613 ZMYND8 ILMN_1652407 -1 202 AIM1 ILMN_1688625 1 51207 DUSP13 ILMN_1785592 -1 83988 NCALD ILMN_1747979 -1 2920 CXCL2 ILMN_1682636 1 8870 IER3 ILMN_1682717 1 55245 C20orf44 ILMN_1745152 1 6666 SOX12 ILMN_1736974 1 80279 CDK5RAP3 ILMN_1658579 -1 1644 DDC ILMN_1811601 1 5441 POLR2L ILMN_1670037 -1 9022 CLIC3 ILMN_1796423 1 7769 ZNF226 ILMN_1715418 1 27239 GPR162 ILMN_1730816 1 26504 CNNM4 ILMN_1655720 -1 3400 ID4 ILMN_1721758 1 1733 DIO1 ILMN_1769547 1 25915 C3orf60 ILMN_1691557 -1 1525 CXADR ILMN_1796925 -1 1475 CSTA ILMN_1669888 1 2155 F7 ILMN_1740559 1 3622 ING2 ILMN_1671265 1 25980 C20orf4 ILMN_1721225 1 8310 ACOX3 ILMN_1743396 1 54820 NDE1 ILMN_1739805 1 5816 PVALB ILMN_1723431 1 60686 C14orf93 ILMN_1724897 -1 8792 TNFRSF11A ILMN_1698952 1 54894 RNF43 ILMN_1700606 -1 5737 PTGFR ILMN_1813341 1 1501 CTNND2 ILMN_1716875 1 7764 ZNF217 ILMN_1789841 1 8405 SPOP ILMN_1795404 1 1847 DUSP5 ILMN_1656501 1 4488 MSX2 ILMN_1766951 1 7163 TPD52 ILMN_1693367 1 25790 CCDC19 ILMN_1807976 -1 5803 PTPRZ1 ILMN_1676616 1 23635 SSBP2 ILMN_1711608 1 6548 SLC9A1 ILMN_1800425 1 8187 ZNF239 ILMN_1748427 -1 2588 GALNS ILMN_1737949 1 54903 MKS1 ILMN_1738949 1 55163 PNPO ILMN_1684289 1 55101 ATP5SL ILMN_1809027 1 4682 NUBP1 ILMN_1689342 -1 3779 KCNMB1 ILMN_1652065 -1 64849 SLC13A3 ILMN_1658519 -1 4691 NCL ILMN_1695422 1 64428 NARFL ILMN_1813833 -1 23266 LPHN2 ILMN_1697548 1 29104 C21orf127 ILMN_1701077 -1 1783 DYNC1LI2 ILMN_1783448 1 8987 GENX-3414 ILMN_1673950 -1 79852 ABHD9 ILMN_1699750 1 57586 SYT13 ILMN_1658499 -1 8785 MATN4 ILMN_1662126 -1 10331 B3GNT3 ILMN_1800082 1 5357 PLS1 ILMN_1759206 1 54880 BCOR ILMN_1773117 -1 4139 MARK1 ILMN_1779800 1 81539 SLC38A1 ILMN_1769911 -1 10810 WASF3 ILMN_1810797 -1 926 CD8B1 ILMN_1748601 -1 50805 IRX4 ILMN_1684108 1 58513 EPS15L1 ILMN_1708369 -1 6304 SATB1 ILMN_1690646 1 79446 WDR25 ILMN_1704351 1 23366 KIAA0895 ILMN_1690484 1 55699 IARS2 ILMN_1671207 Dunbier et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id ERG 1 9 NAT1 ILMN_1688071 1 1556 CYP2B7P1 ILMN_1715888 1 1717 DHCR7 ILMN_1654028 1 1952 CELSR2 ILMN_1711208 1 5174 PDZK1 ILMN_1708341 1 5209 PFKFB3 ILMN_1660847 1 5366 PMAIP1 ILMN_1689525 1 5570 PKIB ILMN_1768268 1 6252 RTN1 ILMN_1687326 1 6781 STC1 ILMN_1758164 1 7031 TFF1 ILMN_1722489 1 7033 TFF3 ILMN_1811387 1 7278 TUBA3C ILMN_1679482 1 7869 SEMA3B ILMN_1653501 1 8309 ACOX2 ILMN_1685703 1 9536 PTGES ILMN_1713829 1 10742 RAI2 ILMN_1760574 1 11001 SLC27A2 ILMN_1700831 1 23541 SEC14L2 ILMN_1684211 1 23678 SGK3 ILMN_1747020 1 23682 RAB38 ILMN_1687293 1 26353 HSPB8 ILMN_1791280 1 27290 SPINK4 ILMN_1681263 1 27314 RAB30 ILMN_1790994 1 55540 IL17RB ILMN_1767523 1 56155 TEX14 ILMN_1685490 1 57580 PREX1 ILMN_1777342 1 64699 TMPRSS3 ILMN_1741768 1 80097 FAM128B ILMN_1717184 1 112714 TUBA3E ILMN_1652464 1 116844 LRG1 ILMN_1805228 1 130013 ACMSD ILMN_1727091 1 203328 SUSD3 ILMN_1785570 1 221662 RBM24 ILMN_1673941 Bild et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id MYC -1 8714 ABCC3 ILMN_1677814 -1 55902 ACSS2 ILMN_1714197 -1 101 ADAM8 ILMN_1708348 1 219 ALDH1B1 ILMN_1675398 1 10195 ALG3 ILMN_1711886 1 54865 GPATCH4 ILMN_1694837 1 55615 PRR5 ILMN_1692664 -1 406 ARNTL ILMN_1731540 -1 56938 ARNTL2 ILMN_1798064 1 471 ATIC ILMN_1673991 -1 493 ATP2B4 ILMN_1680579 1 617 BCS1L ILMN_1738529 1 51154 C1orf33 ILMN_1689800 1 54976 C20orf27 ILMN_1697363 -1 901 CCNG2 ILMN_1747244 -1 55143 CDCA8 ILMN_1709294 -1 1017 CDK2 ILMN_1665559 1 1019 CDK4 ILMN_1689001 -1 8837 CFLAR ILMN_1789830 1 51651 PTRH2 ILMN_1811594 -1 57530 CGN ILMN_1746801 1 84916 CIRH1A ILMN_1796235 -1 64857 PLEKHG2 ILMN_1657836 -1 1277 COL1A1 ILMN_1701308 -1 1289 COL5A1 ILMN_1706505 -1 1296 COL8A2 ILMN_1674050 -1 10903 MTMR11 ILMN_1769299 -1 23564 DDAH2 ILMN_1770787 1 1662 DDX10 ILMN_1753249 1 8886 DDX18 ILMN_1756220 -1 1606 DGKA ILMN_1806863 1 1723 DHODH ILMN_1782993 -1 115817 DHRS1 ILMN_1807206 1 1736 DKC1 ILMN_1671257 -1 91404 SESTD1 ILMN_1782341 1 1844 DUSP2 ILMN_1712959 -1 2012 EMP1 ILMN_1801616 -1 54869 EPS8L1 ILMN_1685000 -1 2065 ERBB3 ILMN_1751346 1 2193 FARSLA ILMN_1778255 -1 2256 FGF11 ILMN_1719938 -1 89848 FCHSD1 ILMN_1783847 1 54663 WDR74 ILMN_1809866 1 54475 NLE1 ILMN_1724304 1 55341 LSG1 ILMN_1705746 1 55621 TRMT1 ILMN_1812940 1 55794 DDX28 ILMN_1741736 1 144577 FLJ32549 ILMN_1736995 1 124093 CCDC78 ILMN_1811397 -1 259173 ALS2CL ILMN_1702322 1 10056 FARSLB ILMN_1697304 -1 2801 GOLGA2 ILMN_1738821 -1 266977 GPR110 ILMN_1744299 -1 9982 FGFBP1 ILMN_1785404 1 7965 JTV1 ILMN_1673252 1 90161 HS6ST2 ILMN_1739429 1 3310 HSPA6 ILMN_1806165 1 51491 HSPC111 ILMN_1704055 1 3329 HSPD1 ILMN_1766713 1 92856 IMP4 ILMN_1661347 1 79711 IPO4 ILMN_1772988 -1 10379 ISGF3G ILMN_1745471 1 23171 GPD1L ILMN_1694106 1 23170 TTLL12 ILMN_1663113 -1 23351 KIAA0323 ILMN_1654392 1 23357 ANGEL1 ILMN_1665871 -1 57674 RNF213 ILMN_1749722 -1 57707 KIAA1609 ILMN_1668465 -1 3918 LAMC2 ILMN_1701424 1 124402 FAM100A ILMN_1733863 1 148523 C1orf51 ILMN_1793543 1 201164 LOC201164 ILMN_1731518 1 55326 AGPAT5 ILMN_1768029 -1 4053 LTBP2 ILMN_1703486 1 27346 TMEM97 ILMN_1710962 -1 9064 MAP3K6 ILMN_1694539 1 255231 MCOLN2 ILMN_1660462 1 4234 METTL1 ILMN_1815190 1 84798 C19orf48 ILMN_1759184 1 84315 MON1A ILMN_1696151 1 84331 C16orf14 ILMN_1730523 1 84291 MGC2408 ILMN_1762883 1 79081 C11orf48 ILMN_1739345 1 79080 CCDC86 ILMN_1689467 1 27042 C1orf107 ILMN_1746677 1 78991 PCYOX1L ILMN_1815951 -1 79026 AHNAK ILMN_1787375 -1 8569 MKNK1 ILMN_1750429 -1 4486 MST1R ILMN_1688154 1 10514 MYBBP1A ILMN_1806757 1 4609 MYC ILMN_1753923 -1 22861 NALP1 ILMN_1680774 1 4691 NCL ILMN_1695422 -1 4791 NFKB2 ILMN_1799062 -1 4804 NGFR ILMN_1752658 -1 64780 MICAL1 ILMN_1807972 -1 4817 NIT1 ILMN_1698330 1 4839 NOL1 ILMN_1723158 1 10528 NOL5A ILMN_1787628 1 65083 NOL6 ILMN_1754061 1 9221 NOLC1 ILMN_1800224 -1 8829 NRP1 ILMN_1699574 1 26354 GNL3 ILMN_1806106 -1 4909 NTF5 ILMN_1737208 1 26747 NUFIP1 ILMN_1813800 -1 23762 OSBP2 ILMN_1781966 1 5036 PA2G4 ILMN_1728984 1 10606 PAICS ILMN_1773760 -1 5091 PC ILMN_1740240 1 26577 PCOLCE2 ILMN_1746888 1 56652 C10orf2 ILMN_1701243 1 23481 PES1 ILMN_1656372 1 5213 PFKM ILMN_1708180 1 5245 PHB ILMN_1692651 -1 5252 PHF1 ILMN_1746968 -1 5328 PLAU ILMN_1656057 -1 5339 PLEC1 ILMN_1744268 1 5373 PMM2 ILMN_1785336 1 87178 PNPT1 ILMN_1810608 1 80308 FLAD1 ILMN_1663667 -1 54704 PPM2C ILMN_1720631 -1 9266 PSCD2 ILMN_1721241 1 10244 RABEPK ILMN_1741957 -1 9052 GPRC5A ILMN_1682599 1 10171 RCL1 ILMN_1813766 -1 64285 RHBDF1 ILMN_1808404 1 10799 RPP40 ILMN_1810423 1 9136 RRP9 ILMN_1795758 1 56915 EXOSC5 ILMN_1659725 1 10813 UTP14A ILMN_1688725 -1 1992 SERPINB1 ILMN_1679133 1 119559 SFXN4 ILMN_1658437 1 84561 SLC12A8 ILMN_1797600 1 6573 SLC19A1 ILMN_1698996 1 3177 SLC29A2 ILMN_1730809 1 6535 SLC6A8 ILMN_1806349 -1 84189 SLITRK6 ILMN_1813197 -1 6525 SMTN ILMN_1785618 -1 57154 SMURF1 ILMN_1737672 1 6652 SORD ILMN_1692517 -1 6653 SORL1 ILMN_1759818 -1 6709 SPTAN1 ILMN_1663526 1 6723 SRM ILMN_1661337 -1 54961 SSH3 ILMN_1755234 -1 50861 STMN3 ILMN_1693425 1 152579 SCFD2 ILMN_1708891 1 6832 SUPV3L1 ILMN_1765857 1 6949 TCOF1 ILMN_1727551 1 29914 UBIAD1 ILMN_1651872 1 64216 TFB2M ILMN_1779998 -1 7051 TGM1 ILMN_1721134 -1 26277 TINF2 ILMN_1697420 -1 7127 TNFAIP2 ILMN_1679162 -1 7846 TUBA1A ILMN_1742981 -1 6843 VAMP1 ILMN_1737611 1 55759 WDR12 ILMN_1770692 1 26094 WDR21A ILMN_1715563 1 57510 XPO5 ILMN_1759495 -1 79413 ZBED2 ILMN_1688392 1 23246 BOP1 ILMN_1715583 1 637 BID ILMN_1763386 -1 51619 UBE2D4 ILMN_1707084 -1 80761 UPK3B ILMN_1803024 -1 7052 TGM2 ILMN_1705750 -1 400077 FLJ42957 ILMN_1732143 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id VEGF 1 7422 VEGFA ILMN_1803882 -1 911 CD1C ILMN_1654210 -1 4005 LMO2 ILMN_1800078 -1 4222 MEOX1 ILMN_1657145 1 29927 SEC61A1 ILMN_1696952 -1 6166 RPL36AL ILMN_1691599 -1 9450 LY86 ILMN_1807825 -1 22900 CARD8 ILMN_1654376 -1 1776 DNASE1L3 ILMN_1762084 1 1119 CHKA ILMN_1658504 1 22809 ATF5 ILMN_1669113 -1 23417 MLYCD ILMN_1651336 -1 23592 LEMD3 ILMN_1727361 1 51621 KLF13 ILMN_1679929 Bild et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id E2F3 1 23456 ABCB10 ILMN_1665730 -1 89845 ABCC10 ILMN_1776119 1 9429 ABCG2 ILMN_1789641 1 253152 ABHD7 ILMN_1719498 1 109 ADCY3 ILMN_1676893 1 51517 NCKIPSD ILMN_1736623 1 231 AKR1B1 ILMN_1701731 1 207 AKT1 ILMN_1784157 1 7915 ALDH5A1 ILMN_1715859 1 56172 ANKH ILMN_1660778 1 134549 SHROOM1 ILMN_1738322 1 576 BAI2 ILMN_1773109 1 10018 BCL2L11 ILMN_1766541 1 54880 BCOR ILMN_1773117 -1 55612 C20orf42 ILMN_1696585 1 221545 C6orf136 ILMN_1813236 1 84553 C6orf168 ILMN_1715096 1 55603 FAM46A ILMN_1740466 1 55450 CAMK2N1 ILMN_1794863 1 10645 CAMKK2 ILMN_1743021 1 896 CCND3 ILMN_1668721 1 898 CCNE1 ILMN_1795852 1 9134 CCNE2 ILMN_1740452 1 9308 CD83 ILMN_1780582 1 23097 CDC2L6 ILMN_1676891 1 1028 CDKN1C ILMN_1718565 1 1029 CDKN2A ILMN_1717714 1 1031 CDKN2C ILMN_1656415 1 1050 CEBPA ILMN_1715715 1 8534 CHST1 ILMN_1677719 1 9435 CHST2 ILMN_1794011 1 56548 CHST7 ILMN_1732831 1 84678 FBXL10 ILMN_1794260 1 25792 CIZ1 ILMN_1724659 1 9738 CP110 ILMN_1773200 1 1407 CRY1 ILMN_1760593 1 10675 CSPG5 ILMN_1688184 1 79850 FAM57A ILMN_1673899 -1 10208 USPL1 ILMN_1662686 1 27065 D4S234E ILMN_1772627 1 1633 DCK ILMN_1651433 1 64858 DCLRE1B ILMN_1655382 1 23576 DDAH1 ILMN_1668507 -1 26151 NAT9 ILMN_1776088 1 23336 DMN ILMN_1712075 1 23234 DNAJC9 ILMN_1799516 1 29980 DONSON ILMN_1758629 1 53820 DSCR6 ILMN_1709257 1 1857 DVL3 ILMN_1686411 1 144455 E2F7 ILMN_1798210 1 1917 EEF1A2 ILMN_1811315 1 2026 ENO2 ILMN_1765796 1 399474 TTMB ILMN_1682231 1 54566 EPB41L4B ILMN_1784967 -1 1969 EPHA2 ILMN_1700527 1 2146 EZH2 ILMN_1708105 1 2175 FANCA ILMN_1799224 1 23014 FBXO21 ILMN_1745887 1 2237 FEN1 ILMN_1755834 1 2254 FGF9 ILMN_1762531 1 2261 FGFR3 ILMN_1723123 1 55084 FLJ10159 ILMN_1666502 1 64130 LIN7B ILMN_1663444 1 65055 REEP1 ILMN_1733746 1 84915 C12orf34 ILMN_1772446 1 54808 DYM ILMN_1680130 1 54463 FLJ20152 ILMN_1811330 1 54867 FLJ20254 ILMN_1716907 1 92370 ACPL2 ILMN_1706598 1 132332 FLJ30834 ILMN_1809947 1 149175 MANEAL ILMN_1662147 1 158158 RASEF ILMN_1779517 1 94234 FOXQ1 ILMN_1669046 1 10023 FRAT1 ILMN_1781416 1 8321 FZD1 ILMN_1784250 1 2643 GCH1 ILMN_1812759 1 80318 GKAP1 ILMN_1736972 1 2743 GLRB ILMN_1669631 1 2774 GNAL ILMN_1746027 1 84634 KISS1R ILMN_1673521 1 57531 HACE1 ILMN_1740217 1 51696 HECA ILMN_1770667 1 23462 HEY1 ILMN_1788203 1 51523 CXXC5 ILMN_1745256 1 29901 SAC3D1 ILMN_1776674 1 55540 IL17RB ILMN_1767523 -1 3553 IL1B ILMN_1775501 1 3625 INHBB ILMN_1685714 1 3643 INSR ILMN_1670918 1 56704 JPH1 ILMN_1693985 1 200845 KCTD6 ILMN_1800942 1 10656 KHDRBS3 ILMN_1691747 1 23199 KIAA0182 ILMN_1807767 1 26033 ATRNL1 ILMN_1786966 -1 23030 JMJD2B ILMN_1720531 1 23158 TBC1D9 ILMN_1703891 1 55636 CHD7 ILMN_1778930 1 25959 KANK2 ILMN_1733226 1 55225 RAVER2 ILMN_1804737 1 116236 LOC116236 ILMN_1769390 1 116238 TLCD1 ILMN_1784655 -1 125476 C18orf37 ILMN_1730294 1 129607 LOC129607 ILMN_1783621 1 151194 FAM119A ILMN_1762888 1 221061 FAM171A1 ILMN_1749868 1 90355 C5orf30 ILMN_1677292 1 90378 SAMD1 ILMN_1658821 1 26018 LRIG1 ILMN_1707342 1 4038 LRP4 ILMN_1675268 1 27346 TMEM97 ILMN_1710962 1 4091 SMAD6 ILMN_1767068 1 79174 CRELD2 ILMN_1748707 1 254887 ZDHHC23 ILMN_1736901 1 115752 DIS3L ILMN_1795822 -1 1609 DGKQ ILMN_1793017 1 130574 LYPD6 ILMN_1776724 -1 79101 JOSD3 ILMN_1682038 1 79022 TMEM106C ILMN_1692511 1 4324 MMP15 ILMN_1718646 1 22808 MRAS ILMN_1748881 1 4602 MYB ILMN_1711894 1 4678 NASP ILMN_1725840 1 4747 NEFL ILMN_1659086 1 81831 NETO2 ILMN_1760849 1 51199 NIN ILMN_1724753 1 9631 NUP155 ILMN_1768293 1 1122 CHML ILMN_1747697 1 5111 PCNA ILMN_1694177 1 26577 PCOLCE2 ILMN_1746888 1 5151 PDE8A ILMN_1699767 1 23089 PEG10 ILMN_1763359 1 5209 PFKFB3 ILMN_1660847 1 55274 PHF10 ILMN_1752823 1 5253 PHF2 ILMN_1720476 1 57157 PHTF2 ILMN_1698220 1 5300 PIN1 ILMN_1776375 1 29941 PKN3 ILMN_1797184 1 23228 PLCL2 ILMN_1737025 1 23129 PLXND1 ILMN_1675222 1 5426 POLE ILMN_1740245 1 5427 POLE2 ILMN_1774336 1 8613 PPAP2B ILMN_1688868 1 29028 ATAD2 ILMN_1763064 1 11168 PSIP1 ILMN_1788701 -1 5742 PTGS1 ILMN_1708275 -1 11137 PWP1 ILMN_1743049 1 5827 PXMP2 ILMN_1799015 1 25837 RAB26 ILMN_1790317 1 51514 DTL ILMN_1745251 1 9401 RECQL4 ILMN_1703092 1 25907 RIS1 ILMN_1792455 -1 58517 RBM25 ILMN_1768117 1 6117 RPA1 ILMN_1795719 1 65078 RTN4R ILMN_1737484 1 864 RUNX3 ILMN_1787461 1 6334 SCN8A ILMN_1679517 -1 6337 SCNN1A ILMN_1713995 -1 9147 SDCCAG1 ILMN_1772489 1 10194 SDCCAG33 ILMN_1718907 1 51460 SFMBT1 ILMN_1741585 -1 6431 SFRS6 ILMN_1697469 1 6450 SH3BGR ILMN_1761875 -1 23309 SIN3B ILMN_1788315 1 147912 SIX5 ILMN_1793672 1 8604 SLC25A12 ILMN_1788053 1 11000 SLC27A3 ILMN_1719627 1 9368 SLC9A3R1 ILMN_1680925 1 6666 SOX12 ILMN_1736974 1 123606 NIPA1 ILMN_1689274 -1 6720 SREBF1 ILMN_1663035 1 117178 SSX2IP ILMN_1720844 1 201254 STRA13 ILMN_1769634 1 6812 STXBP1 ILMN_1728747 1 6874 TAF4 ILMN_1737535 1 7004 TEAD4 ILMN_1705301 1 7027 TFDP1 ILMN_1661717 1 7074 TIAM1 ILMN_1655577 1 64097 EPB41L4A ILMN_1775376 1 53346 TM6SF1 ILMN_1750961 1 7107 GPR137B ILMN_1794715 1 79056 PRRG4 ILMN_1661809 -1 7128 TNFAIP3 ILMN_1702691 1 10612 TRIM3 ILMN_1810441 1 81786 TRIM7 ILMN_1756657 1 7368 UGT8 ILMN_1758816 1 10309 CCNU ILMN_1676631 1 7474 WNT5A ILMN_1800317 -1 9933 KIAA0020 ILMN_1665483 -1 7748 ZNF195 ILMN_1688515 1 11130 ZWINT ILMN_1778034 1 376267 RAB15 ILMN_1731699 1 388228 SBK1 ILMN_1728298 -1 112724 RDH13 ILMN_1660723 Bild et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id BetaCatenin -1 10152 ABI2 ILMN_1724497 -1 26225 ARL5 ILMN_1688526 -1 55870 ASH1L ILMN_1782032 -1 546 ATRX ILMN_1666885 1 8313 AXIN2 ILMN_1724480 -1 55612 C20orf42 ILMN_1696585 -1 25957 C6orf111 ILMN_1742099 -1 9749 PHACTR2 ILMN_1790533 -1 23196 FAM120A ILMN_1721089 -1 1305 COL13A1 ILMN_1761380 -1 1296 COL8A2 ILMN_1674050 -1 1462 VCAN ILMN_1687301 -1 9126 SMC3 ILMN_1718807 1 1591 CYP24A1 ILMN_1685663 -1 170506 DHX36 ILMN_1738272 -1 1778 DYNC1H1 ILMN_1808448 -1 1847 DUSP5 ILMN_1656501 -1 1997 ELF1 ILMN_1664010 -1 2058 EPRS ILMN_1783695 -1 55205 ZNF532 ILMN_1731358 -1 80205 CHD9 ILMN_1762972 1 94234 FOXQ1 ILMN_1669046 -1 10772 FUSIP1 ILMN_1658460 -1 55970 GNG12 ILMN_1673380 -1 23185 LARP5 ILMN_1766222 -1 23351 KIAA0323 ILMN_1654392 -1 23023 TMCC1 ILMN_1750539 -1 23030 JMJD2B ILMN_1720531 -1 23254 KIAA1026 ILMN_1798458 -1 23325 KIAA1033 ILMN_1782222 -1 259282 FAM44A ILMN_1775002 -1 26524 LATS2 ILMN_1703412 -1 987 LRBA ILMN_1652160 -1 7798 LUZP1 ILMN_1664366 -1 79109 MAPKAP1 ILMN_1723142 -1 79101 JOSD3 ILMN_1682038 -1 8202 NCOA3 ILMN_1708805 -1 4750 NEK1 ILMN_1699459 1 25805 BAMBI ILMN_1691410 -1 2908 NR3C1 ILMN_1762085 -1 5325 PLAGL1 ILMN_1815121 -1 59338 PLEKHA1 ILMN_1662839 -1 5744 PTHLH ILMN_1785699 -1 9444 QKI ILMN_1690476 1 157869 RPESP ILMN_1808245 -1 79048 SECISBP2 ILMN_1736481 -1 6322 SCML1 ILMN_1776653 -1 9147 SDCCAG1 ILMN_1772489 -1 140890 SFRS12 ILMN_1720088 -1 6431 SFRS6 ILMN_1697469 -1 23049 SMG1 ILMN_1801383 -1 6653 SORL1 ILMN_1759818 -1 57187 THOC2 ILMN_1696883 -1 7128 TNFAIP3 ILMN_1702691 -1 7150 TOP1 ILMN_1735572 1 9830 TRIM14 ILMN_1713542 -1 619435 C8orf61 ILMN_1684576 1 860 RUNX2 ILMN_1716651 Majumder et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id AKT/mTOR 1 535 ATP6V0A1 ILMN_1752579 1 9474 ATG5 ILMN_1717786 1 998 CDC42 ILMN_1738424 1 475 ATOX1 ILMN_1670609 1 5327 PLAT ILMN_1738742 1 6427 SFRS2 ILMN_1696407 1 5987 RFP ILMN_1730005 1 5518 PPP2R1A ILMN_1810467 1 3948 LDHC ILMN_1745043 1 3838 KPNA2 ILMN_1708160 1 2990 GUSB ILMN_1669878 1 5476 PPGB ILMN_1719286 1 27069 GHITM ILMN_1728467 1 2222 FDFT1 ILMN_1741096 1 896 CCND3 ILMN_1668721 1 7167 TPI1 ILMN_1707627 1 10938 EHD1 ILMN_1651832 1 3190 HNRPK ILMN_1712357 1 2171 FABP5 ILMN_1696302 1 51155 HN1 ILMN_1651461 1 7351 UCP2 ILMN_1685625 1 928 CD9 ILMN_1679858 1 27166 PRELID1 ILMN_1680022 1 5214 PFKP ILMN_1805737 1 7534 YWHAZ ILMN_1801928 1 6241 RRM2 ILMN_1678669 1 50814 NSDHL ILMN_1692163 1 5695 PSMB7 ILMN_1814156 1 11258 DCTN3 ILMN_1762281 1 2937 GSS ILMN_1683462 1 9551 ATP5J2 ILMN_1750143 1 529 ATP6V1E1 ILMN_1798485 1 5356 PLRG1 ILMN_1749634 1 4717 NDUFC1 ILMN_1733603 1 9516 LITAF ILMN_1713934 1 4259 MGST3 ILMN_1751956 1 81614 NIPA2 ILMN_1720344 1 4282 MIF ILMN_1716169 1 5604 MAP2K1 ILMN_1694240 1 9524 GPSN2 ILMN_1720799 1 3326 HSP90AB1 ILMN_1673711 1 4074 M6PR ILMN_1682589 1 527 ATP6V0C ILMN_1773849 1 2987 GUK1 ILMN_1758398 1 5050 PAFAH1B3 ILMN_1762654 1 10055 SAE1 ILMN_1657204 1 6813 STXBP2 ILMN_1795426 1 1072 CFL1 ILMN_1705617 1 56478 EIF4ENIF1 ILMN_1794967 1 10390 CEPT1 ILMN_1676588 1 2539 G6PD ILMN_1697559 1 25994 HIGD1A ILMN_1674522 1 3959 LGALS3BP ILMN_1654314 1 4072 TACSTD1 ILMN_1673871 1 1366 CLDN7 ILMN_1723564 1 80736 SLC44A4 ILMN_1730977 1 57192 MCOLN1 ILMN_1764383 1 25825 BACE2 ILMN_1669323 1 54676 GTPBP2 ILMN_1694475 1 1803 DPP4 ILMN_1692535 1 6120 RPE ILMN_1699476 1 11035 RIPK3 ILMN_1763763 1 204 AK2 ILMN_1716053 1 4289 MKLN1 ILMN_1742578 1 10280 OPRS1 ILMN_1717925 1 533 ATP6V0B ILMN_1721391 1 64225 ATL2 ILMN_1716384 1 29103 DNAJC15 ILMN_1812666 1 79647 C1orf108 ILMN_1658337 1 226 ALDOA ILMN_1736700 1 6993 DYNLT1 ILMN_1678766 1 637 BID ILMN_1763386 1 10519 CIB1 ILMN_1656899 1 2764 GMFB ILMN_1752915 1 6733 SRPK2 ILMN_1657451 1 84245 MGC3207 ILMN_1732089 1 3880 KRT19 ILMN_1753924 1 83786 FKSG44 ILMN_1781047 1 7389 UROD ILMN_1740742 1 1717 DHCR7 ILMN_1654028 1 55872 PBK ILMN_1673673 1 6391 SDHC ILMN_1746241 1 5315 PKM2 ILMN_1672650 1 55856 THEM2 ILMN_1797336 1 801 CALM1 ILMN_1778242 1 7277 TUBA4A ILMN_1784300 1 957 ENTPD5 ILMN_1745849 1 9843 HEPH ILMN_1714523 1 116541 MRPL54 ILMN_1658486 1 2820 GPD2 ILMN_1723139 1 6884 TAF13 ILMN_1712561 1 8504 PEX3 ILMN_1702034 1 10487 CAP1 ILMN_1797604 1 1508 CTSB ILMN_1696360 1 93974 ATPIF1 ILMN_1727332 1 6646 SOAT1 ILMN_1699100 1 55611 OTUB1 ILMN_1778017 1 4669 NAGLU ILMN_1694980 1 5836 PYGL ILMN_1696187 1 23603 CORO1C ILMN_1745954 1 80777 CYB5-M ILMN_1684321 1 59084 ENPP5 ILMN_1660727 1 5230 PGK1 ILMN_1755749 1 51478 HSD17B7 ILMN_1671661 1 890 CCNA2 ILMN_1786125 1 5641 LGMN ILMN_1698019 1 10635 RAD51AP1 ILMN_1670353 1 10103 TSPAN1 ILMN_1747546 1 7064 THOP1 ILMN_1726659 1 100 ADA ILMN_1803686 1 686 BTD ILMN_1699728 1 10728 PTGES3 ILMN_1752566 1 192286 HIGD2A ILMN_1774334 1 2150 F2RL1 ILMN_1673113 1 8342 HIST1H2BM ILMN_1736820 1 23597 ACOT9 ILMN_1658995 1 56675 NRIP3 ILMN_1759563 1 7099 TLR4 ILMN_1706217 1 90843 TCEAL8 ILMN_1670561 1 10204 NUTF2 ILMN_1655046 1 254863 C17orf61 ILMN_1737358 1 3073 HEXA ILMN_1813911 1 3433 IFIT2 ILMN_1739428 1 2872 MKNK2 ILMN_1654060 1 5019 OXCT1 ILMN_1813544 1 3799 KIF5B ILMN_1788160 1 6945 MLX ILMN_1792207 1 7514 XPO1 ILMN_1725121 1 3898 LAD1 ILMN_1782389 1 7001 PRDX2 ILMN_1767766 1 950 SCARB2 ILMN_1814726 1 6788 STK3 ILMN_1666453 1 10618 TGOLN2 ILMN_1651735 1 6698 SPRR1A ILMN_1716591 1 51330 TNFRSF12A ILMN_1689004 1 2597 GAPDH ILMN_1802252 1 27075 TSPAN13 ILMN_1669881 1 112399 EGLN3 ILMN_1667626 1 726 CAPN5 ILMN_1737089 1 57402 S100A14 ILMN_1783287 1 54997 TESC ILMN_1750181 1 10380 BPNT1 ILMN_1712718 1 11187 PKP3 ILMN_1753457 1 80324 PUS1 ILMN_1662658 1 8766 RAB11A ILMN_1712312 1 26517 TIMM13 ILMN_1686557 1 2673 GFPT1 ILMN_1696000 1 2877 GPX2 ILMN_1662776 1 2023 ENO1 ILMN_1710756 1 30001 ERO1L ILMN_1744963 1 4356 MPP3 ILMN_1724754 1 9982 FGFBP1 ILMN_1785404 1 119504 C10orf104 ILMN_1738955 1 7113 TMPRSS2 ILMN_1791123 1 51268 PIPOX ILMN_1743475 1 3055 HCK ILMN_1791771 1 528 ATP6V1C1 ILMN_1659801 1 64078 SLC28A3 ILMN_1741014 1 4641 MYO1C ILMN_1812616 1 79570 NKAIN1 ILMN_1739374 1 26471 P8 ILMN_1790234 1 4488 MSX2 ILMN_1766951 1 3939 LDHA ILMN_1807106 1 10087 COL4A3BP ILMN_1680109 1 30844 EHD4 ILMN_1720083 1 3565 IL4 ILMN_1669174 1 55760 DHX32 ILMN_1713688 1 23643 LY96 ILMN_1724533 1 136319 MTPN ILMN_1791478 1 2643 GCH1 ILMN_1812759 1 6303 SAT1 ILMN_1753342 1 8521 GCM1 ILMN_1695135 1 58472 SQRDL ILMN_1667199 1 3856 KRT8 ILMN_1753584 1 84709 OSAP ILMN_1793025 1 5223 PGAM1 ILMN_1661366 1 1499 CTNNB1 ILMN_1746396 1 7532 YWHAG ILMN_1750145 1 10627 MRCL3 ILMN_1675848 1 7529 YWHAB ILMN_1694385 1 3098 HK1 ILMN_1727672 1 7422 VEGFA ILMN_1803882 1 5284 PIGR ILMN_1685387 1 112939 BTBD14B ILMN_1658231 1 5531 PPP4C ILMN_1750364 1 2821 GPI ILMN_1654465 1 171425 CLYBL ILMN_1663538 1 54107 POLE3 ILMN_1785198 1 9663 LPIN2 ILMN_1670028 1 6611 SMS ILMN_1694305 1 54836 BSPRY ILMN_1667077 1 26292 MYCBP ILMN_1659620 1 429 ASCL1 ILMN_1701653 1 10452 TOMM40 ILMN_1683475 1 4793 NFKBIB ILMN_1690473 1 2017 CTTN ILMN_1744912 1 136 ADORA2B ILMN_1703946 1 4363 ABCC1 ILMN_1802404 1 10611 PDLIM5 ILMN_1770224 1 1119 CHKA ILMN_1658504 1 117156 SCGB3A2 ILMN_1670306 1 5784 PTPN14 ILMN_1754830 1 5211 PFKL ILMN_1713037 1 8740 TNFSF14 ILMN_1655414 1 55740 ENAH ILMN_1716552 1 10401 PIAS3 ILMN_1675497 1 4000 LMNA ILMN_1696749 1 81490 PTDSS2 ILMN_1763723 1 822 CAPG ILMN_1655821 1 3949 LDLR ILMN_1651611 1 3839 KPNA3 ILMN_1708427 1 205 AK3L1 ILMN_1764090 1 5601 MAPK9 ILMN_1795411 1 5469 PPARBP ILMN_1721729 1 5905 RANGAP1 ILMN_1662198 1 5610 EIF2AK2 ILMN_1706502 1 54469 ZFAND6 ILMN_1778803 1 5583 PRKCH ILMN_1780898 1 54463 FLJ20152 ILMN_1811330 1 79774 GRTP1 ILMN_1745068 1 6700 SPRR2A ILMN_1795359 1 537 ATP6AP1 ILMN_1697694 1 1622 DBI ILMN_1715120 1 7511 XPNPEP1 ILMN_1669015 1 664 BNIP3 ILMN_1724658 1 54205 CYCS ILMN_1730416 1 51474 LIMA1 ILMN_1704369 1 1476 CSTB ILMN_1761797 1 523 ATP6V1A ILMN_1711516 1 1431 CS ILMN_1791182 1 5863 RGL2 ILMN_1759159 1 3099 HK2 ILMN_1723486 1 23624 CBLC ILMN_1811729 1 9646 CTR9 ILMN_1665164 1 5550 PREP ILMN_1751887 1 10146 G3BP1 ILMN_1690065 1 3434 IFIT1 ILMN_1707695 1 8357 HIST1H3H ILMN_1749368 1 51142 CHCHD2 ILMN_1815124 1 9689 BZW1 ILMN_1793846 1 9948 WDR1 ILMN_1675844 1 51727 CMPK1 ILMN_1738642 1 6307 SC4MOL ILMN_1720889 1 10140 TOB1 ILMN_1672004 1 9777 TM9SF4 ILMN_1674421 1 740 MRPL49 ILMN_1790834 1 3985 LIMK2 ILMN_1660624 1 92259 MRPS36 ILMN_1807095 1 54682 MANSC1 ILMN_1652490 1 5578 PRKCA ILMN_1771800 1 8560 DEGS1 ILMN_1667430 1 2805 GOT1 ILMN_1656145 1 2224 FDPS ILMN_1804248 1 9262 STK17B ILMN_1798543 1 7086 TKT ILMN_1736597 1 26140 TTLL3 ILMN_1682818 1 10783 NEK6 ILMN_1660871 1 10383 TUBB2C ILMN_1780769 1 55041 PLEKHB2 ILMN_1698323 1 10159 ATP6AP2 ILMN_1677440 1 5226 PGD ILMN_1794165 1 513 ATP5D ILMN_1653599 1 5163 PDK1 ILMN_1670256 1 54583 EGLN1 ILMN_1749892 1 3422 IDI1 ILMN_1755075 1 28958 CCDC56 ILMN_1789786 1 29887 SNX10 ILMN_1786257 1 5236 PGM1 ILMN_1800659 1 9532 BAG2 ILMN_1759618 1 220988 HNRPA3 ILMN_1761083 1 9296 ATP6V1F ILMN_1678308 1 6050 RNH1 ILMN_1660880 1 81876 RAB1B ILMN_1664030 1 8453 CUL2 ILMN_1669252 1 2739 GLO1 ILMN_1702177 1 150684 COMMD1 ILMN_1761242 1 55065 GPR172B ILMN_1683492 1 55620 STAP2 ILMN_1657631 1 30851 TAX1BP3 ILMN_1803392 1 92799 SHKBP1 ILMN_1765493 1 307 ANXA4 ILMN_1711408 1 150290 DUSP18 ILMN_1734288 1 4967 OGDH ILMN_1733869 1 26136 TES ILMN_1765246 1 134147 LOC134147 ILMN_1709634 1 10999 SLC27A4 ILMN_1655039 1 5130 PCYT1A ILMN_1658310 1 55813 UTP6 ILMN_1778238 1 26355 FAM162A ILMN_1803647 1 23443 SLC35A3 ILMN_1653429 1 79815 NPAL2 ILMN_1774373 1 4731 NDUFV3 ILMN_1765500 1 6309 SC5DL ILMN_1677607 1 230 ALDOC ILMN_1755974 1 58513 EPS15L1 ILMN_1708369 1 79370 BCL2L14 ILMN_1664235 1 55930 MYO5C ILMN_1808789 1 767 CA8 ILMN_1696615 1 55287 TMEM40 ILMN_1705054 1 171177 RHOV ILMN_1698484 1 129642 OACT2 ILMN_1777853 1 54097 FAM3B ILMN_1685767 1 6888 TALDO1 ILMN_1746588 1 29088 MRPL15 ILMN_1800598 1 11269 DDX19B ILMN_1707123 1 8786 RGS11 ILMN_1763704 1 2013 EMP2 ILMN_1671270 1 47 ACLY ILMN_1749014 1 1355 COX15 ILMN_1718309 1 151354 FAM84A ILMN_1784422 1 3135 HLA-G ILMN_1656670 1 5795 PTPRJ ILMN_1699851 1 57458 TMCC3 ILMN_1685493 1 1636 ACE ILMN_1779984 1 327 APEH ILMN_1718023 1 829 CAPZA1 ILMN_1803742 1 148223 C19orf25 ILMN_1703985 1 5165 PDK3 ILMN_1776582 1 7706 TRIM25 ILMN_1754859 1 94240 EPSTI1 ILMN_1688566 1 79747 C6orf103 ILMN_1666316 1 6513 SLC2A1 ILMN_1809256 1 51075 TXNDC14 ILMN_1799367 1 25797 QPCT ILMN_1741727 1 3320 HSP90AA1 ILMN_1691097 1 55907 CMAS ILMN_1714082 1 85414 SLC45A3 ILMN_1726114 1 9563 H6PD ILMN_1721136 1 1266 CNN3 ILMN_1782439 1 515 ATP5F1 ILMN_1672191 1 10970 CKAP4 ILMN_1790891 1 23028 AOF2 ILMN_1813840 1 64761 PARP12 ILMN_1718558 1 64859 OBFC2A ILMN_1785852 1 3958 LGALS3 ILMN_1747118 1 286262 C9orf75 ILMN_1664283 1 253943 YTHDF3 ILMN_1657470 1 283130 LOC283130 ILMN_1810727 1 51809 GALNT7 ILMN_1670748 1 4047 LSS ILMN_1715024 1 5336 PLCG2 ILMN_1815719 1 6836 SURF4 ILMN_1799055 1 3892 KRTHB6 ILMN_1811984 1 81844 TRIM56 ILMN_1666376 1 51495 PTPLAD1 ILMN_1729762 1 23089 PEG10 ILMN_1763359 1 162494 RHBDL3 ILMN_1716019 1 6049 RNF6 ILMN_1687267 1 79622 C16orf33 ILMN_1801118 1 57142 RTN4 ILMN_1748983 1 7037 TFRC ILMN_1674243 1 84899 TMTC4 ILMN_1762095 1 85461 TANC1 ILMN_1772278 1 54541 DDIT4 ILMN_1661599 1 84267 C9orf64 ILMN_1777318 1 51081 MRPS7 ILMN_1813389 1 4696 NDUFA3 ILMN_1784641 1 644 BLVRA ILMN_1691436 1 118881 COMTD1 ILMN_1736752 1 4128 MAOA ILMN_1663640 1 4520 MTF1 ILMN_1763828 1 10989 IMMT ILMN_1782579 1 126006 PCP2 ILMN_1720093 1 5520 PPP2R2A ILMN_1788961 1 55276 PGM2 ILMN_1673543 1 57494 FAM80B ILMN_1681757 1 158219 TTC39B ILMN_1769290 1 9603 NFE2L3 ILMN_1724898 1 178 AGL ILMN_1664006 1 55161 TMEM33 ILMN_1750795 1 1545 CYP1B1 ILMN_1693338 1 3157 HMGCS1 ILMN_1797728 1 10992 SF3B2 ILMN_1737807 1 55361 PI4K2A ILMN_1750549 1 9716 AQR ILMN_1717154 1 6659 SOX4 ILMN_1815745 1 400916 CHCHD10 ILMN_1740170 1 83699 SH3BGRL2 ILMN_1762764 1 92359 CRB3 ILMN_1754635 1 10043 TOM1 ILMN_1813148 1 9993 DGCR2 ILMN_1713301 1 1317 SLC31A1 ILMN_1804562 1 55293 UEV3 ILMN_1711452 1 340348 TSPAN33 ILMN_1749403 1 23218 NBEAL2 ILMN_1660629 1 10900 RUNDC3A ILMN_1756715 1 2585 GALK2 ILMN_1723124 1 10971 YWHAQ ILMN_1674385 1 91373 UAP1L1 ILMN_1653712 1 50 ACO2 ILMN_1654861 1 6645 SNTB2 ILMN_1786766 1 23788 MTCH2 ILMN_1785218 1 6218 RPS17 ILMN_1685653 1 292 SLC25A5 ILMN_1774062 1 6651 SON ILMN_1703427 1 1974 EIF4A2 ILMN_1685722 1 5209 PFKFB3 ILMN_1660847 1 2314 FLII ILMN_1737170 1 51629 SLC25A39 ILMN_1721723 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id ERBB2 1 2064 ERBB2 ILMN_1694303 1 93210 PERLD1 ILMN_1805636 1 5709 PSMD3 ILMN_1796430 1 5409 PNMT ILMN_1798007 1 55876 GSDML ILMN_1666206 1 22794 CASC3 ILMN_1683600 1 3927 LASP1 ILMN_1665909 1 147179 WIPF2 ILMN_1786229 1 55040 EPN3 ILMN_1726893 1 5245 PHB ILMN_1692651 1 9635 CLCA2 ILMN_1655523 1 3227 HOXC11 ILMN_1697342 1 29095 ORMDL2 ILMN_1774708 1 5909 RAP1GAP ILMN_1776519 1 1573 CYP2J2 ILMN_1758731 1 26154 ABCA12 ILMN_1701642 1 3081 HGD ILMN_1737541 -1 8804 CREG1 ILMN_1680624 1 9914 KIAA0703 ILMN_1785413 -1 5129 PCTK3 ILMN_1784110 -1 54793 KCTD9 ILMN_1653612 1 404093 CUEDC1 ILMN_1676665 1 3675 ITGA3 ILMN_1685397 1 55129 TMEM16K ILMN_1767111 -1 24147 FJX1 ILMN_1746465 1 1048 CEACAM5 ILMN_1670959 -1 51375 SNX7 ILMN_1685077 Bild et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id SRC -1 89845 ABCC10 ILMN_1776119 -1 47 ACLY ILMN_1749014 -1 771 CA12 ILMN_1720998 -1 55870 ASH1L ILMN_1782032 -1 55612 C20orf42 ILMN_1696585 -1 157680 VPS13B ILMN_1765165 -1 1296 COL8A2 ILMN_1674050 -1 1479 CSTF3 ILMN_1736161 -1 8853 DDEF2 ILMN_1757237 -1 115817 DHRS1 ILMN_1807206 -1 9988 DMTF1 ILMN_1750075 -1 131566 DCBLD2 ILMN_1735499 -1 79813 EHMT1 ILMN_1712453 -1 2135 EXTL2 ILMN_1797950 -1 55120 FANCL ILMN_1754045 -1 64848 YTHDC2 ILMN_1725760 -1 10634 GAS2L1 ILMN_1724059 -1 10808 HSPH1 ILMN_1712888 -1 23023 TMCC1 ILMN_1750539 -1 23030 JMJD2B ILMN_1720531 -1 9388 LIPG ILMN_1689037 -1 125476 C18orf37 ILMN_1730294 -1 4047 LSS ILMN_1715024 -1 4140 MARK3 ILMN_1704795 1 326625 MMAB ILMN_1713055 -1 6526 SLC5A3 ILMN_1787813 1 23645 PPP1R15A ILMN_1659936 -1 144165 PRICKLE1 ILMN_1741356 -1 150696 PROM2 ILMN_1761946 -1 5744 PTHLH ILMN_1785699 -1 6241 RRM2 ILMN_1678669 -1 79048 SECISBP2 ILMN_1736481 -1 5055 SERPINB2 ILMN_1752993 -1 6558 SLC12A2 ILMN_1720996 1 6714 SRC ILMN_1729987 -1 6744 SSFA2 ILMN_1742260 -1 10299 Mar-06 ILMN_1757106 -1 7128 TNFAIP3 ILMN_1702691 -1 23270 TSPYL4 ILMN_1715821 -1 7559 ZNF12 ILMN_1784577 -1 27107 ZBTB11 ILMN_1691395 -1 51592 TRIM33 ILMN_1682316 -1 1277 COL1A1 ILMN_1701308 Loi et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id PIK3CA 1 23157 Sep-06 ILMN_1661342 -1 23461 ABCA5 ILMN_1784176 1 51703 ACSL5 ILMN_1705247 -1 135 ADORA2A ILMN_1743519 1 202 AIM1 ILMN_1688625 -1 205 AK3L1 ILMN_1764090 -1 7915 ALDH5A1 ILMN_1715859 1 240 ALOX5 ILMN_1680996 -1 10513 APPBP2 ILMN_1694875 1 367 AR ILMN_1767351 1 397 ARHGDIB ILMN_1678143 1 9915 ARNT2 ILMN_1718046 -1 10776 ARPP-19 ILMN_1772798 -1 440 ASNS ILMN_1796417 1 481 ATP1B1 ILMN_1736862 -1 8992 ATP6V0E1 ILMN_1715635 1 23215 BAT2D1 ILMN_1743137 -1 596 BCL2 ILMN_1801119 1 629 CFB ILMN_1774287 1 330 BIRC3 ILMN_1696549 -1 51651 PTRH2 ILMN_1811594 1 684 BST2 ILMN_1723480 1 10384 BTN3A3 ILMN_1733338 -1 55847 CISD1 ILMN_1761781 1 116496 C1orf24 ILMN_1667966 1 25966 C21orf25 ILMN_1652512 1 9980 DOPEY2 ILMN_1741711 1 65055 REEP1 ILMN_1733746 1 721 C4B ILMN_1715109 -1 56892 C8orf4 ILMN_1656369 -1 51101 FAM164A ILMN_1789558 1 51806 CALML5 ILMN_1749118 1 10486 CAP2 ILMN_1691237 1 824 CAPN2 ILMN_1716057 1 64127 NOD2 ILMN_1762594 1 834 CASP1 ILMN_1742270 1 874 CBR3 ILMN_1652237 -1 875 CBS ILMN_1804735 1 6352 CCL5 ILMN_1773352 -1 10576 CCT2 ILMN_1701298 1 972 CD74 ILMN_1761464 1 64866 CDCP1 ILMN_1724941 1 1048 CEACAM5 ILMN_1670959 1 4680 CEACAM6 ILMN_1712522 -1 1081 CGA ILMN_1734176 1 79789 CLMN ILMN_1714522 -1 1363 CPE ILMN_1731374 1 1384 CRAT ILMN_1728671 -1 8531 CSDA ILMN_1782788 1 1472 CST4 ILMN_1752452 1 1488 CTBP2 ILMN_1691294 -1 1501 CTNND2 ILMN_1716875 1 1602 DACH1 ILMN_1755741 -1 23259 DDHD2 ILMN_1705871 1 55526 DHTKD1 ILMN_1664369 -1 79665 DHX40 ILMN_1653047 1 1832 DSP ILMN_1655614 -1 1837 DTNA ILMN_1730201 -1 1875 E2F5 ILMN_1782551 -1 55862 ECHDC1 ILMN_1762134 1 26298 EHF ILMN_1708130 -1 1968 EIF2S3 ILMN_1665717 1 8507 ENC1 ILMN_1779147 1 22875 ENPP4 ILMN_1693675 1 956 ENTPD3 ILMN_1775114 1 957 ENTPD5 ILMN_1745849 -1 2042 EPHA3 ILMN_1775931 1 2052 EPHX1 ILMN_1701025 1 2099 ESR1 ILMN_1678535 1 51466 EVL ILMN_1730622 -1 58516 FAM60A ILMN_1683664 -1 2263 FGFR2 ILMN_1682270 -1 55181 C17orf71 ILMN_1657693 -1 79884 FLJ21159 ILMN_1789224 1 2331 FMOD ILMN_1789639 1 2299 FOXI1 ILMN_1736936 1 53827 FXYD5 ILMN_1704286 -1 8323 FZD6 ILMN_1659297 1 2571 GAD1 ILMN_1660973 1 55568 GALNT10 ILMN_1681984 1 2590 GALNT2 ILMN_1814606 1 51809 GALNT7 ILMN_1670748 -1 2743 GLRB ILMN_1669631 1 2745 GLRX ILMN_1737308 1 2762 GMDS ILMN_1711227 1 9630 GNA14 ILMN_1734857 1 51280 GOLM1 ILMN_1766405 1 2239 GPC4 ILMN_1789502 1 2888 GRB14 ILMN_1793832 -1 2886 GRB7 ILMN_1740762 1 2950 GSTP1 ILMN_1679809 -1 51454 GULP1 ILMN_1802690 -1 55573 CDV3 ILMN_1810977 -1 50810 HDGFRP3 ILMN_1784256 -1 3012 HIST1H2AE ILMN_1756849 -1 8969 HIST1H2AG ILMN_1686478 -1 3109 HLA-DMB ILMN_1761733 -1 8337 HIST2H2AA3 ILMN_1659047 -1 8349 HIST2H2BE ILMN_1732071 -1 92815 HIST3H2A ILMN_1805655 1 3106 HLA-B ILMN_1703403 1 3108 HLA-DMA ILMN_1695311 1 3120 HLA-DQB2 ILMN_1741648 1 3158 HMGCS2 ILMN_1815203 -1 9456 HOMER1 ILMN_1804568 -1 22824 HSPA4L ILMN_1732468 1 3310 HSPA6 ILMN_1806165 1 3383 ICAM1 ILMN_1812226 1 3398 ID2 ILMN_1793990 -1 3400 ID4 ILMN_1721758 -1 51124 IER3IP1 ILMN_1763539 1 3321 IGSF3 ILMN_1713014 1 10788 IQGAP2 ILMN_1769433 -1 8660 IRS2 ILMN_1763809 1 11015 KDELR3 ILMN_1722820 1 23254 KIAA1026 ILMN_1798458 1 22998 LIMCH1 ILMN_1664138 1 23303 KIF13B ILMN_1686562 1 9314 KLF4 ILMN_1779857 1 3855 KRT7 ILMN_1801661 -1 3945 LDHB ILMN_1728132 1 51176 LEF1 ILMN_1679185 1 3958 LGALS3 ILMN_1747118 1 3964 LGALS8 ILMN_1664402 1 3965 LGALS9 ILMN_1715760 -1 51136 LOC51136 ILMN_1688606 1 93349 LOC93349 ILMN_1658858 1 9404 LPXN ILMN_1742789 1 64167 LRAP ILMN_1743145 1 4057 LTF ILMN_1677920 1 4065 LY75 ILMN_1757011 -1 23764 MAFF ILMN_1680139 1 57134 MAN1C1 ILMN_1713807 -1 4233 MET ILMN_1715175 -1 286527 MGC39900 ILMN_1740512 -1 23531 MMD ILMN_1733937 -1 4331 MNAT1 ILMN_1672361 1 4488 MSX2 ILMN_1766951 -1 4493 MT1E ILMN_1718968 1 4582 MUC1 ILMN_1756992 -1 4609 MYC ILMN_1753923 1 4651 MYO10 ILMN_1703576 1 9 NAT1 ILMN_1688071 1 4739 NEDD9 ILMN_1758719 -1 27018 NGFRAP1 ILMN_1729208 1 4824 NKX3-1 ILMN_1667162 1 4853 NOTCH2 ILMN_1656254 1 4862 NPAS2 ILMN_1765558 1 4939 OAS2 ILMN_1674063 1 51686 OAZ3 ILMN_1681892 -1 4969 OGN ILMN_1790098 -1 5001 ORC5L ILMN_1705093 -1 5021 OXTR ILMN_1804929 1 5066 PAM ILMN_1788631 1 9659 PDE4DIP ILMN_1743773 1 10158 PDZK1IP1 ILMN_1708580 -1 5178 PEG3 ILMN_1675331 1 64065 PERP ILMN_1726161 -1 5203 PFDN4 ILMN_1801762 -1 5213 PFKM ILMN_1708180 -1 5217 PFN2 ILMN_1728258 -1 51659 GINS2 ILMN_1809590 -1 5281 PIGF ILMN_1808938 1 5295 PIK3R1 ILMN_1760303 1 8503 PIK3R3 ILMN_1692895 1 5307 PITX1 ILMN_1760211 1 5320 PLA2G2A ILMN_1740586 1 5327 PLAT ILMN_1738742 -1 5332 PLCB4 ILMN_1736426 -1 5350 PLN ILMN_1785523 -1 5352 PLOD2 ILMN_1771599 1 5376 PMP22 ILMN_1785646 1 8495 PPFIBP2 ILMN_1675656 -1 8493 PPM1D ILMN_1670875 1 54704 PPM2C ILMN_1720631 1 79056 PRRG4 ILMN_1661809 1 23362 PSD3 ILMN_1717477 -1 11168 PSIP1 ILMN_1788701 -1 5718 PSMD12 ILMN_1691428 1 29108 PYCARD ILMN_1698766 1 5768 QSOX1 ILMN_1758229 -1 5885 RAD21 ILMN_1748578 -1 5889 RAD51C ILMN_1695386 -1 10267 RAMP1 ILMN_1764754 1 5920 RARRES3 ILMN_1701613 1 11030 RBPMS ILMN_1708025 1 9185 REPS2 ILMN_1656934 1 5979 RET ILMN_1655610 -1 6019 RLN2 ILMN_1748529 -1 9045 RPL14 ILMN_1726460 -1 6169 RPL38 ILMN_1670633 -1 6198 RPS6KB1 ILMN_1704557 -1 58528 RRAGD ILMN_1699772 -1 22800 RRAS2 ILMN_1667519 1 23328 SASH1 ILMN_1712673 1 10647 SCGB1D2 ILMN_1714536 1 4250 SCGB2A2 ILMN_1723333 -1 6383 SDC2 ILMN_1784553 1 12 SERPINA3 ILMN_1788874 -1 8910 SGCE ILMN_1674620 1 23677 SH3BP4 ILMN_1785330 1 22941 SHANK2 ILMN_1814790 1 26503 SLC17A5 ILMN_1771317 1 64754 SMYD3 ILMN_1741954 -1 150094 SNF1LK ILMN_1717639 -1 51375 SNX7 ILMN_1685077 1 6653 SORL1 ILMN_1759818 -1 79582 SPAG16 ILMN_1739192 1 9517 SPTLC2 ILMN_1704290 -1 6713 SQLE ILMN_1772241 -1 6717 SRI ILMN_1699525 1 4070 TACSTD2 ILMN_1801274 1 7020 TFAP2A ILMN_1765574 1 7056 THBD ILMN_1759787 1 7088 TLE1 ILMN_1751572 1 7107 GPR137B ILMN_1794715 1 64699 TMPRSS3 ILMN_1741768 1 8743 TNFSF10 ILMN_1801307 1 23043 TNIK ILMN_1687442 1 27324 TNRC9 ILMN_1704283 1 7164 TPD52L1 ILMN_1714383 1 7188 TRAF5 ILMN_1740493 -1 23321 TRIM2 ILMN_1745079 -1 51174 TUBD1 ILMN_1749253 -1 7295 TXN ILMN_1680314 1 7351 UCP2 ILMN_1685625 -1 10810 WASF3 ILMN_1810797 -1 51186 WBP5 ILMN_1679838 1 7474 WNT5A ILMN_1800317 -1 65986 ZBTB10 ILMN_1673222 1 677 ZFP36L1 ILMN_1675448 Saale at al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id PTEN -1 5728 PTEN ILMN_1701134 1 4291 MLF1 ILMN_1684439 1 1010 CDH12 ILMN_1709269 -1 145781 Gcom1 ILMN_1674151 1 4751 NEK2 ILMN_1653822 1 6612 SUMO3 ILMN_1725642 -1 2331 FMOD ILMN_1789639 1 643224 LOC643224 ILMN_1802181 -1 10399 GNB2L1 ILMN_1736500 1 7372 UMPS ILMN_1757437 1 11073 TOPBP1 ILMN_1684929 1 126731 C1orf96 ILMN_1699217 1 5052 PRDX1 ILMN_1710159 -1 5094 PCBP2 ILMN_1724825 1 330 BIRC3 ILMN_1696549 1 5290 PIK3CA ILMN_1705468 -1 1265 CNN2 ILMN_1770290 -1 26123 C10orf61 ILMN_1678652 1 79132 LGP2 ILMN_1678422 1 3838 KPNA2 ILMN_1708160 1 9711 KIAA0226 ILMN_1763637 -1 8510 MMP23B ILMN_1808107 -1 80306 MED28 ILMN_1749821 -1 2043 EPHA4 ILMN_1672022 1 26973 CHORDC1 ILMN_1776337 -1 84896 ATAD1 ILMN_1654497 1 1164 CKS2 ILMN_1756326 1 8208 CHAF1B ILMN_1674231 1 24137 KIF4A ILMN_1799667 -1 23613 ZMYND8 ILMN_1652407 1 87178 PNPT1 ILMN_1810608 1 11004 KIF2C ILMN_1685916 -1 27122 DKK3 ILMN_1815673 1 205564 SENP5 ILMN_1675501 -1 8724 SNX3 ILMN_1740180 -1 11171 STRAP ILMN_1731194 -1 6228 RPS23 ILMN_1772459 1 54503 ZDHHC13 ILMN_1684663 1 1207 CLNS1A ILMN_1736814 1 1062 CENPE ILMN_1716279 -1 3416 IDE ILMN_1769883 1 9833 MELK ILMN_1731184 -1 5169 ENPP3 ILMN_1749131 -1 140459 ASB6 ILMN_1806705 1 51642 MRPL48 ILMN_1774580 -1 56977 STOX2 ILMN_1803256 1 5612 PRKRIR ILMN_1655622 1 10440 TIMM17A ILMN_1656798 -1 84942 WDR73 ILMN_1702592 1 3925 STMN1 ILMN_1657796 1 7307 U2AF1 ILMN_1772113 1 27316 RBMX ILMN_1723580 1 27238 GPKOW ILMN_1684197 -1 50861 STMN3 ILMN_1693425 1 1503 CTPS ILMN_1783285 -1 54556 ING3 ILMN_1806226 1 11169 WDHD1 ILMN_1756043 1 4172 MCM3 ILMN_1806818 -1 9037 SEMA5A ILMN_1656927 1 10383 TUBB2C ILMN_1780769 -1 1889 ECE1 ILMN_1672174 -1 10121 ACTR1A ILMN_1792314 1 9392 TGFBRAP1 ILMN_1696870 1 9787 DLG7 ILMN_1749829 1 151246 SGOL2 ILMN_1746699 -1 3705 ITPK1 ILMN_1715674 1 891 CCNB1 ILMN_1712803 -1 83700 JAM3 ILMN_1769575 1 5984 RFC4 ILMN_1724489 1 5718 PSMD12 ILMN_1691428 -1 8897 MTMR3 ILMN_1739641 -1 23111 SPG20 ILMN_1801236 1 29105 C16orf80 ILMN_1707100 1 6732 SRPK1 ILMN_1798804 1 5870 RAB6A ILMN_1800871 1 81610 C20orf129 ILMN_1781943 1 57380 MRS2L ILMN_1778677 1 3066 HDAC2 ILMN_1767747 1 2618 GART ILMN_1679476 1 25852 ARMC8 ILMN_1781151 1 64793 CCDC21 ILMN_1812489 1 23279 NUP160 ILMN_1652989 1 6632 SNRPD1 ILMN_1768393 -1 10972 TMED10 ILMN_1736585 -1 8450 CUL4B ILMN_1691535 1 9133 CCNB2 ILMN_1801939 1 7159 TP53BP2 ILMN_1779706 1 6434 SFRS10 ILMN_1742798 1 151636 DTX3L ILMN_1784380 -1 4094 MAF ILMN_1719543 1 151188 ARL6IP6 ILMN_1797964 -1 4629 MYH11 ILMN_1660086 1 5873 RAB27A ILMN_1665859 1 2999 GZMH ILMN_1731233 -1 8681 PLA2G4B ILMN_1697629 1 5111 PCNA ILMN_1694177 1 5359 PLSCR1 ILMN_1752889 1 79694 MANEA ILMN_1757026 1 84955 NUDCD1 ILMN_1678745 1 10606 PAICS ILMN_1773760 1 4259 MGST3 ILMN_1751956 -1 51028 VPS36 ILMN_1802519 -1 4038 LRP4 ILMN_1675268 1 64844 Mar-07 ILMN_1717337 -1 200734 SPRED2 ILMN_1791232 1 10541 ANP32B ILMN_1684293 1 92342 C1orf156 ILMN_1734915 1 64789 C1orf176 ILMN_1783996 1 6397 SEC14L1 ILMN_1732575 -1 11257 TP53AP1 ILMN_1658469 -1 9044 BTAF1 ILMN_1791536 1 9232 PTTG1 ILMN_1753196 -1 7284 TUFM ILMN_1738369 1 10951 CBX1 ILMN_1770244 1 54845 RBM35A ILMN_1749180 1 3192 HNRNPU ILMN_1718571 -1 54838 C10orf26 ILMN_1658830 -1 1848 DUSP6 ILMN_1677466 1 10963 STIP1 ILMN_1745906 1 6772 STAT1 ILMN_1690105 1 387103 C6orf173 ILMN_1763907 1 6426 SFRS1 ILMN_1795341 -1 2767 GNA11 ILMN_1739781 -1 9897 KIAA0196 ILMN_1728676 1 3608 ILF2 ILMN_1745172 -1 25794 FSCN2 ILMN_1795472 1 9928 KIF14 ILMN_1808071 1 6941 TCF19 ILMN_1682008 1 29028 ATAD2 ILMN_1763064 1 3833 KIFC1 ILMN_1764840 -1 89122 TRIM4 ILMN_1792265 1 219285 SAMD9L ILMN_1748256 1 699 BUB1 ILMN_1736090 -1 8576 STK16 ILMN_1803774 1 8532 CPZ ILMN_1766780 1 7936 RDBP ILMN_1765532 1 10589 DRAP1 ILMN_1733048 1 219988 PATL1 ILMN_1680782 -1 374868 ATP9B ILMN_1658684 -1 8848 TSC22D1 ILMN_1692177 -1 10540 DCTN2 ILMN_1662232 -1 3983 ABLIM1 ILMN_1785424 1 5889 RAD51C ILMN_1695386 1 6790 AURKA ILMN_1680955 -1 10975 UQCR ILMN_1745049 1 55827 IQWD1 ILMN_1670000 1 60313 GPBP1L1 ILMN_1662719 -1 55662 HIF1AN ILMN_1681812 -1 54531 MIER2 ILMN_1766159 -1 11329 STK38 ILMN_1799153 1 6619 SNAPC3 ILMN_1803611 1 157313 CDCA2 ILMN_1660654 -1 11337 GABARAP ILMN_1692338 -1 5159 PDGFRB ILMN_1815057 -1 5797 PTPRM ILMN_1744937 1 3796 KIF2A ILMN_1734476 1 9493 KIF23 ILMN_1811472 1 7444 VRK2 ILMN_1750088 1 29979 UBQLN1 ILMN_1688622 1 29127 RACGAP1 ILMN_1702140 -1 80031 SEMA6D ILMN_1814494 1 54014 BRWD1 ILMN_1801866 1 79894 ZNF672 ILMN_1669094 1 9582 APOBEC3B ILMN_1691457 -1 221981 LOC221981 ILMN_1653057 1 4175 MCM6 ILMN_1766634 -1 9252 RPS6KA5 ILMN_1657515 1 51773 RSF1 ILMN_1668834 1 54534 MRPL50 ILMN_1664833 1 79572 ATP13A3 ILMN_1663684 1 54625 PARP14 ILMN_1691731 -1 55101 ATP5SL ILMN_1809027 -1 1311 COMP ILMN_1677636 1 8317 CDC7 ILMN_1741801 -1 10206 TRIM13 ILMN_1674260 1 6596 SMARCA3 ILMN_1673820 Farmer et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id Stroma.1 1 1634 DCN ILMN_1768227 1 1462 VCAN ILMN_1687301 1 1009 CDH11 ILMN_1672611 1 1281 COL3A1 ILMN_1773079 1 2191 FAP ILMN_1741468 1 5176 SERPINF1 ILMN_1685078 1 2200 FBN1 ILMN_1783182 1 5157 PDGFRL ILMN_1680339 1 1513 CTSK ILMN_1758895 1 5654 HTRA1 ILMN_1676563 1 54829 ASPN ILMN_1801583 1 6678 SPARC ILMN_1796734 1 1290 COL5A2 ILMN_1729117 1 4016 LOXL1 ILMN_1734950 1 4313 MMP2 ILMN_1762106 1 10418 SPON1 ILMN_1791890 1 6424 SFRP4 ILMN_1810172 1 9358 ITGBL1 ILMN_1653719 1 800 CALD1 ILMN_1717990 1 51226 COPZ2 ILMN_1667361 1 4237 MFAP2 ILMN_1787981 1 23452 ANGPTL2 ILMN_1772612 1 5328 PLAU ILMN_1656057 1 1278 COL1A2 ILMN_1785272 1 10234 LRRC17 ILMN_1652826 1 114899 C1QTNF3 ILMN_1768925 1 6591 SNAI2 ILMN_1655740 1 5118 PCOLCE ILMN_1707070 1 10631 POSTN ILMN_1790761 1 1842 ECM2 ILMN_1746763 1 2192 FBLN1 ILMN_1700541 1 8038 ADAM12 ILMN_1705689 1 4320 MMP11 ILMN_1749226 1 165 AEBP1 ILMN_1736178 1 5159 PDGFRB ILMN_1815057 1 2619 GAS1 ILMN_1772910 1 1293 COL6A3 ILMN_1706643 1 5919 RARRES2 ILMN_1811873 1 1291 COL6A1 ILMN_1732151 1 715 C1R ILMN_1677198 1 4692 NDN ILMN_1730845 1 7043 TGFB3 ILMN_1687652 1 4035 LRP1 ILMN_1669772 1 1300 COL10A1 ILMN_1672776 1 1809 DPYSL3 ILMN_1679262 1 25903 OLFML2B ILMN_1765557 1 4323 MMP14 ILMN_1774739 1 51339 DACT1 ILMN_1798984 1 54587 MXRA8 ILMN_1809868 1 7058 THBS2 ILMN_1678842 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id CASP3 1 836 CASP3 ILMN_1756787 1 10393 ANAPC10 ILMN_1770378 1 7738 ZNF184 ILMN_1678431 -1 3728 JUP ILMN_1733811 -1 8237 USP11 ILMN_1664537 -1 402 ARL2 ILMN_1787879 1 25978 CHMP2B ILMN_1683698 -1 6301 SARS ILMN_1706949 -1 55361 PI4K2A ILMN_1750549 -1 5977 DPF2 ILMN_1734317 Bild et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id RAS -1 19 ABCA1 ILMN_1766054 1 101 ADAM8 ILMN_1708348 -1 11096 ADAMTS5 ILMN_1671747 1 154 ADRB2 ILMN_1695590 1 51129 ANGPTL4 ILMN_1707727 1 384 ARG2 ILMN_1800898 -1 23229 ARHGEF9 ILMN_1690634 1 56938 ARNTL2 ILMN_1798064 1 490 ATP2B1 ILMN_1813399 1 84002 B3GNT5 ILMN_1702609 1 11332 ACOT7 ILMN_1740265 -1 604 BCL6 ILMN_1737314 1 7851 MALL ILMN_1754766 1 650 BMP2 ILMN_1722718 1 55612 C20orf42 ILMN_1696585 1 135398 C6orf141 ILMN_1761762 1 10221 TRIB1 ILMN_1767754 1 805 CALM2 ILMN_1687858 1 813 CALU ILMN_1727194 -1 835 CASP2 ILMN_1736568 1 6364 CCL20 ILMN_1657234 1 8900 CCNA1 ILMN_1726415 1 64866 CDCP1 ILMN_1724941 1 23529 CLCF1 ILMN_1661197 -1 85301 COL27A1 ILMN_1788377 1 1316 KLF6 ILMN_1702995 1 1453 CSNK1D ILMN_1737198 1 1454 CSNK1E ILMN_1724363 1 84951 TNS4 ILMN_1716370 1 2919 CXCL1 ILMN_1787897 1 2920 CXCL2 ILMN_1682636 1 2921 CXCL3 ILMN_1709350 -1 1545 CYP1B1 ILMN_1693338 1 1594 CYP27B1 ILMN_1740418 -1 120227 CYP2R1 ILMN_1762498 1 1604 CD55 ILMN_1800540 -1 10521 DDX17 ILMN_1724114 1 8061 FOSL1 ILMN_1771841 -1 54441 STAG3L1 ILMN_1667315 -1 28514 DLL1 ILMN_1743373 1 1743 DLST ILMN_1773228 1 1839 HBEGF ILMN_1756777 1 1843 DUSP1 ILMN_1781285 1 1846 DUSP4 ILMN_1734387 1 1847 DUSP5 ILMN_1656501 1 1848 DUSP6 ILMN_1677466 1 9170 EDG4 ILMN_1662741 1 1947 EFNB1 ILMN_1654563 1 1958 EGR1 ILMN_1762899 1 10938 EHD1 ILMN_1651832 1 1969 EPHA2 ILMN_1700527 1 9592 IER2 ILMN_1700584 -1 26268 FBXO9 ILMN_1702928 -1 2263 FGFR2 ILMN_1682270 1 55700 RPRC1 ILMN_1733348 -1 65979 PHACTR4 ILMN_1736548 -1 79977 GRHL2 ILMN_1748424 1 79993 ELOVL7 ILMN_1740213 1 201799 TMEM154 ILMN_1683494 -1 121227 LRIG3 ILMN_1699808 -1 160418 TMTC3 ILMN_1732566 1 2317 FLNB ILMN_1752635 1 23767 FLRT3 ILMN_1805665 -1 2335 FN1 ILMN_1778237 1 2353 FOS ILMN_1669523 1 94234 FOXQ1 ILMN_1669046 1 50486 G0S2 ILMN_1691846 -1 2619 GAS1 ILMN_1772910 1 2707 GJB3 ILMN_1652390 1 2709 GJB5 ILMN_1735365 1 2710 GK ILMN_1725471 -1 113263 GLCCI1 ILMN_1781431 1 51228 GLTP ILMN_1768094 1 54676 GTPBP2 ILMN_1694475 1 9982 FGFBP1 ILMN_1785404 -1 3008 HIST1H1E ILMN_1746435 1 3099 HK2 ILMN_1723486 -1 9324 HMGN3 ILMN_1731984 -1 3223 HOXC6 ILMN_1794492 1 10855 HPSE ILMN_1779547 1 3265 HRAS ILMN_1773751 1 8870 IER3 ILMN_1682717 1 3589 IL11 ILMN_1788107 1 3598 IL13RA2 ILMN_1688722 1 3553 IL1B ILMN_1775501 1 3576 IL8 ILMN_1666733 1 3628 INPP1 ILMN_1667239 1 50640 PNPLA8 ILMN_1680223 -1 153572 IRX2 ILMN_1782412 1 3673 ITGA2 ILMN_1665792 1 3710 ITPR3 ILMN_1815500 1 3775 KCNK1 ILMN_1718863 1 3783 KCNN4 ILMN_1726320 1 9938 ARHGAP25 ILMN_1777998 -1 9847 KIAA0528 ILMN_1682572 -1 57507 ZNF608 ILMN_1712798 1 85450 ITPRIP ILMN_1805192 1 688 KLF5 ILMN_1770293 1 26092 TOR1AIP1 ILMN_1729318 1 3949 LDLR ILMN_1651611 -1 3964 LGALS8 ILMN_1664402 1 10184 LHFPL2 ILMN_1811077 1 3976 LIF ILMN_1780599 1 119548 PNLIPRP3 ILMN_1678655 1 120224 TMEM45B ILMN_1771120 1 129642 OACT2 ILMN_1777853 1 11234 HPS5 ILMN_1655312 -1 163782 ANKRD38 ILMN_1776936 1 7804 LRP8 ILMN_1677765 -1 4067 LYN ILMN_1781155 1 4084 MXD1 ILMN_1701957 1 64332 NFKBIZ ILMN_1719695 1 81631 MAP1LC3B ILMN_1703244 1 4170 MCL1 ILMN_1710028 1 4237 MFAP2 ILMN_1787981 1 84803 AGPAT9 ILMN_1794875 -1 10793 ZNF273 ILMN_1775073 1 84985 FAM83A ILMN_1796479 -1 115572 FAM46B ILMN_1808011 -1 78996 C7orf49 ILMN_1740903 -1 58508 MLL3 ILMN_1736165 1 4323 MMP14 ILMN_1774739 -1 57509 MTUS1 ILMN_1663648 1 4615 MYD88 ILMN_1738523 1 89795 NAV3 ILMN_1714600 1 10397 NDRG1 ILMN_1809931 -1 4781 NFIB ILMN_1778991 1 9221 NOLC1 ILMN_1800224 1 4907 NT5E ILMN_1697220 1 4953 ODC1 ILMN_1748591 1 9943 OXSR1 ILMN_1811489 1 10135 PBEF1 ILMN_1653871 1 22822 PHLDA1 ILMN_1687978 1 7262 PHLDA2 ILMN_1671557 1 5266 PI3 ILMN_1693192 -1 8554 PIAS1 ILMN_1780598 1 5293 PIK3CD ILMN_1766275 1 5292 PIM1 ILMN_1809933 1 9518 GDF15 ILMN_1763658 1 5329 PLAUR ILMN_1691508 1 5362 PLXNA2 ILMN_1680617 -1 5383 PMS2L5 ILMN_1759901 1 10687 PNMA2 ILMN_1790778 1 5473 PPBP ILMN_1767281 1 10105 PPIF ILMN_1809607 1 23645 PPP1R15A ILMN_1659936 1 5621 PRNP ILMN_1737988 1 5743 PTGS2 ILMN_1677511 1 5744 PTHLH ILMN_1785699 1 5791 PTPRE ILMN_1734543 1 5806 PTX3 ILMN_1692719 1 5817 PVR ILMN_1677305 1 65059 RAPH1 ILMN_1783846 1 9136 RRP9 ILMN_1795758 -1 861 RUNX1 ILMN_1801504 1 6382 SDC1 ILMN_1815308 1 6385 SDC4 ILMN_1666181 1 10509 SEMA4B ILMN_1672589 1 54910 SEMA4C ILMN_1728432 1 1992 SERPINB1 ILMN_1679133 1 5055 SERPINB2 ILMN_1752993 1 5268 SERPINB5 ILMN_1793888 1 83667 SESN2 ILMN_1751598 1 2810 SFN ILMN_1806607 -1 6502 SKP2 ILMN_1665538 1 9123 SLC16A3 ILMN_1808982 1 6574 SLC20A1 ILMN_1672662 1 6515 SLC2A3 ILMN_1775708 1 6548 SLC9A1 ILMN_1800425 1 6525 SMTN ILMN_1785618 1 8651 SOCS1 ILMN_1774733 1 81848 SPRY4 ILMN_1741168 -1 23524 SRRM2 ILMN_1764460 -1 6764 ST5 ILMN_1773470 1 6804 STX1A ILMN_1791371 1 6926 TBX3 ILMN_1713449 1 7980 TFPI2 ILMN_1667630 1 7039 TGFA ILMN_1805175 -1 7042 TGFB2 ILMN_1812526 1 7076 TIMP1 ILMN_1711566 1 8797 TNFRSF10A ILMN_1721316 1 8795 TNFRSF10B ILMN_1699265 1 51330 TNFRSF12A ILMN_1689004 -1 27327 TNRC6A ILMN_1714622 1 7150 TOP1 ILMN_1735572 -1 10346 TRIM22 ILMN_1779252 1 8848 TSC22D1 ILMN_1692177 -1 123016 TTC8 ILMN_1652309 1 7277 TUBA4A ILMN_1784300 1 6675 UAP1 ILMN_1742461 1 7378 UPP1 ILMN_1798256 -1 57216 VANGL2 ILMN_1715647 1 7422 VEGFA ILMN_1803882 -1 81857 MED25 ILMN_1811823 1 79413 ZBED2 ILMN_1688392 1 7538 ZFP36 ILMN_1720829 -1 7745 ZNF192 ILMN_1811755 1 84879 MFSD2 ILMN_1798284 1 201176 ARHGAP27 ILMN_1734652 1 9208 LRRFIP1 ILMN_1803814 1 56005 C19orf10 ILMN_1787844 -1 23112 TNRC6B ILMN_1726786 -1 1303 COL12A1 ILMN_1733756 -1 2043 EPHA4 ILMN_1672022 Carter et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id CIN70 1 22974 TPX2 ILMN_1792494 1 9055 PRC1 ILMN_1728934 1 2305 FOXM1 ILMN_1716400 1 983 CDC2 ILMN_1747911 1 60436 TGIF2 ILMN_1709044 1 55969 C20orf24 ILMN_1679195 1 4171 MCM2 ILMN_1681503 1 3015 H2AFZ ILMN_1707858 1 7153 TOP2A ILMN_1686097 1 5111 PCNA ILMN_1694177 1 11065 UBE2C ILMN_1714730 1 9833 MELK ILMN_1731184 1 9319 TRIP13 ILMN_1796589 1 9918 NCAPD2 ILMN_1775008 1 4176 MCM7 ILMN_1663195 1 10535 RNASEH2A ILMN_1810901 1 10635 RAD51AP1 ILMN_1670353 1 10112 KIF20A ILMN_1695658 1 8318 CDC45L ILMN_1808347 1 4085 MAD2L1 ILMN_1777564 1 9700 ESPL1 ILMN_1742145 1 9133 CCNB2 ILMN_1801939 1 2237 FEN1 ILMN_1755834 1 7272 TTK ILMN_1788166 1 22948 CCT5 ILMN_1706246 1 5984 RFC4 ILMN_1724489 1 29028 ATAD2 ILMN_1763064 1 9793 CKAP5 ILMN_1748770 1 23165 NUP205 ILMN_1673962 1 991 CDC20 ILMN_1663390 1 1164 CKS2 ILMN_1756326 1 6241 RRM2 ILMN_1678669 1 1994 ELAVL1 ILMN_1685816 1 891 CCNB1 ILMN_1712803 1 6240 RRM1 ILMN_1771593 1 9212 AURKB ILMN_1684217 1 2956 MSH6 ILMN_1729051 1 2146 EZH2 ILMN_1708105 1 1503 CTPS ILMN_1783285 1 1736 DKC1 ILMN_1671257 1 11339 OIP5 ILMN_1759277 1 55143 CDCA8 ILMN_1709294 1 9232 PTTG1 ILMN_1753196 1 55165 CEP55 ILMN_1747016 1 3014 H2AFX ILMN_1785756 1 55907 CMAS ILMN_1714082 1 23397 BRRN1 ILMN_1657600 1 55388 MCM10 ILMN_1706194 1 25804 LSM4 ILMN_1788099 1 55723 ASF1B ILMN_1695414 1 11130 ZWINT ILMN_1778034 1 55872 PBK ILMN_1673673 1 55055 ZWILCH ILMN_1700378 1 83461 CDCA3 ILMN_1737728 1 1894 ECT2 ILMN_1719307 1 990 CDC6 ILMN_1785914 1 7374 UNG ILMN_1683120 1 23788 MTCH2 ILMN_1785218 1 5885 RAD21 ILMN_1748578 1 86 ACTL6A ILMN_1749297 1 2821 GPI ILMN_1654465 1 84306 PDCD2L ILMN_1706149 1 6427 SFRS2 ILMN_1696407 1 3068 HDGF ILMN_1765621 1 29107 NXT1 ILMN_1760280 1 4751 NEK2 ILMN_1653822 1 1717 DHCR7 ILMN_1654028 1 6790 AURKA ILMN_1680955 1 4706 NDUFAB1 ILMN_1755521 1 23306 TMEM194 ILMN_1725880 1 24137 KIF4A ILMN_1799667 Teschendorff et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id Immune.1 1 608 TNFRSF17 ILMN_1768016 1 712 C1QA ILMN_1657181 1 3134 HLA-F ILMN_1762861 1 4063 LY9 ILMN_1725682 -1 6696 SPP1 ILMN_1651354 1 6846 XCL2 ILMN_1666257 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id AURKA 1 6790 AURKA ILMN_1680955 1 11065 UBE2C ILMN_1714730 1 9133 CCNB2 ILMN_1801939 1 1058 CENPA ILMN_1801257 1 332 BIRC5 ILMN_1710082 1 11004 KIF2C ILMN_1685916 1 10112 KIF20A ILMN_1695658 1 991 CDC20 ILMN_1663390 1 2305 FOXM1 ILMN_1716400 1 891 CCNB1 ILMN_1712803 1 22974 TPX2 ILMN_1792494 1 9088 PKMYT1 ILMN_1766658 1 54478 FAM64A ILMN_1728972 1 4751 NEK2 ILMN_1653822 1 24137 KIF4A ILMN_1799667 1 23397 BRRN1 ILMN_1657600 1 9319 TRIP13 ILMN_1796589 1 4085 MAD2L1 ILMN_1777564 1 9156 EXO1 ILMN_1673721 1 10615 SPAG5 ILMN_1768291 1 7083 TK1 ILMN_1806037 1 6491 STIL ILMN_1807232 1 6241 RRM2 ILMN_1678669 1 55839 CENPN ILMN_1720526 1 7298 TYMS ILMN_1806040 1 641 BLM ILMN_1709484 1 4171 MCM2 ILMN_1681503 1 1164 CKS2 ILMN_1756326 1 79682 MLF1IP ILMN_1679438 -1 10129 FRY ILMN_1678437 1 51659 GINS2 ILMN_1809590 1 10212 DDX39 ILMN_1747303 1 3925 STMN1 ILMN_1657796 1 79801 SHCBP1 ILMN_1709162 1 3014 H2AFX ILMN_1785756 1 10535 RNASEH2A ILMN_1810901 1 5984 RFC4 ILMN_1724489 -1 55970 GNG12 ILMN_1673380 1 1033 CDKN3 ILMN_1666305 1 55388 MCM10 ILMN_1706194 1 55257 C20orf20 ILMN_1790136 1 1163 CKS1B ILMN_1719256 1 8914 TIMELESS ILMN_1735093 1 54821 ERCC6L ILMN_1790992 -1 23371 TENC1 ILMN_1685042 1 8544 PIR ILMN_1761247 1 8317 CDC7 ILMN_1741801 -1 2331 FMOD ILMN_1789639 1 51512 GTSE1 ILMN_1771039 -1 6424 SFRP4 ILMN_1810172 1 55353 LAPTM4B ILMN_1680196 -1 8404 SPARCL1 ILMN_1795251 1 990 CDC6 ILMN_1785914 -1 7043 TGFB3 ILMN_1687652 1 11047 ADRM1 ILMN_1760143 -1 58190 CTDSP1 ILMN_1728163 -1 79838 TMC5 ILMN_1730117 1 84823 LMNB2 ILMN_1708101 -1 83989 C5orf21 ILMN_1654542 -1 1793 DOCK1 ILMN_1715789 -1 9358 ITGBL1 ILMN_1653719 1 8836 GGH ILMN_1681754 -1 57088 PLSCR4 ILMN_1757338 -1 6642 SNX1 ILMN_1693998 -1 4969 OGN ILMN_1790098 -1 90627 STARD13 ILMN_1660451 1 11260 XPOT ILMN_1743711 1 22827 PUF60 ILMN_1779404 1 9793 CKAP5 ILMN_1748770 -1 2791 GNG11 ILMN_1782419 1 55247 NEIL3 ILMN_1757697 -1 10234 LRRC17 ILMN_1652826 -1 9353 SLIT2 ILMN_1676449 1 1841 DTYMK ILMN_1716445 1 9631 NUP155 ILMN_1768293 1 5424 POLD1 ILMN_1652580 1 6631 SNRPC ILMN_1741997 -1 10186 LHFP ILMN_1696627 1 4521 NUDT1 ILMN_1735692 -1 3479 IGF1 ILMN_1709613 1 4172 MCM3 ILMN_1806818 -1 2205 FCER1A ILMN_1710386 1 55732 C1orf112 ILMN_1727540 -1 9077 DIRAS3 ILMN_1688877 1 5557 PRIM1 ILMN_1694502 1 54963 UCKL1 ILMN_1800463 1 54512 EXOSC4 ILMN_1745271 -1 79901 CYBRD1 ILMN_1712305 -1 10161 P2RY5 ILMN_1786429 1 29097 CNIH4 ILMN_1714759 1 6513 SLC2A1 ILMN_1809256 1 51123 ZNF706 ILMN_1702384 -1 857 CAV1 ILMN_1687583 1 51110 LACTB2 ILMN_1660635 1 51204 CCDC44 ILMN_1685112 1 54845 RBM35A ILMN_1749180 -1 283 ANG ILMN_1760727 -1 79652 C16orf30 ILMN_1751559 -1 56944 OLFML3 ILMN_1727532 1 3297 HSF1 ILMN_1665621 1 27235 COQ2 ILMN_1756572 -1 2487 FRZB ILMN_1716246 1 3251 HPRT1 ILMN_1736940 1 5119 PCOLN3 ILMN_1709439 1 6839 SUV39H1 ILMN_1781479 -1 27303 RBMS3 ILMN_1665040 -1 10468 FST ILMN_1700081 -1 26289 AK5 ILMN_1690676 1 55038 CDCA4 ILMN_1684045 1 7283 TUBG1 ILMN_1695731 1 23212 RRS1 ILMN_1767658 1 65094 JMJD4 ILMN_1692896 1 55379 LRRC59 ILMN_1786259 -1 10956 OS9 ILMN_1674254 1 51022 GLRX2 ILMN_1680727 1 54915 YTHDF1 ILMN_1753885 -1 54861 SNRK ILMN_1794399 1 79000 C1orf135 ILMN_1787280 -1 79776 ZFHX4 ILMN_1657606 -1 79971 GPR177 ILMN_1671260 1 7718 ZNF165 ILMN_1806502 1 201254 STRA13 ILMN_1769634 -1 1848 DUSP6 ILMN_1677466 -1 9037 SEMA5A ILMN_1656927 1 5433 POLR2D ILMN_1792672 -1 29087 THYN1 ILMN_1781408 -1 79864 C11orf63 ILMN_1680659 -1 358 AQP1 ILMN_1815081 1 6634 SNRPD3 ILMN_1794599 -1 2621 GAS6 ILMN_1779558 1 56270 WDR45L ILMN_1719140 -1 5187 PER1 ILMN_1653125 -1 2098 ESD ILMN_1720285 1 81887 LAS1L ILMN_1774890 -1 1811 SLC26A3 ILMN_1760087 1 54535 CCHCR1 ILMN_1674051 1 55526 DHTKD1 ILMN_1664369 -1 57161 PELI2 ILMN_1780132 -1 2353 FOS ILMN_1669523 -1 51279 C1RL ILMN_1733288 1 60436 TGIF2 ILMN_1709044 1 3028 HADH2 ILMN_1758275 1 26519 TIMM10 ILMN_1765332 -1 25960 GPR124 ILMN_1773059 -1 10252 SPRY1 ILMN_1651610 1 6199 RPS6KB2 ILMN_1761175 1 55630 SLC39A4 ILMN_1706386 -1 7049 TGFBR3 ILMN_1784287 1 8607 RUVBL1 ILMN_1693108 -1 2581 GALC ILMN_1799744 -1 862 RUNX1T1 ILMN_1812795 1 8458 TTF2 ILMN_1810228 1 9775 EIF4A3 ILMN_1667043 1 3181 HNRPA2B1 ILMN_1796491 1 26039 SS18L1 ILMN_1676625 -1 10580 SORBS1 ILMN_1749792 -1 7056 THBD ILMN_1759787 -1 8322 FZD4 ILMN_1743367 -1 1003 CDH5 ILMN_1719236 -1 2152 F3 ILMN_1797009 -1 55068 ENOX1 ILMN_1713471 1 64785 GINS3 ILMN_1754272 1 79042 TSEN34 ILMN_1673111 1 8805 TRIM24 ILMN_1798032 1 1478 CSTF2 ILMN_1653129 -1 57125 PLXDC1 ILMN_1652878 -1 22998 LIMCH1 ILMN_1664138 1 79915 C17orf41 ILMN_1686835 -1 7026 NR2F2 ILMN_1745785 -1 7474 WNT5A ILMN_1800317 -1 55857 C20orf19 ILMN_1779536 -1 114625 ERMAP ILMN_1715013 -1 8857 FCGBP ILMN_1718984 -1 26872 STEAP1 ILMN_1663575 1 29844 TFPT ILMN_1709451 1 4719 NDUFS1 ILMN_1728810 -1 4013 VWA5A ILMN_1764769 1 3396 ICT1 ILMN_1734508 -1 397 ARHGDIB ILMN_1678143 1 10436 EMG1 ILMN_1797074 1 51582 AZIN1 ILMN_1656682 1 10598 AHSA1 ILMN_1703617 1 333 APLP1 ILMN_1763834 1 51142 CHCHD2 ILMN_1815124 -1 27123 DKK2 ILMN_1695506 -1 55020 FLJ20699 ILMN_1692464 -1 23460 ABCA6 ILMN_1701011 -1 64321 SOX17 ILMN_1671092 -1 7098 TLR3 ILMN_1689578 1 6338 SCNN1B ILMN_1740917 1 3692 EIF6 ILMN_1787410 -1 10253 SPRY2 ILMN_1760820 -1 2669 GEM ILMN_1678968 -1 79679 VTCN1 ILMN_1753101 -1 79618 HMBOX1 ILMN_1720059 1 8772 FADD ILMN_1758658 1 9986 RCE1 ILMN_1685002 1 58500 ZNF250 ILMN_1757230 -1 11081 KERA ILMN_1732678 1 7064 THOP1 ILMN_1726659 -1 55799 CACNA2D3 ILMN_1754076 -1 49855 SCAPER ILMN_1811178 1 54606 DDX56 ILMN_1679405 1 7164 TPD52L1 ILMN_1714383 1 80775 TMEM177 ILMN_1756402 -1 667 DST ILMN_1703913 1 2781 GNAZ ILMN_1766182 1 23464 GCAT ILMN_1724437 1 79763 ISOC2 ILMN_1769158 -1 4649 MYO9A ILMN_1690614 1 53820 DSCR6 ILMN_1709257 1 3638 INSIG1 ILMN_1793474 1 11171 STRAP ILMN_1731194 1 10992 SF3B2 ILMN_1737807 1 6832 SUPV3L1 ILMN_1765857 1 55922 NKRF ILMN_1707534 1 10557 RPP38 ILMN_1680386 -1 3216 HOXB6 ILMN_1768101 -1 54785 C17orf59 ILMN_1789643 -1 1933 EEF1B2 ILMN_1705714 1 8161 COIL ILMN_1688034 -1 594 BCKDHB ILMN_1764166 1 6286 S100P ILMN_1801216 1 3954 LETM1 ILMN_1710668 1 51087 YBX2 ILMN_1755354 1 10953 TOMM34 ILMN_1721128 Creighton et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id obesity 1 51 ACOX1 ILMN_1750158 1 345 APOC3 ILMN_1722070 1 1016 CDH18 ILMN_1733669 1 1415 CRYBB2 ILMN_1760708 1 1577 CYP3A5 ILMN_1810942 1 1815 DRD4 ILMN_1773348 1 2147 F2 ILMN_1671753 1 2192 FBLN1 ILMN_1700541 1 2918 GRM8 ILMN_1729212 1 3268 HRBL ILMN_1703228 1 3483 IGFALS ILMN_1673488 1 3769 KCNJ13 ILMN_1709847 1 4352 MPL ILMN_1776640 1 4916 NTRK3 ILMN_1687967 1 5224 PGAM2 ILMN_1666889 1 5337 PLD1 ILMN_1719696 1 5723 PSPH ILMN_1776105 1 6362 CCL18 ILMN_1654411 1 6545 SLC7A4 ILMN_1774229 1 6645 SNTB2 ILMN_1786766 1 6654 SOS1 ILMN_1767135 1 6693 SPN ILMN_1801040 1 6716 SRD5A2 ILMN_1788895 1 6902 TBCA ILMN_1726239 1 7104 TM4SF4 ILMN_1792404 1 7184 HSP90B1 ILMN_1686328 1 8876 VNN1 ILMN_1712365 1 8968 HIST1H3F ILMN_1788489 1 9509 ADAMTS2 ILMN_1796628 1 9776 KIAA0652 ILMN_1692306 1 9948 WDR1 ILMN_1675844 1 10435 CDC42EP2 ILMN_1652777 1 10538 BATF ILMN_1668822 1 10741 RBBP9 ILMN_1786050 1 11009 IL24 ILMN_1774685 1 11255 HRH3 ILMN_1694273 1 11338 U2AF2 ILMN_1768930 1 25788 RAD54B ILMN_1722127 1 26150 RIBC2 ILMN_1680349 1 27240 SIT1 ILMN_1788531 1 27309 ZNF330 ILMN_1710873 1 29122 TSP50 ILMN_1775615 1 51512 GTSE1 ILMN_1771039 1 55658 RNF126 ILMN_1669572 1 55764 IFT122 ILMN_1742379 1 63925 ZNF335 ILMN_1758984 1 64097 EPB41L4A ILMN_1775376 1 65080 MRPL44 ILMN_1671452 1 84168 ANTXR1 ILMN_1670379 1 90634 CG018 ILMN_1799487 1 90861 HN1L ILMN_1706118 1 94081 SFXN1 ILMN_1713680 1 201501 APM-1 ILMN_1796737 -1 25 ABL1 ILMN_1713732 -1 148 ADRA1A ILMN_1799019 -1 213 ALB ILMN_1682763 -1 317 APAF1 ILMN_1659463 -1 351 APP ILMN_1678152 -1 394 ARHGAP5 ILMN_1765897 -1 398 ARHGDIG ILMN_1711278 -1 488 ATP2A2 ILMN_1655884 -1 582 BBS1 ILMN_1800590 -1 659 BMPR2 ILMN_1789095 -1 687 KLF9 ILMN_1778523 -1 901 CCNG2 ILMN_1747244 -1 905 CCNT2 ILMN_1722522 -1 1102 RCBTB2 ILMN_1771695 -1 1107 CHD3 ILMN_1740764 -1 1195 CLK1 ILMN_1679727 -1 1203 CLN5 ILMN_1778203 -1 1385 CREB1 ILMN_1700138 -1 1386 ATF2 ILMN_1748271 -1 1387 CREBBP ILMN_1809583 -1 1407 CRY1 ILMN_1760593 -1 1488 CTBP2 ILMN_1691294 -1 1495 CTNNA1 ILMN_1804854 -1 1523 CUTL1 ILMN_1687567 -1 1655 DDX5 ILMN_1805344 -1 1678 TIMM8A ILMN_1722239 -1 1741 DLG3 ILMN_1811515 -1 1778 DYNC1H1 ILMN_1808448 -1 1781 DYNC1I2 ILMN_1773847 -1 1831 TSC22D3 ILMN_1748124 -1 1846 DUSP4 ILMN_1734387 -1 1848 DUSP6 ILMN_1677466 -1 1859 DYRK1A ILMN_1807735 -1 1948 EFNB2 ILMN_1703852 -1 1964 EIF1AX ILMN_1808344 -1 1998 ELF2 ILMN_1691559 -1 2009 EML1 ILMN_1787972 -1 2071 ERCC3 ILMN_1740216 -1 2145 EZH1 ILMN_1791436 -1 2181 ACSL3 ILMN_1666096 -1 2186 FALZ ILMN_1692021 -1 2188 FANCF ILMN_1682724 -1 2264 FGFR4 ILMN_1730355 -1 2309 FOXO3A ILMN_1681703 -1 2487 FRZB ILMN_1716246 -1 2581 GALC ILMN_1799744 -1 2737 GLI3 ILMN_1685871 -1 2776 GNAQ ILMN_1741482 -1 2800 GOLGA1 ILMN_1806301 -1 2820 GPD2 ILMN_1723139 -1 2887 GRB10 ILMN_1669617 -1 3021 H3F3B ILMN_1695706 -1 3030 HADHA ILMN_1712751 -1 3099 HK2 ILMN_1723486 -1 3184 HNRNPD ILMN_1751368 -1 3382 ICA1 ILMN_1694399 -1 3398 ID2 ILMN_1793990 -1 3431 SP110 ILMN_1731418 -1 3551 IKBKB ILMN_1727142 -1 3572 IL6ST ILMN_1797861 -1 3621 ING1 ILMN_1808863 -1 3632 INPP5A ILMN_1735224 -1 3708 ITPR1 ILMN_1789505 -1 3720 JARID2 ILMN_1764177 -1 4026 LPP ILMN_1651254 -1 4087 SMAD2 ILMN_1771203 -1 4130 MAP1A ILMN_1772366 -1 4149 MAX ILMN_1706546 -1 4179 CD46 ILMN_1815689 -1 4205 MEF2A ILMN_1661888 -1 4211 MEIS1 ILMN_1705685 -1 4351 MPI ILMN_1761262 -1 4608 MYBPH ILMN_1705297 -1 4735 Sep-02 ILMN_1740252 -1 4739 NEDD9 ILMN_1758719 -1 4750 NEK1 ILMN_1699459 -1 4752 NEK3 ILMN_1695020 -1 4780 NFE2L2 ILMN_1790909 -1 4781 NFIB ILMN_1778991 -1 4801 NFYB ILMN_1750005 -1 4820 NKTR ILMN_1721621 -1 4850 CNOT4 ILMN_1772677 -1 4854 NOTCH3 ILMN_1755832 -1 4928 NUP98 ILMN_1732776 -1 4929 NR4A2 ILMN_1782305 -1 4999 ORC2L ILMN_1701440 -1 5048 PAFAH1B1 ILMN_1722276 -1 5062 PAK2 ILMN_1676385 -1 5094 PCBP2 ILMN_1724825 -1 5108 PCM1 ILMN_1690487 -1 5204 PFDN5 ILMN_1755536 -1 5213 PFKM ILMN_1708180 -1 5253 PHF2 ILMN_1720476 -1 5289 PIK3C3 ILMN_1687896 -1 5350 PLN ILMN_1785523 -1 5411 PNN ILMN_1721703 -1 5420 PODXL ILMN_1711311 -1 5495 PPM1B ILMN_1734991 -1 5500 PPP1CB ILMN_1736942 -1 5520 PPP2R2A ILMN_1788961 -1 5525 PPP2R5A ILMN_1738784 -1 5527 PPP2R5C ILMN_1789283 -1 5529 PPP2R5E ILMN_1666761 -1 5573 PRKAR1A ILMN_1738632 -1 5635 PRPSAP1 ILMN_1768449 -1 5664 PSEN2 ILMN_1714417 -1 5683 PSMA2 ILMN_1682553 -1 5863 RGL2 ILMN_1759159 -1 5903 RANBP2 ILMN_1654866 -1 5921 RASA1 ILMN_1725312 -1 5925 RB1 ILMN_1696591 -1 5930 RBBP6 ILMN_1665135 -1 5935 RBM3 ILMN_1698213 -1 5936 RBM4 ILMN_1709042 -1 6171 RPL41 ILMN_1710001 -1 6314 ATXN7 ILMN_1688602 -1 6397 SEC14L1 ILMN_1732575 -1 6416 MAP2K4 ILMN_1739534 -1 6418 SET ILMN_1742238 -1 6421 SFPQ ILMN_1769931 -1 6430 SFRS5 ILMN_1761996 -1 6431 SFRS6 ILMN_1697469 -1 6432 SFRS7 ILMN_1778836 -1 6595 SMARCA2 ILMN_1791702 -1 6604 SMARCD3 ILMN_1792521 -1 6642 SNX1 ILMN_1693998 -1 6651 SON ILMN_1703427 -1 6668 SP2 ILMN_1796208 -1 6738 TROVE2 ILMN_1738909 -1 6777 STAT5B ILMN_1777783 -1 6812 STXBP1 ILMN_1728747 -1 6907 TBL1X ILMN_1744795 -1 6938 TCF12 ILMN_1669832 -1 7025 NR2F1 ILMN_1786197 -1 7072 TIA1 ILMN_1712634 -1 7109 TMEM1 ILMN_1778464 -1 7158 TP53BP1 ILMN_1739234 -1 7187 TRAF3 ILMN_1793154 -1 7204 TRIO ILMN_1657521 -1 7216 TRO ILMN_1691648 -1 7267 TTC3 ILMN_1728605 -1 7329 UBE2I ILMN_1810474 -1 7342 UBP1 ILMN_1784410 -1 7403 UTX ILMN_1654488 -1 7433 VIPR1 ILMN_1707959 -1 7503 XIST ILMN_1764573 -1 7507 XPA ILMN_1787591 -1 7559 ZNF12 ILMN_1784577 -1 7561 ZNF14 ILMN_1692145 -1 7639 ZNF85 ILMN_1747824 -1 7644 ZNF91 ILMN_1802053 -1 7694 ZNF135 ILMN_1726368 -1 7702 ZNF143 ILMN_1674399 -1 7716 VEZF1 ILMN_1705310 -1 7727 ZNF174 ILMN_1719202 -1 7728 ZNF175 ILMN_1675788 -1 7733 ZNF180 ILMN_1696319 -1 7743 ZNF189 ILMN_1806809 -1 7750 ZMYM2 ILMN_1661636 -1 7763 ZFAND5 ILMN_1795228 -1 7767 ZNF224 ILMN_1661293 -1 7771 ZNF228 ILMN_1815885 -1 7779 SLC30A1 ILMN_1745021 -1 7840 ALMS1 ILMN_1709155 -1 7874 USP7 ILMN_1729319 -1 8125 ANP32A ILMN_1803500 -1 8289 ARID1A ILMN_1797341 -1 8451 CUL4A ILMN_1695792 -1 8452 CUL3 ILMN_1653670 -1 8467 SMARCA5 ILMN_1713163 -1 8473 OGT ILMN_1697639 -1 8491 MAP4K3 ILMN_1813120 -1 8500 PPFIA1 ILMN_1800164 -1 8502 PKP4 ILMN_1749410 -1 8527 DGKD ILMN_1765326 -1 8554 PIAS1 ILMN_1780598 -1 8604 SLC25A12 ILMN_1788053 -1 8621 CDC2L5 ILMN_1778557 -1 8648 NCOA1 ILMN_1669033 -1 8658 TNKS ILMN_1657891 -1 8725 C19orf2 ILMN_1798728 -1 8777 MPDZ ILMN_1707649 -1 8805 TRIM24 ILMN_1798032 -1 8863 PER3 ILMN_1732519 -1 8864 PER2 ILMN_1738095 -1 8874 ARHGEF7 ILMN_1796912 -1 8880 FUBP1 ILMN_1776552 -1 8888 MCM3AP ILMN_1784766 -1 8897 MTMR3 ILMN_1739641 -1 8899 PRPF4B ILMN_1760281 -1 8925 HERC1 ILMN_1786211 -1 9140 ATG12 ILMN_1673898 -1 9202 ZMYM4 ILMN_1688404 -1 9276 COPB2 ILMN_1684385 -1 9282 CRSP2 ILMN_1739956 -1 9295 SFRS11 ILMN_1657790 -1 9320 TRIP12 ILMN_1720241 -1 9400 RECQL5 ILMN_1697682 -1 9414 TJP2 ILMN_1664978 -1 9439 MED23 ILMN_1690999 -1 9445 ITM2B ILMN_1713733 -1 9451 EIF2AK3 ILMN_1724984 -1 9491 PSMF1 ILMN_1671696 -1 9583 ENTPD4 ILMN_1806304 -1 9611 NCOR1 ILMN_1700473 -1 9617 MTRF1 ILMN_1654918 -1 9637 FEZ2 ILMN_1739586 -1 9649 RALGPS1 ILMN_1674135 -1 9655 SOCS5 ILMN_1785286 -1 9665 LKAP ILMN_1793371 -1 9666 DZIP3 ILMN_1763200 -1 9716 AQR ILMN_1717154 -1 9724 UTP14C ILMN_1686645 -1 9736 USP34 ILMN_1739454 -1 9759 HDAC4 ILMN_1764396 -1 9816 KIAA0133 ILMN_1696556 -1 9830 TRIM14 ILMN_1713542 -1 9849 ZNF518 ILMN_1742541 -1 9851 KIAA0753 ILMN_1680010 -1 9852 EPM2AIP1 ILMN_1682658 -1 9857 CEP350 ILMN_1742400 -1 9874 TLK1 ILMN_1811029 -1 9878 C14orf92 ILMN_1743131 -1 9879 DDX46 ILMN_1727001 -1 9896 FIG4 ILMN_1800889 -1 9906 SLC35E2 ILMN_1651209 -1 9913 SUPT7L ILMN_1801488 -1 9962 SLC23A2 ILMN_1746578 -1 9969 THRAP1 ILMN_1806184 -1 9984 THOC1 ILMN_1802157 -1 9988 DMTF1 ILMN_1750075 -1 10001 MED6 ILMN_1654543 -1 10079 ATP9A ILMN_1799232 -1 10097 ACTR2 ILMN_1697774 -1 10116 FEM1B ILMN_1744239 -1 10129 FRY ILMN_1678437 -1 10137 RBM12 ILMN_1797698 -1 10142 AKAP9 ILMN_1779315 -1 10157 AASS ILMN_1678323 -1 10181 RBM5 ILMN_1786893 -1 10254 STAM2 ILMN_1781135 -1 10280 OPRS1 ILMN_1717925 -1 10284 SAP18 ILMN_1752793 -1 10285 SMNDC1 ILMN_1691789 -1 10299 Mar-06 ILMN_1757106 -1 10314 LANCL1 ILMN_1703697 -1 10324 KBTBD10 ILMN_1690866 -1 10336 PCGF3 ILMN_1803454 -1 10363 HMG20A ILMN_1719006 -1 10384 BTN3A3 ILMN_1733338 -1 10401 PIAS3 ILMN_1675497 -1 10427 SEC24B ILMN_1745469 -1 10443 PFAAP5 ILMN_1797893 -1 10447 FAM3C ILMN_1777261 -1 10512 SEMA3C ILMN_1695475 -1 10513 APPBP2 ILMN_1694875 -1 10520 ZNF211 ILMN_1811195 -1 10602 CDC42EP3 ILMN_1736327 -1 10605 PAIP1 ILMN_1731775 -1 10614 HEXIM1 ILMN_1685115 -1 10628 TXNIP ILMN_1697448 -1 10651 MTX2 ILMN_1794046 -1 10664 CTCF ILMN_1688638 -1 10677 AVIL ILMN_1674265 -1 10724 MGEA5 ILMN_1686750 -1 10765 JARID1B ILMN_1755727 -1 10768 AHCYL1 ILMN_1770412 -1 10781 ZNF266 ILMN_1753782 -1 10892 MALT1 ILMN_1730986 -1 10912 GADD45G ILMN_1651498 -1 10915 TCERG1 ILMN_1706839 -1 10920 COPS8 ILMN_1756065 -1 10949 HNRNPA0 ILMN_1753279 -1 10956 OS9 ILMN_1674254 -1 10983 CCNI ILMN_1691942 -1 10992 SF3B2 ILMN_1737807 -1 11120 BTN2A1 ILMN_1792070 -1 11177 BAZ1A ILMN_1742230 -1 11189 TNRC4 ILMN_1681234 -1 11212 PROSC ILMN_1748908 -1 11215 AKAP11 ILMN_1693220 -1 11325 DDX42 ILMN_1695983 -1 22826 DNAJC8 ILMN_1698258 -1 22828 RBM16 ILMN_1681675 -1 22856 CHSY1 ILMN_1791576 -1 22863 KIAA0831 ILMN_1678808 -1 22868 FASTKD2 ILMN_1728094 -1 22880 MORC2 ILMN_1661111 -1 22884 WDR37 ILMN_1796464 -1 22887 FOXJ3 ILMN_1657188 -1 22902 RUFY3 ILMN_1730931 -1 22906 TRAK1 ILMN_1754629 -1 22908 SACM1L ILMN_1765019 -1 22909 MTMR15 ILMN_1778734 -1 22930 RAB3GAP1 ILMN_1739876 -1 22934 RPIA ILMN_1714809 -1 22936 ELL2 ILMN_1655930 -1 22941 SHANK2 ILMN_1814790 -1 22950 SLC4A1AP ILMN_1750876 -1 22981 NLP ILMN_1789094 -1 22982 DIP2C ILMN_1676062 -1 22990 PCNX ILMN_1740010 -1 22992 FBXL11 ILMN_1668414 -1 23001 WDFY3 ILMN_1697493 -1 23014 FBXO21 ILMN_1745887 -1 23036 ZNF292 ILMN_1714412 -1 23063 KIAA0261 ILMN_1778792 -1 23071 TXNDC4 ILMN_1772156 -1 23080 KIAA0241 ILMN_1722292 -1 23091 KIAA0853 ILMN_1761384 -1 23099 ZBTB43 ILMN_1731113 -1 23113 PARC ILMN_1806010 -1 23116 KIAA0423 ILMN_1778876 -1 23122 CLASP2 ILMN_1770548 -1 23126 POGZ ILMN_1652929 -1 23171 GPD1L ILMN_1694106 -1 23174 ZCCHC14 ILMN_1743456 -1 23185 LARP5 ILMN_1766222 -1 23190 UBXD2 ILMN_1781097 -1 23196 FAM120A ILMN_1721089 -1 23198 PSME4 ILMN_1763540 -1 23219 FBXO28 ILMN_1812776 -1 23230 VPS13A ILMN_1800721 -1 23232 TBC1D12 ILMN_1743324 -1 23244 PDS5A ILMN_1701069 -1 23253 ANKRD12 ILMN_1661833 -1 23262 HISPPD1 ILMN_1785520 -1 23270 TSPYL4 ILMN_1715821 -1 23283 CSTF2T ILMN_1807515 -1 23294 ANKS1A ILMN_1813669 -1 23300 ATMIN ILMN_1772540 -1 23303 KIF13B ILMN_1686562 -1 23304 UBR2 ILMN_1663489 -1 23326 USP22 ILMN_1666609 -1 23327 NEDD4L ILMN_1733627 -1 23332 CLASP1 ILMN_1700507 -1 23341 DNAJC16 ILMN_1717078 -1 23347 SMCHD1 ILMN_1808148 -1 23348 DOCK9 ILMN_1780732 -1 23358 USP24 ILMN_1684594 -1 23360 FNBP4 ILMN_1750911 -1 23365 ARHGEF12 ILMN_1810712 -1 23369 PUM2 ILMN_1722345 -1 23398 PPWD1 ILMN_1776726 -1 23405 DICER1 ILMN_1772692 -1 23435 TARDBP ILMN_1677532 -1 23451 SF3B1 ILMN_1813603 -1 23462 HEY1 ILMN_1788203 -1 23484 LEPROTL1 ILMN_1752591 -1 23499 MACF1 ILMN_1807808 -1 23509 POFUT1 ILMN_1776076 -1 23522 MYST4 ILMN_1698441 -1 23543 RBM9 ILMN_1745130 -1 23585 TMEM50A ILMN_1745368 -1 23592 LEMD3 ILMN_1727361 -1 23598 PATZ1 ILMN_1759297 -1 23637 RABGAP1 ILMN_1724438 -1 23741 EID1 ILMN_1775269 -1 23774 BRD1 ILMN_1730019 -1 24149 ZNF318 ILMN_1792305 -1 25836 NIPBL ILMN_1759062 -1 25896 INTS7 ILMN_1718354 -1 25924 MYRIP ILMN_1668125 -1 25949 SYF2 ILMN_1660186 -1 25957 C6orf111 ILMN_1742099 -1 26018 LRIG1 ILMN_1707342 -1 26035 GLCE ILMN_1714349 -1 26040 SETBP1 ILMN_1720513 -1 26054 SENP6 ILMN_1761731 -1 26058 TNRC15 ILMN_1750718 -1 26190 FBXW2 ILMN_1661479 -1 26273 FBXO3 ILMN_1749641 -1 26504 CNNM4 ILMN_1655720 -1 26747 NUFIP1 ILMN_1813800 -1 26960 NBEA ILMN_1705346 -1 26993 AKAP8L ILMN_1768962 -1 27072 VPS41 ILMN_1768486 -1 27241 BBS9 ILMN_1794956 -1 27244 SESN1 ILMN_1800626 -1 27332 ZNF638 ILMN_1791379 -1 27342 RABGEF1 ILMN_1760884 -1 28981 IFT81 ILMN_1655504 -1 29066 ZC3H7A ILMN_1693227 -1 29072 HYPB ILMN_1769473 -1 29079 MED4 ILMN_1664641 -1 29994 BAZ2B ILMN_1720850 -1 50717 WDR42A ILMN_1717905 -1 50853 VILL ILMN_1778650 -1 51111 SUV420H1 ILMN_1692026 -1 51112 TTC15 ILMN_1693317 -1 51143 DYNC1LI1 ILMN_1703844 -1 51276 ZNF571 ILMN_1706709 -1 51306 C5orf5 ILMN_1673478 -1 51315 KRCC1 ILMN_1745620 -1 51447 IHPK2 ILMN_1683328 -1 51542 VPS54 ILMN_1761086 -1 51552 RAB14 ILMN_1735765 -1 51592 TRIM33 ILMN_1682316 -1 51594 NAG ILMN_1686392 -1 51603 KIAA0859 ILMN_1790575 -1 51616 TAF9L ILMN_1784880 -1 51626 DYNC2LI1 ILMN_1811836 -1 51631 LUC7L2 ILMN_1747099 -1 51646 YPEL5 ILMN_1711069 -1 51652 VPS24 ILMN_1683827 -1 51742 ARID4B ILMN_1761334 -1 51780 JMJD1B ILMN_1706539 -1 51809 GALNT7 ILMN_1670748 -1 53340 SPA17 ILMN_1678423 -1 54103 LOC54103 ILMN_1772064 -1 54468 FLJ20323 ILMN_1680644 -1 54482 CCDC76 ILMN_1659786 -1 54520 FLJ10996 ILMN_1800392 -1 54529 ASNSD1 ILMN_1722873 -1 54530 C1orf218 ILMN_1789436 -1 54556 ING3 ILMN_1806226 -1 54585 LZTFL1 ILMN_1815705 -1 54665 RSBN1 ILMN_1791097 -1 54741 LEPROT ILMN_1661537 -1 54778 RNF111 ILMN_1767454 -1 54780 NSMCE4A ILMN_1679134 -1 54816 ZNF280D ILMN_1767142 -1 54819 ZCCHC10 ILMN_1769104 -1 54832 VPS13C ILMN_1809582 -1 54861 SNRK ILMN_1794399 -1 54878 DPP8 ILMN_1759801 -1 54880 BCOR ILMN_1773117 -1 54885 TBC1D8B ILMN_1701604 -1 54902 TTC19 ILMN_1781260 -1 54934 C12orf41 ILMN_1713189 -1 55000 TUG1 ILMN_1682783 -1 55006 FLJ20628 ILMN_1706558 -1 55030 FBXO34 ILMN_1765060 -1 55035 NOL8 ILMN_1689747 -1 55037 PTCD3 ILMN_1714424 -1 55082 FLJ10154 ILMN_1788468 -1 55112 WDR60 ILMN_1793290 -1 55119 PRPF38B ILMN_1799299 -1 55125 CEP192 ILMN_1703754 -1 55187 VPS13D ILMN_1656840 -1 55198 DIP13B ILMN_1765076 -1 55251 PCMTD2 ILMN_1767848 -1 55256 ADI1 ILMN_1795671 -1 55295 KLHL26 ILMN_1805330 -1 55333 SYNJ2BP ILMN_1697793 -1 55425 KIAA1704 ILMN_1749676 -1 55435 C4orf16 ILMN_1758427 -1 55556 ENOSF1 ILMN_1803676 -1 55578 FAM48A ILMN_1669555 -1 55596 ZCCHC8 ILMN_1775793 -1 55614 KIF16B ILMN_1772786 -1 55634 ZNF673 ILMN_1710768 -1 55665 URG4 ILMN_1777811 -1 55683 FLJ10081 ILMN_1663571 -1 55758 RCOR3 ILMN_1682095 -1 55763 EXOC1 ILMN_1793766 -1 55769 ZNF83 ILMN_1716921 -1 55786 ZNF415 ILMN_1664292 -1 55818 JMJD1A ILMN_1722532 -1 55893 ZNF395 ILMN_1772876 -1 55930 MYO5C ILMN_1808789 -1 55937 APOM ILMN_1713438 -1 55958 KLHL9 ILMN_1664466 -1 56255 TXNDC13 ILMN_1702759 -1 56339 METTL3 ILMN_1655635 -1 56890 MDM1 ILMN_1750703 -1 56967 C14orf132 ILMN_1713744 -1 57020 MGC16824 ILMN_1729450 -1 57035 C1orf63 ILMN_1749915 -1 57050 UTP3 ILMN_1745423 -1 57209 ZNF248 ILMN_1662192 -1 57214 KIAA1199 ILMN_1813704 -1 57337 SENP7 ILMN_1778294 -1 57396 CLK4 ILMN_1695853 -1 57496 MKL2 ILMN_1690807 -1 57498 KIDINS220 ILMN_1679232 -1 57509 MTUS1 ILMN_1663648 -1 57556 SEMA6A ILMN_1713529 -1 57599 WDR48 ILMN_1762103 -1 57711 ZNF529 ILMN_1660193 -1 57728 WDR19 ILMN_1655117 -1 57798 GATAD1 ILMN_1710863 -1 58517 RBM25 ILMN_1768117 -1 60625 DHX35 ILMN_1733667 -1 63917 GALNT11 ILMN_1651819 -1 63920 LOC63920 ILMN_1727553 -1 63931 MRPS14 ILMN_1779423 -1 64112 MOAP1 ILMN_1804988 -1 64766 S100PBP ILMN_1663577 -1 64795 RMND5A ILMN_1714093 -1 64844 Mar-07 ILMN_1717337 -1 64848 YTHDC2 ILMN_1725760 -1 64860 ARMCX5 ILMN_1741156 -1 65110 UPF3A ILMN_1671742 -1 65117 RSRC2 ILMN_1724431 -1 65982 ZSCAN18 ILMN_1654946 -1 66008 TRAK2 ILMN_1781691 -1 79048 SECISBP2 ILMN_1736481 -1 79072 FASTKD3 ILMN_1750160 -1 79088 ZNF426 ILMN_1673804 -1 79443 FYCO1 ILMN_1709032 -1 79612 NARG1L ILMN_1801109 -1 79635 CCDC121 ILMN_1739054 -1 79664 NARG2 ILMN_1718830 -1 79673 ZNF329 ILMN_1689059 -1 79684 C11orf61 ILMN_1773148 -1 79726 WDR59 ILMN_1795428 -1 79738 C12orf58 ILMN_1741985 -1 79868 CXorf45 ILMN_1724341 -1 79882 ZC3H14 ILMN_1785292 -1 79960 PHF17 ILMN_1736015 -1 79986 ZNF702 ILMN_1663281 -1 80095 ZNF606 ILMN_1681829 -1 80204 FBXO11 ILMN_1713682 -1 80205 CHD9 ILMN_1762972 -1 80207 OPA3 ILMN_1652819 -1 80208 KIAA1840 ILMN_1665049 -1 80213 TM2D3 ILMN_1761120 -1 80232 WDR26 ILMN_1719343 -1 80345 ZSCAN16 ILMN_1809566 -1 81575 APOLD1 ILMN_1723522 -1 81578 COL21A1 ILMN_1732850 -1 81608 FIP1L1 ILMN_1768743 -1 83759 RBM4B ILMN_1743104 -1 84099 ID2B ILMN_1658904 -1 84162 KIAA1109 ILMN_1694357 -1 84901 NFATC2IP ILMN_1725441 -1 84939 MUM1 ILMN_1764764 -1 91647 ATPAF2 ILMN_1727390 -1 91746 YTHDC1 ILMN_1707506 -1 93643 TJAP1 ILMN_1743763 -1 94104 C21orf66 ILMN_1682896 -1 94134 ARHGAP12 ILMN_1753500 -1 94239 H2AFV ILMN_1706784 -1 114625 ERMAP ILMN_1715013 -1 114882 OSBPL8 ILMN_1782459 -1 116987 CENTG2 ILMN_1807407 -1 120526 ZCSL3 ILMN_1685930 -1 126231 ZNF573 ILMN_1658080 -1 130074 LOC130074 ILMN_1677122 -1 146057 TTBK2 ILMN_1705834 -1 150759 LOC150759 ILMN_1755455 -1 158427 C9orf97 ILMN_1684520 -1 171023 ASXL1 ILMN_1726025 -1 200576 PIP5K3 ILMN_1671108 -1 200734 SPRED2 ILMN_1791232 -1 203197 C9orf91 ILMN_1705313 -1 220988 HNRPA3 ILMN_1761083 -1 221078 NSUN6 ILMN_1664646 -1 221395 GPR116 ILMN_1728785 -1 221443 C6orf130 ILMN_1804834 -1 222161 DKFZP586I1420 ILMN_1803856 -1 246243 RNASEH1 ILMN_1726783 -1 253959 GARNL1 ILMN_1741391 -1 285189 PLGLA1 ILMN_1751811 -1 286451 YIPF6 ILMN_1803939 -1 375056 UNQ6077 ILMN_1672043 -1 388397 LOC388397 ILMN_1678312 -1 388969 LOC388969 ILMN_1679771 -1 440026 TMEM41B ILMN_1678004 -1 644450 LOC644450 ILMN_1715439 -1 651633 LOC651633 ILMN_1739583 Sotiriou et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id GGI 1 3838 KPNA2 ILMN_1708160 1 8140 SLC7A5 ILMN_1720373 1 4141 MARS ILMN_1799819 1 7334 UBE2N ILMN_1793651 1 10212 DDX39 ILMN_1747303 1 4605 MYBL2 ILMN_1709020 1 332 BIRC5 ILMN_1710082 1 4171 MCM2 ILMN_1681503 1 5347 PLK1 ILMN_1736176 1 2305 FOXM1 ILMN_1716400 1 9133 CCNB2 ILMN_1801939 1 27338 UBE2S ILMN_1808591 1 991 CDC20 ILMN_1663390 1 11065 UBE2C ILMN_1714730 1 10535 RNASEH2A ILMN_1810901 1 8914 TIMELESS ILMN_1735093 1 10615 SPAG5 ILMN_1768291 1 983 CDC2 ILMN_1747911 1 4001 LMNB1 ILMN_1672988 1 4085 MAD2L1 ILMN_1777564 1 890 CCNA2 ILMN_1786125 1 9232 PTTG1 ILMN_1753196 1 3149 HMGB3 ILMN_1733519 1 701 BUB1B ILMN_1733950 1 9787 DLG7 ILMN_1749829 1 11130 ZWINT ILMN_1778034 1 9319 TRIP13 ILMN_1796589 1 6790 AURKA ILMN_1680955 1 10403 NDC80 ILMN_1664511 1 1017 CDK2 ILMN_1665559 1 51512 GTSE1 ILMN_1771039 1 3832 KIF11 ILMN_1794539 1 9156 EXO1 ILMN_1673721 1 10024 TROAP ILMN_1700337 1 993 CDC25A ILMN_1711005 1 4521 NUDT1 ILMN_1735692 1 2237 FEN1 ILMN_1755834 1 9700 ESPL1 ILMN_1742145 1 7272 TTK ILMN_1788166 1 9833 MELK ILMN_1731184 1 1058 CENPA ILMN_1801257 1 9134 CCNE2 ILMN_1740452 1 1062 CENPE ILMN_1716279 1 641 BLM ILMN_1709484 1 9928 KIF14 ILMN_1808071 1 3161 HMMR ILMN_1781942 1 1063 CENPF ILMN_1664516 1 22948 CCT5 ILMN_1706246 1 84790 TUBA1C ILMN_1663388 1 11004 KIF2C ILMN_1685916 1 9212 AURKB ILMN_1684217 1 699 BUB1 ILMN_1736090 1 3833 KIFC1 ILMN_1764840 1 1033 CDKN3 ILMN_1666305 1 6241 RRM2 ILMN_1678669 1 22974 TPX2 ILMN_1792494 1 10376 TUBA1B ILMN_1800261 1 4288 MKI67 ILMN_1734827 1 4173 MCM4 ILMN_1771558 1 23397 BRRN1 ILMN_1657600 1 11339 OIP5 ILMN_1759277 1 3015 H2AFZ ILMN_1707858 1 6472 SHMT2 ILMN_1661264 1 8833 GMPS ILMN_1771734 1 891 CCNB1 ILMN_1712803 1 55969 C20orf24 ILMN_1679195 1 9055 PRC1 ILMN_1728934 1 51203 NUSAP1 ILMN_1726720 1 24137 KIF4A ILMN_1799667 1 56942 C16orf61 ILMN_1783333 1 55165 CEP55 ILMN_1747016 1 29095 ORMDL2 ILMN_1774708 1 64151 NCAPG ILMN_1751444 1 55355 DKFZp762E1312 ILMN_1703906 1 10112 KIF20A ILMN_1695658 1 79682 MLF1IP ILMN_1679438 1 79075 DSCC1 ILMN_1776577 1 56992 KIF15 ILMN_1809440 1 10721 POLQ ILMN_1740291 1 55839 CENPN ILMN_1720526 1 259266 ASPM ILMN_1815184 1 55010 C12orf48 ILMN_1727055 1 55388 MCM10 ILMN_1706194 1 83461 CDCA3 ILMN_1737728 1 55143 CDCA8 ILMN_1709294 1 54478 FAM64A ILMN_1728972 1 29980 DONSON ILMN_1758629 1 29127 RACGAP1 ILMN_1702140 -1 10129 FRY ILMN_1678437 -1 8100 TTC10 ILMN_1669366 -1 1524 CX3CR1 ILMN_1745788 -1 90627 STARD13 ILMN_1660451 -1 3913 LAMB2 ILMN_1752968 -1 7178 TPT1 ILMN_1789614 -1 79901 CYBRD1 ILMN_1712305 -1 27244 SESN1 ILMN_1800626 -1 582 BBS1 ILMN_1800590 -1 56912 C11orf60 ILMN_1677080 -1 55650 PIGV ILMN_1762993 -1 79846 FLJ21062 ILMN_1790315 -1 79864 C11orf63 ILMN_1680659 -1 57728 WDR19 ILMN_1655117 -1 54737 MPHOSPH8 ILMN_1759942 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id Stroma.2.PLAU 1 526 ATP6V1B2 ILMN_1787705 1 602 BCL3 ILMN_1662437 1 649 BMP1 ILMN_1800412 1 871 SERPINH1 ILMN_1751028 1 1281 COL3A1 ILMN_1773079 1 1290 COL5A2 ILMN_1729117 1 1291 COL6A1 ILMN_1732151 1 1627 DBN1 ILMN_1769926 1 1774 DNASE1L1 ILMN_1787709 1 1833 EPYC ILMN_1677567 1 2037 EPB41L2 ILMN_1805448 1 2050 EPHB4 ILMN_1734624 1 2191 FAP ILMN_1741468 1 2720 GLB1 ILMN_1790862 1 3671 ISLR ILMN_1747593 1 4205 MEF2A ILMN_1661888 1 4237 MFAP2 ILMN_1787981 1 4314 MMP3 ILMN_1784459 1 4323 MMP14 ILMN_1774739 1 4430 MYO1B ILMN_1797585 1 4681 NBL1 ILMN_1770986 1 4811 NID1 ILMN_1674719 1 4921 DDR2 ILMN_1730553 1 5155 PDGFB ILMN_1775822 1 5159 PDGFRB ILMN_1815057 1 5328 PLAU ILMN_1656057 1 5476 PPGB ILMN_1719286 -1 6141 RPL18 ILMN_1695598 -1 6233 RPS27A ILMN_1755883 1 6591 SNAI2 ILMN_1655740 1 6876 TAGLN ILMN_1778668 1 7042 TGFB2 ILMN_1812526 1 7070 THY1 ILMN_1779875 1 7421 VDR ILMN_1794337 1 8038 ADAM12 ILMN_1705689 1 8408 ULK1 ILMN_1705144 1 8459 TPST2 ILMN_1695432 -1 8481 OFD1 ILMN_1785266 1 8507 ENC1 ILMN_1779147 1 8904 CPNE1 ILMN_1670841 1 9180 OSMR ILMN_1724593 1 9260 PDLIM7 ILMN_1690125 1 9697 TRAM2 ILMN_1788783 -1 9849 ZNF518 ILMN_1742541 1 9945 GFPT2 ILMN_1655236 1 10409 BASP1 ILMN_1651826 1 10487 CAP1 ILMN_1797604 1 10993 SDS ILMN_1811114 1 23166 STAB1 ILMN_1682530 1 23299 BICD2 ILMN_1651375 1 23452 ANGPTL2 ILMN_1772612 1 23645 PPP1R15A ILMN_1659936 1 23705 CADM1 ILMN_1680132 1 25903 OLFML2B ILMN_1765557 1 26585 GREM1 ILMN_1752965 1 27295 PDLIM3 ILMN_1695299 1 51330 TNFRSF12A ILMN_1689004 -1 51463 GPR89A ILMN_1804539 -1 51592 TRIM33 ILMN_1682316 1 54587 MXRA8 ILMN_1809868 1 55033 FKBP14 ILMN_1665243 -1 55035 NOL8 ILMN_1689747 1 55742 PARVA ILMN_1756408 1 57158 JPH2 ILMN_1718941 -1 59286 UBL5 ILMN_1691379 -1 93974 ATPIF1 ILMN_1727332 -1 157567 ANKRD46 ILMN_1712298 Creighton et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id MAPK -1 32 ACACB ILMN_1763852 -1 107 ADCY1 ILMN_1742073 -1 191 AHCY ILMN_1657862 -1 293 SLC25A6 ILMN_1671466 -1 317 APAF1 ILMN_1659463 -1 373 TRIM23 ILMN_1752741 -1 400 ARL1 ILMN_1813091 -1 521 ATP5I ILMN_1803509 -1 587 BCAT2 ILMN_1695110 -1 596 BCL2 ILMN_1801119 -1 617 BCS1L ILMN_1738529 -1 694 BTG1 ILMN_1775743 -1 744 MPPED2 ILMN_1676526 -1 776 CACNA1D ILMN_1681223 -1 839 CASP6 ILMN_1694877 -1 1164 CKS2 ILMN_1756326 -1 1326 MAP3K8 ILMN_1741159 -1 1345 COX6C ILMN_1654151 -1 1373 CPS1 ILMN_1792748 -1 1434 CSE1L ILMN_1706238 -1 1468 SLC25A10 ILMN_1804090 -1 1479 CSTF3 ILMN_1736161 -1 1573 CYP2J2 ILMN_1758731 -1 1789 DNMT3B ILMN_1794692 -1 1952 CELSR2 ILMN_1711208 -1 1960 EGR3 ILMN_1807638 -1 2001 ELF5 ILMN_1813270 -1 2099 ESR1 ILMN_1678535 -1 2122 EVI1 ILMN_1803367 -1 2262 GPC5 ILMN_1688886 -1 2264 FGFR4 ILMN_1730355 -1 2317 FLNB ILMN_1752635 -1 2494 NR5A2 ILMN_1811303 -1 2576 GAGE4 ILMN_1715638 -1 2581 GALC ILMN_1799744 -1 2960 GTF2E1 ILMN_1655921 -1 3321 IGSF3 ILMN_1713014 -1 3358 HTR2C ILMN_1767145 -1 3398 ID2 ILMN_1793990 -1 3643 INSR ILMN_1670918 -1 3646 EIF3S6 ILMN_1739257 -1 3682 ITGAE ILMN_1683927 -1 3705 ITPK1 ILMN_1715674 -1 3800 KIF5C ILMN_1773837 -1 3860 KRT13 ILMN_1721218 -1 4048 LTA4H ILMN_1690342 -1 4092 SMAD7 ILMN_1815941 -1 4171 MCM2 ILMN_1681503 -1 4477 MSMB ILMN_1699243 -1 4528 MTIF2 ILMN_1765520 -1 4602 MYB ILMN_1711894 -1 4661 MYT1 ILMN_1721167 -1 4673 NAP1L1 ILMN_1699208 -1 4685 NCAM2 ILMN_1749962 -1 4702 NDUFA8 ILMN_1759729 -1 4729 NDUFV2 ILMN_1766496 -1 4883 NPR3 ILMN_1665033 -1 4929 NR4A2 ILMN_1782305 -1 5025 P2RX4 ILMN_1813846 -1 5087 PBX1 ILMN_1784678 -1 5096 PCCB ILMN_1761010 -1 5110 PCMT1 ILMN_1671621 -1 5121 PCP4 ILMN_1682326 -1 5174 PDZK1 ILMN_1708341 -1 5191 PEX7 ILMN_1729650 -1 5241 PGR ILMN_1811014 -1 5289 PIK3C3 ILMN_1687896 -1 5298 PI4KB ILMN_1666597 -1 5335 PLCG1 ILMN_1740160 -1 5425 POLD2 ILMN_1746252 -1 5627 PROS1 ILMN_1671928 -1 5710 PSMD4 ILMN_1728355 -1 5885 RAD21 ILMN_1748578 -1 5966 REL ILMN_1766085 -1 5979 RET ILMN_1655610 -1 5981 RFC1 ILMN_1792986 -1 6019 RLN2 ILMN_1748529 -1 6138 RPL15 ILMN_1762747 -1 6141 RPL18 ILMN_1695598 -1 6175 RPLP0 ILMN_1709880 -1 6185 RPN2 ILMN_1693421 -1 6205 RPS11 ILMN_1740587 -1 6227 RPS21 ILMN_1800573 -1 6383 SDC2 ILMN_1784553 -1 6387 CXCL12 ILMN_1791447 -1 6445 SGCG ILMN_1659649 -1 6565 SLC15A2 ILMN_1706040 -1 6605 SMARCE1 ILMN_1747857 -1 6744 SSFA2 ILMN_1742260 -1 6785 ELOVL4 ILMN_1737965 -1 6947 TCN1 ILMN_1768469 -1 7031 TFF1 ILMN_1722489 -1 7074 TIAM1 ILMN_1655577 -1 7155 TOP2B ILMN_1777663 -1 7164 TPD52L1 ILMN_1714383 -1 7263 TST ILMN_1691572 -1 7342 UBP1 ILMN_1784410 -1 7482 WNT2B ILMN_1740269 -1 7869 SEMA3B ILMN_1653501 -1 8187 ZNF239 ILMN_1748427 -1 8270 DXS9879E ILMN_1708151 -1 8604 SLC25A12 ILMN_1788053 -1 8645 KCNK5 ILMN_1766918 -1 8663 EIF3C ILMN_1725984 -1 8723 SNX4 ILMN_1738736 -1 8776 MTMR1 ILMN_1741556 -1 8777 MPDZ ILMN_1707649 -1 8890 EIF2B4 ILMN_1671921 -1 8934 RAB7L1 ILMN_1750202 -1 9045 RPL14 ILMN_1726460 -1 9050 PSTPIP2 ILMN_1713058 -1 9053 MAP7 ILMN_1712719 -1 9063 PIAS2 ILMN_1658302 -1 9125 RQCD1 ILMN_1679415 -1 9289 GPR56 ILMN_1756931 -1 9368 SLC9A3R1 ILMN_1680925 -1 9467 SH3BP5 ILMN_1814773 -1 9656 MDC1 ILMN_1814122 -1 9668 ZNF432 ILMN_1693788 -1 9687 GREB1 ILMN_1721170 -1 9779 TBC1D5 ILMN_1767433 -1 9797 TATDN2 ILMN_1734138 -1 9847 KIAA0528 ILMN_1682572 -1 9931 HELZ ILMN_1762835 -1 10090 UST ILMN_1700024 -1 10125 RASGRP1 ILMN_1768958 -1 10140 TOB1 ILMN_1672004 -1 10247 HRSP12 ILMN_1807633 -1 10273 STUB1 ILMN_1756126 -1 10276 NET1 ILMN_1758311 -1 10295 BCKDK ILMN_1693394 -1 10370 CITED2 ILMN_1663092 -1 10395 DLC1 ILMN_1698020 -1 10497 UNC13B ILMN_1669747 -1 10634 GAS2L1 ILMN_1724059 -1 10675 CSPG5 ILMN_1688184 -1 10732 TCFL5 ILMN_1814247 -1 10758 TRAF3IP2 ILMN_1701514 -1 10856 RUVBL2 ILMN_1708808 -1 10884 MRPS30 ILMN_1726743 -1 10907 TXNL4A ILMN_1790218 -1 10914 PAPOLA ILMN_1798354 -1 10922 FASTK ILMN_1664098 -1 10935 PRDX3 ILMN_1737800 -1 10974 C10orf116 ILMN_1680110 -1 11108 PRDM4 ILMN_1691432 -1 11232 POLG2 ILMN_1671004 -1 11259 DOC1 ILMN_1738578 -1 22828 RBM16 ILMN_1681675 -1 22909 MTMR15 ILMN_1778734 -1 23007 PLCH1 ILMN_1668409 -1 23067 KIAA1076 ILMN_1813573 -1 23080 KIAA0241 ILMN_1722292 -1 23118 MAP3K7IP2 ILMN_1672331 -1 23171 GPD1L ILMN_1694106 -1 23219 FBXO28 ILMN_1812776 -1 23229 ARHGEF9 ILMN_1690634 -1 23244 PDS5A ILMN_1701069 -1 23357 ANGEL1 ILMN_1665871 -1 23394 ADNP ILMN_1657993 -1 23443 SLC35A3 ILMN_1653429 -1 23521 RPL13A ILMN_1713369 -1 23549 DNPEP ILMN_1691393 -1 23563 CHST5 ILMN_1759614 -1 23576 DDAH1 ILMN_1668507 -1 23779 ARHGAP8 ILMN_1656276 -1 25840 METTL7A ILMN_1656285 -1 25926 NOL11 ILMN_1688971 -1 25980 C20orf4 ILMN_1721225 -1 26097 C1orf77 ILMN_1736234 -1 26121 PRPF31 ILMN_1719204 -1 26190 FBXW2 ILMN_1661479 -1 26353 HSPB8 ILMN_1791280 -1 26578 OSTF1 ILMN_1742456 -1 27250 PDCD4 ILMN_1768004 -1 27258 LSM3 ILMN_1719032 -1 28956 MAPBPIP ILMN_1756352 -1 28978 TMEM14A ILMN_1785191 -1 29104 C21orf127 ILMN_1701077 -1 29796 UCRC ILMN_1781986 -1 29902 C12orf24 ILMN_1753781 -1 29964 C6orf49 ILMN_1695868 -1 50865 HEBP1 ILMN_1802557 -1 51074 APIP ILMN_1793598 -1 51098 IFT52 ILMN_1673172 -1 51141 INSIG2 ILMN_1797946 -1 51185 CRBN ILMN_1668582 -1 51433 ANAPC5 ILMN_1723177 -1 51491 HSPC111 ILMN_1704055 -1 51499 TRIAP1 ILMN_1774083 -1 51526 C20orf111 ILMN_1676827 -1 51550 CINP ILMN_1765257 -1 51669 TMEM66 ILMN_1780141 -1 54332 GDAP1 ILMN_1730897 -1 54470 ARMCX6 ILMN_1716026 -1 54665 RSBN1 ILMN_1791097 -1 54788 DNAJB12 ILMN_1758545 -1 54840 APTX ILMN_1726752 -1 55005 RMND1 ILMN_1694533 -1 55010 C12orf48 ILMN_1727055 -1 55061 SUSD4 ILMN_1760533 -1 55081 IFT57 ILMN_1811636 -1 55135 WDR79 ILMN_1693669 -1 55245 C20orf44 ILMN_1745152 -1 55256 ADI1 ILMN_1795671 -1 55347 ABHD10 ILMN_1770031 -1 55508 SLC35E3 ILMN_1749521 -1 55573 CDV3 ILMN_1810977 -1 55661 DDX27 ILMN_1760218 -1 55709 KBTBD4 ILMN_1687092 -1 55726 C12orf11 ILMN_1723222 -1 55734 ZFP64 ILMN_1797801 -1 55764 IFT122 ILMN_1742379 -1 55769 ZNF83 ILMN_1716921 -1 55812 SPATA7 ILMN_1652409 -1 55915 LANCL2 ILMN_1708009 -1 56034 PDGFC ILMN_1683023 -1 56943 ENY2 ILMN_1655536 -1 56994 CHPT1 ILMN_1729112 -1 57007 CMKOR1 ILMN_1798360 -1 57020 MGC16824 ILMN_1729450 -1 57380 MRS2L ILMN_1778677 -1 57473 ZNF512B ILMN_1766346 -1 57613 KIAA1467 ILMN_1668619 -1 60436 TGIF2 ILMN_1709044 -1 60598 KCNK15 ILMN_1788421 -1 64172 OSGEPL1 ILMN_1658909 -1 64400 AKTIP ILMN_1665982 -1 64699 TMPRSS3 ILMN_1741768 -1 64769 C1orf149 ILMN_1714854 -1 64919 BCL11B ILMN_1665761 -1 65055 REEP1 ILMN_1733746 -1 65243 ZNF643 ILMN_1799086 -1 79158 GNPTAB ILMN_1736757 -1 79602 ADIPOR2 ILMN_1750651 -1 79624 C6orf211 ILMN_1798108 -1 79665 DHX40 ILMN_1653047 -1 79695 GALNT12 ILMN_1735157 -1 79833 GEMIN6 ILMN_1707484 -1 79882 ZC3H14 ILMN_1785292 -1 79989 TTC26 ILMN_1676555 -1 80129 C6orf97 ILMN_1772588 -1 80173 IFT74 ILMN_1777449 -1 80303 EFHD1 ILMN_1779448 -1 81550 TDRD3 ILMN_1745811 -1 83752 LONP2 ILMN_1691480 -1 84909 C9orf3 ILMN_1674629 1 87 ACTN1 ILMN_1798892 1 133 ADM ILMN_1708934 1 391 RHOG ILMN_1739792 1 411 ARSB ILMN_1712587 1 444 ASPH ILMN_1693771 1 677 ZFP36L1 ILMN_1675448 1 727 C5 ILMN_1746819 1 824 CAPN2 ILMN_1716057 1 831 CAST ILMN_1672947 1 967 CD63 ILMN_1753468 1 1647 GADD45A ILMN_1694075 1 1728 NQO1 ILMN_1720282 1 1729 DIAPH1 ILMN_1757358 1 1874 E2F4 ILMN_1761828 1 1969 EPHA2 ILMN_1700527 1 1999 ELF3 ILMN_1769201 1 2000 ELF4 ILMN_1652082 1 2034 EPAS1 ILMN_1760034 1 2101 ESRRA ILMN_1774272 1 2118 ETV4 ILMN_1720822 1 2119 ETV5 ILMN_1739222 1 2185 PTK2B ILMN_1815522 1 2280 FKBP1A ILMN_1683969 1 2286 FKBP2 ILMN_1807563 1 2355 FOSL2 ILMN_1725175 1 2495 FTH1 ILMN_1683146 1 2771 GNAI2 ILMN_1775762 1 2810 SFN ILMN_1806607 1 3106 HLA-B ILMN_1703403 1 3107 HLA-C ILMN_1721113 1 3133 HLA-E ILMN_1765258 1 3134 HLA-F ILMN_1762861 1 3135 HLA-G ILMN_1656670 1 3455 IFNAR2 ILMN_1791057 1 3659 IRF1 ILMN_1708375 1 3675 ITGA3 ILMN_1685397 1 3956 LGALS1 ILMN_1723978 1 3959 LGALS3BP ILMN_1654314 1 3988 LIPA ILMN_1718063 1 3992 FADS1 ILMN_1670134 1 3995 FADS3 ILMN_1716847 1 4000 LMNA ILMN_1696749 1 4862 NPAS2 ILMN_1765558 1 5048 PAFAH1B1 ILMN_1722276 1 5152 PDE9A ILMN_1683063 1 5337 PLD1 ILMN_1719696 1 5359 PLSCR1 ILMN_1752889 1 5526 PPP2R5B ILMN_1693975 1 5578 PRKCA ILMN_1771800 1 5583 PRKCH ILMN_1780898 1 5827 PXMP2 ILMN_1799015 1 5836 PYGL ILMN_1696187 1 5937 RBMS1 ILMN_1762568 1 5971 RELB ILMN_1811258 1 6286 S100P ILMN_1801216 1 6303 SAT1 ILMN_1753342 1 6305 SBF1 ILMN_1703246 1 6583 SLC22A4 ILMN_1685057 1 6672 SP100 ILMN_1690920 1 6892 TAPBP ILMN_1742450 1 7126 TNFAIP1 ILMN_1655429 1 7422 VEGFA ILMN_1803882 1 7461 CYLN2 ILMN_1798846 1 7538 ZFP36 ILMN_1720829 1 8507 ENC1 ILMN_1779147 1 8714 ABCC3 ILMN_1677814 1 9138 ARHGEF1 ILMN_1772370 1 9568 GABBR2 ILMN_1660718 1 9582 APOBEC3B ILMN_1691457 1 9961 MVP ILMN_1803277 1 10133 OPTN ILMN_1717586 1 10205 MPZL2 ILMN_1752932 1 10263 CDK2AP2 ILMN_1690653 1 10331 B3GNT3 ILMN_1800082 1 10410 IFITM3 ILMN_1805750 1 10847 SRCAP ILMN_1750641 1 11097 NUPL2 ILMN_1789616 1 11138 TBC1D8 ILMN_1735495 1 11182 SLC2A6 ILMN_1778321 1 22927 HABP4 ILMN_1792384 1 22936 ELL2 ILMN_1655930 1 23102 TBC1D2B ILMN_1751779 1 23529 CLCF1 ILMN_1661197 1 23764 MAFF ILMN_1680139 1 26010 DNAPTP6 ILMN_1683678 1 27242 TNFRSF21 ILMN_1738006 1 29109 FHOD1 ILMN_1651776 1 51097 SCCPDH ILMN_1795839 1 51129 ANGPTL4 ILMN_1707727 1 51400 PPME1 ILMN_1732772 1 51657 STYXL1 ILMN_1718822 1 53838 C11orf24 ILMN_1808163 1 55080 TAPBPL ILMN_1805449 1 55652 FLJ20489 ILMN_1758279 1 55861 C20orf35 ILMN_1730612 1 56288 PARD3 ILMN_1710524 1 56829 ZC3HAV1 ILMN_1729973 1 56935 C11orf75 ILMN_1798270 1 57154 SMURF1 ILMN_1737672 1 60673 C12orf44 ILMN_1772527 1 64063 PRSS22 ILMN_1776925 1 64761 PARP12 ILMN_1718558 1 64787 EPS8L2 ILMN_1691047 1 65983 GRAMD3 ILMN_1734007 1 79094 CHAC1 ILMN_1739241 1 79174 CRELD2 ILMN_1748707 1 79567 FAM65A ILMN_1680037 1 79837 PIP4K2C ILMN_1787308 1 80761 UPK3B ILMN_1803024 1 81848 SPRY4 ILMN_1741168 1 85363 TRIM5 ILMN_1704972 1 93664 CADPS2 ILMN_1684461 1 206358 SLC36A1 ILMN_1787826 Creighton et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id IGF1 1 5104 SERPINA5 ILMN_1759910 1 16 AARS ILMN_1662364 1 6950 TCP1 ILMN_1776347 1 47 ACLY ILMN_1749014 1 81 ACTN4 ILMN_1725534 1 87 ACTN1 ILMN_1798892 1 226 ALDOA ILMN_1736700 1 22906 TRAK1 ILMN_1754629 1 440 ASNS ILMN_1796417 1 444 ASPH ILMN_1693771 1 578 BAK1 ILMN_1805990 1 617 BCS1L ILMN_1738529 1 645 BLVRB ILMN_1797793 1 655 BMP7 ILMN_1741566 1 762 CA4 ILMN_1695157 1 816 CAMK2B ILMN_1694997 1 833 CARS ILMN_1696066 1 896 CCND3 ILMN_1668721 1 955 ENTPD6 ILMN_1677955 1 1026 CDKN1A ILMN_1784602 1 1051 CEBPB ILMN_1693014 1 1054 CEBPG ILMN_1716766 1 1075 CTSC ILMN_1696347 1 1147 CHUK ILMN_1677041 1 1152 CKB ILMN_1671478 1 1175 AP2S1 ILMN_1662426 1 1317 SLC31A1 ILMN_1804562 1 1465 CSRP1 ILMN_1811921 1 1468 SLC25A10 ILMN_1804090 1 1503 CTPS ILMN_1783285 1 1515 CTSL2 ILMN_1748352 1 1534 CYB561 ILMN_1771179 1 1537 CYC1 ILMN_1815115 1 1594 CYP27B1 ILMN_1740418 1 1622 DBI ILMN_1715120 1 1717 DHCR7 ILMN_1654028 1 1743 DLST ILMN_1773228 1 1789 DNMT3B ILMN_1794692 1 1837 DTNA ILMN_1730201 1 1847 DUSP5 ILMN_1656501 1 1848 DUSP6 ILMN_1677466 1 1850 DUSP8 ILMN_1743204 1 1857 DVL3 ILMN_1686411 1 1960 EGR3 ILMN_1807638 1 1965 EIF2S1 ILMN_1739821 1 1978 EIF4EBP1 ILMN_1767324 1 2021 ENDOG ILMN_1722309 1 2030 SLC29A1 ILMN_1723971 1 2055 CLN8 ILMN_1701094 1 2119 ETV5 ILMN_1739222 1 2146 EZH2 ILMN_1708105 1 2161 F12 ILMN_1671766 1 2184 FAH ILMN_1781536 1 2222 FDFT1 ILMN_1741096 1 2224 FDPS ILMN_1804248 1 2274 FHL2 ILMN_1668411 1 2316 FLNA ILMN_1687335 1 2356 FPGS ILMN_1681724 1 2539 G6PD ILMN_1697559 1 2553 GABPB2 ILMN_1761147 1 2582 GALE ILMN_1792168 1 2617 GARS ILMN_1771026 1 2618 GART ILMN_1679476 1 2644 GCHFR ILMN_1694780 1 2810 SFN ILMN_1806607 1 3015 H2AFZ ILMN_1707858 1 3035 HARS ILMN_1763523 1 3145 HMBS ILMN_1726306 1 3157 HMGCS1 ILMN_1797728 1 3163 HMOX2 ILMN_1658807 1 3241 HPCAL1 ILMN_1764850 1 3251 HPRT1 ILMN_1736940 1 3376 IARS ILMN_1733956 1 3396 ICT1 ILMN_1734508 1 3422 IDI1 ILMN_1755075 1 3475 IFRD1 ILMN_1667561 1 3556 IL1RAP ILMN_1686884 1 3638 INSIG1 ILMN_1793474 1 3654 IRAK1 ILMN_1738397 1 3661 IRF3 ILMN_1765649 1 3682 ITGAE ILMN_1683927 1 3730 KAL1 ILMN_1750373 1 3831 KNS2 ILMN_1654653 1 3836 KPNA1 ILMN_1751859 1 3898 LAD1 ILMN_1782389 1 3949 LDLR ILMN_1651611 1 3992 FADS1 ILMN_1670134 1 3995 FADS3 ILMN_1716847 1 4016 LOXL1 ILMN_1734950 1 4256 MGP ILMN_1651958 1 4319 MMP10 ILMN_1741847 1 4552 MTRR ILMN_1718932 1 4597 MVD ILMN_1657550 1 4605 MYBL2 ILMN_1709020 1 4728 NDUFS8 ILMN_1794132 1 4860 NP ILMN_1777534 1 4900 NRGN ILMN_1705686 1 5029 P2RY2 ILMN_1723535 1 5106 PCK2 ILMN_1671791 1 5214 PFKP ILMN_1805737 1 5277 PIGA ILMN_1705985 1 5373 PMM2 ILMN_1785336 1 5427 POLE2 ILMN_1774336 1 5534 PPP3R1 ILMN_1796962 1 5601 MAPK9 ILMN_1795411 1 5621 PRNP ILMN_1737988 1 5723 PSPH ILMN_1776105 1 5831 PYCR1 ILMN_1796013 1 5833 PCYT2 ILMN_1652846 1 5983 RFC3 ILMN_1784860 1 5985 RFC5 ILMN_1659364 1 6182 MRPL12 ILMN_1699603 1 6197 RPS6KA3 ILMN_1652736 1 6199 RPS6KB2 ILMN_1761175 1 6301 SARS ILMN_1706949 1 6319 SCD ILMN_1689329 1 6472 SHMT2 ILMN_1661264 1 6510 SLC1A5 ILMN_1707720 1 6520 SLC3A2 ILMN_1679041 1 6535 SLC6A8 ILMN_1806349 1 6541 SLC7A1 ILMN_1683859 1 6576 SLC25A1 ILMN_1813671 1 6624 FSCN1 ILMN_1808707 1 6627 SNRPA1 ILMN_1715179 1 6674 SPAG1 ILMN_1658731 1 6721 SREBF2 ILMN_1669615 1 6723 SRM ILMN_1661337 1 6897 TARS ILMN_1666498 1 6949 TCOF1 ILMN_1727551 1 7083 TK1 ILMN_1806037 1 7262 PHLDA2 ILMN_1671557 1 7264 TSTA3 ILMN_1697777 1 7277 TUBA4A ILMN_1784300 1 7283 TUBG1 ILMN_1695731 1 7347 UCHL3 ILMN_1660111 1 7407 VARS ILMN_1696601 1 7422 VEGFA ILMN_1803882 1 7443 VRK1 ILMN_1805828 1 7453 WARS ILMN_1727271 1 7791 ZYX ILMN_1701875 1 7804 LRP8 ILMN_1677765 1 7866 IFRD2 ILMN_1666194 1 8078 USP5 ILMN_1671494 1 8140 SLC7A5 ILMN_1720373 1 8260 ARD1A ILMN_1721977 1 8273 SLC10A3 ILMN_1712887 1 8402 SLC25A11 ILMN_1664168 1 8407 TAGLN2 ILMN_1700426 1 8487 SIP1 ILMN_1733033 1 8533 COPS3 ILMN_1770732 1 8573 CASK ILMN_1654773 1 8623 ASMTL ILMN_1779748 1 8669 EIF3S1 ILMN_1815345 1 8682 PEA15 ILMN_1771376 1 8726 EED ILMN_1710150 1 8818 DPM2 ILMN_1732049 1 8829 NRP1 ILMN_1699574 1 8877 SPHK1 ILMN_1702032 1 8891 EIF2B3 ILMN_1689233 1 8900 CCNA1 ILMN_1726415 1 8974 P4HA2 ILMN_1795778 1 8985 PLOD3 ILMN_1714350 1 8986 RPS6KA4 ILMN_1756204 1 9040 UBE2M ILMN_1701331 1 9129 PRPF3 ILMN_1715392 1 9141 PDCD5 ILMN_1668425 1 9145 SYNGR1 ILMN_1727805 1 9238 TBRG4 ILMN_1783728 1 9260 PDLIM7 ILMN_1690125 1 9270 ITGB1BP1 ILMN_1665107 1 9361 LONP1 ILMN_1766125 1 9455 HOMER2 ILMN_1671486 1 9466 IL27RA ILMN_1688152 1 9631 NUP155 ILMN_1768293 1 9636 ISG15 ILMN_1813289 1 9738 CP110 ILMN_1773200 1 9830 TRIM14 ILMN_1713542 1 9933 KIAA0020 ILMN_1665483 1 9948 WDR1 ILMN_1675844 1 10038 PARP2 ILMN_1775885 1 10061 ABCF2 ILMN_1781999 1 10105 PPIF ILMN_1809607 1 10184 LHFPL2 ILMN_1811077 1 10273 STUB1 ILMN_1756126 1 10425 ARIH2 ILMN_1792825 1 10452 TOMM40 ILMN_1683475 1 10469 TIMM44 ILMN_1784031 1 10528 NOL5A ILMN_1787628 1 10573 MRPL28 ILMN_1694950 1 10644 IGF2BP2 ILMN_1702447 1 10807 SDCCAG3 ILMN_1803997 1 10808 HSPH1 ILMN_1712888 1 10897 YIF1A ILMN_1712975 1 10950 BTG3 ILMN_1707339 1 10962 MLLT11 ILMN_1759097 1 10963 STIP1 ILMN_1745906 1 11033 CENTA1 ILMN_1694556 1 11047 ADRM1 ILMN_1760143 1 11151 CORO1A ILMN_1713749 1 11187 PKP3 ILMN_1753457 1 11247 NXPH4 ILMN_1741214 1 11260 XPOT ILMN_1743711 1 11266 DUSP12 ILMN_1767892 1 11322 TMC6 ILMN_1794677 1 11332 ACOT7 ILMN_1740265 1 11340 EXOSC8 ILMN_1756162 1 22843 PPM1E ILMN_1708508 1 22913 RALY ILMN_1690610 1 23043 TNIK ILMN_1687442 1 23165 NUP205 ILMN_1673962 1 23234 DNAJC9 ILMN_1799516 1 23381 SMG5 ILMN_1721735 1 23516 SLC39A14 ILMN_1764629 1 23555 TSPAN15 ILMN_1803850 1 23590 PDSS1 ILMN_1703324 1 23594 ORC6L ILMN_1731070 1 23649 POLA2 ILMN_1696713 1 23657 SLC7A11 ILMN_1655229 1 25888 ZNF473 ILMN_1782730 1 26155 NOC2L ILMN_1716428 1 26168 SENP3 ILMN_1751147 1 26227 PHGDH ILMN_1704537 1 26271 FBXO5 ILMN_1710676 1 26471 P8 ILMN_1790234 1 26472 PPP1R14B ILMN_1651406 1 26521 TIMM8B ILMN_1738938 1 26973 CHORDC1 ILMN_1776337 1 27341 RRP7A ILMN_1688178 1 28231 SLCO4A1 ILMN_1743701 1 28960 DCPS ILMN_1740737 1 29107 NXT1 ILMN_1760280 1 29763 PACSIN3 ILMN_1682957 1 29893 PSMC3IP ILMN_1675321 1 29901 SAC3D1 ILMN_1776674 1 29915 HCFC2 ILMN_1674297 1 9807 IHPK1 ILMN_1788593 1 29960 FTSJ2 ILMN_1815933 1 51016 FAM158A ILMN_1755677 1 51018 CGI-115 ILMN_1685661 1 51022 GLRX2 ILMN_1680727 1 51025 Magmas ILMN_1763884 1 51073 MRPL4 ILMN_1804207 1 51075 TXNDC14 ILMN_1799367 1 51083 GAL ILMN_1682015 1 51087 YBX2 ILMN_1755354 1 51109 RDH11 ILMN_1768719 1 51236 C8orf30A ILMN_1658577 1 51330 TNFRSF12A ILMN_1689004 1 51400 PPME1 ILMN_1732772 1 192286 HIGD2A ILMN_1774334 1 51728 POLR3K ILMN_1801664 1 53838 C11orf24 ILMN_1808163 1 54205 CYCS ILMN_1730416 1 54442 KCTD5 ILMN_1672728 1 54476 TRIAD3 ILMN_1729980 1 54541 DDIT4 ILMN_1661599 1 54663 WDR74 ILMN_1809866 1 54849 DEF8 ILMN_1767509 1 91860 CALML4 ILMN_1652389 1 55038 CDCA4 ILMN_1684045 1 55061 SUSD4 ILMN_1760533 1 55071 C9orf40 ILMN_1711799 1 55110 MAGOHB ILMN_1759985 1 55111 PLEKHJ1 ILMN_1697701 1 55168 MRPS18A ILMN_1730391 1 55176 SEC61A2 ILMN_1779381 1 55224 ETNK2 ILMN_1800130 1 55312 RFK ILMN_1690780 1 55341 LSG1 ILMN_1705746 1 55379 LRRC59 ILMN_1786259 1 55388 MCM10 ILMN_1706194 1 55630 SLC39A4 ILMN_1706386 1 55700 RPRC1 ILMN_1733348 1 55720 TSR1 ILMN_1775761 1 55969 C20orf24 ILMN_1679195 1 55975 KLHL7 ILMN_1674458 1 56894 AGPAT3 ILMN_1678548 1 56935 C11orf75 ILMN_1798270 1 56942 C16orf61 ILMN_1783333 1 57060 PCBP4 ILMN_1728498 1 57102 C12orf4 ILMN_1800167 1 57418 WDR18 ILMN_1694479 1 57596 BEGAIN ILMN_1744593 1 57706 DENND1A ILMN_1727315 1 57761 TRIB3 ILMN_1787815 1 58526 MID1IP1 ILMN_1668960 1 58986 TMEM8 ILMN_1741371 1 60673 C12orf44 ILMN_1772527 1 64118 DUS1L ILMN_1653342 1 64222 TOR3A ILMN_1768181 1 64782 ISG20L1 ILMN_1814282 1 65990 FAM173A ILMN_1773780 1 79000 C1orf135 ILMN_1787280 1 79006 METRN ILMN_1712583 1 79050 NOC4L ILMN_1733107 1 79071 ELOVL6 ILMN_1700546 1 79080 CCDC86 ILMN_1689467 1 79094 CHAC1 ILMN_1739241 1 79154 MGC4172 ILMN_1756701 1 79174 CRELD2 ILMN_1748707 1 79180 EFHD2 ILMN_1761463 1 79412 KREMEN2 ILMN_1795710 1 79573 TTC13 ILMN_1745573 1 79581 GPR172A ILMN_1664723 1 79609 C14orf138 ILMN_1781102 1 79693 YRDC ILMN_1736008 1 79710 MORC4 ILMN_1721526 1 79711 IPO4 ILMN_1772988 1 80178 FLJ13909 ILMN_1656452 1 80179 MYO19 ILMN_1750711 1 80742 PRR3 ILMN_1750167 1 81034 SLC25A32 ILMN_1683212 1 81873 ARPC5L ILMN_1800844 1 81894 SLC25A28 ILMN_1790472 1 83743 GRWD1 ILMN_1742166 1 84065 C1orf160 ILMN_1793632 1 84549 MAK16 ILMN_1777139 1 84617 TUBB6 ILMN_1697132 1 84790 TUBA1C ILMN_1663388 1 89797 NAV2 ILMN_1675151 1 92170 MTG1 ILMN_1775328 1 112398 EGLN2 ILMN_1768773 1 115201 ATG4A ILMN_1812161 1 116496 C1orf24 ILMN_1667966 1 116832 RPL39L ILMN_1712413 1 203068 TUBB ILMN_1665583 1 246243 RNASEH1 ILMN_1726783 1 353189 SLCO4C1 ILMN_1686464 -1 9 NAT1 ILMN_1688071 -1 36 ACADSB ILMN_1740920 -1 38 ACAT1 ILMN_1800008 -1 104 ADARB1 ILMN_1679797 -1 107 ADCY1 ILMN_1742073 -1 120 ADD3 ILMN_1814526 -1 123 ADFP ILMN_1660332 -1 143 PARP4 ILMN_1776464 -1 224 ALDH3A2 ILMN_1794825 -1 288 ANK3 ILMN_1657016 -1 317 APAF1 ILMN_1659463 -1 318 NUDT2 ILMN_1778347 -1 328 APEX1 ILMN_1661886 -1 360 AQP3 ILMN_1651574 -1 549 AUH ILMN_1740349 -1 596 BCL2 ILMN_1801119 -1 604 BCL6 ILMN_1737314 -1 638 BIK ILMN_1770505 -1 665 BNIP3L ILMN_1718961 -1 694 BTG1 ILMN_1775743 -1 753 C18orf1 ILMN_1777436 -1 831 CAST ILMN_1672947 -1 857 CAV1 ILMN_1687583 -1 900 CCNG1 ILMN_1694491 -1 901 CCNG2 ILMN_1747244 -1 1102 RCBTB2 ILMN_1771695 -1 1200 TPP1 ILMN_1729234 -1 1299 COL9A3 ILMN_1740155 -1 1315 COPB1 ILMN_1699112 -1 1326 MAP3K8 ILMN_1741159 -1 1362 CPD ILMN_1703074 -1 1604 CD55 ILMN_1800540 -1 29935 RPA4 ILMN_1798880 -1 1733 DIO1 ILMN_1769547 -1 1942 EFNA1 ILMN_1775903 -1 1962 EHHADH ILMN_1751877 -1 1974 EIF4A2 ILMN_1685722 -1 1992 SERPINB1 ILMN_1679133 -1 2053 EPHX2 ILMN_1709237 -1 2065 ERBB3 ILMN_1751346 -1 2066 ERBB4 ILMN_1661857 -1 2073 ERCC5 ILMN_1795495 -1 2186 FALZ ILMN_1692021 -1 2188 FANCF ILMN_1682724 -1 2258 FGF13 ILMN_1671777 -1 2263 FGFR2 ILMN_1682270 -1 2273 FHL1 ILMN_1805842 -1 2308 FOXO1A ILMN_1738816 -1 2330 FMO5 ILMN_1811632 -1 2353 FOS ILMN_1669523 -1 2515 ADAM2 ILMN_1662675 -1 2517 FUCA1 ILMN_1752728 -1 2535 FZD2 ILMN_1653711 -1 2581 GALC ILMN_1799744 -1 2745 GLRX ILMN_1737308 -1 2752 GLUL ILMN_1653496 -1 2799 GNS ILMN_1744517 -1 2804 GOLGB1 ILMN_1747935 -1 2888 GRB14 ILMN_1793832 -1 2896 GRN ILMN_1724250 -1 2990 GUSB ILMN_1669878 -1 3006 HIST1H1C ILMN_1757406 -1 3012 HIST1H2AE ILMN_1756849 -1 3017 HIST1H2BD ILMN_1758623 -1 3155 HMGCL ILMN_1688095 -1 3176 HNMT ILMN_1751789 -1 3321 IGSF3 ILMN_1713014 -1 3358 HTR2C ILMN_1767145 -1 3431 SP110 ILMN_1731418 -1 3476 IGBP1 ILMN_1717165 -1 3554 IL1R1 ILMN_1810584 -1 3667 IRS1 ILMN_1759232 -1 1506 CTRL ILMN_1664863 -1 3764 KCNJ8 ILMN_1735779 -1 3778 KCNMA1 ILMN_1688785 -1 3781 KCNN2 ILMN_1685636 -1 3797 KIF3C ILMN_1797277 -1 3912 LAMB1 ILMN_1658709 -1 3964 LGALS8 ILMN_1664402 -1 4005 LMO2 ILMN_1800078 -1 4048 LTA4H ILMN_1690342 -1 4126 MANBA ILMN_1800733 -1 4128 MAOA ILMN_1663640 -1 4311 MME ILMN_1678170 -1 4329 ALDH6A1 ILMN_1785284 -1 4477 MSMB ILMN_1699243 -1 4501 MT1X ILMN_1775170 -1 4601 MXI1 ILMN_1794074 -1 4602 MYB ILMN_1711894 -1 4610 MYCL1 ILMN_1764443 -1 4753 NELL2 ILMN_1725417 -1 4781 NFIB ILMN_1778991 -1 4886 NPY1R ILMN_1799878 -1 4889 NPY5R ILMN_1718198 -1 4982 TNFRSF11B ILMN_1676663 -1 5046 PCSK6 ILMN_1802550 -1 5087 PBX1 ILMN_1784678 -1 5189 PEX1 ILMN_1727166 -1 5238 PGM3 ILMN_1693620 -1 5290 PIK3CA ILMN_1705468 -1 5334 PLCL1 ILMN_1718852 -1 5349 FXYD3 ILMN_1791580 -1 5376 PMP22 ILMN_1785646 -1 5498 PPOX ILMN_1673798 -1 5538 PPT1 ILMN_1669273 -1 5547 PRCP ILMN_1769091 -1 5627 PROS1 ILMN_1671928 -1 5733 PTGER3 ILMN_1759840 -1 5734 PTGER4 ILMN_1795930 -1 5771 PTPN2 ILMN_1686731 -1 5783 PTPN13 ILMN_1652805 -1 5826 ABCD4 ILMN_1746032 -1 5926 ARID4A ILMN_1810229 -1 5993 RFX5 ILMN_1741200 -1 6019 RLN2 ILMN_1748529 -1 6038 RNASE4 ILMN_1776602 -1 6253 RTN2 ILMN_1749115 -1 6414 SEPP1 ILMN_1785071 -1 6642 SNX1 ILMN_1693998 -1 6658 SOX3 ILMN_1653055 -1 6672 SP100 ILMN_1690920 -1 6814 STXBP3 ILMN_1764168 -1 7026 NR2F2 ILMN_1745785 -1 7035 TFPI ILMN_1707124 -1 7045 TGFBI ILMN_1663866 -1 7078 TIMP3 ILMN_1773664 -1 7107 GPR137B ILMN_1794715 -1 7181 NR2C1 ILMN_1728983 -1 7306 TYRP1 ILMN_1699692 -1 7456 WASPIP ILMN_1689645 -1 7508 XPC ILMN_1790807 -1 7580 ZNF32 ILMN_1695362 -1 7770 ZNF227 ILMN_1721034 -1 7844 RNF103 ILMN_1752677 -1 7852 CXCR4 ILMN_1801584 -1 8031 NCOA4 ILMN_1773906 -1 8204 NRIP1 ILMN_1718629 -1 8269 CXorf12 ILMN_1655022 -1 8339 HIST1H2BG ILMN_1716195 -1 8481 OFD1 ILMN_1785266 -1 8502 PKP4 ILMN_1749410 -1 8519 IFITM1 ILMN_1801246 -1 8613 PPAP2B ILMN_1688868 -1 8630 HSD17B6 ILMN_1653162 -1 8660 IRS2 ILMN_1763809 -1 8705 B3GALT4 ILMN_1690682 -1 8720 MBTPS1 ILMN_1767256 -1 8722 CTSF ILMN_1750122 -1 8800 PEX11A ILMN_1690695 -1 8835 SOCS2 ILMN_1798926 -1 8934 RAB7L1 ILMN_1750202 -1 8991 SELENBP1 ILMN_1680652 -1 9111 NMI ILMN_1739541 -1 9185 REPS2 ILMN_1656934 -1 9187 SLC24A1 ILMN_1747395 -1 9204 ZMYM6 ILMN_1657632 -1 9236 CCPG1 ILMN_1794190 -1 9337 CNOT8 ILMN_1736068 -1 9338 TCEAL1 ILMN_1742341 -1 9367 RAB9A ILMN_1750409 -1 9419 CRIPT ILMN_1813256 -1 9439 MED23 ILMN_1690999 -1 9444 QKI ILMN_1690476 -1 9445 ITM2B ILMN_1713733 -1 9467 SH3BP5 ILMN_1814773 -1 9512 PMPCB ILMN_1728660 -1 9517 SPTLC2 ILMN_1704290 -1 9525 VPS4B ILMN_1792587 -1 9528 TMEM59 ILMN_1792508 -1 9630 GNA14 ILMN_1734857 -1 9638 FEZ1 ILMN_1779071 -1 9649 RALGPS1 ILMN_1674135 -1 9665 LKAP ILMN_1793371 -1 9743 RICS ILMN_1722726 -1 9764 KIAA0513 ILMN_1693233 -1 9766 KIAA0247 ILMN_1786779 -1 9767 PHF16 ILMN_1790518 -1 9772 KIAA0195 ILMN_1669196 -1 9779 TBC1D5 ILMN_1767433 -1 9821 RB1CC1 ILMN_1736796 -1 9847 KIAA0528 ILMN_1682572 -1 9886 RHOBTB1 ILMN_1731831 -1 9906 SLC35E2 ILMN_1651209 -1 9936 CD302 ILMN_1716797 -1 9946 CRYZL1 ILMN_1719290 -1 10023 FRAT1 ILMN_1781416 -1 10040 TOM1L1 ILMN_1802642 -1 10106 CTDSP2 ILMN_1692962 -1 10129 FRY ILMN_1678437 -1 10133 OPTN ILMN_1717586 -1 10142 AKAP9 ILMN_1779315 -1 10179 RBM7 ILMN_1687057 -1 10267 RAMP1 ILMN_1764754 -1 10282 BET1 ILMN_1684042 -1 10284 SAP18 ILMN_1752793 -1 10314 LANCL1 ILMN_1703697 -1 10325 RRAGB ILMN_1741219 -1 10370 CITED2 ILMN_1663092 -1 10397 NDRG1 ILMN_1809931 -1 10451 VAV3 ILMN_1657679 -1 10610 ST6GALNAC2 ILMN_1658706 -1 10742 RAI2 ILMN_1760574 -1 10753 CAPN9 ILMN_1731073 -1 10826 C5orf4 ILMN_1728742 -1 10916 MAGED2 ILMN_1683576 -1 10924 SMPDL3A ILMN_1796349 -1 10928 RALBP1 ILMN_1791840 -1 10957 PNRC1 ILMN_1789955 -1 11045 UPK1A ILMN_1655637 -1 11046 SLC35D2 ILMN_1706571 -1 11069 RAPGEF4 ILMN_1661802 -1 11152 WDR45 ILMN_1756146 -1 11345 GABARAPL2 ILMN_1796458 -1 22882 ZHX2 ILMN_1792951 -1 22920 KIFAP3 ILMN_1697884 -1 23097 CDC2L6 ILMN_1676891 -1 23158 TBC1D9 ILMN_1703891 -1 23240 KIAA0922 ILMN_1712254 -1 23321 TRIM2 ILMN_1745079 -1 23327 NEDD4L ILMN_1733627 -1 23351 KIAA0323 ILMN_1654392 -1 23401 FRAT2 ILMN_1788213 -1 23411 SIRT1 ILMN_1739083 -1 23424 TDRD7 ILMN_1689977 -1 23503 ZFYVE26 ILMN_1798061 -1 23530 NNT ILMN_1806634 -1 23548 OSRF ILMN_1807088 -1 23550 PSD4 ILMN_1699035 -1 23554 TSPAN12 ILMN_1665572 -1 23588 KLHDC2 ILMN_1741204 -1 1122 CHML ILMN_1747697 -1 23678 SGK3 ILMN_1747020 -1 24149 ZNF318 ILMN_1792305 -1 25805 BAMBI ILMN_1691410 -1 25840 METTL7A ILMN_1656285 -1 25850 ZNF345 ILMN_1778886 -1 25875 LETMD1 ILMN_1782743 -1 25901 CCDC28A ILMN_1798659 -1 25913 POT1 ILMN_1692041 -1 25949 SYF2 ILMN_1660186 -1 25996 REXO2 ILMN_1749009 -1 26018 LRIG1 ILMN_1707342 -1 26273 FBXO3 ILMN_1749641 -1 26509 FER1L3 ILMN_1810289 -1 26751 SH3YL1 ILMN_1712231 -1 27010 TPK1 ILMN_1804629 -1 27072 VPS41 ILMN_1768486 -1 27113 BBC3 ILMN_1729645 -1 27241 BBS9 ILMN_1794956 -1 27250 PDCD4 ILMN_1768004 -1 27316 RBMX ILMN_1723580 -1 28965 SLC27A6 ILMN_1797666 -1 29071 C1GALT1C1 ILMN_1751234 -1 29099 COMMD9 ILMN_1808821 -1 29760 BLNK ILMN_1724527 -1 29799 YPEL1 ILMN_1795338 -1 29887 SNX10 ILMN_1786257 -1 29995 LMCD1 ILMN_1754969 -1 51019 CCDC53 ILMN_1715569 -1 51084 CRYL1 ILMN_1714397 -1 51172 NAGPA ILMN_1675266 -1 51227 DSCR5 ILMN_1764871 -1 51231 VRK3 ILMN_1771697 -1 51292 GMPR2 ILMN_1677919 -1 51309 ARMCX1 ILMN_1788192 -1 51315 KRCC1 ILMN_1745620 -1 51363 GALNAC4S-6ST ILMN_1670926 -1 51447 IHPK2 ILMN_1683328 -1 51474 LIMA1 ILMN_1704369 -1 51594 NAG ILMN_1686392 -1 51626 DYNC2LI1 ILMN_1811836 -1 51646 YPEL5 ILMN_1711069 -1 51696 HECA ILMN_1770667 -1 54014 BRWD1 ILMN_1801866 -1 54453 RIN2 ILMN_1769546 -1 54621 FLJ20674 ILMN_1778318 -1 54664 TMEM106B ILMN_1668943 -1 54665 RSBN1 ILMN_1791097 -1 54769 DIRAS2 ILMN_1742846 -1 54800 KLHL24 ILMN_1685297 -1 54816 ZNF280D ILMN_1767142 -1 54974 ICF45 ILMN_1792620 -1 55008 HERC6 ILMN_1654639 -1 55062 WIPI1 ILMN_1781386 -1 55100 WDR70 ILMN_1796454 -1 55196 C12orf35 ILMN_1726289 -1 55204 GOLPH3L ILMN_1655570 -1 55213 RCBTB1 ILMN_1695317 -1 55218 EXDL2 ILMN_1771689 -1 55286 C4orf19 ILMN_1795838 -1 55296 TBC1D19 ILMN_1692844 -1 55315 SLC29A3 ILMN_1717326 -1 55332 FLJ11259 ILMN_1669376 -1 55501 CHST12 ILMN_1735058 -1 55510 DDX43 ILMN_1813893 -1 55625 ZDHHC7 ILMN_1730568 -1 55742 PARVA ILMN_1756408 -1 55763 EXOC1 ILMN_1793766 -1 55788 LMBRD1 ILMN_1652128 -1 55793 FAM63A ILMN_1689552 -1 55812 SPATA7 ILMN_1652409 -1 55818 JMJD1A ILMN_1722532 -1 55827 IQWD1 ILMN_1670000 -1 55830 GLT8D1 ILMN_1713290 -1 55837 C14orf11 ILMN_1741513 -1 55857 C20orf19 ILMN_1779536 -1 55900 ZNF302 ILMN_1652120 -1 56603 CYP26B1 ILMN_1812297 -1 56898 BDH2 ILMN_1673360 -1 56922 MCCC1 ILMN_1760174 -1 56997 CABC1 ILMN_1731064 -1 57007 CMKOR1 ILMN_1798360 -1 57088 PLSCR4 ILMN_1757338 -1 57326 PBXIP1 ILMN_1814315 -1 57419 SLC24A3 ILMN_1663519 -1 57509 MTUS1 ILMN_1663648 -1 57515 SERINC1 ILMN_1741613 -1 57599 WDR48 ILMN_1762103 -1 57728 WDR19 ILMN_1655117 -1 57758 SCUBE2 ILMN_1684085 -1 57763 ANKRA2 ILMN_1710655 -1 58488 PCTP ILMN_1802257 -1 58497 PRUNE ILMN_1728914 -1 59348 ZNF350 ILMN_1744986 -1 60686 C14orf93 ILMN_1724897 -1 63892 THADA ILMN_1811624 -1 63897 ABC1 ILMN_1791106 -1 63901 FAM111A ILMN_1778845 -1 63920 LOC63920 ILMN_1727553 -1 64430 C14orf135 ILMN_1680781 -1 64786 TBC1D15 ILMN_1803941 -1 64798 DEPDC6 ILMN_1756685 -1 64927 TTC23 ILMN_1690320 -1 65018 PINK1 ILMN_1666924 -1 65084 TMEM135 ILMN_1700202 -1 79083 MLPH ILMN_1795342 -1 79090 TRAPPC6A ILMN_1775703 -1 79443 FYCO1 ILMN_1709032 -1 79611 ACSS3 ILMN_1659885 -1 79664 NARG2 ILMN_1718830 -1 79665 DHX40 ILMN_1653047 -1 79738 C12orf58 ILMN_1741985 -1 79762 C1orf115 ILMN_1674817 -1 79789 CLMN ILMN_1714522 -1 79864 C11orf63 ILMN_1680659 -1 79901 CYBRD1 ILMN_1712305 -1 79983 POF1B ILMN_1760705 -1 80195 C10orf57 ILMN_1672717 -1 80230 RUFY1 ILMN_1659777 -1 80254 CEP63 ILMN_1787808 -1 80303 EFHD1 ILMN_1779448 -1 80344 WDR23 ILMN_1765825 -1 81031 SLC2A10 ILMN_1663351 -1 81578 COL21A1 ILMN_1732850 -1 81603 TRIM8 ILMN_1746704 -1 81627 C1orf25 ILMN_1665300 -1 83439 TCF7L1 ILMN_1733841 -1 84124 ZNF394 ILMN_1807514 -1 84159 ARID5B ILMN_1721626 -1 89910 UBE3B ILMN_1752027 -1 90362 C8orf72 ILMN_1679217 -1 90864 SPSB3 ILMN_1682864 -1 93129 ORAI3 ILMN_1736628 -1 112611 RWDD2A ILMN_1722156 -1 113791 PIK3IP1 ILMN_1719986 -1 114625 ERMAP ILMN_1715013 -1 114876 OSBPL1A ILMN_1773063 -1 114883 OSBPL9 ILMN_1785167 -1 123872 LRRC50 ILMN_1776967 -1 259230 SGMS1 ILMN_1740505 -1 286148 DPY19L4 ILMN_1775573 van 't Veer et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id Gene70 -1 163 AP2B1 ILMN_1681998 1 1058 CENPA ILMN_1801257 1 1284 COL4A2 ILMN_1724994 1 1633 DCK ILMN_1651433 1 1894 ECT2 ILMN_1719307 1 2131 EXT1 ILMN_1794343 1 2781 GNAZ ILMN_1766182 -1 2947 GSTM3 ILMN_1736184 1 3488 IGFBP5 ILMN_1750324 1 4175 MCM6 ILMN_1766634 1 4318 MMP9 ILMN_1796316 1 5019 OXCT1 ILMN_1813544 1 5984 RFC4 ILMN_1724489 1 6515 SLC2A3 ILMN_1775708 -1 7043 TGFB3 ILMN_1687652 1 8476 CDC42BPA ILMN_1781472 -1 8659 ALDH4A1 ILMN_1656368 -1 8817 FGF18 ILMN_1797030 1 8833 GMPS ILMN_1771734 -1 8840 WISP1 ILMN_1713499 1 9055 PRC1 ILMN_1728934 1 9134 CCNE2 ILMN_1740452 1 9833 MELK ILMN_1731184 1 10403 NDC80 ILMN_1664511 -1 10455 PECI ILMN_1761131 1 10531 PITRM1 ILMN_1698072 1 10874 NMU ILMN_1740250 1 23594 ORC6L ILMN_1731070 -1 27113 BBC3 ILMN_1729645 1 51203 NUSAP1 ILMN_1726720 1 51377 UCHL5 ILMN_1731612 1 51514 DTL ILMN_1745251 1 51560 RAB6B ILMN_1752299 1 55321 C20orf46 ILMN_1751228 -1 55351 STK32B ILMN_1736356 1 56942 C16orf61 ILMN_1783333 1 57110 HRASLS ILMN_1655867 1 57211 GPR126 ILMN_1658815 -1 57758 SCUBE2 ILMN_1684085 -1 58475 MS4A7 ILMN_1743932 -1 79132 LGP2 ILMN_1678422 1 79888 LPCAT1 ILMN_1702171 1 81624 DIAPH3 ILMN_1695226 1 83879 CDCA7 ILMN_1737184 1 85453 TSPYL5 ILMN_1737972 1 91283 C9orf30 ILMN_1714278 1 92140 MTDH ILMN_1810838 -1 146760 RTN4RL1 ILMN_1778683 -1 146923 RUNDC1 ILMN_1733875 -1 151126 ZNF533 ILMN_1657087 1 160897 ITR ILMN_1738712 1 169714 QSCN6L1 ILMN_1789384 Desmedt et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id Immune.2.STAT1 1 6772 STAT1 ILMN_1690105 1 3627 CXCL10 ILMN_1791759 1 6890 TAP1 ILMN_1751079 1 6373 CXCL11 ILMN_1719597 1 3620 INDO ILMN_1656310 1 4283 CXCL9 ILMN_1745356 1 4599 MX1 ILMN_1662358 1 27074 LAMP3 ILMN_1719734 1 9636 ISG15 ILMN_1813289 1 64108 RTP4 ILMN_1788013 1 55008 HERC6 ILMN_1654639 1 10964 IFI44L ILMN_1723912 1 4600 MX2 ILMN_1754619 1 3437 IFIT3 ILMN_1701789 1 51191 HERC5 ILMN_1729749 1 91543 RSAD2 ILMN_1657871 1 23586 DDX58 ILMN_1797001 1 6352 CCL5 ILMN_1773352 1 27299 ADAMDEC1 ILMN_1716909 1 914 CD2 ILMN_1695025 1 55601 FLJ20035 ILMN_1795181 1 10866 HCP5 ILMN_1803945 1 9111 NMI ILMN_1739541 1 9806 SPOCK2 ILMN_1656287 1 6355 CCL8 ILMN_1772964 1 10346 TRIM22 ILMN_1779252 1 4069 LYZ ILMN_1815205 1 3659 IRF1 ILMN_1708375 1 3902 LAG3 ILMN_1813338 1 9595 PSCDBP ILMN_1746864 1 22797 TFEC ILMN_1711332 1 10537 UBD ILMN_1678841 1 11262 SP140 ILMN_1778599 1 1075 CTSC ILMN_1696347 1 2537 G1P3 ILMN_1687384 1 7941 PLA2G7 ILMN_1701195 1 917 CD3G ILMN_1717197 1 1890 ECGF1 ILMN_1690939 1 51316 PLAC8 ILMN_1653026 1 10875 FGL2 ILMN_1746471 1 3003 GZMK ILMN_1710734 1 962 CD48 ILMN_1753326 1 6775 STAT4 ILMN_1785202 1 2841 GPR18 ILMN_1780368 1 5026 P2RX5 ILMN_1677793 1 10437 IFI30 ILMN_1682846 1 4068 SH2D1A ILMN_1705892 1 7805 LAPTM5 ILMN_1772359 1 969 CD69 ILMN_1651316 1 5778 PTPN7 ILMN_1715214 1 3394 IRF8 ILMN_1666594 1 11040 PIM2 ILMN_1727624 1 51513 ETV7 ILMN_1759014 1 29909 GPR171 ILMN_1761166 1 5720 PSME1 ILMN_1806017 1 330 BIRC3 ILMN_1696549 1 356 FASLG ILMN_1781824 1 8519 IFITM1 ILMN_1801246 1 24138 IFIT5 ILMN_1696654 1 3689 ITGB2 ILMN_1654396 1 11118 BTN3A2 ILMN_1676528 1 3059 HCLS1 ILMN_1727402 1 6398 SECTM1 ILMN_1652277 1 55843 ARHGAP15 ILMN_1777882 1 22914 KLRK1 ILMN_1722991 1 10261 IGSF6 ILMN_1689415 1 1880 EBI2 ILMN_1798706 1 26034 PIP3-E ILMN_1796497 1 29887 SNX10 ILMN_1786257 1 79132 LGP2 ILMN_1678422 1 684 BST2 ILMN_1723480 1 55337 FLJ11286 ILMN_1750400 1 341 APOC1 ILMN_1789007 1 51237 PACAP ILMN_1662878 1 445347 TARP ILMN_1723944 1 56829 ZC3HAV1 ILMN_1729973 -1 23564 DDAH2 ILMN_1770787 1 23547 LILRA4 ILMN_1702385 1 10148 EBI3 ILMN_1802653 1 3823 KLRC3 ILMN_1658387 1 50856 CLEC4A ILMN_1709204 1 959 CD40LG ILMN_1659077 1 7409 VAV1 ILMN_1717334 1 2745 GLRX ILMN_1737308 1 54 ACP5 ILMN_1761728 1 5993 RFX5 ILMN_1741200 1 51816 CECR1 ILMN_1751851 1 7187 TRAF3 ILMN_1793154 1 4218 RAB8A ILMN_1760858 1 3606 IL18 ILMN_1778457 -1 1942 EFNA1 ILMN_1775903 1 10125 RASGRP1 ILMN_1768958 1 9985 REC8L1 ILMN_1751886 -1 10126 DNAL4 ILMN_1801845 Saal et al. coefficient Entrez_Gene_ID Symbol Probe_Id PTEN -1 5728 PTEN ILMN_1701134 1 4291 MLF1 ILMN_1684439 1 1010 CDH12 ILMN_1709269 -1 145781 Gcom1 ILMN_1674151 1 4751 NEK2 ILMN_1653822 1 6612 SUMO3 ILMN_1725642 -1 2331 FMOD ILMN_1789639 1 643224 LOC643224 ILMN_1802181 -1 10399 GNB2L1 ILMN_1736500 1 7372 UMPS ILMN_1757437 1 11073 TOPBP1 ILMN_1684929 1 126731 C1orf96 ILMN_1699217 1 5052 PRDX1 ILMN_1710159 -1 5094 PCBP2 ILMN_1724825 1 330 BIRC3 ILMN_1696549 1 5290 PIK3CA ILMN_1705468 -1 1265 CNN2 ILMN_1770290 -1 26123 C10orf61 ILMN_1678652 1 79132 LGP2 ILMN_1678422 1 3838 KPNA2 ILMN_1708160 1 9711 KIAA0226 ILMN_1763637 -1 8510 MMP23B ILMN_1808107 -1 80306 MED28 ILMN_1749821 -1 2043 EPHA4 ILMN_1672022 1 26973 CHORDC1 ILMN_1776337 -1 84896 ATAD1 ILMN_1654497 1 1164 CKS2 ILMN_1756326 1 8208 CHAF1B ILMN_1674231 1 24137 KIF4A ILMN_1799667 -1 23613 ZMYND8 ILMN_1652407 1 87178 PNPT1 ILMN_1810608 1 11004 KIF2C ILMN_1685916 -1 27122 DKK3 ILMN_1815673 1 205564 SENP5 ILMN_1675501 -1 8724 SNX3 ILMN_1740180 -1 11171 STRAP ILMN_1731194 -1 6228 RPS23 ILMN_1772459 1 54503 ZDHHC13 ILMN_1684663 1 1207 CLNS1A ILMN_1736814 1 1062 CENPE ILMN_1716279 -1 3416 IDE ILMN_1769883 1 9833 MELK ILMN_1731184 -1 5169 ENPP3 ILMN_1749131 -1 140459 ASB6 ILMN_1806705 1 51642 MRPL48 ILMN_1774580 -1 56977 STOX2 ILMN_1803256 1 5612 PRKRIR ILMN_1655622 1 10440 TIMM17A ILMN_1656798 -1 84942 WDR73 ILMN_1702592 1 3925 STMN1 ILMN_1657796 1 7307 U2AF1 ILMN_1772113 1 27316 RBMX ILMN_1723580 1 27238 GPKOW ILMN_1684197 -1 50861 STMN3 ILMN_1693425 1 1503 CTPS ILMN_1783285 -1 54556 ING3 ILMN_1806226 1 11169 WDHD1 ILMN_1756043 1 4172 MCM3 ILMN_1806818 -1 9037 SEMA5A ILMN_1656927 1 10383 TUBB2C ILMN_1780769 -1 1889 ECE1 ILMN_1672174 -1 10121 ACTR1A ILMN_1792314 1 9392 TGFBRAP1 ILMN_1696870 1 9787 DLG7 ILMN_1749829 1 151246 SGOL2 ILMN_1746699 -1 3705 ITPK1 ILMN_1715674 1 891 CCNB1 ILMN_1712803 -1 83700 JAM3 ILMN_1769575 1 5984 RFC4 ILMN_1724489 1 5718 PSMD12 ILMN_1691428 -1 8897 MTMR3 ILMN_1739641 -1 23111 SPG20 ILMN_1801236 1 29105 C16orf80 ILMN_1707100 1 6732 SRPK1 ILMN_1798804 1 5870 RAB6A ILMN_1800871 1 81610 C20orf129 ILMN_1781943 1 57380 MRS2L ILMN_1778677 1 3066 HDAC2 ILMN_1767747 1 2618 GART ILMN_1679476 1 25852 ARMC8 ILMN_1781151 1 64793 CCDC21 ILMN_1812489 1 23279 NUP160 ILMN_1652989 1 6632 SNRPD1 ILMN_1768393 -1 10972 TMED10 ILMN_1736585 -1 8450 CUL4B ILMN_1691535 1 9133 CCNB2 ILMN_1801939 1 7159 TP53BP2 ILMN_1779706 1 6434 SFRS10 ILMN_1742798 1 151636 DTX3L ILMN_1784380 -1 4094 MAF ILMN_1719543 1 151188 ARL6IP6 ILMN_1797964 -1 4629 MYH11 ILMN_1660086 1 5873 RAB27A ILMN_1665859 1 2999 GZMH ILMN_1731233 -1 8681 PLA2G4B ILMN_1697629 1 5111 PCNA ILMN_1694177 1 5359 PLSCR1 ILMN_1752889 1 79694 MANEA ILMN_1757026 1 84955 NUDCD1 ILMN_1678745 1 10606 PAICS ILMN_1773760 1 4259 MGST3 ILMN_1751956 -1 51028 VPS36 ILMN_1802519 -1 4038 LRP4 ILMN_1675268 1 64844 Mar-07 ILMN_1717337 -1 200734 SPRED2 ILMN_1791232 1 10541 ANP32B ILMN_1684293 1 92342 C1orf156 ILMN_1734915 1 64789 C1orf176 ILMN_1783996 1 6397 SEC14L1 ILMN_1732575 -1 11257 TP53AP1 ILMN_1658469 -1 9044 BTAF1 ILMN_1791536 1 9232 PTTG1 ILMN_1753196 -1 7284 TUFM ILMN_1738369 1 10951 CBX1 ILMN_1770244 1 54845 RBM35A ILMN_1749180 1 3192 HNRNPU ILMN_1718571 -1 54838 C10orf26 ILMN_1658830 -1 1848 DUSP6 ILMN_1677466 1 10963 STIP1 ILMN_1745906 1 6772 STAT1 ILMN_1690105 1 387103 C6orf173 ILMN_1763907 1 6426 SFRS1 ILMN_1795341 -1 2767 GNA11 ILMN_1739781 -1 9897 KIAA0196 ILMN_1728676 1 3608 ILF2 ILMN_1745172 -1 25794 FSCN2 ILMN_1795472 1 9928 KIF14 ILMN_1808071 1 6941 TCF19 ILMN_1682008 1 29028 ATAD2 ILMN_1763064 1 3833 KIFC1 ILMN_1764840 -1 89122 TRIM4 ILMN_1792265 1 219285 SAMD9L ILMN_1748256 1 699 BUB1 ILMN_1736090 -1 8576 STK16 ILMN_1803774 1 8532 CPZ ILMN_1766780 1 7936 RDBP ILMN_1765532 1 10589 DRAP1 ILMN_1733048 1 219988 PATL1 ILMN_1680782 -1 374868 ATP9B ILMN_1658684 -1 8848 TSC22D1 ILMN_1692177 -1 10540 DCTN2 ILMN_1662232 -1 3983 ABLIM1 ILMN_1785424 1 5889 RAD51C ILMN_1695386 1 6790 AURKA ILMN_1680955 -1 10975 UQCR ILMN_1745049 1 55827 IQWD1 ILMN_1670000 1 60313 GPBP1L1 ILMN_1662719 -1 55662 HIF1AN ILMN_1681812 -1 54531 MIER2 ILMN_1766159 -1 11329 STK38 ILMN_1799153 1 6619 SNAPC3 ILMN_1803611 1 157313 CDCA2 ILMN_1660654 -1 11337 GABARAP ILMN_1692338 -1 5159 PDGFRB ILMN_1815057 -1 5797 PTPRM ILMN_1744937 1 3796 KIF2A ILMN_1734476 1 9493 KIF23 ILMN_1811472 1 7444 VRK2 ILMN_1750088 1 29979 UBQLN1 ILMN_1688622 1 29127 RACGAP1 ILMN_1702140 -1 80031 SEMA6D ILMN_1814494 1 54014 BRWD1 ILMN_1801866 1 79894 ZNF672 ILMN_1669094 1 9582 APOBEC3B ILMN_1691457 -1 221981 LOC221981 ILMN_1653057 1 4175 MCM6 ILMN_1766634 -1 9252 RPS6KA5 ILMN_1657515 1 51773 RSF1 ILMN_1668834 1 54534 MRPL50 ILMN_1664833 1 79572 ATP13A3 ILMN_1663684 1 54625 PARP14 ILMN_1691731 -1 55101 ATP5SL ILMN_1809027 -1 1311 COMP ILMN_1677636 1 8317 CDC7 ILMN_1741801 -1 10206 TRIM13 ILMN_1674260 1 6596 SMARCA3 ILMN_1673820