DOCSLIB.ORG

Rapport 31 Tweede Druk (2016)

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text
Rapport 31 Tweede Druk (2016) REFERENTIES EN MAATLATTEN VOOR NATUURLIJKE WATERTYPEN VOOR DE KADERRICHTLIJN WATER 2015-2021 2012 RAPPORT 31 TWEEDE DRUK (2016) 978.90.5773.569.1 [email protected] www.stowa.nl Publicaties van de STOWA kunt u bestellen op www.stowa.nl TEL 033 460 32 00 Stationsplein 89 3818 LE Amersfoort POSTBUS 2180 3800 CD AMERSFOORT STOWA 2012-31 REFERENTIES EN MAATLATTEN VOOR NATUURLIJKE WATERTYPEN VOOR DE KADERRICHTLIJN WATER 2015-2021 COLOFON UITGAVE Stichting Toegepast Onderzoek Waterbeheer Postbus 2180 3800 CD Amersfoort AUTEURS Meren: W. Altenburg (Altenburg & Wymenga), G. Arts (Alterra), J.G. Baretta-Bekker (RWS), M.S. van den Berg (RWS), T. van den Broek (Royal Haskoning), R. Buskens (Taken Landschapsplanning), R. Bijkerk (Koeman & Bijkerk), H.C. Coops (RWS, WL/Delft Hydraulics), H. van Dam (Aquasense, Waternatuur), G. van Ee (Provincie Noord Holland, Hoogheemraadschap Hollands Noorderkwartier), C.H.M. Evers (Royal Haskoning), R. Franken (Wageningen Universiteit), B. Higler (Alterra), T. Ietswaart (Royal Haskoning, Provincie Friesland), N. Jaarsma (Witteveen+Bos), D.J. de Jong (RWS), A.M.T. Joosten (Stichting Alg), M. Klinge (Witteveen+Bos), R.A.E. Knoben (Royal Haskoning), J. Kranenbarg (RWS, WL/Delft Hydraulics), W.M.G.M. van Loon (RWS), R. Noordhuis (RWS), R. Pot (Roelf Pot onderzoek- en adviesbureau), F. Twisk (RWS), P.F.M. Verdonschot (Alterra), H. Vlek (Alterra), K. Wolfstein (RWS). Rivieren: J.J.G.M. Backx (RWS), M. Beers (OVB, AquaTerra), M.S. van den Berg (RWS), T. van den Broek (Royal Haskoning), R. Buskens (Taken Landschapsplanning), A.D. Buijse (RWS), H.C. Coops (RWS, WL/Delft Hydraulics), H. van Dam (Aquasense, Waternatuur), G. Duursema (Waterschap Velt en Vecht), C.H.M. Evers (Royal Haskoning), M. Fagel, T. Ietswaart (Royal Haskoning, Provincie Friesland), M. Klinge (Witteveen+Bos), R.A.E. Knoben (Royal Haskoning), J. Kranenbarg (RWS, WL/Delft Hydraulics), J. de Leeuw (RIVO, IMARES), J. van der Molen (Alterra), R. Noordhuis (RWS), R.C. Nijboer (Alterra), J. Postma (Ecofide), R. Pot (Roelf Pot onderzoek- en adviesbureau), P.F.M. Verdonschot (Alterra), H. Vlek (Alterra), T. Vriese (OVB, VisAdvies). Overgangs- en kustwateren: J.J.G.M. Backx (RWS), J.G. Baretta-Bekker (RWS), M.S. van den Berg (RWS), R. Bijkerk (Koeman & Bijkerk), R. Duijts (RWS), J.G. Hartholt (RWS), Z. Jager (RWS), D. de Jong (RWS), M. Klinge (Witteveen+Bos), R.A.E. Knoben (Royal Haskoning), J. Kranenbarg (RWS, WL/Delft Hydraulics), W.M.G.M. van Loon (RWS), E.C. Stikvoort (RWS), F. Twisk (RWS). REDACTIE D.T. van der Molen (Ministerie van Infrastructuur en Milieu), R. Pot (Roelf Pot onderzoek- en advies- bureau), C.H.M. Evers (Royal HaskoningDHV), F.C.J. van Herpen (Royal HaskoningDHV) en L.L.J. van Nieuwerburgh (Royal HaskoningDHV) FOTO OMSLAG De Rode Beek Vlodrop in Nationaal Park De Meinweg is een snelstromende bovenloop op zand (type R13) met de status Natuurlijk (Foto: Barend van Maanen, Waterschap Roer en Overmaas) DRUK Kruyt Grafisch Adviesbureau STOWA rapportnummer 2012-31 ISBN 978.90.5773.569.1 COPYRIGHT De informatie uit dit rapport mag worden overgenomen, mits met bronvermelding. De in het rapport ontwikkelde, dan wel verzamelde kennis is om niet verkrijgbaar. De eventuele kosten die STOWA voor publicaties in rekening brengt, zijn uitsluitend kosten voor het vormgeven, vermenigvuldigen en verzenden. DISCLAIMER Dit rapport is gebaseerd op de meest recente inzichten in het vakgebied. Desalniettemin moeten bij toepassing ervan de resultaten te allen tijde kritisch worden beschouwd. De auteurs en STOWA IIkunnen niet aansprakelijk worden gesteld voor eventuele schade die ontstaat door toepassing van het III gedachtegoed uit dit rapport. STOWA 2012-31 REFERENTIES EN MAATLATTEN VOOR NATUURLIJKE WATERTYPEN VOOR DE KADERRICHTLIJN WATER 2015-2021 VOORWOORD De Kaderrichtlijn Water (KRW) beoogt onder meer de bescherming en verbetering van aqua- tische ecosystemen en duurzaam gebruik van water. Oppervlaktewateren dienen daarom een ‘goede ecologische toestand’ te bereiken. Bij het voorbereiden van de eerste generatie Stroomgebiedbeheerplannen (2009-2015) zijn de ‘goede ecologische toestand’ en de overige kwaliteitsklassen uitgewerkt in KRW-maatlatten voor natuurlijke watertypen. Op weg naar de tweede generatie Stroomgebiedbeheerplannen (2015-2021) zijn de KRW-maatlatten geëvalueerd en verder geharmoniseerd met de beoorde- lingsmethoden in het buitenland. Uit de evaluatie bleek dat een verbetering van de maatlat- ten gewenst was, om de transparantie van het proces van KRW-doelafleiding en de reprodu- ceerbaarheid en kwaliteit van de afgeleide KRW-doelen (GEP’s) te vergroten. Uit de harmo- nisatie bleek dat de ambitie op enkele onderdelen iets moest worden bijgesteld. Daarom zijn in opdracht van de Regiekolom de volgende (deel)maatlatten aangepast: fytoplankton in diepe meren (M20), fytobenthos in enkele stromende wateren (R7, R8, R12 – R18), macrofyten en vissen in stromende wateren (R-typen) en meren (M-typen), macrofauna in rivieren met ge- tijdeninvloed (R8) en in zwak brakke wateren (M30) en angiospermen, macrofauna en vissen in kust- en overgangswateren (O2, K1-K3). De aanpassingen zijn voorbereid door teams van technisch specialisten en afgestemd binnen de werkgroep Ecologische Maatlatten, met vertegenwoordiging van waterschappen, provin- cies, het Ministerie van I&M en de STOWA. De aanpassing van de vissenmaatlat is afgestemd met Sportvisserij Nederland. Voor u ligt de geactualiseerde versie van het document Referenties en maatlatten voor natuurlijke watertypen voor de Kaderrichtlijn Water, dat in het najaar 2012 is vastgesteld door de Regiekolom. De getalswaarden in dit rapport zijn de doelen voor de ‘natuurlijke’ watertypen. Deze doe- len zijn van toepassing bij de voorbereiding van de volgende planperiode (2015-2021). De Ministeriële regeling Monitoring onder het ’Besluit Kwaliteitseisen en Monitoring Water’ (BKMW) zal er te zijner tijd naar verwijzen. Rapporten en achtergronddocumenten zijn digitaal beschikbaar op www.helpdeskwater.nl en www.stowa.nl. De voorzitter van de werkgroep Ecologische Maatlatten namens STOWA Chiel Cuypers Bas van der Wal III STOWA 2012-31 REFERENTIES EN MAATLATTEN VOOR NATUURLIJKE WATERTYPEN VOOR DE KADERRICHTLIJN WATER 2015-2021 VOORWOORD BIJ DE TWEEDE DRUK (2016) In het najaar van 2012 is een geactualiseerde versie van het document Referenties en maat- latten voor natuurlijke watertypen voor de Kaderrichtlijn Water vastgesteld. Uit het gebruik van deze maatlatten en het programmeren van de Aquokit Biologie (webservice voor toetsen van ecologische kwaliteit met deze maatlatten ontwikkeld door het InformatieHuis Water) bleek dat er een aantal errata en verduidelijkingen nodig zijn om te zorgen voor een juiste en consistente toepassing van de maatlatten. Deze errata zijn doorgevoerd in de tweede druk van de maatlatten. In bijlage 14 is een overzicht opgenomen van de aanpassingen in de maatlat ten opzichte van de eerst druk. De tweede druk is alleen digitaal beschikbaar via www.stowa. nl en www.helpdeskwater.nl. De update van de maatlatten is uitgevoerd in opdracht van de Werkgroep Doelstellingen en is gefinancierd door STOWA en Rijkswaterstaat. Naast de errata is ook de voortdurende ontwikkeling van de TWN reden geweest voor een tweede druk van de maatlatdocumenten. De soortenlijsten zoals opgenomen in de maatlatdo- cumenten zijn statisch, terwijl de TWN-lijst in ontwikkeling blijft op basis van nieuwe inzich- ten. In de voorliggende versie is de stand van zaken voor de TWN opgenomen in oktober 2016. De soortenlijsten worden actueel gehouden in de Aquokit-Biologie van het IHW en niet in de maatlatdocumenten. De soortenlijsten in de Aquokit-Biologie zijn dus leidend. Voor een groot deel waren de errata en TWN-aanpassingen al verwerkt in QBWat. Deze her- ziening van de maatlatdocumenten zou niet tot grote veranderingen in de berekende EKR’s moeten leiden. Desondanks kunnen er door de aanpassingen aan de TWN en onjuist gebruik van soortnamen in de maatlatdocumenten door deze errata wel kleine veranderingen in de berekende EKR’s optreden. Namens de Werkgroep Doelstellingen namens STOWA Marcel Tonkes Bas van der Wal IV V STOWA 2012-31 REFERENTIES EN MAATLATTEN VOOR NATUURLIJKE WATERTYPEN VOOR DE KADERRICHTLIJN WATER 2015-2021 SAMENVATTING In december 2000 is de Europese Kaderrichtlijn Water (KRW) vastgesteld. Eén van de ver- plichtingen die voortvloeien uit de KRW is het beschrijven van de ecologische referentiesitu- atie. De referenties vormen het vertrekpunt voor de ecologische doelstelling van natuurlijke oppervlaktewatertypen. Er zijn echter nog meerdere stappen nodig om van de referenties te komen tot beleidsdoelstellingen van de actuele oppervlaktewaterlichamen in Nederland. De uiteindelijke doelstelling per waterlichaam is in 2009 in het Stroomgebiedbeheersplan vastgelegd. Hiervoor is de eerste versie van de referenties en maatlatten gebruikt (Van der Molen & Pot [red], 2007b). In deze nieuwe versie van de maatlatten zijn verbeteringen doorgevoerd en deze versie dient te worden gebruikt voor de doelafleiding en toestandsbepaling voor de tweede generatie Stroomgebiedsbeheersplannen (2015-2021). De Inleiding (Hoofdstuk 1) gaat in op de uitgangspunten. De Methode (Hoofdstuk 2) geeft een algemene uitwerking van de beoordelingssystematiek per biologisch kwaliteitselement. Vervolgens is per watertype een globale referentiebeschrijving gemaakt die samen met enkele foto’s een beeld geeft van de toestand van het type in nagenoeg onverstoorde omstandig- heden. Daarnaast zijn de referentie en de andere vier klassen van de maatlat
Load more

Recommended publications
  • The 2014 Golden Gate National Parks Bioblitz - Data Management and the Event Species List Achieving a Quality Dataset from a Large Scale Event
    National Park Service U.S. Department of the Interior Natural Resource Stewardship and Science The 2014 Golden Gate National Parks BioBlitz - Data Management and the Event Species List Achieving a Quality Dataset from a Large Scale Event Natural Resource Report NPS/GOGA/NRR—2016/1147 ON THIS PAGE Photograph of BioBlitz participants conducting data entry into iNaturalist. Photograph courtesy of the National Park Service. ON THE COVER Photograph of BioBlitz participants collecting aquatic species data in the Presidio of San Francisco. Photograph courtesy of National Park Service. The 2014 Golden Gate National Parks BioBlitz - Data Management and the Event Species List Achieving a Quality Dataset from a Large Scale Event Natural Resource Report NPS/GOGA/NRR—2016/1147 Elizabeth Edson1, Michelle O’Herron1, Alison Forrestel2, Daniel George3 1Golden Gate Parks Conservancy Building 201 Fort Mason San Francisco, CA 94129 2National Park Service. Golden Gate National Recreation Area Fort Cronkhite, Bldg. 1061 Sausalito, CA 94965 3National Park Service. San Francisco Bay Area Network Inventory & Monitoring Program Manager Fort Cronkhite, Bldg. 1063 Sausalito, CA 94965 March 2016 U.S. Department of the Interior National Park Service Natural Resource Stewardship and Science Fort Collins, Colorado The National Park Service, Natural Resource Stewardship and Science office in Fort Collins, Colorado, publishes a range of reports that address natural resource topics. These reports are of interest and applicability to a broad audience in the National Park Service and others in natural resource management, including scientists, conservation and environmental constituencies, and the public. The Natural Resource Report Series is used to disseminate comprehensive information and analysis about natural resources and related topics concerning lands managed by the National Park Service.
    [Show full text]
  • 2021 Tese Rmfranca.Pdf
    UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ CENTRO DE TECNOLOGIA DEPARTAMENTO DE ENGENHARIA HIDRÁULICA E AMBIENTAL PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ENGENHARIA CIVIL RAIMUNDA MOREIRA DA FRANCA ESTRUTURA FITOPLANCTÔNICA EM RESERVATÓRIOS CEARENSES - ASSOCIAÇÃO HIDROCLIMÁTICA E ESTADO TRÓFICO FORTALEZA-CE 2021 RAIMUNDA MOREIRA DA FRANCA ESTRUTURA FITOPLANCTÔNICA EM RESERVATÓRIOS CEARENSES – ASSOCIAÇÃO HIDROCLIMÁTICA E ESTADO TRÓFICO Tese de doutorado apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil da Universidade Federal do Ceará como parte dos requisitos à obtenção do título de doutora em Engenharia Civil (Recursos Hídricos). Área de concentração: Saneamento Ambiental. Orientador: Profº. Dr. Fernando José Araújo da Silva. FORTALEZA-CE 2021 RAIMUNDA MOREIRA DA FRANCA ESTRUTURA FITOPLANCTÔNICA EM RESERVATÓRIOS CEARENSES - ASSOCIAÇÃO HIDROCLIMÁTICA E ESTADO TRÓFICO Tese de doutorado apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Engenharia Civil da Universidade Federal do Ceará como parte dos requisitos à obtenção do título de doutora em Engenharia Civil (Recursos Hídricos). Área de concentração: Saneamento Ambiental. Aprovada em: 04/05/2021 BANCA EXAMINADORA ______________________________________________________ Prof. Dr. Fernando José Araújo da Silva (Orientador) Universidade Federal do Ceará (UFC) ________________________________________________________ Prof.ª. Dra. Marisete Dantas de Aquino (Examinadora Interna) Universidade Federal do Ceará (UFC) ________________________________________________________ Prof. Dr. Iran Eduardo Lima Neto (Examinador
    [Show full text]
  • Primer Reporte De Lemmermanniella Uliginosa (Synechococcaceae
    Revista peruana de biología 27(3): 401 - 405 (2020) Primer reporte de Lemmermanniella uliginosa (Sy- doi: http://dx.doi.org/10.15381/rpb.v27i3.17301 nechococcaceae, Cyanobacteria) en América del ISSN-L 1561-0837; eISSN: 1727-9933 Universidad Nacional Mayor de San Marcos sur, y primer reporte del género para Perú Nota científica First report of Lemmermanniella uliginosa (Synechococca- Presentado: 13/01/2020 ceae, Cyanobacteria) in South America, and the first record Aceptado: 12/03/2020 Publicado online: 31/08/2020 of the genus from Peru Editor: Autores Resumen Leonardo Humberto Mendoza-Carbajal El presente trabajo reporta por primera vez para el Perú a la cianobacteria bentónica [email protected] Lemmermanniella uliginosa, identificada en muestras de perifiton y sedimentos https://orcid.org/0000-0002-9847-2772 bentónicos procedentes del humedal de Caucato en el distrito de San Clemente, de- partamento de Ica. Además, se registra por primera vez al género Lemmermanniella Institución y correspondencia para el país. Se discuten aspectos morfo-taxonómicos de la especie comparándola Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Museo de con poblaciones reportadas para otras localidades en zonas tropicales. Historia Natural, Apartado 14-0434, Lima-15072, Perú. Abstract This work presents the first record of Lemmermmanniella uliginosa from Peru Citación based on periphyton and sediment samples from Caucato wetland (San Clemente district, Ica department). Furthermore, the genus Lemmermmanniella is recorded Mendoza-Carbajal LH. 2020. Primer reporte de Lem- for the first time for Peru. Morpho-taxonomic comparison with other populations mermanniella uliginosa (Synechococcaceae, reported in tropical regions is discussed. Cyanobacteria) en América del sur, y primer reporte del género para Perú.
    [Show full text]
  • Effects of Temperature, Light Intensity and Quality, Carbon Dioxide, and Culture Medium Nutrients on Growth and Lipid Production of Ettlia Oleoabundans
    Effects of Temperature, Light Intensity and Quality, Carbon Dioxide, and Culture Medium Nutrients on Growth and Lipid Production of Ettlia oleoabundans by Ying Yang A Dissertation Submitted to the Faculty of WORCESTER POLYTECHNIC INSTITUTE in partial fulfillment of the requirements for the degree of Doctor of Philosophy in Biology and Biotechnology by December 2013 Approved by: Dr. Pamela Weathers, Advisor Dr. Robert Thompson, Committee Member Dr. Luis Vidali, Committee Member Dr. Reeta Rao, Committee Member “A journey of a thousand miles begins with a single step.” — Lao Tzu (604 BC – 531 BC) ii Abstract Ettlia oleoabundans, a freshwater green microalga, was grown under different environmental conditions to study its growth, lipid yield and quality for a better understanding of the fundamental physiology of this oleaginous species. E. oleoabundans showed steady increase in biomass under low temperature and low light intensity, and at high temperature lipid cell content significantly increased independent of nitrate depletion. Studies on light quality showed that red light treatment did not change the biomass concentration, but stimulated lipid yield especially oleic acid, the most desirable biodiesel precursor. Moreover, no photoreversibility in lipid production was observed when applying alternating short-term red and far-red lights, which left the phytochrome effect still an open question. In addition, carbon dioxide enrichment via an air sparging system significantly boosted exponential growth and increased carbon conversion efficiency. Finally, a practical study demonstrated the feasibility of growing E. oleoabundans for high lipid production using a diluted agricultural anaerobic waste effluent as the medium. Together, these studies showed the potential of E. oleoabundans as a promising high yield feedstock for the production of high quality biodiesel.
    [Show full text]
  • Synechococcus Salsus Sp. Nov. (Cyanobacteria): a New Unicellular, Coccoid Species from Yuncheng Salt Lake, North China
    Bangladesh J. Plant Taxon. 24(2): 137–147, 2017 (December) © 2017 Bangladesh Association of Plant Taxonomists SYNECHOCOCCUS SALSUS SP. NOV. (CYANOBACTERIA): A NEW UNICELLULAR, COCCOID SPECIES FROM YUNCHENG SALT LAKE, NORTH CHINA 1 HONG-RUI LV, JIE WANG, JIA FENG, JUN-PING LV, QI LIU AND SHU-LIAN XIE School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China Keywords: New species; China; Synechococcus salsus; DNA barcodes; Taxonomy. Abstract A new species of the genus Synechococcus C. Nägeli was described from extreme environment (high salinity) of the Yuncheng salt lake, North China. Morphological characteristics observed by light microscopy (LM) and transmission electron microscopy (TEM) were described. DNA barcodes (16S rRNA+ITS-1, cpcBA-IGS) were used to evaluate its taxonomic status. This species was identified as Synechococcus salsus H. Lv et S. Xie. It is characterized by unicellular, without common mucilage, cells with several dispersed or solitary polyhedral bodies, widely coccoid, sometimes curved or sigmoid, rounded at the ends, thylakoids localized along cells walls. Molecular analyses further support its systematic position as an independent branch. The new species Synechococcus salsus is closely allied to S. elongatus, C. Nägeli, but differs from it by having shorter cell with length 1.0–1.5 times of width. Introduction Synechococcus C. Nägeli (Synechococcaceae, Cyanobacteria) was first discovered in 1849 and is a botanical form-genus comprising rod-shaped to coccoid cyanobacteria with the diameter of 0.6–2.1 µm that divide in one plane. It is a group of ultra-structural photosynthetic prokaryote and has the close genetic relationship with Prochlorococcus (Johnson and Sieburth, 1979), and both of them are the most abundant phytoplankton in the world’s oceans (Huang et al., 2012).
    [Show full text]
  • Table S4. Phylogenetic Distribution of Bacterial and Archaea Genomes in Groups A, B, C, D, and X
    Table S4. Phylogenetic distribution of bacterial and archaea genomes in groups A, B, C, D, and X. Group A a: Total number of genomes in the taxon b: Number of group A genomes in the taxon c: Percentage of group A genomes in the taxon a b c cellular organisms 5007 2974 59.4 |__ Bacteria 4769 2935 61.5 | |__ Proteobacteria 1854 1570 84.7 | | |__ Gammaproteobacteria 711 631 88.7 | | | |__ Enterobacterales 112 97 86.6 | | | | |__ Enterobacteriaceae 41 32 78.0 | | | | | |__ unclassified Enterobacteriaceae 13 7 53.8 | | | | |__ Erwiniaceae 30 28 93.3 | | | | | |__ Erwinia 10 10 100.0 | | | | | |__ Buchnera 8 8 100.0 | | | | | | |__ Buchnera aphidicola 8 8 100.0 | | | | | |__ Pantoea 8 8 100.0 | | | | |__ Yersiniaceae 14 14 100.0 | | | | | |__ Serratia 8 8 100.0 | | | | |__ Morganellaceae 13 10 76.9 | | | | |__ Pectobacteriaceae 8 8 100.0 | | | |__ Alteromonadales 94 94 100.0 | | | | |__ Alteromonadaceae 34 34 100.0 | | | | | |__ Marinobacter 12 12 100.0 | | | | |__ Shewanellaceae 17 17 100.0 | | | | | |__ Shewanella 17 17 100.0 | | | | |__ Pseudoalteromonadaceae 16 16 100.0 | | | | | |__ Pseudoalteromonas 15 15 100.0 | | | | |__ Idiomarinaceae 9 9 100.0 | | | | | |__ Idiomarina 9 9 100.0 | | | | |__ Colwelliaceae 6 6 100.0 | | | |__ Pseudomonadales 81 81 100.0 | | | | |__ Moraxellaceae 41 41 100.0 | | | | | |__ Acinetobacter 25 25 100.0 | | | | | |__ Psychrobacter 8 8 100.0 | | | | | |__ Moraxella 6 6 100.0 | | | | |__ Pseudomonadaceae 40 40 100.0 | | | | | |__ Pseudomonas 38 38 100.0 | | | |__ Oceanospirillales 73 72 98.6 | | | | |__ Oceanospirillaceae
    [Show full text]
  • In Four Shallow and Mesophotic Tropical Reef Sponges from Guam the Microbial Community Largely Depends on Host Identity
    In four shallow and mesophotic tropical reef sponges from Guam the microbial community largely depends on host identity Georg Steinert1,2, Michael W. Taylor3, Peter Deines3,4, Rachel L. Simister3,5, Nicole J. de Voogd6, Michael Hoggard3 and Peter J. Schupp1 1 Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment, Carl von Ossietzky Universität Oldenburg, Wilhelmshaven, Germany 2 Laboratory of Microbiology, Wageningen University, Wageningen, The Netherlands 3 School of Biological Sciences, University of Auckland, Auckland, New Zealand 4 Zoological Institute, Christian-Albrechts-University Kiel, Kiel, Germany 5 Department of Microbiology and Immunology, University of British Columbia, Vancouver, Canada 6 Naturalis Biodiversity Center, Leiden, The Netherlands ABSTRACT Sponges (phylum Porifera) are important members of almost all aquatic ecosystems, and are renowned for hosting often dense and diverse microbial communities. While the specificity of the sponge microbiota seems to be closely related to host phylogeny, the environmental factors that could shape differences within local sponge-specific communities remain less understood. On tropical coral reefs, sponge habitats can span from shallow areas to deeper, mesophotic sites. These habitats differ in terms of environmental factors such as light, temperature, and food availability, as well as anthropogenic impact. In order to study the host specificity and potential influence of varying habitats on the sponge microbiota within a local area, four tropical reef sponges, Rhabdastrella
    [Show full text]
  • Lateral Gene Transfer of Anion-Conducting Channelrhodopsins Between Green Algae and Giant Viruses
    bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.042127; this version posted April 23, 2020. The copyright holder for this preprint (which was not certified by peer review) is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity. It is made available under aCC-BY-NC-ND 4.0 International license. 1 5 Lateral gene transfer of anion-conducting channelrhodopsins between green algae and giant viruses Andrey Rozenberg 1,5, Johannes Oppermann 2,5, Jonas Wietek 2,3, Rodrigo Gaston Fernandez Lahore 2, Ruth-Anne Sandaa 4, Gunnar Bratbak 4, Peter Hegemann 2,6, and Oded 10 Béjà 1,6 1Faculty of Biology, Technion - Israel Institute of Technology, Haifa 32000, Israel. 2Institute for Biology, Experimental Biophysics, Humboldt-Universität zu Berlin, Invalidenstraße 42, Berlin 10115, Germany. 3Present address: Department of Neurobiology, Weizmann 15 Institute of Science, Rehovot 7610001, Israel. 4Department of Biological Sciences, University of Bergen, N-5020 Bergen, Norway. 5These authors contributed equally: Andrey Rozenberg, Johannes Oppermann. 6These authors jointly supervised this work: Peter Hegemann, Oded Béjà. e-mail: [email protected] ; [email protected] 20 ABSTRACT Channelrhodopsins (ChRs) are algal light-gated ion channels widely used as optogenetic tools for manipulating neuronal activity 1,2. Four ChR families are currently known. Green algal 3–5 and cryptophyte 6 cation-conducting ChRs (CCRs), cryptophyte anion-conducting ChRs (ACRs) 7, and the MerMAID ChRs 8. Here we 25 report the discovery of a new family of phylogenetically distinct ChRs encoded by marine giant viruses and acquired from their unicellular green algal prasinophyte hosts.
    [Show full text]
  • DOMAIN Bacteria PHYLUM Cyanobacteria
    DOMAIN Bacteria PHYLUM Cyanobacteria D Bacteria Cyanobacteria P C Chroobacteria Hormogoneae Cyanobacteria O Chroococcales Oscillatoriales Nostocales Stigonematales Sub I Sub III Sub IV F Homoeotrichaceae Chamaesiphonaceae Ammatoideaceae Microchaetaceae Borzinemataceae Family I Family I Family I Chroococcaceae Borziaceae Nostocaceae Capsosiraceae Dermocarpellaceae Gomontiellaceae Rivulariaceae Chlorogloeopsaceae Entophysalidaceae Oscillatoriaceae Scytonemataceae Fischerellaceae Gloeobacteraceae Phormidiaceae Loriellaceae Hydrococcaceae Pseudanabaenaceae Mastigocladaceae Hyellaceae Schizotrichaceae Nostochopsaceae Merismopediaceae Stigonemataceae Microsystaceae Synechococcaceae Xenococcaceae S-F Homoeotrichoideae Note: Families shown in green color above have breakout charts G Cyanocomperia Dactylococcopsis Prochlorothrix Cyanospira Prochlorococcus Prochloron S Amphithrix Cyanocomperia africana Desmonema Ercegovicia Halomicronema Halospirulina Leptobasis Lichen Palaeopleurocapsa Phormidiochaete Physactis Key to Vertical Axis Planktotricoides D=Domain; P=Phylum; C=Class; O=Order; F=Family Polychlamydum S-F=Sub-Family; G=Genus; S=Species; S-S=Sub-Species Pulvinaria Schmidlea Sphaerocavum Taxa are from the Taxonomicon, using Systema Natura 2000 . Triochocoleus http://www.taxonomy.nl/Taxonomicon/TaxonTree.aspx?id=71022 S-S Desmonema wrangelii Palaeopleurocapsa wopfnerii Pulvinaria suecica Key Genera D Bacteria Cyanobacteria P C Chroobacteria Hormogoneae Cyanobacteria O Chroococcales Oscillatoriales Nostocales Stigonematales Sub I Sub III Sub
    [Show full text]
  • Diapositive 1
    1 Diversity and ecology of green microalgae in marine systems: 2 an overview based on 18S rRNA sequences 3 4 Margot Tragin1, Adriana Lopes dos Santos1, Richard Christen2, 3, Daniel Vaulot1* 5 1 Sorbonne Universités, UPMC Univ Paris 06, CNRS, UMR 7144, Station Biologique, Place 6 Georges Teissier, 29680 Roscoff, France 7 2 CNRS, UMR 7138, Systématique Adaptation Evolution, Parc Valrose, BP71. F06108 Nice 8 cedex 02, France 9 3 Université de Nice-Sophia Antipolis, UMR 7138, Systématique Adaptation Evolution, Parc 10 Valrose, BP71. F06108 Nice cedex 02, France 11 12 13 * corresponding author : [email protected] 14 Revised version : 28 March 2016 15 For Perspectives in Phycology 16 17 Tragin et al. - Marine Chlorophyta diversity and distribution - p. 2 18 Abstract 19 Green algae (Chlorophyta) are an important group of microalgae whose diversity and ecological 20 importance in marine systems has been little studied. In this review, we first present an overview of 21 Chlorophyta taxonomy and detail the most important groups from the marine environment. Then, using 22 public 18S rRNA Chlorophyta sequences from culture and natural samples retrieved from the annotated 23 Protist Ribosomal Reference (PR²) database, we illustrate the distribution of different green algal 24 lineages in the oceans. The largest group of sequences belongs to the class Mamiellophyceae and in 25 particular to the three genera Micromonas, Bathycoccus and Ostreococcus. These sequences originate 26 mostly from coastal regions. Other groups with a large number of sequences include the 27 Trebouxiophyceae, Chlorophyceae, Chlorodendrophyceae and Pyramimonadales. Some groups, such as 28 the undescribed prasinophytes clades VII and IX, are mostly composed of environmental sequences.
    [Show full text]
  • DIMITAR VALEV: Wastewater Treatment with Algae Doctoral Dissertation, 118 Pp
    ANNALES UNIVERSITATIS TURKUENSIS UNIVERSITATIS ANNALES AI 627 AI Dimitar Valev WASTEWATER TREATMENT WITH ALGAE Dimitar Valev Painosalama Oy, Turku, Finland 2020 Finland Turku, Oy, Painosalama ISBN 978-951-29-8094-9 (PRINT) – ISBN 978-951-29-8095-6 (PDF) TURUN YLIOPISTON JULKAISUJA ANNALES UNIVERSITATIS TURKUENSIS ISSN 0082-7002 (Print) SARJA – SER. AI OSA – TOM. 627 | ASTRONOMICA – CHEMICA – PHYSICA – MATHEMATICA | TURKU 2020 ISSN 2343-3175 (Online) WASTEWATER TREATMENT WITH ALGAE Dimitar Valev TURUN YLIOPISTON JULKAISUJA – ANNALES UNIVERSITATIS TURKUENSIS SARJA – SER. AI OSA – TOM. 627 | ASTRONOMICA – CHEMICA – PHYSICA – MATHEMATICA | TURKU 2020 University of Turku Faculty of Science and Engineering Department of Biochemistry / Molecular Plant Biology Doctoral programme in Molecular Life Sciences Supervised by Dr. Esa Tyystjärvi Dr. Taina Tyystjärvi Department of Biochemistry / Department of Biochemistry / Molecular Plant Biology, Molecular Plant Biology, University of Turku, FI-20014 University of Turku, FI-20014 Turku, Finland Turku, Finland Dr. Taras Antal Department of Botany and Plant Ecology Pskov State University Pskov 180000 Russia Reviewed by Professor Amit Bhatnagar Professor Koenraad Muylaert Water Chemistry & Microbiology Laboratory of Aquatic Biology University of Eastern Finland KU Leuven Kuopio, Finland Kortrijk, Belgium Opponent Professor Ondřej Prášil Centre Algatech Institute of Microbiology, The Czech Academy of Sciences Třeboň, Czech Republic The originality of this publication has been checked in accordance with the University of Turku quality assurance system using the Turnitin OriginalityCheck service. ISBN 978-951-29-8094-9 (PRINT) ISBN 978-951-29-8095-6 (PDF) ISSN 0082-7002 (Painettu/Print) ISSN 2343-3175 (Sähköinen/Online) Painosalama Oy, Turku, Finland 2020 UNIVERSITY OF TURKU Faculty of Science and Engineering Department of Biochemistry Molecular Plant Biology DIMITAR VALEV: Wastewater treatment with algae Doctoral Dissertation, 118 pp.
    [Show full text]
  • Kombinationswirkung Der Beiden Pflanzenschutzmittel Karate Zeon
    Kombinationswirkung der beiden Pflanzenschutzmittel Karate® Zeon und Callisto® in aquatischen Modellökosystemen Inauguraldissertation zur Erlangung des Doktorgrades der Naturwissenschaften im Fachbereich Geowissenschaften der Westfälischen Wilhelms-Universität Münster vorgelegt von Rabea Christmann Dekan: Prof. Dr. Hans Kerp Erster Gutachter: Prof. Dr. Klaus Peter Ebke Zweiter Gutachter Prof. Dr. Dr. Wilfried Huber Dritter Gutachter Prof. Dr. Hermann Mattes Tag der mündlichen Prüfung: 05. Februar 2014 Tag der Promotion: ____________________________ INHALTSVERZEICHNIS Zusammenfassung .................................................................................................................. III Abstract .................................................................................................................................... V 1 Einleitung .......................................................................................................................... 1 1.1 Pflanzenschutzmittel-Zulassung .................................................................................. 2 1.2 Problematik Mischungstoxizität .................................................................................. 4 1.3 Testsubstanzen ............................................................................................................. 7 1.3.1 Insektizid – Karate® Zeon .................................................................................... 7 1.3.2 Herbizid – Callisto® ..........................................................................................
    [Show full text]