Report on the State of Animal Genetic Resources in Italy
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Piano Di Sviluppo Rurale 2000 – 2006 Allegati
ALLEGATO 1 alla deliberazione n……….del…. composto da 377 pagine Direzione Generale Agricoltura Piano di sviluppo rurale 2000 – 2006 Allegati 269 ALLEGATO 1 alla deliberazione n……….del…. composto da 377 pagine Elenco dei Comuni ricadenti in zone svantaggiate pag. 271 Elenco delle aree eligibili all’Obiettivo 2 pag. 277 Elenco dei Comuni appartenenti al territorio classificato di bonifica pag. 281 Giustificazione economica degli indennizzi per il sostegno delle misure agroambientali pag. 290 Principi generali di normale buona pratica agricola nella Regione Lombardia pag. 311 Requisiti minimi in materia di ambiente, igiene e benessere degli animali pag. 324 Approfondimento sulla presenza femminile nell’agricoltura Lombarda pag. 326 Elenco delle Razze in via di estinzione pag. 331 Sbocchi di mercato: pag. 342 1 Settore carne 2 Settore latte 3 Settore vitivinicolo 4 Settore ortofrutta 5 Settore cereali 6 Settore olio di oliva 7 Settore uova 8 Settore florovivaismo 9 Settore alimenti per animali Elenco dei Siti di Importanza Comunitaria e delle Zone di Protezione Speciale individuati ai sensi delle Dir. 92/43/CEE e 79/409/CEE proposti per la Regione Lombardia pag. 373 270 ALLEGATO 1 alla deliberazione n……….del…. composto da 377 pagine Allegato 1 Elenco dei Comuni ricadenti in area svantaggiata Provincia di Bergamo - Adrara San Martino - Cusio - Adrara San Rocco - Dossena - Albino - Endine Gaiano - Almenno San Bartolomeo - Entratico - Almenno San Salvatore - Fino del Monte - Algua - Fiorano al Serio - Alzano Lombardo - Fonteno - Ardesio - Foppolo -
Keep Garfagnina Alive. an Integrated Study on Patterns of Homozygosity, Genomic
bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.16.044644; this version posted April 16, 2020. The copyright holder for this preprint (which was not certified by peer review) is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity. It is made available under aCC-BY 4.0 International license. 1 Keep Garfagnina alive. An integrated study on patterns of homozygosity, genomic 2 inbreeding, admixture and breed traceability of the Italian Garfagnina goat breed. 3 4 5 Christos Dadousis1,*, Francesca Cecchi2, Michela Ablondi1, Maria Chiara Fabbri3, 6 Alessandra Stella4,5, Riccardo Bozzi3 7 8 9 1 Dipartimento di Scienze Medico‐Veterinarie, Università di Parma, Parma, Italy. 10 2 Dipartimento di Scienze Veterinarie, Università di Pisa, Italy. 11 3 Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agrarie, Alimentari, Ambientali e Forestali, 12 Università di Firenze, Firenze, 50144, Italy. 13 4 Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria, Consiglio Nazionale delle Ricerche, 14 Milano, Italy. 15 5 Fondazione Parco Tecnologico Padano, Lodi, Italy. 16 17 18 * Corresponding author: 19 Email: [email protected] (CD) 20 ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-7689-6443 21 1 bioRxiv preprint doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.16.044644; this version posted April 16, 2020. The copyright holder for this preprint (which was not certified by peer review) is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity. It is made available under aCC-BY 4.0 International license. 1 Abstract 2 The objective of this study was to investigate the genomic background of the 3 Garfagnina (GRF) goat breed that faces the risk of extinction. -
Produzione E Qualità Del Latte in Capre Autoctone Allevate Estensivamente Nella Regione Molise J
Casamassima_imp 25-09-2009 10:26 Pagina 165 D. Casamassima et al. Large Animal Review 2009; 15: 165-174 165 Produzione e qualità del latte in capre autoctone allevate estensivamente nella regione Molise j D. CASAMASSIMA, M. PALAZZO, T. PRESUTTI, R. PIZZO Department of Animal, Vegetal and Environmental Sciences, University of Molise, Italy RIASSUNTO La ricerca ha riguardato la valutazione quanti-qualitativa di latte, con particolare riferimento alla composizione acidica e ad al- cune molecole ad attività bionutrizionale, la lattoferrina (LF) ed il contenuto in isomeri coniugati dell’acido linoleico (CLA), nel latte di due popolazioni autoctone molisane a forte rischio di estinzione, la capra di Montefalcone e la capra Valfortorina. La sperimentazione, della durata di 7 mesi, è stata condotta su 60 capre in lattazione appartenenti ai due tipi genetici caprini, ed ha riguardato la determinazione, ad intervalli mensili, della produzione e qualità del latte, della composizione acidica, del contenuto in CLA (cis9, trans11 e trans10, cis12) e della lattoferrina. La produzione del latte, nell’intera prova, è stata di 275,6 kg e 258,3 kg per la capra di Montefalcone e Valfortorina rispettivamente. La qualità del latte, relativamente ad alcuni suoi com- ponenti, si è attestata su valori di 4,46 e 3,97% per il contenuto in grassi e su valori del 3,64 e 3,59% per il contenuto in pro- teine rispettivamente nei due gruppi etnici. Nel corso della prova, i PUFA ed i MUFA sono aumentati statisticamente (P<0,001), in entrambi i tipi genetici, mentre gli SFA sono diminuiti (P<0,001). -
La Capra Girgentana L’Indirizzo Produttivo È Principalmente Quello Della Produzione Di Latte Che Viene Destinato Sia Al Consumo Diretto Che Alla Caseifi Cazione
Razze zootecniche in pericolo di estinzione: la capra Girgentana L’indirizzo produttivo è principalmente quello della produzione di latte che viene destinato sia al consumo diretto che alla caseifi cazione. La produzione di carne è rappresentata dai capretti da latte La razza caprina Girgentana La capra deve la sua denominazione Girgentana a «Girgenti», oggi Agrigen- presenta to, capoluogo della omonima corna provincia, dove un tempo que- caratteristiche sta capra era assai diffusa. a forma di spirale, LA CONSISTENZA portate da entrambi La capra Girgentana dal 1998 fi gura i sessi. nel Libro genealogico della specie capri- L’altezza na e la sua consistenza si attesta attual- al garrese mente su circa 800 capi. (freccia) è di 80 cm LE CARATTERISTICHE per le femmine e di 85 cm La capra Girgentana è un animale di per i maschi taglia media, con testa piccola e legge- ra, profi lo fronto-nasale camuso (legger- mente concavo) per lo sviluppo pronun- ciato delle ossa frontali. Si caratterizza per la presenza di barba sia nel maschio che nella femmina. Le corna, presenti in duzione del latte (400-450 kg per latta- ti parte integrante dell’abitazione, in cui entrambi i sessi, sono tipiche a forma di zione, che dura 150-180 giorni) che vie- l’allevatore risiedeva con la famiglia. Le spirale, quasi verticali, pressoché unite ne destinato sia al consumo diretto che nuove norme in materia di sanità e il con- alla base, molto sviluppate nei maschi. alla caseifi cazione (caprino girgentano, seguente divieto di stabulazione delle ca- Il colore del mantello è bianco con la caprini freschi, caprino siciliano, cane- pre entro i centri abitati non ha cambiato fronte e i mascellari di colore fulvo e rara- straio siciliano misto). -
Genome-Wide Analysis Reveals Selection Signatures Involved in Meat Traits and Local Adaptation in Semi-Feral Maremmana Cattle
Genome-Wide Analysis Reveals Selection Signatures Involved in Meat Traits and Local Adaptation in Semi-Feral Maremmana Cattle Slim Ben-Jemaa, Gabriele Senczuk, Elena Ciani, Roberta Ciampolini, Gennaro Catillo, Mekki Boussaha, Fabio Pilla, Baldassare Portolano, Salvatore Mastrangelo To cite this version: Slim Ben-Jemaa, Gabriele Senczuk, Elena Ciani, Roberta Ciampolini, Gennaro Catillo, et al.. Genome-Wide Analysis Reveals Selection Signatures Involved in Meat Traits and Local Adaptation in Semi-Feral Maremmana Cattle. Frontiers in Genetics, Frontiers, 2021, 10.3389/fgene.2021.675569. hal-03210766 HAL Id: hal-03210766 https://hal.inrae.fr/hal-03210766 Submitted on 28 Apr 2021 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. Distributed under a Creative Commons Attribution| 4.0 International License ORIGINAL RESEARCH published: 28 April 2021 doi: 10.3389/fgene.2021.675569 Genome-Wide Analysis Reveals Selection Signatures Involved in Meat Traits and Local Adaptation in Semi-Feral Maremmana Cattle Slim Ben-Jemaa 1, Gabriele Senczuk 2, Elena Ciani 3, Roberta -
101889 Sp Vol II 426-427
158 RAZAS EUROPEAS DE GANADO BOVINO CARACTERÍSTICAS FUNCIONALES Esta raza se ha conservado solamente por su aptitud al combate y todas las demás características están subordinadas a ésta. Inclu- sive las hembras de casta han de haber pasado una tienta destinada a determinar su bravura y su agresividad, y cuando las vacas están con sus terneros únicamente cabe acercarse a ellas con cuidado pues detestan a los intrusos y sus reacciones son rápidas y fieras. Mu- chas vacas paren únicamente cada dos arios. Los machos que poseen el vigor y la agresividad necesarios se destinan a la lidia. Los animales de ambos sexos que son más tími- dos y dóciles, se eliminan en unas pruebas especiales y a veces se venden para el matadero. Los rendimientos a la canal son a menudo sorprendentemente buenos y pueden alcanzar hasta el 60 por ciento, pero la canal contiene una gran proporción de cortes delanteros cuya calidad gastronómica es inferior. ORGANIZACIÓN DE LA CRIANZA La Unión de Criadores de Toros de Lidia desapareció durante la guerra civil y más tarde se sustituyó por el Subgrupo de Criadores de Toros de Lidia perteneciente al Sindicato Vertical de Ganadería. Dicho Subgrupo se divide en tres zonas, a saber:Centro, Sur y Salamanca, y los criadores pueden clasificarse en varias categorías según las características de las plazas en donde sus toros tengan que combatir. No esfácil conseguir datos fidedignos sobreel número de animales de esta raza, pero se emplean anualmente unos 7.500 toros en las plazas de toros reconocidas oficialmente en España y la pobla- ción total es probablemente de unos 70.000 animales. -
The Climatic and Genetic Heritage of Italian Goat Breeds with Genomic
www.nature.com/scientificreports OPEN The climatic and genetic heritage of Italian goat breeds with genomic SNP data Matteo Cortellari 1,16, Mario Barbato2,16, Andrea Talenti1,3*, Arianna Bionda1, Antonello Carta4, Roberta Ciampolini5, Elena Ciani6, Alessandra Crisà7, Stefano Frattini1, Emiliano Lasagna8, Donata Marletta9, Salvatore Mastrangelo10, Alessio Negro1, Ettore Randi11, Francesca M. Sarti8, Stefano Sartore12, Dominga Soglia12, Luigi Liotta13, Alessandra Stella14, Paolo Ajmone‑Marsan2, Fabio Pilla15, Licia Colli2 & Paola Crepaldi1 Local adaptation of animals to the environment can abruptly become a burden when faced with rapid climatic changes such as those foreseen for the Italian peninsula over the next 70 years. Our study investigates the genetic structure of the Italian goat populations and links it with the environment and how genetics might evolve over the next 50 years. We used one of the largest national datasets including > 1000 goats from 33 populations across the Italian peninsula collected by the Italian Goat Consortium and genotyped with over 50 k markers. Our results showed that Italian goats can be discriminated in three groups refective of the Italian geography and its geo‑political situation preceding the country unifcation around two centuries ago. We leveraged the remarkable genetic and geographical diversity of the Italian goat populations and performed landscape genomics analysis to disentangle the relationship between genotype and environment, fnding 64 SNPs intercepting genomic regions linked to growth, circadian rhythm, fertility, and infammatory response. Lastly, we calculated the hypothetical future genotypic frequencies of the most relevant SNPs identifed through landscape genomics to evaluate their long‑term efect on the genetic structure of the Italian goat populations. -
Harmful Mutational Load in the Mitogenomes of Cattle Breeds
Harmful mutational load in the mitogenomes of cattle breeds Sankar Subramanian GeneCology Research Centre, School of Science and Engineering, The University of the Sunshine Coast, Moreton Bay, QLD 4502, Australia Supporting Information Table S1. List of Mitochondrial genomes used in the study Accession Accession Accession no. Breed no. Breed no. Breed AY676862 Angus-X MN200832 Brahman JN817322 Domiaty AY676863 Angus-X MN200833 Brahman JN817323 Domiaty AY676864 Angus-X MN200834 Brahman JN817324 Domiaty AY676865 Angus-X MN200836 Brahman KT184452 Domiaty AY676866 Angus-X MN200889 Brahman KT184456 Domiaty AY676867 Angus-X EU177840 Cabannina KT184457 Domiaty AY676868 Angus-X EU177850 Cabannina KT184460 Domiaty AY676869 Angus-X EU177851 Cabannina KT184462 Domiaty AY676870 Angus-X EU177866 Cabannina KT184463 Domiaty AY676871 Angus-X EU177867 Cabannina KT184469 Domiaty AY676872 Angus-X HQ184038 Cabannina KT184470 Domiaty AY676873 Angus-X EU177816 Chianina KT184471 Domiaty DQ124387 Beef EU177818 Chianina KT184472 Domiaty DQ124388 Beef EU177819 Chianina DQ124404 Holstein-Friesian DQ124390 Beef EU177820 Chianina DQ124405 Holstein-Friesian DQ124391 Beef EU177822 Chianina DQ124406 Holstein-Friesian DQ124392 Beef EU177825 Chianina DQ124407 Holstein-Friesian DQ124393 Beef EU177828 Chianina DQ124408 Holstein-Friesian DQ124394 Beef EU177841 Chianina DQ124409 Holstein-Friesian DQ124395 Beef EU177845 Chianina DQ124410 Holstein-Friesian DQ124396 Beef EU177846 Chianina DQ124411 Holstein-Friesian DQ124397 Beef EU177853 Chianina DQ124412 Holstein-Friesian DQ124398 -
Local Adaptations of Mediterranean Sheep and Goats Through an Integrative Approach
Supplemental Information for: Local adaptations of Mediterranean sheep and goats through an integrative approach Bruno Serranito 1,2# , Marco Cavalazzi 3# , Pablo Vidal 4, Dominique Taurisson-Mouret 5, Elena Ciani 6, Marie Bal 3, Eric Rouvellac 3, Bertrand Servin 7, Carole Moreno-Romieux 7, Gwenola Tosser-Klopp 7, Stephen J. G. Hall 8, Johannes A. Lenstra 9, François Pompanon 10 , Badr Benjelloun 10,11 , Anne Da Silva 1* #: Serranito B. and Cavalazzi M. should be considered joint first author * Correspondence: [email protected] Table of Contents: Supplementary Table 1. Initial list breeds for the constitution of the datasets. Page 1 Supplementary Figure 1. Synthetic schema of the main steps for the Page 2 proposed approach. Supplementary Figure 2. Goat and sheep cradles description as a function of Pages 3-4 environmental variables: Synthetic descriptions of cradles and some characteristic breed phenotypic traits. Supplementary Table 2. Description of the breeds included in the sheep and Pages 5 -16 goat datasets. Number of individuals considered, country of origin, information on the breed history, geographical definition of the cradle, description of the breed, use and status. Supplementary Figure 3. LD analyses for sheep and goats. Page 17 Supplementary Text 1. Genetic structure assessment: admixture analyses, Pages 18 -20 sNMF cross-entropies and Mantel tests. Supplementary Figure 4 . Mapping display for sheep and goats, of the Pages 21 -22 geographical cradles and the GPS coordinates of the sampled points; statistical comparisons for the variables Annual Mean Temperature, Annual Mean Precipitation and Altitude between the distributions obtained by the cradle method and the GPS area method, display of the results via boxplots. -
Tesi Finale Dottorato
INDICE GENERALE 1. INTRODUZIONE............................................................................................................................3 1.1. La tracciabilità dei prodotti di origine animale: alcuni elementi.........................................3 1.2. Elementi di genetica molecolare..........................................................................................4 1.2.1. I marcatori genetici.......................................................................................................4 1.2.2. Lo stato di avanzamento nello studio del genoma degli animali di interesse zootecnico...............................................................................................................................6 1.3. Tracciabilità dei prodotti di origine animale e genetica molecolare....................................8 1.4. I prodotti “monorazza”.......................................................................................................10 1.5. Genetica e biochimica del colore del mantello: alcuni elementi........................................16 1.6. Genetica molecolare e colore del mantello........................................................................19 1.6.1. Il gene MC1R nella specie bovina.............................................................................21 1.6.2. Il gene MC1R nella specie suina................................................................................26 1.6.3. Il gene KIT nella specie bovina..................................................................................26 -
Revisiting AFLP Fingerprinting for an Unbiased Assessment of Genetic
Utsunomiya et al. BMC Genetics 2014, 15:47 http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/47 RESEARCH ARTICLE Open Access Revisiting AFLP fingerprinting for an unbiased assessment of genetic structure and differentiation of taurine and zebu cattle Yuri Tani Utsunomiya1†, Lorenzo Bomba2†, Giordana Lucente2, Licia Colli2,3, Riccardo Negrini2, Johannes Arjen Lenstra4, Georg Erhardt5, José Fernando Garcia1,6, Paolo Ajmone-Marsan2,3* and European Cattle Genetic Diversity Consortium Abstract Background: Descendants from the extinct aurochs (Bos primigenius), taurine (Bos taurus) and zebu cattle (Bos indicus) were domesticated 10,000 years ago in Southwestern and Southern Asia, respectively, and colonized the world undergoing complex events of admixture and selection. Molecular data, in particular genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) markers, can complement historic and archaeological records to elucidate these past events. However, SNP ascertainment in cattle has been optimized for taurine breeds, imposing limitations to the study of diversity in zebu cattle. As amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers are discovered and genotyped as the samples are assayed, this type of marker is free of ascertainment bias. In order to obtain unbiased assessments of genetic differentiation and structure in taurine and zebu cattle, we analyzed a dataset of 135 AFLP markers in 1,593 samples from 13 zebu and 58 taurine breeds, representing nine continental areas. Results: We found a geographical pattern of expected heterozygosity in European taurine breeds decreasing with the distance from the domestication centre, arguing against a large-scale introgression from European or African aurochs. Zebu cattle were found to be at least as diverse as taurine cattle. -
Effect of Breed on Proximate Composition and Fatty Acid Composition of Meat from Italian Cattle
EFFECT OF BREED ON PROXIMATE COMPOSITION AND FATTY ACID COMPOSITION OF MEAT FROM ITALIAN CATTLE Meo Zilio, D. 1, Contò, M. 1, Ballico, S. 1, Ficco A. 1, Failla, S. 1 1 Center for Research and Experimentation in Agriculture, Department of Meat Production and Genetic Improvement (CRA- PCM), Monterotondo Scalo, 00015, Rome, Italy Abstract — Interest in meat fatty acid profile, even though, due to its multiple purpose composition comes from interest in eating aptitude, other specialized beef breed are often healthier meat, i.e. with a higher ratio of preferred by farmers and traders. On the other polyunsaturated (PUFA) to saturated fatty acids hand the use of Holstein male calves for and a more favourable balance between n6 and n3 fattening and meat production is very common. PUFA. The aim of this study was to compare three different bovine genetic types, Maremmana It is characterized by a fast growth and (MM), Chianina (CH) and Italian Holstein (FR) development and produces carcasses and meat on the base of their nutritional fat properties. fatter than typical beef breeds. In particular dairy Meat fatty acid profile was determined by gas breeds deposit more intramuscular fat in relation chromatography analysis. Main fatty acids and to total fat [1]. This characteristic strongly conjugated linoleic acid (CLA), saturated (SFA), influences consumers who prefer meat with monounsatured (MUFA) and polyunsatured good nutritional and organoleptic properties [2]. (PUFA) total were reported. Analysis of obtained From this point of view it is very important to data showed Maremmana breed as a carrier of reduce the saturated fatty acid intake and an some good features in this sense (e.g., low increase of polyunsaturated fatty acids with saturated fatty acid content and high oleic acid contribution) allowing it to play an important role particular regard to n3 (C18:3, C20:5 and in meat cattle breed.