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Camille Puech Préparée À L’Unité De Recherche U.R

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Camille Puech Préparée À L’Unité De Recherche U.R ANNÉE 2014 THÈSE / UNIVERSITÉ DE RENNES 1 sous le sceau de l’Université Européenne de Bretagne pour le grade de DOCTEUR DE L’UNIVERSITÉ DE RENNES 1 Mention : Biologie Ecole doctorale (Vie-Agro-Santé) présentée par Camille Puech Préparée à l’unité de recherche U.R. 0980 INRA SAD-Paysage Observatoire des Sciences de l’Univers de Rennes Thèse soutenue à Rennes Hétérogénéité des le 15 décembre 2014 pratiques agricoles devant le jury composé de : Jean-Marc MEYNARD biologiques et Directeur de Recherche, INRA Rapporteur conventionnelles David BOHAN Directeur de Recherche, INRA dans les paysages Rapporteur Pierre FRANCK Chargé de Recherche, INRA bretons: effets sur les Examinateur Anne LE RALEC communautés Professeure, Agrocampus Ouest Examinatrice d’insectes auxiliaires Jacques BAUDRY Directeur de Recherche, INRA à différentes échelles Directeur de thèse Stéphanie AVIRON Chargée de recherche, INRA Co-directrice de thèse Hétérogénéité des pratiques agricoles biologiques et conventionnelles dans les paysages bretons: effets sur les communautés d’insectes auxiliaires à différentes échelles _______________________ _______________________ Heterogeneity of organic and conventional farming practices in agricultural landscapes in Brittany: effects on natural enemy communities at different scales Remerciements REMERCIEMENTS Une thèse, ça fait peur… C’est une longue épreuve dont chaque doctorant ressort transformé à sa façon. J’ai la chance de pouvoir affirmer que la thèse a été pour moi une expérience aussi enrichissante que palpitante, qui m’a apporté beaucoup de choses, aussi bien sur le plan scientifique que personnel. Je suis convaincue que cette réussite repose en grande partie sur les personnes qui m’ont entourée de près ou de loin pendant ces trois années et à qui je me dois de dire MERCI ! MERCI à mes deux encadrants, Jacques et Stéphanie. Merci d’avoir créé ce sujet de thèse passionnant qui m’a tenue en haleine pendant trois ans et sur lequel j’ai l’intention de construire la suite de mon parcours professionnel. Sur le plan scientifique, j’ai énormément bénéficié de vos connaissances et de votre expérience en tant qu’écologues. Sur le plan personnel, j’ai apprécié votre complémentarité, votre disponibilité et votre écoute. Merci de m’avoir fait suffisamment confiance pour me laisser des libertés, tout en étant présents dans les moments difficiles. Merci également pour votre bonne humeur et votre humour, j’ai beaucoup apprécié les moments de détente partagés à vos côtés MERCI à Sylvain Poggi, qui a été mon mentor statisticien. J’ai énormément appris en travaillant avec vous. Grâce à vos compétences scientifiques et à vos qualités pédagogiques, j’ai aimé faire des statistiques (et c’était pas gagné d’avance…). MERCI aux membres de mon comité de thèse, Yannick Outreman, Muriel Valantin- Morison, Aude Vialatte, Stanislas Lubac, Philippe Jeanneret et Marie Gosme. Grâce à vos conseils avisés, mes deux comités ont constitué des moments essentiels de mon parcours de thèse, qui ont significativement enrichi mon travail. Je remercie particulièrement Yannick Outreman, pour avoir rempli son rôle de tuteur de thèse avec professionnalisme. MERCI à Jean-Marc Meynard, David Bohan, Pierre Franck et Anne Le Ralec d’avoir accepté de juger mon travail. J’espère que vous prendrez plaisir à le parcourir et qu’il sera la base de discussions intéressantes. MERCI à toutes les personnes qui m’on aidée pour la construction de mes protocoles d’échantillonnage, Megan Woltz, Pavel Kindlmann, Fréderic Noël, Johanna Villenave, Jean-Pierre Coutanceau, Joan Van Baaren, Tiago Andrade, Majida El 7 Remerciements Souki, Dyab Hasan et Alix Deleglise. Merci d’avoir consacré du temps à partager vos expériences de terrain. MERCI à mes stagiaires, Maxime, Elisabeth, Maëva, Etienne et Zoé, parce que sans vous, pas de données, sans données, pas de résultats, et sans résultats, pas de thèse ! Merci pour votre enthousiasme et votre motivation débordante à crapahuter sur le terrain, trier des insectes et cartographier des paysages… Merci à ceux qui m’ont apporté une aide ponctuelle mais indispensable sur le terrain, Marie, Béné, Ambre, Jean-Luc, Gilles, Elven, Annabelle, Simon, Hugo, Nicolas et Noémie. Enfin, merci à Alexia, pour notre collaboration de terrain réussie. J’ai gagné un temps précieux grâce ton aide, et puis trier des carabes, c’est beaucoup plus sympa à deux MERCI à Bernard Chaubet, pour m’avoir transmis une partie de vos précieuses connaissances sur les parasitoïdes. Merci de m’avoir fait une petite place dans votre labo, où j’ai aimé passer des heures à identifier des parasitoïdes… Merci également à Jean-Luc, pour ta gentillesse et tes compétences dignes des meilleurs experts carabidophiles (Jeannel n’a qu’à bien se tenir !). Un grand merci à Hugues, pour m’avoir appris les rudiments de la programmation sous Python (c’était pas gagné non plus…) et pour m’avoir fait gagner un temps précieux (des heures, que dis-je… des jours, des semaines !) grâce à tes scripts magiques. J’ai apprécié ta disponibilité et ta patience. Merci à Alexandre, pour m’avoir appris les rudiments de l’agronomie, tes conseils m’ont été précieux. Merci à Laure, pour avoir identifié mes carabes avec amour Enfin, merci à Marie-Do et Ghislaine pour vos supers pouvoirs administratifs, et à Maryvonne et Nausicaa pour les dépannages informatiques. MERCI à tous les agriculteurs que j’ai été amenée à rencontrer pour ce travail de thèse. La découverte du « monde de l’agriculture » a été pour moi un véritable saut dans le grand bain. J’ai énormément apprécié l’accueil et l’enthousiasme des personnes que j’ai croisées. Ces contacts constituent pour moi un élément essentiel de ma thèse. MERCI à tous les insectes morts pour la science (RIP). MERCI à tous les membres du SAD-Paysage pour votre sympathie, pour les moments partagés à la cantine, aux pauses café et aux pauses goûter. Merci d’avoir laissé ma créativité artistique s’exprimer pleinement en salle de pause… Et bien sur, merci pour les inoubliables séances de mots fléchés collaboratives. En souvenir, voilà une grille un peu spéciale, dans laquelle chacun pourra retrouver son merci Au boulot ! 8 Remerciements Horizontal 1. Pour ta bonne humeur constante et ton « bon-vivantisme » qui fait plaisir à voir 3. Pour ton incontournable recette de la godinette 4. Pour ton calme reposant 8. Pour tes conseils jardins & cuisine 11. Pour les chouquettes à 16h (poupipoupipoupipouuuu) 12. Pour ta gentillesse, tout simplement 14. Pour tes dictons inoubliables (je garderai toujours en tête que la cuisine est un art paysager) 15. Pour tes gougères et tes animations accordéonico- sympathiques de fin d’année 16. Pour les soirées colorées et pour ton rire qui nous fait bien rire 17. Pour ton énergie inépuisable digne de Wonder Woman Vertical 2. Pour les discussions intarissables sur nos félins préférés 5. Pour ta motivation inébranlable à aller boire un coup après le boulot 6. Pour les pauses potins et les virées au Knock entre filles 7. Pour la bisounours team et tout le reste 8. Pour les pauses thé, Albert, les bricolages et tes bavouillages 9. Pour ton caractère bien trempé et ton cœur gros comme ça 10. Pour notre co-conception du désormais célébrissime concept de Café-gourmand-d’anniversaire©, et pour Mr Roux 13. Pour tes magnifiques décos de Noël qui sont toujours dans mon salon 16. Pour m’avoir convaincue de faire des abdos-fessiers le mardi midi MERCI à tous ceux qui sont passés par le SAD paysage pendant ces trois années et avec qui j’ai partagé des moments d’amitié. Merci à Esther, Megan, Clarisse, Elven, Julien, Meichun et Julie. Spéciale dédicace à Marie et Laure pour la Bisounours Team, à Colette pour les papotages autours d’une tasse de thé, d’une chope de bière ou d’une assiette de frites, à Rémi pour ton rôle si important de grand frère de thèse, et à Margot pour les balades à vélo MERCI à mes deux chats, Figaro et Crevette, pour leur pouvoir déstressant (Headey & Krause, 1999). MERCI à ma famille, et tout particulièrement à mon papa et ma maman pour m’avoir donné goût à l’écologie et pour m’avoir soutenue depuis toujours. Enfin, MERCI à David, pour avoir été là au jour le jour pendant tout ce temps ♥ N.B. Toutes les illustrations présentes en début de chapitre sont issues de tableaux de David Hockney. Headey Bruce and Krause Peter, 1999. Health Benefits and Potential Budget Savings Due to Pets: Australian and German Survey Results. Australian Social Monitor (2) 37-41. 9 Sommaire SOMMAIRE REMERCIEMENTS ------------------------------------------------------------------------------------------------ 7 SOMMAIRE ------------------------------------------------------------------------------------------------------ 11 INTRODUCTION GENERALE---------------------------------------------------------------------------------- 17 1. LES ENJEUX DE L’AGRICULTURE MODERNE ----------------------------------------------------------------------- 18 1.1. Agriculture & biodiversité : concilier sécurité alimentaire et durabilité des agro-écosystèmes -- 18 1.1.1. Evolution de l’agriculture au cours du 20ème siècle --------------------------------------------------------- 18 1.1.2. Effets de l’intensification de l’agriculture sur la biodiversité --------------------------------------------- 18 1.1.3. Intérêts de la biodiversité pour l’agriculture ----------------------------------------------------------------- 19 1.2. Principes et intérêts de l’Agriculture Biologique -------------------------------------------------------------- 20 1.2.1. Naissance, définition et organisation
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