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1990年12月18日第４種郵便物認可 ISSN 0914-5818 2018 VOL. 32 NO. 1

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ACTINOMYCETOLOGICA

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日本 I 放線 C 菌学会 http://www.actino.jp/ 日本放線菌学会誌第28巻 1 号誌 Published by ACTINOMYCETOLOGICA VOL.28 NO.1, 2014 The Society for Actinomycetes Japan SAJ NEWS

Vol. 32, No. 1, 2018

Contents

• Outline of SAJ: Activities and Membership S2 • List of new scientific names and nomenclatural changes in the phylum Actinobacteria validly published in 2017 S3 • 62nd Regular Colloquim S23 • The 2018 Annual Meeting of the Society for Actinomycetes Japan S24 • Online access to The Journal of Antibiotics for SAJ members S25

S1 Outline of SAJ: Activities and Membership

The Society for Actinomycetes Japan (SAJ) Annual membership fees are currently 5,000 yen was established in 1955 and authorized as a for active members, 3,000 yen for student mem- scientific organization by Science Council of Japan bers and 20,000 yen or more for supporting mem- in 1985. The Society for Applied Genetics of bers (mainly companies), provided that the fees Actinomycetes, which was established in 1972, may be changed without advance announce- merged in SAJ in 1990. SAJ aims at promoting ment. actinomycete researches as well as social and The current members (April 2018 - March 2020) scientific exchanges between members of the Board of Directors are: Masayuki Hayakawa domestically and internationally. The Activities of (Chairperson; Univ. of Yamanashi), Yasuo SAJ have included annual and regular scientific Ohnishi (Vice Chairperson; Univ. of Tokyo), meetings, workshops and publications of The Atsuko Matsumoto (Secretary General; Kitasato Journal of Antibiotics (the official journal, joint Univ.), Akira Arisawa (MicroBiopharm Japan Co., publication with Japan Antibiotics Research Ltd.), Masayuki Igarashi (Inst. of Microb. Chem. Association), Actinomycetologica (Newsletter) (BIKAKEN)), Susumu Iwamoto (Kyowa Hakko and laboratory manuals. Contributions to Kirin Co., Ltd.), Miyuki Otsuka (Tamagawa International Streptomyces Project (ISP) and Univ.), Hisashi Kawasaki (Tokyo Denki Univ.), International Symposium on Biology of Masaaki Kizuka (Daiichi Sankyo RD Novare Actinomycetes (ISBA) have also been SAJ's Co., Ltd.), Hideaki Takano (Nihon Univ.), Shunji activities. In addition, SAJ have occasional special Takahashi (RIKEN), Takuji Nakashima (Kitasato projects such as the publication of books related to Univ.), Yoshimitsu Hamano (Fukui Pref. Univ.), actinomycetes: “Atlas of Actinomycetes, 1997”, Hideki Yamamura (Univ. of Yamanashi), Hisayuki “Identification Manual of Actinomycetes, 2001” Komaki (NITE), Masahiro Natsume (Tokyo Univ. and “Digital Atlas of Actinomycetes, 2002” of Agr. & Tech.) and Hideyuki Muramatsu (Inst. (http://atlas.actino.jp/). These activities have of Microb. Chem. (BIKAKEN)) . been planned and organized by the board of The members of the Advisory Board are: directors with association of executive committees Hiroyuki Osada (RIKEN), Keiko Ochiai, Ken- consisting of active members who belong to ichiro Suzuki (Tokyo Univ. Agr.), Taichi academic and nonacademic organizations. The SAJ Memberships comprise active Manome and Mutsuyasu Nakajima. members, student members, supporting members and honorary members. Currently (as Copyright: The copyright of the articles of Dec. 20, 2017), SAJ has about 448 active published in Actinomycetologica is transferred members including student members, 21 oversea from the authors to the publisher, The Society for members, 14 honorary members, 3 oversea Actinomycetes Japan, upon acceptance of the honorary members, and 13 supporting members. manuscript. The SAJ members are allowed to join the scientific and social meetings or projects (regular The SAJ Secretariat and specific) of SAJ on a membership basis c/o Institute of Microbial Chemistry (BIKAKEN) and to browse The Journal of Antibiotics from a 3-14-23 Kamiosaki, Shinagawa-ku, link on the SAJ website and will receive each Tokyo 141-0021, JAPAN issue of Actinomycetologica, currently pub- Phone: +81-3-6455-7169 lished in June and December. Actinomycete Fax: +81-3-3441-7589 researchers in foreign countries are welcome to E-mail: [email protected] join SAJ. For application of SAJ membership, please contact the SAJ secretariat (see below).

S2 List of new scientific names and nomenclatural changes in the phylum Actinobacteria validly published in 2017

NEW GENUS

Actinocrinis Kim et al. 2017, gen. nov. A member of the Bifidobacteriaceae. Type species: Actinocrinis puniceicyclus Kim et al. 2017. Haematomicrobium Schumann and Busse Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, gen. nov. 67: 602-609. Type species: Haematomicrobium sanguinis A member of the family Actinospicaceae. (Mages et al. 2009) Schumann and Busse 2017. Allobranchiibius Ai et al. 2017, gen. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type species: Allobranchiibius huperziae Ai et 67: 1052-1057. al. 2017. A member of the family Micrococcaceae. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4210-4215. Krasilnikoviella Nishijima et al. 2017, gen. A member of the family Dermacoccaceae. nov. Type species: Krasilnikoviella muralis Allostreptomyces Huang et al. 2017, gen. nov. Nishijima et al. 2017. Type species: Allostreptomyces psammosilenae Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Huang et al. 2017. 67: 294-300. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, A member of the family 67: 288-293. Promicromonosporaceae. A member of the family Streptomycetaceae. Mangrovihabitans Liu et al. 2017, gen. nov. Arenivirga Hamada et al. 2017, gen. nov. Type species: Mangrovihabitans endophyticus Type species: Arenivirga flava Hamada et al. Liu et al. 2017. 2017. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1629-1636. 67: 3318-3322. A member of the family Micromonosporaceae. A member of the family Microbacteriaceae. Micrococcoides Tóth et al. 2017, gen. nov. Cumulibacter Huang et al. 2017, gen. nov. Type species: Micrococcoides hystricis Tóth et Type species: Cumulibacter manganitolerans al. 2017. Huang et al. 2017. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2758-2765. 67: 2646-2652. A member of the family Micrococcaceae. A member of the family Geodermatophilaceae. Pseudactinotalea Cho et al. 2017, gen. nov. Galliscardovia Pechar et al. 2017, gen. nov. Type species: Pseudactinotalea terrae Cho et Type species: Galliscardovia ingluviei Pechar al. 2017. et al. 2017. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 704-709. 67: 2403-2411. A member of the family Cellulomonadaceae.

S3 Psychromicrobium Schumann et al. 2017, gen. Salinifilum Moshtaghi Nikou et al. 2017, gen. nov. nov. Type species: Psychromicrobium silvestre Type species: Salinifilum proteinilyticum Schumann et al. 2017. Moshtaghi Nikou et al. 2017. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 640-645. 67: 4221-4227. A member of the family Micrococcaceae. A member of the family Pseudonocardiaceae.

Puzihella Sheu et al. 2017, gen. nov. Thalassiella Lee et al. 2017, gen. nov. Type species: Puzihella rosea Sheu et al. 2017. Type species: Thalassiella azotivora Lee et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017. 67: 2383-2389. Reference: Curr. Microbiol., 2016, 73: 676- A member of the family Microbacteriaceae. 683; Validation List no. 173 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1-3]. A member of the family Kineosporiaceae.

NEW SPECIES

Actinocrinis puniceicyclus Kim et al. 2017, sp. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, nov. 110: 787-794; Validation List no. 177 [Int. Type strain: strain OB1 = ATCC BAA-2771 = J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3140- DSM 45618. 3143]. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 602-609. Actinomyces gaoshouyii Meng et al. 2017, sp. nov. Actinokineospora acnipugnans Dahal et al. Type strain: strain pika_113 = CGMCC 4.7372 2017, sp. nov. = DSM 104049. Type strain: strain R434 = JCM 31557 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, KACC 18904 = KEMB 9005-403. 67: 3363-3368. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3043-3049. Actinomyces liubingyangii Meng et al. 2017, sp. nov. Actinomadura algeriensis Lahoum et al. 2017, Type strain: strain VUL4_1 = CGMCC 4.7370 sp. nov. = DSM 104050. Type strain: strain ACD1 = CECT 8841 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, DSM 46744. 67: 1873-1879. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, 109: 159-165; Validation List no. 175 [Int. Actinomyces vulturis Meng et al. 2017, sp. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- nov. 1098]. Type strain: strain VUL7 = CGMCC 4.7366 = DSM 103437. Actinomadura alkaliterrae Ay et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 1720-1726. Type strain: strain D310A = DSM 101185 = KCTC 39657.

S4 Actinophytocola xanthii Wang et al. 2017, sp. Amycolatopsis acidiphila Oyuntsetseg et al. nov. 2017, sp. nov. Type strain: strain 11-183 = KCTC 39690 = Type strain: strain 2-5 = JCM 30562 = KCTC MCCC 1K02062. 39523. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1152-1157. 67: 3387-3392.

Actinoplanes ramoplaninifer Marcone et al. Amycolatopsis deserti Busarakam et al. 2017, 2017, sp. nov. sp. nov. Type strain: strain ATCC 33076 = DSM Type strain: strain GY024 = DSM 100106 = 105064 = NRRL B-65484. NCIMB 14972 = NRRL B-65266. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, 67: 4181-4188. 109: 319-334; Validation List no. 174 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 529- Actinotalea caeni Jin et al. 2017, sp. nov. 531]. Type strain: strain EBR-4-2 = JCM 30447 = KCTC 33604. Angustibacter speluncae Ko and Lee 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 1595-1599. Type strain: strain YC2-20 = DSM 103769 = KCTC 39842. Aeromicrobium choanae Ber et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 3283-3288. Type strain: strain 9H-4 = CCM 8650 = JCM 32379 = LMG 29165 = ZIM B1021. Arcanobacterium wilhelmae Sammra et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 357-361. Type strain: strain 647 = DSM 102162 = LMG 29418. Allobranchiibius huperziae Ai et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 2093-2097. Type strain: strain CPCC 204077 = DSM 29531 = NBRC 110719. Arenivirga flava Hamada et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain HIs16-32 = NBRC 112289 67: 4210-4215. = TBRC 7038. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Alloscardovia venturai Sechovcová et al. 67: 3318-3322. 2017, sp. nov. Type strain: strain MOZIV/2 = CCM 8604 = Arthrobacter ginkgonis Cheng et al. 2017, sp. DSM 100237 = LMG 28781. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain SYP-A7299 = DSM 100491 67: 2842-2847. = JCM 30742 = KCTC 39 592. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Allostreptomyces psammosilenae Huang et al. 67: 319-324. 2017, sp. nov. Type strain: strain YIM DR4008 = CGMCC Arthrobacter pokkalii Krishnan et al. 2017, sp. 4.7247 = DSM 42178. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain P3B162 = KCTC 29498 = 67: 288-293. LMG 28262 = MTCC 12358 = NRIC 0967.

S5 Reference: PLOS ONE, 2016, 11: e0150322; Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Validation List no. 177 [Int. J. Syst. Evol. 110: 339-346; Validation List no. 175 [Int. Microbiol., 2017, 67: 3140-3143]. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- 1098]. Arthrobacter silviterrae Lee et al. 2017, sp. nov. Calidifontibacter terrae Dahal et al. 2017, sp. Type strain: strain KIS14-16 = DSM 27180 = nov. KACC 17303 = NBRC 109660. Type strain: strain R161 = JCM 31558 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, KEMB 9005-404 = KACC 18906. 67: 4546-4551. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1925-1931. Bifidobacterium aerophilum Michelini et al. 2017, sp. nov. Conexibacter stalactiti Lee 2017, sp. nov. Type strain: strain TRE 17 = DSM 100689 = Type strain: strain YC2-25 = DSM 103719 = JCM 30941. KCTC 39840. Reference: Syst. Appl. Microbiol., 2016, 39: Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 229-236; Validation List no. 175 [Int. J. 67: 3214-3218. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- 1098]. Conyzicola nivalis Gu et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain ZD5-4 = CGMCC 1.12813 Bifidobacterium apri Pechar et al. 2017, sp. = JCM 30076. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain RP115 = CCM 8605 = DSM 67: 2818-2822. 100238 = LMG 28779. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Corynebacterium gottingense Atasayar et al. 67: 2349-2356. 2017, sp. nov. Type strain: strain 99221/2016 = DSM 103494 Bifidobacterium ramosum Michelini et al. = JCM 31931. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain TRE M = DSM 100688 = 67: 4494-4499. JCM 30944. Reference: Syst. Appl. Microbiol., 2016, 39: Corynebacterium jeddahense Edouard et al. 229-236; Validation List no. 175 [Int. J. 2017, sp. nov. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- Type strain: strain JCB = CSUR P778 = DSM 1098]. 45997. Reference: Stand. Genomic Sci., 2014, 9: 987- Bifidobacterium vansinderenii Duranti et al. 1002; Validation List no. 176 [Int. J. Syst. 2017, sp. nov. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075-2078]. Type strain: strain Tam10B = CCUG 70655 = LMG 30126. Cryptosporangium eucalypti Himaman et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 3987-3995. Type strain: strain EURKPP3H10 = BCC 77605 = NBRC 111482. Blastococcus colisei Hezbri et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 3077-3082. Type strain: strain BMG 822 = CECT 8823 = DSM 46837.

S6 Cumulibacter manganitolerans Huang et al. Geodermatophilus daqingensis Wang et al. 2017, sp. nov. 2017, sp. nov. Type strain: strain 2-36 = CCTCC AA Type strain: strain WT-2-1 = CGMCC 4.7381 2016026 = DSM 103787. = DSM 104001. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 67: 2646-2652. 110: 803-809; Validation List no. 176 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Flexivirga oryzae Hyeon et al. 2017, sp. nov. 2078]. Type strain: strain R1 = DSM 105369 = JCM 31060 = KACC 18597. Glutamicibacter halophytocola Feng et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 479-484. Type strain: strain KLBMP 5180 = DSM 101718 = KCTC 39692. Frankia asymbiotica Nouioui et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 1120-1125. Type strain: strain M16386 = CECT 9040 = DSM 100626. Gordonia phthalatica Jin et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain QH-11 = CICC 24107 = 67: 4897-4901. KCTC 39933. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Frankia coriariae Nouioui et al. 2017, sp. nov. 67: 5128-5133. Type strain: strain BMG5.1 = CECT 9032 = DSM 100624. Haloactinomyces albus Lai et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 1266-1270. Type strain: strain AFM 102587 = CGMCC 4.7115 = DSM 4597. Frankia discariae Nouioui et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain BCU110501 = CECT 9042 67: 1163-1168. = DSM 46785. Reference: Arch. Microbiol., 2017, 199: 641- Humibacter aquilariae Lin et al. 2017, sp. 647; Validation List no. 177 [Int. J. Syst. nov. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3140-3143]. Type strain: strain CC-YTH161 = BCRC 80936 = JCM 31199. Frankia inefficax Nouioui et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain EuI1c = CECT 9037 = DSM 67: 1468-1472. 45817. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Kibdelosporangium kanagawaense Mingma et 110: 313-320; Validation List no. 175 [Int. al. 2017, sp. nov. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- Type strain: strain K08-0175 = NBRC 112388 1098]. = TBRC 6786. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Galliscardovia ingluviei Pechar et al. 2017, sp. 67: 1758-1765. nov. Type strain: strain RP51 = CCM 8606 = DSM Kibdelosporangium metalli Cao et al. 2017, 100235 = LMG 28778. sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain KC 266 = CCTCC AA 67: 2403-2411. 2016002 = KCTC 39719.

S7 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Kribbella deserti Sun et al. 2017, sp. nov. 67: 101-107. Type strain: strain SL15-1 = CGMCC 1.15906 = KCTC 39825. Kibdelosporangium rhizosphaerae Mingma et Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, al. 2017, sp. nov. 67: 692-696. Type strain: strain K10-0543 = NBRC 112389 = TBRC 6787. Kribbella soli Ozdemir-Kocak et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 1758-1765. Type strain: strain FMN22 = DSM 27132 = KCTC 29219. Kibdelosporangium rhizovicinum Mingma et Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, al. 2017, sp. nov. 110: 641-649; Validation List no. 176 [Int. Type strain: strain K12-0791 = NBRC 112390 J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- = TBRC 6788. 2078]. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1758-1765. Lechevalieria rhizosphaerae Zhao et al. 2017, sp. nov. Kineococcus aureolus Xu et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain NEAU-A2 = CGMCC Type strain: strain YIM 121940 = DSM 4.7405 = DSM 104541. 102158 = KCTC 39739. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4655-4659. 67: 4801-4807. Lentzea cavernae Fang et al. 2017, sp. nov. Kineococcus terrestris Xu et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain SYSU K10001 = CGMCC Type strain: strain YIM 121936 = DSM 4.7367 = DSM 103464 = KCTC 39804 = 102155 = KCTC 39738. NBRC 112394. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4801-4807. 67: 2357-2362.

Kocuria oceani Zhang et al. 2017, sp. nov. Lentzea chajnantorensis Idris et al. 2017, sp. Type strain: strain FXJ8.095 = CGMCC nov. 4.6946 = DSM 24949. Type strain: strain H45 = NCIMB 14966 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, NRRL B-65282. 67: 164-169. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 795-802; Validation List no. 176 [Int. Kocuria salina Camacho et al. 2017, sp. nov. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Type strain: strain Hv14b = CECT 9229 = 2078]. DSM 28714. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Lentzea pudingi Cao et al. 2017, sp. nov. 67: 5006-5012. Type strain: strain DHS C021 = CGMCC 4.7319 = KCTC 39694. Krasilnikoviella muralis Nishijima et al. 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, sp. nov. 67: 4873-4878. Type strain: strain T6220-5-2b = JCM 28789 = NCIMB 15040. Leucobacter corticis Li et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain 2C-7 = CFCC 11901 = 67: 294-300. KCTC 39643.

S8 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain THG-T2.14 = CCTCC AB 67: 2248-2252. 2016180 = KACC 18931. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Leucobacter ruminantium Chun et al. 2017, 67: 3564-3569. sp. nov. Type strain: strain A2 = DSM 104477 = JCM Microbacterium lacusdiani Zhang et al. 2017, 19316 = KACC 17571. sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain JXJ CY 01 = DSM 29188 = 67: 2634-2639. JCM 30286 = KCTC 2965. Reference: J. Antibiot., 2017, 70: 147-151; Leucobacter weissii Schumann and Pukall Validation List no. 176 [Int. J. Syst. Evol. 2017, sp. nov. Microbiol., 2017, 67: 2075-2078]. Type strain: strain S27 = CCM 8762 = DSM 20621 = JCM 32600. Microbacterium rhizosphaerae Cho and Lee Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 5244-5251. Type strain: strain CHO1 = JCM 31396 = KEMB 7306-513. Longispora urticae Piao et al. 2017, sp. nov. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Type strain: strain NEAU-PCY-3 = CCTCC 110: 11-18; Validation List no. 174 [Int. J. AA 2017017 = DSM 105119. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 529-531]. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4228-4234. Microbacterium tumbae Nishijima et al. 2017, sp. nov. Lysinimicrobium sediminis Hamada et al. Type strain: strain T7528-3-6b = JCM 28836 = 2017, sp. nov. NCIMB 15039. Type strain: strain HT7-17 = NBRC 112286 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, TBRC 7037. 67: 1777-1783. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3393-3397. Microbacterium zeae Gao et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain 1204 = CGMCC 1.15289 = Mangrovihabitans endophyticus Liu et al. DSM 100750. 2017, sp. nov. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Type strain: strain S3Cf-2 = CGMCC 4.7299 = 110: 697-704; Validation List no. 177 [Int. DSM 100693. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3140- Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 3143]. 67: 1629-1636. Micrococcoides hystricis Tóth et al. 2017, sp. Marmoricola endophyticus Jiang et al. 2017, nov. sp. nov. Type strain: strain TSL3 = DSM 29785 = Type strain: strain 8BXZ-J1 = CGMCC NCAIM B.02604. 1.16067 = KCTC 39789. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2758-2765. 67: 4379-4384. A member of the family Micrococcaceae.

Microbacterium hibisci Yan et al. 2017, sp. nov.

S9 Micromonospora fulva Lee et al. 2017, sp. Type strain: strain KNN 45-2b = CECT 9023 = nov. DSM 101691. Type strain: strain UDF-1 = KACC 18696 = Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, NBRC 111826. 110: 11-18; Validation List no. 174 [Int. J. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 529-531]. 67: 1746-1751. Mycobacterium aquaticum Shahraki et al. Micromonospora luteifusca Carro et al. 2017, 2017, sp. nov. sp. nov. Type strain: strain RW6 = CIP111198 = DSM Type strain: strain GUI2 = CECT 8846 = DSM 104277. 100204. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Syst. Appl. Microbiol., 2016, 39: 67: 3279-3282. 237-242; Validation List no. 173 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1-3]. Mycobacterium aquiterrae Lee and Whang 2017, sp. nov. Micromonospora parathelypteridis Zhao et al. Type strain: strain S-I-6 = KACC 17600 = 2017, sp. nov. NBRC 109805 = NCAIM B 02535. Type strain: strain NEAU-JXY5 = CGMCC Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 4.7347 = DSM 103125 = JCM 32493. 67: 4104-4110. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 268-274. Mycobacterium eburneum Nouioui et al. 2017, sp. nov. Micromonospora terminaliae Kaewkla et al. Type strain: strain X82 = CECT 8775 = DSM 2017, sp. nov. 44358. Type strain: strain TMS7 = DSM 101760 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, NRRL B-65345. 67: 3174-3181. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 225-230. Mycobacterium grossiae Paniz-Mondolfi et al. 2017, sp. nov. Micromonospora yasonensis Veyisoglu et al. Type strain: strain PB739 = CIP 111318 = 2017, sp. nov. DSM 104744. Type strain: strain DS3186 = DSM 45980 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, KCTC 29433. 67: 4345-4351. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, 109: 1019-1028; Validation List no. 177 Mycobacterium lehmannii Nouioui et al. [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2017, sp. nov. 3140-3143]. Type strain: strain SN 1900 = 40 = CECT 8763 = DSM 43219. Mobilicoccus caccae Chen et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain YIM 101593 = CCTCC AB 67: 4948-4955. 2013229 = DSM 27611. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Mycobacterium malmesburyense Gcebe et al. 67: 2253-2257. 2017, sp. nov. Type strain: strain WCM 7299 = ATCC BAA- Modestobacter caceresii Busarakam et al. 2759 = CIP 110822. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 832-838.

S10 Mycobacterium neumannii Nouioui et al. Type strain: strain AFT2 = CCTCC AB 2017, sp. nov. 2015428 = DSM 103164. Type strain: strain SN 1904 = 2409 = CECT Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 8766 = DSM 43532. 67: 2609-2614. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4948-4955. Naumannella huperziae Sun et al. 2017, sp. nov. Mycobacterium persicum Shahraki et al. 2017, Type strain: strain CPCC 204135 = DSM sp. nov. 101717 = NBRC 111773. Type strain: strain AFPC-000227 = CIP Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 111197 = DSM 104278. 67: 1867-1872. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1766-1770. Nesterenkonia cremea Sultanpuram et al. 2017, sp. nov. Mycobacterium stephanolepidis Fukano et al. Type strain: strain 10C = CGMCC 1.15388 = 2017, sp. nov. KCTC 39636 = LMG 29100. Type strain: strain NJB0901 = JCM 31611 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, KCTC 39843. 67: 1861-1866. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2811-2817. Nesterenkonia pannonica Borsodi et al. 2017, sp. nov. Mycobacterium talmoniae Davidson et al. Type strain: strain BV-35 = DSM 29786 = 2017, sp. nov. NCAIM B 02606. Type strain: strain NE-TNMC-100812 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, ATCC BAA-2683 = DSM 46873. 67: 4116-4120. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2640-2645. Nocardia arizonensis Lasker et al. 2017, sp. nov. Mycobacterium virginiense Vasireddy et al. Type strain: strain W9405 = CCUG 62754 = 2017, sp. nov. DSM 45748 = NBRC 108935. Type strain: strain MO-233 = CIP 110918 = Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2015, DSM 100883. 108: 1129-1137; Validation List no. 175 Reference: J. Clin. Microbiol., 2016, 54: 1340- [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1351; J. Clin. Microbiol., 2017, 55: 985; 1095-1098]. Validation List no. 175 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095-1098]. Nocardia cavernae Li et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain YIM A1135 = CCTCC AA Nakamurella intestinalis Kim et al. 2017, sp. 2017030 = KCTC 39595. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain 63MJ-1 = KACC 18662 = 67: 2998-3003. NBRC 111844. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Nocardia heshunensis Huang et al. 2017, sp. 67: 2970-2974. nov. Type strain: strain CFH S0067 = DSM 46764 = Naumannella cuiyingiana Tian et al. 2017, sp. JCM 30085. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3467-3473.

S11 Nocardia lasii Liu et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain FLL521 = CCTCC AB Type strain: strain 3C-HV12 = CGMCC 2017083 = KCTC 39931. 4.7279 = DSM 10052. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, 67: 5211-5215. 109: 1513-1520; Validation List no. 173 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1-3]. Nocardioides kandeliae Liu et al. 2017, sp. nov. Nocardia tengchongensis Li et al. 2017, sp. Type strain: strain BGMRC 2075 = DSM nov. 104480 = KCTC 39886. Type strain: strain CFH S0057 = JCM 30083 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, KCTC 29485. 67: 3888-3893. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 1149-1155; Validation List no. 178 Nocardioides litoris Lee et al. 2017, sp. nov. [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: Type strain: strain 002-2 = DSM 103718 = 4291-4293]. KCTC 39838. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Nocardia xestospongiae Thawai et al. 2017, 67: 2332-2336. sp. nov. Type strain: strain ST01-07 = BCC 45622 = Nocardioides litorisoli Wang et al. 2017, sp. NBRC 109069. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain x-2 = CCTCC AB 2016255 67: 1451-1456. = KCTC 39845. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Nocardioides agrisoli Wang et al. 2017, sp. 67: 4216-4220. nov. Type strain: strain djl-8 = CCTCC AB Nocardioides phosphati Xie et al. 2017, sp. 2017058 = KCTC 39844. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain WYH11-7 = CGMCC 67: 3722-3727. 4.7371 = DSM 104026. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Nocardioides cavernae Han et al. 2017, sp. 67: 1522-1528. nov. Type strain: strain YIM A1136 = DSM 29950 Nocardioides sonneratiae Li et al. 2017, sp. = JCM 30631 = KCTC 39551. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain BGMRC0092 = DSM 67: 633-639. 100390 = KCTC 39565 = NBRC 110251. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Nocardioides gilvus Zhang et al. 2017, sp. nov. 67: 2592-2597. Type strain: strain XZ17 = KCTC 39561 = MCCC 1H00114. Nocardioides thalensis Khan et al. 2017, sp. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, nov. 109: 1367-1374; Validation List no. 175 Type strain: strain NCCP-696 = CCTCC AB [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2016296 = DSM 103833. 1095-1098]. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2848-2852. Nocardioides immobilis Lu et al. 2017, sp. nov.

S12 Nonomuraea cavernae Fang et al. 2017, sp. Type strain: strain SC1-1 = BCC 66361 = nov. NBRC 110006. Type strain: strain SYSU K10005 = CGMCC Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 4.7368 = KCTC 39805. 67: 2879-2884. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4692-4697. Ornithinimicrobium flavum Fang et al. 2017, sp. nov. Nonomuraea ceibae Wang et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain CPCC 203535 = KCTC Type strain: strain XMU 110 = KCTC 39826 = 29164 = NBRC 109452. MCCC 1K03213. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4541-4545. 67: 1158-1162. Oryzihumus soli Kim et al. 2017, sp. nov. Nonomuraea glycinis Li et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain Aerobe-19 = KACC 18485 Type strain: strain NEAU-BB2C19 = CGMCC = KCTC 39705 = NBRC 111450. 4.7430 = DSM 104838. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3960-3964. 67: 5026-5031. Planomonospora algeriensis Chaabane Nonomuraea guangzhouensis Wang et al. Chaouch et al. 2017, sp. nov. 2017, sp. nov. Type strain: strain PM3 = CECT 9047 = DSM Type strain: strain NEAU-ZJ3 = CGMCC 46752. 4.7101 = DSM 45889. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2014, 110: 245-252; Validation List no. 175 [Int. 105: 109-118; Validation List no. 177 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3140- 1098]. 3143]. Prauserella oleivorans Dastgheib et al. 2017, Nonomuraea harbinensis Wang et al. 2017, sp. nov. sp. nov. Type strain: strain RIPI = IBRC-M 10906 = Type strain: strain NEAU-yn31 = CGMCC LMG 28389. 4.7106 = DSM 45887. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2014, 67: 3381-3386. 105: 109-118; Validation List no. 177 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 3140- Promicromonospora callitridis Kaewkla and 3143]. Franco 2017, sp. nov. Type strain: strain CAP94 = DSM 103339 = Nonomuraea rhodomycinica Sripreechasak et TBRC 6025. al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain NR4-ASC07 = NBRC 67: 3559-3563. 112327 = TISTR 2465. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Promicromonospora kermanensis 67: 1683-1687. Mohammadipanah et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain HM 533 = CECT 8709 = Nonomuraea stahlianthi Niemhom et al. DSM 45485 = UTMC 00533. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 262-267.

S13 Promicromonospora soli Zheng et al. 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, sp. nov. 67: 2773-2778. Type strain: strain NEAU-GS50 = CGMCC4.7398 = DSM 104515. Psychromicrobium silvestre Schumann et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 3829-3833. Type strain: strain AK20-18 = DSM 102047 = LMG 29369. Propioniciclava sinopodophylli Zhang et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 640-645. Type strain: strain TEYR-7 = CCTCC AB 2015257 = KCTC 33808. Puzihella rosea Sheu et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain MI-28 = BCRC 80688 = 67: 4111-4115. KCTC 29239 = LMG 27848. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Pseudactinotalea terrae Cho et al. 2017, sp. 67: 2383-2389. nov. Type strain: strain 5GHs33-3 = DSM 27157 = Rhodococcus gannanensis Ma et al. 2017, sp. KACC 16542 = NBRC 111006. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain M1 = CGMCC 1.15992 = 67: 704-709. DSM 104003. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Pseudokineococcus basanitobsidens Lee et al. 110: 1113-1120; Validation List no. 178 2017, sp. nov. [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: Type strain: strain SKC1-2 = DSM 103726 = 4291-4293]. KCCM 43221. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Rhodococcus sovatensis Táncsics et al. 2017, 67: 3824-3828. sp. nov. Type strain: strain H004 = DSM 102881 = Pseudonocardia nigra Trujillo et al. 2017, sp. NCAIM B.02632. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain ATK03 = CECT 9183 = 67: 190-196. DSM 104088. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Rubrobacter spartanus Norman et al. 2017, 67: 2980-2985. sp. nov. Type strain: strain HPK2-2 = DSM 102139 = Pseudonocardia profundimaris Zhang et al. LMG 29988. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain GY0556 = KCTC 39641 = 67: 3597-3602. MCCC 1A10574. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Saccharomonospora colocasiae 67: 1693-1697. Wattanasuepsin et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain S265 = NBRC 112945 = Pseudonocardia thailandensis Sujarit et al. TBRC 7235. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain CMU-NKS-70 = JCM 67: 4572-4577. 31292 = TBRC 2000.

S14 Saccharopolyspora aidingensis Xia et al. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 2017, sp. nov. 110: 705-717; Validation List no. 176 [Int. Type strain: strain TRM 46074 = CCTCC AA J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- 2012014 = JCM 30185. 2078]. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 687-691. Streptomyces asenjonii Goodfellow et al. 2017, sp. nov. Saccharopolyspora spongiae Moraes et al. Type strain: strain KNN 35.1b = NCIMB 2017, sp. nov. 15082 = NRRL B-65050. Type strain: strain CMAA 1452 = DSM Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 103218 = NRRL B-65384. 110: 1133-1148; Validation List no. 178 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 67: 2019-2025. 4291-4293].

Saccharothrix ghardaiensis Bouznada et al. Streptomyces caldifontis Amin et al. 2017, sp. 2017, sp. nov. nov. Type strain: strain MB46 = CECT 9046 = Type strain: strain NCCP-1331 = CPCC DSM 46886. 204147 = KCTC 39537. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 399-405; Validation List no. 175 [Int. 110: 77-86; Validation List no. 175 [Int. J. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1095- 1098]. 1098].

Salinifilum proteinilyticum Moshtaghi Nikou Streptomyces capparidis Wang et al. 2017, sp. et al. 2017, sp. nov. nov. Type strain: strain Miq-12 = IBRC-M 11033 = Type strain: strain EGI 6500195 = DSM 42145 LMG 28390. = JCM 30089. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4221-4227. 67: 133-137.

Sanguibacter gelidistatuariae Pikuta et al. Streptomyces cerasinus Kanchanasin et al. 2017, sp. nov. 2017, sp. nov. Type strain: strain ISLP-3 = ATCC TSD-17 = Type strain: strain SR3-134 = KCTC 39910 = DSM 100501 = JCM 30887. TISTR 2494. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1442-1450. 67: 3854-3859.

Streptomyces amphotericinicus Cao et al. Streptomyces fuscichromogenes Zhang et al. 2017, sp. nov. 2017, sp. nov. Type strain: strain 1H-SSA8 = CGMCC 4.7350 Type strain: strain m16 = CGMCC 4.7110 = = DSM 103128. KCTC 29195. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4967-4973. 67: 77-81.

Streptomyces aridus Idris et al. 2017, sp. nov. Type strain: strain H9 = NCIMB 14965 = NRRL B-65268.

S15 Streptomyces gamaensis Zhao et al. 2017, sp. Type strain: strain TRM 45540 = CCTCC AA nov. 2014003 = NRRL B-59117. Type strain: strain NEAU-Gz11 = CGMCC Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 4.7304 = DSM 101531. 67: 543-547. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 471-477; Validation List no. 176 [Int. Streptomyces odonnellii Pereira et al. 2017, sp. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- nov. 2078]. Type strain: strain 594 = IMPPG 594 = DSM 41949 = NRRL B-24891. Streptomyces jeddahensis Röttig et al. 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, sp. nov. 67: 5211-5215. Type strain: strain G25 = DSM 101878 = LMG 29545 = NCCB 100603. Streptomyces roietensis Kaewkla and Franco Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2017, sp. nov. 67: 1676-1682. Type strain: strain WES2 = DSM 101729 = NRRL B-65344. Streptomyces kalpinensis Ma et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 4868-4872. Type strain: strain TRM 46509 = CCTCC AA 2015028 = KCTC 39667. Streptomyces solisilvae Zhou et al. 2017, sp. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, nov. 67: 4892-4896. Type strain: strain HNM0141 = CCTCC AA 2016045 = KCTC 39905. Streptomyces krungchingensis Sripreechasak Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, et al. 2017, sp. nov. 67: 3553-3558. Type strain: strain KC-035 = KCTC 29503 = NBRC 110087 = TISTR 2402. Streptomyces xylanilyticus Moonmangmee et Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, al. 2017, sp. nov. 67: 50-54. Type strain: strain SR2-123 = KCTC 39909 = TISTR 2493. Streptomyces lactacystinicus Také et al. 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, sp. nov. 67: 4189-4194. Type strain: strain OM-6519 = DSM 42136 = JCM 10101 = NBRC 110082. Streptomyces zhihengii Huang et al. 2017, sp. Reference: J. Antibiot., 2015, 68: 322-327; J. nov. Antibiot., 2017, 70: 113; Validation List no. Type strain: strain YIM T102 = CGMCC 175 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 4.7248 = DSM 42176 = KCTC 39115. 1095-1098]. Reference: Arch. Microbiol., 2016, 198: 743- 749; Validation List no. 173 [Int. J. Syst. Streptomyces lasiicapitis Ye et al. 2017, sp. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1-3]. nov. Type strain: strain 3H-HV17(2) = CGMCC Subtercola lobariae Si et al. 2017, sp. nov. 4.7349 = DSM 103124. Type strain: strain 583b = CGMCC 1.12976 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, DSM 103962. 67: 1529-1534. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1516-1521. Streptomyces luteus Luo et al. 2017, sp. nov.

S16 Tessaracoccus arenae Thongphrom et al. Reference: Curr. Microbiol., 2016, 73: 676- 2017, sp. nov. 683; Validation List no. 173 [Int. J. Syst. Type strain: strain CAU 1319 = KCTC 39760 Evol. Microbiol., 2017, 67: 1-3]. = NBRC 111973. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Verrucosispora endophytica Ngaemthao et al. 67: 2008-2013. 2017, sp. nov. Type strain: strain A-T 7972 = BCC 50981 = Tessaracoccus defluvii Srinivasan et al. 2017, NBRC 112512 = TBRC 6031. sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain LNB-140 = JCM 17540 = 67: 5114-5119. KEMB 5401-076. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017; Williamsia spongiae Afonso de Menezes et al. 110: 1-9; Validation List no. 174 [Int. J. 2017, sp. nov. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 529-531]. Type strain: strain B138 = CBMAI 1094 = DSM 46676. Thalassiella azotivora Lee et al. 2017, sp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain DSD2 = JCM 31134 = 67: 1260-1265. KCTC 39634.

NEW SUBSPECIES

Mycobacterium chelonae subsp. bovis Kim et KCTC 39630. al. 2017, subsp. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Type strain: strain QIA-37 = JCM 30986 = 67: 3882-3887.

NEW COMBINATION

Haematomicrobium sanguinis (Mages et al. Kitasatospora aburaviensis (Nishimura et al. 2009) Schumann and Busse 2017, comb. 1957) Labeda et al. 2017, comb. nov. nov. Basonym: Streptomyces aburaviensis Basonym: Arthrobacter sanguinis Mages et al. Nishimura et al. 1957. 2009. Type strain: strain S-66 = ATCC 23869 = Type strain: strain 741 = CCUG 46407 = DSM BCRC 11617 = CECT 3315 = CGMCC 21259 = JCM 19108. 4.1469 = DSM 40033 = ISP 5033 = JCM Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 4170 = JCM 4613 = KACC 20033 = KCTC 67: 1052-1057. 9663 = LMG 19305 = NBRC 12830 = NRRL B-2218 = NRRL ISP-5033 = VKM Halopolyspora algeriensis (Saker et al. 2015) Ac-1868. Lai et al. 2017, comb. nov. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Basonym: Mzabimyces algeriensis Saker et al. 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. 2015. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Type strain: strain H195 = CECT 8575 = DSM 2078]. 46680 = MTCC 12101. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2787-2790.

S17 Kitasatospora albolonga (Tsukiura et al. 1964) Basonym: Streptomyces herbaricolor Kawato Labeda et al. 2017, comb. nov. and Shinobu 1959. Basonym: Streptomyces albolongus Tsukiura et Type strain: strain 608 = ATCC 23922 = BCRC al. 1964. 13772 = CGMCC 4.1849 = DSM 40123 = Type strain: strain 304R7 = ATCC 27414 = ISP 5123 = JCM 4138 = JCM 4645 = NBRC BCRC 15179 = CGMCC 4.1661 = DSM 12876 = NCIMB 9837 = NRRL B-3299 = 40570 = ISP 5570 = JCM 4716 = KCTC NRRL ISP-5123 = VKM Ac-793. 9676 = KCTC 9749 = NBRC 13465 = Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, NRRL B-3604 = NRRL ISP-5570 = VKM 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. Ac-704. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 2078]. 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Kitasatospora misakiensis (Nakamura 1961) 2078]. Labeda et al. 2017, comb. nov. Basonym: Streptomyces misakiensis Nakamura Kitasatospora aureofaciens (Duggar 1948) 1961. Labeda et al. 2017, comb. nov. Type strain: strain 7617 = 1755 = ATCC 23938 Basonym: Streptomyces aureofaciens Duggar = BCRC 13799 = CGMCC 4.1437 = DSM 1948. 40222 = ISP 5222 = JCM 4062 = JCM 4653 Type strain: strain A-377 = ATCC 10762 = = KCTC 19951 = NBRC 12891 = NCIMB BCRC 11610 = CCM 3239 = CECT 3206 = 9852 = NRRL B-2923 = NRRL ISP-5222 = CGMCC 4.0568 = CIP 57.11 = DSM 40127 VKM Ac-625. = ISP 5127 = JCM 4008 = JCM 4624 Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, =KACC 20180 =LMG 5968 = NBRC 12843 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. = NCIMB 8234 = NRRL B-5404 = NRRL Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- ISP-5127 = VKM Ac-771. 2078]. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. Kitasatospora psammotica (Virgilio and Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Hengeller 1960) Labeda et al. 2017, comb. 2078]. nov. Basonym: Streptomyces psammoticus Virgilio Kitasatospora cinereorecta (Terekhova and and Hengeller 1960. Preobrazhenskaya 1986) Labeda et al. 2017, Type strain: strain C1 7190 = ATCC 14125 = comb. nov. ATCC 25488 = BCRC 12241 = CGMCC Basonym: Streptomyces cinereorectus 4.1465 = DSM 40341 = ISP 5341 = KCTC Terekhova and Preobrazhenskaya 1986. 19966 = NBRC 13971 = NRRL B-3291 = Type strain: strain INA 5202 = ATCC 43679 = NRRL B-5753 = NRRL ISP-5341 = VKM CGMCC 4.1622 = DSM 41469 = JCM 6916 Ac-996. = NBRC 15395 = NRRL B-16360. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- 2078]. 2078]. Kitasatospora purpeofusca (Yamaguchi and Kitasatospora herbaricolor (Kawato and Saburi 1955) Labeda et al. 2017, comb. nov. Shinobu 1959) Labeda et al. 2017, comb. Basonym: Streptomyces purpeofuscus nov. Yamaguchi and Saburi 1955.

S18 Type strain: strain H-5080 = ATCC 23952 = Type strain: strain PON10 = DSM 22300 = BCRC 12093 = CGMCC 4.1767 =CGMCC JCM 15132 = KCTC 19685 = LMG 24222 = 4.1999 = DSM 40283 = IFO 12905 = ISP MTCC 9128. 5283 = JCM 4156 = JCM 4665 = KCTC Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 19967 = NBRC 12905 = NCIMB 9822 = 67: 2766-2772. NRRL B-1817 = NRRL ISP-5283. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, Pseudactinotalea suaedae (Zhao et al. 2015) 110: 563-583; Validation List no. 176 [Int. J. Cho et al. 2017, comb. nov. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2075- Basonym: Actinotalea suaedae Zhao et al. 2078]. 2015. Type strain: strain EGI 60002 = DSM 28005 = Krasilnikoviella flava (Jiang et al. 2009) JCM 19624 = KACC 17839 = KCTC 29256. Nishijima et al. 2017, comb. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Basonym: Promicromonospora flava Jiang et 67: 704-709. al. 2009. Type strain: strain CC 0387 = CCTCC AA Salinifilum aidingensis (Xia et al. 2017) 208024 = DSM 21481 = JCM 16551. Moshtaghi Nikou et al. 2017, comb. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Basonym: Saccharopolyspora aidingensis Xia 67: 294-300. et al. 2017. Type strain: strain TRM 46074 = CCTCC AA Microterricola gilva (Lee et al. 2008) Dhotre 2012014 = JCM 30185. et al. 2017, comb. nov. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Basonym: Phycicola gilvus Lee et al. 2008. 67: 4221-4227. Type strain: strain SSWW-21 = DSM 18319 = JCM 30550 = KCTC 19185. Salinifilum ghardaiensis (Meklat et al. 2014) Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Moshtaghi Nikou et al. 2017, comb. nov. 67: 2766-2772. Basonym: Saccharopolyspora ghardaiensis Meklat et al. 2014. Microterricola pindariensis (Reddy et al. Type strain: strain H53 = CCUG 63370 = 2008) Dhotre et al. 2017, comb. nov. CECT 8304 = DSM 45606. Basonym: Leifsonia pindariensis Reddy et al. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 2008. 67: 4221-4227.

EMENDATION OF FAMILY

Sanguibacteraceae Stackebrandt and Streptomycetaceae Waksman and Henrici 1943 Schumann 2000 emend. Zhi et al. 2009 emend. Rainey et al. 1997 emend. Kim et al. emend. Pikuta et al. 2017 2003 emend. Zhi et al. 2009 emend. Huang Type genus: Sanguibacter Fernández- et al. 2017 Garayzábal et al. 1995. Type genus: Streptomyces Waksman and Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Henrici 1943. 67: 1442-1450. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, A member of the order Micrococcales. 67: 288-293. A member of the order Streptomycetales.

S19 EMENDATION OF GENUS

Conexibacter Monciardini et al. 2003 emend. Lentzea Yassin et al. 1995 emend. Labeda et Zhi et al. 2009 emend. Foesel et al. 2016 al. 2001 emend. Fang et al. 2017 emend. Lee 2017 Type species: Lentzea albidocapillata Yassin et Type species: Conexibacter woesei al. 1995. Monciardini et al. 2003. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2357-2362. 67: 3214-3218. A member of the family Pseudonocardiaceae. A member of the family Conexibacteraceae. Microterricola Matsumoto et al. 2008 emend. Conyzicola Kim et al. 2014 emend. Gu et al. Dhotre et al. 2017 2017 Type species: Microterricola viridarii Type species: Conyzicola lurida Kim et al. Matsumoto et al. 2008. 2014. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2766-2772. 67: 2818-2822. A member of the family Microbacteriaceae. A member of the family Microbacteriaceae. Naumannella Rieser et al. 2012 emend. Tian Flexivirga Anzai et al. 2012 emend. Hyeon et et al. et al. 2017 al. 2017 Type species: Naumannella halotolerans Type species: Flexivirga alba Anzai et al. Rieser et al. 2012. 2012. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2609-2614. 67: 479-484. A member of the family Propionibacteriaceae. A member of the family Dermacoccaceae. Sanguibacter Fernández-Garayzábal et al. Lechevalieria Labeda et al. 2001 emend. Zhao 1995 emend. Pikuta et al. 2017 et al. 2017 Type species: Sanguibacter keddieii Type species: Lechevalieria aerocolonigenes Fernandez-Garayzabal et al. 1995. (Labeda 1986) Labeda et al. 2001. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1442-1450. 67: 4655-4659. A member of the family Sanguibacteraceae. A member of the family Pseudonocardiaceae.

EMENDATION OF SPECIES

Amycolatopsis ruanii Zucchi et al. 2012 Amycolatopsis thermalba Zucchi et al. 2012 emend. Busarakam et al. 2016 emend. Busarakam et al. 2016 Type strain: strain NMG112 = NCIMB 14711 Type strain: strain SF45 = NCIMB 14705 = = NRRL B-24848. NRRL B-24845. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2016, 109: 319-334; List of changes in taxonomic 109: 319-334; List of changes in taxonomic opinion no. 26 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., opinion no. 26 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2081-2086]. 2017, 67: 2081-2086].

S20 Conyzicola lurida Kim et al. 2014 emend. Gu Sanguibacter keddieii Fernández-Garayzábal et al. 2017 et al. 1995 emend. Pikuta et al. 2017 Type strain: strain HWE2-01 = DSM 105784 = Type strain: strain ST-74 = ATCC 51767 = JCM 19257 = KCTC 29231. CCUG 36690 = CECT 4540 = CGMCC Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 1.3608 = CIP 106323 = DSM 10542 = JCM 67: 2818-2822. 11429 = NBRC 16158 = NCIMB 703025. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Kocuria turfanensis Zhou et al. 2008 emend. 67: 1442-1450. Camacho et al. 2017 Type strain: strain HO-9042 = CCTCC AB Sanguibacter marinus Huang et al. 2005 206107 = DSM 22143 = JCM 15622 = emend. Pikuta et al. 2017 KCTC 19307 = NBRC 107627. Type strain: strain 1-19 = CGMCC 1.3457 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, CIP 109015 = DSM 19083 = JCM 12547. 67: 5006-5012. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1442-1450. Mycobacterium chelonae Bergey et al. 1923 emend. Kim et al. 2017 Sanguibacter soli Kim et al. 2008 emend. Type strain: strain ATCC 35752 = CCUG Pikuta et al. 2017 47445 = CIP 104535 = DSM 43804 = JCM Type strain: strain DCY22 = DSM 21574 = 6388 = KCTC 9505 = NCIMB 1474 = JCM 14841 = KCTC 13155. NCTC 946. Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 1442-1450. 67: 3882-3887. Sanguibacter suarezii Fernández-Garayzábal Nakamurella lactea (Lee et al. 2008) Kim et et al. 1995 emend. Pikuta et al. 2017 al. 2012 emend. Nouioui et al. 2017 Type strain: strain ST-26 = ATCC 51766 = Type strain: strain DLS-10 = DSM 19367 = CCUG 36691 = CECT 4539 = CGMCC JCM 16024 = KCTC 19285 = NBRC 1.3609 = CIP 106322 = DSM 10543 = JCM 106258. 11430 = NBRC 16159 = NCIMB 703023. Reference: Stand. Genomic Sci., 2017, 12: 4; Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, List of changes in taxonomic opinion no. 26 67: 1442-1450. [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 2081-2086]. Streptomyces noboritoensis Isono et al. 1957 emend. Idris et al. 2017 Sanguibacter antarcticus Hong et al. 2008 Type strain: strain 97 = ATCC 25477 = BCRC emend. Pikuta et al. 2017 11553 = CGMCC 4.1457 = DSM 40223 = Type strain: strain KOPRI 21702 = DSM ISP 5223 = JCM 4065 = JCM 4557 = KCTC 18966 = JCM 14623 = KCTC 13143. 9060 = LMG 19337 = NBRC 13065 = Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, NRRL B-12152 = VKM Ac-1012. 67: 1442-1450. Reference: Antonie van Leeuwenhoek, 2017, 110: 705-717; List of changes in taxonomic Sanguibacter inulinus Pascual et al. 1996 opinion no. 26 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., emend. Pikuta et al. 2017 2017, 67: 2081-2086]. Type strain: strain ST-50 = CCUG 36689 = CIP 110775 = DSM 100099 = JCM 19122. Tsukamurella pseudospumae Nam et al. 2004 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, emend. Teng et al. 2016 67: 1442-1450. Type strain: strain N1176 = DSM 44118 = JCM

S21 13375 = NCIMB 13963. List of changes in taxonomic opinion no. 25 Reference: Front. Microbiol., 2016, 7: 1137; [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 7-8]. List of changes in taxonomic opinion no. 25 [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 7-8]. Tsukamurella tyrosinosolvens Yassin et al. 1997 emend. Teng et al. 2016 Tsukamurella pulmonis Yassin et al. 1996 Type strain: strain IMMIB D-1397 = CCUG emend. Teng et al. 2016 38499 = CIP 106771 = DSM 44234 = JCM Type strain: strain IMMIB D-1321 = ATCC 10112. 700081 = CCUG 35732 = CIP 104791 = Reference: Front. Microbiol., 2016, 7: 1137; DSM 44142 = JCM 10111. List of changes in taxonomic opinion no. 25 Reference: Front. Microbiol., 2016, 7: 1137; [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 7-8].

SYNONYM

Streptomyces canchipurensis Li et al. 2015 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, pro synon. Streptomyces muensis 67: 343-345. Ningthoujam et al. 2014 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Tsukamurella carboxydivorans Park et al. 67: 548-556. 2009 pro synon. Tsukamurella tyrosinosolvens Yassin et al. 1997 Streptomyces endus Anderson and Gottlieb Reference: Front. Microbiol., 2016, 7: 1137; 1952 pro synon. Streptomyces List of changes in taxonomic opinion no. 25 hygroscopicus subsp. hygroscopicus (Jensen [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 7-8]. 1931) Yüntsen et al. 1956 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Tsukamurella spongiae Olson et al. 1996 pro 67: 343-345. synon. Tsukamurella pulmonis Yassin et al. 1996 Streptomyces phaeopurpureus Shinobu 1957 Reference: Front. Microbiol., 2016, 7: 1137; pro synon. Streptomyces griseorubiginosus List of changes in taxonomic opinion no. 25 (Ryabova and Preobrazhenskaya 1957) [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 7-8]. Pridham et al. 1958 Reference: Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, Tsukamurella sunchonensis Seong et al. 2008 67: 3111-3116. pro synon. Tsukamurella pseudospumae Nam et al. 2004 Streptomyces sporocinereus Preobrazhenskaya Reference: Front. Microbiol., 2016, 7: 1137; 1986 pro synon. Streptomyces List of changes in taxonomic opinion no. 25 hygroscopicus subsp. hygroscopicus (Jensen [Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2017, 67: 7-8]. 1931) Yüntsen et al. 1956

S22 62nd Regular Colloquium

Date: Mar. 14 (Wed.), 2018 Place: Tokyo Denki University

Program:

1. “Search for new compounds using physicochemical screening” Takuji NAKASHIMA (Kitasato Univ.)

2. “Substances for activating disease defense system in plants” Kenji UMEMURA (Agri&Vet Research Labs., Meiji Seika Pharma Co., Ltd.)

3. “Discovery of a novel antifungal agent ASP2397 utilizing fungal specific transporter and its antifungal activities ” Ikuko NAKAMURA (Candidate Discovery Science Labs., Drug Discovery Research, Astellas Pharma Inc.)

4. “Cryo-EM structural analysis of the bacterial flagellar system.” Hideyuki MATSUNAMI (RIKEN Center for Life Science Technologies)

5. “Future perspectives of medicine and drug discovery opened by AI Technology and Supercomputer” Yasushi OKUNO （Department of Biomedical Data Intelligence, Graduate School of Medicine, Kyoto University）

S23 The 2018 (33rd) Annual Meeting of the Society for Actinomycetes Japan

Chair person: Koji Ichinose (Musashino University, Tokyo)

The 2018 annual meeting of SAJ (SAJ33) will be held in September 2018 in Tokyo, Japan. We are looking forward to welcoming you to participate in the meeting and to submit papers. Updated information will be provided on the following SAJ33 Website: https://www.musashino-u.ac.jp/yakugaku/shoyakukagaku/saj33/guidance_en.html.

General Outline

Dates: September 11 (Tue)-12 (Wed), 2018 Venue: Musashino University Ariake Campus (https://www.musashino-u.ac.jp/en/) Address: 3-3-3 Ariake, Koto-ku, Tokyo 135-8181, Japan TEL: +81-3-5530-7333

Registration fee (including abstracts): SAJ member 10,000 yen (8,000 yen until July 17, 2018) Student 4,000 yen (3,000 yen until July 17, 2018) Non-member 12,000 yen (10,000 yen until July 17, 2018) Abstracts only 2,000 yen

Registration is acceptable through the SAJ33 Website.

Banquet: From 18:30 on September 11 (Tue) 2018 at Hotel Sunroute Ariake (http://www.hotelsunrouteariake.jp/en)

SAJ member 9,000 yen (7,000 yen until July 17, 2018) Student member 5,000 yen (4,000 yen until July 17, 2018) Non-member 11,000 yen (9,000 yen until July 17, 2018) Non-member Student 7,000 yen (6,000 yen until July 17, 2018)

Scientific program: Invited lectures, SAJ award lectures, and contributed paper sessions (oral/poster) will be arranged.

Submission of abstracts: Abstracts for contributed oral/poster sessions should be submitted via the SAJ33 web site (in Japanese), or by contacting the SAJ33 organizing office.

Deadline for submission of abstracts will be on 29th June, 2018.

For further information, contact to: The SAJ33 organizing office c/o, Prof. Koji Ichinose, Faculty of Pharmacy & Research Institute of Pharmaceutical Sciences, Musashino University Address: 1-1-20 Shinmachi, Nishitokyo-shi, Tokyo 202-8585, Tokyo, Japan Tel/Fax: +81-42-468-8691; E-mail: [email protected].

S24 Online access to The Journal of Antibiotics for SAJ members

Eligible members of SAJ can access to online issues of The Journal of Antibiotics (JA) by taking following steps;

1. Open the SAJ official website (URL: http://www.actino.jp/) and click the banner of JA. 2. To register, enter your Membership number (10-digit figures starting with 154), First name, Last name, and E-mail address to receive a password and click 'Send'. You can find your Membership number on the envelope from SAJ. 3. Then, you will receive your password from SAJ. 4. Open the SAJ official website (URL: http://www.actino.jp/) and click the banner of JA again. To access the JA website, enter Membership number and password and click 'Login'. 5. Upon recognition of Membership number and password, SAJ site relays the access to the journal's website on nature.com 6. In the journal's website on nature.com, contents are freely available. Members can find the article from current issue table of contents, or archive issues list. Click 'PDF' or 'HTML' link of each article to read full contents.

Please note; Unique set of Membership number and password is issued and provided to each eligible members of SAJ. Members are not allowed to distribute this information to the third person or third parties. Depending on the network environment there's a case where access to full contents is not permitted even though Membership number and password is correct. In such case please contact us by email for alternative access method. When contacting please provide your membership number and password, and specify name and version of your Internet browser.

RBA Helpdesk- The Journal of Antibiotics E-mail : [email protected]

S25

日本放線菌学会誌

会報

第 32 巻 1 号

— 目次 —

巻頭言「微生物学研究者の気炎万丈を願う」早川正幸････････････････････････････ 1

2018 年度（第 33 回）日本放線菌学会大会のご案内････････････････････････････････ 3

2018 年度日本放線菌学会四賞授賞者の決定について･･････････････････････････････ 5

第 62 回日本放線菌学会学術講会････････････････････････････････････････････････ 6

日本放線菌学会賛助会員･････････････････････････････････････････････････････ 15

著作権について･･････････････････････････････････････････････････････････････ 15

巻頭言

微生物学研究者の気炎万丈を願う

日本の科学研究力が近年、衰退してきていることが叫ばれています。Nature では複数回にわたって日本の研究力に関する特集を組み、この 10 年間における停滞に警鐘を鳴らしました。本年 3 月の Nature 特集記事（Vo. 555, Issue 7697, 22 March 2018）では、Nature Index 掲載の高品質論文のうち日本の論文の割合は 2012 年の9.2%から 2017 年は8.6%に減少したこと、またElsevier 社の Scopus 収録自然科学系論文に占める日本の論文の割合は 2007年の 7.7%から2017 年は 5.1% に減少したことが示されています。国内でも文部科学省の「科学技術のベンチマーキング 2017」（科学技術・学術政策研究所）や「平成 30 年版科学技術白書」において、過去 10 年で日本の論文数や Top 10%論文の国際シェアの減少が見られることが報告されています。

7000

分野 6000

5000

Microbiology アメリカ

； 4000 中国ドイツ論文数 3000 イギリス

掲載日本 2000

1000 Web of Science 0

図 1 微生物学分野における論文数の国別経年推移

使用データベース：InCites（Clarivate Analytics 社）．対象分野と対象論文： Microbiology 分野（Essential Science Indicators 22 分野分類）で Web of Science に掲載された論文．データ抽出日：2018 年 6 月 11 日．図の作成者：山梨大学 URA センター助教奥脇勝也．

1 ところで最近、国内の大学で研究の企画・マネジメントなどを担う URA（リサーチ・アドミニストレーター）組織が構築されてきています。私の所属する山梨大学の URA センターでは、活動の一環として研究分野別の科学論文数等を調査し、学内研究の企画運営に活用しています。図 1 は調査結果の一つで、クラリベイト・アナリティクス社による ESI22 分野分類のうち「Microbiology」分野の論文数の国別経年推移を示したものです。図 1 では、1990 年以降にアメリカ、ドイツ、イギリスでは順調に論文数が増え、さらに中国では 2005 年以降に劇的に論文数が増えているのに対し、日本では 2005 年以降、論文数の増加が停滞していることが示されています。ちなみに、2008 年から 2017 年の 10 年間における Microbiology 分野の論文数の増加率を計算すると、アメリカ 28％、中国 390％、イギリス 37％、ドイツ 41％に対し、日本はなんとマイナス 4％でした。微生物学は言うまでも無く、2015 年の大村智先生および 2016 年の大隅良典先生のノーベル医学・生理学賞受賞に代表されるように、日本のお家芸の一つであります。しかし、図 1 に示された状況が今後も続くと、やがて日本の微生物研究は世界の潮流から取り残されることは想像に難くありません。なぜ、日本の研究力が衰退してきているのか？その要因の一つは、Nature の記事”Budget cuts fuel frustration among Japan’s academics”（Vol. 548, Issue 7667, 17 August 2017）等で指摘されているように、国の科学研究予算（例えば国立大学への運営費交付金）の削減だと考えられます。研究費の増額については、その必要性の理由とともに様々な機会をとおして声を高くしていくことが研究機関や関連学会の長の役割の一つだと思っております。しかし一方で、“経常的研究費が少ないから研究が進まない”では科学技術力の衰退は免れようがありません。独創的な研究を開拓し、国内外の競争的研究資金に積極的にチャレンジするとともに、研究領域や研究機関・組織そして国を越えた共同研究が必要になってくると考えます。そして何よりも、若い研究者達が大村先生や大隅先生の偉業を越える意気込みで、より挑戦的な研究を展開されていくことを切望するものです。

日本放線菌学会会長早川正幸（山梨大学）

2018 年度（第 33 回）日本放線菌学会大会のご案内

大会長市瀬浩志（武蔵野大学薬学部・薬学研究所）

2018 年度大会は、2020 年の東京五輪等で競技会場が集中する臨海副都心での開催となります。最先端の情報にふれることができる刺激的な環境に皆様をお招きできることを楽しみにいたしております。多数の皆様のご参加を心よりお待ち申し上げております。詳しい情報は大会のウェブサイト（下記）を通じて随時ご案内いたします。

メインサイト：https://www.musashino-u.ac.jp/yakugaku/shoyakukagaku/saj33/ 英語版サイト：https://www.musashino-u.ac.jp/yakugaku/shoyakukagaku/saj33/guidance_en.html

概要

期日：平成 30 年 9 月 11 日（火），12 日（水）会場：武蔵野大学有明キャンパス（〒135-8181 東京都江東区有明 3-3-3）〒135-8181 東京都江東区有明 3-3-3 （りんかい線国際展示場駅徒歩７分・ゆりかもめ国際展示場正門駅徒歩６分） TEL：03-5530-7333 https://www.musashino-u.ac.jp/

講演申し込み，講演要旨提出の締切日：平成 30 年 6 月 29 日（金）大会参加の事前申し込みの締切日：平成 30 年 7 月 17 日（火）

参加費（講演要旨集代を含む） 7 月 17 日まで 7 月 18 日～当日正会員： 8,000 円 10,000 円学生： 3,000 円 4,000 円非会員： 10,000 円 12,000 円＊要旨集（2,000 円）のみをご希望の方は, 大会事務局までご連絡下さい。

懇親会日時：平成 30 年 9 月 11 日（火）18:30～20:30 （予定）会場：ホテルサンルート有明 (https://www.sunrouteariake.jp/) 会費： 7 月 17 日まで 7 月 18 日～当日正会員： 7,000 円 9,000 円学生会員： 4,000 円 5,000 円非会員： 9,000 円 11,000 円非会員学生： 6,000 円 7,000 円

プログラム概要（詳細は大会ウェブサイトをご覧下さい。） 1. 一般講演（口頭発表とポスター発表 [ショートプレゼンテーションあり]） 2. 受賞講演（大村賞・功績功労賞・浜田賞・企業賞） 3. 招待講演（掛谷秀昭, 京都大学大学院教授・鈴木睦昭, 国立遺伝学研究所室長）

3 参加および講演申し込み要領

● 参加および講演申し込み（大会登録システムをご利用ください）大会ウェブサイト(https://www.musashino-u.ac.jp/yakugaku/shoyakukagaku/saj33/)の参加登録より、リンク先の大会登録システムで参加・講演登録して下さい。

＊講演申し込み、講演要旨提出の締切日：平成 30 年 6 月 29 日（金）＊大会参加の事前申し込みの締切日：平成 30 年 7 月 17 日（火）

● 参加費・懇親会費等の振込み：下記の口座へお振込み下さい。大会の運用口座が総合口座になっている関係で「振込取扱票」による送金（通常振込）がご利用できません。お手数をおかけ致しますが、お手元のゆうちょ口座からの電信振替または現金による電信払込（窓口取扱）をご利用下さい。

郵便局から口座記号番号：10150 − 87989411 口座名称（漢字）：日本放線菌学会第 33 回大会口座名称（カナ）：ニホンホウセンキンガッカイダイサンジュウサンカイタイカイ

他行等から銀行名：ゆうちょ銀行店名：〇一八（ゼロイチハチ）店、店番：０１８預金種目：普通口座番号：8798941 口座名称（カナ）：ニホンホウセンキンガッカイダイサンジュウサンカイタイカイ

● 発表者は学会会員に限らせていただきます。入会手続きについては学会ホームページをご覧下さい。口頭発表の希望者が多い場合、ポスター発表への変更をお願いすることがあります。ポスター発表者にはショートプレゼンテーションを行っていただく予定です。 ● 講演要旨：大会登録システムにある雛形をダウンロードして登録システムで入稿して下さい。和文・英文どちらで作成して頂いても結構ですが、発表言語との統一（和文→日本語、英文→英語）をお願い申し上げます。所属は和文・英文とも省略形で記入してください。英文タイトル等は英文プログラム作成に使用します。2 ページ目に記載してください（英文要旨の場合には不要）。 ● 発表形式の詳細等は、電子メールにてお知らせいたします。 ● 発表スライドならびにポスターは英語で作成することを推奨いたします。

お問合せ先（大会事務局）〒202-8585 西東京市新町 1-1-20 武蔵野大学薬学部・薬学研究所生薬化学研究室内第 33 回放線菌学会大会事務局 Tel/Fax: 042-468-8691 E-mail: [email protected]

4 2018年度日本放線菌学会四賞授賞者の決定について

2018年4月20日会長早川正幸

日本放線菌学会は、下記のように2018年度日本放線菌学会四賞授賞者を決定しましたので以下にご報告致します。日本放線菌学会大村賞（学会賞）および日本放線菌学会功績功労賞候補者については、理事、評議員、監事およびその経験者が推薦することができます。日本放線菌学会浜田賞（研究奨励賞）および日本放線菌学会企業賞候補者については、自薦も含めてすべての正会員が推薦できることになっておりますので、今後も、積極的なご推薦をお願い申し上げます。

【大村賞（学会賞）】五十嵐康弘氏（富山県立大学）「先駆的ケミカルアプローチによる放線菌二次代謝多様性の解明」

【功績功労賞】天野昭一氏（元明治製菓株式会社）「多様な放線菌とその代謝産物の発見および電子顕微鏡観察への貢献」

【浜田賞（研究奨励賞）】勝山陽平氏（東京大学）「放線菌における芳香族アミン由来天然物等の生合成機構に関する研究」福本敦氏（東邦大学）「放線菌により産生される細菌感染を制御するための化合物の探索」

【企業賞】アステラスファーマテック株式会社、富山技術センター「放線菌 Streptomyces tsukubensis が生産するタクロリムスの安定供給および増産への取り組み」

以上

5 報告第 62 回日本放線菌学会学術講演会

主催：日本放線菌学会日時：平成 30 年 3 月 14 日(水) 13:30～18:10 場所：東京電機大学東京千住キャンパス参加者： 56 名

プログラム１．『Physicochemical screening による新規二次代謝産物の探索』中島琢自 (北里大学北里生命科学研究所）２．『植物の病害防除機構を活性化する物質とその作用について』梅村賢司 (Meiji Seika ファルマ株式会社生物産業研究所）３『真菌特異的トランスポーターを利用した新規抗真菌剤ASP2397の発見と抗真菌活性』中村郁子 (アステラス製薬株式会社研究本部キャンディデートディスカバリー研究所）４．『クライオ電子顕微鏡法による細菌べん毛の高分解能構造解析』松波秀行 (理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター) ５．『AI・スーパーコンピュータが拓く創薬の未来』奥野恭史 (京都大学大学院医学研究科人間健康科学系専攻臨床看護学講座ビッグデータ医科学分野)

Physicochemical screening による新規二次代謝産物の探索中島琢自（北里大学北里生命科学研究所） [email protected]

ゲノム解析技術が進展し、放線菌は多くの二次代謝遺伝子を保有していることがわかった。1 その二次代謝生合成経路は 5 つに大別（ポリケチド, メバロン酸・非メバロン酸, アミノ酸, 糖質, シキミ酸経路）でき、単独もしくは複数の代謝系が関わって二次代謝産物が生産される。しかし、わずか 5 つの二次代謝経路で複雑・多様な構造を生み出している。

6 そこには二次代謝の基質となる原料の違いや修飾酵素など様々な要因が関わっている。さらに同じ類縁体でもわずかな構造的な違いにより全く異なる生物活性を示すなど、放線菌が生産する二次代謝産物の有効利用を考えると天文学的な数になる。北里大学大村創薬グループは約 60 年に渡って微生物代謝産物から 500 以上の新規化合物を発見し、その生産菌を長期保存している。そのうち、avermectin や staurosporine など代表的な新規有用物質を生産する微生物を含めた放線菌保存株約 330 菌株を復元し、4 種類の生産培地を用いて培養液抽出物ライブラリーを作製した。演者らはこのライブラリーを機器分析による physicochemical screening で新規物質を探索した。

1) Streptomyces griseus OS-3601 株より見いだされた iminimycin： MakerView 解析により、約 1,200 サンプルのうち OS-3601 株の 1 培養液に m/z 242 を示す化合物が含まれていることがわかった。OS-3601 Streptomyces griseus OS-3601 株は 1981 年に熊本県阿蘇の土壌から分離され、streptomycin 生産菌として長期保存され、Streptomyces griseus と同定された株である。各種クロマトグラフィーにより精製し、類縁体も含めて 2 種類の新規ポリケチド化合物（iminimycin A と B）2,3 を得ることができた。構造解析 Iminimycin A の結果、iminimycin A は放線菌では初めての知見となるイミニウムイ Fig. 1 Iminimycin A のオンを持つインドリジン化合物、iminimycin B はピリジニウムイオン生産菌と構造を持つ類縁体であった（Fig. 1）。 Iminimycin は弱い抗菌活性、細胞毒性を示した。

2) Streptomyces rosa subsp. notoensis OS-3966 株より見いだされた新規 nanaomycin 類縁体：能登半島の七尾市から単離された OS-3966 株の代謝産物から 1974 年に nanaomycin A および B が発見され、1979 年までに 5 種類の類縁体が見いだされた。Nanaomycin A4 は皮膚糸状菌に対して強力な抗真菌活性を示し、動物用皮膚糸状菌症治療薬として使用されている。OS-3966 株の培養液から m/z 805 を示す化合物に注目し、各種クロマトグラフィーにより精製した。その結果、類縁体も含めて 3 種類の新規物質（nanaomycin F, G, H）5,6 を得ることができた。NMR および質量分析による構造解析の結果、Fig. 2 に示した構造であることがわかった。3 つの新規類縁体は抗菌活性は消失していたが、nanaomycin H に新規生物活性である上皮間葉転換を誘導させた細胞に対して殺活性が認められた。

7 OH O CH3 OH O O

OH OH O

Streptomyces rosa subsp. notoensis OS-3966 Nanaomycin F

OH O CH3 OH O O

OH S O H CH3 N O HO CH3 OH O CH3 OH O OH O N O O O OH H O OH O HO OH OH HO O O O CH HO OH O 3 HO

Nanaomycin A Nanaomycin G Nanaomycin H

Fig. 2 新規 nanaomycin 類縁体の生産菌と構造

Iminimycin は抗菌活性を示したが、OS-3601 株は streptomycin や cyclohexmide を生産し、抗菌活性を指標にした場合、見いだすことができなかった可能性が高い。また、nanaomycin A は 1,4-ナフトキノン骨格を有し、1 電子還元されたセミキノンラジカルとなり、酸素と反応してスーパーオキシドを発生する。一方、nanaomycin H はナフトキノンがテトラリン -1,4-ジオンに還元されているため、セミキノンラジカルを形成できず、抗菌活性が消失したと考えられる。Nanaomycin A を発見した当時も nanaomycin H を生産していたと考えられるが、抗菌活性を示さなかったため、発見されなかったと考察している。

参考文献 1) Nett M., et al., Nat. Prod. Rep., 26: 1362–1384 (2009) 2) Nakashima T., et al., J. Antibiot., 69: 611-615 (2016) 3) Nakashima T., et al., Tetrahedron Lett., 30: 3284-3286 (2016) 4) Ōmura, S., et al., J. Antibiot., 27: 363-365 (1974) 5) Nakashima T. et al., J. Biosci. Bioeng., 120: 596-600 (2015) 6） Nakashima T. et al., J. Biosci. Bioeng., 123: 765-770 (2017)

8 植物の病害防除機構を活性化する物質とその作用について梅村賢司（Meiji Seika ファルマ株式会社生物産業研究所） [email protected]

植物は、病原菌からの感染に対して、過敏感細胞死、感染特異的(PR)タンパク質の誘導、抗菌性物質(ファイトアレキシンなど)の蓄積など、様々な防御応答する。この病害防御機構は、植物が病原菌由来の特定の成分を認識して始まるなど、哺乳動物の免疫機構との類似性が知られている。また、植物の防御防御機構は、病原菌由来の成分以外にも、特定の化学物質を処理することでも活性化できる。このような化学物質の一部は農薬として実用化されており、国内の最重要病害の一つである「イネいもち病」において主要な防除手段として普及している。本講演では、植物の病害防御機構を活性化する物質として、当社品である化学合成農薬と当社の研究で見出された病原菌成分について、その作用機序を中心に紹介したい。

植物の病害防御機構を活性化するタイプの農薬

化合物名主要対象病害主要対象病害の登録構造式開発会社または抽出物（作物 / 病害）登録国登録年

イネ / いもち病 Meiji Seika プロベナ野菜 / 軟腐病、ファルマ日本 1974 年ゾール黒腐病 (旧明治製菓) 斑点細菌病

シンジェンタアシベンゾラ 1998 年イネ / いもち病（旧チバガイギ日本ル S-メチル (2003 年失効) ー）

チアジニルイネ / いもち病日本農薬日本 2003 年

イソチアニルイネ / いもち病バイエル日本 2010 年

9 オオイタドリ野菜 / うどんこ病、 ― Marrone US 2009 年抽出物灰色かび病

海藻抽出物果樹 / 火傷病、 ― Goëmar EU 2013 年（ラミナリン）腐敗病

参考文献 1) 梅村, JATTAF ジャーナル, 4: 15-19 (2016) 2) Umemura et al., Plant Journal, 57: 463-472 (2009) 3) Umemura et al., Plant Cell Physiol., 41: 676-683 (2000) 4) 梅村&古賀, 植物の生長調節, 38: 229-239 (2003) 5) Umemura et al. Phytopathology, 94: 813-818 (2004)

真菌特異的トランスポーターを利用した新規抗真菌剤 ASP2397 の発見と抗真菌活中村郁子（アステラ製薬株式会社研究本部キャンディデートディスカバリー研究所） [email protected]

深在性真菌症は、免疫状態が低下した状態になった時に発症し、しばしば致死的な経過を辿る重篤な感染症である。近年、ステロイド治療、抗がん剤による治療、移植時の免疫抑制剤の使用等の医療的介入により全身の免疫能が低下することで、深在性真菌症患者が増加し、これら易感染性患者における日和見真菌感染症が医療上の問題となっている。最も頻度の高い深在性真菌症はカンジタ症であり、主な起因菌は皮膚や消化管内の常在菌である Candida 属である。難治性で予後が悪い侵襲性アスペルギルス症は、空中や土壌に広く分布する Aspergillus 属が起因菌である。現在臨床で用いられている深在性抗真菌薬は、カンジタ症には真菌の細胞膜合成阻害であるアゾール系抗真菌薬のフルコナゾールや、真菌の細胞壁合成阻害であるエキノキャンディン系抗真菌薬のミカファンギンがあり、一定の治療効果を得ている。一方、侵襲性アスペルギルス症は、新世代アゾールであるボリコナゾールを第一選択薬とし、細胞膜エルゴステロールへの結合による細胞膜障害作用のアンホテリシン B のリポソーム製剤やエキ

10 ノキャンディン系も第二選択薬として使用されている。しかしながら未だ有効性と副作用の面で問題点も多く、臨床的有用性の高い侵襲性アスペルギルス症の薬剤の開発が望まれている。このような背景から、我々は微生物代謝産物から有効性と安全性を兼ね備えた新規抗真菌薬を見出すことを目的に、本研究を開始した。微生物培養液からの新規活性物質創出に大切なことは、スクリーニングに供する微生物の多様性と微生物培養液中に如何に生理活性物資を生産させるかである。当時微生物の多様性拡大のため、マレーシアの SIRIM 社、TropBio 社と共同研究を行い、熱帯資源を導入していた。また新規抗真菌活性物質を生産させる微生物を効率的に選択するため、 Aspergillus fumigatus と共培養し、A. fumigatus 存在下で抗真菌活性を示す微生物を培養し、スクリーニングに供していた。一方抗真菌薬を探索する上で障害となったのは、被験菌の培養条件で薬剤の感受性が大きく影響されることと、in vitro と in vivo の活性が必ずしも相関しないことであった。そこで我々は、動物感染実験系をスクリーニングシステムに組み込むこととした。当時マウスのアスペルギルス全身感染モデルでの薬効判定には、最低でも 1 週間を要し、微生物培養液を直接投与してスクリーニングするには不向きであった。そこで当時東京大学薬学部の関水和久教授らが学会で発表していたカイコ幼虫感染系 1)の使用許諾を得て、簡便かつ短期間で判定可能なアスペルギルス感染系を構築した。これらの取り組みによって、我々はマレーシア落葉から分離したカビ (Acremonium persicinum MF-347833)より ASP2397 を見出した。ASP2397 はカイコ幼虫感染系のみならず、マウス全身感染モデルでも強い薬効を示した 2) 3)。現在導出先の Vical 社 (San Diego, CA)にて、Phase 1 試験を終了し、2018 年に侵襲性アスペルギルス症での Phase 2 試験を予定している 4)。本講演では、既存薬とは異なる作用を有する ASP2397 の魅力について、カイコ幼虫感染系構築から ASP2397 の発見、構造確定、in vitro 抗真菌活性、in vivo での感染防御効果、作用機序探索等の観点から発表する。

参考文献 1) Hamamoto H, Kurokawa K, Kaito C, Kamura K, Manitra Razanajatovo I, Kusuhara H, Santa T, Sekimizu K., Quantitative evaluation of the therapeutic effects of antibiotics using silkworms infected with human pathogenic microorganisms. Antimicrob Agents Chemother, 48: 774-9 (2004)

11 2) Nakamura I, Kanasaki R, Yoshikawa K, Furukawa S, Fujie A, Hamamoto H,Sekimizu K., Discovery of a new antifungal agent ASP2397 using a silkworm model of Aspergillus fumigatus infection. J Antibiot (Tokyo), 70: 41-44 (2017) 3) Nakamura I, Yoshimura S, Masaki T, Takase S, Ohsumi K, Hashimoto M, Furukawa S, Fujie A., ASP2397: a novel antifungal agent produced by Acremonium persicinum MF-347833. J Antibiot (Tokyo), 70: 45-51 (2017) 4) http://vica l.com/

クライオ電子顕微鏡法による細菌べん毛の高分松波秀行（理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター） [email protected]

昨年、長年にわたりクライオ電子顕微鏡法の開発に携わってきた 3 人の研究者が 2017 年度のノーベル化学賞を受賞したことは記憶に新しい。ここ数年、クライオ電子顕微鏡法で明らかになった生体分子構造が、トップジャーナルの表紙を賑わせている。これまで、ウイルスやリボソームなどの生体超分子の構造解析法として認知されていたクライオ電子顕微鏡法が、次世代の構造生物学の担い手として注目を浴びている。電子を直接検出できる検出器の登場によって画像撮影方法が一変し、新たに開発された画像解析プログラムとの

組み合わせによって、これまで X 結晶構造解析法では困難であった膜タンパク質や超分子複合体の構造解析が加速すると期待されている。今後、クライオ電子顕微鏡法が核となる

創薬研究が一気に進むと考えられる。細菌はべん毛と呼ばれる運動装置を利用して溶液中を巧みに泳ぎ回る。べん毛は 20 種類以上のタンパク質で構成される超分子複合体で、フィラメント、フックと基部体に分けら

れる[1]。フィラメントやフックは菌体の外側に構築されるらせん状のタンパク質である。フックはユニバーサルジョイントとして基部体とフィラメントと繋ぐ部分で、フィラメントの滑らかな回転には欠かせない。べん毛では、細胞膜を隔てた特定のイオンの流入によって基部体が回転しフィラメントによって推進力を生み出す。国内からも、クライオ電子顕微鏡法によるらせん対称性を用いた細菌べん毛のフィラメントやフックの原子分解能モ

デルが報告された[2-5]。クライオ電子顕微鏡構造解析に成功したべん毛の例を示しながら、最近の研究動向を議論する。

12 参考文献 1) Berg, H., Anuu. Rev. Biochem., 72: 19-54 (2003) 2) Yonekura, K., et al., Nature, 424: 643-50 (2003) 3) Fujii, T., et al., Structure, 17: 1485-1493 (2009) 4) Matsunami, H., et al., Nat. Commun., 7: 13425 (2016) 5) Fujii, T., et al., Nat. Commun. 8: 14276 (2017)

AI・スーパーコンピューターが拓く創薬の未来奥野恭史（京都大学大学院医学研究科人間健康科学系専攻臨床看護学講座ビッグデータ医科学分野）

第一の科学的手法である「経験科学（実験科学）」、第二の科学的手法である「理論科学」に加え、近年新たな潮流として、第三の科学的手法である「計算科学（シミュレーション科学）」と第四の科学的手法である「データ科学（data centric science）」が注目をあびている。実際、2013 年のノーベル化学賞に、ハーバード大のカープラス教授らが、創薬計算などにも貢献する計算化学の基盤技術で受賞するなど、生命科学分野における「シミュレーション科学」の重要性は高まる一方である。また、近年のハイスループット技術やオミクス計測技術の著しい進展に伴い、生命科学分野においてもデータ爆発が起こり、「ビッグデータ科学」の研究開発が急務とされている。このように多種多様かつ膨大なデータに直面する最中、今度はこれらビッグデータを解析する技術として人工知能が注目されるに至っている。言うまでもなく、人工知能分野そのものは新興の分野という訳でないが、Google 社の Deep Learning や IBM 社のワトソンの出現により、近年の人工知能技術のパフォーマンスと可能性にさまざまな分野が大きな期待を寄せている。演者は、これまでにスーパーコンピュータ「京」を用いた創薬計算や AI 技術の創薬応用に関する研究開発を行ってきた。例えば、我が国では、2020 年頃の本格運用を目指し、理化学研究所計算科学研究機構を中心に次期スーパーコンピュータであるポスト「京」の開発がスタートしている。演者は、9 つの重点課題の一つである創薬分野「生体分子システムの機能制御による革新的創薬基盤の構築」の代表研究者として、次世代の創薬計算技術の開発を担当している。ポスト「京」において我々が目指すところは、生体分子の動きをシミュレーションする計算（分子動力学計算）の速度を「京」の数十倍程度の速さにするこ

13 とによって、生体内分子（タンパク質など）の長時間（ミリ秒レベル）の動きを捉え、より多くの生体内分子を対象にした創薬シミュレーションを実現することである。これにより、疾患の原因タンパク質の動的制御や複数の創薬関連タンパク質を加味したドラッグデザインの新しい方法を開発する。具体的には、ポスト「京」の演算能力を最大限に活かす分子シミュレーション技術を開発することで、生体分子システムの時間的空間的機能解析を実現する新たな構造生命科学の開拓と次世代創薬計算技術の開発を目指す。さらには、これらの要素計算技術を創薬計算フローに沿って連結した統合システムを開発することで、高精度かつ超高速の革新的な創薬計算基盤の確立を目指している。また演者は、ライフ分野を対象とした AI 開発を産学、異業種連携で進めるため、昨年 11 月にライフ・インテリジェンス・コンソーシアム（LINC）を立ち上げた。LINC は、京大・理研などのアカデミアの支援のもと、IT 業界と、製薬・化学、医療・ヘルスケア、食品のライフサイエンス分野の企業など約 70 社・団体がタッグを組むことで、AI 戦略による保健医療分野・関連産業の振興を目指すものである。本講演では、演者のこれまでの具体的な研究開発を例に、スパコンや AI などの先端計算技術の創薬の可能性について紹介する。

14 日本放線菌学会賛助会員

長瀬産業(株)研究開発センターアステラスファーマテック(株)富山技術センター技術開発部協和発酵キリン(株)研究本部創薬化学研究所 (公財)微生物化学研究会微生物化学研究所第一三共 RD ノバーレ(株)合成化学研究部天然物グループ Meiji Seika ファルマ(株)足柄研究所日本マイクロバイオファーマ(株)研究開発部合同酒精(株)酵素医薬品研究所味の素株式会社・イノベーション研究所大鵬薬品工業株式会社天然物フロンティア研究所トヨタ紡織株式会社基礎研究所富士シリシアチーム未来グループ

著作権について

本誌に掲載された論文、抄録、記事等の著作権は、日本放線菌学会に帰属します。これら著作物の一部または全部をいかなる形式でもそのまま転載しようとするときは、学会事務局から転載許可を得て下さい。

日本放線菌学会誌第 32 巻 1 号 ACTINOMYCETOLOGICA 平成 30 年 6 月 29 日発行

編集兼発行日本放線菌学会〒141－0021 東京都品川区上大崎 3-14-23 公益財団法人微生物化学研究会微生物化学研究所内日本放線菌学会事務局電話: 03-6455-7169 Fax: 03-3441-7589 E-mail [email protected] 年間購読料 5,000 円（会員無料） http://www.actino.jp/

B5判 264頁＋口絵4頁 ISBN 978-4- 86399-101-9 C3047 みみずく舎：発行／医学評論社：発売定価4,104円（税込み）学会特別頒布価格3,200円（税・送料込み）

日本放線菌学会編日本学会事務センター刊 ISBN 978-4891140113 A4版上製、410頁定価7,000円（税別）特別価格 4,500円（税および送料別）

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1990年12月18日第４種郵便物認可 ISSN 0914-5818 2018 VOL. 32 NO. 1

C 2014 T VOL. 27 NO. 1 IN (会員用) O

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日本 I 放線 C 菌学会 http://www0.nih.go.jp/saj/index-j.html 誌 Published by ⽇本放線菌学会誌第32巻1号 ACTINOMYCETOLOGICA VOL.32 NO.1, 2018 The Society for Actinomycetes Japan