Étude De La Variabilité Génétique De Populations Sauvages Et Captives De La Perche Eurasienne Perca Fluviatilis, Espèce En Cours De Domestication Sana Ben Khadher
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Étude de la variabilité génétique de populations sauvages et captives de la perche eurasienne Perca fluviatilis, espèce en cours de domestication Sana Ben Khadher To cite this version: Sana Ben Khadher. Étude de la variabilité génétique de populations sauvages et captives de la perche eurasienne Perca fluviatilis, espèce en cours de domestication. Sciences agricoles. Université de Lorraine, 2015. Français. NNT : 2015LORR0197. tel-01754452 HAL Id: tel-01754452 https://hal.univ-lorraine.fr/tel-01754452 Submitted on 1 Oct 2020 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. 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Pascal Fontaine, Professeur des Universités et directeur de l’équipe domestication en aquaculture continentale, pour m'avoir accueillie au sein de son équipe. Je lui suis très reconnaissante pour le temps conséquent qu’il m’a accordé, ses qualités pédagogiques et scientifiques, sa franchise, sa sympathie et pour le soutien scientifique et moral qu’il m’a apporté tout au long de cette thèse. Son énergie et sa confiance ont été des éléments moteurs pour moi. J’adresse de chaleureux remerciements à mon co-encadrant de thèse, M. Fabrice Teletchea, Maître de conférences à l’université de Lorraine, pour son attention de tout instant sur mes travaux, pour ses nombreuses suggestions, ses conseils avisés et son écoute qui ont été prépondérants pour la bonne réussite de cette thèse. Son œil critique m’a été très précieux pour structurer ce travail, pour améliorer la qualité des différentes sections. Nos échanges m’ont permis d’acquérir une culture scientifique au-delà de mon sujet de recherche et m’ont fourni l’occasion d’améliorer ma façon d’exposer. J’ai pris un grand plaisir à travailler avec lui. Je tiens à remercier les membres du jury pour avoir consacré de leur temps à l’évaluation de ce manuscrit. Je voudrais remercier Mme Béatrice Chatain, cadre de recherche C3 à l’IFREMER Palavas-Les-Flots, et M. Guillaume Evanno, chargé de recherche à l’UMR ESE à Rennes, qui m’ont fait l’honneur d’être les rapporteurs de ma thèse et pour l’intérêt qu’ils ont porté à mon travail. J'associe à ces remerciements M. Charles Mélard, Professeur des Universités de Liège pour avoir accepté d’examiner mon travail et être membre de mon jury. J’adresse aussi des remerciements très particuliers à M. Jean-François Agnèse, directeur de recherche à l’IRD et directeur adjoint de l’ISEM, qui m’a beaucoup aidé pendant mes stages à l’ISEM de Montpellier. Outre son appui scientifique, il a toujours été disponible pour me soutenir et me conseiller au cours de l’élaboration de mes articles. Nos échanges par mail ou 2 ----------------------------------------------------------------------------- Remerciements par téléphone m’ont été d’une très grande utilité. J’ai beaucoup appris à ses côtés et je lui adresse ma gratitude pour tout cela. Tout le travail présenté dans ce manuscrit n’aurait pas été possible sans l’appui du ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche scientifique de la Tunisie qui m’a accordé une bourse de recherche pour mon master en Belgique puis pour ma thèse durant trois années. Je suis reconnaissante envers Sylvain Milla pour ses relectures enrichissantes et ses conseils pertinents pour améliorer mes capacités de rédaction ainsi qu’Alain Pasquet pour ses conseils qui m’ont beaucoup aidé et ses enrichissantes conversations. Je voulais aussi exprimer toute ma gratitude à toute l’équipe de l’ISEM, plus particulièrement Frédérique Cerqueira et Erick Desmarais, qui m’ont accueillie pour une période totale de six mois. Un grand merci pour Frédérique de m’avoir toujours privilégié pour le passage des plaques au séquenceur, et pour les conversations sympathiques. Je n’oublierai pas les aides permanentes reçues du personnel administratif : Patricia Erndt et Catherine Larrière pour leur gentillesse. Et comment oublier notre sympathique et agréable secrétaire de l’école doctorale Christine Fivet ! Bien sûr, atteindre ces objectifs n’aurait pas été possible sans l’aide des pêcheurs français et suisses, je cite Michael Dumaz, David Bened, Daniel Champier, Jean-Jacques Beausire, André Gay, Fréderic Clerc, Claude Delley, Didier Magnin et François Schmid, je n’oublierai jamais leur accueil chaleureux et leur curiosité pour comprendre ce qui se passe dans les lacs Léman et Neuchâtel. Leur gratitude fût l’un des moments les plus joyeux de ma thèse. Un grand merci aussi pour les perciculteurs pour m’avoir fourni des échantillons de poissons. Je pense également aux doctorants et collègues de bureau avec qui j’ai partagé des moments inoubliables de ma vie, des discussions intéressantes ainsi que les repas de midi : Maud, Tatiana, Imen, Amine, Jennifer, Brian, Evelyne et Juliette. Une pensée toute particulière à ma copine Emilie avec qui j’ai eu beaucoup de complicité et d’entente, ‘’Gwen’’ je ne t’oublierai jamais !! Merci Didier pour tes conseils et tes relectures d’anglais. Mes sincères gratitudes à tous les collègues de l’équipe, plus particulièrement : Marielle, Bérénice, 3 ----------------------------------------------------------------------------- Remerciements Dominique, Damien, Daniel, Yannick, Alain et Joëlle, pour leurs conseils et bonne humeur. Je ne peux pas oublier mon unique stagiaire, Marc. Je te remercie pour ton assiduité et gentillesse. Mes remerciements vont aussi à mon père Khemaies et ma mère Samira, qui m’ont encouragé depuis mes premiers pas et m’ont permis de ne jamais dévier de mon objectif final. Je les remercie pour le soutien moral mais aussi financier qu’ils m’ont apporté. Sans votre amour et votre force que vous me transmettez, je n’aurai jamais réussi ma vie !! Merci également à mon frère, mes sœurs, mes belles-sœurs, ma nièce, mon neveu, mes beaux- parents, mes cousines, et mes amis pour m’avoir toujours remonté le moral. Je voudrais également remercier mon oncle Salem et ma tante Nicole de m’avoir accueillie chez eux pendant mon Master et de m’avoir encouragé à poursuivre ma thèse à Nancy. Enfin, je remercie mon cher époux, Haykel, et à qui je dédie cette thèse pour son soutien quotidien indéfectible même dans les périodes angoissantes et fréquentes de doutes et son enthousiasme contagieux à l’égard de mes travaux comme de la vie en général, pour sa présence à Nancy malgré ses engagements d’enseignant en Tunisie. Je te remercie d’être professionnel et franc dans tes commentaires et d’être aimant et tendre dans les moments de faiblesse et de doute. Merci pour ton affection et ton réconfort sans limite. 4 Table des matières Remerciements ...................................................................................................... 2 Résumé .................................................................................................................. 8 Abstract ................................................................................................................. 9 Liste des figures .................................................................................................. 10 Liste des tableaux ............................................................................................... 12 Glossaire.............................................................................................................