Èíòåãðàöèîííûå Ïðîåêòû Ñî Ðàí Âûï. 7 Sb Ras Integrate
Total Page:16
File Type:pdf, Size:1020Kb
Перейти на страницу с полной версией» Âûï. 7 SB RAS INTEGRATE PROJECTS INTEGRATE RAS SB ÈÍÒÅÃÐÀÖÈÎÍÍÛÅ ÏÐÎÅÊÒÛ ÑÎ ÐÀÍ ÑÎ ÏÐÎÅÊÒÛ ÈÍÒÅÃÐÀÖÈÎÍÍÛÅ Issue 7 Перейти на страницу с полной версией» Перейти на страницу с полной версией» RUSSIAN ÀCÀDEMY O SCIENCES SIBERIAN BRANCH BIODIVERSITY and Dinamic of Ecosystems: Computationl Approaches and Modelling Executive editors: Academician of RAS V.K. Shumny, Yu.I. Shokin Corresponding member of RAS N.A. Kolchanov, A.M. edotov NOVOSIBIRSK PUBLISHING HAUSE O THE SIBERIAN BRANCH O THE RUSSIAN ACADEMY O SCIENCES 2006 Перейти на страницу с полной версией» Перейти на страницу с полной версией» ÐÎÑÑÈÉÑÊÀß ÀÊÀÄÅÌÈß ÍÀÓÊ ÑÈÁÈÐÑÊÎÅ ÎÒÄÅËÅÍÈÅ ÈÍÑÒÈÒÓÒ ÖÈÒÎËÎÃÈÈ È ÃÅÍÅÒÈÊÈ ÈÍÑÒÈÒÓÒ ÂÛ×ÈÑËÈÒÅËÜÍÛÕ ÒÅÕÍÎËÎÃÈÉ ÈÍÑÒÈÒÓÒ ËÅÑÀ èì. Â.Í. ÑÓÊÀ×ÅÂÀ ÈÍÑÒÈÒÓÒ ÑÈÑÒÅÌÀÒÈÊÈ È ÝÊÎËÎÃÈÈ ÆÈÂÎÒÍÛÕ ÖÅÍÒÐÀËÜÍÛÉ ÑÈÁÈÐÑÊÈÉ ÁÎÒÀÍÈ×ÅÑÊÈÉ ÑÀÄ ÍÎÂÎÑÈÁÈÐÑÊÈÉ ÃÎÑÓÄÀÐÑÒÂÅÍÍÛÉ ÓÍÈÂÅÐÑÈÒÅÒ ÁÈÎÐÀÇÍÎÎÁÐÀÇÈÅ È ÄÈÍÀÌÈÊÀ ÝÊÎÑÈÑÒÅÌ: ÈÍÔÎÐÌÀÖÈÎÍÍÛÅ ÒÅÕÍÎËÎÃÈÈ È ÌÎÄÅËÈÐÎÂÀÍÈÅ Îòâåòñòâåííûå ðåäàêòîðû: àêàäåìèêè ÐÀÍ Â.Ê. Øóìíûé, Þ.È. Øîêèí ÷ëåíû-êîððåñïîíäåíòû ÐÀÍ Í.À. Êîë÷àíîâ, À.Ì. Ôåäîòîâ ÍÎÂÎÑÈÁÈÐÑÊ ÈÇÄÀÒÅËÜÑÒÂÎ ÑÈÁÈÐÑÊÎÃÎ ÎÒÄÅËÅÍÈß ÐÎÑÑÈÉÑÊÎÉ ÀÊÀÄÅÌÈÈ ÍÀÓÊ 2006 Перейти на страницу с полной версией» Перейти на страницу с полной версией» ÓÄÊ 574:004.9 ÁÁÊ 28.0+32.97 Á63 Ðåäàêöèîííàÿ êîëëåãèÿ ñåðèè: àêàäåìèê Â.Ì. Òèòîâ (ãëàâíûé ðåäàêòîð), àêàäåìèê Þ.È. Øîêèí, ÷ëåí-êîððåñïîíäåíò ÐÀÍ Â.È. Åâñèêîâ, ÷ëåí-êîððåñïîíäåíò ÐÀÍ Â.Í. Îïàðèí, ÷ëåí-êîððåñïîíäåíò ÐÀÍ Â.À. Ëàìèí, êàíä. ãåîë.-ìèí. íàóê Â.Ä. Åðìèêîâ (îòâåòñòâåííûé ñåêðåòàðü) Ñåðèÿ îñíîâàíà â 2003 ã. Áèîðàçíîîáðàçèå è äèíàìèêà ýêîñèñòåì: èíôîðìàöèîííûå òåõíîëî- Á63 ãèè è ìîäåëèðîâàíèå / îòâ. ðåä. Â.Ê. Øóìíûé, Þ.È. Øîêèí, Í.À. Êîë- ÷àíîâ, À.Ì. Ôåäîòîâ; Ðîñ. àêàä. íàóê, Ñèá. îòä-íèå, Èí-ò öèòîëîãèè è ãåíåòèêè [è äð.]. Íîâîñèáèðñê: Èçä-âî ÑÎ ÐÀÍ, 2006. 648 c. (Èíòåãðàöèîííûå ïðîåêòû ÑÎ ÐÀÍ; âûï. 7). Ìîíîãðàôèÿ ïðåäñòàâëÿåò ðåçóëüòàòû ôóíäàìåíòàëüíîãî èññëåäîâàíèÿ ñòðóê- òóðíî-ôóíêöèîíàëüíîé îðãàíèçàöèè áèîðàçíîîáðàçèÿ ñ èñïîëüçîâàíèåì ñîâðåìåí- íûõ èíôîðìàöèîííûõ òåõíîëîãèé. Êîëëåêòèâîì àâòîðîâ, ñîñòîÿùèì èç ñïåöèàëèñ- òîâ â ðàçëè÷íûõ îáëàñòÿõ áèîëîãèè è èíôîðìàòèêè, àíàëèçèðóþòñÿ êîíöåïòóàëüíûå âîçìîæíîñòè ñâÿçûâàíèÿ ðàçíîðîäíîé èíôîðìàöèè î ðàñòèòåëüíîì è æèâîòíîì ìèðå, ïî÷âåííîì ïîêðîâå ñ öåëüþ ôîðìèðîâàíèÿ ìàêñèìàëüíî ïîëíîãî ïðåäñòàâëå- íèÿ îá ýêîñèñòåìå êàê îá îäíîì èç íàèáîëåå ñëîæíûõ ïðèðîäíûõ îáúåêòîâ. Ðàññìàò- ðèâàþòñÿ ïðîáëåìû ìåòàîïèñàíèÿ ðàçëè÷íûõ àñïåêòîâ áèîðàçíîîáðàçèÿ: îò ãåíåòè- ÷åñêèõ ìàêðîìîëåêóë äî áèîñôåðû íà îñíîâå ðåàëèçîâàííûõ ïðåäñòàâëåíèé îá óðîâ- íÿõ áèîðàçíîîáðàçèÿ: ãåíåòè÷åñêîì, ïîïóëÿöèîííî-âèäîâîì è ýêîñèñòåìíîì. Îïè- ñûâàåòñÿ òåõíîëîãèÿ ñîçäàíèÿ òåìàòè÷åñêè ñâÿçàííûõ èíôîðìàöèîííûõ ñèñòåì, ýëåê- òðîííûõ áèáëèîòåê è áàç äàííûõ. Ïðèâîäÿòñÿ ðåçóëüòàòû êîìïüþòåðíîãî àíàëèçà è ìîäåëèðîâàíèÿ áèîëîãè÷åñêîãî ðàçíîîáðàçèÿ íà ðàçíûõ óðîâíÿõ åãî îðãàíèçàöèè. Êíèãà ðàññ÷èòàíà íà ñïåöèàëèñòîâ â îáëàñòè áèîðàçíîîáðàçèÿ, ýêîëîãèè, èíôîðìàòèêè, áîòàíèêè, çîîëîãèè, ïðèðîäîïîëüçîâàíèÿ. Óòâåðæäåíî ê ïå÷àòè Ó÷åíûì ñîâåòîì Èíñòèòóòà öèòîëîãèè è ãåíåòèêè ÑÎ ÐÀÍ Ðåöåíçåíòû: äîêòîðà áèîëîãè÷åñêèõ íàóê Â.Í. Ñòåãíèé, À.Þ. Õàðèòîíîâ, Â.Ê. Âîéíèêîâ Ðàáîòà âûïîëíåíà â ðàìêàõ èíòåãðàöèîííûõ ïðîåêòîâ ÑÎ ÐÀÍ ¹ 66 «Ôóíäàìåíòàëüíûå ïðîáëåìû áèîðàçíîîáðàçèÿ è äèíàìèêè ýêîñèñòåì», ¹ 145 «Áèîëîãè÷åñêîå ðàçíîîáðàçèå è äèíàìèêà ýêîñèñòåì: Èíôîðìàöèîííûå òåõíîëîãèè è ìîäåëèðîâàíèå» ISBN 5769208805 (âûï. 7) © Êîëëåêòèâ àâòîðîâ, 2006 ISBN 5769206691 © Èíñòèòóò öèòîëîãèè è ãåíåòèêè, 2006 © Èíñòèòóò âû÷èñëèòåëüíûõ òåõíîëîãèé, 2006 © Èíñòèòóò ëåñà èì. Â.Í. Ñóêà÷åâà, 2006 © Èíñòèòóò ñèñòåìàòèêè è ýêîëîãèè æèâîòíûõ, 2006 © Öåíòðàëüíûé ñèáèðñêèé áîòàíè÷åñêèé ñàä, 2006 © Íîâîñèáèðñêèé ãîñóäàðñòâåííûé óíèâåðñèòåò, 2006 © Îôîðìëåíèå. Èçäàòåëüñòâî ÑÎ ÐÀÍ, 2006 Перейти на страницу с полной версией» Перейти на страницу с полной версией» ÏÐÅÄÈÑËÎÂÈÅ Òàê ñâÿçàí, ñúåäèíåí îò âåêà Ñîþçîì êðîâíîãî ðîäñòâà Ðàçóìíûé ãåíèé ÷åëîâåêà Ñ òâîðÿùåé ñèëîé åñòåñòâà Ñêàæè çàâåòíîå îí ñëîâî È ìèðîì íîâûì åñòåñòâî Âñåãäà îòêëèêíóòüñÿ ãîòîâî ÏÐÎÅÊÒÛ ÈÍÒÅÃÐÀÖÈÎÍÍÛÅ Íà ãîëîñ ðîäñòâåííûé åãî. Ô.È. Òþò÷åâ Ðàçíîîáðàçèå æèâûõ ñóùåñòâ îãðîìíî. Äàæå â íà÷àëå XXI â. ìû íå ðàñïîëàãàåì òî÷íûìè îöåíêàìè ÷èñëà âèäîâ, íûíå îáèòàþùèõ íà Çåì- ëå, à òåì áîëåå âèäîâ, îáèòàâøèõ íà íåé â ìèíóâøèå ýïîõè. Ïî-âèäè- ìîìó, ïîòåíöèàë ðîñòà áèîðàçíîîáðàçèÿ äàëåêî íå èñ÷åðïàí: â êàéíîçîå åùå íåò ïðèçíàêîâ âûõîäà áèîðàçíîîáðàçèÿ (îöåíèâàåìîãî â äàííîì ñëó- ÷àå ïî ÷èñëó îäíîâðåìåííî ñóùåñòâóþùèõ òàêñîíîâ ñðåäíåãî ðàíãà ñåìåéñòâ, îòðÿäîâ) íà ïëàòî, ïîäîáíîå ïàëåîçîéñêîìó, íåñìîòðÿ íà ïå- ðèîäè÷åñêîå ïîëíîå âûìèðàíèå ðÿäà êðóïíûõ òàêñîíîìè÷åñêèõ ãðóïï, ñìåíû êëèìàòà, èñ÷åçíîâåíèå ðàçëè÷íûõ áèîòîïîâ è äàæå ìíîãîëåòíþþ òåõíîãåííóþ äåÿòåëüíîñòü ÷åëîâå÷åñòâà [Sepkoski, 1994; 1996, Àëåêñååâ, 1998, Ìàðêîâ, 2001]. Åùå ñëîæíåå îõàðàêòåðèçîâàòü âíóòðèâèäîâîå ìíî- ãîîáðàçèå è ðàçíîîáðàçèå ñîîáùåñòâ æèâûõ îðãàíèçìîâ. Ìîæíî ëèøü óòâåðæäàòü, ÷òî ðàçíîîáðàçèå ñîîáùåñòâ è òàêñîíîìè÷åñêîå ðàçíîîáðà- çèå âçàèìîñâÿçàíû, ÷åì è îáóñëîâëèâàåòñÿ óñòîé÷èâîñòü ýêîñèñòåì, â òîì ÷èñëå è áèîñôåðû â öåëîì [Óîëëåñ, 1956; Äàæî, 1976; Ðàçóìîâñêèé, 1981; Æåðèõèí, 1986]. Ýâîëþöèîííàÿ èñòîðèÿ âèäà ôèêñèðóåòñÿ â åãî ãåíîìå, íî ðåàëè- çîâàòüñÿ ìîæåò òîëüêî ÷åðåç ôåíîòèï. Èìåííî ôåíîòèï âçàèìîäåéñòâóåò ñ âíåøíåé ñðåäîé è, â êîíå÷íîì ñ÷åòå, òåñòèðóåòñÿ îòáîðîì [Êàìøè- ëîâ, 1940à; 1974]. Ðàçâèòèå æå îïòèìàëüíîãî, ñ òî÷êè çðåíèÿ æèçíå- ñïîñîáíîñòè âèäà, ôåíîòèïà òðåáóåò îïðåäåëåííîé óñòîé÷èâîé ñðåäû. Ñðåäîâûå âîçäåéñòâèÿ íåñïîñîáíû íàïðàâëåííî èçìåíèòü ãåíåòè÷åñ- êóþ ïðîãðàììó, íî ìîãóò îáåñïå÷èòü âîçìîæíîñòü ðåàëèçàöèè òîãî èëè èíîãî èç óæå ñóùåñòâóþùèõ âàðèàíòîâ åå ïðî÷òåíèÿ [Êàìøèëîâ, 1939, 1940á, 1974; Ìàðãàëåô, 1992] êàê ïðÿìî (èçìåíèâ ðåãóëÿöèþ ýêñïðåñ- ñèè ãåíîâ ñèãíàëüíûì âîçäåéñòâèåì ÷åðåç ðåöåïòîðû ãåííûõ ñåòåé [Êîë- ÷àíîâ è äð., 2005] èëè ïóòåì èçìåíåíèÿ ýïèãåíåòè÷åñêîé ðåãóëÿöèè ãåíîìà [Srinivasan et al., 2003; Vadlamudi et al., 1995]), òàê è êîñâåííî (ñíèçèâ èëè óñèëèâ óðîâåíü «îíòîãåíåòè÷åñêîãî øóìà» òåìè æå ìåõà- íèçìàìè [Còðóííèêîâ, Âûøèíñêèé, 1991]). Òàêèì îáðàçîì, ïðè ðåà- ëèçàöèè îïòèìàëüíîãî ñ òî÷êè çðåíèÿ æèçíåñïîñîáíîñòè ôåíîòèïà âèä ìîæåò èñïîëüçîâàòü òðè æèçíåííûå ñòðàòåãèè: 1) ïàññèâíî æäàòü íà- ÏÐÅÄÈÑËÎÂÈÅ 5 Перейти на страницу с полной версией» Перейти на страницу с полной версией» ñòóïëåíèÿ îïòèìàëüíûõ óñëîâèé (ñòðàòåãèÿ «õîëîäíîãî ðåçåðâà»); 2) àâòîíîìèçèðîâàòüñÿ îò âëèÿíèé âíåøíåé ñðåäû; 3) êîíòðîëèðîâàòü ôîð- ìèðîâàíèå ñðåäû. Êàæäàÿ ñòðàòåãèÿ èìååò ñâîè ïëþñû è ìèíóñû: ñòðàòåãèþ «õîëîäíîãî ðåçåðâà» èñïîëüçóþò â îñíîâíîì âèäû ñ íèçêîé ñêîðîñòüþ îáìåíà âåùåñòâ è ñëàáîé èíòåãðàöèåé (ìîäóëÿðíûå îðãà- íèçìû áåç íåðâíîé ñèñòåìû èëè ñ äèôôóçíîé íåðâíîé ñèñòåìîé) [Íî- òîâ, 1999], à ñòðàòåãèþ àâòîíîìèçàöèè íàïðîòèâ, âûñîêîèíòåãðèðî- âàííûå âèäû ñ èíòåíñèâíûì îáìåíîì âåùåñòâ [Øìàëüãàóçåí, 1968]. Êîíòðîëèðîâàòü æå ôîðìèðîâàíèå ñðåäû îäíîìó âèäó ïðàêòè÷åñêè íå ïîä ñèëó1 . ÈÍÒÅÃÐÀÖÈÎÍÍÛÅ ÏÐÎÅÊÒÛ ÈÍÒÅÃÐÀÖÈÎÍÍÛÅ Â õîäå ýâîëþöèè ýòó ðîëü ñòàëè âûïîëíÿòü ìíîãîâèäîâûå ñîîáùå- ñòâà ýêîñèñòåìû [Ðàçóìîâñêèé, 1981]. Îñíîâíàÿ çàäà÷à ýêîñèñòåì (îò ãðå÷. óikos æèëèùå) îáåñïå÷èòü âîñïðîèçâîäñòâî êîìôîðòíûõ óñëî- âèé äëÿ ÷ëåíîâ ñîîáùåñòâà íà áàçå èíôîðìàöèè, çàêîäèðîâàííîé â ãå- íîìàõ îðãàíèçìîâ. Òàêèì îáðàçîì, ïî ìíåíèþ Ì.Ì. Êàìøèëîâà [1974], ýêîñèñòåìû, âêëþ÷àþùèå ñîîáùåñòâà è ñîñòîÿùèå èç ñàìîâîñïðîèç- âîäÿùèõñÿ ïîäñèñòåì, ðàáîòàþò êàê ìíîãîêðàòíî äóáëèðîâàííûå èí- ôîðìàöèîííûå êàíàëû, ñâÿçûâàþùèå ïðîøëîå è áóäóùåå, ïðè÷åì ìå- òàèíôîðìàöèÿ (êîä) ïðåäñòàâëåíà â ïåðâóþ î÷åðåäü â âèäå âçàèìîäåé- ñòâèé ìåæäó âèäàìè [Ìàðãàëåô, 1992]. Êðîìå òîãî, âêëþ÷åíèå êàêîãî- ëèáî îáúåêòà â ñèñòåìó ýòî òàêæå ïðîöåññ ïåðåäà÷è èíôîðìàöèè [Àð- ìàíä, 1988]. Òåì ñàìûì îáåñïå÷èâàåòñÿ ðîñò ñîâîêóïíîé ïðèñïîñîá- ëåííîñòè îðãàíèçìîâ â õîäå ýâîëþöèè, ÷òî â ñàìîé îáùåé ôîðìå ìîæ- íî ïðèíÿòü çà îïðåäåëåíèå áèîëîãè÷åñêîãî ïðîãðåññà. Ïàëåîáèîëîãè- ÷åñêèå äàííûå ñâèäåòåëüñòâóþò, ÷òî òàêîé ðîñò äåéñòâèòåëüíî íàáëþ- äàåòñÿ: â ÷àñòíîñòè, ðàñòåò èíòåðâàë ìåæäó ãëîáàëüíûìè áèîöåíîòè- ÷åñêèì êðèçèñàìè [Sepkoski, 1994, 1996], âûÿâëåí ýêñïîíåíöèàëüíûé ðîñò ñóììàðíîé ïðîäîëæèòåëüíîñòè ñóùåñòâîâàíèÿ ðîäîâ [Ìàðêîâ, 2002], õîòÿ è ïðåðûâàåìûé êðèçèñàìè, íî ïîñëå ïåðìñêîãî ïåðèîäà (~250 ìëí ëåò íàçàä) íàáëþäàåòñÿ òåíäåíöèÿ ñíèæåíèÿ ðàçðóøèòåëü- íîñòè êðèçèñîâ [Íåâåññêàÿ, 2004] íà ôîíå ðîñòà áèîðàçíîîáðàçèÿ [Ìàð- êîâ, 2001]. Òàê, ýâêàðèîòè÷åñêèå ýêîñèñòåìû, âîçíèêøèå â õîäå «êåìáðèé- ñêîé ñêåëåòíîé ðåâîëþöèè» (~540 ìëí ëåò íàçàä) ïî÷òè ïîëíîñòüþ ñòåðëè ïðåäøåñòâóþùóþ âåíäñêóþ áèîòó [Ñîêîëîâ, Ôåäîíêèí, 1988] è, â ñâîþ î÷åðåäü, íåäîëãî ïðîñóùåñòâîâàâ, âûìåðëè â õîäå êåìáðèé/ îðäîâèêñêîãî áèîöåíîòè÷åñêîãî êðèçèñà (~490 ìëí ëåò íàçàä). Òåì íå ìåíåå, îáùåãî ñíèæåíèÿ òàêñîíîìè÷åñêîãî áèîðàçíîîáðàçèÿ íå áûëî, òàê êàê â îðäîâèêå ïðîèçîøëà ãëîáàëèçàöèÿ ýâêàðèîòè÷åñêîé áèîñôåðû. Áëàãîäàðÿ îñâîåíèþ íîâîãî ãðàíäèîçíîãî áèîòîïà ìîð- 1Äàæå ÷åëîâåê äîëãîå âðåìÿ êîíòðîëèðîâàë ñðåäó ñâîåãî îáèòàíèÿ ñ ïîìîùüþ äðóãèõ âèäîâ. Çàäîëãî äî íà÷àëà îäîìàøíèâàíèÿ æèâîòíûõ îí óæå ñâÿçàë ñåáÿ ñ äðåâåñíûìè ðàñòåíèÿìè, ñëóæèâøèìè òîïëèâîì äëÿ ïåðâûõ êîñòðîâ. Óæå ïîýòîìó ðîëü äåðåâà â ñòà- íîâëåíèè ÷åëîâå÷åñêîé öèâèëèçàöèè òðóäíî ïåðåîöåíèòü. Èñïîëüçóÿ åãî, êðîìå òîãî, äëÿ ñòðîèòåëüñòâà æèëèù è ñóäîâ ÷åëîâåê âûíóæäåí áûë ïðèíèìàòü ìåðû äëÿ âîñïðîèç- âîäñòâà ëåñîâ. 6 ÏÐÅÄÈÑËÎÂÈÅ Перейти на страницу с полной версией» Перейти на страницу с полной версией» ñêîé ïåëàãèàëè2 òåìï îáðàçîâàíèÿ íîâûõ òàêñîíîâ ïåðåêðûë èõ óáûëü âñëåäñòâèå âûìèðàíèÿ [Kanygin, 2001]. Çàòî áèîöåíîòè÷åñêèå êðèçèñû «ýïîõè ãëîáàëèçàöèè» (îðäîâèê/ñèëóð, äåâîí/êàðáîí, ïåðìü/òðèàñ, òðè- àñ/þðà, ìåë/ïàëåîãåí) õàðàêòåðèçîâàëèñü ãëóáîêèì ïàäåíèåì óðîâíÿ áèî- ðàçíîîáðàçèÿ è çíà÷èòåëüíûì óïðîùåíèåì