Centro De Investigación En Alimentación Y Desarrollo, A.C
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Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. «TAXONOMÍA, ECOLOGÍA Y FILOGENIA DEL GÉNERO Disciseda CZERN. (AGARICALES, AGARICACEAE) EN SONORA» . Por: OSCAR EDUARDO HERNÁNDEZ NAVARRO Tesis aprobada por la COORDINACIÓN DE TECNOLOGÍA DE ALIMENTOS DE ORIGEN VEGETAL Como requisito parcial para obtener el grado de MAESTRO EN CIENCIAS HERMOSILLO, SONORA AGOSTO DE 2013 APROBACIÓN Los miembros del comité designado para la revisión de la tesis de Oscar Eduardo Hernández Navarro, la han encontrado satisfactoria y recomiendan que sea aceptada como requisito parcial para obtener el grado de Maestro en Ciencias ii DECLARACIÓN INSTITUCIONAL La información generada en esta tesis es propiedad intelectual del Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C. (CIAD). Se permiten y agradecen las citas breves del material contenido en esta tesis sin permiso especial del autor, siempre y cuando se dé crédito correspondiente. Para la reproducción parcial o total de la tesis con fines académicos, se deberá contar con la autorización escrita del Director General del CIAD. La publicación en comunicaciones científicas o de divulgación popular de los datos contenidos en esta tesis, deberá dar los créditos al CIAD, previa autorización escrita del manuscrito en cuestión del director de tesis. Dr. Pablo Wong González Director General iii A Paulina Quintana iv AGRADECIMIENTOS Al Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT) por las facilidades otorgadas durante mis estudios de posgrado. Al Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A.C. definitiva y A la Coordinación de Tecnología de Alimentos de Orígen Vegetal (CTAOV), orgullosamente mi segunda Alma-mater. Al Dr. Martín Esqueda Valle, director, asesor, jefe, amigo, colega, maestro. Muchas gracias por todo lo que me ha enseñado, por introducirme al apasionante mundo de los hongos. Mi eterno respeto, admiración y agradecimiento. A los miembros de mi comité de tesis, que los considero maestros y amigos, gracias por sus observaciones, apoyos, jaladas de orejas, etc: A la Dra. Mary Islas, por sus enseñanzas en las clases y seminarios (que si hacemos cuentas, nos vimos en micología, bioquímica, biología molecular y dos seminarios), sus consejos y hasta artículos enviados a las 3 de la mañana. Gracias Doctora. A la Dra. Carmen Contreras, por toda su paciencia (y vaya que se necesita mucha) hacia mi persona. Gracias por resolver mis dudas, por enseñarme tanto en teoría como en práctica. Al M.C. Aldo Hiram Gutiérrez, por ser mi primer maestro de micología, las idas a campo, soporte técnico, en fin, todo. Gracias Aldo MacGyver. A mis profesores de posgrado, que con sus buenos y no tan buenos ejemplos, me mostraron por dónde sí y por dónde no, y en mayor o menor medida me ayudaron a formarme como persona y como estudiante. A todos los integrantes del Laboratorio de Biotecnología de Hongos y asociados: Dr, Esqueda, Aldo, Geo, Beto, Damián, Toño, y Gaby. Gracias por hacer los días más amenos, sus observaciones, comentarios, discusiones de v temas, en fin, gracias por formar parte de este gran equipo que somos. ¡Gracias chicos! Los quiero. Gracias a Georgina Vargas por su apoyo técnico. ¡Gracias tía Geo! Gracias a Juan Villa Ibarra por su apoyo téncino en la redacción del Resumen en Inglés. A los miembros del laboratorio de Genética y Biología Molecular de Plantas: Dra, Mary, Dra. Carmen, Magda, Mitzuko, Lucía, Ignacio y Fox. Gracias por tenerme paciencia y compartirme un poco de sus experiencias, conocimientos y amistad. A todos los miembros de los laboratorios de Genética de Plantas y Fisiología Vegetal, especialmente a Emmanuel Arispuro y Javier Ojeda, gracias por prestarme sus equipos y hacer amenas esas breves visitas. A los miembros del laboratorio de marcadores moleculares de CICY: Dr. Felipe Sánchez-Teyer, M.C. Adriana Quiroz, Toño, Pika, Mary, Laura, Zamaria y Huijara, por su compañía y sus consejos. Al Dr. Jorge Humberto Ramírez por su ayuda en el análisis bioinformático, a pesar de todo. Y a los miembros de su Laboratorio de Bioinformática aplicada de CICY: Ramón Pacheco, Lilly Oyösa y Felipe Barredo-Pool, a éste último y a Silvanna Andrade, gracias por su apoyo técnico y trasmitirme sus conocimientos de microscopía electrónica de barrido. A los chicos que me recibieron con tanta amabilidad en CICY y se volvieron mis amigos en tan corto tiempo: Zamaria, Laura Espinosa, Laura Seele, Irving, Eduardo, Lupita, Zaira y sobre todo y de manera muy especial a Alfredo Miranda Plaza. Nos volveremos a encontrar. A Lily Camargo Vázquez, una gran amiga desde hace muchos años, que la vida me hizo coincidir con ella en mi estancia en Mérida, profundamente agradecido por todas tus atenciones, momentos y compañía. Mérida no hubiera sido lo que fue sin ti. Nos volveremos a encontrar ¡Te adoro! vi A casi todos mis compañeros de Maestría, pero en especial a Mafer (¡Mi Armaaaa!), Beto, David y Valentín, por esas tardes estudiando, los ratos de risas y todo en general. Al personal de docencia: Laura García, Argelia Marín, Verónica Araiza, Alejandra Córdova y Héctor Galindo. Gracias por su apoyo técnico y Gracias por todo. A mis amigos, en especial a las perras del Mal: Edna, Vanessa, Diana y Alejandra. También a Carlos y a Miguel. Su cariño y apoyo me ayudan a ser mejor persona. Gente como ustedes son especies en peligro de extinción. A mi toda familia, tanto materna como paterna, a mi tío Arturo en especial por su apoyo durante la estancia en Mérida. Mi eterno agradecimiento y amor a mi madre: la Mujer Maravilla alias Dra. Rita Navarro, a mis padre Dr. Jacinto Hernández, a mis “nanos” Carlos y Ulises, y a mi Abuelita (Doña Lupita de Navarro), que sin su amor no sería yo quién soy A todos los que por mi “despistadéz” no nombre y forman parte de mi vida, a la que le agradezco por permitirme conocer a toda esta gente maravillosa. vii CONTENIDO LISTA DE FIGURAS ............................................................................................ x LISTA DE TABLAS ............................................................................................. xi RESUMEN ......................................................................................................... xii ABSTRACT ....................................................................................................... xiii INTRODUCCIÓN ................................................................................................ 1 ANTECEDENTES ............................................................................................... 3 Características del Género Disciseda .............................................................. 3 Taxonomía ....................................................................................................... 5 Ecología ........................................................................................................... 6 Filogenia .......................................................................................................... 7 Caracterización Genotípica de los Hongos .................................................. 7 Situación Filogenética Actual de Hongos Gasteroides ................................. 9 Situación Filogenética Actual del Género Disciseda .................................. 10 JUSTIFICACIÓN ............................................................................................... 12 HIPÓTESIS ....................................................................................................... 13 OBJETIVOS ...................................................................................................... 13 Objetivo General ............................................................................................ 13 Objetivos Particulares .................................................................................... 13 MATERIALES Y MÉTODOS ............................................................................. 14 Origen del Material Micológico ...................................................................... 14 Identificación Taxonómica de las Especies ................................................... 14 Análisis Macroscópico y Microscopía Óptica .............................................. 14 viii Análisis por Microscopía Electrónica de Barrido ........................................ 15 Análisis Ecológico .......................................................................................... 15 Caracterización Genotípica de las Especies ................................................. 16 Extracción de ADN total ............................................................................. 16 Amplificación de Fragmentos de ADNr por PCR ........................................ 17 Análisis de Productos de PCR ................................................................... 18 Clonación y Secuenciación ........................................................................ 18 Análisis Bioinformático ............................................................................... 19 RESULTADOS Y DISCUSIÓN ......................................................................... 20 Caracterización Taxonómica y Ecológica ...................................................... 20 Caracterización Molecular y Filogenética ...................................................... 36 CONCLUSIÓN .................................................................................................. 51 RECOMENDACIONES ..................................................................................... 52 Anexo 1. ....................................................................................................