Verfahren Zur Bestimmung Von Stress

(19) *DE102009043485A120110331*

(10) DE 10 2009 043 485 A1 2011.03.31

(12) Offenlegungsschrift

(21) Aktenzeichen: 10 2009 043 485.2 (51) Int Cl.8: C12Q 1/68 (2006.01) (22) Anmeldetag: 30.09.2009 (43) Offenlegungstag: 31.03.2011 (71) Anmelder: (72) Erfinder: Henkel AG & Co. KGaA, 40589 Düsseldorf, DE Weiß, Thomas, Dr., 40591 Düsseldorf, DE; Ghosh, Robin, Dr., 40215 Düsseldorf, DE; Briese, Melanie, 40597 Düsseldorf, DE; Özka, Yasmin, 40225 Düsseldorf, DE Die folgenden Angaben sind den vom Anmelder eingereichten Unterlagen entnommen

(54) Bezeichnung: Verfahren zur Bestimmung von Stress

(57) Zusammenfassung: Die Erfindung betrifft ein Verfah- ren zur Bestimmung von Stress, insbesondere chronischem Stress, durch die Analyse von biologischem Material aus Haarfollikeln. DE 10 2009 043 485 A1 2011.03.31

Beschreibung

[0001] Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Bestimmung von Stress, insbesondere chronischem Stress, durch die Analyse von biologischem Material aus Haarfollikeln.

[0002] Chronischer Stress kann zahlreiche Gesundheitsstörungen hervorrufen, wobei die Ausprägung man- nigfaltig ist: Migräne, Asthma, Tinnitus, Allergien, Burnout, Depressionen, Herz-Kreislauf-Erkrankungen, Stö- rungen des Immunsystems, des Bewegungsapparats und der Fortpflanzungsfunktionen, Magen-Darm-Erkran- kungen, Hauterkrankungen oder Schmerz- und Schlafstörungen sind nur einige von vielen möglichen Erkran- kungen, bei denen Stress ein wichtiger Einflussfaktor sein kann.

[0003] Nicht selten treten derartige Funktionsstörungen unmerklich ein, da tägliche Belastungen als ”normal” angesehen werden und dabei keine ungewohnte psychische Belastung erlebt wird. Manche Menschen reagie- ren dagegen eher psychisch sensibel, ohne dass Körperfunktionen beeinträchtigt sind. Ob stressbezogene Erkrankungen auftreten, hängt letztendlich von dem individuellen Zusammenspiel sehr vieler und äußerst unterschiedlicher genetischer, biologischer und psychischer Faktoren ab, in deren Folge sich bestimmte Funkti- onsveränderungen des Gehirns ergeben können, welche dann psychische und körperliche Störungen hervorrufen können.

[0004] Die psychische Komponente von Stress wird von jedem Menschen subjektiv wahrgenommen. Das bedeutet, ein Mensch kann sich beispielsweise wohltuend belastet fühlen, obwohl der Körper bereits Signale ernster körperlicher Beschwerden aussendet. Man kann sich daher nicht alleine auf die subjektive Einschät- zung verlassen, wenn es um die Frage geht, ob man (zukünftigen) Belastungen gewachsen ist.

[0005] Häufig sind praktizierende Mediziner bei der Diagnose stress-bedingter Erkrankungen allerdings alleine auf die subjektiven Angaben ihrer Patienten angewiesen. Eine differentielle Diagnostik zur Bestimmung der Beteiligung und/oder des Anteils von Stress als möglicher Auslöser einer organischen Erkrankung wie bei Herz-Kreislauf-Erkrankungen, Hauterkrankungen etc. ist derzeit nicht möglich. Dies macht eine zielgerichtete medikamentöse oder psychotherapeutische Behandlung häufig schwierig. Des Weiteren besteht die Gefahr, die körperliche Folge-Erkrankung, aus Unkenntnis über die Ursache, rein symptombezogen, palliativ zu be- handeln, da aufgrund der mangelnden differentiellen Diagnostik kein kurativer Ansatz gewählt werden kann.

[0006] In diesem Sinne ist es wichtig, den Einfluss von Stress, insbesondere von chronischem Stress frühzei- tig und quantitativ messbar beschreiben zu können, um anhand der zugrunde liegenden molekularen Mecha- nismen für jeden Patienten eine individuelle Therapieform wählen zu können.

[0007] Es liegen im Stand der Technik nur wenige Instrumente vor, mit denen Stress, insbesondere chronischer Stress frühzeitig objektiv erkannt werden kann. Erste Ansätze hierzu wurden von einem Forschungs- team an der Universität Trier entwickelt. Das Diagnosesystem neuropatternTM misst neben der Bestimmung psychometrischer Parameter (über einen Fragebogen) den Cortisolgehalt im Speichel. Hierbei werden jeweils spezifische Muster an psychischen, biologischen und symptomatischen Veränderungen erfasst, die stressbezogene Störungen kennzeichnen.

[0008] Nachteilig an der Auswertung von Parametern der Hypophysen-Hirnanhangsdrüsen-Nebennieren- Achse (HPA), wie dem Cortisol, ist die stark individualisierte Ausprägung. Beispielsweise kann neuropatternTM nicht bei allen Betroffenen Einsatz finden; Personen, die regelmäßig Psychopharmaka einnehmen, mit Corti- sol behandelt werden oder Frauen während der Schwangerschaft und der Stillzeit können nicht mit diesem Diagnosewerkzeug analysiert werden.

[0009] Es wurde auch gefunden, dass Personen, die mit chronischem Stress belastet waren, in akuten Stress- Situationen einige der üblichen physiologischen Reaktionen, Anstieg der Herzrate und des Cortisolspiegels, nicht zeigten. Mit der Bestimmung des Cortisolgehaltes im Speichel können somit Personen, die unter chronischem Stress leiden, gar nicht erkannt werden.

[0010] Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es daher, ein einfaches, schnelles und verlässliches Testsys- tem bereitzustellen, welches die Nachteile des Standes der Technik vermeidet und Stress, insbesondere chronischer Stress frühzeitig objektiv, frühzeitig sowie quantitativ messen kann.

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[0011] Diese Aufgabe wird gelöst durch ein Verfahren zur Diagnose von Stress, insbesondere chronischem Stress bei einem Lebewesen, bevorzugt einem Säugetier, insbesondere einem Menschen, das die folgenden Schritte umfasst: a) Bereitstellung einer Probe aus einem oder mehreren Haarfollikeln eines Lebewesens, bevorzugt einem Säugetier, insbesondere einem Menschen, b) Bestimmung der Expression mindestens eines Markers für Stress, insbesondere chronischen Stress ausgewählt aus der Liste gemäß Anhang 1, c) ggf. Bestimmung der Expression und/oder Konzentration eines oder mehrerer weiterer Marker für Stress, insbesondere chronischen Stress, in der gleichen oder einer weiteren Probe d) Korrelieren der Ergebnisse aus b) und ggf. c) mit der Diagnose von Stress, insbesondere chronischem Stress.

[0012] Vorteilhafterweise können durch frühes Erkennen und detailliertes Beschreiben des Faktors Stress bei Erkrankungen und anschließende individualisierte Behandlungen die wirtschaftlichen Einbussen verhindert und vor allem das Wohlbefinden der betroffenen Personen nachhaltig verbessert werden.

[0013] Überraschenderweise wurde gefunden, dass es möglich ist, durch die Analyse von biologischem Ma- terial aus Haarfollikeln im Hinblick auf ein oder mehrere Marker für chronischen Stress, eine objektive Methode zur Bestimmung von Stress, insbesondere von chronischem Stress.

[0014] Gemäß einer besonders bevorzugten Ausführungsform des Verfahrens wurde in Schritt a) verwendete Probe durch die Anwendung einer nicht-invasiven Methode gewonnen. Geeignet sind in diesem Zusammen- hang alle nicht-invasiven Methoden. Darunter sind solche Methoden zu verstehen, die nicht die Anwesenheit eines Arztes/Chirugen oder ärztlichen Fachpersonals erfordern.

[0015] Als bevorzugte Ausführungsformen bieten sich, um eine möglichst einfache und für den Patienten we- nig beeinflussende Probenentnahme zu gewährleisten, insbesondere die folgenden nicht-invasiven Methoden an, bevorzugt die Entnahme des Haarfollikels durch Zupfen von Kopfhaaren (analog der Methode, wie sie in DE 10 2005 011 957 und EP1859272 beschrieben ist, auf diese Anmeldungen wird hiermit im vollen Umfang Bezug genommen) oder der Abriss von obersten Hautschichten mittels der „Tape-Stripping” Methode, wie sie in der EP1112077 beschrieben ist, auf diese Anmeldung wird hiermit ebenfalls im vollen Umfang Bezug genommen. Bei dieser Methode wird auf Unterarm oder sonstige behaarten Stellen ein Klebeband geeigneter Stärke und Klebekraft aufgebracht, mit dem die Haarfollikel aus der Haut gezogen werden können.

[0016] Besonders bevorzugt ist das o. g. Zupfen des Haarfollikels. Bei der nicht invasiven Isolierung von Haar- follikeln werden dem Patienten Haare durch Zupfen entnommen. Derart isoliert der Fachmann den Grossteil des Haarfollikels, wobei die dermale Papille, das Steuerzentrum des Haarwuchses in der Kopfhaut verbleibt und dadurch den Haarwuchs wieder neu initiieren kann. Das derart gewonnene Gewebe wird im Folgenden fachgerecht verwahrt und für die Analysen aufgearbeitet.

[0017] Nach einer alternativen Ausführungsform können auch die Abrisse von der Haut, welche Hautzellen enthalten, auf entsprechende Marker untersucht werden.

[0018] Gemäß einer anderen besonders bevorzugten Ausführungsform erfolgt die Bereitstellung einer Probe, enthaltend ein oder mehrere Haarfollikel von einem Lebewesen, bevorzugt einem Säugetier, insbesondere einem Menschen, durch Aufbringung eines Klebestreifens auf die Haut und anschließendem Abziehen des Klebestreifens von der Haut (der bereit weiter oben beschriebenen Tape-Stripping-Methode).

[0019] Beispielsweise können auch die „Endprodukte” von Enthaarungsprozeduren, d. h. die Klebestreifen nach der Epilation verwendet werden. Bei solchen Enthaarungsverfahren werden analog dem Tape-Stripping die Haarfollikel durch einen mit Wachs-, Klebstoffen (ggf. auch synthetischen Klebstoffen) oder Honig bestri- chenen Träger, beispielsweise Kunststoff-, Stoffstreifen oder Mullbinden etc., auf die Haut aufgebracht, ange- drückt bzw. glatt gestrichen, und anschließend die Haarfollikel, häufig mit einem Ruck gegen die Wuchsrich- tung epiliert.

[0020] Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform des Verfahrens erfolgt die Bereitstellung der Probe aus einem oder mehreren Haarfollikeln gemäß Schritt a) aus 2 bis 50 Haarfollikeln, bevorzugt 3 bis 25, besonders bevorzugt 4 bis 20, ganz besonders bevorzugt 5 bis 15 Haarfollikeln. Die Verwendung mehrerer Haarfollikel für eine Probe führt zu einem besseren Ergebnis im Hinblick auf die Signifikanz und verhindert die Messung von Artefakten.

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[0021] Bevorzugt sind die in Schritt a) bereitgestellten Haarfollikel gezupfte Haarfollikel, bevorzugt aus dem Kopfhaar. Diese Methode (insbesondere nach der oben genannten Methode aus DE 10 2005 011 957 bzw. EP1859272) erbringt genügend biologisches Material, um die nachfolgenden Tests durchzuführen, ohne zu viele Haarfollikel zu entfernen.

[0022] Gemäß einer weiteren Ausführungsform wird in Schritt b) die Gen- und/oder Proteinexpression mindestens eines Markers für Stress, insbesondere chronischen Stress bestimmt.

[0023] Entsprechend geeignete Marker für Stress, insbesondere chronischen Stress sind in der Liste gemäß Anhang 1 aufgeführt. Die gefundenen 581 Biomarker, die in der Liste gemäß Anhang 1 aufgeführt sind, unterscheiden sich signifikant nach Auslösung des milden, akuten Stress durch den TSST signifikant mit einem p- Wert < 0.05 zwischen den beiden Gruppen.

[0024] Überraschenderweise und für den Fachmann nicht vorhersehbar konnten signifikante Unterschiede zwischen chronisch gestressten und nicht chronisch gestressten Probanden durch Analyse des Haarfollikels (d. h. des biologischen Materials im Haarfollikel) festgestellt werden.

[0025] Es kann vorteilhaft sein, in Schritt b) mehrere Marker (insbesondere solche ausgewählt aus der Liste gemäß Anhang 1) zu untersuchen. Diese Liste beschreibt die als unterschiedlich bei chronisch gestressten im Vergleich zu nicht chronisch gestressten Personen aufgefundenen mRNAs (Quotient), weiterhin angegeben sind die systematischen Namen (Accessionnumber) sowie eine Beschreibung.

[0026] Die Zuordnungen der gemäß Beispiel 1 mit dem Genomchip aufgefundenen mRNA sowie deren Be- schreibungen erfolgte über Gendatenbanken (u. a. über die Suche des NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ sites/entrez?db=nuccore) und beziehen sich auf die Zuordnung gemäß Stand der Datenbank vom 01.06.2008.

[0027] In Anhang 1 bzw. 2 wurden durch die Untersuchungsmethode (Genomchip) bedingt die mRNAs refe- renziert.

[0028] Die erfindungsgemäße Lehre zur Verwendung der Marker als solche oder im erfindungsgemäßen Ver- fahren betrifft neben der in der Beschreibung explizit genannten mRNA auch die daraus für den Fachmann unmittelbar ableitbaren cDNA und DNAs sowie die entsprechenden codierten Proteine (oder deren Fragmente). Diese Informationen sind für den Fachmann unmittelbar über die Accessionnummer in der NCBI-Datenbank abrufbar.

[0029] Erfindungsgemäß ist bei den Markern die Bezeichnung, welche in der rechten Spalte der Listen 1 und 2 angegeben ist, entscheidend. Wenn diese Bezeichnung keine eineindeutige Zuordnung erlaubt, kann die Accession-Number aus der Spalte links daneben zur Zuordnung hinzugezogen werden.

[0030] Als Marker im Sinne der vorliegenden Erfindung eignen sich sowohl die über die Beschreibung in der Datenbank auffindbaren Nukleinsäuren bzw. Proteine. Dabei sind darunter auch die Fragmente der Nuklein- säure- als auch die Proteinsequenzen zu verstehen, die dem Fachmann eine eindeutige Zuordnung ermögli- chen.

[0031] Die Angaben in Liste 1 und 2 beziehen sich aufgrund des Testdesigns auf den Menschen, wenn das erfindungsgemäße bei anderen Lebewesen, beispielsweise Säugetieren wie der Maus eingesetzt werden soll, wählt der Fachmann als Marker den entsprechend in den Datenbanken zugängliche murinen Marker mit der, ggf. abweichenden, murinen Protein- bzw. Nukleinsäuresequenz aus.

[0032] Ggf. kann die Bestimmung mehrerer absoluter Expressionen durch nachträgliche Quotientenbildung zu einer noch weiter verbesserten Analysegenauigkeit führen. Somit können inter-indivduelle Unterschiede bei der absoluten Expression durch eine einfachere Analyse der relativen Expression, die Korrelation in Schritt d) vereinfachen.

[0033] Weiterhin ist es beispielsweise möglich, eine entsprechende relative Expression auch auf Basis einer oder mehrerer nicht von dem vorhanden sein chronischen Stresses beeinflussten Marker (einem Referenz- wert) zu bestimmen. Dieser nicht beeinflusste Marker kann dann in Schritt b) und/oder c) gleichzeitig oder nacheinander mitbestimmt werden.

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[0034] Gemäß einer besonders bevorzugten Ausführungsform wird in Schritt b) nicht der Marker Cortisol bestimmt wird. Wie im Beispiel 1 beschrieben, ist der Marker Cortisol, insbesondere, wenn er im Speichel bestimmt wird, nicht geeignet, das Vorhandensein bzw. die Abwesenheit von chronischem Stress eindeutig nachzuweisen. Es ist jedoch möglich, die Cortisolbestimmung, insbesondere über die Konzentration im Speichel, zur Unterstützung der Diagnose in Schritt c) zu bestimmen. Dabei wird dann in Schritt c) in einer Speichelprobe des gleichen Individuums der Cortisolgehalt bestimmt wird.

[0035] Zur Bestimmung der Expression sind alle dem Fachmann bekannten Methoden zur Bestimmung der Expression von Genen und/oder Proteinen geeignet. Insbesondere solche Methoden, die eine Quantifizierung dieser Expression ermöglichen, sind erfindungsgemäß geeignet.

[0036] Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform erfolgt die Bestimmung des Markers in Schritt b) mittels einer Expressionsanalyse auf einem Microarray.

[0037] Microarrays im Sinne der Erfindung sind Nukleinsäurechips (Nukleinsäuremicroarrays) und/oder Pro- teinchips (Proteinmicroarrays).

[0038] Gemäß einer weiteren bevorzugten Ausführungsform erfolgt die Bestimmung in Schritt b) und/oder c) mittels Analyse von Nukleinsäuren.

[0039] Zur Bestimmung, insbesondere Quantifizierung von RNA wird insbesondere eine der folgenden Me- thoden durchführt, die ausgewählt ist unter i. Northern Blots, ii. Reverse Transkriptase Polymerasekettenreaktion (RT-PCR), iii. RNase-Schutzexperimente, iv. Dot-Blots, v. cDNA-Sequenzierung, vi. Klon-Hybridisierung, vii. Differential Display, viii. Subtraktive Hybridisierung, ix. cDNA-Fragment-Fingerprinting, x. Total Gene Expression Analysis (TOGA), xi. Serielle Analyse der Genexpression (SAGE), xii. Massively Parallel Signature Sequencing (MPSS®) und insbesondere xiii. Einsatz von Nukleinsäurechips, oder mittels geeigneter Kombinationen dieser Methoden.

[0040] Diese erfindungsgemäß einsetzbaren Methoden sind in den Übersichtsartikeln von Akhilesh Pandey und Matthias Mann: „Proteomics to study genes and genomes”, Nature, Volume 405, Number 6788, 837– 846 (2000), und „Genomics, gene expression and DNA arrays”, Nature, Volume 405, Number 6788, 827– 836 (2000), und den dort angegebenen Referenzen beschrieben, worauf hiermit in vollem Umfang Bezug genommen wird. Das TOGA-Verfahren ist in ”J. Gregor Sutcliffe et al, TOGA: An automated parsing technology for analyzing expression of nearly all genes, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), Vol. 97, No. 5, pp. 1976–1981 (2000)” beschrieben, worauf hiermit vollumfänglich Bezug genommen wird. Das MPSS®-Verfahren ist in der US-A-6,013,445 beschrieben, worauf hiermit in vollem umfang Bezug genommen wird.

[0041] Beispielhaft sei im Weiteren ein CDNA Microarray beschrieben. Diese dienen dazu, RNA-Menge zu quantifizieren und darüber Genaktivitäten nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche die auf gebundener cDNA beruhen und solche die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen. Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden. Unabhängig von der Art der verwendeten Arrays, wird RNA zunächst aus dem zu untersuchenden Objekt extrahiert und diese nach eventuellen Aufreinigungs- und/oder Vermeh- rungsschritten der mRNA in cDNA oder cRNA umgeschrieben und beispielsweise mit Fluoreszenzfarbstoffen markiert. Diese werden dann mit den Microarrays hybridisiert. Hierbei binden markierte cDNA/cRNA Stücke an ihren komplementären Gegenpart auf dem Array. Nach der Abwaschung der nicht gebundenen cDNA/cR- NA Stücke wird das Fluoreszenzsignal jeder Position des DNA-Microarrays mittels eines Lasers ausgelesen. Diese reine Intensität wird üblicherweise noch normalisiert um Abbaueffekte, verschieden gute Extraktionen und andere Effekte mit einzurechnen. In der vorliegenden Studie wurde der Agilent Whole Genome Oligo Mi- croarray eingesetzt, bei welchem ca. 40.000 Gene immobilisiert sind.

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[0042] Wenn in Schritt c) ein weiterer Marker für Stress bestimmt werden soll, kann diese Bestimmung gleichzeitig oder zeitlich vor oder nach Schritt b) erfolgen.

[0043] Beispielsweise ist es ökonomisch sinnvoll, ein oder insbesondere mehrere Stressmarker (sowie ggf. ein oder mehrere Referenzmarker) gleichzeitig auf einem Microarray (Protein oder Nukleinsäurechip) zu bestimmen, welcher diese und ggf. noch weitere Marker detektieren kann. Es ist bevorzugt, auch die Marker in Schritt b) und c) gleichzeitig mittels Protein- oder Nukleinsäure-Microarray zu bestimmen.

[0044] Gemäß einer weiteren bevorzugten Ausführungsform erfolgt die Bestimmung in Schritt b) und/oder c) mittels Proteinanalyse. Als Alternative zur Bestimmung der Genexrpession oder auch zur breiten Absicherung der Analyse kann die Bestimmung auch über alle dem Fachmann bekannten Methoden zur Proteinanalyse bestimmt werden. Besonders bevorzugt sind i. Affinitätschromatographie ii. ein- oder zweidimensionaler Gelelektrophorese iii. Protein-Protein-Komplexierung in Lösung iv. Massenspektrometrie, insbesondere Matrix Assistierter Laser Desorptions Ionisation (MALDI) und insbesondere v. Einsatz von Proteinchips, oder mittels geeigneter Kombinationen dieser Methoden.

[0045] Es muss bei der angewendeten Methode gewährleistet sein, dass der gewünschte Marker spezifisch erkannt wird. Beispielsweise geeignet sind auch ELISA und andere fluoreszenz-markierende Methoden, Anti- körper und sonstige Methoden. Bevorzugt sind bei mehreren Markern, die in Schritt b) und/oder c) zu bestimmen sind auch Proteinchips

[0046] Diese erfindungsgemäß einsetzbaren Methoden sind in dem Übersichtsartikel von Akhilesh Pandey und Matthias Mann: „Proteomics to study genes and genomes”, Nature, Volume 405, Number 6788, 837– 846 (2000), und den dort angegebenen Referenzen beschrieben, worauf hiermit in vollem Umfang Bezug genommen wird.

[0047] Die 2D-Gelelektrophorese, wird beispielsweise in L. D. Adams, Two-dimensional Gel Electrophoresis using the Isodalt System oder in L. D. Adams & S. R. Gallagher, Two-dimensional Gel Electrophoresis using the O'Farrell System; beide in Current Protocols in Molecular Biology (1997, Eds. F. M. Ausubel et al.), Unit 10.3.1– 10.4.13; oder in 2-D Electrophoresis-Manual; T. Berkelman, T. Senstedt; Amersham Pharmacia Biotech, 1998 (Bestell-Nr. 80-6429-60), beschrieben.

[0048] Die massenspektrometrische Charakterisierung der Proteine oder Proteinfragmente erfolgt in der Fach- welt bekannter Weise, beispielsweise wie in den folgenden Literaturstellen beschrieben: Methods in Molecular Biology, 1999; Vol 112; 2-D Proteome Analysis Protocols; Editor: A. J. Link; Humana Press; Totowa; New Jersey. Darin insbesondere: Courchesne, P. L. und Patterson, S. D.; S. 487–512.

[0049] Carr, S. A. und Annan, R. S.; 1997; in: Current Protocols in Molecular Biology; Editor: Ausubel, F. M. et al.; John Wiley and Sons, Inc. 10.2.1–10.21.27.

[0050] Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform wird in Schritt b) die Gen- und/oder Proteinexpression mindestens eines Markers für chronischen Stress bestimmt, welcher ausgewählt ist aus der Liste gemäß An- hang 2. Die in Anhang 2 aufgeführten Marker sind zur Analyse von Stress, insbesondere chronischem Stress besonders geeignet.

[0051] Besonders bevorzugt in Schritt b) einzusetzende Marker sind ausgewählt aus: • Urocortin • POMC • tPA • ghrelin • FGFR3 • Mucin • CXCL 6 • Prohibitin • Reinsäure-Rezeptor-Responder (RARRES3)

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• MAP3Kinase2 • Keratin 4 • Keratin assozieirte Proteine, insbesondere KAP 1-1, 4-2, 4-10 und • Plakophilin 2

[0052] Ganz besonders bevorzugte, in Schritt b) zu bestimmende Marker sind ausgewählt aus: • CXCL 6 • Prohibitin • Reinsäure-Rezeptor-Responder (RARRES3) • MAP3Kinase2 • Keratin 4 • Keratin assozieirte Proteinen, insbesondere KAP 1-1, 4-2, 4-10 und • Plakophilin 2

[0053] Gemäß einer weiteren bevorzugten Ausführungsform wird in Schritt c) in der gleichen Probe die Ex- pression eines, zweier oder mehr weiteren Marker, bevorzugt ebenfalls ausgewählt aus der Liste gemäß An- hang 1, besonders bevorzugt ausgewählt aus der Liste gemäß Anhang 2, bestimmt. Dabei sind selbstverständ- lich die in Schritt b) und ggf. Schritt c) bestimmten Marker voneinander verschieden.

[0054] Gemäß einer ganz besonders bevorzugten Ausführungsform wird in Schritt c) die Expression eines, zweier oder mehr weiteren Markers bestimmt, wobei die Marker ausgewählt sind aus • Urocortin (Uniprot-/Swissprot-Nr. UCN, P55089) • POMC (Uniprot-/Swissprot-Nr. Pro-opiomelanocortin, P01189) • tPA (Uniprot-/Swissprot-Nr. Q6LBF5) • GHRL (Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9UBU3) • FGFR3 (Uniprot-/Swissprot-Nr. P22607) • Mucin8 (Uniprot-/Swissprot-Nr. Q12964) • CXCL 5 (C-X-C motif chemokine 5, Uniprot-/Swissprot-Nr. P42830) • Prohibitin (PHB, Uniprot-/Swissprot-Nr. P35232) • Reinsäure-Rezeptor-Responder ((RARRES3, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9UL19) • MAP3Kinase2 (MEKK2 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2, Uniprot.-Nr. Q9Y2U5) • Keratin 4 (Uniprot-/Swissprot-Nr. P19013) • Keratin assoziierte Proteine (bevorzugt KAP 1-1 (KRTAP1-1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07627), 4-2 (KRTAP4-2, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYR5), KAP 4-10 (KRTAP4-10, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYQ7)) und • Plakophilin 2 (PKP2, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q99959) bestimmt wird.

[0055] Gemäß einer anderen bevorzugten Ausführungsform wird in Schritt b) und/oder c) die Gen- und/oder Proteinexpression mindestens eines Markers für psychoemotionalen Stress bestimmt, welcher ausgewählt ist aus den folgenden Marker tumor rejection antigen (gp96) 1 (TRA1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5), fatty acid binding protein (FABP5, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q01469), Moesin (MSN, Uniprot-/Swissprot-Nr. P26038), Haar- keratin Typ I (Ha1, Keratin-31,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q15323), Enolase 1 (alpha-Enolase, Uniprot-/Swiss- prot-Nr. P06733), Trichohyalin (TCHH, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07283), mindestens einem Type II Keratin, beta-Actin (ACTB, actin cytoplamic 1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P60709), Glutamatdehydrogenase 1 (GLUD1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P00367), basischem Haarkeratin 1 (hHb1) (KRT81,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5), Peptidylprolyl cis-trans isomerase A (PPIA, Uniprot-/Swissprot-Nr. P62937) und Keratin 6 (irs) (KRT71, Uni- prot-/Swissprot-Nr. Q3SY84).

[0056] Besonders bevorzugt wird in Schritt b) und/oder c) die Gen- du/oder Proteinexpression mindestens eines Markers ausgewählt ist aus tumor rejection antigen (gp96) 1 (TRA1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5), Eno- lase 1 (alpha-Enolase, Uniprot-/Swissprot-Nr. P06733), Trichohyalin (TCHH, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07283), mindestens einem Type II Keratin, beta-Actin (ACTB, actin cytoplamic 1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P60709) und Peptidylprolyl cis-trans isomerase A (PPIA, Uniprot-/Swissprot-Nr. P62937) bestimmt.

[0057] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung mindestens eines Gens, welches die Haarstruktur betrifft, als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress. Besonders bevorzugt ist das Gen/Protein, welches die Haarstruktur betrifft, ausgewählt aus Keratin 4 (Uniprot-/Swissprot-Nr. P19013), Keratin assoziierten Proteinen (bevorzugt KAP 1-1 (KRTAP1-1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07627), 4-2

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(KRTAP4-2, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYR5 ), KAP 4-10 (KRTAP4-10, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYQ7)) und Plakophilin2 (PKP2, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q99959).

[0058] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung des CXCL 5 (C-X-C motif chemokine 5, Uniprot-/Swissprot-Nr. P42830) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

[0059] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung des Prohibitin (PHB, Uniprot-/ Swissprot-Nr. P35232) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

[0060] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung des Retinsäure-Rezeptor- Responder 3 (RARRES3, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9UL19) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

[0061] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von MAP3Kinase2 (MAP3K2, MEKK2 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2, Uniprot.-Nr. Q9Y2U5) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

[0062] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von tumor rejection antigen (gp96) 1 (TRA1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0063] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von fatty acid binding protein (FABP5, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q01469) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0064] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von Moesin (MSN, Uniprot-/ Swissprot-Nr. P26038) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0065] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von Enolase 1 (alpha-Enola- se, Uniprot-/Swissprot-Nr. P06733) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0066] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von Trichohyalin (TCHH, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07283) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0067] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von Haarkeratin Typ I (Ha1, Keratin-31,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q15323) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0068] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von beta-Actin (ACTB, actin cytoplamic 1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P60709) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0069] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von mindestens einem Type II Keratin als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0070] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung der Glutamatdehydrogena- se 1 (GLUD1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P00367) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0071] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von basischem Haarkeratin 1 (hHb1) (KRT81,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0072] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von Peptidylprolyl cis-trans isomerase A (PPIA, Uniprot-/Swissprot-Nr. P62937) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

[0073] Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist die Verwendung von Keratin 6 (irs) (KRT71, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q3SY84) als Markermolekül bei der Diagnose von psychoemotionalem Stress.

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[0074] Die Proteinbezeichnungen bzw. die angegebenen Nummern aus UniprotKB/Swissprot sind auf dem Stand vom 1.09.2009.

[0075] Bezüglich der Verwendungen der einzelnen Marker, insbesondere ihrer Definition, ihrer Detektion, etc. gilt das oben bereits zu den im erfindungsgemäßen Verfahren beschriebene.

[0076] Die im Folgenden angeführten Beispiele dienen dazu, die Erfindung zu verdeutlichen, ohne sie jedoch darauf zu beschränken:

Beispiel 1 Testdesign zur Bestimmung chronisch gestresster Personen

[0077] Im Rahmen dieser Erfindung wurde eine Stichprobe aus 24 Männern mit einem mittleren Alter von 25,8 Jahren (±3,24 Standardabweichung, SD) und einer Alterspanne zwischen 22 und 36 Jahren untersucht. Das mittlere Gewicht betrug 83,8 kg (±13,56 SD) und die mittlere Größe betrug 182,75 cm (±7,2 cm). Der mittlere Body Mass Index (BMI) lag bei 25 (±3,47 SD). Eine sorgfältige medizinische Anamnese bestätigte, dass alle Studienteilnehmer keine akuten oder chronischen Erkrankungen aufwiesen und keine Medikamente einnahmen. Zur Bereitstellung des biologischen Materials wurden in der Studie den Probanden Haarfollikel durch Zupfen einzelner Haaren entnommen und der molekularbiologische Status der Follikel bestimmt. Im Detail werden zu drei verschiedenen Zeitpunkten jeweils 10 intakte Haarfollikel isoliert. Das biologische Material wurde im Folgenden zur Bestimmung des Transkriptoms und des Proteoms verwendet.

[0078] Zur Einschätzung der Probanden hinsichtlich chronischen Stresses wurde das Trierer Inventar zum chronischem Stress (TICS), ein renommierter und validierter psychometrischer Test (TICS, Trierer Inventar zum chronischen Stress, Autoren: Schulz, Schlotz, & Becker, 1. Auflage, 2004, erschienen beim Hogrefe Ver- lag, Göttingen) durchgeführt.

[0079] Zusätzlich wurden die Probanden einem akuten, milden Stress mittels des Trier Sozialstress Testes (TSST, Kirschbaum, Pirke & Hellhammer, Neuropsychobiology, 28, S. 76–81, 1993)) unterzogen. Im Rahmen des TSST wurden den Probanden zusätzlich physiologische Parameter abgenommen: Herzrate und Cortisol- gehalt im Speichel. Ebenso wurde die „Zustandsangst” und die „Angst als Zustand” der Probanden vor und nach dem TSST mit Hilfe des State Trait Angstinventars STAI bestimmt.

Speichelcortisol

[0080] Die Konfrontation mit dem TSST führte in der Gesamtstichprobe zu einem signifikanten Anstieg der Speichelcortisolspiegel (Haupteffekt Zeit: F1,83, 42,06 = 16,35, p < 0.001) (Abb. 1). Für das Speichelcortisol wurden Responderraten für den TSST berechnet. Ein inhaltlich bedeutsamer Cortisolanstieg wurde in der Ver- gangenheit in vergleichbaren Studien mit einem Anstieg von 2,5 nmol/l definiert, basierend auf dem Kriterium von Weitzman et al. (Weitzman et al., 1971). Wurde dieses Kriterium angelegt, so lag der Anteil an Respondern im TSST vergleichbar mit bisherigen Studien (u. a. Kirschbaum et al., Psychosomatic Medicine, 57, S. 468– 474, 1995) bei 75% (n = 18). Für die weiteren Analysen der Genexpressions- und Proteinmuster wurde die Gesamtstichprobe in drei Gruppen gemäß des Cortisolanstiegs aufgeteilt: 1. High Responder (n = 8) oberes Terzil des Speichelcortisolanstieges, mittlerer Anstieg: 11,45 (±1,75 SE) nmol/l) 2. Responder (n = 10, mittleres Terzil, mittlerer Anstieg: 4,28 (±0,57 SE) nmol/l 3. Nonresponder (n = 6, unteres Terzil, mittlerer Anstieg: –0,3 (±0,33 SE) nmol/l

Herzrate:

[0081] Die TSST-Exposition führte zu einem signifikanten Anstieg der Herzrate (Haupteffekt Zeit: F4,23,88,78 = 24, p < 0.0001). Zu Messzeitpunkt +10 Minuten wurden die Probanden gebeten, aufzustehen und bis zu Be- ginn des TSST stehen zu bleiben. Nach Ende des TSST blieben die Probanden noch 10 Minuten bis Messzeit- punkt +45 Minuten in einer stehenden Position. Die Einteilung der Gesamtstichprobe nach den Anstiegswerten im Speichelcortisol wird von den Herzratenanstiegen der drei Gruppen reflektiert. So zeigten High-Responder den höchsten mittleren Anstieg von 36, 94 ± 5,46 bpm, Responder einen Anstieg von 27,92 ± 3,53 bpm und Non-Responder einen Anstieg von 16,08 ± 4,52 bpm (Abb. 2).

[0082] Anhand der Ergebnisse, der während des TSST erhobenen physiologischen Parameter Herzrate und Cortisolgehalt, konnte die Probandengruppe in drei Untergruppen eingeteilt werden, die nachfolgend mit „High Responder”, „Responder” und „Non-Responder” bezeichnet werden. Der Gruppe der Non-Responder gehören

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6 der 24 Probanden an. Diese zeigten, verglichen mit den High-Respondern, signifikant unterschiedliche Er- gebnisse auf der Ebene der erhobenen psychologischen und physiologischen Parameter.

TICS:

[0083] Die Auswertung des TICS ergab signifikante Unterschiede zwischen den Respondergruppen auf den Skalen soziale Überlastung, Überforderung und der Screening-Skala zum chronischen Stress. Auf allen Ska- len zeigten Non-Responder die höchsten Werte (Abb. 3). Posthoc Analysen ergaben, dass sich auf den Skala zur sozialen Überlastung und auf der Screening-Skala die High Responder signifikant von den anderen beiden Gruppen unterschieden (p < 0.02), es aber keine signifikanten Unterschiede zwischen Non-Respondern und Respondern gab. Bei der Skala Überforderung zeigten sich nur zwischen High- und Non-Respondern signifikante Unterschiede (p = 0.01).

STAI:

[0084] Zwischen den Respondergruppen zeigten sich signifikante Unterschiede in den Anstiegswerten be- züglich der Zustandsangst (F1,23 = 5,41; p = 0.013). Die Gruppe der Non-Responder zeigte die höchsten Anstiege mit 16,5 ± 1,63, die Gruppe der High Responder zeigte Anstiege um 9,63 ± 3,20 und Responder Anstiege um 5,3 ± 1,7.

[0085] Die Gruppe der Non-Responder zeigte deutliche Symptome chronischen Stresses, wie es anhand des TICS festgestellt werden konnte, ebenso zeigt diese Gruppe während des TSST eine Erhöhung der Zustands- angst im STAI. Überraschenderweise zeigen diese Personen, die im TICS als chronisch gestresste Personen auffielen und die den höchsten Anstieg der Zustandsangst während des akuten Stresses durch den TSST zeigten, eine „unphysiologische”, weil fehlende Reaktion in Bezug auf den Anstieg der Herzrate und des Corti- solspiegels. Da die Cortisolausschüttung einen schützenden antiinflammatorischen Effekt bewirkt, hat dies zur Folge, dass Personen mit fehlender, bzw. mangelhafter Cortisolausschüttung möglichen Entzündungsreaktio- nen, die stressbedingt auftreten können, schutzlos ausgeliefert sind und von daher eine negative Prädispositi- on in Bezug auf körperliche Folgeerkrankungen mit sich führen. Daraus folgt weiterhin, dass solche Personen nicht direkt über die Analyse des Cortisolspiegels im Speichel als mit Stress, insbesondere chronischem Stress belastete Personen identifiziert werden.

Beispiel 2: Identifikation von Biomarkern chronischen Stresses

[0086] Die gezupften Haarfollikel wurden mittels etablierter Verfahren lysiert und aus dem Lysat die Gesamt RNA isoliert (DE 10 2005 011 957 und EP1859272). Anhand der vorher determinierten Kategorie der Proban- den (chronisch gestresst versus nicht chronisch gestresst) wurden die RNA-Proben vereinigt und einer Ex- pressionsanalyse mittels des Agilent Whole Genome Oligo Microarray unterzogen.

[0087] CDNA Microarrays dienen dazu, RNA-Menge zu quantifizieren und darüber Genaktivitäten nachzuweisen. Es gibt hauptsächlich zwei verschiedene Arten von DNA-Microarrays, einerseits solche die auf gebundener cDNA beruhen und solche die auf synthetisch hergestellten Oligonukleotiden beruhen. Diese dienen als Sonden, die an definierte Positionen eines Rasters z. B. auf Glasträger aufgebracht werden. Unabhängig von der Art der verwendeten Arrays, wird RNA zunächst aus dem zu untersuchenden Objekt extrahiert und diese nach eventuellen Aufreinigungs- und/oder Vermehrungsschritten der mRNA in cDNA oder cRNA umgeschrieben und beispielsweise mit Fluoreszenzfarbstoffen markiert. Diese werden dann mit den Microarrays hybridisiert. Hierbei binden markierte cDNA/cRNA Stücke an ihren komplementären Gegenpart auf dem Array. Nach der Abwaschung der nicht gebundenen cDNA/cRNA Stücke wird das Fluoreszenzsignal jeder Position des DNA-Microarrays mittels eines Lasers ausgelesen. Diese reine Intensität wird üblicherweise noch normalisiert um Abbaueffekte, verschieden gute Extraktionen und andere Effekte mit einzurechnen. In der vorliegenden Studie wurde der Agilent Whole Genome Oligo Microarray eingesetzt, bei welchem ca. 40.000 Gene immobilisiert sind.

[0088] Die Biomarker chronischen Stress wurden durch bioinformatische Aufarbeitung der Expressionswerte mittels Spotfire identifiziert. Bei der Analyse der Daten haben wir unseren Fokus auf die Gene gelegt, deren Expression ursächlich im Zusammenhang mit Stress stehen können. Anhand der Befunde des TICS, des STAI, und der Cortisol- und Herzratenreaktion wurde gefunden, dass einige Probanden bereits konstitutiv gestresst in den TSST traten, während andere Probanden erst im Laufe des TSST eine spezifische Genexpressions- Reaktion auf Stress zeigen. Diese Genexpressionsmuster, die ursächlich im Zusammenhang mit Stress stehen, sollten sich vor Beginn des TSST zum Zeitpunkt t = 0 h signifikant unterscheiden. Nach Durchführung

10/63 DE 10 2009 043 485 A1 2011.03.31 des TSST sollte dieser Unterschied zeitnah (t = 3 h) zwischen den Probandengruppen nicht mehr signifikant feststellbar sein. Im weiteren Verlauf sollte sich die Nivellierung des Genexpressionsprofils wieder aufheben.

[0089] Entsprechend dieser Hypothese wurden die Expressionsdaten zu 44.000 Genen wie folgt mittels Spot- fire prozessiert. Hierbei wurden solche Gene ausgewählt, die sich vor der Auslösung des milden, akuten Stress durch den TSST signifikant mit einem p-Wert < 0.05 zwischen den beiden Gruppen unterscheiden. 3 h nach dem TSST sollte der Unterschied mit dem entsprechenden p-Wert nicht mehr feststellbar sein. Anhand dieser Vorgabe wurden 581 Gene identifiziert, die als Biomarker chronischen Stress einzuschätzen sind.

[0090] Auflistung aller Gene im Kontext chronischen Stress im Anhang 1

[0091] Aus der Gesamtheit aller Gene im Kontext chronischen Stress sind folgende von besonderer Relevanz Anhang 2

[0092] Aus der Liste der Gene mit besonderer Relevanz sind folgende Marker für die Einschätzung chronischen Stress herausragend von Interesse. • Urocortin 3 (HPA Achsen assoziiertes Neuropeptid; bei chronisch Gestressten reprimiert) • POMC (HPA Achsen assoziiertes Neuropeptid; bei chronisch Gestressten reprimiert) • tPA • ghrelin • FGFR3 • Mucin • CXCL 5 (Chemokin ähnlich des entzündungsfördernden IL-8; bei chronisch Gestressten induziert) • Prohibitin • Retinsäure-Rezeptor-Responder (RARRES3) • MAP3Kinase2 • Keratin 4 • Keratin assoziierte Proteine (KAP 1-1-, 4-2, 4-10) • Plakophilin 2

Beispiel 3

Analyse von Stresseffekten auf das Proteom mittels Differenzieller Gelelektrophorese (DIGE)

[0093] Neben der Analyse differenziell regulierter Gene wurden Stress-bedingte Effekte auf den Haarfollikel auch mit Hilfe der Differentiellen 2D Gelelektrophorese (DIGE) untersucht. Die zweidimensionale Gelelektro- phorese ist eine analytische Methode in Biochemie, Molekularbiologie und Proteomik. Sie wurde 1975 durch O'Farrell und Klose unabhängig voneinander entwickelt und kombiniert die isoelektrische Fokussierung (IEF) mit der SDS-Polyacrylamidgelelektrophorese (SDS-PAGE) zur Trennung komplexer Proteingemische (Bakte- rienlysate, Lysate von höheren Zellen oder Geweben, Körperflüssigkeiten) in Einzelproteine. Durch die Kom- bination der beiden orthogonal zueinander ausgeführten Trenntechniken wird eine besonders hochauflösende Trennung erreicht.

[0094] Jeder Punkt im Proteinmuster entspricht einem Proteinmolekül. Da sich Proteinmuster in biologischen Systemen umwelt- und zustandsabhängig verändern, können sie zur Analyse unterschiedlicher zellulärer Zu- stände herangezogen werden. Sie geben beispielsweise Aufschluss über den Einfluss intrinsischer oder extrin- sischer Effekte auf molekularer Ebene. Vergleicht man die Proteinmuster unterschiedlicher Proben, beispielsweise vor und nach dem TSST, so deuten unterschiedlich starke Signalintensitäten auf eine Veränderung in der Menge des entsprechenden Proteins hin. Hierfür wurden die gezupften Haarfollikel sofort nach Entnahme in einen stark harnstoffhaltigen Puffer überführt und eingefroren. Aus logistischen Gründen wurden hierbei die Haarfollikel aller Probanden einer Tagesgruppe (jeweils 6) für jeden Messpunkt (0, 3, 20 h) unabhängig der Cortisol-Response gepoolt. Daraus resultieren 24 zu analysierende Proben. Mittels der DIGE Methode ist es möglich die Proben jedes Zeitpunkts mit unterschiedlichen Fluoreszenzfarbstoffen zu markieren und gemein- sam auf einem Gel zu analysieren. Durch Intensitätsvergleiche der aufgetrennten Proteinspots wurden Men- genunterschiede berechnet und derart konnten Aussagen zu differenzieller Regulation auch auf Proteinebene getroffen werden.

[0095] Es wurden 2 Experimente mit ProteomWeaver durchgeführt. Im ersten Experiment wurden alle Gele pH 4–7 zusammengefasst und speziell wurde die Regulationen 0 h versus 3 h und 0 h versus 20 h angeschaut.

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Analoges gilt für das 2. Experiment mit pH 6–11. Die Auswahlkriterien für eine signifikante Regulation sind die Folgenden: • innerhalb einer Gruppe muss der Spot in mind. 50% der Gele vorhanden sein • T-Test threshold liegt bei <= 0.05 • Regulationen entsprechen den Quotienten der Mittelwerte der Spotintensitäten, wobei jeweils die behan- delten Proben gegen den Zustand 0 h verglichen werden. Up-reguliert bedeutet, ein Spot ist in 3 h (oder 20 h) gegenüber dem Zustand 0 h um mindestens 1.5 höher exprimiert. Für eine Down-regulation ist die Expression gegenüber dem Zustand 0 h geringer, um kleiner/gleich 0.67.

Die Software vergleicht eine Gruppe gegen nur eine weitere Gruppe (0 h vs 3 h, bzw. 0 h vs 20 h). Die Gele der Cy2-Gruppe (Farbstoff der 3 h Proben) sind erwartungsgemäß vom Scanbild etwas schwächer. Das hängt damit zusamnnen, dass der Farbstoff Cy2 im Vergleich zu den Farbstoffen Cy3 und Cy5 nicht so intensiv ist. Die Software gleicht dies allerdings aus, da die Gele innerhalb eines Experiments normalisiert sind. Insgesamt wurden derart 36 Proteinspots identifiziert.

Beispiel 4

Charakterisierung von besonders interessanten Proteinspots mittels Protein Mass Fingerprint

[0096] Da die Identität des Proteins nach Auftrennung in einem 2D PAGE nicht bekannt ist, werden für aus- gewählte Proteinspots weitere proteinchemische Verfahren eingesetzt. Diese proteinchemischen Verfahren bauen auf Massenspektroskopie und Proteinsequenzierung auf. In Tabelle 1 sind für die besonders interessanten Proteinspots die entsprechenden Identifizierungen durchgeführt worden.

Tabelle 1:

Diff. Expression T-Test Protein Name Spot ID 0 vs 3 0 vs 20 3 h vs 0 h 20 h vs 0 h 53647 0 0,55 N. A. 0,022 Fatty acid binding protein 54221 2,37 1,52 N. A. 0,024 tumor rejection antigen (gp96) 1 54262 0 0,65 N. A. 0,026 moesin 56430 2,6 0,92 0,004 0,709 beta actin 56520 2,36 1,06 0,012 0,793 peptidylprolyl isomerase A 56523 2,28 0,95 0,007 0,873 enolase 1 56977 0,06 1,32 0 0,247 keratin 6 irs 56989 n. a. 3,34 N. A. 0,006 trichohyalin 57495 0,98 1,9 0,839 0,015 Hair keratin, hair, basic, 1 (hHb1) 57620 2,47 1,43 0,013 0,153 keratin type II 58524 0,53 1,84 0,024 0,043 Hair keratin, type I Ha1 58574 0,03 1,3 0 0,036 glutamate dehydrogenase 1

Anhang 1: Liste aller Gene im Kontext chronischen Stress

Chronisch Nicht-chro- Quotient Signifikanz Systematischer Beschreibung gestresst nisch ge- (ttest) Name stresst 0,459683 0,97302967 0,4724 0,0023 BX640624 Homo sapiens mRNA; cD- NA DKFZp686K18196 0,042618 0,08625617 0,4941 0,0022 AF343666 Homo sapiens translocation associated fusion protein IRTA1/IGA1 0,037155 0,0721755 0,5148 0,0214 A_32_P209924 Unknown

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0,044522 0,08638333 0,5154 0,0141 NM_005369 Homo sapiens MCF.2 cell line derived transforming sequence 0,055613 0,10775317 0,5161 0,0257 THC2422705 Unknown 0,0827047 0,15685567 0,5273 0,0173 THC2368590 ALU4_HUMAN (P39191) Alu subfamily SB2 sequence contamination warning entry 0,1146253 0,2140505 0,5355 0,0037 NM_182520 Homo sapiens chromosome 22 open reading frame 15 0,0682173 0,12480683 0,5466 0,0218 BC040966 Homo sapiens sialic acid acetylesterase 0,164506 0,30037417 0,5477 0,0337 NM_001004432 Homo sapiens leucine rich repeat neuronal 6D 0,1424477 0,25688783 0,5545 0,0246 THC2284827 Unknown 0,4559843 0,80957467 0,5632 0,0053 NM_178170 Homo sapiens NIMA(ne- ver in mitosis gene a)-related kinase 8 0,0801837 0,1408925 0,5691 0,0362 NM_194314 Homo sapiens zinc finger and BTB domain containing 41 0,2106797 0,368742 0,5713 0,0061 BC094756 Homo sapiens myotubula- rin related protein 11 0,208796 0,36344867 0,5745 0,0377 AK090647 Homo sapiens cDNA FLJ 33328 fis, clone BRACE 1000051, weakly similar to KERATIN 0,0731013 0,1263495 0,5786 0,0165 NM_006546 Homo sapiens insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (IGF2BP1), mRNA [NM_006546] 0,080429 0,138763 0,5796 0,0300 NM_145046 Homo sapiens calreticulin 3 (CALR3), mRNA [NM_ 145046] 0,137653 0,23238267 0,5924 0,0270 AB051442 Homo sapiens mRNA for KIAA1655 protein, partial cds. [AB051442] 0,204915 0,34555683 0,5930 0,0379 NM_014681 Homo sapiens DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 34 (DHX34), transcript variant 1, mRNA [NM_014681] 0,0845153 0,14179533 0,5960 0,0012 NM_001008269 Homo sapiens transmembrane protein 89 (TMEM89), mRNA [NM_ 001008269] 0,271343 0,4543495 0,5972 0,0311 NM_000956 Homo sapiens prostaglan- din E receptor 2 (subtype EP2), 53 kDa (PTGER2), mRNA [NM_000956]

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0,0912717 0,15282717 0,5972 0,0009 BC009051 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3865825, with apparent retained intron. [BC009051] 0,3215147 0,537799 0,5978 0,0325 A_32_P192586 Unknown 0,7298393 1,21707267 0,5997 0,0112 CR992331 CR992331 RZPD no. 9016 Homo sapiens cDNA clone RZPDp9016A0141 5', mRNA sequence [CR 992331] 0,400002 0,66491317 0,6016 0,0099 A_24_P392910 Unknown 0,5723173 0,9461595 0,6049 0,0319 THC2436815 Q8R3T9 (Q8R3T9) Dnm3 protein, partial (7%) [THC 2436815] 0,1568223 0,25791567 0,6080 0,0433 NM_014219 Homo sapiens killer cell immunoglobulin-like receptor, two domains, long cytoplasmic tail, 2 (KIR2DL2), mRNA [NM_ 014219] 0,0367587 0,0602955 0,6096 0,0279 AK022953 Homo sapiens cDNA FLJ 12891 fis, clone NT2RP 2004142. [AK022953] 0,5701493 0,925707 0,6159 0,0365 AK022252 Homo sapiens cDNA FLJ 12190 fis, clone MAMMA 1000842. [AK022252] 0,108087 0,17531333 0,6165 0,0223 CR623296 full-length cDNA clone CS0DJ013YG19 of T cells (Jurkat cell line) Cot 10- normalized of Homo sapiens (human). [CR623296] 0,0569187 0,09214 0,6177 0,0219 NM_198427 Homo sapiens brevican (BCAN), transcript variant 2, mRNA [NM_198427] 0,318335 0,51222417 0,6215 0,0247 NM_017429 Homo sapiens beta-caro- tene 15,15'-monooxyge- nase 1 (BCMO1), mRNA [NM_017429] 0,221561 0,356211 0,6220 0,0320 NM_004188 Homo sapiens growth factor independent 1B (potential regulator of CDKN1A, translocated in CML) (GFI1B), mRNA [NM_004188] 0,0917767 0,14726333 0,6232 0,0438 NM_007354 Homo sapiens chromosome 3 open reading frame 27 (C3orf27), mRNA [NM_ 007354] 0,1477997 0,23714433 0,6232 0,0378 THC2366170 ALU5_HUMAN (P39192) Alu subfamily SC sequence contamination warning entry, partial (3%) [THC2366170]

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0,566885 0,90909767 0,6236 0,0137 NM_178514 Homo sapiens hypothetical protein LOC283487 (LOC283487), mRNA [NM_178514] 0,4203437 0,67404133 0,6236 0,0397 NM_001004351 Homo sapiens similar to Williams Beuren syndrome chromosome region 19 (MGC57359), mRNA [NM_001004351] 0,059858 0,09564667 0,6258 0,0375 A_24_P911734 Unknown 0,4009037 0,63859783 0,6278 0,0391 NM_000377 Homo sapiens Wiskott- Aldrich syndrome (ec- zemathrombocytopenia) (WAS), mRNA [NM_ 000377] 0,0362927 0,05759117 0,6302 0,0465 ENST PREDICTED: Homo sa- 00000343945 piens hypothetical protein LOC646457 (LOC 646457), mRNA [XM_ 929382] 0,183259 0,287199 0,6381 0,0460 NM_178828 Homo sapiens chromosome 9 open reading frame 79 (C9orf79), mRNA [NM_ 178828] 0,114218 0,1789715 0,6382 0,0207 AI090310 AI090310 oy81c05.s1 NCI_CGAP_CLL1 Ho- mo sapiens cDNA clone IMAGE:1672232 3', mR- NA sequence [AI090310] 0,500166 0,77780367 0,6430 0,0418 NM_172138 Homo sapiens interleukin 28A (interferon, lambda 2) (IL28A), mRNA [NM_ 172138] 0,096839 0,15038133 0,6440 0,0334 AF351616 Homo sapiens UG 0315G03 mRNA, complete cds. [AF351616] 0,253914 0,39426867 0,6440 0,0317 NM_001005172 Homo sapiens olfactory receptor, family 52, subfamily K, member 2 (OR52K2), mRNA [NM_ 001005172] 0,4283007 0,66336933 0,6456 0,0089 NM_020877 Homo sapiens dynein heavy chain domain 3 (DNHD3), mRNA [NM_ 020877] 0,268342 0,4147895 0,6469 0,0363 NM_006180 Homo sapiens neurotro- phic tyrosine kinase, receptor, type 2 (NTRK2), transcript variant a, mRNA [NM_006180] 0,0732757 0,11254983 0,6511 0,0265 NM_203348 Homo sapiens hypothetical MGC50722 (MGC 50722), mRNA [NM_ 203348]

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6,0329213 9,23969083 0,6529 0,0351 NM_004585 Homo sapiens retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 3 (RARRES3), mRNA [NM_ 004585] 0,1833203 0,27935233 0,6562 0,0106 NM_173463 Homo sapiens hypothetical protein DKFZp 761B107 (DKFZp 761B107), mRNA [NM_ 173463] 0,4188653 0,6368615 0,6577 0,0095 AY945262 Homo sapiens mucin (MUC8) mRNA, complete cds. [AY945262] 0,153034 0,2314005 0,6613 0,0041 NM_138564 Homo sapiens kallikrein 15 (KLK15), transcript variant 3, mRNA [NM_ 138564] 0,150943 0,22823017 0,6614 0,0429 THC2460283 Unknown 0,5007123 0,7567805 0,6616 0,0071 NM_152466 Homo sapiens chromosome 17 open reading frame 69 (C17orf69), mR- NA [NM_152466] 0,2052043 0,3101265 0,6617 0,0344 CB852325 UI-CF-FN0-afp-n-21-0- UI.s1 UI-CF-FN0 Homo sapiens cDNA clone UI- CF-FN0-afp-n-21-0-UI 3', mRNA sequence [CB 852325] 0,1987437 0,29940867 0,6638 0,0049 AA693695 AA693695 zi55a03.s1 So- ares_fetal_liver_spqleen_ 1 NFLS_S1 Homo sapiens cDNA clone IMAGE: 434668 3', mRNA sequence [AA693695] 0,1197583 0,180164 0,6647 0,0493 AB014602 Homo sapiens mRNA for KIAA0702 protein, partial cds. [AB014602] 0,1170687 0,17610717 0,6648 0,0181 NM_031895 Homo sapiens calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 8 (CACNG8), mRNA [NM_ 031895] 0,1808143 0,27121367 0,6667 0,0381 NM_053049 Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin) (UCN3), mRNA [NM_053049] 0,1334357 0,20007533 0,6669 0,0363 THC2413224 Unknown 0,146381 0,21896933 0,6685 0,0349 NM_134268 Homo sapiens cytoglo- bin (CYGB), mRNA [NM_ 134268] 1,0509367 1,559047 0,6741 0,0203 NM_007279 Homo sapiens U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2 (U2AF2), transcript variant 1, mRNA [NM_ 007279]

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0,544716 0,80759333 0,6745 0,0331 NM_002479 Homo sapiens myoge- nin (myogenic factor 4) (MYOG), mRNA [NM_ 002479] 0,1399903 0,20713467 0,6758 0,0434 NM_003396 Homo sapiens wingless- type MMTV integration site family, member 9B (WNT9B), mRNA [NM_ 003396] 0,2409917 0,35366183 0,6814 0,0391 BG196763 RST15990 Athersys RA- GE Library Homo sapiens cDNA, mRNA sequence [BG196763] 0,9545223 1,39959917 0,6820 0,0137 NM_016541 Homo sapiens guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13 (GNG13), mRNA [NM_ 016541] 0,3148203 0,46160467 0,6820 0,0137 NM_153221 Homo sapiens cartilage intermediate layer protein 2 (CILP2), mRNA [NM_ 153221] 0,445211 0,6464815 0,6887 0,0412 AF028825 Homo sapiens Tax inter- action protein 15 mRNA, complete cds. [AF028825] 0,529228 0,76781633 0,6893 0,0115 NM_016212 Homo sapiens TP53TG3 protein (TP53TG3), mR- NA [NM_016212] 0,0459113 0,06653283 0,6901 0,0136 NM_003465 Homo sapiens chitinase 1 (chitotriosidase) (CHIT1), mRNA [NM_003465] 63,354131 91,7183925 0,6907 0,0021 A_24_P392312 Unknown 0,197207 0,28538733 0,6910 0,0115 NM_004210 Homo sapiens neura- lized-like (Drosophila) (NEURL), mRNA [NM_ 004210] 0,2406427 0,34767533 0,6921 0,0049 THC2279436 Unknown 0,3386913 0,48828967 0,6936 0,0348 NM_003643 Homo sapiens glial cells missing homolog 1 (Dro- sophila) (GCM1), mRNA [NM_003643] 0,1838103 0,2647995 0,6941 0,0246 AK097703 Homo sapiens cDNA FLJ 40384 fis, clone TESTI 2035796. [AK097703] 0,603573 0,86805383 0,6953 0,0180 NM_001622 Homo sapiens alpha-2- HS-glycoprotein (AHSG), mRNA [NM_001622] 0,340071 0,4884255 0,6963 0,0008 AK092559 Homo sapiens cDNA FLJ 35240 fis, clone PROST 2002425, moderately similar to ZINC FINGER PRO- TEIN 136. [AK092559]

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0,499893 0,71580767 0,6984 0,0430 H11348 H11348 ym13h04.s1 So- ares infant brain 1NIB Ho- mo sapiens cDNA clone IMAGE:47855 3' similar to gb:X63657_rna1 FOLLICULAR VARIANT TRANSLOCATION PRO- TEIN 1 PRECURSOR (HUMAN);, mRNA sequence [H11348] 38,306262 54,72036 0,7000 0,0055 THC2395355 T28605 EST48922 Hu- man Spleen Homo sapiens cDNA 5' end similar to proto-oncogene junD (GB: X51346) (HT:1498), mR- NA sequence [T28605] 0,892903 1,273641 0,7011 0,0060 AK092338 Homo sapiens cDNA FLJ 35019 fis, clone OCBBF 2014541. [AK092338] 0,27635 0,393666 0,7020 0,0218 THC2449273 Unknown 0,3176827 0,45232733 0,7023 0,0385 BC008927 Homo sapiens zinc finger, FYVE domain containing 26, mRNA (cDNA clone IMAGE:3836316), partial cds. [BC008927] 2,195482 3,12383233 0,7028 0,0167 NM_003038 Homo sapiens solute carrier family 1 (glutamate/neutral amino acid transporter), member 4 (SLC1A4), mRNA [NM_ 003038] 0,7269133 1,03169133 0,7046 0,0273 BC064621 Homo sapiens vacuolar protein sorting 37 homolog D (S. cerevisiae), mR- NA (cDNA clone IMAGE: 5590230), complete cds. [BC064621] 0,443229 0,62488167 0,7093 0,0301 NM_031478 Homo sapiens family with sequence similarity 57, member B (FAM57B), mRNA [NM_031478] 0,3112173 0,43867667 0,7094 0,0342 AK055306 Homo sapiens cDNA FLJ 30744 fis, clone FEBRA 2000378. [AK055306] 0,7458877 1,04870583 0,7112 0,0418 NM_138809 Homo sapiens similar to mouse 2310016A09Rik gene (LOC134147), mR- NA [NM_138809] 0,2245617 0,31563667 0,7115 0,0125 AI971459 AI971459 wq86e07.x1 NCI_CGAP_GC6 Ho- mo sapiens cDNA clone IMAGE:2478948 3', mR- NA sequence [AI971459]

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0,220679 0,30973717 0,7125 0,0333 NR_001537 Homo sapiens testis-specific transcript, Y-linked 13 (TTTY13) on chromosome Y [NR_001537] 0,3839277 0,538446 0,7130 0,0485 NM_006671 Homo sapiens solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7 (SLC1A7), mRNA [NM_ 006671] 0,301334 0,42197383 0,7141 0,0306 NM_133367 Homo sapiens progestin and adipoQ receptor family member VIII (PAQR8), mRNA [NM_133367] 0,360661 0,50478717 0,7145 0,0186 NM_018962 Homo sapiens Down syndrome critical region gene 6 (DSCR6), mRNA [NM_ 018962] 7,470732 10,4264925 0,7165 0,0412 NM_018357 Homo sapiens La ribonucleoprotein domain family, member 6 (LARP6), transcript variant 1, mRNA [NM_018357] 0,080351 0,11202517 0,7173 0,0309 NM_020655 Homo sapiens junctophi- lin 3 (JPH3), mRNA [NM_ 020655] 1,0468497 1,45751117 0,7182 0,0393 NM_015077 Homo sapiens sterile alpha and TIR motif containing 1 (SARM1), mRNA [NM_015077] 0,3002587 0,4176295 0,7190 0,0210 NM_000923 Homo sapiens phosphodiesterase 4C, cAMP-specific (phosphodiesterase E1 dunce homolog, Dro- sophila) (PDE4C), mRNA [NM_000923] 0,3608567 0,5016485 0,7193 0,0198 NM_152780 Homo sapiens hypothetical protein FLJ14503 (FLJ14503), mRNA [NM_ 152780] 0,78433 1,0873255 0,7213 0,0498 A_23_P75192 Unknown 0,758962 1,04846267 0,7239 0,0210 NM_145200 Homo sapiens calcium binding protein 4 (CABP4), mRNA [NM_ 145200] 29,126738 40,2345267 0,7239 0,0373 NM_006234 Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J, 13.3 kDa (POLR2J), mRNA [NM_006234] 0,642184 0,88666367 0,7243 0,0111 NM_002272 Homo sapiens keratin 4 (KRT4), mRNA [NM_ 002272]

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1,124593 1,548265 0,7264 0,0207 AK092257 Homo sapiens cDNA FLJ 34938 fis, clone NT2RP 7006457, weakly similar to CALPAIN P94, LARGE [CATALYTIC] SUBUN- IT (EC 3.4.22.17). [AK 092257] 0,9155813 1,255936 0,7290 0,0422 BC071598 Homo sapiens D-2-hy- droxyglutarate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:87530 IMAGE: 30334929), complete cds. [BC071598] 0,1064913 0,14599733 0,7294 0,0338 BQ015182 BQ015182 UI-H-ED1- axw-m-24-0-UI.s1 NCI_ CGAP_ED1 Homo sapiens cDNA clone IMAGE: 5834687 3', mRNA sequence [BQ015182] 0,4807773 0,65849333 0,7301 0,0311 THC2290313 Unknown 9,9457087 13,6209432 0,7302 0,0189 NM_003713 Homo sapiens phosphati- dic acid phosphatase type 2B (PPAP2B), transcript variant 1, mRNA [NM_ 003713] 0,3209627 0,43933917 0,7306 0,0099 NM_032041 Homo sapiens neurocal- cin delta (NCALD), transcript variant 8, mRNA [NM_032041] 0,1617243 0,2203045 0,7341 0,0161 AK027057 Homo sapiens cDNA: FLJ23404 fis, clone HEP 18862. [AK027057] 1,1853873 1,61455533 0,7342 0,0226 NM_000043 Homo sapiens Fas (TNF receptor superfamily, member 6) (FAS), transcript variant 1, mRNA [NM_000043] 0,2659063 0,362093 0,7344 0,0459 NM_001039643 Homo sapiens zinc finger protein 96 (ZNF96), mR- NA [NM_001039643] 8,696871 11,8378298 0,7347 0,0221 NM_033439 Homo sapiens chromosome 9 open reading frame 26 (NF-HEV) (C9orf26), mRNA [NM_033439] 78,013577 106,141333 0,7350 0,0137 NM_000142 Homo sapiens fibrob- last growth factor receptor 3 (achondropla- sia, thanatophoric dwar- fism) (FGFR3), transcript variant 1, mRNA [NM_ 000142] 0,2056613 0,27977133 0,7351 0,0327 NM_172099 Homo sapiens CD8b molecule (CD8B), transcript variant 1, mRNA [NM_172099]

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0,2039807 0,27719783 0,7359 0,0154 NM_030641 Homo sapiens apolipopro- tein L, 6 (APOL6), mRNA [NM_030641] 14,08897 19,139492 0,7361 0,0393 NM_000156 Homo sapiens guanidi- noacetate N-methyltransferase (GAMT), transcript variant 1, mRNA [NM_ 000156] 0,1958977 0,26577633 0,7371 0,0443 NM_203395 Homo sapiens chromosome 6 open reading frame 71 (C6orf71), mRNA [NM_ 203395] 3,4297363 4,65093883 0,7374 0,0441 NM_001005368 Homo sapiens zinc finger protein 32 (ZNF32), transcript variant 2, mRNA [NM_001005368] 4,28153 5,80433 0,7376 0,0365 BC068045 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4140029, partial cds. [BC068045] 0,2954477 0,39910183 0,7403 0,0105 AK094860 Homo sapiens cDNA FLJ 37541 fis, clone BRCAN 2026340. [AK094860] 0,0705263 0,09525383 0,7404 0,0313 AK097034 Homo sapiens cDNA FLJ 39715 fis, clone SMINT 2013228. [AK097034] 2,134096 2,881703 0,7406 0,0470 NM_001622 Homo sapiens alpha-2- HS-glycoprotein (AHSG), mRNA [NM_001622] 0,6348247 0,85622733 0,7414 0,0179 A_32_P64025 Unknown 0,205255 0,2766585 0,7419 0,0421 NM_005306 Homo sapiens free fatty acid receptor 2 (FFAR2), mRNA [NM_005306] 0,255904 0,34384933 0,7442 0,0278 BC044608 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4827340. [BC 044608] 0,446498 0,59973017 0,7445 0,0415 NM_005551 Homo sapiens kallikrein 2, prostatic (KLK2), transcript variant 1, mRNA [NM_005551] 16,24332 21,7664292 0,7463 0,0023 NM_002634 Homo sapiens prohibitin (PHB), mRNA [NM_ 002634] 0,2335937 0,31207767 0,7485 0,0011 NM_145313 Homo sapiens RasGEF domain family, member 1A (RASGEF1A), mRNA [NM_145313] 0,6840123 0,91342083 0,7488 0,0324 NM_020201 Homo sapiens 5',3'-nu- cleotidase, mitochondrial (NT5M), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_020201]

21/63 DE 10 2009 043 485 A1 2011.03.31

14,935265 19,9416022 0,7490 0,0227 NM_003202 Homo sapiens transcription factor 7 (T-cell specific, HMG-box) (TCF7), transcript variant 1, mRNA [NM_003202] 0,781918 1,04147167 0,7508 0,0498 THC2431799 Q7QPY0 (Q7QPY0) GLP_ 223_1319_516, partial (10%) [THC2431799] 0,415148 0,551845 0,7523 0,0148 W72519 W72519 zd64h01.s1 So- ares_fetal_heart_Nb- HH19 W Homo sapiens cDNA clone IMAGE: 345457 3' similar to gb: M33552 LYMPHOCY- TE-SPECIFIC PROTEIN LSP1 (HUMAN);, mRNA sequence [W72519] 0,3727877 0,494368 0,7541 0,0472 AK054756 Homo sapiens cDNA FLJ 30194 fis, clone BRACE 2001352. [AK054756] 0,3197833 0,4240155 0,7542 0,0159 NM_181643 Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 88 (C1orf88), mRNA [NM_ 181643] 0,2655627 0,3515275 0,7555 0,0065 AW579245 AW579245 PM2-DT0042- 120100-001-f07 DT0042 Homo sapiens cDNA, mR- NA sequence [AW579245] 99,778491 131,959087 0,7561 0,0125 NM_021064 Homo sapiens histone 1, H2ag (HIST1H2AG), mR- NA [NM_021064] 0,2182567 0,2884875 0,7566 0,0426 NM_016362 Homo sapiens ghrelin/ obestatin preprohormo- ne (GHRL), mRNA [NM_ 016362] 3,1961587 4,22417733 0,7566 0,0151 CR610885 full-length cDNA clone CS0DC019YC18 of Neu- roblastoma Cot 25-normalized of Homo sapiens (human). [CR610885] 0,2844213 0,3754505 0,7575 0,0427 NM_206914 Homo sapiens family with sequence similarity 119, member B (FAM119B), transcript variant 2, mRNA [NM_206914] 3,8735853 5,099564 0,7596 0,0435 A_32_P133926 Unknown 0,3704323 0,48762933 0,7597 0,0043 X97675 H. sapiens mRNA for plakophilin 2a and b. [X97675] 209,57515 275,815462 0,7598 0,0061 NM_153200 Homo sapiens endothelial differentiation-related factor 1 (EDF1), transcript variant beta, mRNA [NM_ 153200]

22/63 DE 10 2009 043 485 A1 2011.03.31

0,366455 0,48225383 0,7599 0,0070 AK097411 Homo sapiens cDNA FLJ 40092 fis, clone TESTI 2003756. [AK097411] 1,4158043 1,862863 0,7600 0,0128 NM_001008491 Homo sapiens septin 2 (SEPT2), transcript variant 1, mRNA [NM_ 001008491] 0,0532493 0,0699225 0,7615 0,0070 THC2336892 Unknown 0,2813867 0,36927517 0,7620 0,0431 NM_002895 Homo sapiens retinoblast- oma-like 1 (p107) (RBL1), transcript variant 1, mRNA [NM_002895] 0,4230583 0,55421317 0,7633 0,0498 NM_198474 Homo sapiens olfacto- medin-like 1 (OLFML1), mRNA [NM_198474] 10,194874 13,3469772 0,7638 0,0012 NM_031485 Homo sapiens glutamate- rich WD repeat containing 1 (GRWD1), mRNA [NM_ 031485] 2,4491543 3,2053175 0,7641 0,0495 NM_018163 Homo sapiens DnaJ (Hsp 40) homolog, subfamily C, member 17 (DNAJC17), mRNA [NM_018163] 5,236155 6,8446235 0,7650 0,0109 NM_005321 Homo sapiens histone 1, H1e (HIST1H1E), mRNA [NM_005321] 64,792775 84,6775658 0,7652 0,0108 NM_003153 Homo sapiens signal transducer and activator of transcription 6, interleukin-4 induced (STAT6), mRNA [NM_003153] 46,020409 60,1306913 0,7653 0,0168 NM_001005464 Homo sapiens histone 2, H3a (HIST2H3A), mRNA [NM_001005464] 0,250901 0,3277355 0,7656 0,0103 NM_000298 Homo sapiens pyruva- te kinase, liver and RBC (PKLR), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA [NM_000298] 5,0157663 6,5483425 0,7660 0,0386 NM_004380 Homo sapiens CREB binding protein (Rubin- stein-Taybi syndrome) (CREBBP), mRNA [NM_ 004380] 0,33527 0,43757767 0,7662 0,0392 AW015426 UI-H-BI0-aat-h-12-0-UI.s1 NCI_CGAP_Sub1 Ho- mo sapiens cDNA clone IMAGE:2710535 3', mR- NA sequence [AW015426] 0,898054 1,17020433 0,7674 0,0441 BG007597 BG007597 QV4-GN0250- 281100-608-g10 GN0250 Homo sapiens cDNA, mR- NA sequence [BG007597]

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0,596823 0,77750833 0,7676 0,0451 S79912 GHRH-R = growth hormone-releasing hormone receptor {alternatively spliced} [human, GH- producing pituitary ade- noma, mRNA Partial, 561 nt]. [S79912] 0,3322937 0,43256983 0,7682 0,0470 NM_145345 Homo sapiens UBX domain containing 5 (UBXD5), transcript variant 1, mRNA [NM_ 145345] 20,208747 26,3070428 0,7682 0,0286 AK055387 Homo sapiens cDNA FLJ 30825 fis, clone FEBRA 2001706, highly similar to Human APEG-1 mRNA. [AK055387] 7,4693607 9,722072 0,7683 0,0103 NM_018719 Homo sapiens cell division cycle associated 7-like (CDCA7L), mRNA [NM_ 018719] 0,5528243 0,717527 0,7705 0,0312 THC2449916 Unknown 20,569373 26,6498688 0,7718 0,0263 NM_018973 Homo sapiens dolichylp- hosphate mannosyltransferase polypeptide 3 (DPM3), transcript variant 1, mRNA [NM_018973] 0,2060887 0,26694317 0,7720 0,0153 THC2457016 Unknown 23,500191 30,3977162 0,7731 0,0409 NM_001487 Homo sapiens biogene- sis of lysosome-related or- ganelles complex-1, subunit 1 (BLOC1S1), mRNA [NM_001487] 0,3194743 0,41242967 0,7746 0,0310 NM_147195 Homo sapiens FLJ35740 protein (FLJ35740), mR- NA [NM_147195] 14,811679 19,1118367 0,7750 0,0358 NM_006848 Homo sapiens coiled-coil domain containing 85B (CCDC85B), mRNA [NM_ 006848] 4,2215373 5,440874 0,7759 0,0112 NM_024119 Homo sapiens likely or- tholog of mouse D11lgp2 (LGP2), mRNA [NM_ 024119] 138,0598 177,778669 0,7766 0,0159 NM_020179 Homo sapiens chromosome 11 open reading frame 75 (C11orf75), mR- NA [NM_020179] 0,571553 0,73490217 0,7777 0,0107 NM_181718 Homo sapiens aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 (ASPHD1), mRNA [NM_181718] 485,39947 623,202979 0,7789 0,0175 A_23_P210285 Unknown 543,1896 696,377393 0,7800 0,0092 A_24_P366546 Unknown

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0,619164 0,793716 0,7801 0,0070 AK127258 Homo sapiens cDNA FLJ 45325 fis, clone BRHIP 3006717. [AK127258] 16,186236 20,7371483 0,7805 0,0254 NM_012336 Homo sapiens nuclear prelamin A recognition factor (NARF), transcript variant 1, mRNA [NM_ 012336] 11,572603 14,8220233 0,7808 0,0445 BC003583 Homo sapiens fatso, transcript variant 6, mRNA (cDNA clone IMAGE: 3353414), complete cds. [BC003583] 3,411087 4,36266433 0,7819 0,0017 NM_012099 Homo sapiens CD3e molecule, epsilon associated protein (CD3EAP), mRNA [NM_012099] 5,966171 7,62827083 0,7821 0,0481 NM_016558 Homo sapiens SCAN domain containing 1 (SCAND1), transcript variant 1, mRNA [NM_ 016558] 4,4969637 5,74942567 0,7822 0,0333 NM_015922 Homo sapiens NAD(P) dependent steroid dehy- drqogenase-like (NSDHL), mRNA [NM_015922] 2,1608577 2,75826317 0,7834 0,0352 NM_001010846 Homo sapiens Src homology 2 domain containing E (SHE), mRNA [NM_ 001010846] 25,991564 33,1278335 0,7846 0,0443 NM_004148 Homo sapiens ninjurin 1 (NINJ1), mRNA [NM_ 004148] 0,414746 0,5282605 0,7851 0,0484 NM_199350 Homo sapiens chromosome 9 open reading frame 50 (C9orf50), mRNA [NM_ 199350] 0,208917 0,26599117 0,7854 0,0217 AK026312 Homo sapiens cDNA: FLJ22659 fis, clone HSI 07953. [AK026312] 3,348778 4,251839 0,7876 0,0413 AK131396 Homo sapiens cDNA FLJ 16488 fis, clone BRTHA 3008826. [AK131396] 99,175644 125,863784 0,7880 0,0080 NM_014583 Homo sapiens LIM and cysteine-rich domains 1 (LMCD1), mRNA [NM_ 014583] 90,699297 115,031794 0,7885 0,0265 NM_001009 Homo sapiens ribosomal protein 85 (RPS5), mRNA [NM_001009]

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38,060085 48,2197533 0,7893 0,0301 BC014228 Homo sapiens prohibitin pseudogene, mRNA (cDNA clone MGC:20874 IMAGE:4547239), complete cds. [BC014228] 15,79584 19,9296698 0,7926 0,0072 A_24_P614940 Unknown 1556,8485 1962,498 0,7933 0,0082 NM_030967 Homo sapiens keratin associated protein 1-1 (KRTAP1-1), mRNA [NM_ 030967] 37,04429 46,6295877 0,7944 0,0211 NM_023915 Homo sapiens G protein- coupled receptor 87 (GPR 87), mRNA [NM_023915] 10,076628 12,6837447 0,7945 0,0401 NM_018194 Homo sapiens hedgehog acyltransferase (HHAT), mRNA [NM_018194] 14,700243 18,5015062 0,7945 0,0360 NM_003202 Homo sapiens transcription factor 7 (T-cell specific, HMG-box) (TCF7), transcript variant 1, mRNA [NM_003202] 0,831788 1,04682367 0,7946 0,0407 BC005095 Homo sapiens PANK2 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:3958459), partial cds. [BC005095] 112,08555 140,924458 0,7954 0,0487 NM_003532 Homo sapiens histone 1, H3e (HIST1H3E), mRNA [NM_003532] 21,845378 27,462027 0,7955 0,0463 NM_032687 Homo sapiens cysteine/ histidine-rich 1 (CYHR1), mRNA [NM_032687] 35,636983 44,783734 0,7958 0,0181 NM_052850 Homo sapiens growth ar- rest and DNA-damage- inducible, gamma interacting protein 1 (GADD 45GIP1), mRNA [NM_ 052850] 1,1209413 1,408607 0,7958 0,0366 NM_020706 Homo sapiens splicing factor, arginine/serine- rich 15 (SFRS15), mRNA [NM_020706] 6,2485583 7,85029733 0,7960 0,0180 NM_017828 Homo sapiens COMM domain containing 4 (COMMD4), mRNA [NM_ 017828] 14,797757 18,586547 0,7962 0,0151 NM_001025105 Homo sapiens ca- sein kinase 1, alpha 1 (CSNK1A1), transcript variant 1, mRNA [NM_ 001025105] 0,7536783 0,9458545 0,7968 0,0351 NM_005240 Homo sapiens ets variant gene 3 (ETV3), mRNA [NM_005240]

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18,265828 22,8979022 0,7977 0,0389 AB051487 Homo sapiens mRNA for KIAA1700 protein, partial cds. [AB051487] 32,30131 40,421443 0,7991 0,0159 NM_017885 Homo sapiens host cell factor C1 regulator 1 (XPO1 dependent) (HCFC1R1), transcript variant 1, mRNA [NM_ 017885] 2,014185 2,52021433 0,7992 0,0122 A_24_P622697 Unknown 4,2750213 5,34427583 0,7999 0,0253 NM_017828 Homo sapiens COMM domain containing 4 (COMMD4), mRNA [NM_ 017828] 1,9153753 2,39188683 0,8008 0,0247 NM_006987 Homo sapiens rabphilin 3A-like (without C2 domains) (RPH3AL), mRNA [NM_006987] 312,85444 390,631618 0,8009 0,0120 NM_001861 Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1 (COX4I1), mR- NA [NM_001861] 0,277507 0,34643983 0,8010 0,0427 NM_198440 Homo sapiens Der1-like domain family, member 3 (DERL3), transcript variant 1, mRNA [NM_ 198440] 0,2049687 0,25568 0,8017 0,0059 NM_016362 Homo sapiens ghrelin/ obestatin preprohormo- ne (GHRL), mRNA [NM_ 016362] 48,948875 61,0351 0,8020 0,0151 NM_003517 Homo sapiens histone 2, H2ac (HIST2H2AC), mR- NA [NM_003517] 111,9136 139,519589 0,8021 0,0231 NM_012232 (Homo sapiens polymerase I and transcript release factor PTRF), mR- NA [NM_012232] 1,8795677 2,34299967 0,8022 0,0339 NM_032040 Homo sapiens coiled- coil domain containing 8 (CCDC8), mRNA [NM_ 032040] 4,0011433 4,9836155 0,8029 0,0202 NM_012305 Homo sapiens adaptor-related protein complex 2, alpha 2 subunit (AP2A2), mRNA [NM_012305] 4,2940347 5,3441915 0,8035 0,0277 BC000986 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3446313, complete cds. [BC000986]

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32,859417 40,8664857 0,8041 0,0492 NM_001001975 Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, delta subunit (ATP5D), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 2, mRNA [NM_001001975] 2,6951407 3,3508085 0,8043 0,0439 NM_207377 Homo sapiens TIMM9 (UNQ9438), mRNA [NM_ 207377] 90,357419 112,339322 0,8043 0,0146 NM_007311 Homo sapiens translo- cator protein (18 kDa) (TSPO), transcript variant PBR-S, mRNA [NM_ 007311] 0,519267 0,64552417 0,8044 0,0127 BM994983 BM994983 UI-H-ED0- awz-n-15-0-UI.s1 NCI_ CGAP_ED0 Homo sapiens cDNA clone IMAGE: 5825870 3', mRNA sequence [BM994983] 274,12731 340,756883 0,8045 0,0229 XM_933879 PREDICTED: Homo sapiens similar to 60S ribosomal protein L7a, transcript variant 2 (LOC644029), mRNA [XM_933879] 4,5677457 5,6739565 0,8050 0,0282 NM_032140 Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 48 (C16orf48), mR- NA [NM_032140] 3,1769033 3,94344667 0,8056 0,0174 NM_020834 Homo sapiens KIAA1443 (KIAA1443), mRNA [NM_ 020834] 1,5144967 1,87980467 0,8057 0,0292 NM_153035 Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 83 (C1orf83), mRNA [NM_ 153035] 1,465883 1,81822483 0,8062 0,0140 THC2378276 Q7QA91 (Q7QA91) EN- SANGP00000012641 (Fragment), partial (4%) [THC2378276] 11,606927 14,3950348 0,8063 0,0102 NM_022163 Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L46 (MRPL46), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_ 022163] 36,944294 45,75093 0,8075 0,0155 NM_178121 Homo sapiens HBV pre-s2 binding protein 1 (SBP1), mRNA [NM_ 178121] 8,224834 10,178031 0,8081 0,0486 A_24_P552987 Unknown

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0,3861027 0,4777785 0,8081 0,0394 BC006340 Homo sapiens zinc finger, CCHC domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:4079754), complete cds. [BC006340] 4,0822567 5,04711917 0,8088 0,0090 NM_032268 Homo sapiens zinc and ring finger 1 (ZNRF1), mRNA [NM_032268] 7,046084 8,70958333 0,8090 0,0445 NM_016558 Homo sapiens SCAN domain containing 1 (SCAND1), transcript variant 1, mRNA [NM_ 016558] 0,6947477 0,85860117 0,8092 0,0365 AF117899 Homo sapiens LDLR-FUT fusion protein (LDLR-FUT) mRNA, complete cds. [AF 117899] 246,95643 304,957498 0,8098 0,0114 NM_012385 Homo sapiens nuclear protein 1 (NUPR1), transcript variant 2, mRNA [NM_012385] 0,838182 1,034949 0,8099 0,0037 NM_173359 Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 4E member 3 (EIF4E3), mRNA [NM_173359] 9,6260587 11,8849977 0,8099 0,0374 NM_024571 Homo sapiens chromosome 16 open reading frame 33 (C16orf33), mR- NA [NM_024571] 0,2983747 0,3681575 0,8105 0,0223 NM_017894 Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 2 (ZSCAN2), transcript variant 2, mRNA [NM_017894] 3,6473073 4,49888283 0,8107 0,0078 NM_032265 Homo sapiens zinc finger, MYND-type containing 15 (ZMYND15), mRNA [NM_ 032265] 2,9744547 3,66781183 0,8110 0,0150 NM_024068 Homo sapiens oligonu- cleotide/oligosacchari de- binding fold containing 2B (OBFC2B), mRNA [NM_ 024068] 0,8085067 0,99618367 0,8116 0,0215 NM_173537 Homo sapiens GTF2I repeat domain containing 2 (GTF2IRD2), mRNA [NM_ 173537] 1,0793177 1,32939983 0,8119 0,0191 NM_032293 Homo sapiens GTPase acfvating Rap/RanGAP domain-like 3 (GARNL3), mRNA [NM_032293] 0,138637 0,170604 0,8126 0,0228 AF116718 Homo sapiens PRO2900 mRNA, complete cds. [AF 116718]

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1685,0435 2073,15405 0,8128 0,0493 NM_002952 Homo sapiens ribosomal protein S2 (RPS2), mRNA [NM_002952] 1,9866483 2,4408535 0,8139 0,0323 AK092508 Homo sapiens cDNA FLJ 35189 fis, clone PLACE 6016210. [AK092508] 209,24239 256,997528 0,8142 0,0293 A_24_P24142 Unknown 13,0987 16,0732848 0,8149 0,0333 NM_015299 Homo sapiens KIAA0323 (KIAA0323), mRNA [NM_ 015299] 1,0222143 1,25238617 0,8162 0,0212 BC014215 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4110098, partial cds. [BC014215] 0,5402633 0,66188383 0,8163 0,0130 A_24_P233560 Unknown 11,117575 13,6135605 0,8167 0,0019 NM_004436 Homo sapiens endosulfine alpha (ENSA), transcript variant 3, mRNA [NM_ 004436] 9,646862 11,8042768 0,8172 0,0111 NM_182612 Homo sapiens Parkinson disease 7 domain containing 1 (PDDC1), mRNA [NM_182612] 22,467934 27,4850912 0,8175 0,0169 NM_014066 Homo sapiens COMM domain containing 5 (COMMD5), mRNA [NM_ 014066] 7,4120307 9,0602435 0,8181 0,0212 NM_016492 Homo sapiens RAN guanine nucleotide release factor (RANGNRF), mR- NA [NM_016492] 11,449168 13,9938627 0,8182 0,0370 NM_001015885 Homo sapiens RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe) (RAE1), transcript variant 2, mRNA [NM_ 001015885] 0,3213093 0,39263883 0,8183 0,0374 THC2342207 Unknown 0,152199 0,18595017 0,8185 0,0124 ENST Unknown 00000361266 1,5277307 1,86271083 0,8202 0,0246 BM680823 UI-E-EJ0-aih-c-18-0-UI.s1 UI-E-EJ0 Homo sapiens cDNA clone UI-E-EJ0-aih- c-18-0-UI 3', mRNA sequence [BM680823] 14,719989 17,9381115 0,8206 0,0497 AK000900 Homo sapiens cDNA FLJ 10038 fis, clone HEMBA 1000971. [AK000900] 1,438005 1,75161917 0,8210 0,0143 NM_014938 Homo sapiens MIX interacting protein (MLXIP), mRNA [NM_014938]

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46,771838 56,9213533 0,8217 0,0322 NM_019848 Homo sapiens solute carrier family 10 (sodium/bi- le acid cotransporter family), member 3 (SLC10A3), mRNA [NM_019848] 5,394203 6,5618275 0,8221 0,0149 NM_000411 Homo sapiens holocar- boxylase synthetase (bio- tin-(proprionyl-Coenzyme A-carboxylase (ATP-hy- drolysing))ligase) (HLCS), mRNA [NM_000411] 1,112521 1,3530275 0,8222 0,0101 NM_019042 Homo sapiens pseudou- ridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae) (PUS7), mRNA [NM_ 019042] 198,02032 240,782696 0,8224 0,0433 NM_006736 Homo sapiens DnaJ (Hsp 40) homolog, subfamily B, member 2 (DNAJB2), transcript variant 2, mRNA [NM_006736] 8,1716317 9,93614317 0,8224 0,0499 BX641069 Homo sapiens mRNA; cD- NA DKFZp686H22112 (from clone DKFZp 686H22112). [BX641069] 2,5396733 3,083981 0,8235 0,0428 AB014518 Homo sapiens mRNA for KIAA0618 protein, partial cds. [AB014518] 0,343203 0,41645733 0,8241 0,0162 A_24_P230100 Unknown 12,321888 14,942404 0,8246 0,0123 NM_002093 Homo sapiens glycogen synthase kinase 3 beta (GSK3B), mRNA [NM_ 002093] 1,3444193 1,63027217 0,8247 0,0379 AK054718 Homo sapiens cDNA FLJ 30156 fis, clone BRACE 2000487. [AK054718] 3,9679913 4,80557383 0,8257 0,0272 BC000986 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3446313, complete cds. [BC000986] 1,602633 1,93874333 0,8266 0,0111 NM_032018 Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 124 (C1orf124), transcript variant 1, mRNA [NM_ 032018] 1007,0068 1218,18733 0,8266 0,0170 NM_002415 Homo sapiens macropha- ge migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor) (MIF), mRNA [NM_ 002415] 16,473629 19,9200738 0,8270 0,0479 ENST full-length cDNA clone 00000274695 CS0DC016YE18 of Neu- roblastoma Cot 25-normalized of Homo sapiens (human). [CR623381]

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11,741074 14,1897767 0,8274 0,0111 NM_005170 Homo sapiens achaete- scute complex-like 2 (Dro- sophila) (ASCL2), mRNA [NM_005170] 24,857371 30,0279775 0,8278 0,0308 NM_002634 Homo sapiens prohibitin (PHB), mRNA [NM_ 002634] 14,502301 17,5089387 0,8283 0,0497 NM_018135 Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein S18A (MRPS18A), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_018135] 13,494769 16,2924855 0,8283 0,0102 NM_000713 Homo sapiens biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)) (BLVRB), mRNA [NM_000713] 6,741004 8,1352315 0,8286 0,0040 NM_005262 Homo sapiens growth factor, augmenter of liver regeneration (ERV1 homolog, S. cerevisiae) (GFER), mRNA [NM_ 005262] 4,87034 5,87548233 0,8289 0,0303 NM_005834 Homo sapiens transloca- se of inner mitochondrial membrane 17 homolog B (yeast) (TIMM17B), mR- NA [NM_005834] 10,255827 12,36193 0,8296 0,0309 NM_024295 Homo sapiens Der1-like domain family, member 1 (DERL1), mRNA [NM_ 024295] 3,454044 4,16207367 0,8299 0,0374 NM_019592 Homo sapiens ring finger protein 20 (RNF20), mR- NA [NM_019592] 0,2055293 0,247597 0,8301 0,0392 NM_016362 Homo sapiens ghrelin/ obestatin preprohormo- ne (GHRL), mRNA [NM_ 016362] 51,469745 61,879264 0,8318 0,0460 NM_022780 Homo sapiens required for meiotic nuclear division 5 homolog A (S. cerevisiae) (RMND5A), mRNA [NM_ 022780] 22,535553 27,089679 0,8319 0,0439 NM_004718 Homo sapiens cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2 like (COX7A2L), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_ 004718]

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10,752304 12,9172793 0,8324 0,0445 NM_032343 Homo sapiens coiled- coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 (CHCHD6), mRNA [NM_ 032343] 11,76503 14,1185037 0,8333 0,0090 NM_022756 Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 149 (C1orf149), mRNA [NM_022756] 129,49914 155,402185 0,8333 0,0117 A_24_P358279 Unknown 5,7808853 6,9319845 0,8339 0,0196 ENST full-length cDNA clone 00000341249 CS0DJ010YL19 of T cells (Jurkat cell line) Cot 10- normalized of Homo sapiens (human). [CR602837] 8,2565303 9,8979725 0,8342 0,0459 NM_016143 Homo sapiens NSFL1 (p97) cofactor (p47) (NSFL1C), transcript variant 1, mRNA [NM_ 016143] 127,12889 152,297581 0,8347 0,0209 NM_005505 Homo sapiens scavenger receptor class B, member 1 (SCARB1), mRNA [NM_ 005505] 544,73667 651,60625 0,8360 0,0051 NM_000980 Homo sapiens ribosomal protein Lq18a (RPL18A), mRNA [NM_000980] 1,3748387 1,6437735 0,8364 0,0210 NM_007047 Homo sapiens butyro- philin, subfamily 3, member A2 (BTN3A2), mRNA [NM_007047] 0,6528893 0,78035683 0,8367 0,0203 NM_005373 Homo sapiens myelopro- liferative leukemia virus oncogene (MPL), mRNA [NM_005373] 4,2273017 5,05124667 0,8369 0,0229 NM_002601 Homo sapiens phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta (PDE6D), mRNA [NM_002601] 19,127091 22,8487672 0,8371 0,0472 NM_020442 Homo sapiens valyl-tRNA synthetase like (VARSL), mRNA [NM_020442] 266,53447 318,058937 0,8380 0,0193 NM_001005 Homo sapiens ribosomal protein S3 (RPS3), mRNA [NM_001005] 9,2716333 11,0342298 0,8403 0,0372 NM_000671 Homo sapiens alcohol dehydrogenase 5 (class III), chi polypeptide (ADH5), mRNA [NM_000671] 0,9200763 1,094488 0,8406 0,0049 A_24_P367326 Unknown 272,27771 323,829605 0,8408 0,0054 NM_000992 Homo sapiens ribosomal protein L29 (RPL29), mR- NA [NM_000992]

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1,083409 1,28827933 0,8410 0,0475 NM_001381 Homo sapiens docking protein 1, 62 kDa (down- stream of tyrosine kinase 1) (DOK1), mRNA [NM_ 001381] 10,544083 12,5340593 0,8412 0,0347 NM_198194 Homo sapiens stomatin (STOM), transcript variant 2, mRNA [NM_198194] 9,6345377 11,4415832 0,8421 0,0234 NM_152395 Homo sapiens nudix (nu- cleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 (NUDT16), mRNA [NM_152395] 184,7889 219,446561 0,8421 0,0105 XM_063336 PREDICTED: Homo sapiens similar to Cytochro- me c oxidase subunit IV isoform 1, mitochondrial precursor (COX IV- 1) (Cytochrome c oxidase polypeptide IV) (LOC 12q2867), mRNA [XM_ 063336] 9,6112083 11,4046188 0,8427 0,0475 NM_016049 Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 122 (C14orf122), mRNA [NM_016049] 1,6294597 1,93241383 0,8432 0,0242 NM_004289 Homo sapiens nuclear factor (erythroid-derived 2) -like 3 (NFE2L3), mRNA [NM_004289] 1886,9503 2236,56647 0,8437 0,0313 AF159295 Homo sapiens serine/ threonine protein kinase Kp78 splice variant CTAK 75a mRNA, complete cds. [AF159295] 36,421503 43,1493477 0,8441 0,0134 NM_032872 Homo sapiens synapto- tagmin-like 1 (SYTL1), mRNA [NM_032872] 19,037824 22,5532862 0,8441 0,0247 NM_030981 Homo sapiens RAB1B, member RAS oncogene family (RAB1B), mRNA [NM_030981] 0,562706 0,66649433 0,8443 0,0492 NM_213568 Homo sapiens solute carrier family 39 (zinc transporter), member 3 (SLC 39A3), transcript variant 2, mRNA [NM_213568] 93,831815 111,061398 0,8449 0,0306 NM_003514 Homo sapiens histone 1, H2am (HIST1H2AM), mR- NA [NM_003514] 15,681649 18,5569167 0,8451 0,0481 NM_014925 Homo sapiens R3H domain containing 2 (R3HDM2), mRNA [NM_ 014925]

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1007,7415 1192,09104 0,8454 0,0088 NM_002415 Homo sapiens macropha- ge migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor) (MIF), mRNA [NM_ 002415] 6,946848 8,21763983 0,8454 0,0458 NM_017445 Homo sapiens H2B histone family, member S (H2BFS), mRNA [NM_ 017445] 1,7985233 2,127 0,8456 0,0185 NM_004249 Homo sapiens RAB28, member RAS oncogene family (RAB28), transcript variant 2, mRNA [NM_ 004249] 507,58654 599,765931 0,8463 0,0472 NM_000972 Homo sapiens ribosomal protein L7a (RPL7A), mR- NA [NM_000972] 2,9713137 3,508718 0,8468 0,0350 AW452819 UI-H-BI3-aly-a-06-0-UI.s1 NCI_CGAP_Sub5 Ho- mo sapiens cDNA clone IMAGE:3068842 3', mR- NA sequence [AW452819] 387,25889 456,662225 0,8480 0,0424 NM_015414 Homo sapiens ribosomal protein L36 (RPL36), transcript variant 2, mRNA [NM_015414] 991,61105 1167,74284 0,8492 0,0054 NM_002415 Homo sapiens macropha- ge migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor) (MIF), mRNA [NM_ 002415] 23,032957 27,0948202 0,8501 0,0305 NM_020239 Homo sapiens CDC42 small effector 1 (CDC42 SE1), transcript variant 2, mRNA [NM_020239] 12,174343 14,309782 0,8508 0,0017 NM_005631 Homo sapiens smoothe- ned homolog (Drosophi- la) (SMO), mRNA [NM_ 005631] 1054,5333 1239,3571 0,8509 0,0243 NM_001002857 Homo sapiens annexin A2 (ANXA2), transcript variant 2, mRNA [NM_ 001002857] 44,39607 52,1582223 0,8512 0,0457 NM_014952 Homo sapiens bromo ad- jacent homology domain containing 1 (BAHD1), mRNA [NM_014952] 5,247308 6,15975833 0,8519 0,0135 NM_016594 Homo sapiens FK506 binding protein 11, 19 kDa (FKBP11), mRNA [NM_ 016594] 9,1895947 10,7822622 0,8523 0,0374 NM_033088 Homo sapiens family with sequence similarity 40, member A (FAM40A), mRNA [NM_033088]

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6,8353187 8,01809867 0,8525 0,0337 NM_005327 Homo sapiens L-3-hydrox- yacyl-Coenzyme A dehydrogenase, short chain (HADHSC), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_ 005327] 1,569993 1,84120967 0,8527 0,0211 THC2438975 Q6STG2 (Q6STG2) DNA polymerase-transactiva- ted protein 3, partial (13%) [THC2438975] 128,92785 151,170077 0,8529 0,0477 NM_005319 Homo sapiens histone 1, H1c (HIST1H1C), mRNA [NM_005319] 126,85356 148,225893 0,8558 0,0401 NM_021173 Homo sapiens polymerase (DNA-directed), delta 4 (POLD4), mRNA [NM_ 021173] 757,69589 884,811314 0,8563 0,0278 NM_033062 Homo sapiens keratin associated protein 4-2 (KRTAP4-2), mRNA [NM_ 033062] 463,49518 541,096094 0,8566 0,0202 A_24_P178784 Unknown 7,4527123 8,69911833 0,8567 0,0377 NM_144580 Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 85 (C1orf85), mRNA [NM_ 144580] 1005,4152 1173,41541 0,8568 0,0217 NM_003752 Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 8, 110 kDa (EIF3S8), transcript variant 1, mRNA [NM_ 003752] 2,61623 3,04925083 0,8580 0,0254 NM_024327 Homo sapiens zinc finger protein 576 (ZNF576), mRNA [NM_024327] 89,37778 104,114883 0,8585 0,0112 ENST Q5T1D1 (Q5T1D1) OTT- 00000287144 HUMP00000017090 (Fragment), partial (93%) [THC2434258] 87,343303 101,741598 0,8585 0,0429 NM_014161 Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein 118 (MRPL18), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_ 014161] 3,758715 4,37704983 0,8587 0,0139 A_32_P91156 Unknown 922,22101 1073,71319 0,8589 0,0256 NM_053275 Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript variant 2, mRNA [NM_053275]

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3,7081583 4,315819 0,8592 0,0259 ENST Homo sapiens hypothe- 00000325900 tical protein MGC39606, mRNA (cDNA clone MGC: 39606 IMAGE:5260968), complete cds. [BC051704] 1,6815133 1,95654683 0,8594 0,0385 NM_152277 Homo sapiens dendritic cell-derived ubiquitin-like protein (DC-UbP), mRNA [NM_152277] 258,43876 300,594031 0,8598 0,0331 XM_932704 PREDICTED: Homo sapiens similar to 60S ribosomal protein L29 (Cell sur- face heparin binding protein HIP), transcript variant 2 (LOC643433), mR- NA [XM_932704] 53,321734 61,9924253 0,8601 0,0314 NM_014017 Homo sapiens mitogen- activated protein-binding protein-interacting protein (MAPBPIP), mRNA [NM_ 014017] 2,6654497 3,09863367 0,8602 0,0235 NM_194458 Homo sapiens ubiquit- inconjugating enzyme E2, J2 (UBC6 homolog, yeast) (UBE2J2), transcript variant 3, mRNA [NM_194458] 288,30067 334,953524 0,8607 0,0428 NM_005745 Homo sapiens B-cell receptor-associated protein 31 (BCAP31), mRNA [NM_005745] 582,7852 676,867103 0,8610 0,0316 NM_012423 Homo sapiens ribosomal protein L13a (RPL13A), mRNA [NM_012423] 2,9639893 3,43974267 0,8617 0,0268 BC023989 Homo sapiens cDNA clone IMAGE:3931276, partial cds. [BC023989] 89,105191 103,398005 0,8618 0,0372 NM_006409 Homo sapiens actin related protein 2/3 complex, subunit 1A, 41 kDa (ARPC1A), mRNA [NM_ 006409] 944,34934 1095,61889 0,8619 0,0257 NM_053275 Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript variant 2, mRNA [NM_053275] 1,2669587 1,46908883 0,8624 0,0247 ENST Unknown 00000373014 27,983381 32,4108853 0,8634 0,0470 BC026344 Homo sapiens hypothetical protein FLJ20489, mR- NA (cDNA clone MGC: 26667 IMAGE:4798578), complete cds. [BC026344]

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7,3874573 8,53645083 0,8654 0,0202 NR_002730 Homo sapiens bromodo- main containing protein 75 kDa pseudogene (BP75) on chromosome 6 [NR_ 002730] 8,7638957 10,1250138 0,8656 0,0348 NM_007349 Homo sapiens PAX interacting (with transcription- activation domain) protein 1 (PAXIP1), mRNA [NM_ 007349] 221,23395 255,57186 0,8656 0,0080 NM_016091 Homo sapiens eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 6 interacting protein (EIF3S6IP), mRNA [NM_016091] 86,165062 99,4562165 0,8664 0,0284 CR603845 full-length cDNA clone CS0DI026YH22 of Pla- centa Cot 25-normalized of Homo sapiens (human). [CR603845] 2,6302947 3,033168 0,8672 0,0458 NM_014159 Homo sapiens SET domain containing 2 (SETD2), mRNA [NM_ 014159] 470,75634 542,796059 0,8673 0,0176 BC004943 Homo sapiens hypothetical protein MGC10814, mRNA (cDNA clone MGC: 10814 IMAGE:3613095), complete cds. [BC004943] 3,9805053 4,588039 0,8676 0,0392 NM_004423 Homo sapiens dishevel- led, dsh homolog 3 (Dro- sophila) (DVL3), mRNA [NM_004423] 282,32635 325,266626 0,8680 0,0488 ENST PREDICTED: Homo sapi- 00000284293 ens similar to 60S ribosomal protein L29 (Cell sur- face heparin binding protein HIP) (LOC283412), mRNA [XM_497352] 1,331912 1,53296417 0,8688 0,0429 NM_022074 Homo sapiens family with sequence similarity 111, member A (FAM111A), transcript variant 1, mRNA [NM_022074] 8,6319967 9,92716667 0,8695 0,0162 ENST Unknown 00000371142 434,65944 499,302505 0,8705 0,0292 NM_000992 Homo sapiens ribosomal protein L29 (RPL29), mR- NA [NM_000992] 1904,2873 2187,41742 0,8706 0,0275 NM_033060 Homo sapiens keratin associated protein 4-10 (KRTAP4-10), mRNA [NM_033060]

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913,28248 1048,79816 0,8708 0,0125 NM_053275 Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript variant 2, mRNA [NM_053275] 77,252738 88,6380977 0,8716 0,0490 NM_007241 Homo sapiens SNF8, ES- CRT-II complex subunit, homolog (S. cerevisiae) (SNF8), mRNA [NM_ 007241] 118,58033 135,94074 0,8723 0,0324 NM_002744 Homo sapiens protein kinase C, zeta (PRKCZ), transcript variant 1, mRNA [NM_002744] 47,92867 54,9265595 0,8726 0,0454 NM_181484 Homo sapiens zinc finger, CCCH-type with G patch domain (ZGPAT), transcript variant 2, mRNA [NM_181484] 9,664483 11,0754115 0,8726 0,0135 U69195 U69195 Soares infant brain 1NIB Homo sapiens cDNA clone 32996, mR- NA sequence [U69195] 172,8329 197,70505 0,8742 0,0248 NM_016006 Homo sapiens abhydro- lase domain containing 5 (ABHD5), mRNA [NM_ 016006] 5,137576 5,87004067 0,8752 0,0448 ENST Homo sapiens ornithine 00000379534 transporter (ORNT1) mR- NA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. [AF112968] 996,27628 1135,49383 0,8774 0,0416 NM_018955 Homo sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA [NM_ 018955] 1075,1322 1225,11847 0,8776 0,0237 NM_002415 Homo sapiens macropha- ge migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor) (MIF), mRNA [NM_ 002415] 4,988246 5,68407 0,8776 0,0233 NM_000821 Homo sapiens gamma- glutamyl carboxylase (GGCX), mRNA [NM_ 000821] 434,7075 495,067811 0,8781 0,0115 NM_000980 Homo sapiens ribosomal protein L18a (RPL18A), mRNA [NM_000980] 4,169575 4,74421483 0,8789 0,0476 NM_004814 Homo sapiens WD repeat domain 57 (U5 snRNP specific) (WDR57), mRNA [NM_004814] 161,30911 183,524875 0,8789 0,0299 NM_182565 Homo sapiens family with sequence similarity 100, member B (FAM100B), mRNA [NM_182565]

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50,537658 57,4917358 0,8790 0,0426 NM_006233 Homo sapiens polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide I, 14.5 kDa (POLR2I), mRNA [NM_006233] 644,49318 732,942303 0,8793 0,0308 NM_001675 Homo sapiens activating transcription factor 4 (tax- responsive enhancer element B67) (ATF4), transcript variant 1, mRNA [NM_001675] 24,079547 27,3753305 0,8796 0,0223 NM_003782 Homo sapiens UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,3-ga- lactosyltransferase, polypeptide 4 (B3GALT4), mRNA [NM_003782] 20,384476 23,168513 0,8798 0,0292 NM_017841 Homo sapiens hypothetical protein FLJ20487 (FLJ20487), mRNA [NM_ 017841] 1017,2523 1152,50843 0,8826 0,0126 NM_002415 Homo sapiens macropha- ge migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor) (MIF), mRNA [NM_ 002415] 59,870739 67,8234433 0,8827 0,0414 NM_002646 Homo sapiens phos- phoinositide-3-kinase, class 2, beta polypeptide (PIK3C2B), mRNA [NM_ 002646] 98,882151 111,782294 0,8846 0,0235 NM_000939 Homo sapiens proopiome- lanocortin (adrenocorti- cotropin/beta-lipotropin/ alpha-melanocyte stimulating hormone/beta-melanocyte stimulating hormone/beta-endorphin) (POMC), transcript variant 2, mRNA [NM_000939] 4,0895417 4,622329 0,8847 0,0485 NM_003498 Homo sapiens stan- nin (SNN), mRNA [NM_ 003498] 1078,0732 1218,44444 0,8848 0,0183 NM_001404 Homo sapiens eukaryotic translation elongation factor 1 gamma (EEF1G), mRNA [NM_001404] 6,3993097 7,2269525 0,8855 0,0278 NM_022745 Homo sapiens ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 (ATPAF1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA [NM_022745]

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11,62773 13,1181095 0,8864 0,0153 NM_145039 Homo sapiens hypothetical protein MGC16385 (MGC16385), mRNA [NM_145039] 36,696039 41,3695668 0,8870 0,0463 NM_033445 Homo sapiens histone 3, H2a (HIST3H2A), mRNA [NM_033445] 1,2714627 1,43336517 0,8870 0,0065 AK055981 Homo sapiens cDNA FLJ 31419 fis, clone NT2NE 2000356. [AK055981] 27,333347 30,7743192 0,8882 0,0327 NM_014183 Homo sapiens dynein, light chain, roadblock-type 1 (DYNLRB1), mRNA [NM_014183] 27,012452 30,3472607 0,8901 0,0215 NM_007171 Homo sapiens protein- O-mannosyltransferase 1 (POMT1), mRNA [NM_ 007171] 1,5910903 1,78627433 0,8907 0,0474 NM_183013 Homo sapiens cAMP responsive element modu- lator (CREM), transcript variant 19, mRNA [NM_ 183013] 61,806042 69,3195665 0,8916 0,0468 NM_004889 Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit F2 (ATP5J2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA [NM_004889] 95,118414 106,57159 0,8925 0,0163 NM_006442 Homo sapiens DR1-associated protein 1 (negative cofactor 2 alpha) (DRAP1), mRNA [NM_ 006442] 0,4934863 0,55237533 0,8934 0,0253 NM_001004285 Homo sapiens DNA frag- mentation factor, 40 kDa, beta polypeptide (cas- pase-activated DNa- se) (DFFB), transcript variant 3, mRNA [NM_ 001004285] 2,1600583 2,41613417 0,8940 0,0386 NM_004618 Homo sapiens topoiso- merase (DNA) III alpha (TOP3A), mRNA [NM_ 004618] 3,4017 3,8049215 0,8940 0,0265 NM_014506 Homo sapiens torsin family 1, member B (torsin B) (TOR1B), mRNA [NM_ 014506] 33,465703 37,3902508 0,8950 0,0456 NM_024326 Homo sapiens F-box and leucine-rich repeat protein 15 (FBXL15), mRNA [NM_ 024326]

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881,84085 984,374022 0,8958 0,0461 NM_021009 Homo sapiens ubiquitin C (UBC), mRNA [NM_ 021009] 1419,4227 1584,37822 0,8959 0,0351 NM_033059 Homo sapiens keratin associated protein 4-14 (KRTAP4-14), mRNA [NM_033059] 4,6801283 5,21972017 0,8966 0,0446 NM_033540 Homo sapiens mitofusin 1 (MFN1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_033540] 125,83844 140,241905 0,8973 0,0375 NM_032800 Homo sapiens chromosome 1 open reading frame 198 (C1orf198), mRNA [NM_032800] 7,9049993 8,80153633 0,8981 0,0094 THC2312637 moxR3 {Mycobacteri- um smegmatis str. MC2 155;}, partial (3%) [THC 2312637] 0,8067007 0,89788517 0,8984 0,0415 NM_000603 Homo sapiens nitric oxi- de synthase 3 (endothelial cell) (NOS3), mRNA [NM_ 000603] 907,12954 1007,28159 0,9006 0,0323 NM_015710 Homo sapiens glioma tumor suppressor candi- date region gene 2 (GL- TSCR2), mRNA [NM_ 015710] 129,55403 143,447871 0,9031 0,0452 NM_020470 Homo sapiens Yip1 interacting factor homolog A (S. cerevisiae) (YIF1A), mRNA [NM_020470] 15,376423 16,993881 0,9048 0,0383 NM_013342 Homo sapiens TCF3 (E2A) fusion partner (in childhood Leukemia) (TFPT), mRNA [NM_ 013342] 187,57239 207,278048 0,9049 0,0246 NM_015853 Homo sapiens unknown protein LOC51035 (LOC 51035), mRNA [NM_ 015853] 11,701434 12,9262423 0,9052 0,0154 NM_004596 Homo sapiens small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A (SNRPA), mRNA [NM_004596] 944,58212 1041,32494 0,9071 0,0441 NM_053275 Homo sapiens ribosomal protein, large, P0 (RPLP0), transcript variant 2, mRNA [NM_053275] 1,775092 1,95605067 0,9075 0,0358 NM_152289 Homo sapiens zinc finger protein 561 (ZNF561), mRNA [NM_152289]

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1,8558283 2,04362417 0,9081 0,0457 NM_001011713 Homo sapiens N-acetyl- transferase 12 (NAT12), mRNA [NM_001011713] 1,8446353 2,0177575 0,9142 0,0489 THC2302865 FABE_HUMAN (Q01469) Fatty acid-binding protein, epidermal (E-FABP) (Psoriasis-associated fatty acid-binding protein homolog) (PA-FABP), partial (53%) [THC2302865] 2,7092307 2,95087167 0,9181 0,0133 BC024231 Homo sapiens hypothetical protein MGC27345, mRNA (cDNA clone MGC: 27345 IMAGE:4670552), complete cds. [BC024231] 1,34223 1,4616705 0,9183 0,0438 NM_015208 Homo sapiens ankyrin repeat domain 12 (ANKRD 12), mRNA [NM_015208] 85,227872 91,7127122 0,9293 0,0163 NM_007278 Homo sapiens GABA(A) receptor-associated protein (GABARAP), mRNA [NM_007278] 122,41644 131,332476 0,9321 0,0387 NM_007096 Homo sapiens clathrin, light polypeptide (Lca) (CLTA), transcript variant brain-specific, mRNA [NM_007096] 9,7995967 10,4725987 0,9357 0,0409 NM_001035235 Homo sapiens steroid receptor RNA activator 1 (SRA1), mRNA [NM_ 001035235] 3,1628717 3,37680167 0,9366 0,0333 NM_198256 Homo sapiens E2F transcription factor 6 (E2F6), mRNA [NM_198256] 34,960888 32,9857448 1,0599 0,0325 NM_016491 Homo sapiens mitochondrial ribosomal protein L37 (MRPL37), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA [NM_ 016491] 4,044631 3,76024983 1,0756 0,0134 AK074056 Homo sapiens mRNA for FLJ00127 protein. [AK 074056] 6,1135637 5,56243483 1,0991 0,0312 ENST Q8NH99 (Q8NH99) Se- 00000331736 ven transmembrane helix receptor, partial (77%) [THC2437350] 7,7420707 7,02705 1,1018 0,0097 NM_144578 Homo sapiens chromosome 14 open reading frame 32 (C14orf32), mR- NA [NM_144578] 40,006194 36,2530487 1,1035 0,0271 NM_198868 Homo sapiens KIAA0676 protein (KIAA0676), transcript variant 1, mRNA [NM_198868]

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18,890234 17,1134318 1,1038 0,0440 A_24_P493116 Unknown 3,874694 3,5030975 1,1061 0,0253 A_24_P204015 Unknown 1,4853403 1,33920317 1,1091 0,0499 ENST Homo sapiens mRNA full 00000366751 length insert cDNA clone EUROIMAGE 2068962. [AJ420589] 56,195022 50,1249295 1,1211 0,0018 NM_002086 Homo sapiens growth factor receptor-bound protein 2 (GRB2), transcript variant 1, mRNA [NM_ 002086] 10,642292 9,474307 1,1233 0,0100 NM_172020 Homo sapiens POM121 membrane glycoprotein (rat) (POM121), mRNA [NM_172020] 910,37743 810,268002 1,1236 0,0314 NM_002960 Homo sapiens S100 calcium binding protein A3 (S100A3), mRNA [NM_ 002960] 28,386671 25,2584198 1,1238 0,0367 AK021957 Homo sapiens cDNA FLJ 11895 fis, clone HEMBA 1007301, weakly similar to COLLAGEN ALPHA 1(III) CHAIN. [AK021957] 0,9396913 0,83522217 1,1251 0,0450 ENST Homo sapiens cDNA: 00000367942 FLJ21663 fis, clone COL 08885. [AK025316] 3,2230547 2,86250633 1,1260 0,0394 NM_018835 Homo sapiens membrane associated DNA binding protein (MNAB), mRNA [NM_018835] 58,867752 52,2325087 1,1270 0,0377 NM_004630 Homo sapiens splicing factor 1 (SF1), transcript variant 1, mRNA [NM_ 004630] 1681,617 1491,47049 1,1275 0,0415 NM_021009 Homo sapiens ubiquitin C (UBC), mRNA [NM_ 021009] 2,650353 2,34761217 1,1290 0,0188 ENST Homo sapiens, clone 00000270201 IMAGE:4643306, mRNA. [BC041033] 32,707412 28,9274112 1,1307 0,0400 ENST Homo sapiens cDNA: FLJ 00000359495 20958 fis, clone ADSE 02059. [AK024611] 9,0600683 8,00389233 1,1320 0,0416 NM_012319 Homo sapiens solute carrier family 39 (zinc transporter), member 6 (SLC39A6), mRNA [NM_ 012319] 0,8034097 0,70970133 1,1320 0,0224 AY665468 Homo sapiens clone B4- E11 carcinoma associated protein HOJ-1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. [AY665468]

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1,0375053 0,91172483 1,1380 0,0491 AK023732 Homo sapiens cDNA FLJ 13670 fis, clone PLACE 1011725. [AK023732] 1,1418593 1,0023495 1,1392 0,0195 A_24_P670147 Unknown 11,318088 9,92952783 1,1398 0,0040 NM_018981 Homo sapiens DnaJ (Hsp 40) homolog, subfamily C, member 10 (DNAJC10), mRNA [NM_018981] 34,15896 29,7357888 1,1487 0,0247 NM_000181 Homo sapiens glucuroni- dase, beta (GUSB), mR- NA [NM_000181] 2,592443 2,2529915 1,1507 0,0321 AF292100 Homo sapiens RP42 protein mRNA, complete cds. [AF292100] 24,240658 21,0495297 1,1516 0,0028 NM_024098 Homo sapiens coiled- coil domain containing 86 (CCDC86), mRNA [NM_ 024098] 1,1289227 0,97943433 1,1526 0,0074 NM_198457 Homo sapiens zinc finger protein 600 (ZNF600), mRNA [NM_198457] 91,49621 79,3179448 1,1535 0,0210 A_24_P255654 Unknown 742,87434 640,463336 1,1599 0,0458 NM_001614 Homo sapiens actin, gamma 1 (ACTG1), mRNA [NM_001614] 11,091324 9,55534583 1,1607 0,0235 A_24_P213144 Unknown 11,623873 9,92536767 1,1711 0,0407 NM_145175 Homo sapiens family with sequence similarity 84, member A (FAM84A), mRNA [NM_145175] 16,194527 13,8251657 1,1714 0,0303 NM_012426 Homo sapiens splicing factor 3b, subunit 3, 130 kDa (SF3B3), mRNA [NM_012426] 5,020191 4,28121517 1,1726 0,0463 NM_016096 Homo sapiens zinc finger protein 706 (ZNF706), transcript variant 2, mRNA [NM_016096] 3,734752 3,17510917 1,1763 0,0108 NM_005357 Homo sapiens lipase, hormone-sensitive (LIPE), mRNA [NM_005357] 3,8522113 3,26836833 1,1786 0,0384 NM_016436 Homo sapiens PHD finger protein 20 (PHF20), mR- NA [NM_016436] 5,5605837 4,71050133 1,1805 0,0203 NM_177528 Homo sapiens sulfotrans- ferase family, cytoso- lic, 1A, phenolpreferring, member 2 (SULT1A2), transcript variant 2, mRNA [NM_177528]

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6,9327693 5,84500333 1,1861 0,0183 NM_015432 Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family G (with Rho- Gef domain) member 4 (PLEKHG4), mRNA [NM_ 015432] 0,4074237 0,3432685 1,1869 0,0401 A_23_P27460 Unknown 3,6278707 3,051827 1,1888 0,0262 NM_001720 Homo sapiens bone mor- phogenetic protein 8b (osteogenic protein 2) (BMP8B), mRNA [NM_ 001720] 2,1045953 1,763216 1,1936 0,0410 NM_018185 Homo sapiens DCN1, defective in cullin ned- dylation 1, domain containing 2 (S. cerevisiae) (DCUN1D2), transcript variant 1, mRNA [NM_ 018185] 367,69144 307,647261 1,1952 0,0427 THC2337941 Unknown 25,108185 20,9792057 1,1968 0,0279 NM_014633 Homo sapiens Ctr9, Paf1/ RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (CTR9), mRNA [NM_014633] 36,305386 30,3218563 1,1973 0,0178 NM_000181 Homo sapiens glucuroni- dase, beta (GUSB), mR- NA [NM_000181] 2,1676713 1,8065525 1,1999 0,0304 NM_003528 Homo sapiens histone 2, H2be (HIST2H2BE), mR- NA [NM_003528] 2,4019433 1,99835467 1,2020 0,0234 A_32_P201620 Unknown 0,1753343 0,14569817 1,2034 0,0426 NM_004732 Homo sapiens potassi- um voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 3 (KCNAB3), mRNA [NM_ 004732] 4,9323167 4,08201917 1,2083 0,0477 NM_015001 Homo sapiens spen homolog, transcriptional regulator (Drosophila) (SPEN), mRNA [NM_ 015001] 3,8940067 3,21265117 1,2121 0,0012 ENST Unknown 00000305820

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14,169068 11,6842963 1,2127 0,0312 ENST (PREDICTED: Homo sa- 00000354861 piens similar to Hetero- geneous nuclear ribonucleoprotein A1 (Helix-de- stabilizing protein) Sing- le-strand binding protein) (hnRNP core protein A1) (HDP-1) (Topoiso- merase-inhibitor suppres- sed) (LOC120364), mRNA [XM_062025] 1,028731 0,8469895 1,2146 0,0061 NM_013310 Homo sapiens chromosome 2 open reading frame 27 (C2orf27), mRNA [NM_ 013310] 4,902205 4,03576233 1,2147 0,0446 A_24_P324644 Unknown 1,291285 1,05862333 1,2198 0,0157 AK095562 Homo sapiens cDNA FLJ 38243 fis, clone FCBBF 2006882, moderately similar to ZINC FINGER PRO- TEIN 83. [AK095562] 1,7628467 1,44361383 1,2211 0,0165 NM_016518 Homo sapiens pipeco- lic acid oxidase (PIPOX), mRNA [NM_016518] 1,5601243 1,27612617 1,2225 0,0278 NM_001008401 Homo sapiens zinc finger protein 468 (ZNF468), mRNA [NM_001008401] 0,8057247 0,658738 1,2231 0,0232 A_24_P655735 Unknown 0,3532613 0,288304 1,2253 0,0125 NM_153359 Homo sapiens hypothetical protein MGC24975 (MGC24975), mRNA [NM_153359] 7,3416047 5,97469583 1,2288 0,0139 NM_015378 Homo sapiens vacuolar protein sorting 13 homolog D (S. cerevisiae) (VPS 13D), transcript variant 1, mRNA [NM_015378] 1,827586 1,4826025 1,2327 0,0240 NM_145686 Homo sapiens mitogen- activated protein kinase kinase kinase kinase 4 (MAP4K4), transcript variant 2, mRNA [NM_ 145686] 9,2965003 7,531422 1,2344 0,0269 NM_001384 Homo sapiens DPH2 homolog (S. cerevisiae) (DPH2), transcript variant 1, mRNA [NM_001384] 9,517071 7,7094075 1,2345 0,0099 NM_001950 Homo sapiens E2F transcription factor 4, p107/ p130-binding (E2F4), mR- NA [NM_001950] 7,438011 6,02143783 1,2353 0,0423 NM_172020 Homo sapiens POM121 membrane glycoprotein (rat) (POM121), mRNA [NM_172020]

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2,48448 2,00889467 1,2367 0,0305 BC036527 Homo sapiens CTAGE family pseudogene, mRNA (cDNA clone MGC:33437 IMAGE:5270059), complete cds. [BC036527] 10,169864 8,2009205 1,2401 0,0463 NM_004419 Homo sapiens dual spe- cificity phosphatase 5 (DUSP5), mRNA [NM_ 004419] 24,654026 19,8396152 1,2427 0,0220 THC2426662 Q5VZP2 (Q5VZP2) HERV-H LTR-associa- ting 3, partial (21%) [THC 2426662] 0,2009423 0,16102117 1,2479 0,0279 AK023257 Homo sapiens cDNA FLJ 13195 fis, clone NT2RP 3004424, weakly similar to Homo sapiens mRNA for stromal antigen 3 (STAG3 gene). [AK023257] 12,112047 9,6652135 1,2532 0,0029 ENST Homo sapiens mRNA for 00000369911 FLJ00095 protein. [AK 074041] 2,2751193 1,81355083 1,2545 0,0093 NM_014615 Homo sapiens KIAA0182 (KIAA0182), mRNA [NM_ 014615] 8,7873547 6,998681 1,2556 0,0024 NM_001002762 Homo sapiens DnaJ (Hsp 40) homolog, subfamily B, member 12 (DNAJB12), transcript variant 1, mRNA [NM_001002762] 2,735607 2,162516 1,2650 0,0324 AB065089 Homo sapiens OK/KNS- cl.7 mRNA for ribosomal protein S2, complete cds. [AB065089] 0,193822 0,15311433 1,2659 0,0044 ENST Homo sapiens clone 00000379900 B4E9F5H myosin-reac- tive immunoglobulin heavy chain variable region mRNA, partial cds. [AF 035021] 0,3763993 0,29720033 1,2665 0,0339 NM_058191 Homo sapiens chromosome 21 open reading frame 66 5,4841723 4,32871083 1,2669 0,0206 NM_017656 Homo sapiens zinc finger protein 562 0,196163 0,15412667 1,2727 0,0163 NM_000875 Homo sapiens insulin-like growth factor 1 receptor 1,0779823 0,84457867 1,2764 0,0321 AB032983 Homo sapiens mRNA for KIAA1157 protein 68,147226 53,2683797 1,2793 0,0219 A_24_P7380 Unknown 303,48907 236,752359 1,2819 0,0423 NM_181686 Homo sapiens keratin associated protein 12-1 (KRTAP12-1)

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0,247655 0,19309233 1,2826 0,0493 NM_002139 Homo sapiens RNA binding motif protein, X-linked (RBMX) 1,4616557 1,13696417 1,2856 0,0034 NM_006315 Homo sapiens polycomb group ring finger 3 0,526145 0,40807967 1,2893 0,0063 AJ297349 Homo sapiens t(8; 10) (p21.3; q11.2) translocation breakpoint for partial RET/PCM-1 fusion gene 1,550655 1,201992 1,2901 0,0091 THC2283618 Unknown 3,5971823 2,7873115 1,2906 0,0499 BC065041 Homo sapiens phospho- lipase B1, mRNA 0,8455267 0,654687 1,2915 0,0467 NM_014903 Homo sapiens neuron na- vigator 3 0,6527653 0,50499367 1,2926 0,0399 CR749856 Homo sapiens mRNA; cD- NA DKFZp781I1252 0,5809797 0,44944617 1,2927 0,0363 CR599788 full-length cDNA clone CS0DC013YA17 1,33244 1,02971433 1,2940 0,0297 NM_003829 Homo sapiens multiple PDZ domain protein 1378,6013 1064,25102 1,2954 0,0090 NM_002278 Homo sapiens keratin, hair, acidic, 2 (KRTHA2) 0,9107123 0,70299833 1,2955 0,0291 ENST Human tissue plasmino- 00000302932 gen activator mRNA 13,442665 10,3637198 1,2971 0,0369 NM_004284 Homo sapiens chromodo- main helicase DNA binding protein 1-like 0,6143363 0,47201617 1,3015 0,0493 NM_182613 Homo sapiens EP400 N- terminal like 0,7609863 0,58419133 1,3026 0,0131 A_23_P96035 Unknown 0,7150193 0,548033 1,3047 0,0242 NM_174903 Homo sapiens ring finger protein 151 0,2340807 0,17931467 1,3054 0,0324 NM_000965 Homo sapiens retinoic acid receptor, beta (RARB), 0,811124 0,62014133 1,3080 0,0055 NM_015196 Homo sapiens KIAA0922 4,0990513 3,12934417 1,3099 0,0484 NM_001003845 Homo sapiens Sp5 transcription factor 0,759889 0,57876383 1,3130 0,0355 ENST Q9TSM6 (Q9TSM6) pro- 00000308465 tein tyrosine phosphatase 9,823358 7,452162 1,3182 0,0404 ENST Homo sapiens mRNA for 00000355095 KIAA1473 protein 4,1361313 3,13053767 1,3212 0,0387 NM_170606 Homo sapiens myeloid/ lymphoid or mixed-lineage leukemia 3 3,289312 2,48692383 1,3226 0,0254 NM_152601 Homo sapiens zinc finger protein 709 (ZNF709) 3,4713843 2,62192517 1,3240 0,0499 NM_153831 Homo sapiens PTK2 protein tyrosine kinase 2 (PTK2),

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2,832621 2,13783733 1,3250 0,0351 ENST Unknown 00000361429 14,852481 11,1942737 1,3268 0,0371 NM_018943 Homo sapiens tubulin, alpha 8 (TUBA8) 0,6246543 0,47036117 1,3280 0,0349 NM_173539 Homo sapiens zinc finger protein 596 0,5444603 0,40986167 1,3284 0,0063 NM_182492 Homo sapiens low densi- ty lipoprotein receptor-related protein 5-like 2,5750217 1,93437767 1,3312 0,0487 NM_006609 Homo sapiens mitogen- activated protein kinase kinase kinase 2 17,227908 12,9408752 1,3313 0,0044 THC2382871 Unknown 182,48963 137,072948 1,3313 0,0097 A_24_P289884 Unknown 2,259188 1,696177 1,3319 0,0109 A_24_P170283 Unknown 0,3760177 0,2819955 1,3334 0,0092 NM_001004301 Homo sapiens FLJ16542 protein 0,4640563 0,34760333 1,3350 0,0141 ENST Homo sapiens cDNA clo- 00000380295 ne 8,8342 6,6168245 1,3351 0,0136 A_24_P187154 Unknown 1,16418 0,87119683 1,3363 0,0235 NM_199132 Homo sapiens zinc finger protein ZNF468 4,301045 3,19530333 1,3461 0,0329 NM_003536 Homo sapiens histone 1, H3h 1,0215383 0,75873767 1,3464 0,0048 NM_001005386 Homo sapiens ARP2 actin-related protein 2 homolog 0,583826 0,433506 1,3468 0,0388 BE672985 7d26c02.x1 NCI_CGAP_ Pr28 Homo sapiens cD- NA clone IMAGE:3248354 3' similar to TR:O43789 O43789 OLFACTORY RECEPTOR;, 0,580244 0,4283975 1,3545 0,0266 NM_021175 Homo sapiens hepcidin antimicrobial peptide 153,18617 112,988744 1,3558 0,0092 NM_130830 Homo sapiens leucine rich repeat containing 15 13,210691 9,74181883 1,3561 0,0163 NM_002950 Homo sapiens ribophorin (RPN1) 2,3096403 1,69728367 1,3608 0,0443 NM_201400 Homo sapiens family with sequence similarity 86, member A 0,7131043 0,5238335 1,3613 0,0353 NM_004441 Homo sapiens EPH receptor B1 3,6000153 2,64149683 1,3629 0,0149 NM_198284 Homo sapiens hypothetical protein LOC349114 0,5366887 0,39160567 1,3705 0,0287 BG190831 RST9909 Athersys RAGE Library 2,045537 1,487156 1,3755 0,0453 NM_022487 Homo sapiens DNA cross- link repair 1C

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0,213483 0,15519833 1,3755 0,0231 NM_000185 Homo sapiens serpin pep- tidase inhibitor, clade D 0,2300373 0,16644883 1,3820 0,0088 NM_002146 Homo sapiens homeobox B3 (HOXB3) 1,3868207 1,002741 1,3830 0,0061 AK092942 Homo sapiens cDNA FLJ 35623 fis, 11,804657 8,53094167 1,3837 0,0049 A_24_P247576 Unknown 2,174533 1,569467 1,3855 0,0251 A_24_P418176 Unknown 32,707669 23,5531238 1,3887 0,0317 NM_006086 Homo sapiens tubulin, beta 3 (TUBB3) 0,1210903 0,08658117 1,3986 0,0297 AL833303 Homo sapiens mRNA; cD- NA DKFZp451M139 2,091506 1,49128 1,4025 0,0012 AB028979 Homo sapiens mRNA for KIAA1056 protein 0,574951 0,408685 1,4068 0,0061 AK096056 Homo sapiens cDNA FLJ 38737 fis, clone KIDNE 2011200. 0,192541 0,13666083 1,4089 0,0450 BC000200 Homo sapiens, clone IMAGE:3352526 0,2130097 0,150597 1,4144 0,0306 NM_181877 Homo sapiens zinc finger and SCAN domain containing 2 1,2837897 0,8994025 1,4274 0,0048 NM_003799 Homo sapiens RNA (guanine-7-) methyltransferase 0,529991 0,37023733 1,4315 0,0461 AK023691 Homo sapiens cDNA FLJ 13629 fis 0,2495417 0,17357433 1,4377 0,0388 NM_001004298 Homo sapiens chromosome 10 open reading frame 90 3,9958867 2,77375483 1,4406 0,0171 NM_016220 Homo sapiens zinc finger protein 588 (ZNF588) 1,0979637 0,76192817 1,4410 0,0175 NM_013333 Homo sapiens epsin 1 20,520728 14,2195878 1,4431 0,0217 THC2301371 Q864S5 (Q864S5) Pep- tidylprolyl isomerase A 0,893154 0,6163975 1,4490 0,0289 NM_014809 Homo sapiens KIAA0319 0,4110937 0,2833965 1,4506 0,0237 NM_170606 Homo sapiens myeloid/ lymphoid or mixed-lineage leukemia 3 0,5169427 0,354681 1,4575 0,0098 CR603951 full-length cDNA clone CS0DM011YC22 of Fetal liver of Homo sapiens 1,2475963 0,84808683 1,4711 0,0411 NM_018376 Homo sapiens nipsnap homolog 3B (C. elegans) 1,3036637 0,885955 1,4715 0,0193 A_24_P246863 Unknown 0,2728107 0,184473 1,4789 0,0032 A_24_P585660 Unknown 7,6303653 5,13732817 1,4853 0,0154 NM_002098 Homo sapiens guanylate cyclase activator 1B (reti- na)

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1,389023 0,93294067 1,4889 0,0049 NM_016350 Homo sapiens ninein (GSK3B interacting protein) 5,5563713 3,7283175 1,4903 0,0107 A_24_P289984 Unknown 14,666085 9,82951467 1,4920 0,0184 X75962 H. sapiens mRNA for OX 40 homologue 39,763515 26,5083177 1,5000 0,0149 NM_003530 Homo sapiens histone 1, H3d 0,4629763 0,306142 1,5123 0,0158 AF157326 Homo sapiens TIP120 protein 2,5357673 1,6767415 1,5123 0,0077 A_24_P204204 Unknown 42,286873 27,9339342 1,5138 0,0193 ENST PREDICTED: Homo sapi- 00000343756 ens similar to peptidyl-Pro cis trans isomerase 0,8479657 0,552055 1,5360 0,0116 NM_013361 Homo sapiens zinc finger protein 223 5,762487 3,7485665 1,5373 0,0128 THC2268216 NCB2_HUMAN (P80303) Nucleobindin 2 precursor 5,407615 3,50116583 1,5445 0,0182 AK090421 Homo sapiens mRNA for FLJ00330 protein 1,1506497 0,7448215 1,5449 0,0055 BC011595 Homo sapiens glycoprotein (transmembrane) nmb 2,949906 1,89781433 1,5544 0,0269 A_24_P127425 Unknown 11,600163 7,4525025 1,5565 0,0068 NM_002994 Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5 (CXCL5) 0,4837503 0,30943933 1,5633 0,0198 NM_138342 Homo sapiens hypothetical protein BC008326 8,9960633 5,7482425 1,5650 0,0168 NM_005293 Homo sapiens G protein- coupled receptor 20 (GPR 20) 0,643855 0,41100533 1,5665 0,0013 AB082524 Homo sapiens mRNA for KIAA1993 protein 0,5989183 0,37937667 1,5787 0,0053 NM_005931 Homo sapiens MHC class I polypeptide-related sequence B (MICB) 0,3195133 0,201284 1,5874 0,0258 THC2447272 Unknown 0,150627 0,094788 1,5891 0,0024 NM_199077 Homo sapiens cyclin M2 (CNNM2), transcript variant 3, 0,7448133 0,46465883 1,6029 0,0049 A_24_P136155 Unknown 38,258105 23,5050825 1,6277 0,0098 A_24_P418106 Unknown 0,4936807 0,29994367 1,6459 0,0013 NM_013362 Homo sapiens zinc finger protein 225 (ZNF225) 0,1646773 0,09975567 1,6508 0,0132 ENST Homo sapiens zinc finger 00000339986 protein SBZF3 mRNA, 0,2486767 0,14899517 1,6690 0,6256 NM_147777 Homo sapiens sorting nexin 15 (SNX15), transcript variant B

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1,421853 0,80959867 1,7562 0,0012 NM_130830 Homo sapiens leucine rich repeat containing 15 (LRRC15) 35,259457 19,9687158 1,7657 0,0002 AK130207 Homo sapiens cDNA FLJ 26697 fis, clone PCD 00618 0,6598523 0,36207017 1,8224 0,0005 BC047014 Homo sapiens, clone IMAGE:5197279 0,1564783 0,07190417 2,1762 0,0010 NM_032303 Homo sapiens hydroxys- teroid dehydrogenase like 2

Anhang 2: Gene mit besonderer Relevanz im Kontext chronischen Stress.

Chronisch Nicht-chro- Quotient Signifiknaz Systematischer Beschreibung gestresst nisch ge- (ttest) Name stresst 0,07 0,13 0,58 0,02 NM_006546 Homo sapiens insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (IGF2BP1), mRNA [NM_006546] 0,27 0,41 0,65 0,04 NM_006180 Homo sapiens neurotro- phic tyrosine kinase, receptor, type 2 (NTRK2), transcript variant a, mRNA [NM_006180] 6,03 9,24 0,65 0,04 NM_004585 Homo sapiens retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 3 (RARRES3), mRNA [NM_ 004585] 0,42 0,64 0,66 0,01 AY945262 Homo sapiens mucin (MUC8) mRNA, complete cds. [AY945262] 0,15 0,23 0,66 0,00 NM_138564 Homo sapiens kallikrein 15 (KLK15), transcript variant 3, mRNA [NM_ 138564] 0,18 0,27 0,67 0,04 NM_053049 Homo sapiens urocortin 3 (stresscopin) (UCN3), mRNA [NM_053049] 0,14 0,21 0,68 0,04 NM_003396 Homo sapiens wingless- type MMTV integration site family, member 9B (WNT9B), mRNA [NM_ 003396] 0,76 1,05 0,72 0,02 NM_145200 Homo sapiens calcium binding protein 4 (CABP4), mRNA [NM_ 145200] 0,64 0,89 0,72 0,01 NM_002272 Homo sapiens keratin 4 (KRT4), mRNA [NM_ 002272]

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1,19 1,61 0,73 0,02 NM_000043 Homo sapiens Fas (TNF receptor superfamily, member 6) (FAS), transcript variant 1, mRNA [NM_000043] 78,01 106,14 0,73 0,01 NM_000142 Homo sapiens fibrob- last growth factor receptor 3 (FGFR3), transcript variant 1, mRNA [NM_ 000142] 0,45 0,60 0,74 0,04 NM_005551 Homo sapiens kallikrein 2, prostatic (KLK2), transcript variant 1, mRNA [NM_005551] 0,37 0,49 0,76 0,00 X97675 H. sapiens mRNA for plakophilin 2a and b. [X97675] 64,79 84,68 0,77 0,01 NM_003153 Homo sapiens signal transducer and activator of transcription 6, interleukin-4 induced (STAT6), mRNA [NM_003153] 5,02 6,55 0,77 0,04 NM_004380 Homo sapiens CREB binding protein (Rubin- stein-Taybi syndrome) (CREBBP), mRNA [NM_ 004380] 1556,85 1962,50 0,79 0,01 NM_030967 Homo sapiens keratin associated protein 1-1 (KRTAP1-1), mRNA [NM_ 030967] 35,64 44,78 0,80 0,02 NM_052850 Homo sapiens growth ar- rest and DNA-damage- inducible, gamma interacting protein 1 (GADD 45GIP1), mRNA [NM_ 052850] 0,20 0,26 0,80 0,01 NM_016362 Homo sapiens ghrelin/ obestatin preprohormo- ne (GHRL), mRNA [NM_ 016362] 12,32 14,94 0,82 0,01 NM_002093 Homo sapiens glycogen synthase kinase 3 beta (GSK3B), mRNA [NM_ 002093] 24,86 30,03 0,83 0,03 NM_002634 Homo sapiens prohibitin (PHB), mRNA [NM_ 002634] 12,17 14,31 0,85 0,00 NM_005631 Homo sapiens smoothe- ned homolog (Drosophi- la) (SMO), mRNA [NM_ 005631]

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757,70 884,81 0,86 0,03 NM_033062 Homo sapiens keratin associated protein 4-2 (KRTAP4-2), mRNA [NM_ 033062] 1904,29 2187,42 0,87 0,03 NM_033060 Homo sapiens keratin associated protein 4-10 (KRTAP4-10), mRNA [NM_033060] 5,14 5,87 0,88 0,04 ENST0000037 Homo sapiens ornithine 9534 transporter (ORNT1) mR- NA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. [AF112968] 98,88 111,78 0,88 0,02 NM_000939 Homo sapiens proopiome- lanocortin (adrenocorti- cotropin/beta-lipotropin/ alpha-melanocyte stimulating hormone/beta-melanocyte stimulating hormone/beta-endorphin) (POMC) 1,59 1,79 0,89 0,05 NM_183013 Homo sapiens cAMP responsive element modu- lator (CREM), transcript variant 19, mRNA [NM_ 183013] 1419,42 1584,38 0,90 0,04 NM_033059 Homo sapiens keratin associated protein 4-14 (KRTAP4-14), mRNA [NM_033059] 0,81 0,90 0,90 0,04 NM_000603 Homo sapiens nitric oxi- de synthase 3 (endothelial cell) (NOS3), mRNA [NM_ 000603] 910,38 810,27 1,12 0,03 NM_002960 Homo sapiens S100 calcium binding protein A3 (S100A3), mRNA [NM_ 002960] 3,63 3,05 1,19 0,03 NM_001720 Homo sapiens bone mor- phogenetic protein 8b (osteogenic protein 2) (BMP8B), mRNA [NM_ 001720] 0,20 0,15 1,27 0,02 NM_000875 Homo sapiens insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R), mRNA [NM_ 000875] 303,49 236,75 1,28 0,04 NM_181686 Homo sapiens keratin associated protein 12- 1 (KRTAP12-1), mRNA [NM_181686] 0,85 0,65 1,29 0,05 NM_014903 Homo sapiens neuron na- vigator 3 (NAV3), mRNA [NM_014903]

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1378,60 1064,25 1,30 0,01 NM_002278 Homo sapiens keratin, hair, acidic, 2 (KRTHA2), mRNA [NM_002278] 0,91 0,70 1,30 0,03 ENST0000030 Human tissue plasmino- 2932 gen activator mRNA, partial cds. [U63828] 3,47 2,62 1,32 0,05 NM_153831 Homo sapiens PTK2 protein tyrosine kinase 2 (PTK2), transcript variant 1, mRNA [NM_153831] 2,58 1,93 1,33 0,05 NM_006609 Homo sapiens mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2 (MAP3K2), mRNA [NM_ 006609] 0,21 0,16 1,38 0,02 NM_000185 Homo sapiens serpin pep- tidase inhibitor, clade D (heparin cofactor), member 1 (SERPIND1), mRNA [NM_000185] 11,60 7,45 1,56 0,01 NM_002994 Homo sapiens chemokine (C-X-C motif) ligand 5 (CXCL5), mRNA [NM_ 002994]

[0097] Abb. 1: Anstieg des Speichelcortisols beim Stresstest (TSST), Unterteilung in 3 Gruppen, High-Re- sponder (hoher Anstieg), Responder (mittlerer Anstieg) und Non-Responder (geringer, kein oder negativer Anstieg)

[0098] Abb. 2: Entwicklung der Herzrate vor, während und nach dem Stresstest TSST bei den unterschiedlichen Respondergruppen

[0099] Abb. 3: Ausprägung auf den TICS Skalen in den drei Respondergruppen – jeweils linke Säule „High Responder”, mittlere Säule „Responder”, rechte Säule „Non-Responder”.

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ZITATE ENTHALTEN IN DER BESCHREIBUNG

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Zitierte Patentliteratur

- DE 102005011957 [0015, 0021, 0086] - EP 1859272 [0015, 0021, 0086] - EP 1112077 [0015] - US 6013445 A [0040]

Zitierte Nicht-Patentliteratur

- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db= - TSST, Kirschbaum, Pirke & Hellhammer, nuccore [0026] Neuropsychobiology, 28, S. 76–81, 1993) - Akhilesh Pandey und Matthias Mann: „Pro- [0079] teomics to study genes and genomes”, Na- - Weitzman et al., 1971 [0080] ture, Volume 405, Number 6788, 837–846 - Kirschbaum et al., Psychosomatic Medicine, (2000) [0040] 57, S. 468–474, 1995 [0080] - „Genomics, gene expression and DNA arrays”, Nature, Volume 405, Number 6788, 827–836 (2000) [0040] - ”J. Gregor Sutcliffe et al, TOGA: An automated parsing technology for analyzing expression of nearly all genes, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), Vol. 97, No. 5, pp. 1976–1981 (2000)” [0040] - Akhilesh Pandey und Matthias Mann: „Pro- teomics to study genes and genomes”, Na- ture, Volume 405, Number 6788, 837–846 (2000) [0046] - L. D. Adams, Two-dimensional Gel Electro- phoresis using the Isodalt System [0047] - L. D. Adams & S. R. Gallagher, Two-dimensional Gel Electrophoresis using the O'Farrell System; beide in Current Protocols in Molecu- lar Biology (1997, Eds. F. M. Ausubel et al.), Unit 10.3.1–10.4.13 [0047] - 2-D Electrophoresis-Manual; T. Berkelman, T. Senstedt; Amersham Pharmacia Biotech, 1998 (Bestell-Nr. 80-6429-60 [0047] - Methods in Molecular Biology, 1999; Vol 112 [0048] - 2-D Proteome Analysis Protocols; Editor: A. J. Link; Humana Press; Totowa; New Jersey. Darin insbesondere: Courchesne, P. L. und Patterson, S. D.; S. 487–512 [0048] - Carr, S. A. und Annan, R. S.; 1997; in: Cur- rent Protocols in Molecular Biology; Editor: Ausubel, F. M. et al.; John Wiley and Sons, Inc. 10.2.1–10.21.27 [0049] - TICS, Trierer Inventar zum chronischen Stress, Autoren: Schulz, Schlotz, & Becker, 1. Auflage, 2004, erschienen beim Hogrefe Ver- lag, Göttingen [0078]

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Patentansprüche

1. Verfahren zur Diagnose von chronischem Stress bei einem Lebewesen, bevorzugt einem Säugetier oder Menschen, das die folgenden Schritte umfasst: a) Bereitstellung einer Probe aus einem oder mehreren Haarfollikeln eines Lebewesens, bevorzugt einem Säugetier, insbesondere einem Menschen, b) Bestimmung der Expression mindestens eines Markers für chronischen Stress ausgewählt aus der Liste gemäß Anhang 1, c) ggf. Bestimmung der Expression und/oder Konzentration eines oder mehrerer weiterer Marker für Stress, insbesondere chronischen Stress, in der gleichen oder einer weiteren Probe d) Korrelieren der Ergebnisse aus b) und ggf. c) mit der Diagnose von Stress, insbesondere chronischem Stress.

2. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt a) die Probe, durch die Anwendung einer nicht-invasiven Methode gewonnen wurde.

3. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, dass die Bereitstellung der Probe aus einem oder mehreren Haarfollikeln aus 2 bis 50 Haarfollikeln, bevorzugt 3 bis 25, besonders bevorzugt 4 bis 20, ganz besonders bevorzugt 5 bis 15 Haarfollikeln erfolgt.

4. Verfahren nach Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt a) die Haarfollikel gezupfte Haar- follikel, bevorzugt aus dem Kopfhaar, sind.

5. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt a) die Probe von der Hautoberfläche stammt.

6. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 5, dadurch gekennzeichnet, dass die Bereitstellung einer Pro- be, enthaltend genetisches Material von einem Lebewesen, durch Anwendung des Tape-Stripping Verfahrens (d. h. Aufbringung eines Klebestreifens auf die Haut und anschließendem Abziehen des Klebestreifens von der Haut) erfolgt.

7. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 6, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt b) die Gen- und/ oder Proteinexpression mindestens eines Markers für chronischen Stress bestimmt wird.

8. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 7, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt b) mindestens eines Markers für chronischen Stress ausgewählt ist aus der Liste gemäß Anhang 2.

9. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 8, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt b) der Marker ausgewählt aus: • Urocortin • POMC • tPA • ghrelin • FGFR3 • Mucin • CXCL 6 • Prohibitin • Reinsäure-Rezeptor-Responder (RARRES3) • MAP3Kinase2 • Keratin 4 • Keratin assozieirte Proteine, insbesondere KAP 1-1, 4-2, 4-10 und • Plakophilin 2

10. Verfahren nach Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt b) der Marker ausgewählt aus: • CXCL 6 • Prohibitin • Reinsäure-Rezeptor-Responder (RARRES3) • MAP3Kinase2 • Keratin 4 • Keratin assozieirte Proteinen, insbesondere KAP 1-1, 4-2, 4-10 und

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• Plakophilin 2

11. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 10, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt c) in der gleichen Probe die Expression eines, zweier oder mehr weiteren Marker, bevorzugt ebenfalls ausgewählt aus der Liste gemäß Anhang 1, bestimmt wird.

12. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 11, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt c) in der gleichen Probe die Expression eines, zweier oder mehr weiteren Marker, bevorzugt ebenfalls ausgewählt aus der Liste gemäß Anhang 2, bestimmt wird.

13. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 12, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt c) die Expression eines, zweier oder mehr weiteren Markers ausgewählt aus • Urocortin (Uniprot-/Swissprot-Nr. UCN, P55089) • POMC (Uniprot-/Swissprot-Nr. Pro-opiomelanocortin, P01189) • tPA (Uniprot-/Swissprot-Nr. Q6LBF5) • GHRL (Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9UBU3) • FGFR3 (Uniprot-/Swissprot-Nr. P22607) • Mucin8 (Uniprot-/Swissprot-Nr. Q12964) • CXCL 5 (C-X-C motif chemokine 5, Uniprot-/Swissprot-Nr. P42830) • Prohibitin (PHB, Uniprot-/Swissprot-Nr. P35232) • Reinsäure-Rezeptor-Responder ((RARRES3, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9UL19) • MAP3Kinase2 (MEKK2 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2, Uniprot.-Nr. Q9Y2U5) • Keratin 4 (Uniprot-/Swissprot-Nr. P19013) • Keratin assoziierte Proteine (bevorzugt KAP 1-1 (KRTAP1-1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07627), 4-2 (KRTAP4- 2, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYR5), KAP 4-10 (KRTAP4-10, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYQ7)) und • Plakophilin 2 (PKP2, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q99959) bestimmt wird.

14. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 13, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt b) und/oder c) die Gen- und/oder Proteinexpression mindestens eines Markers für psychoemotionalen Stress bestimmt wird, welcher ausgewählt ist aus den folgenden Marker tumor rejection antigen (gp96) 1 (TRA1, Uniprot-/ Swissprot-Nr. Q5CAQ5), fatty acid binding protein (FABP5, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q01469), Moesin (MSN, Uniprot-/Swissprot-Nr. P26038), Haarkeratin Typ I (Ha1, Keratin-31,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q15323), Enolase 1 (alpha-Enolase, Uniprot-/Swissprot-Nr. P06733), Trichohyalin (TCHH, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07283), mindestens einem Type II Keratin, beta-Actin (ACTB, actin cytoplamic 1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P60709), Glut- amatdehydrogenase 1 (GLUD1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P00367), basischem Haarkeratin 1 (hHb1) (KRT81,_ Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5), Peptidylprolyl cis-trans isomerase A (PPIA, Uniprot-/Swissprot-Nr. P62937) und Keratin 6 (irs) (KRT71, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q3SY84).

15. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 14 dadurch gekennzeichnet, dass die Bestimmung in Schritt b) und/oder c) mittels Proteinanalyse erfolgt.

16. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 14 dadurch gekennzeichnet, dass die Bestimmung in Schritt b) und/oder c) mittels Nukleinsäureanalyse erfolgt.

17. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 16, dadurch gekennzeichnet, dass die Bestimmung in Schritt b) mittels einer Expressionsanalyse auf einem Microarray erfolgt.

18. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 17, dadurch gekennzeichnet, dass die Bestimmung in Schritt c) mittels einer Expressionsanalyse auf einem Microarray erfolgt.

19. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 18, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt c) in einer Speichelprobe des gleichen Individuums der Cortisolgehalt bestimmt wird.

20. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 19, dadurch gekennzeichnet, dass in Schritt b) nicht der Marker Cortisol bestimmt wird.

21. Verwendung mindestens eines Gens, welches die Haarstruktur betrifft, als Markermolekül bei der Dia- gnose von chronischem Stress.

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22. Verwendung nach Anspruch 21, dadurch gekennzeichnet, dass das Gen/Protein, welches die Haar- struktur betrifft, ausgewählt ist aus Keratin 4 (Uniprot-/Swissprot-Nr. P19013), Keratin assoziierten Prote- inen (bevorzugt KAP 1-1 (KRTAP1-1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07627), 4-2 (KRTAP4-2, Uniprot-/Swissprot- Nr. Q9BYR5), KAP 4-10 (KRTAP4-10, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9BYQ7)) und Plakophilin2 (PKP2, Uniprot-/ Swissprot-Nr. Q99959).

23. Verwendung des CXCL 5 (C-X-C motif chemokine 5, Uniprot-/Swissprot-Nr. P42830) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

24. Verwendung des Prohibitin (PHB, Uniprot-/Swissprot-Nr. P35232) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

25. Verwendung des Retinsäure-Rezeptor-Responder 3 (RARRES3, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q9UL19) als Markermolekül bei der Diagnose von chronischem Stress.

26. Verwendung von MAP3Kinase2 (MAP3K2, MEKK2 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2, Uniprot.-Nr. Q9Y2U5) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere chronischem Stress.

27. Verwendung von tumor rejection antigen (gp96) 1 (TRA1, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5) als Marker- molekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

28. Verwendung von fatty acid binding protein (FABP5, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q01469) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

29. Verwendung von Moesin (MSN, Uniprot-/Swissprot-Nr. P26038) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

30. Verwendung von Enolase 1 (alpha-Enolase, Uniprot-/Swissprot-Nr. P06733) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

31. Verwendung von Trichohyalin (TCHH, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q07283) als Markermolekül bei der Dia- gnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

32. Verwendung von Haarkeratin Typ I (Ha1, Keratin-31,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q15323) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

33. Verwendung von beta-Actin (ACTB, actin cytoplamic 1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P60709) als Markermo- lekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

34. Verwendung von mindestens einem Type II Keratin als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

35. Verwendung der Glutamatdehydrogenase 1 (GLUD1, Uniprot-/Swissprot-Nr. P00367) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

36. Verwendung von basischem Haarkeratin 1 (hHb1) (KRT81,_Uniprot-/Swissprot-Nr. Q5CAQ5) als Mar- kermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

37. Verwendung von Peptidylprolyl cis-trans isomerase A (PPIA, Uniprot-/Swissprot-Nr. P62937) als Mar- kermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

38. Verwendung von Keratin 6 (irs) (KRT71, Uniprot-/Swissprot-Nr. Q3SY84) als Markermolekül bei der Diagnose von Stress, insbesondere psychoemotionalem Stress.

Es folgen 3 Blatt Zeichnungen

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Anhängende Zeichnungen

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