Service Systèmes D'information, Identification & Traçabilité Animale
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Revisiting AFLP Fingerprinting for an Unbiased Assessment of Genetic
Utsunomiya et al. BMC Genetics 2014, 15:47 http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/47 RESEARCH ARTICLE Open Access Revisiting AFLP fingerprinting for an unbiased assessment of genetic structure and differentiation of taurine and zebu cattle Yuri Tani Utsunomiya1†, Lorenzo Bomba2†, Giordana Lucente2, Licia Colli2,3, Riccardo Negrini2, Johannes Arjen Lenstra4, Georg Erhardt5, José Fernando Garcia1,6, Paolo Ajmone-Marsan2,3* and European Cattle Genetic Diversity Consortium Abstract Background: Descendants from the extinct aurochs (Bos primigenius), taurine (Bos taurus) and zebu cattle (Bos indicus) were domesticated 10,000 years ago in Southwestern and Southern Asia, respectively, and colonized the world undergoing complex events of admixture and selection. Molecular data, in particular genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) markers, can complement historic and archaeological records to elucidate these past events. However, SNP ascertainment in cattle has been optimized for taurine breeds, imposing limitations to the study of diversity in zebu cattle. As amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers are discovered and genotyped as the samples are assayed, this type of marker is free of ascertainment bias. In order to obtain unbiased assessments of genetic differentiation and structure in taurine and zebu cattle, we analyzed a dataset of 135 AFLP markers in 1,593 samples from 13 zebu and 58 taurine breeds, representing nine continental areas. Results: We found a geographical pattern of expected heterozygosity in European taurine breeds decreasing with the distance from the domestication centre, arguing against a large-scale introgression from European or African aurochs. Zebu cattle were found to be at least as diverse as taurine cattle. -
Guide Visiteur Professionnel Professional Visitor’S Guide
22 FÉVRIER > 01 MARS PARIS EXPO PORTE DE VERSAILLES Les conseils précieux des experts Cerfrance ont porté leurs fruits. GUIDE VISITEUR PROFESSIONNEL PROFESSIONAL VISITOR’S GUIDE Idéale, 6 ans Charolaise 700 agences partout en France ! #SIAPRO Retrouvez l’agence la plus proche de chez vous sur Cerfrance.fr www.salon-agriculture.com ELEVAGE Chaque année, le Salon International de l’Agriculture a à coeur de proposer aux professionnels des secteurs agricole et agroalimentaire une expérience #SIAPRO inoubliable. FOURNISSEUR OFFICIEL HALL 1 Détenteur de l’e-badge professionnel ? de bien-être pour les animaux STAND R017 Le Salon vous a réservé des avantages premium : • Une entrée coupe-file en Porte V pour éviter l’attente • Un vestiaire gratuit (situé à proximité du Club d’Affaires International - Pavillon 1) pour un meilleur confort de visite • Des places réservées dans les tribunes du Ring de Présentation et du Grand Ring pour profiter pleinement des présentations et des concours de toutes les races bovines du Concours Général Agricole des Animaux. Every year, the Paris International Agricultural Show does everything it can to provide professionals from the agricultural and agro-food sectors with an unforgettable #SIAPRO experience. Do you have a professional e-badge? Then you can enjoy premium benefits at the Show: Idéale, 6 ans, • Direct admission at Gate V so you don’t have to queue • A free cloakroom (located by the International Business Club – Hall 1) so you can be parce que rien n’est trop beau Charolaise more comfortable while you visit the Show pour l’égérie ! • Reserved seating in the Presentation Ring and Main Ring grandstands so you can fully enjoy the cattle presentations and competitions that feature in the « Concours Général Agricole ». -
De Variabilité Génétique
Managing rare local breeds: approach of the diversity of set ups. Anne Lauvie To cite this version: Anne Lauvie. Managing rare local breeds: approach of the diversity of set ups.. Life Sciences [q-bio]. AgroParisTech, 2007. English. NNT : 2007AGPT0017. pastel-00003464 HAL Id: pastel-00003464 https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00003464 Submitted on 28 Feb 2008 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. Institut des sciences et industries du vivant et de l’environnement Institut National de la Recherche Agronomique UFR Génétique, Elevage et Reproduction UMR Agrosystèmes et Dévnt territorial UMR Génétique et Diversité Animales Thèse Pour obtenir le grade de DOCTEUR D’AGROPARISTECH Discipline : Gestion des ressources génétiques animales présentée et soutenue publiquement par Anne Lauvie le 15 juin 2007 Gérer les populations animales locales à petits effectifs : Approche de la diversité des dispositifs mis en oeuvre Directeurs de thèse : Annick AUDIOT et Etienne VERRIER Jury Roland DARRE Professeur, ENV Toulouse Rapporteur Bernard HUBERT -
Consulter La Revue De Presse
Elle sera une des reines du Salon de l'agriculture Ouest-France 24 Février Benjamin Henry et la gentille « Impatiente » avant le départ de cette dernière pour la capitale. | Samedi, à Paris, la plus grande ferme du monde ouvre ses portes pour une semaine. Tête d'affiche, la race Bretonne pie noir, dont Impatiente sera l'ambassadrice. Sous l'égide de l'Union bretonne pie noir, une sélection de dix vaches a été effectuée auprès des éleveurs de la race emblématique de Bretagne, la pie noir, plus petite vache laitière de France. Parmi les éleveurs, le tout jeune Gaec (groupement agricole d'exploitation en commun) Le Buis sonnant, de Kerléo, a été choisi, à la grande joie de ses associés, Pierre-Yves Le Panse, Marion et Benjamin Henry. À l'issue de la visite des techniciens de l'Union bretonne pie noir, leur vache, Impatiente, a été sélectionnée. Moins d'1 m 20 au garrot, Impatiente correspond aux standards de la race. « De plus, elle est gentille, calme et gourmande. On pense qu'elle ne devrait pas poser de problèmes lors des défilés », précise Benjamin. La race pie noir désormais sauvée « Les dix vaches sélectionnées participeront à un concours mais, pour le Gaec le Buis Sonnant, c'est avant tout la promotion de la race qui compte », poursuit Benjamin Henry. « Nous n'y allons certainement pas pour gagner un prix ! » Le départ d'Impatiente s'est fait ce jeudi 24 février, de la gare de Gouarec, avec deux autres vaches. De leur côté, les associés vont se relayer au salon pendant six jours, à partir de samedi. -
Tables De Référence Du SIIA
Système d’Information de Référence IE/SIIB/GA/009 l’Identification Animale Version 8.7 Date de rédaction 06/05/2019 Catégorie Document Rédacteur(s) G BLERIOT Source Tables de référence SIIB v87.doc Système d'Information de l'Identification Animale TABLES DE REFERENCE DESCRIPTION Ce document a été élaboré avec le soutien financier du ministère de l’Agriculture Tables de référence Version 8.7 du 06/05/2019 Description Page 1 sur 49 Système d’Information de Référence IE/SIIB/GA/009 l’Identification Animale Version 8.7 Date de rédaction 06/05/2019 Catégorie Document Rédacteur(s) G BLERIOT Source Tables de référence SIIB v87.doc N° de version Date Modifications 0.2 à 0.4 06/04/1999 au Document préparatoire 20/05/1999 1.0 27/09/1999 Nouvelle version intégrant les mises à jour des différents documents de référence 2.0 05/11/2001 Version validée 3.0 04/12/2002 Version validée 4.0 19/03/2003 Version validée 4.1 24/06/2003 Modifications en lien avec la version BDNI 1.08 Validée le 20/08/2003 4.4 18/02/2004 Précisions sur la cause de mouvement « X » Validée le 03/03/2004 4.7 15/09/2004 Validée le 15/09/2004 4.8 à 4.82 15/11/2004 au Modifications en lien avec la version BDNI 1.09 09/02/2005 4.9 07/03/2005 Validée le 07/03/2005 4.91 et 4.92 03/08/2005 Modifications 5.0 26/09/2005 Validée 5.1 17/01/2006 Modifications en lien avec la version BDNI 2.00, validée le 24/03/2006 5.2 10/04/2006 Migration E.D.E. -
On the Breeds of Cattle—Historic and Current Classifications
Diversity 2011, 3, 660-692; doi:10.3390/d3040660 OPEN ACCESS diversity ISSN 1424-2818 www.mdpi.com/journal/diversity Review On the Breeds of Cattle—Historic and Current Classifications Marleen Felius 1, Peter A. Koolmees 2, Bert Theunissen 2, European Cattle Genetic Diversity Consortium † and Johannes A. Lenstra 2,* 1 Mauritsstraat 167, Rotterdam 3012 CH, The Netherlands; E-Mail: [email protected] 2 Utrecht University, Yalelaan 2, Utrecht 3584 CM, The Netherlands; E-Mails: [email protected] (P.A.K.); [email protected] (B.T.) † The following members of the European Cattle Genetic Diversity Consortium contributed to the study: Austria: R. Baumung, S. Manatrinon, BOKU University, Vienna; Belgium: G. Mommens, University of Ghent, Merelbeke; Denmark: L.-E. Holm, Aarhus University, Tjele; K.B. Withen, B.V. Pedersen, P. Gravlund, University of Copenhagen, Copenhagen; Estonia: H. Viinalass, Estonian University of Life Sciences, Tartu; Finland: J. Kantanen, I. Tapio, M.H. Li, MTT, Jokioinen; France: K. Moazami-Goudarzi, M. Gautier, Denis Laloë, INRA, Jouy-en-Josas; A. Oulmouden, H. Levéziel, INRA, Limoges; P. Taberlet, Université Joseph Fourier et CNRS, Grenoble; Germany: B. Harlizius, School of Veterinary Medicine, Hannover; H. Simianer, H. Täubert, Georg-August-Universität, Göttingen; G. Erhardt, O. Jann, C. Weimann, E.-M. Prinzenberg, Justus-Liebig Universität, Giessen; I. Medugorac, A. Medugorac, M. Förster, Ludwig-Maximilians Universität, Munich; H.M. Mix, Naturschutz International, Grünheide; C. Looft, E. Kalm, Christian-Albrechts-Universität, Kiel; Ireland: D.G. Bradley, C.J. Edwards, D.E. MacHugh, A.R. Freeman, Trinity College, Dublin; Italy: P. Ajmone Marsan, R. Negrini, Università Cattolica del S. -
Petit Journal Des Races Locales 1.Pdf
Petit journal des races locales Bulletin d’informations de l’Institut de l’Élevage N° 1 - octobre 2 013 partenaires du projet ont analysées depuis le participants ont bravé le froid pour visiter des Temps forts des races printemps. Au final, des journées riches, élevages (Porcs Gascons, moutons Barègeois, Séminaire VARAPE à Vendôme les 12 et conviviales et ludiques car centrées sur une poules Gasconnes, chèvres des Pyrénées) ainsi 13 décembre 2012 et Lourdes les 23 et « pédagogie participative » appréciée. Cerise sur que la Coopérative des Gaves (transformation de 24 mai 2013 le gâteau, Pierre Parguel a marqué les esprits par viande multi-espèces). Deux sessions de travail une intervention sur les différentes possibilités avec les partenaires du projet et une soirée de démarcation des produits issus des races à d’échanges avec les acteurs locaux favorisant la Maraichine, Mirandaise, Grise du Vercors, Thônes petits effectifs et renversé plusieurs certitudes. valorisation des races ont complété ce riche et Marthod, Cul Noir du Limousin… voici programme. quelques-unes des races que le projet Varape suit Ce séminaire sera suivi de plusieurs temps forts depuis un an. Varape est un projet Casdar régionaux : le premier a eu lieu les 23 et 24 mai Prochain rendez-vous : les 20 et 21 novembre en coordonné par l’Institut de l’Élevage (Lucie dans les Pyrénées, autour de Lourdes. Les Bretagne ! Markey et Christèle Couzy) dans lequel l’INRA, Trame, le Coram sont impliqués, en plus de l’IFIP et l’Itavi, jusque fin 2014. Le sigle signifie « Valorisation des Races à Petits Effectifs via les circuits courts », plutôt qu’escalade… Néanmoins, il nous amène vers des passages escarpés. -
(01) Verrier Et Al EAAP 2018
EAAP annualEtude meeting, races Dubrovnik, menacées August 27-31, 2018 Specific products with added value for local breeds: lessons from success and non-success stories Etienne Verrier (1) Lucie Markey (2) Anne Lauvie (3) © E. Verrier (1) GABI, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, France (2) Institut de l’Elevage, France (3) SELMET, INRA, CIRAD, SupAgro Montpellier, France Local breeds Definition by the French Code Rural : A breed mainly linked to a given territory (by its origins, its geographical distribution and its farming system) A local breed may be rare… or not! © J.C. Periquet © OS Lacaune Houdan chicken breed Lacaune dairy sheep breed 80 hens 900,000 ewes E. Verrier, L. Markey, A. Lauvie, EAAP meeting, Dubrovnik, August 27-31, 2018 Preservation or development of local breeds: Main factors Motivated farmers/breeders © Union Bretonne Pie Noir © cancoillotte.net Products with Other services added value © E. Verrier Specific environment (adaptation) E. Verrier, L. Markey, A. Lauvie, EAAP meeting, Dubrovnik, August 27-31, 2018 Content 1. Large diversity of initiatives 2. Need for a market and supply-demand adequacy 3. Maintaining a close control by farmers 4. Cohesion between the different actors 5. Name and image issues 6. Conclusion E. Verrier, L. Markey, A. Lauvie, EAAP meeting, Dubrovnik, August 27-31, 2018 1. Large diversity of initiatives Abondance Tarentaise Collective initiatives Official designations of origin or quality © IGN Salers Aubrac Lacaune Rouge des Prés E. Verrier, L. Markey, A. Lauvie, EAAP meeting, Dubrovnik, August 27-31, 2018 1. Large diversity of initiatives Trade mark Géline Coucou Abondance Tarentaise de Touraine de Rennes Collective initiatives Official designations of origin or quality © IGN Salers Aubrac Lacaune Rouge des Prés E. -
Notice D'accompagnement Extraction Du 23 Janvier 2014
Fichiers des taureaux déclarés à la Monte Publique Notice d’accompagnement Extraction du 23 janvier 2014 Le fichier taureaux20140123.txt est un fichier téléchargeable librement qui contient les données des déclarations initiales des taureaux susceptibles d’être utilisés pour l’insémination animale publique. C’est un fichier de format CSV contenant les colonnes suivantes : Nom colonne Type Présence CodePays Texte O NumeroNationalAnimal Texte O Nom Texte F DateNaissance Date O CodeRaceBovin Texte O Sexe Texte O NumeroIETaureau Texte O EntrepriseSelectionDeclarante Texte F TypeDeclarationInitiale Texte O ValiditeDeclarationInitiale Texte O DateDebut Date O DateFin Date F TypeProgrammeAgrement Texte F Chaque ligne se termine par un « ; ». La 1ère ligne contient les en-têtes des colonnes qui correspondent aux noms des balises correspondantes dans le message EDEL. Attention, de nombreuses données de type texte ne contiennent que des chiffres, mais les zéros à gauche étant signifiants, il faut absolument les traiter comme des données de type texte. Attention, jusqu’en 1975, le même « NumeroIETaureau » pouvait être attribué à plusieurs taureaux dés lors qu’ils étaient de race différente Il y a ainsi 1495 doublons sur ce numéro pour des « DateDebut » dont la plus récente est le 15/04/1975. Le fichier contient les dossiers des taureaux répondant aux critères suivants : Ayant une déclaration pour la monte publique valide ET Déclarés à la mise à l’épreuve sur descendance jusqu’au 31/12/2006 et n’ayant pas été : o REFUSES en commission d’agrément ou o SUPPRIMES avant de passer en commission d’agrément ou o enregistrés comme NON PRESENTES en commission d’agrément OU Déclarés pour la monte publique pour tout autre motif que la mise à l’épreuve sur descendance L’extraction du 23/01/2014 contient 33 565 dossiers de déclarations initiales taureau, soit 382 de plus que celle du 17/10/2013 qui en contenait 33 183. -
La Bretonne Pie Noir Et La Froment Du Léon
INRAE Prod. Anim., Caractérisation du lait 2021, 34 (1), 29-46 de deux races locales de vaches : la Bretonne Pie Noir et la Froment du Léon Catherine HURTAUD1, Rim CHAABOUNI2, Rémi RESMOND1, Guy MIRANDA3, Benoît GRAULET4, Clémence MORINIÈRE2 1PEGASE, INRAE, Institut Agro, 35590, Saint-Gilles, France 2Fédération des races de Bretagne, GIE Élevages de Bretagne, 35000, Rennes, France 3Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, GABI, 78350, Jouy-en-Josas, France 4Université Clermont Auvergne, INRAE, VetAgro Sup, UMR Herbivores, 63122, Saint-Genès-Champanelle, France Courriel : [email protected] Moutons des landes de Bretagne, vaches Bretonne Pie Noir, vaches Nantaises, chèvres des Fossés, porcs blancs de l’Ouest, moutons d’Ouessant, etc. Depuis plusieurs siècles, de nombreuses races animales existent en Bretagne. Elles ont bien failli disparaître avec l’intensification de l’élevage. Deux races de vaches laitières, Bretonne Pie Noir et Froment du Léon, connaissent un regain d’intérêt de la part des éleveurs et des restaurateurs en recherche de conduites alternatives. Introduction par les industriels qui profitent de cette 1907, 35 000 vaches Froment du Léon biodiversité génétique. ont été recensées. Puis leur nombre a Les races locales d’élevage repré- diminué très fortement jusqu’en 1978, sentent pour l’élevage de demain une Dans cette étude, nous nous sommes date à laquelle ne subsistaient qu’une ressource unique tant sur le plan géné- intéressés à deux races locales de quarantaine de vaches et quatre tau- tique, qu’environnemental (Verrier et al., vaches laitières, la Bretonne Pie Noir reaux. En 1980, un code race a été créé 2015). Ces races adaptées à leur milieu et la Froment du Léon (encadré). -
Conservation in Situ De 11 Races Bovines Françaises À Très Faibles Effectifs : Bilan Génétique Et Perspectives L
Conservation in situ de 11 races bovines françaises à très faibles effectifs : bilan génétique et perspectives L. AVON (1), J.J. COLLEAU (2) (1) Institut de l’Elevage, Département Génétique, 149 rue de Bercy - F-75595 Paris Cedex 12 (2) INRA, Station de génétique Quantitative et Appliquée - F- 78352 Jouy-en-Josas Cedex RESUME - Depuis 1976, des programmes de conservation de 11 races bovines françaises, d’effectif inférieur à 1000 vaches, ont été mis en place. Cette communication décrit l’évolution des effectifs jusqu’en 2004 et fournit les paramètres génétiques tels que coefficients de consanguinité, de parenté et contributions relatives des ancêtres. Les effectifs sont encore très modestes, quoiqu’en augmentation très nette. La situation génétique de chaque race dépend surtout de la qualité du noyau initial. Pour la plupart des races étudiées, la situation génétique n’est pas plus préoccupante que dans les grandes races bovines laitières sélectionnées en France. En ce qui concerne l’avenir, la situation actuelle est encore fragile et il apparaît important d’une part de pérenniser une organisation technique nationale et une animation locale de ces races et d’autre part de pouvoir garantir une conservation à long terme par les entreprises d’Insémination Animale (IA) des stocks de semence opérationnels. In vivo conservation of 11 very rare French cattle breeds: survey and perspectives L. AVON (1), J.J. COLLEAU (2) (1) Institut de l’Elevage, Département Génétique, 149 rue de Bercy, F.75595 Paris Cedex 12 SUMMARY - Since 1976, conservation programmes have been settled for 11 French cattle breeds, of population sizes lower than 1000 cows. -
Bilan De Différents Programmes De Conservation De Races Bovines Francaises À Faible Effectif
ÉCOLE NATIONALE VÉTÉRINAIRE D’ALFORT Année 2013 BILAN DE DIFFÉRENTS PROGRAMMES DE CONSERVATION DE RACES BOVINES FRANCAISES À FAIBLE EFFECTIF THÈSE Pour le DOCTORAT VÉTÉRINAIRE Présentée et soutenue publiquement devant LA FACULTÉ DE MÉDECINE DE CRÉTEIL le…………… par GAUTHIER, MATHILDE, NOËLLE Née le 20 août 1988 à Paris 15ème JURY Président : Pr. Professeur à la Faculté de Médecine de CRÉTEIL Membres Directeur : Mme Constant Maître de conférences à l’ENVA Assesseur : Mme Grimard-Ballif Professeur à l’ENVA Invitée : Mme Massé-Morel Maître de conférences contractuel à l’ENVA LISTE DES MEMBRES DU CORPS ENSEIGNANT Directeur : M. le Professeur GOGNY Marc Directeurs honoraires : MM. les Professeurs : COTARD Jean-Pierre, MORAILLON Robert, PARODI André-Laurent, PILET Charles, TOMA Bernard Professeurs honoraires : Mme et MM. : BENET Jean-Jacques, BRUGERE Henri, BRUGERE-PICOUX Jeanne, BUSSIERAS Jean, CERF Olivier, CLERC Bernard, CRESPEAU François, DEPUTTE Bertrand, MOUTHON Gilbert, MILHAUD Guy, POUCHELON Jean-Louis, ROZIER Jacques DEPARTEMENT D’ELEVAGE ET DE PATHOLOGIE DES EQUIDES ET DES CARNIVORES (DEPEC) Chef du département : M. POLACK Bruno, Maître de conférences - Adjoint : M. BLOT Stéphane, Professeur UNITE DE CARDIOLOGIE DISCIPLINE : NUTRITION-ALIMENTATION - Mme CHETBOUL Valérie, Professeur * - M. PARAGON Bernard, Professeur - Mme GKOUNI Vassiliki, Praticien hospitalier DISCIPLINE : OPHTALMOLOGIE UNITE DE CLINIQUE EQUINE - Mme CHAHORY Sabine, Maître de conférences - M. AUDIGIE Fabrice, Professeur - M. DENOIX Jean-Marie, Professeur UNITE DE PARASITOLOGIE ET MALADIES PARASITAIRES - Mme DUMAS Isabelle, Maître de conférences contractuel - M. BENSIGNOR Emmanuel, Professeur contractuel - Mme GIRAUDET Aude, Praticien hospitalier * - M. BLAGA Radu Gheorghe, Maître de conférences (rattaché au DPASP) - M. LECHARTIER Antoine, Maître de conférences contractuel - M. CHERMETTE René, Professeur * - Mme MESPOULHES-RIVIERE Céline, Praticien hospitalier - M.