Systematique Et Ecologie Des Lichens De La Region D'oran

Total Page:16

File Type:pdf, Size:1020Kb

Systematique Et Ecologie Des Lichens De La Region D'oran MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE FACULTE des SCIENCES de la NATURE et de la VIE Département de Biologie THESE Présentée par Mme BENDAIKHA Yasmina En vue de l’obtention Du Diplôme de Doctorat en Sciences Spécialité : Biologie Option : Ecologie Végétale SYSTEMATIQUE ET ECOLOGIE DES LICHENS DE LA REGION D’ORAN Soutenue le 27 / 06 / 2018, devant le jury composé de : Mr BELKHODJA Moulay Professeur Président Université d’Oran 1 Mr HADJADJ - AOUL Seghir Professeur Rapporteur Université d'Oran 1 Mme FORTAS Zohra Professeur Examinatrice Université d’Oran 1 Mr BELAHCENE Miloud Professeur Examinateur C. U. d’Ain Témouchent Mr SLIMANI Miloud Professeur Examinateur Université de Saida Mr AIT HAMMOU Mohamed MCA Invité Université de Tiaret A la Mémoire De nos Chers Ainés Qui Nous ont Ouvert la Voie de la Lichénologie Mr Ammar SEMADI, Professeur à la Faculté des Sciences Et Directeur du Laboratoire de Biologie Végétale et de l’Environnement À l’Université d’Annaba Mr Mohamed RAHALI, Docteur d’État en Sciences Agronomiques Et Directeur du Laboratoire de Biologie Végétale et de l’Environnement À l’École Normale Supérieure du Vieux Kouba – Alger REMERCIEMENTS Au terme de cette thèse, je tiens à remercier : Mr HADJADJ - AOUL Seghir Professeur à l’Université d’Oran 1 qui m’a encadré tout au long de ce travail en me faisant bénéficier de ses connaissances scientifiques et de ses conseils. Je tiens à lui exprimer ma reconnaissance sans bornes, Mr BELKHODJA Moulay Professeur à l’Université d’Oran 1 et lui exprimer ma gratitude pour m’avoir fait l’honneur d’accepter de présider ma thèse sans oublier ses encouragements et ses conseils durant tout mon parcours universitaire, Mme FORTAS Zohra, Professeure à l’Université d’Oran 1 d’avoir accepté de faire partie du jury une autre fois et de juger ma thèse, Mr BELAHCENE Miloud, Professeur au Centre Universitaire d’Ain Témouchent d’avoir accepté d’évaluer ce travail, Mr SLIMANI Miloud, Professeur à l’Université de Saida pour avoir spontanément accepté d’examiner cette thèse et s’être dérangé, Des remerciements particuliers s’adressent à Mr AIT HAMMOU Mohammed, Maitre de Conférences à l’Université de Tiaret et à son équipe, de m’avoir accueilli dans leur laboratoire et ont mis à ma disposition le matériel nécessaire pour réaliser une partie de ce travail. Je suis reconnaissante pour leur aide. De même, je remercie chaleureusement : Mr & Mme LEBSIR Professeurs à l’Université d’Oran 1 et 2 pour m’avoir aidé dans les moments difficiles et soutenu moralement, Melle KADIRI Amina, Maitre de Conférences à l’Université d’Oran 1 pour son aide à la réalisation des analyses statistiques, Mme SEKKAL Fatima Zohra pour son assistance à la réalisation des traitements statistiques, Mme HANITET Karima pour son soutien moral et son aide pour l’accomplissement de ce travail, Toute personne ayant contribué de près ou de loin à l’élaboration de cette thèse. Je vous remercie tous. Dédicaces Je dédie ce modeste travail avec toute mon affection À tous les membres de ma petite et grande familles, Qui m’ont permis d’avancer et de faire aboutir cette thèse. A Mes Très Chers Parents Que le Bon Dieu les protège et les garde pour moi Mon très Cher Époux Lounes Mon Petit Ange Mohamed Ibrahim Mes Frères, Beaux Frères et Sœurs tout particulièrement A Fouad § Hayet Qui m’ont énormément aidé et soutenu pour la réalisation de ce travail Mes Neveux et Nièces Mes Amis (es). Liste des Tableaux Tab. 1 : Répartition des lichens au Maghreb. Tab.2 : Flore lichénique observés dans la région d’Oran par différents auteurs. Tab. 3 : Classification phylogénique des lichens d’après AFL (2014). Tab. 4 : Coordonnées géographiques des stations météorologiques d’Oran (Annexes). Tab. 5 : Précipitations annuelles des trois stations météorologiques (Annexes). Tab. 6 : Températures moyennes annuelles des trois stations météorologiques (Annexes) Tab. 7 : Moyennes de l’humidité relative mensuelle des trois stations météorologiques (Annexes) Tab. 8 : Sites des mailles prospectées. Tab. 9 : Présence/ Absence des Lichens sur différents types de phorophytes. Tab. 10 : Caractéristiques botaniques des différents phorophytes et physico-chimie de leurs écorces. Tab. 11 : Localisation des sites de transplantation de Xanthoria parietina. Tab. 12 : Rapport MF/MS de Xanthoria p. pour quatre mois d’exposition dans les 13 sites. Tab. 13 : Teneur en plomb des échantillons de lichens transplantés Tab. 14 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 1. Tab.15 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 2. Tab.16 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 3. Tab.17 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 4. Tab. 18 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 5. Tab. 19 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 6. Tab. 20 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 7. Tab. 21 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 8. Tab. 22 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 9. Tab. 23 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 10. Tab. 24 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 11. Tab. 25 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 12. Tab. 26 : Matrice de corrélations entre les paramètres mesurés chez le bio indicateur Xanthoria parietina pour le site 13. Tab. 27 : Moyenne du taux de plomb accumulé par Xanthoria parietina Tab. 28 : Liste des phorophytes naturels et introduits à Oran (Annexes) Liste des Figures Fig. 1 : Porphyridium cruentum (Rhodophycées) Fig. 2 : Cylindrotheca closterium (Diatomées) Fig. 3 : Pseudochara ciopsisovalis (Chlorophycées) Fig. 4 : Nostoc sp. (Cyanophycées) Fig. 5 : Structure de la paroi fongique schématisée. Fig. 6 : Différents modes de sporulation et les différents types de spores associées. Fig. 7 : Phylogénie et classification des Champignons Fig. 8 : Schéma représentatif de la symbiose lichénique Fig. 9 : Cellules de champignon : hyphe Fig. 10 : Structure d’une cellule algale Fig. 11 : Différents types de thalles de lichens Fig. 12 : Structure homéomère Fig. 13 : Structure hétéromère stratifiée Fig. 14 : Coupe transversale du thalle de la Structure hétéromère radiée Fig. 15 : Schéma représentatif de la reproduction sexuée des lichens Fig. 16 : Schéma de la Reproduction asexuée des Lichens par isidies Fig. 17 : Schéma de la Reproduction asexuée des Lichens par sorédies Fig. 18 : Différentes formes d’asques. Fig. 19 : Différentes formes de spores. Fig. 20 : Phénotypes des appareils reproducteurs du complexe lichénique Fig. 21 : Organes portés par le thalle sur les deux faces Fig. 22 : Organes de reproduction sexuée Fig. 23 : Organes de reproduction asexuée Fig. 24 : Différentes tailles de Xanthoria parietina L. à travers le temps Fig. 25 : Asque de Rhizocarpon reductum. Fig. 26 : Hétérobaside de Phleogena faginea Fig. 27 : Schéma de cloison des Ascomycetes Fig. 28 : Schéma de Cloison des Basidiomycetes Fig. 29 : Différents types des Arthoniales. Fig. 30 : Représentants de la classe des Dothideomycetes Fig. 31 : Différentes espèces des Pyrenulales Fig. 32 : Exemples d’espèces des Verrucariales Fig. 33 : Représentant de la sous-classe des Mycocaliciomycetidae (Mycocaliciales) Fig. 34 : Différentes espèces des Lecanorales 1 Fig. 35 : Différentes espèces des Lecanorales 2 Fig. 36 : Différentes espèces des Lecanorales 3 Fig. 37 : Différentes espèces des Lecanorales 4 Fig. 38 : Quelques exemples des Peltigerales Fig. 39 : Représentants de la Sous-classe des Lecanoromycetidae incertae sedis Fig. 40 : Différentes espèces des Teloschistales Fig. 41 : Représentants de la Sous-classe des Ostropomycetidae incertae sedis Fig. 42 : Exemples d’espèces des Agyriales Fig. 43 : Représentants des Baeomycetales Fig. 44 : Représentants des Ostropales Fig. 45 : Représentants des Pertusariales Fig. 46 : Représentants des Candelariales Fig. 47 : Représentants des Umbilicariales Fig. 48 : Représentants des Lichinales Fig. 49 : Lichenomphaliaum bellifera Fig. 50 : Carte topographique de la région d’Oran Fig. 51 : Carte des principaux sols de la région Fig. 52 : Variations des précipitations annuelles pour la station d'Arzew Fig. 53 : Variations des précipitations annuelles pour la station d’Oran port Fig. 54 : Variations des précipitations annuelles pour la station de Sénia Fig. 55 : Variations des précipitations annuelles des trois stations météorologiques Fig. 56 : Variations des températures moyennes annuelles d'Arzew Fig. 57 : Variations des températures moyennes annuelles d’Oran port Fig. 58 : Variations des températures moyennes annuelles de Sénia Fig. 59 : Variations des Températures moyennes annuelles des trois stations météorologiques Fig. 60 : L’humidité relative moyenne mensuelle d'Arzew Fig. 61 : L’humidité relative moyenne mensuelle d’Oran port Fig. 62 : L’humidité relative moyenne mensuelle de Sénia Fig. 63 : Rose des vents
Recommended publications
  • Phylogeny of the Cetrarioid Core (Parmeliaceae) Based on Five
    The Lichenologist 41(5): 489–511 (2009) © 2009 British Lichen Society doi:10.1017/S0024282909990090 Printed in the United Kingdom Phylogeny of the cetrarioid core (Parmeliaceae) based on five genetic markers Arne THELL, Filip HÖGNABBA, John A. ELIX, Tassilo FEUERER, Ingvar KÄRNEFELT, Leena MYLLYS, Tiina RANDLANE, Andres SAAG, Soili STENROOS, Teuvo AHTI and Mark R. D. SEAWARD Abstract: Fourteen genera belong to a monophyletic core of cetrarioid lichens, Ahtiana, Allocetraria, Arctocetraria, Cetraria, Cetrariella, Cetreliopsis, Flavocetraria, Kaernefeltia, Masonhalea, Nephromopsis, Tuckermanella, Tuckermannopsis, Usnocetraria and Vulpicida. A total of 71 samples representing 65 species (of 90 worldwide) and all type species of the genera are included in phylogentic analyses based on a complete ITS matrix and incomplete sets of group I intron, -tubulin, GAPDH and mtSSU sequences. Eleven of the species included in the study are analysed phylogenetically for the first time, and of the 178 sequences, 67 are newly constructed. Two phylogenetic trees, one based solely on the complete ITS-matrix and a second based on total information, are similar, but not entirely identical. About half of the species are gathered in a strongly supported clade composed of the genera Allocetraria, Cetraria s. str., Cetrariella and Vulpicida. Arctocetraria, Cetreliopsis, Kaernefeltia and Tuckermanella are monophyletic genera, whereas Cetraria, Flavocetraria and Tuckermannopsis are polyphyletic. The taxonomy in current use is compared with the phylogenetic results, and future, probable or potential adjustments to the phylogeny are discussed. The single non-DNA character with a strong correlation to phylogeny based on DNA-sequences is conidial shape. The secondary chemistry of the poorly known species Cetraria annae is analyzed for the first time; the cortex contains usnic acid and atranorin, whereas isonephrosterinic, nephrosterinic, lichesterinic, protolichesterinic and squamatic acids occur in the medulla.
    [Show full text]
  • <I>Cyanodermella Asteris</I> Sp. Nov. (<I>Ostropales</I>)
    MYCOTAXON ISSN (print) 0093-4666 (online) 2154-8889 Mycotaxon, Ltd. ©2017 January–March 2017—Volume 132, pp. 107–123 http://dx.doi.org/10.5248/132.107 Cyanodermella asteris sp. nov. (Ostropales) from the inflorescence axis of Aster tataricus Linda Jahn1,*, Thomas Schafhauser2, Stefan Pan2, Tilmann Weber2,7, Wolfgang Wohlleben2, David Fewer3, Kaarina Sivonen3, Liane Flor4, Karl-Heinz van Pée4, Thibault Caradec5, Philippe Jacques5,8, Mieke M.E. Huijbers6,9, Willem J.H. van Berkel6 & Jutta Ludwig-Müller1,* 1 Institut für Botanik, Technische Universität Dresden, 01062 Dresden, Germany 2 Mikrobiologie und Biotechnologie, Interfakultäres Institut für Mikrobiologie und Infektionsmedizin, Eberhard Karls Universität Tübingen, Auf der Morgenstelle 28, 72076 Tübingen, Germany 3 Microbiology and Biotechnology Division, Dept. of Food and Environmental Sciences, University of Helsinki, Viikinkaari 9, FIN-00014, Helsinki, Finland 4 Allgemeine Biochemie, Technische Universität Dresden, 01069 Dresden, Germany 5 Laboratoire ProBioGEM, Université Lille1- Sciences et Technologies, Villeneuve d’Ascq, France 6 Laboratory of Biochemistry, Wageningen University, Dreijenlaan 3, 6703 HA Wageningen, The Netherlands 7 moved to: Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, Kemitorvet Bygning 220, 2800 Kgs. Lyngby, Denmark 8 moved to: Gembloux Agro-Bio Tech, Université de Liege, Passage des Déportés 2, 5030 Gembloux, Belgium 9 moved to: Department of Biotechnology, Technical University Delft, Van der Maasweg 9, 2629 HZ Delft, The Netherlands *Correspondence to: [email protected], [email protected] Abstract—An endophytic fungus isolated from the inflorescence axis ofAster tataricus is proposed as a new species. Phylogenetic analyses based on sequences from the ribosomal DNA cluster (the ITS1+5.8S+ITS2, 18S, and 28S regions) and the RPB2 gene revealed a relationship between the unknown fungus and the Stictidaceae lineage of the Ostropales.
    [Show full text]
  • <I>Sordariales</I>, <I>Ascomycota</I>
    MYCOTAXON Volume 109, pp. 323–328 July–September 2009 Roselliniella stereocaulorum (Sordariales, Ascomycota), a new lichenicolous fungus from the Holarctic Mikhail P. Zhurbenko1, Martin Kukwa2 & Magdalena Oset2 [email protected] Komarov Botanical Institute, Russian Academy of Sciences Professor Popov 2, St. Petersburg, 197376 Russia 2 [email protected], [email protected] Department of Plant Taxonomy and Nature Conservation, University of Gdańsk Al. Legionów 9, PL–80–441 Gdańsk, Poland Abstract — Roselliniella stereocaulorum growing on Stereocaulon spp. is described as new from Poland, the Asiatic part of Russia and the USA (Alaska). Key words — taxonomy, new species Introduction Roselliniella Vain. (Sordariales, Ascomycota) is an obligate lichenicolous pyrenomycetous genus that included 15 species. It is characterized mainly by non-amyloid, up to 8-spored asci without distinct apical structures, brown, simple or very rarely septate ascospores with smooth or microguttulate (not verruculose) walls lacking visible pores, and brown, commonly distinct vegetative hyphae penetrating usually only the host tissues, but sometimes also surrounding perithecia (Matzer & Hafellner 1990, Aptroot et al. 1997, Hawksworth & Miądlikowska 1997, Hoffmann & Hafellner 2000, Etayo 2002, Etayo & Sancho 2008). Members of the genus grow mainly on various foliose, fruticose and occasionally also crustose lichens of two orders, Lecanorales and Peltigerales (Matzer & Hafellner 1990, Aptroot et al. 1997, Hawksworth & Miądlikowska 1997, Etayo 2002), with the exception of R. microthelia (Wallr.) Nik. Hoffm. & Hafellner. This species is confined to the genus Trapelia M. Choisy (Hoffmann & Hafellner 2000), a member of Baeomycetales (classification according to Lumbsch & Huhndorf 2007, Lumbsch et al. 2007). During the studies on lichenicolous fungi in the Holarctic and a revision of the genus Stereocaulon in Poland, we found interesting specimens of Roselliniella with predominantly 4-spored asci.
    [Show full text]
  • 1307 Fungi Representing 1139 Infrageneric Taxa, 317 Genera and 66 Families ⇑ Jolanta Miadlikowska A, , Frank Kauff B,1, Filip Högnabba C, Jeffrey C
    Molecular Phylogenetics and Evolution 79 (2014) 132–168 Contents lists available at ScienceDirect Molecular Phylogenetics and Evolution journal homepage: www.elsevier.com/locate/ympev A multigene phylogenetic synthesis for the class Lecanoromycetes (Ascomycota): 1307 fungi representing 1139 infrageneric taxa, 317 genera and 66 families ⇑ Jolanta Miadlikowska a, , Frank Kauff b,1, Filip Högnabba c, Jeffrey C. Oliver d,2, Katalin Molnár a,3, Emily Fraker a,4, Ester Gaya a,5, Josef Hafellner e, Valérie Hofstetter a,6, Cécile Gueidan a,7, Mónica A.G. Otálora a,8, Brendan Hodkinson a,9, Martin Kukwa f, Robert Lücking g, Curtis Björk h, Harrie J.M. Sipman i, Ana Rosa Burgaz j, Arne Thell k, Alfredo Passo l, Leena Myllys c, Trevor Goward h, Samantha Fernández-Brime m, Geir Hestmark n, James Lendemer o, H. Thorsten Lumbsch g, Michaela Schmull p, Conrad L. Schoch q, Emmanuël Sérusiaux r, David R. Maddison s, A. Elizabeth Arnold t, François Lutzoni a,10, Soili Stenroos c,10 a Department of Biology, Duke University, Durham, NC 27708-0338, USA b FB Biologie, Molecular Phylogenetics, 13/276, TU Kaiserslautern, Postfach 3049, 67653 Kaiserslautern, Germany c Botanical Museum, Finnish Museum of Natural History, FI-00014 University of Helsinki, Finland d Department of Ecology and Evolutionary Biology, Yale University, 358 ESC, 21 Sachem Street, New Haven, CT 06511, USA e Institut für Botanik, Karl-Franzens-Universität, Holteigasse 6, A-8010 Graz, Austria f Department of Plant Taxonomy and Nature Conservation, University of Gdan´sk, ul. Wita Stwosza 59, 80-308 Gdan´sk, Poland g Science and Education, The Field Museum, 1400 S.
    [Show full text]
  • An Evolving Phylogenetically Based Taxonomy of Lichens and Allied Fungi
    Opuscula Philolichenum, 11: 4-10. 2012. *pdf available online 3January2012 via (http://sweetgum.nybg.org/philolichenum/) An evolving phylogenetically based taxonomy of lichens and allied fungi 1 BRENDAN P. HODKINSON ABSTRACT. – A taxonomic scheme for lichens and allied fungi that synthesizes scientific knowledge from a variety of sources is presented. The system put forth here is intended both (1) to provide a skeletal outline of the lichens and allied fungi that can be used as a provisional filing and databasing scheme by lichen herbarium/data managers and (2) to announce the online presence of an official taxonomy that will define the scope of the newly formed International Committee for the Nomenclature of Lichens and Allied Fungi (ICNLAF). The online version of the taxonomy presented here will continue to evolve along with our understanding of the organisms. Additionally, the subfamily Fissurinoideae Rivas Plata, Lücking and Lumbsch is elevated to the rank of family as Fissurinaceae. KEYWORDS. – higher-level taxonomy, lichen-forming fungi, lichenized fungi, phylogeny INTRODUCTION Traditionally, lichen herbaria have been arranged alphabetically, a scheme that stands in stark contrast to the phylogenetic scheme used by nearly all vascular plant herbaria. The justification typically given for this practice is that lichen taxonomy is too unstable to establish a reasonable system of classification. However, recent leaps forward in our understanding of the higher-level classification of fungi, driven primarily by the NSF-funded Assembling the Fungal Tree of Life (AFToL) project (Lutzoni et al. 2004), have caused the taxonomy of lichen-forming and allied fungi to increase significantly in stability. This is especially true within the class Lecanoromycetes, the main group of lichen-forming fungi (Miadlikowska et al.
    [Show full text]
  • Lichen Functional Trait Variation Along an East-West Climatic Gradient in Oregon and Among Habitats in Katmai National Park, Alaska
    AN ABSTRACT OF THE THESIS OF Kaleigh Spickerman for the degree of Master of Science in Botany and Plant Pathology presented on June 11, 2015 Title: Lichen Functional Trait Variation Along an East-West Climatic Gradient in Oregon and Among Habitats in Katmai National Park, Alaska Abstract approved: ______________________________________________________ Bruce McCune Functional traits of vascular plants have been an important component of ecological studies for a number of years; however, in more recent times vascular plant ecologists have begun to formalize a set of key traits and universal system of trait measurement. Many recent studies hypothesize global generality of trait patterns, which would allow for comparison among ecosystems and biomes and provide a foundation for general rules and theories, the so-called “Holy Grail” of ecology. However, the majority of these studies focus on functional trait patterns of vascular plants, with a minority examining the patterns of cryptograms such as lichens. Lichens are an important component of many ecosystems due to their contributions to biodiversity and their key ecosystem services, such as contributions to mineral and hydrological cycles and ecosystem food webs. Lichens are also of special interest because of their reliance on atmospheric deposition for nutrients and water, which makes them particularly sensitive to air pollution. Therefore, they are often used as bioindicators of air pollution, climate change, and general ecosystem health. This thesis examines the functional trait patterns of lichens in two contrasting regions with fundamentally different kinds of data. To better understand the patterns of lichen functional traits, we examined reproductive, morphological, and chemical trait variation along precipitation and temperature gradients in Oregon.
    [Show full text]
  • H. Thorsten Lumbsch VP, Science & Education the Field Museum 1400
    H. Thorsten Lumbsch VP, Science & Education The Field Museum 1400 S. Lake Shore Drive Chicago, Illinois 60605 USA Tel: 1-312-665-7881 E-mail: [email protected] Research interests Evolution and Systematics of Fungi Biogeography and Diversification Rates of Fungi Species delimitation Diversity of lichen-forming fungi Professional Experience Since 2017 Vice President, Science & Education, The Field Museum, Chicago. USA 2014-2017 Director, Integrative Research Center, Science & Education, The Field Museum, Chicago, USA. Since 2014 Curator, Integrative Research Center, Science & Education, The Field Museum, Chicago, USA. 2013-2014 Associate Director, Integrative Research Center, Science & Education, The Field Museum, Chicago, USA. 2009-2013 Chair, Dept. of Botany, The Field Museum, Chicago, USA. Since 2011 MacArthur Associate Curator, Dept. of Botany, The Field Museum, Chicago, USA. 2006-2014 Associate Curator, Dept. of Botany, The Field Museum, Chicago, USA. 2005-2009 Head of Cryptogams, Dept. of Botany, The Field Museum, Chicago, USA. Since 2004 Member, Committee on Evolutionary Biology, University of Chicago. Courses: BIOS 430 Evolution (UIC), BIOS 23410 Complex Interactions: Coevolution, Parasites, Mutualists, and Cheaters (U of C) Reading group: Phylogenetic methods. 2003-2006 Assistant Curator, Dept. of Botany, The Field Museum, Chicago, USA. 1998-2003 Privatdozent (Assistant Professor), Botanical Institute, University – GHS - Essen. Lectures: General Botany, Evolution of lower plants, Photosynthesis, Courses: Cryptogams, Biology
    [Show full text]
  • One Hundred New Species of Lichenized Fungi: a Signature of Undiscovered Global Diversity
    Phytotaxa 18: 1–127 (2011) ISSN 1179-3155 (print edition) www.mapress.com/phytotaxa/ Monograph PHYTOTAXA Copyright © 2011 Magnolia Press ISSN 1179-3163 (online edition) PHYTOTAXA 18 One hundred new species of lichenized fungi: a signature of undiscovered global diversity H. THORSTEN LUMBSCH1*, TEUVO AHTI2, SUSANNE ALTERMANN3, GUILLERMO AMO DE PAZ4, ANDRÉ APTROOT5, ULF ARUP6, ALEJANDRINA BÁRCENAS PEÑA7, PAULINA A. BAWINGAN8, MICHEL N. BENATTI9, LUISA BETANCOURT10, CURTIS R. BJÖRK11, KANSRI BOONPRAGOB12, MAARTEN BRAND13, FRANK BUNGARTZ14, MARCELA E. S. CÁCERES15, MEHTMET CANDAN16, JOSÉ LUIS CHAVES17, PHILIPPE CLERC18, RALPH COMMON19, BRIAN J. COPPINS20, ANA CRESPO4, MANUELA DAL-FORNO21, PRADEEP K. DIVAKAR4, MELIZAR V. DUYA22, JOHN A. ELIX23, ARVE ELVEBAKK24, JOHNATHON D. FANKHAUSER25, EDIT FARKAS26, LIDIA ITATÍ FERRARO27, EBERHARD FISCHER28, DAVID J. GALLOWAY29, ESTER GAYA30, MIREIA GIRALT31, TREVOR GOWARD32, MARTIN GRUBE33, JOSEF HAFELLNER33, JESÚS E. HERNÁNDEZ M.34, MARÍA DE LOS ANGELES HERRERA CAMPOS7, KLAUS KALB35, INGVAR KÄRNEFELT6, GINTARAS KANTVILAS36, DOROTHEE KILLMANN28, PAUL KIRIKA37, KERRY KNUDSEN38, HARALD KOMPOSCH39, SERGEY KONDRATYUK40, JAMES D. LAWREY21, ARMIN MANGOLD41, MARCELO P. MARCELLI9, BRUCE MCCUNE42, MARIA INES MESSUTI43, ANDREA MICHLIG27, RICARDO MIRANDA GONZÁLEZ7, BIBIANA MONCADA10, ALIFERETI NAIKATINI44, MATTHEW P. NELSEN1, 45, DAG O. ØVSTEDAL46, ZDENEK PALICE47, KHWANRUAN PAPONG48, SITTIPORN PARNMEN12, SERGIO PÉREZ-ORTEGA4, CHRISTIAN PRINTZEN49, VÍCTOR J. RICO4, EIMY RIVAS PLATA1, 50, JAVIER ROBAYO51, DANIA ROSABAL52, ULRIKE RUPRECHT53, NORIS SALAZAR ALLEN54, LEOPOLDO SANCHO4, LUCIANA SANTOS DE JESUS15, TAMIRES SANTOS VIEIRA15, MATTHIAS SCHULTZ55, MARK R. D. SEAWARD56, EMMANUËL SÉRUSIAUX57, IMKE SCHMITT58, HARRIE J. M. SIPMAN59, MOHAMMAD SOHRABI 2, 60, ULRIK SØCHTING61, MAJBRIT ZEUTHEN SØGAARD61, LAURENS B. SPARRIUS62, ADRIANO SPIELMANN63, TOBY SPRIBILLE33, JUTARAT SUTJARITTURAKAN64, ACHRA THAMMATHAWORN65, ARNE THELL6, GÖRAN THOR66, HOLGER THÜS67, EINAR TIMDAL68, CAMILLE TRUONG18, ROMAN TÜRK69, LOENGRIN UMAÑA TENORIO17, DALIP K.
    [Show full text]
  • Lichens and Associated Fungi from Glacier Bay National Park, Alaska
    The Lichenologist (2020), 52,61–181 doi:10.1017/S0024282920000079 Standard Paper Lichens and associated fungi from Glacier Bay National Park, Alaska Toby Spribille1,2,3 , Alan M. Fryday4 , Sergio Pérez-Ortega5 , Måns Svensson6, Tor Tønsberg7, Stefan Ekman6 , Håkon Holien8,9, Philipp Resl10 , Kevin Schneider11, Edith Stabentheiner2, Holger Thüs12,13 , Jan Vondrák14,15 and Lewis Sharman16 1Department of Biological Sciences, CW405, University of Alberta, Edmonton, Alberta T6G 2R3, Canada; 2Department of Plant Sciences, Institute of Biology, University of Graz, NAWI Graz, Holteigasse 6, 8010 Graz, Austria; 3Division of Biological Sciences, University of Montana, 32 Campus Drive, Missoula, Montana 59812, USA; 4Herbarium, Department of Plant Biology, Michigan State University, East Lansing, Michigan 48824, USA; 5Real Jardín Botánico (CSIC), Departamento de Micología, Calle Claudio Moyano 1, E-28014 Madrid, Spain; 6Museum of Evolution, Uppsala University, Norbyvägen 16, SE-75236 Uppsala, Sweden; 7Department of Natural History, University Museum of Bergen Allégt. 41, P.O. Box 7800, N-5020 Bergen, Norway; 8Faculty of Bioscience and Aquaculture, Nord University, Box 2501, NO-7729 Steinkjer, Norway; 9NTNU University Museum, Norwegian University of Science and Technology, NO-7491 Trondheim, Norway; 10Faculty of Biology, Department I, Systematic Botany and Mycology, University of Munich (LMU), Menzinger Straße 67, 80638 München, Germany; 11Institute of Biodiversity, Animal Health and Comparative Medicine, College of Medical, Veterinary and Life Sciences, University of Glasgow, Glasgow G12 8QQ, UK; 12Botany Department, State Museum of Natural History Stuttgart, Rosenstein 1, 70191 Stuttgart, Germany; 13Natural History Museum, Cromwell Road, London SW7 5BD, UK; 14Institute of Botany of the Czech Academy of Sciences, Zámek 1, 252 43 Průhonice, Czech Republic; 15Department of Botany, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 1760, CZ-370 05 České Budějovice, Czech Republic and 16Glacier Bay National Park & Preserve, P.O.
    [Show full text]
  • Black Fungal Extremes
    Studies in Mycology 61 (2008) Black fungal extremes Edited by G.S. de Hoog and M. Grube CBS Fungal Biodiversity Centre, Utrecht, The Netherlands An institute of the Royal Netherlands Academy of Arts and Sciences Black fungal extremes STUDIE S IN MYCOLOGY 61, 2008 Studies in Mycology The Studies in Mycology is an international journal which publishes systematic monographs of filamentous fungi and yeasts, and in rare occasions the proceedings of special meetings related to all fields of mycology, biotechnology, ecology, molecular biology, pathology and systematics. For instructions for authors see www.cbs.knaw.nl. EXECUTIVE EDITOR Prof. dr Robert A. Samson, CBS Fungal Biodiversity Centre, P.O. Box 85167, 3508 AD Utrecht, The Netherlands. E-mail: [email protected] LAYOUT EDITOR S Manon van den Hoeven-Verweij, CBS Fungal Biodiversity Centre, P.O. Box 85167, 3508 AD Utrecht, The Netherlands. E-mail: [email protected] Kasper Luijsterburg, CBS Fungal Biodiversity Centre, P.O. Box 85167, 3508 AD Utrecht, The Netherlands. E-mail: [email protected] SCIENTIFIC EDITOR S Prof. dr Uwe Braun, Martin-Luther-Universität, Institut für Geobotanik und Botanischer Garten, Herbarium, Neuwerk 21, D-06099 Halle, Germany. E-mail: [email protected] Prof. dr Pedro W. Crous, CBS Fungal Biodiversity Centre, P.O. Box 85167, 3508 AD Utrecht, The Netherlands. E-mail: [email protected] Prof. dr David M. Geiser, Department of Plant Pathology, 121 Buckhout Laboratory, Pennsylvania State University, University Park, PA, U.S.A. 16802. E-mail: [email protected] Dr Lorelei L. Norvell, Pacific Northwest Mycology Service, 6720 NW Skyline Blvd, Portland, OR, U.S.A.
    [Show full text]
  • One Hundred and Seventy-Five New Species of Graphidaceae: Closing the Gap Or a Drop in the Bucket?
    Phytotaxa 189 (1): 007–038 ISSN 1179-3155 (print edition) www.mapress.com/phytotaxa/ Article PHYTOTAXA Copyright © 2014 Magnolia Press ISSN 1179-3163 (online edition) http://dx.doi.org/10.11646/phytotaxa.189.1.4 One hundred and seventy-five new species of Graphidaceae: closing the gap or a drop in the bucket? ROBERT LÜCKING1, MARK K. JOHNSTON1, ANDRÉ APTROOT2, EKAPHAN KRAICHAK1, JAMES C. LENDEMER3, KANSRI BOONPRAGOB4, MARCELA E. S. CÁCERES5, DAMIEN ERTZ6, LIDIA ITATI FERRARO7, ZE-FENG JIA8, KLAUS KALB9,10, ARMIN MANGOLD11, LEKA MANOCH12, JOEL A. MERCADO-DÍAZ13, BIBIANA MONCADA14, PACHARA MONGKOLSUK4, KHWANRUAN BUTSATORN PAPONG 15, SITTIPORN PARNMEN16, ROUCHI N. PELÁEZ14, VASUN POENGSUNGNOEN17, EIMY RIVAS PLATA1, WANARUK SAIPUNKAEW18, HARRIE J. M. SIPMAN19, JUTARAT SUTJARITTURAKAN10,18, DRIES VAN DEN BROECK6, MATT VON KONRAT1, GOTHAMIE WEERAKOON20 & H. THORSTEN 1 LUMBSCH 1Science & Education, The Field Museum, 1400 South Lake Shore Drive, Chicago, Illinois 60605-2496, U.S.A.; email: [email protected], [email protected], [email protected], [email protected] 2ABL Herbarium, G.v.d.Veenstraat 107, NL-3762 XK Soest, The Netherlands; email: [email protected] 3Institute of Systematic Botany, The New York Botanical Garden, Bronx, NY 10458-5126, U.S.A.; email: [email protected] 4Lichen Research Unit, Department of Biology, Faculty of Science, Ramkhamhaeng University, Ramkhamhaeng 24 road, Bangkok, 10240 Thailand; email: [email protected] 5Departamento de Biociências, Universidade Federal de Sergipe, CEP: 49500-000,
    [Show full text]
  • <I> Lecanoromycetes</I> of Lichenicolous Fungi Associated With
    Persoonia 39, 2017: 91–117 ISSN (Online) 1878-9080 www.ingentaconnect.com/content/nhn/pimj RESEARCH ARTICLE https://doi.org/10.3767/persoonia.2017.39.05 Phylogenetic placement within Lecanoromycetes of lichenicolous fungi associated with Cladonia and some other genera R. Pino-Bodas1,2, M.P. Zhurbenko3, S. Stenroos1 Key words Abstract Though most of the lichenicolous fungi belong to the Ascomycetes, their phylogenetic placement based on molecular data is lacking for numerous species. In this study the phylogenetic placement of 19 species of cladoniicolous species lichenicolous fungi was determined using four loci (LSU rDNA, SSU rDNA, ITS rDNA and mtSSU). The phylogenetic Pilocarpaceae analyses revealed that the studied lichenicolous fungi are widespread across the phylogeny of Lecanoromycetes. Protothelenellaceae One species is placed in Acarosporales, Sarcogyne sphaerospora; five species in Dactylosporaceae, Dactylo­ Scutula cladoniicola spora ahtii, D. deminuta, D. glaucoides, D. parasitica and Dactylospora sp.; four species belong to Lecanorales, Stictidaceae Lichenosticta alcicorniaria, Epicladonia simplex, E. stenospora and Scutula epiblastematica. The genus Epicladonia Stictis cladoniae is polyphyletic and the type E. sandstedei belongs to Leotiomycetes. Phaeopyxis punctum and Bachmanniomyces uncialicola form a well supported clade in the Ostropomycetidae. Epigloea soleiformis is related to Arthrorhaphis and Anzina. Four species are placed in Ostropales, Corticifraga peltigerae, Cryptodiscus epicladonia, C. galaninae and C. cladoniicola
    [Show full text]