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Identification Spécifique Et Structure Génétique Des Populations Du Papillon-Cendre Responsable Des Épisodes De Papillonite En Guyane Et Au Vénézuela Marina Ciminera

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Identification Spécifique Et Structure Génétique Des Populations Du Papillon-Cendre Responsable Des Épisodes De Papillonite En Guyane Et Au Vénézuela Marina Ciminera Identification spécifique et structure génétique des populations du papillon-cendre responsable des épisodes de papillonite en Guyane et au Vénézuela Marina Ciminera To cite this version: Marina Ciminera. Identification spécifique et structure génétique des populations du papillon-cendre responsable des épisodes de papillonite en Guyane et au Vénézuela. Sciences agricoles. Université de Guyane, 2017. Français. NNT : 2017YANE0016. tel-01834559v2 HAL Id: tel-01834559 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01834559v2 Submitted on 24 Sep 2019 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. Présentée et soutenue publiquement le 20 avril 2016 par : Auteur du mémoire Titre du mémoire, v.1.10 Thèse En vue de l’obtention du grade de Docteur de l’Université de Guyane Discipline : Sciences et Technologies Spécialité : Écologie Présentée et soutenue publiquement le 11 décembre 2017 par : MARINA CIMINERA Identification spécifique et structure génétique des populations du papillon-cendre responsable des épisodes de papillonite en Guyane et au Vénézuela JURY Directrice de Recherches INRA UMR CBGP Montpellier Rapporteur Carole KERDELHUÉ Chargé de Recherches INRA URZF Orléans Rapporteur Carlos LOPEZ-VAAMONDE Eric MARCON Directeur de Recherches INRA UMR EcoFoG Kourou Examinateur Maître de Conférences des Universités, Muséum National Examinateur Rodolphe ROUGERIE d'Histoire Naturelle Paris Marie-Anne AUGER- Chargée de Recherches INRA URZF Orléans, HDR Co-Directrice de ROZENBERG Thèse Chargé de Recherches INRA UMR EcoFoG Kourou Co-Directeur de Niklas TYSKLIND Thèse Alain ROQUES Directeur de Recherches INRA URZF Orléans Directeur de Thèse Ecole Doctorale n°587 : Diversités, Santé et développement en Amazonie Identification spécifique et structure génétique des populations du papillon-cendre responsable des épisodes de papillonite en Guyane et au Vénézuela. Table des matières AVANT-PROPOS ET REMERCIEMENTS 1. Introduction générale ........................................................................................................ 8 1.1. La spéciation : de la population à l’espèce dans le contexte néotropical .................................................. 8 1.2. Les Lépidoptères et autres arthropodes urticants .................................................................................. 12 1.3. Les agents de la papillonite en Amérique du Sud ................................................................................... 14 1.4. Mes hypothèses de travail concernant les espèces impliquées dans la papillonite en Guyane ............ 17 2. Le Modèle biologique : le Genre Hylesia et l’espèce H. metabus .................................... 19 2.1. Taxonomie et délimitation des espèces .................................................................................................... 19 2.2. Distribution géographique de l’espèce Hylesia metabus ......................................................................... 22 2.3. Biologie et écologie d’ Hylesia metabus .................................................................................................... 23 2.3.1. Cycle de développement .................................................................................................................................... 23 2.3.2. Plantes-hôtes d’H. metabus ............................................................................................................................... 27 2.3.3. Ennemis naturels d’H. metabus ........................................................................................................................ 29 2.3.4. Impact sanitaire économique et écologique d’H. metabus ................................................................................ 29 3. Echantillonnage et méthodes d’analyse ......................................................................... 31 3.1. Stratégie d’échantillonnage ...................................................................................................................... 31 3.1.1. Les Zones d’études et les méthodes de collectes ................................................................................................ 31 3.2. Outils d’analyse génétique ....................................................................................................................... 39 3.2.1. Introduction ....................................................................................................................................................... 39 3.2.2. Les marqueurs utilisés pour mon étude ............................................................................................................ 41 3.2.3. Méthodes d’analyse ............................................................................................................................................ 46 3.3. Méthodes d’études du comportement sexuel d’Hylesia metabus ............................................................ 49 3.3.1. Elevage des Hylesia metabus ............................................................................................................................. 49 3.3.2. Conditionnement ............................................................................................................................................... 49 3.3.3. Alimentation des chenilles et mesures d’hygiène (désinfection des élevages) ................................................. 51 3.3.4. Identification de la période d’appel des femelles............................................................................................... 51 3.3.5. Tentative d’identification de la phéromone sexuelle ......................................................................................... 52 4. Identification des especes d’Hylesia responsables de la papillonite en Guyane et au Venezuela ................................................................................................................................ 54 4.1. Hylesia metabus : une unité taxonomique au sein du genre .................................................................. 54 4.2. Identification des espèces d’Hylesia responsables de la papillonite en Guyane et au Venezuela......... 57 5. Structure génétique et diversité des populations d’H. metabus lépidoptère responsable de la papillonite en Guyane et au Venezuela. ........................................................................ 60 6. Contribution à la compréhension du comportement sexuel chez Hylesia metabus ....... 89 6.1. Aperçu synthétique des phéromones de Lépidoptères Saturniidae et objectifs de l’étude .................... 89 6.2. Résultats de l’étude .................................................................................................................................. 93 3 6.2.1. Identification de la période d’appel des femelles d’Hylesia metabus ............................................................... 93 6.2.2. Une identification encore très imparfaite des composés impliqués dans la phéromone sexuelle ................... 96 6.3. Avancées et faiblesses dans la compréhension du comportement sexuel de Hylesia metabus ............. 98 6.3.1. Le rythme d’émission de la phéromone sexuelle chez H. metabus................................................................... 98 6.3.2. La composition de la phéromone sexuelle d’Hylesia metabus reste toujours une boite noire ......................... 99 6.3.3. Conclusion ......................................................................................................................................................... 99 7. Discussion générale et perspectives .............................................................................. 101 8. BIBLIOGRAPHIE.......................................................................................................... 108 Liste des Figures : Figure 1: Schéma conceptuel du continuum de divergence durant le processus de spéciation. Nosil et al. (2009b). ................................................................................................................................................... 9 Figure 2: Les modes de spéciation géographique ..................................................................................... 11 Figure 3: Dispositif urticant chez Hylesia metabus. ................................................................................ 15 Figure 4: Synthèse de la classification des espèces d’Hylesia du groupe I ............................................. 21 Figure 5: Synthèse de la classification des espèces d’Hylesia du groupe II ............................................ 22 Figure 6 Aire de répartition d’H. metabus en gris, extrapolée à partir des zones de recensement d’H. metabus de Lemaire (2002) et des coordonnés géographiques des individus représentés dans la base de données Barcode Of Life Database (BOLD- BIN AAA3035) ................................................................... 23 Figure 7: Cycle de développement d’H. metabus. Les photographies illustrent les différentes phases de développement : A- dôme de ponte
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