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Variabilités Chimiques Et Activités Antimicrobiennes Des Huiles Essentielles De Cinnamosma Spp

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Variabilités Chimiques Et Activités Antimicrobiennes Des Huiles Essentielles De Cinnamosma Spp UNIVERSITE D’ANTANANARIVO Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques Département Industries Agricoles et Alimentaires THESE pour l'obtention du diplôme de Doctorat Option Industries Agricoles et Alimentaires Variabilités chimiques et activités antimicrobiennes des huiles essentielles de Cinnamosma spp. (Alternative aux antibiotiques en aquaculture de crevette) Par : RAZAFIMAMONJISON Dina Emile Nicolas Gaylor Soutenu le 09 Décembre 2011 UNIVERSITE D’ANTANANARIVO Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques Département Industries Agricoles et Alimentaires THESE pour l'obtention du diplôme de Doctorat Option Industries Agricoles et Alimentaires Variabilités chimiques et activités antimicrobiennes des huiles essentielles de Cinnamosma spp. (Alternative aux antibiotiques en aquaculture de crevette) Par: RAZAFIMAMONJISON Dina Emile Nicolas Gaylor Soutenu le 09 Décembre 2011 Membres de jury : Président : Professeur RAONIZAFINIMANANA née RAMAROSON Béatrice Directeur de thèse : Professeur Titulaire RAMANOELINA Panja Directeur de thèse: Docteur DANTHU Pascal Rapporteur interne : Professeur RASOARAHONA Jean Rapporteur externe : Professeur Titulaire RAZANAMPARANY Louisette Examinateur : Professeur RANDRIANARY Phillipe Examinateur : Professeur RAKOTOZANDRINDRAINY Raphaël Je dédie ce travail A mes parents pour l’éducation que vous m’avez donnée. A ma chère et dévouée épouse qui par son amour m’a toujours soutenue et a su réconforter les enfants avec tant de sacrifice et patience. A mes chers enfants, Tiavina et Diary, pour leur amour, patience, compréhension et sacrifice. Retrouvez un motif réel de fierté pour ce travail. A mon frère et sœur, beau frère, belle sœur, nièce et neveu, merci pour vos encouragements. A mon cher et regretté Oncle (Tonton Nest : Bandy akama) qui je sais est fiers là où il est. A tous ceux qui m’ont épaulé dans la réalisation de ce travail, mille mercis. « Il m’arrive plusieurs fois par jour de réaliser à quel point ma vie extérieure et intérieure repose sur le labeur des autres, vivants et morts, et avec quelle ardeur je dois m’appliquer à donner, en retour, autant que j’ai reçu. » Remerciements Ce travail n'a pas pu être mené à terme sans les aides précieuses et le soutien de plusieurs personnes; nous tenons à remercier, plus particulièrement: Au Professeur RAONIZAFINIMANANA née RAMAROSON Béatrice, Enseignant chercheur et Chef de département des Industries Agricoles et Alimentaires à l'Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques pour avoir bien voulu présider le jury de cette Thèse. Qu'elle veuille accepter mes plus vifs remerciements et ma respectueuse reconnaissance Au Professeur RANDRIANARY Philippe, Enseignant chercheur et Directeur de l’Ecole Supérieure Polytechnique d’Antananarivo, qui a bien voulu examiner ce travail. Qu’il trouve ici l’expression de ma haute considération et de mes chaleureux remerciements Au Professeur RAKOTOZANDRINDRAINY Raphaël, Enseignant chercheur à l'Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques, qui a bien voulu examiner ce travail. Qu’il veuille accepter ma respectueuse reconnaissance Au Professeur Titulaire RAMANOELINA Panja, Directeur de Thèse, Enseignant chercheur à l'Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques, qui malgré ses nombreuses occupations, a bien voulu prendre la peine d'encadrer et de corriger ce travail. Qu'il reçoive ici ma très profonde reconnaissance Au Docteur DANTHU Pascal, Directeur de Thèse, Coordinateur du programme de l'URP Forêts – Biodiversité au CIRAD – FORET, par les précieux conseils autant sur la technique que sur la rédaction ont permis l'accomplissement de ce mémoire. Qu'il trouve ici ma très haute considération Au Professeur RASOARAHONA Jean, Enseignant chercheur et Directeur de l'Ecole Supérieure des Sciences Agronomiques pour avoir accepter de rapporter ce travail. Qu'il reçoive ici l'expression de ma plus profonde gratitude Au Professeur Titulaire RAZANAMPARANY Louisette, Enseignant chercheur à la Faculté des Sciences, qui malgré ses nombreuses occupations, a bien voulu prendre la peine de rapporter ce travail. Qu’elle trouve ici mes sincères remerciements Au Docteur HDR SARTER Samira, qui malgré ses lourdes préoccupations a consacré beaucoup de ses précieux temps pour m’accueillir et me former au sein du laboratoire, pour l’encadrement, pour la collaboration et pour le soutien constant qu’elle m’a accordé pendant toutes ces années. Qu'elle trouve ici mes remerciements les plus chaleureux Mes vifs remerciements sont également adressés : Au Docteur REYNES Max, Docteur ODOUX Eric, Monsieur LEBRUN Marc, Chercheurs CIRAD-FLHOR maison de la technologie Montpellier, de m’avoir accueilli dans leur laboratoire et apporté ses compétences, précieux conseils dans les analyses par CPG/SM. Au Docteur HDR PETIT Thomas, Enseignant chercheur et Chef de département Génie Biologique, IUT ST Pierre, Université de La Réunion, de m’avoir encadré dans les analyses microbiologiques effectuées au sein du laboratoire de Chimie des Substances Naturelles et des Sciences des Aliments La Réunion. Au Mr RUEZ Philippe, Directeur de l’écloserie OSO Farming/LGA Ambovonaomby, qui a consacré beaucoup de temps pour m’initier et m’aider dans l’élevage larvaire et dans les tests en écloserie de crevettes. Au Personnel du département IAA, DBFA Au Personnel du FOFIFA – DRFP et du CIRAD – FORET Merci pour votre affection et votre soutien TABLE DES MATIERES Glossaire ............................................................................................................................... a Liste des abréviations ............................................................................................................ c Liste des figures .................................................................................................................... e Liste des tableaux ................................................................................................................. g Liste des annexes .................................................................................................................. i INTRODUCTION ................................................................................................................... 1 Partie I : Contexte général : Pôle d’Excellence Régional (PER) - Généralités sur les crevettes, sur le genre Cinnamosma et ses huiles essentielles ...................................... 5 I Présentation du projet « Pôle d’Excellence Régional (PER) » ................................. 5 I.1. Thématique retenue .............................................................................................. 5 I.2.Objectifs scientifiques ............................................................................................ 6 I.3. Objectifs partenariaux ........................................................................................... 6 II Généralités sur les crevettes pénéides .................................................................... 7 II.1. Systématique ....................................................................................................... 7 II.2. Etudes morphologiques ....................................................................................... 7 II.3. Sexualité .............................................................................................................. 9 II.4. Cycle de vie ......................................................................................................... 9 II.4.1. Fécondation et ponte ....................................................................................10 II.4.2. Développement larvaire ................................................................................10 a) Phase Nauplius ...........................................................................................10 b) Phase Zoé ...................................................................................................10 c) Phase Mysis ................................................................................................11 d) Phase de Post-larves ...................................................................................11 II.4.3. Juvéniles ......................................................................................................11 II.4.4. Adultes .........................................................................................................11 II.5. Répartition bathymétrique ...................................................................................13 II.6 Etapes d’élevage .................................................................................................14 II.6.1. Ecloseries .....................................................................................................14 a) Maturation ...................................................................................................14 b) Ponte et éclosion .........................................................................................14 c) Elevage larvaire ...........................................................................................14 II.6.2. Prégrossissement .........................................................................................15 II.6.3. Grossissement .............................................................................................16 II.7. La crevetticulture à Madagascar .........................................................................16 II.8. Maladies et stratégies de developpements .........................................................17 II.8.1. Maladies .......................................................................................................17
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