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Caractérisation Biochimique Et Moléculaire Des Souches De Bact

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Caractérisation Biochimique Et Moléculaire Des Souches De Bact Recherche de mol´eculesbioactives d'origine microbienne : caract´erisationbiochimique et mol´eculairedes souches de bact´eriesisol´eesdu Soumbala, du Bikalga et de certains yaourts consomm´esau Burkina Faso, productrices de bact´eriocines Essodolom Taale To cite this version: Essodolom Taale. Recherche de mol´eculesbioactives d'origine microbienne : caract´erisation biochimique et mol´eculairedes souches de bact´eriesisol´eesdu Soumbala, du Bikalga et de cer- tains yaourts consomm´esau Burkina Faso, productrices de bact´eriocines. Biologie mol´eculaire. Universit´eOuaga I Pr Joseph KI-ZERBO, 2016. Fran¸cais. <tel-01290941> HAL Id: tel-01290941 https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-01290941 Submitted on 19 Mar 2016 HAL is a multi-disciplinary open access L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destin´eeau d´ep^otet `ala diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publi´esou non, lished or not. The documents may come from ´emanant des ´etablissements d'enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche fran¸caisou ´etrangers,des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou priv´es. UNIVERSITÉ OUAGA I PR JOSEPH KI-ZERBO ……………… École Doctorale Sciences et Technologie ……………… Laboratoire : Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN) N° d’ordre…………./ THÈSE UNIQUE Présentée par Essodolom TAALE Pour obtenir le grade de Docteur de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO Option : Sciences Biologiques Appliquées Spécialité : Microbiologie-Biologie Moléculaire Sur le thème : Recherche de molécules bioactives d’origine microbienne : caractérisation biochimique et moléculaire des souches de bactéries isolées du Soumbala, du Bikalga et de certains yaourts consommés au Burkina Faso, productrices de bactériocines Soutenue publiquement, le 6 Février 2016 devant le Jury composé de : Président : Jacques SIMPORE, Professeur Titulaire en Biologie et Génétique Moléculaires, Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, Burkina Faso (Rapporteur) Membres : Alfred S. TRAORE, Professeur Titulaire en Biochimie-Microbiologie, Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, Burkina Faso (Directeur de thèse) ; Lamine Saïd BABA-MOUSSA, Professeur Titulaire en Biochimie et Biologie Moléculaire, Université d’Abomey-Calavi, Bénin (Rapporteur) ; Yaovi Agbékponou AMEYAPOH, Maître de Conférences en Microbiologie - Biochimie, Université de Lomé, Togo (Rapporteur) ; Aly SAVADOGO, Maître de Conférences en Biochimie-Microbiologie, Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, Burkina Faso. DÉDICACE A mes parents Professeur Elias Kodjo DonkorTAALE et Amah Grâce PAROU. Votre affection et votre soutien ont été déterminant dans la réalisation de ce travail. Soyez bénis. A Blandine, pour tout le bonheur que tu me procures. A mes fils Wiyao et Warou, vous êtes ma fierté. A mes frères et sœurs Recherche de molécules bioactives d’origine microbienne : caractérisation biochimique et moléculaire des souches de bactéries isolées du Soumbala, du Bikalga et de certains yaourts consommés au Burkina Faso, i productrices de bactériocines REMERCIEMENTS Ce travail a été réalisé au Centre de Recherche en Sciences Biologiques, Alimentaires et Nutritionnelles (CRSBAN), du département de Biochimie-Microbiologie, de l’Unité de Formation et de Recherche en Sciences de la Vie et de la Terre (UFR-SVT), de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI- ZERBO (Burkina Faso) avec la collaboration du Laboratoire de Biologie et de Typage Moléculaire en Microbiologie, du département de Biochimie et Biologie Cellulaire, de la Faculté des Sciences et Techniques, de l’Université d’Abomey-Calavi (Bénin). Au terme de ce travail, nos remerciements vont : Au Pr Alfred S. TRAORE, Professeur Titulaire en Biochimie – Microbiologie à l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, responsable pédagogique de la formation Doctorale en Biotechnologies, Président du Réseau Ouest Africain de Biotechnologies (RA-BIOTECH), Directeur du CRSBAN et Directeur de cette thèse, pour nous avoir accueilli dans son centre et nous avoir offert l’opportunité de faire nos premiers pas dans la recherche scientifique. Hommages respectueux ; Au Dr Aly SAVADOGO, Maître de Conférences en Biochimie – Microbiologie au département de Biochimie – Microbiologie à l’UFR-SVT de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, pour avoir suivi ce travail, pour sa disponibilité, pour ses multiples conseils et son appui moral, pratique et théorique. Veuillez trouver ici, l’expression de mes sincères reconnaissances. Merci d’avoir accepté de sièger dans ce jury comme membre ; Au Pr Jacques SIMPORE, Professeur Titulaire en Génétique et en Biologie Moléculaire à l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO (Burkina Faso) pour avoir accepté d’être rapporteur et président de jury de cette thèse et pour aussi m’avoir accordé l’opportunité de suivre les techniques de séquençage au CERBA (Centre de Recherche Biomoléculaire Pietro Annigoni) ; Au Pr Nicolas BARRO, Professeur Titulaire en Biochimie – Microbiologie, Vice-président chargé des Enseignements et des Innovations pédagogiques de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI- ZERBO et responsable du LABESTA (Laboratoire de Biologie Moléculaire, d'Epidémiologie et de Surveillance des Bactéries et Virus Transmissible par l’Eau et les Aliments) de l’UFR-SVT de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO. Toutes nos reconnaissances pour votre soutien et vos conseils tout au long de cette étude ; Recherche de molécules bioactives d’origine microbienne : caractérisation biochimique et moléculaire des souches de bactéries isolées du Soumbala, du Bikalga et de certains yaourts consommés au Burkina Faso, ii productrices de bactériocines Au Dr Cheikna ZONGO, Maître-Assistant en Biochimie – Microbiologie au Département de Biochimie – Microbiologie de l’UFR-SVT de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, pour ses encouragements, ses conseils et ses soutiens multiformes depuis le DEA jusqu’à l’aboutissement de cette thèse et le temps consacré à la lecture et à la correction de cette thèse. Qu’il trouve ici l’expression de ma reconnaissance ; Au Dr Marius K. SOMDA, Assistant en Microbiologie – Biotechnologie au Département de Biochimie – Microbiologie de l’UFR-SVT de l’Université Ouaga I Pr Joseph KI-ZERBO, pour ses encouragements, ses conseils et ses soutiens multiformes depuis le DEA jusqu’à l’aboutissement de cette thèse. Qu’il trouve ici l’expression de ma reconnaissance. Toute ma reconnaissance à tous les enseignants du CRSBAN pour l’enseignement de qualité qu’ils ne cessent de dispenser afin que les sociétés africaines arrivent à intégrer les biotechnologies comme facteur incontournable d’un développement durable et efficace. Mes remerciements s’adressent aussi : Au Pr Lamine Said BABA-MOUSSA, Professeur Titulaire en Biochimie, Microbiologie et Biologie Moléculaire, Directeur du Laboratoire de Biologie et de Typage Moléculaire en Microbiologie du Département de Biochimie et de Biologie Cellulaire, de la Faculté des Sciences et Techniques (FAST) de l’Université d’Abomey-Calavi (Bénin), pour m’avoir accueilli dans son laboratoire pour la PCR, le Séquençage partiel du gène 16S rRNA des souches de Lactobacillus et la bioinformatique. Merci professeur d’avoir accepté d’être rapporteur de cette thèse et membre du jury. Cher Professeur, veuillez accepter toute notre reconnaissance ; Au Dr Yaovi Agbékponou AMEYAPOH, Maître de Conférences en Microbiologie – Biochimie à l’Ecole Supérieure des Techniques Biologiques et Alimentaires (ESTBA) de l’Université de Lomé (Togo) pour avoir accepté d’être rapporteur et membre de jury de cette thèse. Veuillez accepter toute notre reconnaissace. Toute ma reconnaissance va au Dr Simplice KAROU, Maître de Conférence en Biochimie à l’ESTBA (Ecole Supérieure des Techniques Biologiques et Alimentaires) de l’Université de Lomé pour ces encouragements, son soutien et pour m’avoir permis de découvrir le CRSBAN. Recherche de molécules bioactives d’origine microbienne : caractérisation biochimique et moléculaire des souches de bactéries isolées du Soumbala, du Bikalga et de certains yaourts consommés au Burkina Faso, iii productrices de bactériocines Je tiens à exprimer ma profonde gratitude aux Messieurs et Mesdames suivants pour leurs disponibilités et leurs conseils : Dr François TAPSOBA ; Dr Joseph SAWADOGO, Dr Gertrude BSADJO TCHAMBA, Adama SAWADOGO, Fulbert GUIRA, Serge KOUHOUNDE, Valéry BAZIE, Désiré TRAORE, Benoît TRAORE et Bakary TARNAGDA. Aux Dr Abdel Haziz SINA OROU, Maître Assistant en Biochimie et Biologie Moléculaire et Dr Pacôme A. D. NOUMAVO, Assistant au Laboratoire de Biologie et de Typage Moléculaire en Microbiologie du Département de Biochimie et Biologie Cellulaire, de la Faculté des Sciences et Techniques (FAST) de l’Université d’Abomey-Calavi (Bénin), pour tous leurs soutiens et assistances. Je tiens à remercier Marius Durand DAH NOUVLESSOUNON et son épouse Michaelle CHOKKI et Christine N’TCHA et son époux Gildas BOKO, ainsi que leur famille respective, pour l’accueil qu’ils m’ont réservé et pour la chaleur familiale qu’ils m’ont permis d’avoir tout au long de mon séjour à Abomey-Calavi (Bénin). Mes remerciemments vont également à tous les étudiants en Master et doctorants du Pr Lamine Said BABA-MOUSSA. J’espère que c’est le début d’une longue et fructueuse collaboration. Aux Dr Issiaka SOULAMA (Responsable du laboratoire de Biologie Moléculaire) et Mr Samuel S. SÉRÉMÉ (Responsable de l’Unité de Parasitologie Moléculaire)
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