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Thèse Kamel Cherif.Pdf

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Thèse Kamel Cherif.Pdf الجمھوریة الجزائریة الدیمقراطیة الشعبیة وزارة التعلیم العالي والبحث العلمي جامعة فرحات عباس سطیف Université Ferhat Abbas-Setif 1 1 كلیة علوم الطبیعة والحیاة Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie N°……/SNV/2014 Département de Biochimie THESE Présentée par: CHERIF Kamel En vue de l’obtention du diplôme de : Doctorat en Sciences Option: Biochimie THEME : ETUDE ECO-EPIDEMIOLOGIQUE DE LA LEISHMANIOSE CUTANEE DANS LE BASSIN DU HODNA (M’SILA) Soutenue publiquement le 81/60/2014 Devant le jury Président : Pr ARRAR Lekhmici Professeur Université Sétif 1 Rapporteur : Pr Hamdi Cherif Mokhtar Professeur Université Sétif 1 Examinateurs : Pr Si Bachir Abdelkrim Professeur Université Batna Pr Ait Hamouda Rabeh Professeur Université Batna . Année universitaire 2013-2014 Remerciements Je remercie le bon dieu et je lui rends grâce de m’avoir donné foi et volonté ; Je tiens à remercier, tous ceux qui m’ont aidé par la volonté de dieu et en particulier ; Monsieur Hamdi Cherif Mokhtar qui a inspiré l’idée du sujet de cette thèse et pour tout le temps et l’intérêt qu’il a consacré à mon travail Je remercie vivement monsieur Arrar Lekhmissi d’avoir bien voulu présidé le jury de cette thèse Je remercie très sincèrement, Messieurs : Ait Hamouda Rabeh et Si Bachir Abdelkrim pour avoir accepté d’examiner ce travail et pour l’honneur qu’ils m’ont fait en participant au jury de cette thèse A monsieur Boudrissa Abdelkrim et Harrat Zoubir pour m’avoir aidé dans la réalisation de ce travail Un grand merci s’adresse à tous ceux qui m’ont aidé de près ou de loin à mener à bien ce travail Résumé Les leishmanioses cutanées sont des maladies parasitaires touchant l’homme et les animaux dont certains sont des réservoirs. Les activités humaines sont parmi les causes de leur recrudescence .La lutte contre cette parasitose repose sur des stratégies régionales intégrées englobant tous les pays endémiques. Les systèmes d’information géographiques utilisés dans notre étude sont des outils pratiques pour la surveillance et le contrôle de ces maladies. Dans cette étude nous avons mené une approche à deux échelles, une régionale qui a intéressé le bassin du Hodna et une autre locale à l’échelle urbaine dans la ville de Bou Saada ; les résultats obtenus ont confirmé le rôle des facteurs environnementaux dans l’expression de la maladie et la distribution des phlébotomes vecteurs et des rongeurs réservoirs. Mots clés : Leishmanioses, phlébotomes, bassin , M’sila , SIG , Télédétection , TUP à Himo Summary The cutaneous leishmanioses are man and animals parasitic diseases . the human activities are among the causes of their recrudescence . the fight against this parasitosis rests on integrated regional strategies including all the endemic countries. The geographical information systems used in our study are used more and more in the monitoring and the control of these diseases. The approach that carried out is interested in two scales (regional and urban) (basin of Hodna). The results have advanced the role of the climatic conditions for the maintenance of the disease and the spatial distribution of rodents and sandflies. Keywords: Leishmaniasiss, sandfly, M’sila , basin , GIS , Remote sensing, TUP à Himo ملخص داء الليشمانيات مرض يُسببه أحد الطفيليات اﻷوالي من جنس الليشمانية التي تتكاثر عند اﻻنسان و بعض الفقاريات التي تصبح بمثابة مستودعات للمرض. أن أسباب انتشاره متعددة منها اﻷنشطة البشرية وقد أوضح تحليل استراتيجيات الوقاية من هذا المرض في الجزائر وفي غيره من البلدان المغاربية مدى الحاجة ﻻتخاذ تدابير إقليمية متكاملة للمكافحة في جميع بلدان اﻹقليم. تم استعمال نظام المعلومات الجغرافية واﻻستشعار عن بعد لتتبع تطور المرض زمكانيا وإنجاز خرائط اﻻختطاربمنطقة الحضنة (الجزائر). تمت هذه الدراسة حسب بعدين : البعد اﻷول على المستوى الحضري يخص مدينة بوسعادة كحاضرة مهددة بهذا المرض وبعد اخر إقليمي يشمل حوض الحضنة عبر سبع وﻻيات. وقد بينت هذه الدراسة ان للعوامل البيئية الناجمة عن فعاليات اﻻنسان و كذا العوامل المناخية والغطاء النباتي دور رئيسي في التوزع الجغرافي للفاصدات و الخازنات التي هي السبب في توطن المرض. الكلمات المفتاحية: الليشمانيا ، الفواصد، الحوض، المسيلة ، نظم المعلومات الجغرافية، اﻻستشعار عن بعد، برنامج اﻻشغال اليدوية المكثفة Sommaire SOMMAIRE Remerciements Liste des abréviations Liste des figures Liste des tableaux INTRODUCTION ……………………………………………………… 1 CHAPITRE 1 : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE ………………… 4 1. Historique …………………………………………………………… 4 2. Les Leishmanioses dans le monde …………………......... 8 2.1. Leishmaniose Viscérale de l’Ancien Monde ……………… 10 2.2. Leishmaniose Cutanée de l’ancien Monde …………….... 12 2.3. Leishmaniose des muqueuses de l’Ancien Monde ………….... 14 2.4. Leishmaniose cutanée diffuse de l’Ancien Monde ……….... 14 2.5. Leishmaniose viscérale du Nouveau Monde …………………. 14 2.6. Leishmaniose cutanée du Nouveau Monde ………………… 15 2.7. Leishmaniose cutanée diffuse du Nouveau Monde ………… 16 2.8. Leishmaniose cutanée disséminée du nouveau Monde……….. 16 2.9. Leishmaniose dermique post-kala-azar ……………………. 16 2.10. Concomitance infestation leishmanienne et infection VIH …. 17 3. Les Leishmanioses en Algérie ……………………………….. 17 3.1. Leishmaniose Cutanée sporadique du Nord……………….... 17 3.2. Leishmaniose Viscérale Zoonotique ………………………. 18 3.3. Leishmaniose Cutanée Zoonotique ……………………….… 18 3.4. Leishmaniose Cutanée Anthroponotique …………………….. 18 4. Leishmaniose Cutanée Zoonotique du bassin du Hodna …………. 19 4.1. Historique de la L C Z dans le bassin du Hodna …………... 19 4.2. Epidémiologie ………………………………………………… 20 4.2.1. Parasite ………………………………………………..…. 20 4.2.2. Phlébotome vecteur ………………………………. 22 4.2.2.1. Importance médicale………………………….. 22 4.2.2.2. Liste des phlébotomes d’Algérie…………….. 23 4.2.2.3. Biologie …………………………………… 24 4.2.3. Réservoirs anthropiques ………………………….. 29 4.2.3.1. Réservoirs zoonotiques ………………………. 29 4.3. Cycle épidémiologique …………………………………. 30 5. IMPACT DE L’ENVIRONNEMENT SUR LA LCZ ……………….. 31 5.1. Impacts de l’environnement sur les rongeurs …………….. 32 5.2. Impact de l’environnement sur les phlébotomes ………… 32 Application du système d’information géographique et de la 36 télédétection dans l’étude de l’évolution des maladies vectorielles 1. Introduction ……………………………………………………… 36 2. Importance et intérêt de la télédétection et (SIG) en épidémiologie 36 Sommaire 2.1. Application dans l’épidémio surveillance des leishmanioses ……. 42 Urbanisation et santé …………………………………………………. 44 1. Définition de l’urbanisation: …………………………………... 44 2. L’urbanisation en Algérie ……………………………………... 44 3. Tendances de l’urbanisation …………………………………… 46 4. La dynamique de l’urbanisation………………………………. 47 5. Conséquences de l’étalement urbain ………………………… 48 6. Déterminants épidémiologiques………………………………. 49 Chapitre II : Techniques d’identification des leishmanies …………… 52 1.1 Techniques d’identification : …………………………………. 52 1.2. l'utilisation de l'ADN …………………………………….…… 52 1.3.Identification moléculaire par PCR…………………………… 53 1.4. Identification enzymatique…………………………………… 53 1.4.1. Rappels biochimiques…………………………….….... 53 1.4.1.1. Les enzymes …………………………………….. 53 1.4.1.2. les isoenzymes ………………………………..… 54 CHAPITRE III ZONE D’ETUDE ………………………………………….………. 56 1. Présentation de la zone d’étude………………………………. 56 2. Structure physique du Hodna ………………………………... 57 3. Géologie …………………………………………………….. 59 4. Hydrologie …………………………...….………………….. 60 5. Climat ……………………………………..……………….…. 61 5.1. Précipitations ………………………………………… 61 5.2. Grêle de neige ……………………………………..…. 61 5.3. Températures ………………………………………… 62 5.4. Humidité relative……………………………………… 62 5.5. Classification bioclimatique ………………………... 62 6. Formations Végétales du Hodna ……………………………... 64 7. Données socio-économiques ………………………………….. 65 7.1. Indicateurs économiques ……………………………... 65 7.2. Caractéristiques démographiques…………………...... 66 CHAPITRE IV : MATERIELS ET METHODES …………………… 67 1. Etude épidémiologique …………………………………………. 67 1.1. Collecte des données……………………………………… 67 1.2. Enquêtes épidémiologiques………………………………. 67 1.2.1. Enquête épidémiologique rétrospective ………………. 67 1.2.2. Enquête épidémiologique au niveau urbain …………. 67 1.2.2.1 Sectorisation de la ville ………………………… 69 1.2.2.2 . Réalisation d’une fiche d’enquête…………… 70 1.3. Etude du réservoir …………………………………………. 70 Sommaire 1.3.1. Prospection …………………………………………. 70 1.3.2. Echantillonnage ………………………………….. 70 1.3.3. Traitement des captures ……………………………. 72 1.4. Etude entomologique ……………………………………… 72 1.4.1. Choix des stations ……………………………………… 72 1.4.2. Technique d’échantillonnage ………………………….. 73 1.4.3. Montage et conservation des phlébotomes ……………. 75 1.5. Etude du parasite………………………………………….. 75 1.5.1. Techniques de prélèvement …………………………….. 75 1.5.2. Technique d’identification (typage iso enzymatique)…. 76 1.5.2.1. Systèmes enzymatiques ………………………… 76 1.6. Analyse statistique………………………………………… 77 1.6.1. Utilisation des indices écologiques…………………… 77 1.6.2. Statistiques multi variées ……………………………… 78 1.6.3. Géostatistique………………………………………….. 78 2. Etude cartographique ……………………………………………. 80 2.1. Collecte des cartes et images …………………………….. 80 2.2. Traitement des images et cartes …………………………… 80 2.2.1. Cartographie paysagère………………………………… 80 2.2.2. Cartographie épidémiologique ………………………… 81 2.2.2.1. Description de la méthode………………………. 81 2.2.2.2. Raison du choix ………………………………… 82 2.3. Carte de répartition des réservoirs ………………………… 83 2.4. Carte de répartition des phlébotomes vecteurs ……………. 83 3. Méthode de lutte contre la leishmaniose cutanée ……………….. 83 3.1. Zone d’étude ………………………………………………. 83 3.2. Données épidémiologiques……………………………….… 84 3.3. Choix des communes…………………………………….…. 85 3.4. Méthodes de lutte ………………………………………...… 86 3.4.1.
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