Manuscrit Thèsejanv18
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UNIVERSITE D’AIX-MARSEILLE Faculté des sciences de Luminy Institut Méditerranéen d’Océanologie Thèse de Doctorat de l’Université d’Aix-Marseille Spécialité : océanographie Analyse de la diversité et de la structuration spatio- temporelle des assemblages démersaux dans la zone économique exclusive mauritanienne Ecole Doctorale des Sciences de l’Environnement Manuscrit de thèse présenté par Saïkou Oumar KIDE Soutenue le 11 avril 2018 JURY Pr. Patrice FRANCOUR (Université de Nice - UMR ECOMERS) Rapporteur Dr. Didier JOUFFRE (IRD - UMR MARBEC) Rapporteur Dr. Mireille HARMELIN (CNRS Marseille, UMR MIO) Examinatrice Dr. Sandrine RUITTON (Université Aix-Marseille, UMR MIO) Examinatrice Monique SIMIER (IRD – UMR MARBEC) Invitée Dr. Claude MANTE (CNRS Marseille, UMR MIO) Directeur de thèse Dr. Bastien MERIGOT (Université de Montpellier, UMR MARBEC) Co-Directeur de thèse II Dédicaces Je dédie cette thèse à mes parents qui m’ont accompagné durant les premières années de mon scolarité, le soutien moral et les prières dont ils m’ont accompagné. À la mémoire de mon oncle Kidé Abou Yéro qui a été le principal artisan qui m’a donné la motivation dans les études. Dès les premières années du primaire à Kaédi (1979), tu as été la personne qui a eu confiance à mes aptitudes. En 1985, de ton retour des USA (Idaho, formation en Entomologie) la satisfaction que tu avais sur mes résultats de la classe de 6 ème et cela m’a encore boosté de plus. En classe de terminal, je me devais de t’offrir cette réussite en première session du baccalauréat, ce qui fît fait et combien aussi tu étais comblé de joies et de satisfactions. La Maîtrise et le Master II, ne dérogent pas à la règle ta fierté pour ma réussite était toujours là. J’aurais souhaité t’honorer de cette réussite, Allah en a décidé autrement, toutes mes pensées à toi et paix à ton âme. Je dédie spécialement cette thèse à ma famille, à mon épouse Bintou Koumé qui a dû supporter des épreuves difficiles lors de cette période de reprise d’études, malgré toute la durée de mes séjours hors du domicile familial, elle a été mon premier soutien et a comblé le vide que je laisse derrière moi. À mes enfants, Hawa “la Sage”, Fatimata “la Shark Specialist”, Amadou “l’Hyper-actif” et Abou “le P’tit malin” ; je vous dédie cette thèse tout en vous rappelant que ce sacrifice je l’ai fait pour vous et vous demande d’en faire autant dans vos études. Je serais là pour vous assister moralement, financièrement et je ne ménagerais aucun effort pour la réussite dans vos études. Je vous cite en exemple le poème de Jean de la Fontaine : Travaillez, prenez de la peine : C’est le fonds qui manque le moins. …………………………………….. Que le travail est un trésor. Comme j’ai l’habitude de le dire seul le travail paie, croyez-en vous, en vos capacités et ne vous influencez par d’autres dans le sens négatif. La balle est dans votre camp pour me satisfaire et me rendre heureux dans vos réussites futures, Inchallah. I Remerciements Je tiens à exprimer mes sincères remerciements à la direction de ma thèse, Dr. Claude Manté et Dr. Bastien Mérigot pour avoir pris le temps et la patience de diriger cette thèse et surtout pour leurs conseils et soutiens. Je suis très honoré à remercier par leur présence et qui ont accepté de se déplacer depuis Nice et Montpellier pour faire partie du jury de cette thèse, ainsi que tous les membres du jury: Monsieur Patrice Francoure et Mr Didier Jouffre en qualité de rapporteurs pour le temps consacré à la lecture de cette thèse, les suggestions et les remarques judicieuses qu’ils m’ont soulignées. Madame Mireille Harmelin d’avoir accepté d’être présidente du jury, en étant aussi examinatrice, Mme Sandrine Ruitton en sa qualité d’examinatrice et Mme Monique Simier, l’honorable invitée. Les expertises et les connaissances dans divers domaines des sciences de l’environnement, sur la structure et la dynamique des populations marines des membres de ce jury ont grandement contribué à la qualité des discussions. La version finale de cette thèse a bénéficié de leur lecture très attentive et de leurs remarques pertinentes. Je tiens à les assurer de ma profonde reconnaissance pour l’intérêt qu’ils portent à ce travail. Je tiens aussi à remercier le Service de Coopération et d’Action Culturelle (SCAC) de l’Ambassade de France à Nouakchott, qui a été le premier contributeur au financement de cette thèse. Toutes ces personnes que j’ai eu à contacter physiquement ou par courriel et qui n’ont ménagé aucun effort pour rendre mes séjours les meilleurs possibles, qu’elles trouvent toute ma reconnaissance, ma gratitude et ma joie de vous connaître durant toute cette période, à Mr. Olivier Bergossi, à Mme Véronique Yatera et à Mme Fatimata Dem du SCAC et à Mme Thomont Betina de Campus France à Marseille et tant d’autres ; merci du fond du cœur. Je tiens aussi à remercier l’ensemble du personnel de l’Institut Méditerranéen d’Océanographie (MIO) et particulièrement à l’équipe Ecologie Marine et Biodiversité pour leur accueil parmi eux. De nombreux autres membres du MIO, qui ont contribué de diverses manières directement ou indirectement à cette recherche et à mon plaisir de mon doctorat, à mes côtés. À cette fin, je voudrais remercier Richard Sempère, Jean-Christophe Poggiale, David Nerini, Mathias Gauduchon, Jean Blanchot, Elvira Poulido, Christelle Chevalier et Thomas Changeux. Le Service Informatique pour leur assistance et aide technique, mes sincères remerciements à Mrs Maurice Libes et Christophe Yohia. Le service administratif, à Pascal II Lessage, Aurelia Lozingot, Dominique Poirot et Brigitte Panta, et à Dominique Estival de la Scolarité. Mes sincères remerciements à Monsieur M. Med M’Bareck O. Soueilim pour sa reconnaissance et sa patience pour le temps qui m’a été accordé pour finaliser ce travail. Il a accompagné financièrement du début et jusqu’à l’aboutissement de cette thèse. Honneur à M. Mohamed El Hafedh Ejiwen le Directeur de l’Institut Mauritanien de Recherches Océanographiques et des Pêches, qui n’a ménagé aucun effort pour la finalisation de ce travail dans de bonnes conditions. A Monsieur Mohamed Moustapha Bouzouma Directeur adjoint et à tout le staff de la Direction de l’IMROP. En qualité de collègues exceptionnels, je ne saurais passer sous silence les souhaits formulés pour la réussite de cette thèse à savoir Dr. Khallahi Brahim, Dr. Abdoulaye Wagué, Abdou Daïm Dia, Mohamedou Fah, Hamoud Taleb. J’ai pu apprécier le dynamisme et l’éfficacité de M. Cheikh Hejbou, le personnel du service de la comptabilité dans le traitement de mes dossiers de formation et à ma grande sœur Aissata Djiby Sall pour son réconfort moral. Mes remerciements les plus sincères à mes collègues de l’Institut Mauritanien de Recherches Océanographiques et des Pêches, Dr Kane Elimane Abou, Dr Khairdine Med Abdallahi, Med Salem Haidalla, Sall Amadou, Bâ Birane Mamadou, N’Diaye Abdoulaye pour leurs encouragements. Le personnel du Laboratoire d’Evaluation des Ressources Vivantes et Aquatiques et du Centre de Documentation pour leur aide remarquable et combien utile. Mes remerciements s’adressent également à tous les chercheurs, techniciens qui ont contribué à un aspect quelconque de la présente étude de la collecte, à la validation, au stockage des données et spécialement à mon cher Yeslem Vally qui m’a été d’une aide précieuse pour la réalisation des cartes. Que mes collègues Dr. Dia Mamadou, Diagne Ahmed, Sakho Cheikh Ibrahima, Dr. Dia Abdoul et Dr. Beyah Meissa croient à ma profonde reconnaissance et sympathie pour leurs encouragements et leur aide morale qui m’ont été très utiles. Je remercie sincèrement tous les collègues du Laboratoire de Biologie et Ecologie des Organismes Aquatiques et ceux du Laboratoire d’Etudes des Milieux Marins et Côtiers. Je n’oublie pas aussi la communauté mauritanienne à Marseille qui m’ont aussi apporté amours et réconforts à des moments difficiles lors de mes séjours. Mes sincères remerciements à Sédima Oumar Mané, Djiby Sall dit Bill, Boubou Sakho, Mamadou Sylla et Boubacar Soumaré. A mon frère Mokhtar Abdoul Dia et toute la petite communauté de Niabina à Nice, je vous remercie du fond du cœur pour vos soutiens. III A mon cher ami Ali Samba Bâ et sa famille, qui sait le sens de l’amitié depuis l’enfance et jusqu’à présent. Parcourir de longues distances en laissant derrière toi toute seule ta famille et uniquement pour me soutenir dans mes projets d’étude, merci du fond du cœur. A mon grand frère Amadou Kidé, à mes frères Mohamed El Hebib Kidé et Souleymane Kidé, à notre sœur Néné Gallé Kidé, tous les parents et aux amis, qu’ils trouvent ma reconnaissance et ma gratitude pour leurs soutiens directs ou indirects. Enfin, je ne saurais terminer ce préliminaire sans évoquer l’appui moral de mes parents (Kidé Mamadou Yéro et Guissé Hawa Demba), combien si fort de votre part, de vos bénédictions et de vos souhaits ardents de me voir toujours plus grand. IV I Sommaire Sommaire Dédicaces ................................................................................................................ I Remerciements ..................................................................................................... II Sommaire ........................................................................................................... VII Liste des abréviations .................................................................................... XVIII Liste des tableaux ............................................................................................. XXI Liste des figures ............................................................................................