Taxonomia
• Visa classificar em grupos de acordo com propriedades físicas e químicas comuns
• Vírus no mesmo grupo frequentemente tem propriedades biológicas semelhantes: – Replicação – Doença não! (cuidado!) – Transmissão Classificação definida pelo:
Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV)
ICTVdB - The Universal Virus Database (acesso fácil na Internet)
International Committee on Taxonomy of Viruses A classificação dos vírus é politética
• “Tem em comum muitas características, mas nenhuma em particular é essencial para a inclusão de determinado vírus em um taxon”. Classificação viral Estrutura (morfologia): Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade
Taxonomia
Ordem: ... virales Família ... viridae Subfamília ... virinae Espécie/Gênero: ... virus Ordens
Seis ordens estebelecidas até o presente pelo ICTV:
Caudovirales bacteriófagos com cauda
Herpesvirales vírus herpes de eucariotos
Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais .
Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados.
Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais.
Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas. Como se escreve?
Exemplos:
1. Família Poxviridae, sub-família Chordopoxvirinae, gênero Orthopoxvirus, vírus vaccínia.
2. Família Herpesviridae, sub-família Alphaherpesvirinae, gênero Simplexvirus, herpes vírus humano 2 (vírus do herpes simples 2).
3. Família Picornaviridae, gênero Enterovirus, poliovírus 1.
4. Ordem Mononegavirales, Família Rhabdoviridae, gênero Lyssavirus, vírus da raiva.
No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado. Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus.
Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV
Classificação de Baltimore
ss= fita simples ds= fita dupla
(+) polaridade posirtiva (- ) polaridade negativa
Vírus DNA
com envelope sem envelope
Adeno Anelo Herpes Parvo Hepadna Papiloma Irido Polioma Pox Vírus com DNA Exemplos (nomes Vírion Família Simetria Capsídeo Tipo ácido nucléico Grupo (Baltimore) comuns) nú/envelopado Adenovirus, 1.Adenoviridae Infectious canine nú Icosaédrico ds I hepatitis virus 2.Papillomaviridae Papillomavirus nú Icosaédrico ds circular I Parvovirus B19, 3.Parvoviridae nú Icosaédrico ss II Canine parvovirus Herpes simplex virus, varicella- 4.Herpesviridae zoster virus, Envelopado Icosaédrico ds I cytomegalovirus, Epstein-Barr virus Smallpox virus, cow pox virus, 5.Poxviridae sheep pox virus, orf Complexo Complexo ds I virus, monkey pox virus, vaccinia virus circular, 6.Hepadnaviridae Hepatitis B virus Envelopado Icosaédrico parcialmente dupla VII fita Polyoma virus; JC virus (progressive 7.Polyomaviridae multifocal nú Icosaédrico ds circular I leukoencephalopath y) 8.Anelloviridae Torque teno virus nú Icosaédrico ss circular II Vírus RNA
com envelope sem envelope
Arena Picorna Arteri Reo Astro Borna Bunya Calici Corona Filo Flavi Ortomixo Paramixo Rhabdo Toga
Examples (common Capsid Capsid Virus Family Nucleic acid type Group names) Nú/Envelopado Symmetry 1.Reoviridae Reovirus, Rotavirus Nú Icosaédrico ds III Enterovirus, Rhinovirus, Hepatovirus, Cardiovirus, Aphthovirus, Poliovirus, 2.Picornaviridae Nú Icosaédrico ss IV Parechovirus, Erbovirus, Kobuvirus, Teschovirus, Coxsackie 3.Caliciviridae Norwalk virus Nú Icosaédrico ss IV 4.Togaviridae Rubella virus Envelopado Icosaédrico ss IV Lymphocytic 5.Arenaviridae Envelopado Complexo ss(-) V choriomeningitis virus Dengue virus, Hepatitis C 6.Flaviviridae Envelopado Icosaédrico ss IV virus, Yellow fever virus Influenzavirus A, Influenzavirus B, 7.Orthomyxoviridae Envelopado Helicoidal ss(-) V Influenzavirus C, Isavirus, Thogotovirus Measles virus, Mumps virus, Respiratory 8.Paramyxoviridae syncytial virus, Rinderpest Envelopado Helicoidal ss(-) V virus, Canine distemper virus California encephalitis 9.Bunyaviridae Envelopado Helicoidal ss(-) V virus, Hantavirus 10.Rhabdoviridae Rabies virus Envelopado Helicoidal ss(-) V 11.Filoviridae Ebola virus, Marburg virus Envelopado Helicoidal ss(-) V 12.Coronaviridae Corona virus Envelopado Helicoidal ss IV 13.Astroviridae Astrovirus Nú Icosaédrico ss IV 14.Bornaviridae Borna disease virus Envelopado Helical ss(-) V Arterivirus, Equine 15.Arteriviridae Envelopado Icosaédrico ss IV Arteritis Virus 16.Hepeviridae Hepatitis E virus Nú Icosaédrico ss IV CIRCOVIRIDAE VÍRUS DNA
PARVOVIRIDAE
ADENOVIRIDAE PAPOVAVIRIDAE
HERPESVIRIDAE
HEPADNAVIRIDAE POXVIRIDAE Vírus DNA
com envelope sem envelope
Adeno Anelo Asfar Parvo Herpes Papiloma Hepadna Polioma Irido Pox Família Asfarviridae
• Gênero: Asfivírus: – Vírus da peste suína Africana – Somente infecta suídeos – Interesse veterinário Ordem Herpesvirales Família Herpesviridae • Subfamílias: • Alfaherpesvirinae – Simplexvirus HHV-1, BHV-1, BHV-5 – Varicellovirus HHV-3 – Não classificado (Doença de Marek das aves) – Nâo classificado (Laringotraqueíte das aves) Família Herpesviridae
• Subfamília: Betaherpesvirinae – Cytomegalovirus HHV-5 – Muromegalovirus MCMV-1 – Roseolovirus HHV-6 Família Herpesviridae
• Subfamília: Gammaherpesvirinae – Lymphocryptovirus HHV-4 (vírus Epstein Barr, EBV) – Rhadinovirus
HEPADNAVIRIDAE
- fita dupla parcial de DNA - envelopado, pleomórfico - transcrição reversa
2 gêneros: - Ortohepadnavirus: Hepatite B (humanos) - Avihepadnavirus (aves)
Iridoviridae
POXVIRIDAE
- os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm) - simetria complexa - DNA duplo (codifica > 100 prots) - multiplicação intracitoplásmica
Varíola Molusco contagioso Ectima dos ovinos Vários outros poxvírus Varíola Vírus Cantagalo- um poxvírus semelhante ao vírus vaccinia
An Emergent Poxvirus from Humans and Cattle in Rio de Janeiro State: Cantagalo Virus May Derive from Brazilian Smallpox Vaccine. Damaso et al, Virology 277, 439±449 (2000) Clarissa R. A. Damaso,* Joseph J. Esposito,§ Richard C. Condit,¶ and Nissin Moussatche *, Vírus DNA
com envelope sem envelope
Adeno Anelo Herpes Circo Hepadna Parvo Irido Papiloma Pox Polioma
ADENOVIRIDAE
- icosaédricos - não envelopados - DNA dupla fita linear - potencial oncogênico (inativam p53 e pRb)
Gêneros: - Mastadenovírus (em mamíferos) - Aviadenovírus (em aves)
Anelloviridae
Anellovirus Virus classification
Group: Group II (ssDNA)
Family: Anelloviridae
Genera Alphatorquevirus Betatorquevirus Gammatorquevirus Deltatorquevirus Epsilontorquevirus Etatorquevirus Iotatorquevirus Thetatorquevirus Zetatorquevirus Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples
circovírus suínos ( e outros)
Circoviridae Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros)
parvovírus canino-2 Parvoviridae vírus da panleucopenia felina parvovírus suíno parvovírus humano (B19) Família Circoviridae
Menores vírus com genoma DNA
- DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV) - simetria icosaédrica - Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia, Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros similares em diversas espécies) Família Circoviridae
Menores vírus com genoma DNA
- DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV) - simetria icosaédrica - Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia, Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros similares em diversas espécies) Circovírus
Torque teno Circovírus suíno (PCV) Descoberta de um novo agente : Girovírus das aves tipo 2 • Discovery of a genome of a distant relative of chicken anemia virus reveals a new member of the genus Gyrovirus.
Franciscus A. M. Rijsewijk, Helton F. dos Santos, Thais F. Teixeira, Samuel P. Cibulski, Ana Paula M. Varela, Diogenes Dezen, Ana Cláudia Franco, Paulo M. Roehe.
Publicado em: Archives of Virology, 2011 • DOI 10.1007/s00705-011-0971-6 PARVOVIRIDAE
- DNA fita simples - não envelopados (15-25 nm)
3 gêneros: Parvovirus (MVM) Erythrovirus (B19) Dependovirus
Eritema infeccioso Parvovirose canina, suína
Famílias de vírus com genoma de DNA de fita dupla Papilomaviridae papilomavírus > 70 Poliomaviridae adenovírus >40 Adenoviridae Herpes simples Herpesviridae Varicela-zoster Epstein-Barr Poxviridae poxvírus (em quase todas as espécies) PAPILOMAVIRIDAE
- DNA fita dupla circular - Sem envelope - Vários associados a cânceres
Papilomavírus: - verrugas (>70) - condiloma acuminado - NIC - epidermodisplasia verruciforme
POLIOMAVIRIDAE
- DNA fita dupla circular - Sem envelope - Importância em imunocomprometidos
Poliomavirus: BK, JC (leucoencefalopatia multifocal progressiva) Vírus RNA
com envelope sem envelope
Arena Birna Arteri Picorna Astro Reo Borna Bunya Calici Corona Filo Flavi Ortomixo Paramixo Rhabdo Toga
Grupo IV: RNA (+) fs Ordem: Nidovirales Família: ARTERIVIRIDAE
Vírus da arterite equina Vírus da PRRS Vírus elevador da lactato dehidrogenase
Família ASTROVIRIDAE Gênero: Astrovírus
- RNA fs, nús 20-30 nm - encontrados em fezes - associados a diarréias
Família Caliciviridae
• RNA fita simples, nús, polaridade positiva • Gêneros: • Sapovírus • Norovírus • São as mais importantes causas de gastroenterite viral em humanos. • Geralmente causam gastroenterites leves em animais jovens de várias espécies .
Capsídeo - norovírus Hepeviridae
• Gênero Hepevírus=> Vírus da hepatite E • - Não envelopado, fs, +, 7200 nt, • - Com cap, poliadenilado • Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR • - Vírus da Hepatite E (HEV)
• Quatro genotipos: 1,2,3,4 • Genotipos 1 e 2: epidemias associadas a água • Genotipos 3 e 4: são zoonóticos - infectam suínos (raramente outros primatas não humanos) e humanos; causam hepatites esporádicas de origem zoonótica. • Pelo menos 3 genotipos de HEV aviários já foram detectados mundialmente, mas estes tem cerca de 50% de similaridade nas sequencias de nt c/HEV mamíferos Ordem Nidovirales Família Coronaviridae
- Pleomórficos, envelopados - peplômeros espaçados - RNA fs positiva (+)
Gêneros: Coronavírus; Torovírus Coronavírus humano (resfriados) Bronquite Infecciosa das Aves Peritonite Infecciosa dos felinos
Coronavírus Infecção respiratória FAMÍLIA FLAVIVIRIDAE
- Flavi = amarelo - globulares (50 nm) - RNA fs positiva - nucleocapsídeo icosaédrico - envelopados
-Gêneros: Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4
Pestivírus Peste Suína Clássica, BVD, BDO
Hepacivirus: Hepatite C (!!!)
Família Togaviridae
- Grupo IV : RNA fs (+) - envelopados - pleomórficos (70 nm) - RNA fs positiva
-Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies -Causam arboviroses: -ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana
Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!)
Família Filoviridae
- filamentosos (80-14 000 nm) - envelopados - RNA fs negativa
Marburg Ebola
Família Paramyxoviridae
Duas sub-famílias: Paramyxovirinae: Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3, Rubulavirus: PI-2,Cachumba Morbillivirus: Cinomose, Sarampo, Morbilivírus das focas
Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV, Metapneumovirus humano Metapneumovírus aviário
Henipavirus: Hendra, Nipah
Vírus Nipah – “flying foxes”, ou raposas voadoras
Família Rhabdoviridae
• forma de bala • Simetria helicoidal • RNA fs negativa
Gêneros: Lyssavirus: Raiva, Lagos Bat, Mokola, Obodhiang, Kotonkan Vesiculovírus: Estomatite Vesicular Efemerovirus: Vírus com genoma RNA de fita simples segmentado Família: Arenaviridae - Pleomórficos (globulares) 50-300 nm - Envelopados - Duas fitas simples de RNA (L e S) - Contem ribossomos - Usualmente são vírus latentes de roedores Gênero Arenavirus - Coriomeningite linfocítica - Febre Lassa - Febres hemorrágicas: Argentina e Boliviana
Orthomyxoviridae
- myxo = muco - pleomórficos - RNA fs (-) - nucleocapsídeo helicoidal, segmentado (C=7; A & B= 8) - envelopados
- Gênero: Influenza A,B,C > importante: A
Família: Bunyaviridae Ordem: Mononegavirales
- Globulares (100nm) - Envelopados - Três segmentos de RNA de fita simples, polaridade negativa
- Quatro gêneros: Bunyavirus (18 grupos antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba, Guaroa e muitos outros. Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por Phlebotomum). Nairovirus (6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus transmitidos por carrapatos). Hantavirus (pelo menos 6 vírus, não-arbo, transmitidos por roedores) Hantavirose- A síndrome pulmonar por Hantavírus Em SC: O brotamento da Taquara
No MS: O plantio de soja
Todos: O desmatamento Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado Família Picornaviridae
- Pico = pequeno - simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA (+) fs - não envelopados
- Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero) Rinovírus (resfriados) Aftovírus (Febre Aftosa)
-
Família Picornaviridae Aftovírus (Febre Aftosa)
-
Febre Aftosa – efeitos indiretos no meio ambiente
-
Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado Vírus com genomas de RNA de cadeia dupla • Reoviridae – 10 a 12 segmentos de RNA
• Birnaviridae – 2 segmentos de RNA Família Birnaviridae
- sem envelope, icosaédricos - RNA bisegmentado
Gêneros: Entomobirnavírus Aquabirnavírus Avibirnavírus (Gumboro)
Família Reoviridae
- dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm) - RNA f`dupla - não envelopados
- Gêneros: Orthoreovírus Orbivírus Rotavírus
Rotavírus: aptos a resistir ao pH ácido estomacal Rotavírus
(Courtesia de Linda Stannard, University of Cape Town, S.A.) SDS-PAGE (ELETROFORESE EM GEL DE POLIACRILAMIDA)
Fonte: Simone Guadagnucci Morillo Fonte: Simone Guadagnucci Morillo PATOGÊNESE
* *
Os rotavírus aderem ao epitélio do trato GI (mucosa jejunal)
Danos da região apical das Aumento da Motilidade e vilosidades Diminuição da Absorção Enterotoxina viral NSP4
Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182. Vírus RNA (+), com transcriptase reversa
vírus da leucemia felina Retroviridae imunodeficiencia humana, bovina, felina, dos símios
Leucose dos bovinos e das aves
Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina Família Retroviridae - nucleocapsídeo icosaédrico - genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva - envelopados, frágeis - contém transcriptase reversa
- Três Gêneros: 1- Oncovírus Leucose bovina (bovine leukemia virus) HTLV (Human adult T cell leukemia virus)
2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV), Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV), vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV), vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV), vírus da anemia infecciosa equina (EIAV)
3- Spumavírus
Type A (donut) Endogenous viruses
Type B (eccentric) MMTV
Type C (central) ALV, RSV
Type D (bar) Mason Pfizer virus
Lentivirus (cone) HIV
Spumavirus (central) Foamy viruses
1953- W Bernhard, F Haguenau, L Gross, others description of the morphology / morphogenesis of retroviruses and classification of 1966 murine and avian types A, B, C and D retroviruses LEMBRE-SE !
Arbovirus (arthropod borne virus) = vírus transmitidos por artrópodos!
Os arbovírus pertencem a diversas famílias! (ex.: Bunya, Toga, Flavi) Aguarde!!!
• Este slide vai ser acrescentado a seguir!!! Vírus com genoma DNA Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples
circovírus suínos ( e outros)
Circoviridae Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outros)
parvovírus canino-2 Parvoviridae vírus da panleucopenia felina parvovírus suíno parvovírus humano (B19)