PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA
Strukturní charakterizace fágové infekce v bakteriálním biofilmu
Diplomová práce
YULIIA MIRONOVA
Vedoucí práce: Ing. Zuzana Cieniková PhD
Ústav experimentální biologie Obor Molekulární biologie a genetika
Brno 2021 STRUKTURNÍ CHARAKTERIZACE FÁGOVÉ INFEKCE V BAKTERIÁLNÍM BIOFILMU
STRUKTURNÍ CHARAKTERIZACE FÁGOVÉ INFEKCE V BAKTERIÁLNÍM BIOFILMU
Bibliografický záznam
Autor: Yuliia Mironova Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita Ústav experimentální biologie Název práce: Strukturní charakterizace fágové infekce v bakteriálním biofilmu Studijní program: Molekulární biologie a genetika Studijní obor: Molekulární biologie a genetika Vedoucí práce: Ing. Zuzana Cieniková PhD Rok: 2021 Počet stran: 75 Klíčová slova: kryo-EM, kryo-ET, bakteriofágy, fágová terapie, fág T7, Kmvviry, Pseudomonas aeruginosa, biofilm
STRUKTURNÍ CHARAKTERIZACE FÁGOVÉ INFEKCE V BAKTERIÁLNÍM BIOFILMU
Bibliographic record
Author: Yuliia Mironova Faculty of Science Masaryk University Department of Experimental Biology Title of Thesis: Structural characterisation of phage infection in bacterial biofilm Degree Programme: Molecular biology and genetics Field of Study: Molecular biology and genetics Supervisor: Ing. Zuzana Cieniková PhD Year: 2021 Number of Pages: 75 Keywords: cryo-EM, cryo-ET, bacteriophages, phage therapy, phage T7, Phikmvviruses, Pseudomonas aeruginosa, biofilm
STRUKTURNÍ CHARAKTERIZACE FÁGOVÉ INFEKCE V BAKTERIÁLNÍM BIOFILMU
Anotace
Bakteriofágy rodu Phikmvvirus jsou slibnými kandidáty pro fágovou terapií cílenou na Pseudomonas aeruginosa. Tato diplomová práce se zabývá strukturní charakteri- zací fága z rodu Phikmvvirus a procesu jeho infekce v buňkách P. aeruginosa. Jednot- livé stadia infekce byli analyzovány a struktura zralých virionů naplněných geno- mem byla vyřešena s pomocí kombinace kryo-elektronové mikroskopie a tomogra- fie. Nakonec byl předložen protokol fluorescenčního značení fága pro sledování in- fekce v bakteriálním biofilmu za použití “light-sheet” fluorescenční mikroskopie.
STRUKTURNÍ CHARAKTERIZACE FÁGOVÉ INFEKCE V BAKTERIÁLNÍM BIOFILMU
Abstract
Phikmvviruses are promising candidates for phage therapy targeting Pseudomonas aeruginosa. This diploma thesis focuses on the structural characterization of a phage belonging to the Phikmvvirus genus and its infection in P. aeruginosa cells. Stages of the phage infection were investigated, and the structure of the mature virion filled with genome was determined using cryo-electron microscopy. Lastly, a protocol for phage fluorescent labelling, designed to study the phage infection in biofilm using light-sheet fluorescent microscopy, was developed.
STRUKTURNÍ CHARAKTERIZACE FÁGOVÉ INFEKCE V BAKTERIÁLNÍM BIOFILMU