[Tel-00085049, V1] Systématique Et Ecologie Des Crustacés Décapodes

Université de Perpignan - Faculté des Sciences Mémoire présenté par Joseph Poupin à L’Université de Perpignan Pour l’obtention d’une Habilitation à Diriger les Recherches Titre Systématique et Ecologie des Crustacés Décapodes et Stomatopodes de Polynésie Française. tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Soutenance effectuée le mercredi 25 mai 2005 à l’Institut de Recherche de l’Ecole Navale Composition du jury : • Claramunt Christophe, examinateur • Galzin René, rapporteur • Hily Christian, rapporteur • Lemaitre Rafael, examinateur • Van Wormoudth Alain, rapporteur Mémoire accompagné d’un fascicule séparé sur les Travaux et Perspectives de Recherche de Mr. POUPIN (56 pp, 17 figs). A l’issue de la soutenance, le 25 mai 2005, l’Habilitation à Diriger les Recherches a été attribuée au candidat. Version du mémoire corrigée suivant les recommandations du jury. tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Université de Perpignan Mémoire présenté le mercredi 25 mai 2005 à l’Institut de Recherche de l’Ecole Navale Composition du Jury GALZIN, René – Rapporteur, Professeur, Directeur d’Etudes EPHE, Directeur du laboratoire des Ecosystèmes Aquatiques Tropicaux et Méditerranéens, UMR 8046, CNRS-EPHE Université de Perpignan, 52 avenue Paul Alduy, 66 860 PERPIGNAN CEDEX. VAN WORMOUDTH, Alain – Rapporteur, Docteur Etat, Directeur de Recherche CNRS, Directeur du Laboratoire EPHE Evolution moléculaire et adaptation, Station de Biologie Marine du Muséum national d’Histoire naturelle et du Collège de France, BP 225, 22 182 CONCARNEAU. HILY, Christian – Rapporteur, Docteur Etat, Chargé de Recherche CNRS Biodiversité et biologie de la conservation dans les écosystème côtiers, Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin, IUEM Technopôle de Brest-Iroise, Place Nicolas Copernic, 29 280 PLOUZANE. tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 LEMAITRE, Rafael – Examinateur, Research Zoologist, PhD Curator of Crustacea, Dpt of Systematic Biologoy, Smithsonian National Museum of Natural History, Department of Systematic Biology, PO BOX 37012, WASHINGTON D.C. 20013- 7012. CLARAMUNT, Christophe – Président du jury, Examinateur, Professeur, Directeur Adjoint de l’IRENav, Groupe SIG Développement de SIG spatio-temporels, Ecole Navale, Institut de Recherche (IRENav), BP 600, 29 240 BREST ARMEES. tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Remerciements Cette partie n’est pas d’une rédaction facile tant sont nombreuses les personnes qui m’ont aidé d’une façon ou d’une autre au cours des vingt ans couvert par la réalisation de cette synthèse. Comment remercier tout le monde, comment n’oublier personne ? En d’autres occasions, j’ai contourné l’obstacle par une formulation simple, centrée sur une belle page blanche, en me disant que se reconnaîtraient facilement tous ceux qui m’avaient soutenu d’une façon ou d’une autre. Pour cet exercice, je prends la peine d’une rédaction plus précise, avec le risque d’être injuste ou d’oublier certaines personnes, auxquelles je demande de bien vouloir m’excuser par avance. Le professeur René Galzin a bien voulu accepter de remplir le rôle de directeur de recherche. Sans ses encouragements et le temps passé à me conseiller, ce projet n’aurait pas pu aboutir. Le professeur Christophe Claramunt, m’accueille depuis 2001 au sein du groupe SIG de l’IRENav. De formation scientifique différente de la mienne, son rôle de co- directeur de recherche a été important pour me conseiller vers des orientations de recherche en analyses spatio-temporelles, appliquées à l’étude de la biodiversité marine. Alain Van Wormhoudth, Christian Hily, et Rafael Lemaitre, tous très occupés par leurs activités de recherche, ont accepté de participer à ce jury en y consacrant un peu de leur précieux temps. Le Contre Amiral Pierre De Roquefeuil est le commandant de l’Ecole Navale et du Groupe des Ecoles du Poulmic, qui héberge l’Institut de Recherche de l’Ecole Navale où j’ai terminé ce projet d’HDR. A travers lui, je tiens à remercier l’ensemble des personnels militaires avec qui j’ai travaillé depuis mon intégration, en 1985, au Service Mixte de Contrôle Biologique des Armées. Avec du recul je ne peux que me féliciter de la grande compréhension des personnels militaires vis-à-vis de mes tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 initiatives de recherche. Au cours des quelques années que j’ai passées au Muséum national d’Histoire naturelle de Paris, j’ai eu la chance de rencontrer de nombreux spécialistes, français et étrangers, de la systématique des crustacés décapodes et stomatopodes. Nombreux sont ceux à qui je dois les déterminations publiées dans ce travail et il ne m’est pas possible de tous les citer. Alain Crosnier est choisi pour les représenter. Depuis 1986, il n’a cessé de m’aider dans mes études. Sans son travail constant, la plupart des collections polynésiennes de cette étude n’auraient pas été étudiées. Les nombreux jours de mer en Polynésie française, sur le navire Marara, puis sur l’Alis, les déplacements en congrès ou en missions, et les longues soirées passées au bureau à terminer des travaux en cours, ont réduit d’autant le temps que j’ai pu consacrer à ma famille. Ma femme Isabelle a toujours su gérer mes absences avec une grande efficacité. A toutes et à tous j’adresse mes remerciements les plus sincères. tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Systématique et Ecologie des Crustacés Décapodes et Stomatopodes de Polynésie Française Par Joseph Poupin Docteur en Océanologie Biologique Ecole Navale, Institut de Recherche de l’Ecole Navale IRENAV, Groupe de recherche SIG, BP 600, F-29240 BREST Armées tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Enoplometopus crosnieri Chan & Yu, 1998 Langoustine récifale découverte en 1990 aux îles Marquises tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Sommaire Introduction............................................................................................................... 11 Historique des récoltes ............................................................................................... 3 Grands voyages de circumnavigation ..................................................................... 3 ème Début du XX siècle (1900-1967) ........................................................................ 4 Période moderne .................................................................................................... 6 Bilan des récoltes en Polynésie française............................................................. 10 Inventaire des décapodes et stomatopodes polynésiens ......................................... 11 Liste des espèces ................................................................................................. 11 Analyse de la liste ................................................................................................. 38 Ecologie des espèces............................................................................................... 46 Principaux biotopes............................................................................................... 47 Associations remarquables ................................................................................... 72 Analyse biogéographique ......................................................................................... 78 Identité de la faune polynésienne ......................................................................... 78 Disparités régionales en Polynésie ....................................................................... 81 tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Comparaison avec d’autres régions du Pacifique ................................................. 82 Importance économique des crustacés polynésiens ................................................ 85 Pêche artisanale ................................................................................................... 85 Espèces toxiques.................................................................................................. 86 Aquaculture........................................................................................................... 87 Pêcheries de profondeur....................................................................................... 88 Conclusion................................................................................................................ 93 Bibliographie............................................................................................................. 95 tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Iles de Polynésie française visitées pour ce travail de recherche Introduction La Polynésie française est un territoire d'outre-mer du Pacifique Sud. Il est constitué de 118 îles : une trentaine d'îles hautes, de nature volcanique, et plus de 80 îles basses ou atolls, de nature corallienne. Ces chapelets d'îles sont répartis en cinq archipels : les Marquises, les Tuamotu, la Société, les Gambier, et les Australes. Ils s'étendent, d'ouest en est, entre les longitudes 154°40' ouest (île Scilly) et 134°28' ouest (atoll de Temoe), et du nord au sud, entre les latitudes 7°50' sud (banc de sable de Motu One) et 27°36' sud (rocher de Marotiri). La zone exclusive économique (ZEE) représente une superficie de 5 000 000 km2, pour seulement 3500 km2 de terres émergées. En dépit de sa vaste étendue océanique, la Polynésie française, située à plusieurs milliers de kilomètres de tout continent, est très isolée dans le Pacifique Sud (Fig. 1). tel-00085049, version 1 - 11 Jul 2006 Figure 1 - Situation des îles de Polynésie française dans l’océan Pacifique (d’après Bonvallot et al., 1996) Cette étude est une synthèse des connaissances

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