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Universidad De Los Andes Aportes Genéticos Para El

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Universidad De Los Andes Aportes Genéticos Para El UNIVERSIDAD DE LOS ANDES APORTES GENÉTICOS PARA EL ENTENDIMIENTO DE LA ORGANIZACIÓN SOCIAL DE LA COMUNIDAD MUISCA TIBANICA (SOACHA, CUNDINAMARCA) LUZ ADRIANA PÉREZ DISERTACIÓN DE TESIS PRESENTADA AL DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLÓGICAS DIRECTORA DE TESIS: DOCTORA HELENA GROOT DE RESTREPO, DIRECTORA LABORATORIO DE GENÉTICA HUMANA, UNIVERSIDAD DE LOS ANDES CO-DIRECTOR: CARL HENRIK LANGEBAEK, VICERRECTOR DE ASUNTOS ACADEMICOS, DIRECTOR DEL GRUPO DE ARQUEOLOGÍA, UNIVERSIDAD DE LOS ANDES BOGOTA, D.C., DICIEMBRE DE 2015 1 AGRADECIMIENTOS A mi familia hermosa, Juan Carlos, Nicolás, mi madre Constanza, mi padre Pedro y Tifa por su amor, paciencia y apoyo. A mi familia putativa, Magdalena, Gustavo, Daniel y Elizabeth, por abrir las puertas de su hogar Un especial agradecimiento a la doctora Helena Groot y al doctor Carl Langebaek por invitarme a formar parte de este proyecto y brindarme su apoyo para su desarrollo. A Freddy Rodríguez, María Antonieta Corcione y Lucero Aristizabal por su apoyo en aspectos Antropológicos e históricos. A Nicolás rojas y al Doctor Adolfo Quiroz por su apoyo en aspectos estadísticos. A Carolina Muñoz, Diana Polania, Angelina Perna y Laura Gaviria, por su apoyo moral. A Jorge Mario Cárdenas, la doctora Leonor Gusmao, Doctor Felipe Guhl y el Doctor Andrew Crawford por sus acertados consejos. A todo el equipo del Laboratorio de Genética Humana y de Antropología de Tibanica, por su apoyo y amistad. A la doctora Marian Pancorbo y el equipo de trabajo del Banco de ADN de la Universidad del País Vasco por su colaboración en los ensayos de repetibilidad de los resultados de secuenciación. Al Fondo de Investigaciones de la Facultad de Ciencias y la Vicerectoría de investigaciones de la Universidad de los Andes. 2 TABLA DE CONTENIDO AGRADECIMIENTOS ............................................................................................................. 2 TABLA DE CONTENIDO ......................................................................................................... 3 RESUMEN DEL TRABAJO ...................................................................................................... 6 INTRODUCCIÓN ................................................................................................................... 7 MARCO TEÓRICO ............................................................................................................... 10 Generalidades de la organización social y estructura familiar muisca ................................... 10 Análisis genéticos en la Sabana de Bogotá ............................................................................. 16 Hallazgo funerario Tibanica ..................................................................................................... 18 JUSTIFICACIÓN .................................................................................................................. 21 OBJETIVO GENERAL ........................................................................................................... 23 OBJETIVOS ESPECÍFICOS ..................................................................................................... 23 METODOLOGÍA.................................................................................................................. 24 Fundamentos análisis del ADN antiguo .................................................................................. 24 Selección de la muestra .......................................................................................................... 25 Pulverización ........................................................................................................................... 29 Extracción del ADN .................................................................................................................. 29 Cuantificación del material genético obtenido ....................................................................... 30 Amplificación de ADN mitocondrial, regiones HVI y HVII ....................................................... 30 Secuenciación .......................................................................................................................... 31 Análisis de resultados .............................................................................................................. 31 Anexos metodología................................................................................................................ 33 Criterios de Autenticidad Considerados para la Universidad de los Andes ........................ 33 Limpieza y Esterilización de Áreas y Equipos de Laboratorio para trabajo con ADNa ........ 34 Descripción del Área Pre-PCR .............................................................................................. 36 3 Esquema general del proceso para obtención de ADNa ..................................................... 37 Tablas descripción trabajo metodológico ........................................................................... 38 CAPITULO 1. ESTRATEGIA METODOLÓGICA Y HALLAZGOS MOLECULARES ASOCIADOS AL ESTUDIO DE LA POBLACIÓN TIBANICA ................................................................................ 40 Cuantificación en tiempo real de un conjunto de muestras colombianas de relevancia histórica basado en la detección de un fragmento corto de la región Hipervariable II del ADN mitocondrial ............................................................................................................................ 40 Resumen ............................................................................................................................ 42 Materiales y metodos ....................................................................................................... 47 Resultados ......................................................................................................................... 51 Hallazgos moleculares asociados al análisis de muestras de Tibanica ................................... 65 Articulo Anexo: Y Chromosome STR haplotypes in different ethnic groups of Vietnam ........ 67 CAPITULO 2. APORTES GENÉTICOS PARA EL ENTENDIMIENTO DE ASPECTOS SOCIALES DE UNA COMUNIDAD MUISCA ................................................................................................ 68 Resumen .................................................................................................................................. 68 Introducción ............................................................................................................................ 69 Materiales y métodos ............................................................................................................. 71 Selección de la muestra ...................................................................................................... 71 Limpieza y pulverización de las piezas óseas seleccionadas ............................................... 73 Extracción de ADN y cuantificación del material genético ................................................. 74 Amplificación regiones HVI y HVII del ADN mitocondrial ................................................... 74 Verificación de autenticidad de las secuencias ................................................................... 75 Análisis filogenético y estadístico ........................................................................................ 76 Criterios de autenticidad adicionales .................................................................................. 77 Resultados ............................................................................................................................... 78 Autenticación de las secuencias obtenidas ......................................................................... 78 Diversidad molecular en Tibanica ....................................................................................... 79 Discusión ................................................................................................................................. 81 4 Indicadores de autenticidad considerados en Tibanica ...................................................... 81 Análisis de diversidad genética en Tibanica ........................................................................ 82 Análisis de haplotipos mitocondriales en individuos de alta jerarquía............................... 84 Análisis de costumbres funerarias en Tibanica ................................................................... 87 Análisis de otras poblaciones antiguas asociadas a la Sabana de Bogotá .......................... 90 Conclusiones ........................................................................................................................... 92 Anexos ..................................................................................................................................... 94 Figuras ................................................................................................................................. 94 Tablas .................................................................................................................................. 99 Artículo anexo: Vivir y morir en Tibanica ............................................................ 113 CAPITULO 3. ANALISIS DE REGIONES DEL ADN AUTOSOMAL PARA LA DETERMINACIÓN DE SEXO Y ESTMACIÓN DE RELACIONES FILIALES EN UN GRUPO DE INDIVIDUOS DE LA POBLACIÓN TIBANICA .....................................................................................................
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