INPA Programa De Pós-Graduação Em Biologia Tropical E Recursos Naturais Programa De Genética, Conservação E Biologia Evolutiva/INPA – PPG-Gcbev
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MINISTÉRIO DA CIÊNCIA E TECNOLOGIA - MCT INSTITUTO NACIONAL DE PESQUISAS DA AMAZÔNIA – INPA Programa de Pós-Graduação em Biologia Tropical e Recursos Naturais Programa de Genética, Conservação e Biologia Evolutiva/INPA – PPG-GCBEv DISTRIBUIÇÃO DA VARIABILIDADE GENÉTICA DA PESCADA, Plagioscion squamosissimus (HECKEL, 1840) NA CALHA DO RIO AMAZONAS ELIZABETE SIMÃO GALLETTI Manaus - Amazonas Julho, 2009 i Livros Grátis http://www.livrosgratis.com.br Milhares de livros grátis para download. ELIZABETE SIMÃO GALLETTI DISTRIBUIÇÃO DA VARIABILIDADE GENÉTICA DA PESCADA, Plagioscion squamosissimus (HECKEL, 1840) NA CALHA DO RIO AMAZONAS Orientador: AYLTON SATURNINO TEIXEIRA Co-orientadora: IZENI PIRES FARIAS Dissertação apresentada ao Programa de Pós- Graduação em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva/INPA como parte dos requisitos para obtenção do titulo de Mestre em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva. Manaus - Amazonas Julho, 2009 ii FICHA CATALOGRÁFICA G167 Galetti, Elizabete Simão Distribuição da variabilidade genética da pescada, Plagioscion squamosissimus (Heckel, 1840) na calha do Rio Amazonas / Elizabete Simão Galetti.‐‐‐ Manaus : [s.n.], 2009. xiv, 67f. : il. color. Dissertação(mestrado)‐‐ INPA, Manaus, 2009 Orientador : Aylton Saturnino Teixeira Co‐orientador : Izeni Pires Farias Área de concentração : Genética, Conservação e Biologia Evolutiva 1.Plagioscion squamosissimus. 2. Genética de população. 3. Pescada ‐ Bacias hidrográficas – Amazônia. I. Título. CDD 19. ed. 597.580415 Sinopse: Estudou-se a distribuição da variabilidade genética da pescada, Plagioscion squamosissimus em cinco localidades da calha principal do rio Amazonas. Níveis de diversidade genética e estruturação genético-populacional foram avaliados. Palavras-chave: Plagioscion squamosissimus, Genética de População, Região controle, Bacia Amazônica. iii À minha mãe Verônica Ao meu irmão Vitor Ao meu amor Ricardo iv AGRADECIMENTOS Agradeço primeiramente à Deus, que não permitiu que eu me desviasse do caminho, me dando forças nas horas mais difíceis, após cada queda. Me ajudando a compreender o porquê de cada acontecimento e de cada pessoa, boas e ruins, colocada em meu caminho. À minha mãe, para a qual o agradecimento não consigo expressar em palavras. Tudo o que ela representou durante esta fase de minha vida... Como tem sido a vida toda... Pelo AMOR INCONDICIONAL. Ao meu maninho querido, que comprava as minhas dores a cada lágrima que alguém arrancava dos meus olhos (como tem sido a vida toda) a fim de evitar meu sofrimento nas horas difíceis. E por ser sempre meu fã número um, apesar das minhas limitações. À minha vó, por tantas orações. Ao meu pai, por estar sempre na torcida para que o sucesso bata a minha porta por meio das minhas conquistas. À Doutora Izeni Pires Farias, por ter me recebido em seu laboratório com tanto carinho logo no primeiro dia. E pelas contribuições como co-orientadora, não permitindo que alguma monstruosidade pudesse passar aos meus olhos durante minhas escritas. Ao Doutor Aylton Saturnino Teixeira, pela gentileza com que sempre me tratou durantes todos estes meses, mesmo em situações adversas ao bom humor. E pelas contribuições como orientador, dispensando horas preciosas do seu tempo investindo no meu “saber” e acreditando em mim. v Aos mestres desta fase, pelas grandes influências na minha formação. Que muito mais que aulas, foram exemplos de profissional que quero (e devo) e que não quero ser. Ao Ministério da Ciência e Tecnologia (MCT)/Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), e à Universidade Federal do Amazonas (UFAM) pela infra- estrutura e apoio cedidos, para a realização desta dissertação. Ao Curso de Pós-Graduação em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEV/INPA), pela oportunidade do aprendizado profissional e pessoal. À CAPES pela bolsa de estudo concedida, tornando possível a realização do curso de Mestrado. Ao CNPq/CT-Amazônia/N⁰ 554057/2006-9, sob coordenação da Dra. Izeni Pires Farias, projeto de financiamento que tornou possível a realização deste estudo. Aos colegas de turma, Arlison, Rodrigo, Leila, Suzana, Fabíola e Alessandra, que de alguma forma contribuíram para a minha formação. À Alessandra pelo carinho e por toda ajuda concedida na secretaria do GCBEv. Aos amigos e companheiros profissionais do LEGAL (Laboratório de Evolução e Genética Animal) que sempre me instruíram desde os processos técnicos mais simples, e partilharam discussões complexas com paciência, dedicação e interesse. Em especial, à Valéria, Concy e Natasha, que estiveram ao meu lado, me orientando e partilhando as fases mais difíceis desse trabalho. A essas pessoas mais que “legais”, o meu muito obrigada!!! Aos companheiros e amigos de república, durante os anos que vivi aqui em função desse mestrado, Cristina, Nathalia, Mírian, Daiane, Letícia, Mário e Herbert, que colaboraram para que eu pudesse estudar em casa. Isso foi muito importante!!! vi À Suzana e Letícia, por serem minhas irmãs. E a todas as pessoas que torceram por mim, e que em nenhum momento acreditaram no meu fracasso. Amigos daqui de Manaus, e de minha terrinha Dourados, que ficaram na torcida sempre. E ao meu amor, Ricardo que cuidou de mim durante minhas estafas e angústias, foi meu enfermeiro, cozinheiro, companheiro, pessoa insubstituível na minha vida, que nunca me deixou abater. Eu te amo muito!!! vii “Nunca se sabe até onde vai a influência de um mestre” (autor desconhecido) viii RESUMO A pescada Plagioscion squamosissimus, é um scianídeo de água doce restrito à América do Sul, com ampla distribuição no território brasileiro, originário da bacia amazônica e introduzido nas regiões nordeste e sudeste. Esta espécie apresenta importância para a economia pesqueira da região amazônica, por ser um pescado considerado nobre e de grande valor comercial. No entanto, não há ainda para a pescada, um projeto de manejo de seus estoques pesqueiros, que permita sua conservação. Os estudos genético-populacionais aplicados a espécies de peixes de importância comercial têm gerado importantes dados para uma delimitação mais adequada dos estoques pesqueiros. O conhecimento da distribuição da diversidade genética da pescada branca no canal principal do rio Amazonas pode ser uma importante contribuição para um manejo apropriado da espécie e consequentemente de sua conservação. Cinco localidades do rio Amazonas foram amostradas, com um total de 81 indivíduos coletados. O DNA genômico foi extraído de nadadeiras via CTAB 2%, e a região controle do DNA mitocondrial foi amplificada e sequenciada no sequenciador automático ABI 3130 XL. Os 727 pares de bases obtidos foram alinhados e editados no programa BioEdit v. 5.0.6 e evidenciaram a existência de 54 haplótipos. Resultados provenientes do programa Arlequin 3.1 tambem sugerem altos níveis de diversidade genética para a pescada, verificados pelo elevado índice da média de diversidade gênica (Ĥ=0.9778), e diversidade nucleotídica (π=0.016300). Tais resultados indicam ausência de sobrepesca nas populações de pescada, especialmente, no nível da região controle do DNA mitocondrial. Nos resultados de AMOVA, de toda variabilidade genética observada, 93,68% foi verificada dentro das localidades, e apenas 6,32% encontra-se entre as localidade amostradas. O valor de ΦST (0,06319), apesar de baixo, indica alguma diferenciação entre as localidades (P=0,00673). A ausência de diferenciação entre as localidades foi inferida pela falta de valores significantes das comparações par-a-par de ΦST após a correção de Bonferroni. Estes resultados mostraram que a única comparação significante foi entre Tabatinga – Soure as quais são as localidades dos extremos de distribuição da presente análise. Tais resultados evidenciam que a pescada provavelmente forma uma única população na calha do rio Amazonas em pelo menos uma faixa de aproximadamente 2300Km de distância. A diferenciação genética para essas localidades pode ser o resultado de isolamento por distância, entretanto, pelo teste de Mantel, não observou-se nenhuma correlação entre distância genética e distância geográfica. Uma expansão populacional foi observada entre os pontos extremos da distribuição amostral. ix ABSTRACT The South American silver croaker Plagioscion squamosissimus, is a sciaenid restricted to freshwaters of South America. It has a wide distribution within the Brazilian territory, originally found in the Amazonian basin and introduced in northeast and southeast of Brazil. This species is important for the fishing economy of the Amazonian area, being considered a noble fish species and being of great commercial value. However, there is still no fisheries management project that would allow its conservation. Applied genetic-population studies to species of fish of commercial importance have been generating data of extreme importance for a more appropriate delimitation of fishery stocks. Knowing the distribution of genetic diversity of populations of South American silver croaker in the main channel of the river Amazon, one can obtain data that contribute to the appropriate management of this species in this area, and, consequently, its conservation. Five localities of the Amazon River were sampled, with a total of 81 individuals collected. The genomic DNA was extracted from fins using 2% CTAB, and the control region of the mitochondrial DNA was amplified and sequenced on the ABI 3130 XL automatic sequencer. A total of 727 base pairs (bp) were aligned and edited in the program BioEdit v. 5.0.6. resulting in 54 haplotypes. Results generated in the program Arlequin