Evaluation of Mangrove Connectivity Using Biological Models with Different Larval Dispersal
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Paola Franzan Sanches Evaluation of Mangrove Connectivity using Biological Models with different Larval Dispersal Tese apresentada ao Instituto Oceanográfico da Universidade de São Paulo, como requisito para obtenção do título de Doutora em Ciências, Programa de Oceanografia, área de Oceanografia Biológica. Orientador: Prof. Dr. Alexander Turra Co-orientadores: Prof. Dr. Antonio Carlos Marques Prof. Dr. Paulo Simionato Polito São Paulo 2019 UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO INSTITUTO OCEANOGRÁFICO Evaluation of Mangrove Connectivity using Biological Models with different Larval Dispersal Paola Franzan Sanches Tese apresentada ao Instituto Oceanográfico da Universidade de São Paulo, como parte dos requisitos para obtenção do título de Doutora em Ciências, Programa de Oceanografia, área de Oceanografia Biológica. Julgada em 06/08/2019. Versão Corrigida ______________________________________ ___________ Prof. Dr. Alexander Turra Não Votante ______________________________________ ___________ Prof. Dr. André Carrara Morandini Conceito ______________________________________ __________ Prof. Dr. Tito Monteiro da Cruz Lotufo Conceito ______________________________________ __________ Prof. Dr. Paulo Roberto Pagliosa Alves Conceito ii Sumário Agradecimentos..................................................................................................................................i Lista de Figuras.................................................................................................................................iii Lista de Tabelas..................................................................................................................................v Resumo...............................................................................................................................................vi Abstract.............................................................................................................................................vii Introduction……………....................................................................................................................1 Chapter 1…………………………………………………………………………….………………5 1. Introduction …………………………………………………………………….…………..6 2. Methods…………………………………………………………………………………..….8 3. Results………………………………………………………………………………………..8 4. Discussion…………………………….…………………………………………………….12 5. Acknowledgement…………………………………………………………………..……..16 6. References . ………………………………………………………………………………..16 7. Supplementary Material……………………………….……………………………….…23 Chapter 2………………………………………………………………………………..…………29 1. Introduction…………………………………….………………………………………….30 2. Methods……………………………………….…………………………………………....31 3. Results……………………………………….…………………………………….……….33 4. Discussion…………………………………..………………………………………………38 5. Acknowledgements………………………….……………………………………….…….40 6. References………………………………………………………………………………….40 7. Supplementary Material…………………………………………………………………..43 Chapter 3…………………………………………………………………………………………...55 1. Introduction…………………………………………………………………………….….56 2. Methods…………………………………………………………………………….………59 3. Results……………………………………………………………………………..……….61 4. Discussion……………………………………………………………………..……………65 5. Conclusion …………………………………………………………………….…………..68 6. Acknowledgements…………………………………………………………………..…….68 7. References………………………………………………………………………………….69 8. Supplementary Material…………………………………………………………………..73 Final Considerations………..................................................................................................…….74 iii Para Catharina, o grande amor da minha vida, Quem eu tive o prazer de gerar e com quem eu aprendo todos os dias a ser mais feliz! i v Agradecimentos Agradecimentos são regados às nostalgias e lembranças de todo o processo de condução do documento final submetido a uma banca. Mas para mim também é um momento de reflexão, que me faz reforçar todos os motivos que me fizeram chegar até aqui. Desde o sonho infantil de ser bióloga e poder trabalhar com orcas (quem sabe um dia?!), até ser pesquisadora e professora, com todo o orgulho e o amor que pode existir na referência à profissão. Sou pesquisadora e sou professora. Talvez ainda não no mesmo lugar, mas esses são os próximos capítulos da minha história. Assim, começo agradecendo aos meus pais que me deram a oportunidade de realizar meus sonhos, desde nova, e continuaram me incentivando, sempre. Eu nada seria sem vocês. E nesse meu momento, especialmente, que bom poder voltar para o ninho. Sou grata por vocês terem me ajudado com a peixinha. Que sorte a minha vocês serem a minha rede de apoio. Que eu possa representar o mesmo para a Catharina. Agradeço à Catharina, a luz dos meus olhos, minha filha, minha amiga e companheira. Você é a minha maior inspiração e motivação. A vida é mais bonita, mais colorida e mais cheia de sorrisos e de amor, porque te tenho ao meu lado. Que honra e que orgulho ter sido escolhida por ti. Mamãe te ama mais que tudo nessa vida. Você dividiu comigo esse doutorado, metade do tempo na barriga, metade do tempo aqui ao lado. Esse trabalho é também para você. Felizes daqueles que têm orientadores, mentores e mestres. Tive a sorte de poder aprender com três professores incríveis, que além de confiarem em mim, me abriram as portas de seus laboratórios e de suas famílias. Me apoiaram e incentivaram. Comemoraram comigo a chegada da minha pequena e disseram que eu daria conta do recado. Feliz de mim. Assim, agradeço ao meu orientador, quem me abriu as portas e confiou no meu potencial e nas minhas ideias. Quem me usou de exemplo em momentos especiais, mostrando para mim valores que talvez nem eu via. Alex, obrigada pela parceria, pela confiança, pelas piadas e conversas. Também agradeço ao meu co-orientador Tim, quem embarcou no projeto e em quem eu dei tantos sustos com notas e orçamentos. Tim, obrigada pela parceria, pela confiança, pelas piadas e conversas. Por ler meus textos em fins de semana e feriados. Tim, você pra mim é também um sinal de conforto, quando tudo não parecia mais certo, você me estendeu a mão. As duas, na verdade. Sou grata. Eternamente. Agradeço ao meu outro co-orientador Paulo, quem aceitou me ensinar uma linguagem nova, confiando que eu daria um jeito de aprender. Paulo, obrigada pela parceria, pela confiança, pelas piadas e conversas. Sou grata também pelo apoio que recebi de ti. Foi fundamental para a minha vida. Agradeço na sequência à Beatriz e ao Manuel, técnicos do LEM, que seguraram as pontas, quando eu mais precisei. Para mim vocês foram amigos e eu serei eternamente grata. Agradeço à Sabrina, técnica do LEM e à Camila técnica do IO. Agradeço aos meus colegas e amigos dos três laboratórios, em especial Ana, Marília, Isabela (por essa e tantas coisas...), Juliana, Felipe que me ajudaram em alguns campos, Henrique que me tirou dúvidas de Matlab e Thaís e Luciana que me ajudaram com o ArcGis. Por fim, agradeço à Mariana por toda a ajuda em momentos delicados e à parceria. Aos grupos dos professores Drs Paulo Lana, Marcelo Petraco, Perimar Espírito Santo de Moura e à Dra Maíra Pombo pelas coletas e envio de material e aos Prof. Dr. João Setubal do IQ e Dr. Gustavo Ribeiro pela parceria na bioinformática. vi Agradeço aos antigos amigos, que me inspiram e com quem tenho o prazer de dividir tantos anos de risadas (como gosto de rir), em especial à Elis, à Marina, à Luli, à Fer e à Gabi, ao Tiri e ao Marcelo e à minha família do Bar. Agradeço também aos meus novos amigos em especial à Thaís, ao Henrique, à Joice, à Priscila, à Carla e à Luiza. Gratidão por lembrarem que eu era forte, e chegaria até o final. De qualquer processo. Vocês acreditaram mais em mim que eu mesma, muitas vezes. Agradeço também à Janaina, quem me orientou, me ajudou a lembrar qual era o meu grande sonho e quem me inspira quanto mulher e profissional. Aos membros da secretaria do IO, Ana Paula, Daniel e Letícia, sou grata por toda a ajuda, as risadas e aos galhos gentilmente quebrados, enquanto gestante e puérpera. Vocês fazem a diferença nas nossas vidas. Aos professores e colegas que me ajudaram a chegar até aqui. O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001. À FAPESP pelo financiamento do projeto. vii Lista de Figuras Introduction Figure 1: Distribution of mangroves in the world. National Geographic Magazine 2007…………...2 Chapter 1 Figure 1: Accumulation curve of (A) references on connectivity per year of publication, separated in the different approaches: community ecology (green); genetic (red); GIS/remote sensing (orange); dispersal modeling (blue); and (B) log (base 10) of references on connectivity per year of publication, separated in the different approaches (same colors used in A)………………………………………………………………………………………………………………….9 Figure 2: Number of references in relation to: (I) taxa (ascidian, bird, cnidaria, crustacean, porifera, fauna, fishes, mammals, mollusc, nemertea, sponges, turtle, and not applied) and approach as community ecology (green); genetic (red); GIS/remote sensing (orange); dispersal modeling (blue); (II) Number of species used and approach (same colors used in I). ……………………………………………………………………………………………………………..…10 Figure 3: Number of references per type of habitat. (A): Based on the approach as community ecology (green); genetic (red); GIS/remote sensing (orange); dispersal modeling (blue). (B) Based on the method used to estimate connectivity, that can be Actual (red), Structural (green) and Potential (purple) (cf. Calabrese & Fagan 2014)………………………11 Figure 4: Number of references for each locality