Una Aplicación a La Cladística
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Contrastando reconstrucciones con herramientas computacionales: una aplicación a la cladística Ariel Jonathan Roffé Director: Santiago Ginnobili Codirector: Pablo Lorenzano Consejero de estudios: Eduardo Barrio Tesis de Doctorado en Filosofía Universidad de Buenos Aires Agradecimientos Esta tesis es el fruto de cinco arduos años de estudios e investigaciones doctorales, y otros tantos de formación universitaria de grado. Tales esfuerzos no fueron puramente individuales. Hay un sinnúmero de personas e instituciones que me brindaron apoyo (de diversos tipos) y sin las cuales recorrer este camino hubiese sido imposible. A ellas y ellos deseo agradecer brevemente en este comienzo de la tesis. Agradezco, en primer lugar, a mis padres. No solo por el soporte económico que me brindaron durante todos estos años (que fue muy importante), sino también por el afectivo, por haber creído en mí y haber confiado en todas mis decisiones. Su apoyo constante e incondicional fue sin dudas el factor más importante para poder haber llegado a concluir esta tesis. En segundo, a mis directores. Santiago es la persona que mayor influencia tuvo sobre mi formación intelectual. Su trabajo como director, y mi admiración por él, se ven reflejados en este trabajo. La elección de los problemas, mi consideración sobre la importancia de abordarlos y los marcos conceptuales usados para solucionarlos son todos fruto de sus enseñanzas. A Pablo, por su generosidad y por haberme integrado en los diversos espacios en los que participa. Su conocimiento erudito sobre la historia de la filosofía de la ciencia y de la biología, y sobre el estructuralismo metateórico fueron una aporte invaluable para la elaboración de esta tesis. En tercer lugar, deseo agradecer a los miembros de todos los grupos de investigación de los que participo, los cuales me brindaron amplias oportunidades de discusión de ideas (propias y ajenas), instancias de aprendizaje en ambientes intelectualmente estimulantes y grandes amistades. Agradezco por ello a los miembros del grupo ANFIBIO, liderado por Santiago, especialmente a Andrea, Carlos, Ezequiel y Federico, quienes pacientemente escucharon, criticaron y mejoraron absolutamente todos mis trabajos a lo largo de estos años (algunos de los cuales quedaron integrados en la tesis). Agradezco también al grupo dirigido por Pablo, por ayudarme a mejorar mi comprensión del estructuralismo metateórico, así como al Buenos Aires Logic Group y a su director (y mí consejero de estudios) Eduardo, que me brindaron un espacio de formación metodológica que considero fundamental para un profesional en la academia. En cuarto lugar, a mis amigos Anahí, Claudio, Joaquín, Mauro, Pedro, Ramona y Soledad, porque no solo de negotium se vive. Por último, cabe destacar que el presente trabajo fue desarrollado con una beca doctoral otorgada por el CONICET. 3 4 Índice Capítulo 1. Introducción ................................................................................................................ 7 PARTE I - La teoría objeto ......................................................................................................... 14 Capítulo 2. La cladística .............................................................................................................. 15 2.1. La ancestría común darwiniana ....................................................................................................... 15 2.2. El surgimiento de la cladística ......................................................................................................... 23 2.3. Presentación informal de la teoría.................................................................................................... 32 2.4. Conclusiones ................................................................................................................................... 49 Capítulo 3. Una reconstrucción estructuralista de la cladística ............................................... 51 3.1. Tratamientos formales previos de la cladística ................................................................................ 51 3.2. Axiomas impropios ......................................................................................................................... 53 3.3. Leyes fundamentales ....................................................................................................................... 66 3.4. Otros conceptos importantes de CLAD ........................................................................................... 75 3.5. Especializaciones, T-teoricidad y condiciones de ligadura .............................................................. 79 3.6. Métodos de determinación ............................................................................................................... 87 3.7. Conclusiones ................................................................................................................................... 91 PARTE II - Testeo de la reconstrucción de la cladística mediante el software Reconstructor ........................................................................................................................................................ 93 Capítulo 4. Reconstructor y la contrastación de reconstrucciones .......................................... 94 4.1. Lenguaje, axiomas y especializaciones ............................................................................................ 95 4.2. Modelos y el primer método de contrastación ............................................................................... 108 4.3. Condiciones de ligadura ................................................................................................................ 117 4.4. La semántica paracompleta de Reconstructor ................................................................................ 122 4.5. Métodos de determinación manuales ............................................................................................. 129 4.6. Métodos de determinación automáticos ......................................................................................... 139 4.7. Conclusiones ................................................................................................................................. 150 4.8. Apéndice ....................................................................................................................................... 151 Capítulo 5. Aplicación del programa Reconstructor a la teoría objeto ................................ 157 5.1. Los axiomas................................................................................................................................... 157 5.2. Los modelos y (algunos) métodos de determinación ..................................................................... 165 5.3. Las condiciones de ligadura........................................................................................................... 175 5 5.4. Otros métodos de determinación manuales.................................................................................... 177 5.5. Conclusiones ................................................................................................................................. 180 PARTE III - Consecuencias del análisis anterior .................................................................... 182 Capítulo 6. Consecuencias ......................................................................................................... 183 6.1. Consecuencias sobre el estructuralismo: la noción de método de determinación .......................... 183 6.2. Consecuencias sobre la cladística: la noción de homología ........................................................... 193 Capítulo 7. Conclusiones ............................................................................................................ 218 7.1. Resumen de los resultados obtenidos ............................................................................................ 218 7.2. Trabajo por realizar ....................................................................................................................... 223 Referencias bibliográficas .......................................................................................................... 226 6 Capítulo 1. Introducción El proyecto de elaborar una metaciencia o ciencia de la ciencia tiene una larga tradición en filosofía de la ciencia. Desde sus inicios a principios del siglo XX con los empiristas lógicos, la filosofía de la ciencia buscó (junto con otras disciplinas) explicar diversos aspectos del quehacer científico (Carnap, 1934; Hahn et al., [1929] 2002). En particular, una preocupación central ha sido la de elaborar una metateoría, esto es, una teoría acerca de las teorías científicas. Algunos historiadores que estudiaron al Círculo de Viena han sostenido recientemente que los empiristas lógicos veían a la metateoría como dividida en dos grandes partes: por un lado estaría la lógica de la ciencia y por otro la pragmática de la ciencia (Lorenzano, 2011; Uebel, 2013, 2015). En este proyecto bipartito, la lógica de la ciencia consistiría en el análisis formal de las teorías (en sus aspectos sintáctico y semántico), utilizando las herramientas de la lógica matemática, para esclarecer el contenido cognitivo de las teorías. Esto no solo tendría consecuencias prácticas inmediatas (como el mejoramiento de la educación y la comunicación científicas), sino que además permitiría delimitar el ámbito de otro tipo de discusiones