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Contribution À L'étude Des Successions Écologiques Du Phytoplancton

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Contribution À L'étude Des Successions Écologiques Du Phytoplancton Contribution à l’étude des successions écologiques du phytoplancton dans la lagune de Ghar El Melh Amel Dhib To cite this version: Amel Dhib. Contribution à l’étude des successions écologiques du phytoplancton dans la lagune de Ghar El Melh. Biodiversité et Ecologie. Université de Franche-Comté, 2015. Français. NNT : 2015BESA2033. tel-01693267 HAL Id: tel-01693267 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01693267 Submitted on 26 Jan 2018 HAL is a multi-disciplinary open access L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est archive for the deposit and dissemination of sci- destinée au dépôt et à la diffusion de documents entific research documents, whether they are pub- scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, lished or not. The documents may come from émanant des établissements d’enseignement et de teaching and research institutions in France or recherche français ou étrangers, des laboratoires abroad, or from public or private research centers. publics ou privés. Université El MANAR II Institut National des Sciences et Université de Faculté des sciences de Tunis Technologies de la Mer Franche-Comté THESE DE DOCTORAT Présentée par Mme Amel DHIB Pour obtenir le titre de Docteur de l’université de Tunis El-Manar Docteur de l’université de Franche-Comté Discipline Sciences Biologiques (Tunisie) Sciences de la Vie et de l’Environnement (France) Contribution à l’étude des successions écologiques du phytoplancton dans la lagune de Ghar El Melh Soutenue publiquement le 20 juillet 2015 devant le jury composé de : - Pr. Rafika FEHRI-BEDOUI (Faculté des Sciences de Tunis) : Présidente de jury - Dr. Souad TURKI (INSTM) : Encadrant - Pr. Lotfi ALEYA (Université de Franche-Comté) : Encadrant - Pr. Asma SAKKA- HLAILI (Faculté des Sciences de Bizerte) : Rapporteur - Pr. Michel DENIS (Université d'Aix Marseille) : Rapporteur - Dr. Estelle MASSERET (Université Montpellier/ IRD) : Examinatrice A mon ange NOOR Pour la joie de la vie qu’elle m’offre A mon père Mustapha & ma mère Najet Pour l'éducation qu'ils m'ont prodigué; avec tous les moyens et au prix de toutes les sacrifices qu'ils ont consentis à mon égard A mes sœurs Hanen & Boutheina & mon frère Anis A mon cher mari Ibrahim A ma chère Tante Souad Pour tout le soutien moral et matériel Trouvez ici l’expression de ma profonde gratitude Remerciements Ce travail a été réalisé en cotutelle internationale entre l‘Université de Tunis El- Manar et l‘Université de Franche Comté au sein du Laboratoire Milieu Marin de l‘Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (La Goulette) et du laboratoire Chrono-Environnement de Besançon. Que ces honorables institutions soient remerciées de m’avoir permis de réaliser ce travail dans les meilleures conditions. Je tiens à exprimer ma profonde gratitude et ma sincère reconnaissance à mes deux directeurs de thèse : A Mme. Souad TURKI, Maître de conférences à l’INSTM. Au cours de mon stage de mastère, son encadrement de qualité a motivé mon désir de poursuivre ma formation au travers d’une thèse, je le remercie chaleureusement pour la confiance qu’il m’accordée en soutenant ma candidature. Tout au long de ma thèse, j’ai pu bénéficier de sa grande disponibilité, de son aide, et de ses connaissances en matière d’écologie du phytoplancton. Je vous suis reconnaissante, Madame, pour votre patience, vos encouragements et vos conseils constructifs. A Mr. Lotfi ALEYA, Professeur à l’Université de Franche Comté. Je tiens à rendre hommage à la pertinence de ses conseils, à sa capacité à élargir la réflexion ainsi qu’à ses qualités en matière de communication, et en particulier de rédaction scientifique. J’ai été particulièrement sensible à son respect des initiatives personnelles ainsi qu’à ses encouragements. A maintes reprises, il a su me faire profiter de ses compétences scientifiques, mais également de sa bonne humeur et de son humour ; j’ai été très heureuse de faire mes premiers pas dans le domaine de la recherche à ses côtés. Il a ainsi grandement contribué à ma formation mais aussi à me laisser un très bon souvenir de ces années écoulées, qu’il soit ici chaleureusement remercié. Je tiens ensuite à exprimer ma reconnaissance aux membres du jury : A Mme. Rafika BEDOUI, Professeur à la Faculté des sciences de Tunis, qui a accepté de juger ce travail en tant que présidente de jury. Qu’elle trouve ici l’expression de mon profond respect et ma sincère reconnaissance. A Mme. Asma SAKKA, Professeur à la Faculté des sciences de Bizerte, et à Mr. Michel DENIS, Professeur à l’Université d'Aix Marseille, de m’avoir fait l’honneur d’être les rapporteurs de cette thèse. Merci pour l’intérêt que vous avez porté à ce travail. Vos suggestions, vos remarques pertinentes et vos commentaires judicieux m‘ont été très utiles. Merci infiniment. A Mme. Estelle MASSERET, maître de conférences à l’Université Montpellier, d‘avoir accepté d‘examiner ce travail. Sincèrement merci. Je veux exprimer aussi ma profonde gratitude au Professeur Cherif SAMMARI, Directeur du Laboratoire du Milieu marin de l’Institut National des Sciences et Technologies de la Mer. Je le remercie pour m’avoir accueilli dans son laboratoire. Je tiens également à remercier Mr. Fourat AKROUT, Ingénieur au laboratoire du Milieu Marin à L’INSTM, Mme. Noura BALTI, Technicienne au laboratoire du Milieu Marin à L’INSTM, Mme. Mouna FERTOUNA-BELLAKHAL, Chef laboratoire à l’Institut Supérieur de Pêche et d’Aquaculture de Bizerte, Mme. Aude BARANI, Technicienne à l’Université de Marseille, Mr. Nicolas ROUGE, Ingénieur à l’Université de Franche-Comté et Mr. Victor FROSSARD, docteur à l’Université de Franche-Comté, pour leur aide à réaliser ce travail. L’aide de tous les pêcheurs de la lagune m’a été indispensable pour la réalisation de mes sorties de terrain. Je remercie particulièrement Riadh OUELDI. Boutheina, Amine, Imen, Mouna, Afef, mes compagnons, merci pour votre amitié, votre soutien, votre gentillesse, votre disponibilité, votre amour, vos petits coups de pouce et vos gros coups de main…et tout le reste ! Ce fut un grand plaisir de vous avoir connue. Voilà le temps de remercier mes parents qui m’ont toujours soutenu, et à qui je dois mon épanouissement tant personnel que professionnel. Sans leur soutien, ce travail n’aurait pas vu le jour. Je remercie également mes sœurs Hanen et Boutheina et ma cousine Amna, pour ses nombreux coups de pouce et encouragements au cours de ces années de thèse. Merci d’avoir pris ce temps-là pour moi. A mon mari et mon meilleur ami IBRAHIM, à celui qui a partagé les joies et satisfactions mais aussi les moments difficiles de découragement ou de doutes de ces années, merci d’avoir toujours cru autant en moi et de m’avoir toujours soutenue. A tous les membres de famille LANDOULSI (am EL HEDI, omi JAMILA, Imen, Abdou, Mohamed ALI, am BOUJEMAA …) mille mercis pour votre présence et votre soutien. J’en oublie certainement encore et je m’en excuse. Je remercie finalement tous ceux qui de près ou de loin ont contribué à la réalisation de ce travail. Amel SOMMAIRE LISTE DES FIGURES………………………………………………………………… 4 LISTE DES TABLEAUX…………………………………………………………….. 7 LISTE DES ABREVIATIONS……………………………………………………… 9 INTRODUCTION……………………………………………………………………….. 10 Chapitre I. Le monde phytoplanctonique……………………………………… 15 1. Définition et classification……………………………………………………… 15 1.1. Microphytoplancton……………………………………………………………... 16 1.1.1. Diatomées………………………………………………………………………... 16 1.1.2. Dinoflagellés……………………………………………………………………... 17 1.1.3. Organismes procaryotes : les cyanobactéries……………………………………. 19 1.2. Nanophytoplancton……………………………………………………….……... 19 1.3. Picophytoplancton……………………………………………………………….. 19 2. Efflorescences microalguales nuisibles ……………………………………….. 20 3. Successions écologiques du phytoplancton……………………………………. 21 4. Microphytoplancton en relation avec les facteurs abiotiques et biotiques…......................................................................................................................... 23 4.1. Relation avec les facteurs abiotiques………………………………………………… 23 4.2. Relation avec les facteurs biotiques…………………………………………………. 25 4.2.1. Microalgues épiphytes………………………………………......................................... 25 4.2.2. Kystes de dinoflagellés…………………………………………………………............ 25 4.2.3. Ultraplancton…………………………………………………………………………… 27 4.2.4. Ciliés…………………………………………………………………………………… 28 5. Aperçu sur les travaux réalisés sur le phytoplancton en Tunisie…………… 31 Chapitre II. Site d’étude……………………………………………………………… 34 1. Situation géographique………………………………………………………… 34 2. Cadre géomorphologique………………………………………………………. 35 2.1. Formation de la lagune……………………………………………………………….. 35 2.2. Evolution de la communication mer-lagune…………………………………………… 35 3. Bassin versant de la lagune…………………………………………………….. 36 4. Cadre climatique…………………………………………………………………….. 37 4.1. Pluviométrie ………………………………………………………………………….. 37 4.2. Température de l‘air …………………………………………………………………. 38 4.3. Evaporation…………………………………………………………………………… 39 4.4. Humidité relative……………………………………………………………………… 39 4.5. Vents………………………………………………………………………………….. 40 5. Hydrologie………………………………………………………………………. 41 5.1. Bathymétrie……………………………………………………………………… 41 5.2. Marée…………………………………………………………………………….. 42 5.3. Courants……………………………………………………………………......... 43 6. Caractéristiques biologiques de la lagune de Ghar El Melh …………………….. 43 6.1. Phytoplancton…………………………………………………………………… 43 6.2. Zooplancton…………………………………………………………………....... 45 1 6.3. Macrophytes benthiques…………………………………………………..… …. 45 6.4. Faune ichtyque…………………………………………………………………... 46 7. Pressions anthropiques…………………………………………………………
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