Estimation Des Potentialités D'accueil De L'anguille Européenne, Des Aloses Et De La Lamproie Marine Dans Le Bassin Du Cher Aval
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MÉMOIRE Présenté par : Thomas THIZY Dans le cadre de la dominante d’approfondissement : IDEA (Ingénierie de l’Environnement, Eau, Déchets et Aménagements durables) Estimation des potentialités d'accueil de l'anguille européenne, des aloses et de la lamproie marine dans le bassin du Cher aval Pour l’obtention du : DIPLÔME D’INGENIEUR d’AGROPARISTECH Cursus ingénieur agronome et du DIPLÔME D’AGRONOMIE APPROFONDIE Stage effectué du 01/03/2011 au 31/08/2011 A : Office National de l'Eau et des Milieux Aquatiques Délégation interrégionale Centre, Poitou-Charentes Bâtiment A6 - BP 36009 3, avenue Claude Guillemin 45 060 Orléans CEDEX 2 Enseignant-responsable : Gilian CADIC Maître de stage : Vincent VAUCLIN Soutenu le 21/09/2011 2 Remerciements J’adresse mes sincères remerciements à Monsieur Bertrand, Délégué Interrégional à l'ONEMA pour m’avoir accueilli dans son établissement durant six mois, afin d’effectuer ce stage de fin d'études d'ingénieur agronome. Je remercie tout particulièrement Vincent Vauclin, mon maître de stage, ainsi que Pierre Steinbach, pour leur encadrement, leur disponibilité, leurs conseils et leur sympathie tout au long de ce travail. Ma gratitude va également à Caroline Berthier pour son aide à la pratique du SIG et à Sylvie Tomanova pour son appui en analyses statistiques, ainsi qu’à l’ensemble de leurs collègues de la Délégation Interrégionale d'Orléans (Dir4) pour leur disponibilité et l'excellente ambiance générale de travail. Je suis reconnaissant aux chefs et aux agents des services départementaux de l'ONEMA de l’Indre-et-Loire, du Loir-et-Cher, de l'Indre, du Cher et de l’Allier, ainsi qu’à Laëtitia Boutet-Berry, technicienne supérieure à la Dir 4, de m’avoir apporté leurs connaissances et leur aide logistique et pratique lors des opérations de terrain. Enfin, je n‘aurais garde d’oublier la contribution à ce travail de M. Jean-Luc Baglinière, de l’INRA de Rennes, de Mme Catherine Boisneau, de l’Université de Tours et de M. Adrien Alber, de la DREAL Centre, qui m’ont consacré du temps sous la forme d’échanges verbaux informatifs concernant l’écologie des poissons migrateurs et la géomorphologie fluviale du Cher. Qu’ils en trouvent ici l’expression de mes remerciements cordiaux. 3 4 Table des matières Introduction.........................................................................................................................................7 1 Un bassin versant potentiellement productif en poissons migrateurs................................................8 1.1 Aperçu du bassin versant du Cher.........................................................................................8 1.1.1 Caractéristiques générales........................................................................................8 1.1.2 Le Cher Amont et ses affluents................................................................................8 1.1.3 Le Cher aval et ses affluents.....................................................................................9 1.1.3.1 Le Cher sauvage, la Sauldre et le Fouzon....................................................9 1.1.3.2 Le Cher canalisé...........................................................................................9 1.2 Des espèces à la biologie particulière.................................................................................10 1.2.1 Les aloses................................................................................................................10 1.2.2 La lamproie marine.................................................................................................12 1.2.3 L’anguille européenne............................................................................................13 1.3 Données de répartition actuelle et passée............................................................................14 1.3.1 Les aloses................................................................................................................15 1.3.2 La lamproie marine.................................................................................................15 1.3.3 L’anguille européenne............................................................................................16 1.4 Une protection réglementaire conséquente.........................................................................17 1.4.1 ...des espèces aux niveaux national et européen.....................................................17 1.4.2 ...des cours d’eau au titre de la libre circulation piscicole......................................18 2 Méthodologie...................................................................................................................................19 2.1 Définition des « variables » recherchées.............................................................................19 2.1.1 Les aloses................................................................................................................19 2.1.2 La lamproie marine.................................................................................................20 2.1.3 L'anguille européenne.............................................................................................21 2.2 Aloses et lamproie marine...................................................................................................21 2.2.1 Repérage des zones courantes par photo-interprétation.........................................21 2.2.2 Tronçonnage...........................................................................................................22 2.2.3 Relevé et bancarisation des données.......................................................................24 2.2.4 Extrapolation des secteurs parcourus aux secteurs non parcourus.........................26 2.2.4.1 Extrapolation par modélisation de la relation entre les zones courantes repérées par photo-interprétation et les frayères potentielles décrites sur le terrain..................27 2.2.4.2 Extrapolation basée sur des critères morphologiques qualitatifs...............31 2.2.4.3 Choix de la méthode retenue pour chaque espèce......................................33 2.3 Anguille européenne...........................................................................................................33 2.3.1 Surface de bassin versant........................................................................................33 2.3.2 Surface en eau.........................................................................................................33 2.4 Accessibilité du bassin versant (obstacles aux migrations)................................................34 3 Résultats..........................................................................................................................................36 3.1 Hydromorphologie du Cher................................................................................................36 3.2 Les aloses............................................................................................................................36 3.2.1 Nombre actuel de frayères potentielles...................................................................36 3.2.2 Accessibilité aux frayères potentielles....................................................................37 3.3 La lamproie marine.............................................................................................................39 3.3.1 Surface actuelle de frayères potentielles.................................................................39 3.3.2 Accessibilité aux frayères potentielles....................................................................39 3.4 L'anguille européenne.........................................................................................................40 5 3.4.1 Importance du bassin du Cher rapporté à celui de la Loire....................................40 3.4.2 Accès aux habitats de grossissement......................................................................42 4 Discussion........................................................................................................................................44 4.1 Discussion sur la méthode utilisée......................................................................................44 4.1.1 Définition des « variables » recherchées................................................................44 4.1.2 Repérage des zones courantes par photo-interprétation.........................................45 4.1.3 Tronçonnage...........................................................................................................45 4.1.4 Relevé et bancarisation des données de terrain pour l'alose et la lamproie marine45 4.1.5 Extrapolation des secteurs parcourus aux secteurs non parcourus.........................46 4.1.5.1 Les aloses...................................................................................................46 4.1.5.2 La lamproie marine....................................................................................46 4.1.6 L'échantillonnage....................................................................................................47 4.1.7 L'anguille européenne.............................................................................................47 4.1.8 Accessibilité du bassin versant...............................................................................48 4.2 Une répartition largement restreinte par les obstacles physiques.......................................48 4.2.1 Extension théorique maximale...............................................................................48