DOCSLIB.ORG

Výroční Zpráva NP 2014

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text
Výroční Zpráva NP 2014 Výroční zpráva za rok 2014 Název projektu: Národní program konzervace a využívání genetických zdrojů mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu Koordinátor: Ing. Petr Komínek, Ph.D. Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i. Drnovská 507, 161 06 Praha 6 - Ruzyně, Tel. +420 233 022 111 (ústředna), Fax +420 233 310 636, +420 233 310 638, ) E-mail: [email protected] 1 Výroční zpráva za rok 2014 Název projektu: Národní program konzervace a využívání genetických zdrojů mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu Doba řešení: 1 - 12 2014 Koordinátor: Ing. Petr Komínek, Ph.D. Dne: 23. 3. 2015 Podpis: Pověřená osoba: Výzkumný ústav rostlinné výroby v.v.i., Drnovská 507, 161 06 Praha 6 - Ruzyně IČO: 00027006 Statutární zástupce: Dr. Ing. Pavel Čermák ředitel VÚRV, v.v.i. Dne: 23. 3. 2015 Podpis: Čerpání finančních prostředků: Plán: 13 340 tis. Kč Skutečnost 13 340 tis. Kč Potvrzení garanta o převzetí výsledků expertního projektu: Ing. Renáta Jandová, MZe ČR Potvrzuji převzetí výsledků projektu Národního programu genetických zdrojů mikroorganismů ...: Dne: Podpis: 2 Obsah OBSAH strana Přehled sbírek 4 Anotace výroční zprávy 6 1. Charakteristika vykonaných prací 9 2.Přehled skupin mikroorganismů ve sbírce – současný stav a způsob evidence 29 3.Hodnocení a charakterizace genetických zdrojů 47 4. Výstupy řešení a jejich uživatelé 60 5. Účast na mezinárodní spolupráci 74 6. Seznam publikací v r. 2014 a jiných aktivit 79 7. Zákonné normy, z nichž vyplývá nutnost ochrany genových zdrojů 90 8. Závěr 92 9. Přílohy 93 A) Seznamy kmenů 93 3 Přehled sbírek SBÍRKY NÁRODNÍHO PROGRAMU GENETICKÝCH ZDROJŮ MIKROORGANISMŮ A. Přehled sbírek VÚRV v.v.i : a) Sbírka fytopatogenních virů a kolekce virových patogenů na ovocných dřevinách a révě vinné v technickém izolátu Pracoviště: VÚRV v.v.i Praha – Ruzyně, odbor rostlinolékařství Zodpovědný kurátor: Ing. Jiří Svoboda, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 233022303 b) Sbírka fytopatogenních baktérií a referenčních protilátek Pracoviště: VÚRV v.v.i Praha – Ruzyně, odbor rostlinolékařství Zodpovědný kurátor: Ing. Iveta Pánková, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 233022442 c) Sbírka fytopatogenních a dalších zemědělsky významných hub Pracoviště: VÚRV v.v.i Praha – Ruzyně, odbor rostlinolékařství Zodpovědný kurátor: RNDr. David Novotný, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 233022373, 233022358 d) Sbírka rhizobií Pracoviště: VÚRV v.v.i Praha – Ruzyně, odbor výživy rostlin Zodpovědný kurátor: Ing. Lenka Kabátová e-mail: [email protected], tel: 233022308 e) Sbírka rzí a padlí travního Pracoviště: VÚRV v.v.i Praha – Ruzyně, odbor genetiky, šlechtění a kvality produkce Zodpovědný kurátor: Mgr. Alena Hanzalová, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 233022243 f) Sbírka živočišných škůdců zemědělských plodin a jejich antagonistů Pracoviště: VÚRV v.v.i. Praha – Ruzyně, odbor rostlinolékařství Zodpovědný kurátor: Doc. RNDr. Pavel Saska, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 233022332 g) Chovy a sbírky skladištních škůdců, roztočů a mikroskopických hub Pracoviště: VÚRV v.v.i. Praha – Ruzyně, odbor rostlinolékařství Zodpovědný kurátor: Ing. Radek Aulický, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 233022360 h) Sbírka zahradnicky významných hub - makromycetů Pracoviště: VÚRV v.v.i. Olomouc, odbor genetiky, šlechtění a kvality produkce Zodpovědný kurátor: Ing. Karel Dušek, CSc. e-mail: [email protected], tel: 585209963 B. Přehled sbírek externích pracovišť ch)Sbírka fytopatogenních virů brambor Pracoviště: Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, s.r.o. Zodp. řešitel: Ing. Petr Dědič, CSc. e-mail: [email protected], tel: 605875454 i) Sbírka virů ovocných dřevin a drobného ovoce Pracoviště: VŠÚO Holovousy, s.r.o. Zodp. řešitel: Ing. Jana Suchá e-mail: [email protected], tel: 493692821 4 Přehled sbírek j) Sbírka virů okrasných rostlin Pracoviště: VÚKOZ, v.v.i., Průhonice Zodp. řešitel: Ing. Josef Mertelík, CSc. e-mail: [email protected], tel: 296528294 k) Sbírka zoopatogenních mikroorganismů Pracoviště: Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i , Brno Zodp. řešitel: MVDr. Markéta Reichelová e-mail: [email protected], tel: 533332131 l) Sbírka mlékárenských mikroorganismů Laktoflora Pracoviště: Milcom, a.s., Tábor Zodp. řešitel: Ing. Petr Roubal, CSc. e-mail: [email protected], tel: 381259014 m) Sbírka pivovarských mikroorganismů Pracoviště: Výzkumný ústav pivovarský a sladařský, a.s., Praha Zodp. řešitel: RNDr. Dagmar Matoulková, Ph.D. e-mail: [email protected], tel: 224900132 n) Sbírka průmyslově využitelných mikroorganismů Pracoviště: Výzkumný ústav potravinářský Praha, v.v.i. Zodp. řešitel: Ing. Alexandra Prošková e-mail: [email protected], tel: 296792206 o) Sbírka fytopatogenních mikroorganismů (fytopatogenních hub, vybraných fytoplazem a izolátů virů, a hospodářsky významných sinic a řas) Pracoviště: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta – katedra botaniky Zodp. řešitel: Prof. Ing. Aleš Lebeda, DrSc. e-mail: [email protected], tel: 585634800 p) Sbírka basidiomycetů hospodářsky významných pro zemědělství Pracoviště: Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i., Praha Zodp. řešitel: RNDr. Ladislav Homolka, CSc., RNDr. Ivana Eichlerová, Ph.D. e-mail: [email protected], [email protected], tel: 241062397 q) Sbírka patogenů chmele Pracoviště: Chmelařský institut, s.r.o , Žatec Zodp. řešitel: Ing. Petr Svoboda, CSc. e-mail: [email protected], tel: 415732121 r) Sbírka zemědělsky a potravinářsky významných kultur toxinogenních, fytopatogenních a entomopatogenních hub Pracoviště: Universita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta UK Zodp. řešitel: RNDr. Alena Kubátová, CSc. e-mail: [email protected], tel: 221951656 s) Sbírka fytopatogenních oomycetů Pracoviště: VÚKOZ, v.v.i., Průhonice Zodp. řešitel: Ing. Marcela Mrázková e-mail: [email protected], tel. 296528234 5 Anotace výroční zprávy Anotace výroční zprávy Národní program mikroorganismů sdružuje 12 organizací včetně VÚRV, v.v.i., který jeho činnost v rámci ČR koordinuje. V rámci VÚRV je součástí NP 8 sbírek mikroorganismů a drobných organismů, mimo VÚRV pak dalších 12 sbírek mikroorganismů. Obrázek 1: Struktura Národního programu mikroorganismů Sbírky v rámci NP mikroorganismů udržovaly v roce 2014 celkem 6 503 kmenů genetických zdrojů, úbytek oproti roku 2013 činil 302 položek, největší podíl na tomto úbytku měla reorganizace dvou sbírek, především vyřazování duplikátů a neživotaschopných izolátů. Sbírky v podprogramu mikroorganismů zahrnují fytopatogenní a zoopatogenní viry, bakterie a houby, užitečné mikroorganismy jako jsou rhizobia, průmyslově využitelné bakterie, kvasinky, askomycety, oomycety a basidiomycety. Součástí NP jsou také dvě sbírky škůdců; a to hmyzích rostlinných škůdců a jejich nepřátel a škůdců skladovaných komodit a potravin. Obrázek 2: Změny počtu kmenů v rámci Národního programu mikroorganismů 6 Anotace výroční zprávy V rámci VÚRV je také uchovávána referenční sbírka entomologických preparátů hmyzu a skladištních škůdců v počtu 7519 položek, která ovšem není genetickým zdrojem a není předmětem Národního programu ani dotací. V průběhu roku 2014 probíhaly práce na základě schválených standardních metodických postupů, spočívajících především v udržování položek jejich pravidelným pasážováním. V rámci celého podprogramu mikroorganismů probíhala průběžně charakterizace uchovávaných kmenů, zejména dle morfologických a biochemických kritérií. U řady sbírkových položek již byly získány sekvence jejich genomů, u některých virů to byly sekvence úplné. Tato charakterizace je financovaná především na základě projektů z veřejných soutěží, tedy mimo prostředky Národního programu. Uchovávané sbírkové položky byly v průběhu roku 2014 poskytovány uživatelům, což byly domácí i zahraniční pracoviště základního i aplikovaného výzkumu, šlechtitelské instituce, univerzity, střední školy a orgány státní správy. Celkem bylo v roce 2014 poskytnuto 903 kmenů, z toho 102 do zahraničí. Uvádíme pouze poskytnutí mimo instituci udržující daný genetický zdroj. Poskytnuté kmeny tak byly využity jako standardy pro expertní činnost (identifikace organismů, mikrobiologické rozbory a biochemická stanovení, školení a instruktáže), jako zdroje infekčního materiálu pro šlechtitelské účely a kontrolu kvality. Největší objem vydaných položek byl využit při řešení výzkumných projektů a jako studijní materiál při výuce na vysokých a středních školách. Obrázek 3: Počty vzoků genetických zdrojů mikroorganismů poskytnutých uživatelům Sbírky se poskytnutím genetických zdrojů podílely na vypracování 137 původních vědeckých publikací, odborných publikací, metodik a příspěvků do sborníků. Na konferencích a odborných seminářích byly předneseny příspěvky pro praxi. V rámci sbírek NP mikroorganismů byly v roce 2014 uděleny dva patenty a podány tři žádosti o patent. NP mikroorganismů jako celek byl prezentován na mezinárodní konferenci EFPP (European Foundation for Plant Pathology) v září 2014 v Krakowě v Polsku. Charakterizované kmeny poskytnuté sbírkami tak slouží jako referenční materiál k identifikaci, dále k přípravě detekčních nástrojů (specifické primery, optimalizované PCR postupy, specifické protilátky) a jako referenční kmeny pro laboratoře státní správy. Bohaté spektrum patogenů je využíváno šlechtiteli k hledání a ověřování zdrojů rezistence. 7 Anotace výroční zprávy Údaje o jednotlivých položkách všech sbírek jsou ukládány do centrální databáze umístěné na internetových stránkách VÚRV, v.v.i. Tato databáze slouží jako zdroj informací pro širokou veřejnost. Za poslední rok bylo provedeno 1153 dotazů na informace v databázi.
Load more

Recommended publications
  • Conservation Status Assessment
    Element Ranking Form Oregon Biodiversity Information Center Conservation Status Assessment Scientific Name: Fayodia bisphaerigera Classification: Fungus Assessment area: Global Heritage Rank: G3Q Rank Date: 3/9/2017 Assigned Rank Comments: None. Rank Adjustment Notes: Found over a wide range but rare within its range. In 2017 L. Norvell says "A good species; widespread in Asia, Europe (including Iceland), North America; critically threatened in Czech Republic (Holec & Beran 2006, Holec & al. 2015), France (Larent-Dargent 2009), and on Norway red list; 22 historical occurrences noted in Region 6. Antonín (2004) provides an excellent description of the European type material. NOTE: In 2002 Norvell noted taxonomic confusion between F. bisphaerigera and 'Mycena rainierensis' to be resolved when Redhead combined M. rainierensis in Fayodia. As no such transfer has been made, the status of the PNW taxon remains unresolved. The PNW reports of F. 'biphaerigera', would reflect the rarity accurately, and current ranking accepted until taxonomy is resolved." (Holec, Jan; Beran, Miroslav (eds.) 2006. Red list of fungi (macromycetes) of the Czech Republic]. – Příroda, Praha, 24: 1-282. [in Czech with English summary] ; Holec, Jan; Kříž, Martin; Pouzar, Zdeněk; Šandová, Markéta. 2015. Boubínský prales virgin forest, a Central European refugium of boreal-montane and old-growth forest fungi. Czech Mycology 67(2): 157–226. ; Laurent-Dargent, Jonathan. 2009. La Liste Rouge des Champignons (macromycètes) rares ou menacés de Lorraine. Thesis for Docteur de Pharmacie: Universite Henry Poincare - Nancy I. 120 pp ; Antonín, Vladimír. 2004. Notes on the genus Fayodia s.l. (Tricholomataceae) — II. Type studies of European species described in the genera Fayodia and Gamundia.
    [Show full text]
  • Major Clades of Agaricales: a Multilocus Phylogenetic Overview
    Mycologia, 98(6), 2006, pp. 982–995. # 2006 by The Mycological Society of America, Lawrence, KS 66044-8897 Major clades of Agaricales: a multilocus phylogenetic overview P. Brandon Matheny1 Duur K. Aanen Judd M. Curtis Laboratory of Genetics, Arboretumlaan 4, 6703 BD, Biology Department, Clark University, 950 Main Street, Wageningen, The Netherlands Worcester, Massachusetts, 01610 Matthew DeNitis Vale´rie Hofstetter 127 Harrington Way, Worcester, Massachusetts 01604 Department of Biology, Box 90338, Duke University, Durham, North Carolina 27708 Graciela M. Daniele Instituto Multidisciplinario de Biologı´a Vegetal, M. Catherine Aime CONICET-Universidad Nacional de Co´rdoba, Casilla USDA-ARS, Systematic Botany and Mycology de Correo 495, 5000 Co´rdoba, Argentina Laboratory, Room 304, Building 011A, 10300 Baltimore Avenue, Beltsville, Maryland 20705-2350 Dennis E. Desjardin Department of Biology, San Francisco State University, Jean-Marc Moncalvo San Francisco, California 94132 Centre for Biodiversity and Conservation Biology, Royal Ontario Museum and Department of Botany, University Bradley R. Kropp of Toronto, Toronto, Ontario, M5S 2C6 Canada Department of Biology, Utah State University, Logan, Utah 84322 Zai-Wei Ge Zhu-Liang Yang Lorelei L. Norvell Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Pacific Northwest Mycology Service, 6720 NW Skyline Sciences, Kunming 650204, P.R. China Boulevard, Portland, Oregon 97229-1309 Jason C. Slot Andrew Parker Biology Department, Clark University, 950 Main Street, 127 Raven Way, Metaline Falls, Washington 99153- Worcester, Massachusetts, 01609 9720 Joseph F. Ammirati Else C. Vellinga University of Washington, Biology Department, Box Department of Plant and Microbial Biology, 111 355325, Seattle, Washington 98195 Koshland Hall, University of California, Berkeley, California 94720-3102 Timothy J.
    [Show full text]
  • Phylogenetic Classification of Trametes
    TAXON 60 (6) • December 2011: 1567–1583 Justo & Hibbett • Phylogenetic classification of Trametes SYSTEMATICS AND PHYLOGENY Phylogenetic classification of Trametes (Basidiomycota, Polyporales) based on a five-marker dataset Alfredo Justo & David S. Hibbett Clark University, Biology Department, 950 Main St., Worcester, Massachusetts 01610, U.S.A. Author for correspondence: Alfredo Justo, [email protected] Abstract: The phylogeny of Trametes and related genera was studied using molecular data from ribosomal markers (nLSU, ITS) and protein-coding genes (RPB1, RPB2, TEF1-alpha) and consequences for the taxonomy and nomenclature of this group were considered. Separate datasets with rDNA data only, single datasets for each of the protein-coding genes, and a combined five-marker dataset were analyzed. Molecular analyses recover a strongly supported trametoid clade that includes most of Trametes species (including the type T. suaveolens, the T. versicolor group, and mainly tropical species such as T. maxima and T. cubensis) together with species of Lenzites and Pycnoporus and Coriolopsis polyzona. Our data confirm the positions of Trametes cervina (= Trametopsis cervina) in the phlebioid clade and of Trametes trogii (= Coriolopsis trogii) outside the trametoid clade, closely related to Coriolopsis gallica. The genus Coriolopsis, as currently defined, is polyphyletic, with the type species as part of the trametoid clade and at least two additional lineages occurring in the core polyporoid clade. In view of these results the use of a single generic name (Trametes) for the trametoid clade is considered to be the best taxonomic and nomenclatural option as the morphological concept of Trametes would remain almost unchanged, few new nomenclatural combinations would be necessary, and the classification of additional species (i.e., not yet described and/or sampled for mo- lecular data) in Trametes based on morphological characters alone will still be possible.
    [Show full text]
  • INTRODUCTION Biodiversity of Agaricomycetes Basidiomes
    View metadata, citation and similar papers at core.ac.uk brought to you by CORE provided by CONICET Digital DARWINIANA, nueva serie 1(1): 67-75. 2013 Versión final, efectivamente publicada el 31 de julio de 2013 ISSN 0011-6793 impresa - ISSN 1850-1699 en línea BIODIVERSITY OF AGARICOMYCETES BASIDIOMES ASSOCIATED TO SALIX AND POPULUS (SALICACEAE) PLANTATIONS Gonzalo M. Romano1, Javier A. Calcagno2 & Bernardo E. Lechner1 1Laboratorio de Micología, Fitopatología y Liquenología, Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental, Programa de Plantas Medicinales y Programa de Hongos que Intervienen en la Degradación Biológica (CONICET), Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, Intendente Güiraldes 2160, Pabellón II, Piso 4, Laboratorio 7, C1428EGA Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina; [email protected] (author for correspondence). 2Centro de Estudios Biomédicos, Biotecnológicos, Ambientales y de Diagnóstico - Departamento de Ciencias Natu- rales y Antropológicas, Instituto Superior de Investigaciones, Hidalgo 775, C1405BCK Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina. Abstract. Romano, G. M.; J. A. Calcagno & B. E. Lechner. 2013. Biodiversity of Agaricomycetes basidiomes asso- ciated to Salix and Populus (Salicaceae) plantations. Darwiniana, nueva serie 1(1): 67-75. Although plantations have an artificial origin, they modify environmental conditions that can alter native fungi diversity. The effects of forest management practices on a plantation of willow (Salix) and poplar (Populus) over Agaricomycetes basidiomes biodiversity were studied for one year in an island located in Paraná Delta, Argentina. Dry weight and number of basidiomes were measured. We found 28 species belonging to Agaricomycetes: 26 species of Agaricales, one species of Polyporales and one species of Russulales.
    [Show full text]
  • Hans Halbwachs
    Hans Halbwachs hat are fungal characteristics Moreover, the variability of spore traits in winter. It has been speculated that good for? Well, for identifying is bewildering (as was discussed by Else this may be a strategy to avoid predators fungi, of course! Field Vellinga in the previous issue of FUNGI). (Halbwachs et al., 2016), though this Wmycologists all over the world are living Size, ornamentation, and pigmentation would imply investment, e.g., into encyclopedias when it comes to fungal occur in all combinations (Fig. 2). These antifreeze substances and producing traits. Even the most subtle differences are the visible characteristics which may relatively small fruit bodies, as in in spore size or cap coloration have their be grouped in (1) morphological (shape, Flammulina velutipes or Hygrophorus place in identifying mushrooms and size) and (2) physiological (pigments, hypothejus. Generally, species fruiting other fungi. Quite many mycologists are taste, smell, toxicity, etc.). A third, more in late autumn seem to have larger intrigued by the endless variations, for mysterious trait, is the phenology of fruit fruit bodies, at least in Cortinarius instance of fruit bodies (Fig. 1). bodies. Some do it in spring, some even (Halbwachs, 2018). Figure 1. Examples of basidiomycete fruit body shapes and colors. From left to right top: Amanita flavoconia (courtesy J. Veitch), Lactarius indigo (courtesy A. Rockefeller), Butyriboletus frostii (courtesy D. Molter); bottom: Calostoma cinnabarinum (courtesy D. Molter), Tricholomopsis decora (courtesy W. Sturgeon), Mycena adonis (courtesy D. Molter). creativecommons. org/licenses/by-sa/3.0/deed.en. 18 FUNGI Volume 12:1 Spring 2019 Knockin’ on Evolution’s Door Although some ideas are circulating about the functionality of fungal traits, mycologists want to know more about their ecological implications.
    [Show full text]
  • Universidade Federal Do Paraná Francisco Menino Destéfanis Vítola Antileishmanial Biocompounds Screening on Submerged Mycelia
    UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ FRANCISCO MENINO DESTÉFANIS VÍTOLA ANTILEISHMANIAL BIOCOMPOUNDS SCREENING ON SUBMERGED MYCELIAL CULTURE BROTHS OF TWELVE MACROMYCETE SPECIES CURITIBA 2008 FRANCISCO MENINO DESTÉFANIS VÍTOLA ANTILEISHMANIAL BIOCOMPOUNDS SCREENING ON SUBMERGED MYCELIAL CULTURE BROTHS OF TWELVE MACROMYCETE SPECIES Dissertation presented as a partial requisite for the obtention of a master’s degree in Bioprocesses Engineering and Biotechnology from the Bioprocesses Engineering and Biotechnology post-Graduation Program, Technology Sector, Federal University of Parana. Advisors: Prof. Dr. Carlos Ricardo Soccol Prof. Dr. Vanete Thomaz Soccol CURITIBA 2008 ACKNOWLEDGMENTS I would like to express my gratefulness for: My supervisors, Dr. Carlos Ricardo Soccol and Dr. Vanete Thomaz Soccol, for all the inspiration and patience. I am very thankful for this opportunity to take part and contribute on such a decent scientific field as that covered by this dissertation, mainly concerned with the application of biotechnology for noble purposes as solving health problems and improving quality of life. Dr. Jean Luc Tholozan and Dr. Jean Lorquin– Université de Provence et de la Mediterranée, for their efforts on international cooperation for science development. The expert mycologist, André de Meijer (SPVS), who gently colaborated with this work, identifying all the assessed mushrooms species. Dr. Luiz Cláudio Fernandes – physiology department – UFPR, for collaboration with instruction, equipments, and material for the radiolabelled thymidine methodology. Dr. Stênio Fragoso – IBMP, for collaborating with the scintillator equipment. Dr. Sílvio Zanatta – neurophysiology laboratory – UFPR, for helping with laboratory material and equipment. Marcelo Fernandes, that has been my colleague on mushroom research for the last years, for help with mushrooms collection, isolation and maintenance.
    [Show full text]
  • Fungal Diversity in the Mediterranean Area
    Fungal Diversity in the Mediterranean Area • Giuseppe Venturella Fungal Diversity in the Mediterranean Area Edited by Giuseppe Venturella Printed Edition of the Special Issue Published in Diversity www.mdpi.com/journal/diversity Fungal Diversity in the Mediterranean Area Fungal Diversity in the Mediterranean Area Editor Giuseppe Venturella MDPI • Basel • Beijing • Wuhan • Barcelona • Belgrade • Manchester • Tokyo • Cluj • Tianjin Editor Giuseppe Venturella University of Palermo Italy Editorial Office MDPI St. Alban-Anlage 66 4052 Basel, Switzerland This is a reprint of articles from the Special Issue published online in the open access journal Diversity (ISSN 1424-2818) (available at: https://www.mdpi.com/journal/diversity/special issues/ fungal diversity). For citation purposes, cite each article independently as indicated on the article page online and as indicated below: LastName, A.A.; LastName, B.B.; LastName, C.C. Article Title. Journal Name Year, Article Number, Page Range. ISBN 978-3-03936-978-2 (Hbk) ISBN 978-3-03936-979-9 (PDF) c 2020 by the authors. Articles in this book are Open Access and distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY) license, which allows users to download, copy and build upon published articles, as long as the author and publisher are properly credited, which ensures maximum dissemination and a wider impact of our publications. The book as a whole is distributed by MDPI under the terms and conditions of the Creative Commons license CC BY-NC-ND. Contents About the Editor .............................................. vii Giuseppe Venturella Fungal Diversity in the Mediterranean Area Reprinted from: Diversity 2020, 12, 253, doi:10.3390/d12060253 .................... 1 Elias Polemis, Vassiliki Fryssouli, Vassileios Daskalopoulos and Georgios I.
    [Show full text]
  • A Preliminary Checklist of Arizona Macrofungi
    A PRELIMINARY CHECKLIST OF ARIZONA MACROFUNGI Scott T. Bates School of Life Sciences Arizona State University PO Box 874601 Tempe, AZ 85287-4601 ABSTRACT A checklist of 1290 species of nonlichenized ascomycetaceous, basidiomycetaceous, and zygomycetaceous macrofungi is presented for the state of Arizona. The checklist was compiled from records of Arizona fungi in scientific publications or herbarium databases. Additional records were obtained from a physical search of herbarium specimens in the University of Arizona’s Robert L. Gilbertson Mycological Herbarium and of the author’s personal herbarium. This publication represents the first comprehensive checklist of macrofungi for Arizona. In all probability, the checklist is far from complete as new species await discovery and some of the species listed are in need of taxonomic revision. The data presented here serve as a baseline for future studies related to fungal biodiversity in Arizona and can contribute to state or national inventories of biota. INTRODUCTION Arizona is a state noted for the diversity of its biotic communities (Brown 1994). Boreal forests found at high altitudes, the ‘Sky Islands’ prevalent in the southern parts of the state, and ponderosa pine (Pinus ponderosa P.& C. Lawson) forests that are widespread in Arizona, all provide rich habitats that sustain numerous species of macrofungi. Even xeric biomes, such as desertscrub and semidesert- grasslands, support a unique mycota, which include rare species such as Itajahya galericulata A. Møller (Long & Stouffer 1943b, Fig. 2c). Although checklists for some groups of fungi present in the state have been published previously (e.g., Gilbertson & Budington 1970, Gilbertson et al. 1974, Gilbertson & Bigelow 1998, Fogel & States 2002), this checklist represents the first comprehensive listing of all macrofungi in the kingdom Eumycota (Fungi) that are known from Arizona.
    [Show full text]
  • A New Poroid Species of Resupinatus from Puerto Rico, with a Reassessment of the Cyphelloid Genus Stigmatolemma
    Mycologia, 97(5), 2005, pp. 000–000. # 2005 by The Mycological Society of America, Lawrence, KS 66044-8897 A new poroid species of Resupinatus from Puerto Rico, with a reassessment of the cyphelloid genus Stigmatolemma R. Greg Thorn1 their place in the cyphellaceous genus Stigmatolemma…’’ Department of Biology, University of Western Ontario, (Donk 1966) London, Ontario, N6A 5B7 Canada Jean-Marc Moncalvo INTRODUCTION Centre for Biodiversity and Conservation Biology, Royal Ontario Museum and Department of Botany, University Resupinatus S.F. Gray is a small genus of euagarics of Toronto, Toronto, Ontario, M5S 2C6 Canada (Hibbett and Thorn 2001) with 49 specific and Scott A. Redhead varietal epithets as of Apr 2005, excluding autonyms Systematic Mycology and Botany Section, Eastern Cereal and invalid names (www.indexfungorum.org). Fruit- and Oilseed Research, Agriculture and Agri-Food ing bodies of Resupinatus are small—a few mm to Canada, Ottawa, Ontario, K1A 0C6 Canada 2 cm in breadth—and generally pendent or resupi- D. Jean Lodge nate on the undersides of rotting logs and other Center for Forest Mycology Research, USDA Forest woody materials or herbaceous debris. Historically, Service-FPL, P.O. Box 1377, Luquillo, Puerto Rico, members of Resupinatus were treated within the USA 00773-1377 broad concept of Pleurotus (Fr.) P. Kumm. (e.g. Pila´t 1935, Coker, 1944). In modern times, the genus has Marı´a P. Martı´n been characterized by a gelatinous zone in the pileus, Real Jardı´n Bota´nico, CSIC, Plaza de Murillo 2, 28014 Madrid, Spain hyaline inamyloid spores and the absence of metuloid cystidia. The genus Hohenbuehelia Schulzer shares the gelatinized layer and inamyloid spores, but has Abstract: A fungus with gelatinous poroid fruiting metuloid cystidia (Singer 1986, Thorn and Barron bodies was found in Puerto Rico and determined by 1986).
    [Show full text]
  • Chemical Elements in Ascomycetes and Basidiomycetes
    Chemical elements in Ascomycetes and Basidiomycetes The reference mushrooms as instruments for investigating bioindication and biodiversity Roberto Cenci, Luigi Cocchi, Orlando Petrini, Fabrizio Sena, Carmine Siniscalco, Luciano Vescovi Editors: R. M. Cenci and F. Sena EUR 24415 EN 2011 1 The mission of the JRC-IES is to provide scientific-technical support to the European Union’s policies for the protection and sustainable development of the European and global environment. European Commission Joint Research Centre Institute for Environment and Sustainability Via E.Fermi, 2749 I-21027 Ispra (VA) Italy Legal Notice Neither the European Commission nor any person acting on behalf of the Commission is responsible for the use which might be made of this publication. Europe Direct is a service to help you find answers to your questions about the European Union Freephone number (*): 00 800 6 7 8 9 10 11 (*) Certain mobile telephone operators do not allow access to 00 800 numbers or these calls may be billed. A great deal of additional information on the European Union is available on the Internet. It can be accessed through the Europa server http://europa.eu/ JRC Catalogue number: LB-NA-24415-EN-C Editors: R. M. Cenci and F. Sena JRC65050 EUR 24415 EN ISBN 978-92-79-20395-4 ISSN 1018-5593 doi:10.2788/22228 Luxembourg: Publications Office of the European Union Translation: Dr. Luca Umidi © European Union, 2011 Reproduction is authorised provided the source is acknowledged Printed in Italy 2 Attached to this document is a CD containing: • A PDF copy of this document • Information regarding the soil and mushroom sampling site locations • Analytical data (ca, 300,000) on total samples of soils and mushrooms analysed (ca, 10,000) • The descriptive statistics for all genera and species analysed • Maps showing the distribution of concentrations of inorganic elements in mushrooms • Maps showing the distribution of concentrations of inorganic elements in soils 3 Contact information: Address: Roberto M.
    [Show full text]
  • 21 August 2021 Aperto
    AperTO - Archivio Istituzionale Open Access dell'Università di Torino Gamundia nivea sp. nov. (Basidiomycota, Agaricomycetes) from central Europe (France) This is the author's manuscript Original Citation: Availability: This version is available http://hdl.handle.net/2318/78020 since 2016-10-06T15:44:51Z Published version: DOI:10.1111/j.1756-1051.2010.00783.x Terms of use: Open Access Anyone can freely access the full text of works made available as "Open Access". Works made available under a Creative Commons license can be used according to the terms and conditions of said license. Use of all other works requires consent of the right holder (author or publisher) if not exempted from copyright protection by the applicable law. (Article begins on next page) 06 October 2021 This is the author's final version of the contribution published as: E. Musumeci; M. Contu; A. Vizzini. Gamundia nivea sp. nov. (Basidiomycota, Agaricomycetes) from central Europe (France). NORDIC JOURNAL OF BOTANY. 28(4) pp: 428-431. DOI: 10.1111/j.1756-1051.2010.00783.x The publisher's version is available at: http://doi.wiley.com/10.1111/j.1756-1051.2010.00783.x When citing, please refer to the published version. Link to this full text: http://hdl.handle.net/2318/78020 This full text was downloaded from iris - AperTO: https://iris.unito.it/ iris - AperTO University of Turin’s Institutional Research Information System and Open Access Institutional Repository Gamundia nivea sp. nov. (Basidiomycota, Agaricomycetes) from central Europe (France) Authors E. Musumeci, M. Contu, A. Vizzini Abstract The new species Gamundia nivea is described from an Abies alba wood in France.
    [Show full text]
  • New Records of Polypores from Iran, with a Checklist of Polypores for Gilan Province
    CZECH MYCOLOGY 68(2): 139–148, SEPTEMBER 27, 2016 (ONLINE VERSION, ISSN 1805-1421) New records of polypores from Iran, with a checklist of polypores for Gilan Province 1 2 MOHAMMAD AMOOPOUR ,MASOOMEH GHOBAD-NEJHAD *, 1 SEYED AKBAR KHODAPARAST 1 Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Sciences, University of Gilan, P.O. Box 41635-1314, Rasht 4188958643, Iran. 2 Department of Biotechnology, Iranian Research Organization for Science and Technology (IROST), P.O. Box 3353-5111, Tehran 3353136846, Iran; [email protected] *corresponding author Amoopour M., Ghobad-Nejhad M., Khodaparast S.A. (2016): New records of polypores from Iran, with a checklist of polypores for Gilan Province. – Czech Mycol. 68(2): 139–148. As a result of a survey of poroid basidiomycetes in Gilan Province, Antrodiella fragrans, Ceriporia aurantiocarnescens, Oligoporus tephroleucus, Polyporus udus,andTyromyces kmetii are newly reported from Iran, and the following seven species are reported as new to this province: Coriolopsis gallica, Fomitiporia punctata, Hapalopilus nidulans, Inonotus cuticularis, Oligo- porus hibernicus, Phylloporia ribis,andPolyporus tuberaster. An updated checklist of polypores for Gilan Province is provided. Altogether, 66 polypores are known from Gilan up to now. Key words: fungi, hyrcanian forests, poroid basidiomycetes. Article history: received 28 July 2016, revised 13 September 2016, accepted 14 September 2016, published online 27 September 2016. Amoopour M., Ghobad-Nejhad M., Khodaparast S.A. (2016): Nové nálezy chorošů pro Írán a checklist chorošů provincie Gilan. – Czech Mycol. 68(2): 139–148. Jako výsledek systematického výzkumu chorošotvarých hub v provincii Gilan jsou publikovány nové druhy pro Írán: Antrodiella fragrans, Ceriporia aurantiocarnescens, Oligoporus tephroleu- cus, Polyporus udus a Tyromyces kmetii.
    [Show full text]