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Tesis Doctoral Rocío Pelayo García

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Tesis Doctoral Rocío Pelayo García CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LA RAZA BOVINA DE LIDIA: DIFERENCIACIÓN GENÉTICA DE LOS DISTINTOS ENCASTES DE LA RAZA ASÍ COMO LA CARACTERIZACIÓN DE LA ACTITUD COMPORTAMENTAL DE LA MISMA CHARACTERIZATION OF THE LIDIA CATTLE BREED: GENETIC DIFFERENTIATION OF DIFFERENT ENCASTES AND BEHAVIORAL ATTITUDE CHARACTERIZATION TESIS DOCTORAL ROCÍO PELAYO GARCÍA Córdoba, Febrero de 2017 TITULO: Caracterización genética de la raza bovina de Lidia: diferenciación genética de los distintos encastes de la raza así como la caracterización de la actitud comportamental de la misma AUTOR: Rocío Pelayo García © Edita: UCOPress. 2017 Campus de Rabanales Ctra. Nacional IV, Km. 396 A 14071 Córdoba www.uco.es/publicaciones [email protected] CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LA RAZA BOVINA DE LIDIA: DIFERENCIACIÓN GENÉTICA DE LOS DISTINTOS ENCASTES DE LA RAZA ASÍ COMO LA CARACTERIZACIÓN DE LA ACTITUD COMPORTAMENTAL DE LA MISMA CHARACTERIZATION OF THE LIDIA CATTLE BREED: GENETIC DIFFERENTIATION OF DIFFERENT ENCASTES AND BEHAVIORAL ATTITUDE CHARACTERIZATION MEMORIA DE TESIS DOCTORAL PRESENTADA POR ROCÍO PELAYO GARCÍA Para optar al Grado de Doctor con Mención Internacional por la Universidad de Córdoba DIRECTORES Dra. Mercedes Valera Córdoba Dr.Luis Royo Martín Dr. Pedro J. Azor Ortiz Córdoba, Febrero de 2017 TÍTULO DE LA TESIS: CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LA RAZA BOVINA DE LIDIA: DIFERENCIACIÓN GENÉTICA DE LOS DISTINTOS ENCASTES DE LA RAZA ASÍ COMO LA CARACTERIZACIÓN DE LA ACTITUD COMPORTAMENTAL DE LA MISMA. DOCTORANDO/A: ROCÍO PELAYO GARCÍA INFORME RAZONADO DE LOS DIRECTOR/ES DE LA TESIS Y EL TUTOR (se hará mención a la evolución y desarrollo de la tesis, así como a trabajos y publicaciones derivados de la misma). La Tesis Doctoral que se presenta se ha elaborado a modo de “compendio de publicaciones”, al estar integrada por cuatro artículos publicados en revistas JCR, de gran impacto en el campo de la Ciencia Animal. La Tesis se ha estructurado en 3 bloques principalmente. Capítulo 1: “Caracterización genética, a partir de marcadores moleculares, de la raza bovina de Lidia”. En el primer capítulo se ha abordado una caracterización molecular en el cromosoma Y para estudiar el origen filogenético de la raza bovina de Lidia y algunas de sus principales castas y encastes. Asimismo, con la ayuda de diferentes polimorfismos no estudiados hasta el momento en el cromosoma Y, se ha encontrado un nuevo haplogrupo presente únicamente en razas bovinas españolas y en algunas castas de Lidia. Este capítulo está integrado por dos trabajos: - Pelayo R, Valera M, Molina A, Royo LJ. 2015. Contribution of Lidia cattle breed historical castes to the paternal genetic stock of Spain. Animal Genetics, 46 (3): 312-315. Doi: 10.1111/age.12278 o Impact Index: 1,779 (Journal Citation Report, 2015). o Subject and Quartile: Genetics and heredity, 1st quartile. - Pelayo R, Penedo M.C.T, Valera M, Molina A, Ginja C, Royo L.J. 2016. Identification of a new Y chromosome haplogroup in Spanish native cattle. Animal Genetics. DOI: 10.1111/age.12549. In press. o Impact Index: 1,779 (Journal Citation Report, 2015). o Subject and Quartile: Genetics and heredity, 1st quartile. Capítulo 2: “Sistema de calificación lineal estandarizada para evaluar el comportamiento en la raza Bovina de Lidia y estimación de parámetros genéticos”. En el segundo capítulo se ha puesto a punto un sistema de Calificación Lineal Estandarizada para evaluar el Comportamiento del toro durante el tentadero en ganadería (ficha CLEC). A partir de los datos recogidos utilizando la metodología CLEC se he estimado los parámetros genéticos para los principales caracteres comportamentales de esta raza. Este capítulo está integrado por 1 trabajo: - Pelayo R, Solé M, Sánchez M.J, Molina A, Valera M. 2015. Behavioural linear standardized scoring system of the Lidia cattle breed by testing in herd: estimation of genetic parameters. Journal of Animal Breeding and Genetics, 133(2016): 414-421. Doi: 10.1111/jbg.12198. o Impact Index: 1,745 (Journal Citation Report, 2015). o Subject and Quartile: Agriculture, Dairy and Animal Science, 1st quartile. Capítulo 3: “Estudio de polimorfismos asociados con la calidad de la carne en la raza Bovina de Lidia, como posible uso alternativo en el sistema de cría de esta raza”. En el tercer capítulo se ha contemplado el estudio de diferentes polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en varios cromosomas autosómicos de la raza bovina de Lidia (cromosoma 14 y 29) en tres genes relacionados con la terneza (CAPN1 y CAST) y la infiltración grasa (DGAT). Este capítulo está integrado por 1 trabajo: - Pelayo R, Valera M, Molina A, Avilés C 2016. Analysis of polymorphisms in candidate´s genes for meat quality in Lidia cattle. Spanish Journal of Agricultural Research, Volume 14, Issue 4, e04SC02. Doi: 10.5424/sjar/2016144-9279. o Impact Index: 0,760 (Journal Citation Report, 2015). o Subject and Quartile: Agriculture, multidisciplinary, 2nd quartile. Por la presente autorizamos la presentación y defensa de esta Tesis Doctoral bajo la modalidad de “compendio de publicaciones”, para obtener el grado de Doctor Internacional. Córdoba, Febrero de 2017 Firma de los directores Dra. Mercedes Valera Córdoba Dr. Luis Royo Martín Dr. Pedro J. Azor Ortiz Visto Bueno y Firma del Tutor y Responsable de la Línea de Investigación Fdo: Antonio Molina Alcalá Dra. Mercedes Valera Córdoba, Dr. Luís Royo Martín y Dr. Pedro J. Azor Ortiz INFORMAN: Que el trabajo titulado: CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LA RAZA BOVINA DE LIDIA: DIFERENCIACIÓN GENÉTICA DE LOS DISTINTOS ENCASTES DE LA RAZA ASÍ COMO LA CARACTERIZACIÓN DE LA ACTITUD COMPORTAMENTAL DE LA MISMA (CHARACTERIZATION OF THE LIDIA CATTLE BREED: GENETIC DIFFERENTIATION OF DIFFERENT ENCASTES AND BEHAVIORAL ATTITUDE CHARACTERIZATION), realizado por Dña. Rocío Pelayo García bajo la dirección de la Dra. Mercedes Valera Córdoba, el Dr. Luís Royo Martín y el Dr. Pedro J. Azor Ortiz, puede ser presentado para su exposición y defensa como Tesis Doctoral en el Departamento de Genética de la Universidad de Córdoba. Firmado en Córdoba, Febrero de 2017 Dra. Mercedes Valera Córdoba Dr. Luis Royo Martín Dr. Pedro J. Azor Ortiz TÍTULO DE LA TESIS: CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LA RAZA BOVINA DE LIDIA: DIFERENCIACIÓN GENÉTICA DE LOS DISTINTOS ENCASTES DE LA RAZA ASÍ COMO LA CARACTERIZACIÓN DE LA ACTITUD COMPORTAMENTAL DE LA MISMA. DOCTORANDA: ROCIO PELAYO GARCÍA MENCIÓN DE DOCTORADO INTERNACIONAL Esta Tesis reúne los requisitos establecidos en el artículo 35 de Normativa de Doctorado de la Universidad de Córdoba para la obtención del título de Doctor con Mención Internacional: Estancia internacional predoctoral de 3 meses (24/09/2013 AL 24/12/2013) en la Facultad de Veterinaria de la Universidad de Davis (California) bajo la supervisión de la Dr. Cecilia Penedo. La Tesis cuenta con el informe previo de dos doctores expertos y con experiencia investigadora acreditada perteneciente a alguna institución de educación superior o instituto de investigación de fuera de España: Dr. Abel Ponce de León. Research Scientist. Genomics and Molecular Genetics, University of Massachusetts. Dra. Mª Elena Fernández. Assistan Researcher Institute of Animal Genetics “Ing. Fernando Noel Dulout”. National Research Council (CONICET). Argentina. Parte de la Tesis se ha redactado en español e inglés y será presentada en estos dos idiomas. ”Estar preparado es importante, saber esperarlo es aún más, pero aprovechar el momento adecuado es la clave de la vida”. (Arthur Schnitzler) A mis padres, mis hermanos y a Miguel, por apoyar cada una de mis decisiones, por quererme tanto, por creer en mí. AGRADECIMIENTOS Al finalizar un trabajo tan apasionante, como el desarrollo de una Tesis Doctoral, te das cuenta que este trabajo habría sido imposible sin la participación de personas e instituciones que me han prestado su ayuda cada día. Por ello, para mí es un verdadero placer utilizar este espacio para expresar mi agradecimiento y reconocimiento. En primer lugar quiero agradecer de manera especial y sincera a los directores de esta Tesis. Mercedes Valera, Pedro J. Azor y Luís Royo. Mercedes gracias por darme esta oportunidad, por enseñarme tanto, por responder cada una de mis dudas de manera isofacta, por estar SIEMPRE ahí. Pedro, gracias por tu ayuda (sobre todo al inicio de este proyecto) y gracias por esas risas telefónicas y tantos bailes. Luís, gracias por acogerme en Asturias, por enseñarme todo lo que sé de cromosoma Y (es mi cromosoma favorito), gracias por estar presente cada día a través de Skype y por ser además de un director, UN AMIGO. Vuestro apoyo, disponibilidad y cariño, han sido fundamentales. No puedo olvidarme de Antonio Molina Alcalá. Gracias por enseñarme tanto (es una suerte tener cerca una mente como la tuya), por dedicarme los minutos que no tenías, por tantos peroles organizados jajajaja. Un auténtico placer poder trabajar con jefes como tú. Muchas gracias por tu apoyo y ayudarme en todo. Gracias Angelines por ser “la mami del grupo”. Siempre ayudándonos a todos, siempre con una sonrisa para todos. A la Agrupación Española de Ganaderos de Reses Bravas (AEGRB). Gracias Charo por permitir que usara vuestros datos y desde mi punto de vista, creer en nuestras investigaciones. Muchas gracias Pilar y sobre todo Isabel por ayudarme a cuadrar los datos de cada informe, siempre hemos sido un buen equipo. Gracias a todas las personas que me ayudaron y apoyaron cuando realicé estancias de investigación: Luis Royo en el SERIDA quien me enseñó todo lo que se del cromosoma Y pero sobre todo beber cervezas y arreglar el mundo de tarde en tarde, Cecilia Penedo (y todo su equipo) en la Universidad de Davis (California) y Simone Simone EF Guimarães (y todos los alumnos de su laboratorio) en la Universidad de Viçosa (Brasil). A mi grupo de investigación MERAGEM al completo… vaya equipo divertido he tenido y vaya suerte la mía de poder tener compañeros y AMIGOS: mis niñas “Sevillanas”, Ester, María José (Rubi, cómo nos gustan las comidas de empresa y acabar durmiendo en cualquier pub jajajjjajaj), la recién llegada Julia…GRACIAS chicas porque cada una de vosotras me habéis aportado algo.
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