TAXREF V6.0, Référentiel Taxonomique Pour La France : Mise En Œuvre Et Diffusion
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Direction de la Recherche, de l’Expertise et de la Valorisation Direction Déléguée au Développement Durable, à la Conservation de la Nature et à l’Expertise - 1 - - 1 - Service du Patrimoine Naturel O. Gargominy, S. Tercerie, C. Régnier, T. Ramage, P. Dupont, E. Vandel, P. Daszkiewicz & L. Poncet TAXREF v7.0, référentiel taxonomique pour la France. Méthodologie, mise en œuvre et diffusion Rapport SPN 2013 - 22 28 novembre 2013 Le Service du Patrimoine Naturel (SPN) Inventorier - Gérer - Analyser - Diffuser Au sein de la direction de la recherche, de l’expertise et de la valorisation (DIREV), le Service du Patrimoine Naturel développe la mission d'expertise confiée au Muséum national d'Histoire naturel pour la connaissance et la conservation de la nature. Il a vocation à couvrir l'ensemble de la thématique biodiversité (faune/flore/habitat) et géodiversité au niveau français (terrestre, marine, métropolitaine et ultra-marine). Il est chargé de la mutualisation et de l'optimisation de la collecte, de la synthèse et la diffusion d'informations sur le patrimoine naturel. Placé à l'interface entre la recherche scientifique et les décideurs, il travaille de façon partenariale avec l'ensemble des acteurs de la biodiversité afin de pouvoir répondre à sa mission de coordination scientifique de l’Inventaire national du Patrimoine naturel (code de l'environnement : L411-5). Un objectif : contribuer à la conservation de la Nature en mettant les meilleures connaissances à disposition et en développant l'expertise. En savoir plus : http://www.mnhn.fr/spn/ Directeur : Jean-Philippe SIBLET Adjoint au directeur en charge des programmes de connaissance : Laurent PONCET Adjoint au directeur en charge des programmes de conservation : Julien TOUROULT Porté par le SPN, cet inventaire est l'aboutissement d'une démarche qui associe scientifiques, collectivités territoriales, naturalistes et associations de protection de la nature en vue d'établir une synthèse sur le patrimoine naturel en France. Les données fournies par les partenaires sont organisées, gérées, validées et diffusées par le MNHN. Ce système est un dispositif clé du SINP et de l'Observatoire National de la Biodiversité. Afin de gérer cette importante source d'informations, le Muséum a construit une base de données permettant d'unifier les données à l’aide de référentiels taxonomiques, géographiques et administratifs. Il est ainsi possible d'accéder à des listes d'espèces par commune, par espace protégé ou par maille de 10x10 km. Grâce à ces systèmes de référence, il est possible de produire des synthèses quelle que soit la source d'information. Ce système d'information permet de mutualiser au niveau national ce qui était jusqu'à présent éparpillé à la fois en métropole comme en outre-mer et aussi bien pour la partie terrestre que pour la partie marine. C’est une contribution majeure pour la connaissance, l'expertise et l'élaboration de stratégies de conservation efficaces du patrimoine naturel. En savoir plus : http://inpn.mnhn.fr Programme/Projet : TAXREF, référentiel taxonomique pour la France Convention : Ministère en charge de l’Ecologie Chef de projet : O. Gargominy Chargés de mission : P. Daszkiewicz, T. Ramage, C. Régnier, S. Tercerie PARTENAIRES Citation conseillée : Gargominy, O., Tercerie, S., Régnier, C., Ramage, T., Dupont, P., Vandel, E., Daszkiewicz, P. & Poncet, L. 2013. TAXREF v7.0, référentiel taxonomique pour la France. Méthodologie, mise en œuvre et diffusion. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris. Rapport SPN 2013 – 22. 104 pp. Photos de couverture : Yan BUSKE, Olivier GARGOMINY, Arnaud HORELLOU, Philippe GOURDAIN, Renaud PUISSAUVE, Jean-Philippe SIBLET, Julien TOUROULT. TAXREF v7.0 en un clin d’œil France métropolitaine • « micro-algues » d’eau douce (dans le cadre de l’ATBI Mercantour) • flore vasculaire (mise à jour) • acariens aquatiques • araignées (mise à jour) Guyane française • araignées • oiseaux (mise à jour d’après la liste du CSRPN de Guyane) Antilles françaises • bryophytes (mousses, hépatiques et anthocérotes) de Guadeloupe et Martinique • acariens (mise à jour) • myriapodes (mise à jour) • insectes (mise à jour des coléoptères, diptères, hémiptères, lépidoptères et hyménoptères) • espèces marines de Saint-Martin (algues, éponges, hydraires, gorgones, échinodermes, …) Mayotte • odonates La Réunion • flore vasculaire (index du Conservatoire Botanique National de Mascarin) • acariens • insectes (coléoptères, dermaptères, dictyoptères, diptères, hémiptères, hyménoptères, neuroptères, orthoptères, phasmoptères, psocoptères, odonates (mise à jour)) Iles Eparses • crustacés décapodes Terres Australes et Antarctiques Françaises • flore native Nouvelle-Calédonie • monogènes • foraminifères • amphipodes • pycnogonides • trichoptères Wallis et Futuna • mollusques marins (mise à jour) • échinodermes Polynésie française • « zooplancton » • foraminifères • bryozoaires Clipperton • « micro-algues » • « zooplancton » Prise en compte de demandes d’utilisateurs • SERENA (RNF) • Liste des espèces déterminantes ZNIEFF (en cours) • Silene (DREAL PACA) • Sandre (ONEMA) % d’ajouts Version 7.0 par rapport à la v6.0 Nombre total de noms 407137 5 Classification supra-spécifique 40460 7 Noms d’espèces et d’infra 366677 5 Espèces et infra 144073 4 Noms d’espèces et d’infra pour la métropole 268494 2 Espèces et infra de métropole 97609 0 Espèces de métropole 86200 2 Espèces endémiques de métropole 2319 1 Noms d’espèces et d’infra pour l’outre-mer 124237 18 Espèces et infra d’outre-mer 50249 16 Espèces d’outre-mer 48002 16 Espèces d’outre-mer (hors Guyane) 42725 17 Espèces endémiques d’outre-mer 7540 23 Espèces endémiques d’outre-mer (hors Guyane) 7308 23 Nombre de références bibliographiques 2820 65 Nombre de données bibliographiques 142485 28 Nombre de CD_NOM liés à une référence bibliographique 101949 15 Nombre de CD_REF liés à une référence bibliographique 65810 21 Table des matières AVANT-PROPOS ............................................................................................................................................................................ 13 PARTIE 1 : METHODOLOGIE .................................................................................................................................................... 15 A. CONTEXTE ET OBJECTIFS ...................................................................................................................................................... 15 A.I. Objectifs ..................................................................................................................................................................... 15 A.II. Portée du référentiel .................................................................................................................................................. 16 A.II.1 Portée géographique ................................................................................................................................................................. 16 A.II.2 Portée taxonomique ................................................................................................................................................................. 16 A.II.3 Portée temporelle ..................................................................................................................................................................... 16 A.III. Périmètre du référentiel ............................................................................................................................................. 16 A.IV. Coordination et consolidation, rôle du MNHN .......................................................................................................... 16 B. GESTION DES NOMS SCIENTIFIQUES ...................................................................................................................................... 17 B.I. Principes généraux .................................................................................................................................................... 17 B.II. Pérennité des noms diffusés ....................................................................................................................................... 17 B.III. Règles pour la création de nouveaux noms ................................................................................................................ 18 B.IV. Recommandations nomenclaturales ........................................................................................................................... 18 C. SOURCES DE L’INFORMATION ............................................................................................................................................... 19 C.I. Sources utilisées ......................................................................................................................................................... 19 C.II. GSD : Global Species Database ................................................................................................................................ 20 C.III. Références bibliographiques ...................................................................................................................................... 21 C.III.1 Cas des listes liées à une GSD ................................................................................................................................................. 21 C.III.2 Cas des listes non liées à une GSD .........................................................................................................................................