TAXREF V8.0, Référentiel Taxonomique Pour La France : Méthodologie, Mise En Œuvre Et Diffusion
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Direction de la Recherche, de l’Expertise et de la Valorisation Direction Déléguée au Développement Durable, à la Conservation de la Nature et à l’Expertise - 1 - - 1 - Service du Patrimoine Naturel O. Gargominy, S. Tercerie, C. Régnier, T. Ramage, C. Schoelinck, P. Dupont, E. Vandel, P. Daszkiewicz & L. Poncet TAXREF v8.0, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion. Rapport SPN 2014 - 42 1er décembre 2014 Le Service du Patrimoine Naturel (SPN) Inventorier - Gérer - Analyser - Diffuser Au sein de la direction de la recherche, de l’expertise et de la valorisation (DIREV), le Service du Patrimoine Naturel développe la mission d'expertise confiée au Muséum national d'Histoire naturel pour la connaissance et la conservation de la nature. Il a vocation à couvrir l'ensemble de la thématique biodiversité (faune/flore/habitat) et géodiversité au niveau français (terrestre, marine, métropolitaine et ultra-marine). Il est chargé de la mutualisation et de l'optimisation de la collecte, de la synthèse et la diffusion d'informations sur le patrimoine naturel. Placé à l'interface entre la recherche scientifique et les décideurs, il travaille de façon partenariale avec l'ensemble des acteurs de la biodiversité afin de pouvoir répondre à sa mission de coordination scientifique de l’Inventaire national du Patrimoine naturel (code de l'environnement : L411-5). Un objectif : contribuer à la conservation de la Nature en mettant les meilleures connaissances à disposition et en développant l'expertise. En savoir plus : http://www.mnhn.fr/spn/ Directeur : Jean-Philippe SIBLET Adjoint au directeur en charge des programmes de connaissance : Laurent PONCET Adjoint au directeur en charge des programmes de conservation : Julien TOUROULT Porté par le SPN, cet inventaire est l'aboutissement d'une démarche qui associe scientifiques, collectivités territoriales, naturalistes et associations de protection de la nature en vue d'établir une synthèse sur le patrimoine naturel en France. Les données fournies par les partenaires sont organisées, gérées, validées et diffusées par le MNHN. Ce système est un dispositif clé du SINP et de l'Observatoire National de la Biodiversité. Afin de gérer cette importante source d'informations, le Muséum a construit une base de données permettant d'unifier les données à l’aide de référentiels taxonomiques, géographiques et administratifs. Il est ainsi possible d'accéder à des listes d'espèces par commune, par espace protégé ou par maille de 10x10 km. Grâce à ces systèmes de référence, il est possible de produire des synthèses quelle que soit la source d'information. Ce système d'information permet de mutualiser au niveau national ce qui était jusqu'à présent éparpillé à la fois en métropole comme en outre-mer et aussi bien pour la partie terrestre que pour la partie marine. C’est une contribution majeure pour la connaissance, l'expertise et l'élaboration de stratégies de conservation efficaces du patrimoine naturel. En savoir plus : http://inpn.mnhn.fr Programme/Projet : TAXREF, référentiel taxonomique pour la France Convention : Ministère en charge de l’Ecologie Chef de projet : O. Gargominy Chargés de mission : P. Daszkiewicz, T. Ramage, C. Régnier, C. Schoelinck, S. Tercerie PARTENAIRES Citation conseillée : Gargominy, O., Tercerie, S., Régnier, C., Ramage, T., Schoelinck, C., Dupont, P., Vandel, E., Daszkiewicz, P. & Poncet, L. 2014. TAXREF v8.0, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris. Rapport SPN 2014 – 42. 126 pp. Photos de couverture : Yan BUSKE, Olivier GARGOMINY, Arnaud HORELLOU, Philippe GOURDAIN, Renaud PUISSAUVE, Jean-Philippe SIBLET, Julien TOUROULT. TAXREF v8.0 en un clin d’œil France métropolitaine fourmis et syrphes (mise à jour) crustacés non décapodes et divers invertébrés marins (mise à jour) poissons marins (mise à jour) algues (mise à jour) Guyane française flore vasculaire, hépatiques et anthocérotes insectes oiseaux (mise à jour) reptiles (mise à jour) Antilles françaises mousses de Guadeloupe et Martinique hydraires de Martinique orchidées (mise à jour) insectes (mise à jour) Saint-Pierre et Miquelon flore vasculaire insectes Mayotte algues, annélides, éponges et zooplancton insectes La Réunion insectes (mise à jour) Iles Eparses échinodermes insectes Terres Australes et Antarctiques Françaises angiospermes natives de Saint-Paul et Amsterdam insectes Nouvelle-Calédonie nudibranches reptiles (mise à jour) Wallis et Futuna oiseaux mammifères insectes Polynésie française flore vasculaire (mise à jour) polychètes insectes, arachnides, myriapodes et crustacés terrestres et d'eau douce Clipperton insectes % d’ajouts Version v8.0 par rapport à la v7.0 Nombre total de noms 452106 11 Classification supra-spécifique 45758 13 Noms d’espèces et d’infra 406348 11 Espèces et infra 168699 17 Métropole Noms d’espèces et d’infra 272996 2 Espèces et infra 98731 1 Espèces 87325 1 Espèces endémiques 2357 2 Espèces introduites 2588 2 Outre-mer Noms d’espèces et d’infra 163928 32 Espèces et infra 74392 48 Espèces 70458 47 Espèces (hors Guyane) 48596 14 Espèces endémiques 10968 45 Espèces endémiques (hors Guyane) 9646 32 Espèces introduites 3046 14 Nombre de références bibliographiques 5154 83 Nombre de données bibliographiques 186855 31 Nombre de CD_NOM liés à une référence bibliographique 131829 29 Nombre de CD_REF liés à une référence bibliographique 84011 28 Pour toutes remarques ou demandes relatives à TAXREF, utiliser la page « contactez-nous » de l’INPN (thématiques : Référentiel espèces) : http://inpn.mnhn.fr/contact/contacteznous Pour envoyer de nouvelles publications (voir C.IV) : [email protected] Table des matières AVANT-PROPOS ............................................................................................................................................................................ 15 A. CONTEXTE ET OBJECTIFS .............................................................................................................................................. 17 A.I. OBJECTIFS ....................................................................................................................................................................... 17 A.II. PORTEE DU REFERENTIEL ................................................................................................................................................. 18 A.II.1 Portée géographique .................................................................................................................................................. 18 A.II.2 Portée taxonomique ................................................................................................................................................... 18 A.II.3 Portée temporelle ....................................................................................................................................................... 18 A.III. PERIMETRE DU REFERENTIEL ........................................................................................................................................... 18 A.IV. COORDINATION ET CONSOLIDATION, ROLE DU MNHN .................................................................................................... 18 B. GESTION DES NOMS SCIENTIFIQUES .......................................................................................................................... 19 B.I. PRINCIPES GENERAUX ...................................................................................................................................................... 19 B.II. PERENNITE DES NOMS DIFFUSES ...................................................................................................................................... 19 B.III. REGLES POUR LA CREATION DE NOUVEAUX NOMS ........................................................................................................... 20 B.IV. RECOMMANDATIONS NOMENCLATURALES ...................................................................................................................... 20 C. SOURCES DE L’INFORMATION ...................................................................................................................................... 21 C.I. SOURCES UTILISEES ......................................................................................................................................................... 21 C.II. GSD : GLOBAL SPECIES DATABASE ................................................................................................................................ 22 C.III. CONSOLIDATIONS NATIONALE ET INTERNATIONALE ........................................................................................................ 23 C.III.1 Cas des listes de taxons liés à une GSD ................................................................................................................ 23 C.III.2 Cas des listes de taxons non liés à une GSD ......................................................................................................... 24 C.IV. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES .................................................................................................................................... 25 C.IV.1 Pour ajout de noms scientifiques ........................................................................................................................... 25 C.IV.2 Pour ajout de noms vernaculaires ........................................................................................................................