Supplementary file 1 to: Conservation of genetic diversity in Mediterranean endemic : balearica () Javier Bobo-Pinilla, Noemí López-González & Julio Peñas de Giles

Plant Ecology and Evolution 153(3), 2020

Supplementary file 1 – Probabilities of loss of 474 rare AFLP alleles when all populations of Arenaria balearica are considered as one single management unit and preferred sampling area. Npop, number of populations where each AFLP allele was found; Nind, number of individuals where the alleles were found; geographical regions: MAJ = Majorca, COR = Corsica, SAR = Sardinia; Lo, observed probability of loss of the allele; Le, expected probability of loss of the allele; PSA, preferred sampling area.

Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B004 3 1 1 1 1 1 1 0.4632 0.0027 0.12 B012 4 0 3 1 0 9 1 COR 0.0849 0.0000 0.27 B017 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.5410 0.0009 0.14 B024 2 1 0 1 1 0 2 SAR 0.4358 0.0001 0.19 B030 3 2 0 1 3 0 1 MAJ 0.3674 0.0005 0.15 B031 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 B033 3 1 1 1 2 2 1 0.2967 0.0001 0.18 B044 4 0 1 3 0 1 11 SAR 0.0558 0.0000 0.30 B047 4 2 1 1 2 1 1 MAJ 0.4200 0.0068 0.10 B053 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5057 0.0054 0.11 B070 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6204 0.0041 0.11 B071 4 2 0 2 4 0 2 SAR 0.2357 0.0002 0.17 B076 4 0 2 2 0 2 2 0.3849 0.0041 0.11 B080 4 2 1 1 3 1 1 MAJ 0.3128 0.0013 0.14 B083 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B084 3 1 0 2 1 0 11 SAR 0.0429 0.0000 0.41 B094 3 0 1 2 0 1 5 SAR 0.2621 0.0000 0.20 B097 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 B099 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B100 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.7656 0.0021 0.13 B101 2 1 0 1 1 0 6 SAR 0.3164 0.0000 0.25 B105 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.5003 0.0049 0.11 B115 4 2 0 2 2 0 2 0.4453 0.0095 0.10 B161 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 B162 2 0 1 1 0 6 1 COR 0.1296 0.0000 0.40 B163 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6049 0.0000 0.22 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B167 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.3071 0.0000 0.26 B170 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 B178 3 0 2 1 0 4 3 COR 0.1234 0.0000 0.29 B182 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B188 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 B189 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6050 0.0031 0.12 B191 3 0 3 0 0 6 0 COR 0.1780 0.0000 0.25 B193 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B195 4 0 2 2 0 4 5 SAR 0.0507 0.0000 0.31 B196 3 2 1 0 2 4 0 MAJ 0.2682 0.0000 0.20 B197 4 3 1 0 4 1 0 MAJ 0.3582 0.0027 0.12 B198 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 B199 4 2 2 0 2 3 0 COR 0.3508 0.0024 0.12 B202 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B208 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B210 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 B211 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 B214 2 2 0 0 4 0 0 MAJ 0.4285 0.0001 0.19 B215 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 B216 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 B218 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.2357 0.0002 0.17 B226 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6243 0.0044 0.11 B228 2 1 0 1 9 1 1 MAJ 0.0780 0.0000 0.47 B231 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 B232 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 B233 1 0 0 1 0 0 4 SAR 0.5625 0.0000 0.25 B235 3 1 1 1 1 1 1 0.4849 0.0039 0.11 B237 4 2 2 0 3 2 0 MAJ 0.3082 0.0012 0.14 B239 2 1 0 1 2 0 1 MAJ 0.4920 0.0003 0.16 B241 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B247 3 0 2 1 0 2 5 SAR 0.1355 0.0000 0.28 B248 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.4902 0.0042 0.11 B251 3 1 1 1 1 1 1 0.5291 0.0076 0.10 B252 1 1 0 0 3 0 0 MAJ 0.5289 0.0000 0.27 B254 3 2 1 0 2 1 0 MAJ 0.5291 0.0076 0.10 B256 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3462 0.0003 0.16 B258 2 1 1 0 1 2 0 COR 0.4735 0.0002 0.17 B259 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 B261 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.5625 0.0000 0.25 B262 4 1 1 2 1 2 3 SAR 0.2885 0.0008 0.14 B266 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B267 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B268 3 0 2 1 0 3 5 COR 0.1018 0.0000 0.32 B269 3 0 2 1 0 2 2 COR 0.2967 0.0001 0.18 B270 2 1 0 1 1 0 1 0.6695 0.0099 0.10 B271 2 1 0 1 1 0 1 0.6204 0.0041 0.11 B272 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.4633 0.0001 0.18 B274 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B277 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B282 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8264 0.0125 0.09 B283 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3674 0.0005 0.15 B284 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 B285 3 0 2 1 0 4 1 COR 0.3069 0.0001 0.18 B289 2 1 1 0 1 1 0 0.6050 0.0031 0.12 B292 2 1 1 0 1 1 0 0.4735 0.0002 0.17 B293 2 1 1 0 4 1 0 MAJ 0.3482 0.0000 0.23 B294 2 0 1 1 0 1 1 0.6400 0.0059 0.11 B295 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 B297 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6400 0.0059 0.11 B299 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B300 4 1 1 2 1 1 3 SAR 0.3062 0.0011 0.14 B301 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B303 3 0 1 2 0 1 8 SAR 0.0784 0.0000 0.35 B307 4 0 1 3 0 1 4 SAR 0.2089 0.0001 0.18 B310 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B311 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.4181 0.0066 0.10 B312 3 0 2 1 0 6 1 COR 0.1973 0.0000 0.24 B313 4 0 3 1 0 6 2 COR 0.1925 0.0001 0.19 B314 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7901 0.0044 0.11 B319 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B320 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 B328 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.4633 0.0001 0.18 B329 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.5625 0.0000 0.25 B330 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B331 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 B333 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B335 2 1 1 0 1 2 0 COR 0.5220 0.0006 0.15 B336 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 B337 4 1 0 3 4 0 8 SAR 0.0436 0.0000 0.32 B339 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B342 3 1 0 2 3 0 3 SAR 0.2058 0.0000 0.23 B343 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 B344 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B346 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.4509 0.0001 0.18 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B347 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8264 0.0125 0.09 B348 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.5625 0.0000 0.25 B349 2 1 1 0 1 1 0 0.6204 0.0041 0.11 B353 4 0 3 1 0 6 1 COR 0.2019 0.0001 0.18 B357 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 B358 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B359 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 B360 2 1 1 0 1 1 0 0.6332 0.0052 0.11 B361 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B362 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B363 3 1 1 1 1 2 1 COR 0.3555 0.0004 0.16 B364 3 2 0 1 2 0 2 MAJ 0.4238 0.0014 0.13 B366 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 B367 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 B368 2 1 0 1 1 0 1 0.5333 0.0007 0.15 B369 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 B370 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.3531 0.0000 0.23 B371 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 B372 3 1 1 1 1 1 1 0.5314 0.0079 0.10 B374 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 B375 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B377 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 C010 4 0 2 2 0 3 2 COR 0.3163 0.0013 0.13 C082 4 1 1 2 1 1 5 SAR 0.1823 0.0001 0.19 C118 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6745 0.0108 0.09 C124 3 1 2 0 2 2 0 COR 0.2967 0.0001 0.18 C170 4 0 1 3 0 1 4 SAR 0.3245 0.0015 0.13 C219 4 1 2 1 1 4 1 COR 0.2357 0.0002 0.17 C227 4 0 2 2 0 2 2 0.3637 0.0030 0.12 C237 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 C245 2 0 1 1 0 1 1 0.7125 0.0203 0.08 C260 3 1 1 1 1 1 1 0.5057 0.0054 0.11 C261 4 0 1 3 0 1 3 SAR 0.3350 0.0019 0.13 C266 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.3380 0.0000 0.24 C270 4 1 1 2 1 2 2 SAR 0.3339 0.0018 0.13 C272 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C304 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.7125 0.0203 0.08 C306 4 1 2 1 2 5 1 COR 0.1632 0.0000 0.20 C308 4 2 2 0 3 4 0 COR 0.1438 0.0000 0.22 C309 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 C332 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 C334 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.2252 0.0000 0.31 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency C335 3 1 2 0 3 2 0 COR 0.2310 0.0000 0.22 C338 4 2 1 1 4 1 1 MAJ 0.2569 0.0004 0.16 C342 4 0 3 1 0 3 1 COR 0.2815 0.0007 0.15 C343 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 C350 3 2 1 0 4 2 0 MAJ 0.2310 0.0000 0.22 C355 2 0 2 0 0 3 0 COR 0.5220 0.0006 0.15 C356 4 1 1 2 1 1 4 SAR 0.2234 0.0002 0.17 C361 3 0 2 1 0 2 2 COR 0.3555 0.0004 0.16 C369 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 C370 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 C376 4 1 3 0 1 5 0 COR 0.2569 0.0004 0.16 C380 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5773 0.0148 0.09 C381 4 1 0 3 1 0 5 SAR 0.2899 0.0008 0.14 C384 4 2 1 1 2 1 1 MAJ 0.3849 0.0041 0.11 C386 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6243 0.0044 0.11 C390 4 1 0 3 2 0 3 SAR 0.2725 0.0006 0.15 C391 2 2 0 0 6 0 0 MAJ 0.2401 0.0000 0.30 C394 4 1 1 2 3 1 5 SAR 0.0972 0.0000 0.25 C395 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.4358 0.0001 0.19 C396 3 0 0 3 0 0 3 SAR 0.5464 0.0097 0.10 C397 2 0 1 1 0 2 2 0.3873 0.0000 0.21 C398 2 0 1 1 0 1 1 0.7125 0.0203 0.08 C401 4 0 1 3 0 1 3 SAR 0.3742 0.0035 0.12 C407 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 C411 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 C415 2 0 1 1 0 1 1 0.6204 0.0041 0.11 C416 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 C417 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C418 2 1 0 1 1 0 1 0.7125 0.0203 0.08 C419 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C423 2 1 1 0 1 3 0 COR 0.1128 0.0000 0.42 C426 3 1 0 2 1 0 3 SAR 0.2967 0.0001 0.18 C427 4 2 1 1 3 1 2 MAJ 0.2725 0.0006 0.15 C431 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.4952 0.0003 0.16 C433 3 0 3 0 0 3 1 COR 0.3674 0.0005 0.15 C434 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.3896 0.0007 0.15 C435 4 2 2 0 3 2 1 MAJ 0.3163 0.0013 0.13 C436 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.4305 0.0079 0.10 C438 1 0 1 0 0 1 0 0.8100 0.0079 0.10 C439 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6561 0.0079 0.10 C440 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 C441 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency C442 3 1 1 1 1 1 1 0.5026 0.0051 0.11 C443 2 0 1 1 0 1 1 0.5220 0.0006 0.15 C444 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6204 0.0041 0.11 C445 4 0 3 1 0 4 1 COR 0.3265 0.0016 0.13 C447 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3999 0.0009 0.14 C448 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 C449 3 0 1 2 0 1 3 SAR 0.3999 0.0009 0.14 C451 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.5625 0.0000 0.25 C452 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6561 0.0079 0.10 C453 2 2 0 0 3 0 0 MAJ 0.5220 0.0006 0.15 C455 4 0 3 1 0 5 1 COR 0.2654 0.0005 0.15 C458 3 1 1 1 1 1 1 0.5314 0.0079 0.10 C459 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.4494 0.0001 0.18 C461 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.3971 0.0049 0.11 C462 3 1 2 0 2 2 1 COR 0.2887 0.0001 0.19 C464 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8264 0.0125 0.09 C467 4 1 1 2 1 2 3 SAR 0.2453 0.0003 0.16 C471 2 1 1 0 2 1 0 MAJ 0.5220 0.0006 0.15 C473 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.5464 0.0097 0.10 C474 2 1 1 0 1 1 0 0.6204 0.0041 0.11 C478 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 C479 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.7656 0.0021 0.13 C480 4 2 0 2 3 0 2 MAJ 0.2806 0.0007 0.15 C481 3 0 1 2 0 1 3 SAR 0.4130 0.0011 0.14 C484 1 1 0 0 2 0 0 MAJ 0.6400 0.0000 0.20 C485 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C486 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.4097 0.0059 0.11 C491 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 C492 4 1 3 0 1 3 0 COR 0.3849 0.0041 0.11 C494 3 1 1 1 2 1 1 MAJ 0.3896 0.0007 0.15 C495 4 0 2 2 0 3 2 COR 0.1899 0.0001 0.19 C496 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.5625 0.0000 0.25 C497 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 C498 3 1 1 1 1 1 1 0.5185 0.0065 0.10 C500 4 2 1 1 4 1 1 MAJ 0.2502 0.0003 0.16 G010 2 0 0 2 0 0 5 SAR 0.2805 0.0000 0.27 G011 4 0 2 2 0 2 3 SAR 0.2089 0.0001 0.18 G015 3 1 1 1 1 3 1 COR 0.3261 0.0002 0.17 G020 3 1 2 0 1 3 0 COR 0.4130 0.0011 0.14 G050 4 1 0 3 1 0 3 SAR 0.3971 0.0049 0.11 G052 3 1 1 1 1 1 1 0.4902 0.0042 0.11 G058 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.5185 0.0065 0.10 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency G072 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.4238 0.0014 0.13 G100 3 2 0 1 5 0 1 MAJ 0.2608 0.0000 0.20 G115 4 1 0 3 2 0 3 SAR 0.3183 0.0014 0.13 G116 4 2 1 1 2 1 1 MAJ 0.4771 0.0142 0.09 G119 3 1 1 1 1 1 1 0.4488 0.0021 0.13 G135 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.5773 0.0148 0.09 G150 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6745 0.0108 0.09 G224 3 1 1 1 1 1 1 0.5773 0.0148 0.09 G229 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.4902 0.0042 0.11 G232 2 0 1 1 0 1 2 SAR 0.5220 0.0006 0.15 G250 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.3971 0.0049 0.11 G254 4 1 2 1 1 3 2 COR 0.2089 0.0001 0.18 G255 4 1 2 1 1 4 1 COR 0.2502 0.0003 0.16 G258 4 2 1 1 3 1 1 MAJ 0.3535 0.0025 0.12 G268 4 1 2 1 1 3 1 COR 0.2019 0.0001 0.18 G269 2 0 1 1 0 1 1 0.5220 0.0006 0.15 G272 4 0 3 1 0 4 1 COR 0.3062 0.0011 0.14 G279 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 G291 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 G299 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 G302 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.5220 0.0006 0.15 G322 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 G325 3 1 1 1 1 1 1 0.4902 0.0042 0.11 G326 3 0 1 2 0 2 3 SAR 0.3153 0.0001 0.18 G327 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3555 0.0004 0.16 G328 4 4 0 0 15 1 0 MAJ 0.0301 0.0000 0.35 G341 2 0 0 2 0 0 7 SAR 0.1785 0.0000 0.35 G344 4 2 1 1 2 1 1 MAJ 0.4200 0.0068 0.10 G345 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 G346 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.3971 0.0049 0.11 G347 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.3999 0.0009 0.14 G350 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6561 0.0079 0.10 G358 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.4238 0.0014 0.13 G359 3 0 2 1 0 3 3 COR 0.1555 0.0000 0.27 G360 3 2 1 0 3 1 0 MAJ 0.3999 0.0009 0.14 G364 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 G367 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 G370 2 0 1 1 0 1 1 0.6400 0.0059 0.11 G373 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 G386 4 0 2 2 0 3 2 COR 0.2908 0.0008 0.14 G390 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 G392 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency G393 2 1 0 1 1 0 3 SAR 0.5375 0.0008 0.14 G395 3 0 0 3 0 0 4 SAR 0.3922 0.0008 0.14 G399 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 G404 2 1 1 0 1 2 0 COR 0.5220 0.0006 0.15 G405 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.5057 0.0054 0.11 G406 2 0 1 1 0 1 1 0.6400 0.0059 0.11 G407 4 1 3 0 1 6 0 COR 0.1785 0.0000 0.19 G408 2 1 1 0 2 1 0 MAJ 0.4633 0.0001 0.18 G409 4 0 4 0 0 5 0 COR 0.3062 0.0011 0.14 G410 3 0 3 0 0 7 0 COR 0.2031 0.0000 0.23 G414 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 G415 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.4096 0.0000 0.20 G416 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.3971 0.0049 0.11 G420 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 G421 2 1 1 0 1 4 0 COR 0.2958 0.0000 0.26 G422 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 G423 4 0 3 1 0 7 1 COR 0.1479 0.0000 0.21 G429 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 G430 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 G433 2 0 2 0 0 5 0 COR 0.3164 0.0000 0.25 G435 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.4238 0.0014 0.13 G437 2 0 2 0 0 4 0 COR 0.3380 0.0000 0.24 G440 4 3 0 1 3 0 1 MAJ 0.4285 0.0077 0.10 G443 3 2 1 0 2 1 0 MAJ 0.5185 0.0065 0.10 G445 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.5220 0.0006 0.15 G448 3 1 1 1 1 1 1 0.5168 0.0063 0.10 G449 3 2 1 0 4 1 0 MAJ 0.3349 0.0002 0.17 G451 3 2 0 1 3 0 1 MAJ 0.3462 0.0003 0.16 G454 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 G455 2 1 0 1 2 0 1 MAJ 0.4920 0.0003 0.16 G457 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.5220 0.0006 0.15 G459 3 1 2 0 1 3 0 COR 0.3771 0.0006 0.15 G460 4 2 2 0 2 2 0 0.4305 0.0079 0.10 G461 2 0 1 1 0 1 1 0.7125 0.0203 0.08 G462 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 G463 3 0 0 3 0 0 12 SAR 0.0528 0.0000 0.39 G469 3 0 3 0 0 5 0 COR 0.3153 0.0001 0.18 G470 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 G472 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 G474 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 G475 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 G476 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency G478 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.3896 0.0007 0.15 G479 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 G480 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 G482 3 1 2 0 1 2 0 COR 0.3771 0.0006 0.15 G484 2 1 1 0 1 1 0 0.6332 0.0052 0.11 G486 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.5085 0.0004 0.16 G487 4 1 2 1 2 3 2 COR 0.1798 0.0001 0.19 T002 4 1 0 3 1 0 4 SAR 0.3873 0.0043 0.11 T023 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 T031 3 1 1 1 1 2 2 0.3153 0.0001 0.18 T034 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 T042 3 0 0 3 0 0 3 SAR 0.3896 0.0007 0.15 T046 4 1 0 3 1 0 18 SAR 0.0049 0.0000 0.49 T072 3 1 1 1 1 1 1 0.3674 0.0005 0.15 T080 4 3 0 1 5 0 1 MAJ 0.2502 0.0003 0.16 T093 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 T101 4 1 2 1 1 3 1 COR 0.3334 0.0018 0.13 T102 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6050 0.0031 0.12 T105 3 1 2 0 4 2 0 COR 0.2621 0.0000 0.20 T107 4 1 1 2 5 1 2 SAR 0.1532 0.0000 0.21 T117 1 1 0 0 2 0 0 MAJ 0.5625 0.0000 0.25 T153 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 T154 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.5314 0.0079 0.10 T156 3 1 1 1 1 1 1 0.3999 0.0009 0.14 T158 4 1 1 2 1 2 2 SAR 0.3535 0.0025 0.12 T165 4 0 1 3 0 3 4 SAR 0.1587 0.0000 0.21 T167 3 1 1 1 1 1 1 0.4632 0.0027 0.12 T184 3 0 1 2 0 1 4 SAR 0.2790 0.0001 0.19 T194 3 1 2 0 1 3 0 COR 0.3771 0.0006 0.15 T202 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.3637 0.0030 0.12 T203 4 0 1 3 0 1 4 SAR 0.2089 0.0001 0.18 T205 2 1 0 1 2 0 1 MAJ 0.5220 0.0006 0.15 T209 4 2 1 1 2 2 1 MAJ 0.2654 0.0005 0.15 T210 2 0 1 1 0 1 1 0.4358 0.0001 0.19 T211 4 0 0 4 0 0 6 SAR 0.2234 0.0002 0.17 T215 4 2 0 2 2 0 3 SAR 0.2908 0.0008 0.14 T217 4 1 2 1 1 3 1 COR 0.1220 0.0000 0.23 T219 4 0 1 3 0 1 5 SAR 0.3447 0.0022 0.12 T229 3 1 1 1 1 1 2 SAR 0.4238 0.0014 0.13 T230 2 1 0 1 1 0 1 0.5862 0.0021 0.13 T234 3 0 2 1 0 4 2 COR 0.1987 0.0000 0.24 T242 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency T248 4 2 1 1 3 1 1 MAJ 0.3508 0.0024 0.12 T259 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.2790 0.0001 0.19 T260 4 0 2 2 0 2 2 0.3245 0.0015 0.13 T262 4 2 1 1 3 1 1 MAJ 0.2654 0.0005 0.15 T263 4 2 0 2 2 0 2 MAJ 0.3350 0.0019 0.13 T264 2 1 0 1 1 0 1 0.4920 0.0003 0.16 T270 4 1 1 2 1 2 2 SAR 0.2569 0.0004 0.16 T271 2 2 0 0 3 0 0 MAJ 0.5085 0.0004 0.16 T273 4 3 0 1 4 0 1 MAJ 0.2784 0.0006 0.15 T276 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 T280 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.3873 0.0000 0.21 T282 3 1 1 1 1 1 1 0.4238 0.0014 0.13 T283 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T284 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.3849 0.0041 0.11 T285 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 T286 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T289 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 T297 3 1 1 1 3 1 1 MAJ 0.2549 0.0000 0.20 T301 3 1 0 2 2 0 2 SAR 0.3349 0.0002 0.17 T302 2 1 1 0 4 2 0 MAJ 0.2401 0.0000 0.30 T303 3 0 1 2 0 3 3 SAR 0.2410 0.0000 0.21 T304 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 T305 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T306 3 1 1 1 1 1 1 MAJ 0.5314 0.0079 0.10 T308 3 0 1 2 0 1 5 SAR 0.1313 0.0000 0.29 T310 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.3873 0.0000 0.21 T313 4 2 2 0 2 2 0 0.4200 0.0068 0.10 T316 4 3 1 0 3 1 0 MAJ 0.4071 0.0057 0.11 T318 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5773 0.0148 0.09 T320 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.5026 0.0051 0.11 T322 4 2 2 0 2 2 0 0.4071 0.0057 0.11 T324 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T326 4 1 0 3 1 0 5 SAR 0.1689 0.0000 0.20 T327 3 0 3 0 0 5 0 COR 0.2121 0.0000 0.23 T328 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 T331 2 1 0 1 1 0 1 0.6400 0.0059 0.11 T332 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 T334 4 0 3 1 0 3 1 COR 0.4200 0.0068 0.10 T336 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 T340 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 T341 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 T343 3 1 1 1 1 1 1 0.3999 0.0009 0.14 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency T344 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.4130 0.0011 0.14 T345 2 1 0 1 1 0 2 SAR 0.4633 0.0001 0.18 T347 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5026 0.0051 0.11 T348 4 2 2 0 2 2 0 0.3849 0.0041 0.11 T349 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.3600 0.0000 0.40 T350 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.5220 0.0006 0.15 T351 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T352 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.4200 0.0068 0.10 T353 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T355 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.4633 0.0001 0.18 T357 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6049 0.0000 0.22 T358 2 0 1 1 0 1 1 0.6400 0.0059 0.11 T359 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.4238 0.0014 0.13 T360 1 0 0 1 0 0 4 SAR 0.2500 0.0000 0.50 T362 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T363 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.5220 0.0006 0.15 T364 2 1 0 1 1 0 1 0.5220 0.0006 0.15 T365 2 1 0 1 1 0 1 0.6204 0.0041 0.11 T367 4 0 4 0 0 4 0 COR 0.3971 0.0049 0.11 T369 2 0 1 1 0 1 1 0.7125 0.0203 0.08 T370 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 T371 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T374 2 1 1 0 1 1 0 0.6204 0.0041 0.11 T375 3 1 1 1 3 1 1 MAJ 0.2310 0.0000 0.22 T376 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 T379 2 0 2 0 0 3 0 COR 0.3405 0.0000 0.24 T380 4 0 3 1 0 4 1 COR 0.2089 0.0001 0.18 T383 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 T384 2 0 1 1 0 1 1 0.6561 0.0079 0.10 T393 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T396 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6561 0.0079 0.10 T397 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.5314 0.0079 0.10 T399 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 T400 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 T401 2 1 0 1 1 0 1 0.4920 0.0003 0.16 T402 2 1 0 1 1 0 2 SAR 0.3241 0.0000 0.25 T403 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.2984 0.0010 0.14 T404 2 1 1 0 2 1 0 MAJ 0.5220 0.0006 0.15 T406 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 T409 3 0 0 3 0 0 5 SAR 0.3174 0.0002 0.17 T410 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 T412 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency T415 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6745 0.0108 0.09 T416 1 0 0 1 0 0 3 SAR 0.6602 0.0001 0.19 T419 3 1 2 0 1 3 0 COR 0.4130 0.0011 0.14 T420 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 T421 3 1 1 1 1 1 1 0.4632 0.0027 0.12 T422 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0059 0.11 T423 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T424 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T425 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.4952 0.0003 0.16 T426 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T427 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 T428 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T431 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 T432 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 T433 1 1 0 0 6 0 0 MAJ 0.1600 0.0000 0.60 T437 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.2500 0.0000 0.50 T438 3 0 0 3 0 0 4 SAR 0.3999 0.0009 0.14 T439 3 1 0 2 1 0 4 SAR 0.3261 0.0002 0.17 T440 4 3 0 1 4 0 1 MAJ 0.3420 0.0021 0.13 T441 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T445 2 0 1 1 0 1 1 0.6561 0.0079 0.10 T448 2 1 0 1 1 0 1 0.5220 0.0006 0.15 T449 2 1 0 1 2 0 1 MAJ 0.4096 0.0000 0.20 T452 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T453 3 0 1 2 0 1 2 SAR 0.4618 0.0027 0.12 T454 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 T455 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 T456 2 1 1 0 1 1 0 0.6400 0.0059 0.11