Supplementary file 1 to: Conservation of genetic diversity in Mediterranean endemic species: Arenaria balearica (Caryophyllaceae) Javier Bobo-Pinilla, Noemí López-González & Julio Peñas de Giles Plant Ecology and Evolution 153(3), 2020 Supplementary file 1 – Probabilities of loss of 474 rare AFLP alleles when all populations of Arenaria balearica are considered as one single management unit and preferred sampling area. Npop, number of populations where each AFLP allele was found; Nind, number of individuals where the alleles were found; geographical regions: MAJ = Majorca, COR = Corsica, SAR = Sardinia; Lo, observed probability of loss of the allele; Le, expected probability of loss of the allele; PSA, preferred sampling area. Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B004 3 1 1 1 1 1 1 0.4632 0.0027 0.12 B012 4 0 3 1 0 9 1 COR 0.0849 0.0000 0.27 B017 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.5410 0.0009 0.14 B024 2 1 0 1 1 0 2 SAR 0.4358 0.0001 0.19 B030 3 2 0 1 3 0 1 MAJ 0.3674 0.0005 0.15 B031 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 B033 3 1 1 1 2 2 1 0.2967 0.0001 0.18 B044 4 0 1 3 0 1 11 SAR 0.0558 0.0000 0.30 B047 4 2 1 1 2 1 1 MAJ 0.4200 0.0068 0.10 B053 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5057 0.0054 0.11 B070 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6204 0.0041 0.11 B071 4 2 0 2 4 0 2 SAR 0.2357 0.0002 0.17 B076 4 0 2 2 0 2 2 0.3849 0.0041 0.11 B080 4 2 1 1 3 1 1 MAJ 0.3128 0.0013 0.14 B083 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B084 3 1 0 2 1 0 11 SAR 0.0429 0.0000 0.41 B094 3 0 1 2 0 1 5 SAR 0.2621 0.0000 0.20 B097 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 B099 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B100 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.7656 0.0021 0.13 B101 2 1 0 1 1 0 6 SAR 0.3164 0.0000 0.25 B105 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.5003 0.0049 0.11 B115 4 2 0 2 2 0 2 0.4453 0.0095 0.10 B161 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 B162 2 0 1 1 0 6 1 COR 0.1296 0.0000 0.40 B163 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6049 0.0000 0.22 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B167 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.3071 0.0000 0.26 B170 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 B178 3 0 2 1 0 4 3 COR 0.1234 0.0000 0.29 B182 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B188 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 B189 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6050 0.0031 0.12 B191 3 0 3 0 0 6 0 COR 0.1780 0.0000 0.25 B193 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B195 4 0 2 2 0 4 5 SAR 0.0507 0.0000 0.31 B196 3 2 1 0 2 4 0 MAJ 0.2682 0.0000 0.20 B197 4 3 1 0 4 1 0 MAJ 0.3582 0.0027 0.12 B198 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 B199 4 2 2 0 2 3 0 COR 0.3508 0.0024 0.12 B202 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B208 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B210 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 B211 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 B214 2 2 0 0 4 0 0 MAJ 0.4285 0.0001 0.19 B215 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 B216 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 B218 4 1 2 1 1 2 1 COR 0.2357 0.0002 0.17 B226 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6243 0.0044 0.11 B228 2 1 0 1 9 1 1 MAJ 0.0780 0.0000 0.47 B231 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5185 0.0065 0.10 B232 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 B233 1 0 0 1 0 0 4 SAR 0.5625 0.0000 0.25 B235 3 1 1 1 1 1 1 0.4849 0.0039 0.11 B237 4 2 2 0 3 2 0 MAJ 0.3082 0.0012 0.14 B239 2 1 0 1 2 0 1 MAJ 0.4920 0.0003 0.16 B241 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B247 3 0 2 1 0 2 5 SAR 0.1355 0.0000 0.28 B248 3 2 0 1 2 0 1 MAJ 0.4902 0.0042 0.11 B251 3 1 1 1 1 1 1 0.5291 0.0076 0.10 B252 1 1 0 0 3 0 0 MAJ 0.5289 0.0000 0.27 B254 3 2 1 0 2 1 0 MAJ 0.5291 0.0076 0.10 B256 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3462 0.0003 0.16 B258 2 1 1 0 1 2 0 COR 0.4735 0.0002 0.17 B259 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 B261 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.5625 0.0000 0.25 B262 4 1 1 2 1 2 3 SAR 0.2885 0.0008 0.14 B266 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B267 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B268 3 0 2 1 0 3 5 COR 0.1018 0.0000 0.32 B269 3 0 2 1 0 2 2 COR 0.2967 0.0001 0.18 B270 2 1 0 1 1 0 1 0.6695 0.0099 0.10 B271 2 1 0 1 1 0 1 0.6204 0.0041 0.11 B272 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.4633 0.0001 0.18 B274 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B277 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B282 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8264 0.0125 0.09 B283 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3674 0.0005 0.15 B284 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 B285 3 0 2 1 0 4 1 COR 0.3069 0.0001 0.18 B289 2 1 1 0 1 1 0 0.6050 0.0031 0.12 B292 2 1 1 0 1 1 0 0.4735 0.0002 0.17 B293 2 1 1 0 4 1 0 MAJ 0.3482 0.0000 0.23 B294 2 0 1 1 0 1 1 0.6400 0.0059 0.11 B295 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 B297 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6400 0.0059 0.11 B299 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B300 4 1 1 2 1 1 3 SAR 0.3062 0.0011 0.14 B301 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B303 3 0 1 2 0 1 8 SAR 0.0784 0.0000 0.35 B307 4 0 1 3 0 1 4 SAR 0.2089 0.0001 0.18 B310 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B311 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.4181 0.0066 0.10 B312 3 0 2 1 0 6 1 COR 0.1973 0.0000 0.24 B313 4 0 3 1 0 6 2 COR 0.1925 0.0001 0.19 B314 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7901 0.0044 0.11 B319 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B320 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 B328 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.4633 0.0001 0.18 B329 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.5625 0.0000 0.25 B330 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7901 0.0044 0.11 B331 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 B333 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B335 2 1 1 0 1 2 0 COR 0.5220 0.0006 0.15 B336 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 B337 4 1 0 3 4 0 8 SAR 0.0436 0.0000 0.32 B339 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B342 3 1 0 2 3 0 3 SAR 0.2058 0.0000 0.23 B343 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 B344 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 B346 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.4509 0.0001 0.18 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency B347 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8264 0.0125 0.09 B348 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.5625 0.0000 0.25 B349 2 1 1 0 1 1 0 0.6204 0.0041 0.11 B353 4 0 3 1 0 6 1 COR 0.2019 0.0001 0.18 B357 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 B358 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B359 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 B360 2 1 1 0 1 1 0 0.6332 0.0052 0.11 B361 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B362 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B363 3 1 1 1 1 2 1 COR 0.3555 0.0004 0.16 B364 3 2 0 1 2 0 2 MAJ 0.4238 0.0014 0.13 B366 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 B367 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.7656 0.0021 0.13 B368 2 1 0 1 1 0 1 0.5333 0.0007 0.15 B369 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.6400 0.0000 0.20 B370 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.3531 0.0000 0.23 B371 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 B372 3 1 1 1 1 1 1 0.5314 0.0079 0.10 B374 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 B375 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 B377 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 C010 4 0 2 2 0 3 2 COR 0.3163 0.0013 0.13 C082 4 1 1 2 1 1 5 SAR 0.1823 0.0001 0.19 C118 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6745 0.0108 0.09 C124 3 1 2 0 2 2 0 COR 0.2967 0.0001 0.18 C170 4 0 1 3 0 1 4 SAR 0.3245 0.0015 0.13 C219 4 1 2 1 1 4 1 COR 0.2357 0.0002 0.17 C227 4 0 2 2 0 2 2 0.3637 0.0030 0.12 C237 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6561 0.0079 0.10 C245 2 0 1 1 0 1 1 0.7125 0.0203 0.08 C260 3 1 1 1 1 1 1 0.5057 0.0054 0.11 C261 4 0 1 3 0 1 3 SAR 0.3350 0.0019 0.13 C266 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.3380 0.0000 0.24 C270 4 1 1 2 1 2 2 SAR 0.3339 0.0018 0.13 C272 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C304 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.7125 0.0203 0.08 C306 4 1 2 1 2 5 1 COR 0.1632 0.0000 0.20 C308 4 2 2 0 3 4 0 COR 0.1438 0.0000 0.22 C309 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8100 0.0079 0.10 C332 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 C334 2 0 0 2 0 0 4 SAR 0.2252 0.0000 0.31 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency C335 3 1 2 0 3 2 0 COR 0.2310 0.0000 0.22 C338 4 2 1 1 4 1 1 MAJ 0.2569 0.0004 0.16 C342 4 0 3 1 0 3 1 COR 0.2815 0.0007 0.15 C343 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.7656 0.0021 0.13 C350 3 2 1 0 4 2 0 MAJ 0.2310 0.0000 0.22 C355 2 0 2 0 0 3 0 COR 0.5220 0.0006 0.15 C356 4 1 1 2 1 1 4 SAR 0.2234 0.0002 0.17 C361 3 0 2 1 0 2 2 COR 0.3555 0.0004 0.16 C369 1 0 1 0 0 2 0 COR 0.6400 0.0000 0.20 C370 1 0 1 0 0 1 0 COR 0.8100 0.0079 0.10 C376 4 1 3 0 1 5 0 COR 0.2569 0.0004 0.16 C380 3 1 0 2 1 0 2 SAR 0.5773 0.0148 0.09 C381 4 1 0 3 1 0 5 SAR 0.2899 0.0008 0.14 C384 4 2 1 1 2 1 1 MAJ 0.3849 0.0041 0.11 C386 2 0 0 2 0 0 2 SAR 0.6243 0.0044 0.11 C390 4 1 0 3 2 0 3 SAR 0.2725 0.0006 0.15 C391 2 2 0 0 6 0 0 MAJ 0.2401 0.0000 0.30 C394 4 1 1 2 3 1 5 SAR 0.0972 0.0000 0.25 C395 2 0 0 2 0 0 3 SAR 0.4358 0.0001 0.19 C396 3 0 0 3 0 0 3 SAR 0.5464 0.0097 0.10 C397 2 0 1 1 0 2 2 0.3873 0.0000 0.21 C398 2 0 1 1 0 1 1 0.7125 0.0203 0.08 C401 4 0 1 3 0 1 3 SAR 0.3742 0.0035 0.12 C407 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 C411 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.8789 0.0514 0.06 C415 2 0 1 1 0 1 1 0.6204 0.0041 0.11 C416 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6204 0.0041 0.11 C417 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C418 2 1 0 1 1 0 1 0.7125 0.0203 0.08 C419 2 1 1 0 1 1 0 0.6561 0.0079 0.10 C423 2 1 1 0 1 3 0 COR 0.1128 0.0000 0.42 C426 3 1 0 2 1 0 3 SAR 0.2967 0.0001 0.18 C427 4 2 1 1 3 1 2 MAJ 0.2725 0.0006 0.15 C431 2 0 1 1 0 2 1 COR 0.4952 0.0003 0.16 C433 3 0 3 0 0 3 1 COR 0.3674 0.0005 0.15 C434 3 0 2 1 0 3 1 COR 0.3896 0.0007 0.15 C435 4 2 2 0 3 2 1 MAJ 0.3163 0.0013 0.13 C436 4 1 1 2 1 1 2 SAR 0.4305 0.0079 0.10 C438 1 0 1 0 0 1 0 0.8100 0.0079 0.10 C439 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6561 0.0079 0.10 C440 1 0 0 1 0 0 1 SAR 0.7656 0.0021 0.13 C441 1 1 0 0 1 0 0 MAJ 0.8100 0.0079 0.10 Npop Nind PSA Lo Le Average Rare allele All MAJ COR SAR MAJ COR SAR frequency C442 3 1 1 1 1 1 1 0.5026 0.0051 0.11 C443 2 0 1 1 0 1 1 0.5220 0.0006 0.15 C444 2 2 0 0 2 0 0 MAJ 0.6204 0.0041 0.11 C445 4 0 3 1 0 4 1 COR 0.3265 0.0016 0.13 C447 3 0 2 1 0 2 1 COR 0.3999 0.0009 0.14 C448 2 1 0 1 1 0 1 0.6561 0.0079 0.10 C449 3 0 1 2 0 1 3 SAR 0.3999 0.0009 0.14 C451 1 0 0 1 0 0 2 SAR 0.5625 0.0000 0.25 C452 2 0 2 0 0 2 0 COR 0.6561 0.0079 0.10 C453