DOCSLIB.ORG

מר פשוט ו של ש כמוטיפית באוכלוסיות דיפרנציאציה (Foeniculum Vulgare Mill

Total Page：16

File Type：pdf, Size：1020Kb

Download full-text PDF Read full-text
מר פשוט ו של ש כמוטיפית באוכלוסיות דיפרנציאציה (Foeniculum Vulgare Mill אוניברסיטת תל אביב הפקולטה למדעי החיים ע"ש ג'ורג' ס. וייז המדרשה לתארים מתקדמים דיפרנציאציה כמוטיפית באוכלוסיות של שומר פשוט (Foeniculum vulgare Mill. var. vulgare, Apiaceae) בישראל חיבור לשם קבלת התואר "דוקטור לפילוסופיה" מאת מיכל גרוס הוגש לסנאט של אוניברסיטת תל-אביב יוני 2006 עבודה זו נעשתה בהנחיית פרופ' יעקב פרידמן ד"ר אפרים לוינסון II לזכרם של הורי היקרים חיה ורפאל כהן ז"ל III תודות לפרופ' יקי פרידמן על ההשקעה וההנחיה המסורה והמקצועית. לד"ר אפרים לוינסון על היחס החם, ההנחיה והתמיכה המקצועית. לפרופ' אמוץ דפני על הנכונות והייעוץ בנושא הביולוגיה של ההאבקה. לפרופ' עידו יצחקי על הנכונות והייעוץ הסטטיסטי. לפרופ' דני יואל על הייעוץ והעזרה בעבודה המיקרוסקופית. לד"ר נתיב דודאי , דויא סעדי ודוד בחשיאן על הסיוע בעבודת השדה והתמיכה החברית. לעינת בר ואולגה לרקוב על עזרתן ב- GC-MS. ליעל כהן על התמיכה והערות המועילות בכתיבה. לפרופ' עוזי רביד ולכל יתר חברי המחלקה לתבלינים על התמיכה המקצועית והחברתית. לד"ר מוסה אוקזן עבור איסוף יחידות תפוצה של שומר פשוט ממרסין, טורקיה. לשמוליק אישי היקר ולבנותי האהובות. שחוו איתי את הרגעים השמחים והקשים, תמכו, עזרו ועודדו לאורך כל הדרך. לכולכם תודה רבה. IV תוכן העניינים עמוד תקציר ------------------------------------------------------------------------------------------ VIII-XI פרק א. מבוא ------------------------------------------------------------------------------------ 1-6 א.1 תיאור הצמח -------------------------------------------------------------------------- 1 א.2 שימושים של שומר פשוט ------------------------------------------------------------- 1 א.3 אברי הפרשת השמן האתרי בשומר פשוט ---------------------------------------------- 2 א.4 מרכיבי השמן האתרי בשומר פשוט ---------------------------------------------------- 2-4 א.5 טקסונומיה, תפוצת המין בעולם ובארץ ------------------------------------------------ 5 א.6 מטרות המחקר ------------------------------------------------------------------------ 6 פרק ב. חומרים ושיטות - כללי ----------------------------------------------------------------- 7-9 ב.1 אוכלוסיות המחקר -------------------------------------------------------------------- 7 ב.2 זיהוי תרכובות נדיפות ------------------------------------------------------------------ 8-9 מיצוי תרכובות המצויות באברי צמח שונים ----------------------------------------- 8 הפקת שמן אתרי על ידי זיקוק מים ------------------------------------------------- 8 איסוף תרכובות נדיפות הנפלטות לאוויר החופשי ---------------------------------- 8 אנליזת הנדיפים באמצעות GC-MS ---------------------------------------------- 9 ב.3 ניתוח סטטיסטי ---------------------------------------------------------------------- 9 פרק ג. הרכב ותכולת האולאורזין באברי צמח במהלך האונטוגנזה ------------------------------ 10-51 ג.1 חומרים ושיטות ---------------------------------------------------------------------- 12-16 ג.2 תוצאות ------------------------------------------------------------------------------ 17-41 ג.1.2. אפיון מרכיבי האולאורזין של אוכלוסיות המחקר ------------------------------- 17-18 ג.2.2. הרכב ותכולת האולאורזין במהלך האונטוגנזה השוואה - בין שני הכמוטיפים ---- 18-22 ג.1.2.2. הרכב ותכולה בצמח הצעיר (נבטים) -------------------------------- 18-22 ג.2.2.2. הרכב ותכולה בצמח הבוגר ---------------------------------------- 23-30 ג.3.2 מבנה ביבי השמן במהלך התפתחות הפרי ---------------------------------------- 31-34 ג.4.2. ההרכב הכימי ושיעור הפליטה של נדיפים מאברי צמח שלמים ------------------ 34-36 ג.5.2. הפוטנציאל הפיטוטוקסי והאוטוטוקסי של השמן האתרי המופק משני כמוטיפים--- 37-41 ג.3 דיון ומסקנות ------------------------------------------------------------------------ 41-51 ג.1.3. השוואת ההרכב הכימי בין אברי הצמח השונים במהלך האונטוגנזה -------------- 41-46 V ג.2.3. ההרכב הכימי ושיעור הפליטה של נדיפים מאברי צמח שלמים ------------------ 47-48 ג.3.3. הפוטנציאל הפיטוטוקסי והאוטוטוקסי של השמן האתרי המופק משני כמוטיפים - 49-51 פרק ד. ביוסינתזה של t-anethole ו-estragole ----------------------------------------------- 52-80 ד. 1 חומרים ושיטות --------------------------------------------------------------------- 54-58 ד.1.1. מתילטרנספראז ---------------------------------------------------------------- 54-57 א. הכנת מיצוי חלבוני אל-תאי ------------------------------------------------- 54 ב. בדיקת פעילות אנזימטית למתילטרנספראז ---------------------------------- 54-55 ג. זיהוי תוצרי פעילות OMT's ----------------------------------------------- 55 ד. קביעת ריכוז החלבון ------------------------------------------------------- 55 ה. ניקוי חלקי של האנזים – gel permeation ------------------------------- 56 ו. קביעת המשקל המולקולרי -------------------------------------------------- 56 ז. בדיקת תכונות הפעילות האנזימטית ----------------------------------------- 56-57 ד.2.1. איזומראז --------------------------------------------------------------------- 57-58 א. הכנת מיצויים חלבוניים אל-תאיים ------------------------------------------ 57 ב. בדיקת פעילות אנזימטית לאיזומראז ---------------------------------------- 57-58 ד.2 תוצאות ------------------------------------------------------------------------------ 58-74 ד.1.2. מתילטרנספראז --------------------------------------------------------------- 58-72 א. פעילות של O-methyltransferases המותנת ב-Chavicol או ב- Anol בפירות הכמוטיפים -------------------------------------------------------- 58-60 ב. השוואת פעילות של O-methyltransferases באוכלוסיות שונות של שומר ---- 60 ג. הקשר בין פעילות O-methyltransferases ותכולת estragole ו- t-anethole באברי צמח שונים במהלך התפתחותם ------------------------ 60-65 ד. פעילות של O-methyltransferases כלפי נגזרות פנוליות שונות -------- 66-67 ה. מאפייני הפעילות האנזימטית של O-methyltransferases בשני הכמוטיפים- 68-72 ד.2.2. איזומראז --------------------------------------------------------------------- 73-74 ד.3 דיון ומסקנות ------------------------------------------------------------------------ 75-80 ד.1.3 מתילטרנספראז ---------------------------------------------------------------- 75-79 א. מתילציה של Anol ו-Chavicol במיצוי אל-תאי של שומר פשוט ----------- 75 ב. תכונות ה-O-methyltransferases שהופקו מפירות שני הכמוטיפים ------- 75-77 ג. הקשר בין פעילות O-methyltransferases והשינויים בתכולת estragole ו- t- anethole במהלך ההתפתחות של אברי צמח שונים בשומר פשוט --------- 77-79 ד. פעילות של O-methyltransferases באוכלוסיות שונות של שומר ------ 79 VI ד.2.3. פעילות של anethole / methyl chavicol isomerase --------------------- 79-80 פרק ה. דרך ההורשה של התכונה לצבירת estragole ו/או t-anethole ---------------------- 81-91 ה.1 חומרים ושיטות ------------------------------------------------------------------- 82-84 ה.2 תוצאות --------------------------------------------------------------------------- 84-89 ה.3 דיון ומסקנות ---------------------------------------------------------------------- 89-91 פרק ו. מהלך הפריחה ושיעור החנטה -------------------------------------------------------- 92-116 ו.1 חומרים ושיטות -------------------------------------------------------------------- 93-96 ו.2 תוצאות ---------------------------------------------------------------------------- 96-104 ו.1.2. התפתחות הפרח ------------------------------------------------------------- 96-98 ו.2.2. מועד ומשך הזמן של רצפטיביות הצלקת ------------------------------------- 99 ו.3.2. הכנית כאתר לנביטת אבקה -------------------------------------------------- 99-100 ו.4.2. מועדי הפריחה האוכלוסיות השונות ------------------------------------------ 101-102 ו.5.2. שיעור החנטה כתוצאה מהאבקה בין ובתוך נציגי אוכלוסיות טבעיות ---------- 102-104 ו.3 דיון ומסקנות ---------------------------------------------------------------------- 105-109 ו.1.3. ביולוגיה של הפריחה בנציגי אוכלוסיות טבעיות שגודלו בתנאים דומים ------- 105-107 ו.2.3. שיעור החנטה כתוצאה מהכלאות מכוונות בין ובתוך נציגי אוכלוסיות טבעיות - 107-109 פרק ז. דיון כללי ----------------------------------------------------------------------------- 110-116 ז.1 תכולה והרכב האולאורזין בשני הכמוטיפים של שומר פשוט ומשמעותם האקולוגית--- 110-113 ז.2 הבסיס הגנטי והביוכימי לשונות בהרכב הכימי של הכמוטיפים. ---------------------- 113-115 ז.3 המנגנון לשימור ההבדלים ביו הכמוטיפים------------------------------------------- 115-116 רשימת ספרות -------------------------------------------------------------------- 117-131 נספחים --------------------------------------------------------------------------------------- 132-136 תקציר באנגלית -------------------------------------------------------------------- D -A VII תקציר שומר פשוט (Foeniculum vulgare Mill. var. vulgare), סוככיים (Apiaceae), הינו המיקריפטופיט, נפוץ באגן הים התיכון עם חדירה אירנוטורנית, המקובל מקדמת דנא כצמח רפואה ותבלין. המרכיבים העיקריים בשמן האתרי של פירות השומר המשפיעים על טעמו המיוחד הם: הפנילפרופנואידים – t-anethole ו-methylchavicol) estragole) והמונוטרפנואידים: fenchone ו- limonene. בישראל, נפוץ המין במגוון רחב של בתי גידול. באוכלוסיות הבר בארץ זוהו שני כמוטיפים הנבדלים בתכולה היחסית של t-anethole ו-estragole בפירות. בעבודה זו הוגדרו המטרות הבאות: 1. השוואת ההרכב ותכולת המרכיבים הנדיפים באברי צמח שונים במהלך האונטוגנזה בשני כמוטיפים שונים שגודלו בתנאים דומים, ובחינת הקשר בין תכולת השמן האתרי הנצברת, לבין הרכב הנדיפים המשתחררים לאוויר בסביבת הצמח ופוטנציאל השפעתו הפיטוטוקסית של השמן האתרי. 2. איתור השלב(ים) במסלול הביוסינתטי לייצור t-anethole ו-estragole הגורם להבדל בין הכמוטיפים השונים ובחינת פוטנציאל הייצור שלהם באברים השונים של הצמח במהלך האונטוגנזה. 3. תיאור מערכת הרבייה והשוואת פוטנציאל ההפריה כתוצאה מהכלאות בין ובתוך אוכלוסיות שומר. 4. קביעת הבסיס הגנטי האחראי לשונות בהרכב הכימי בין הכמוטיפים. לצורך המחקר נבחרו אוכלוסיות בר של שומר פשוט בעלות הרכב שונה של t-anethole ו- estragole בשמן האתרי שלהן. ארבע אוכלוסיות ממקומות שונים בישראל, ולהשוואה גם שתי אוכלוסיות הממוקמות מחוץ לישראל: אוכלוסיה דרומית מג'בל קתרינה (סיני, מצרים) ואוכלוסיה
Load more

Recommended publications
  • PLANTAS MEDICINAIS: Um Perfil Etnofarmacológico
    PLANTAS MEDICINAIS: um perfil etnofarmacológico Francisco Angelo Gurgel da Rocha PLANTAS MEDICINAIS Um Perfil Etnofarmacológico 1 Presidente da República Luiz Inácio Lula da Silva Ministro da Educação Fernando Haddad Secretaria de Educação Profissional Tecnológica Eliezer Moreira Pacheco Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio Grande do Norte (IFRN) Reitor Belchior de Oliveira Rocha Diretor do Campos de Currais Novos Rady Dias de Medeiros Pró-Reitor de Pesquisa e Inovação José Yvan Pereira Leite Coordenador da Editora do IFRN Samir Cristino de Souza Conselho Editorial Samir Cristino de Souza (Presidente) André Luiz Calado de Araújo Dante Henrique Moura Jerônimo Pereira dos Santos José Yvan Pereira Leite Valdenildo Pedro da Silva 2 Francisco Ângelo Gurgel da Rocha PLANTAS MEDICINAIS Um Perfil Etnofarmacológico 2009 3 Plantas Medicinais: Um Perfil Etnofarmacológico © Copyright 2009 da Editora do IFRN Todos os direitos reservados Nenhuma parte dessa publicação poderá ser reproduzida ou transmitida de qualquer modo ou por qualquer outro meio, eletrônico ou mecânico, incluindo fotocópia, gravação ou qualquer tipo de sistema de armazenamento e transmissão de informação, sem prévia autorização, por escrito, da Editora do IFRN. Divisão de Serviços Técnicos. Catalogação da publicação na fonte. Biblioteca Sebastião Fernandes (BSF) – IFRN Rocha, Francisco Ângelo Gurgel da Plantas Medicinais: um perfil etnofarmacológico / Francisco Ângelo Gurgel da Rocha. – Natal: Editora do IFRN, 2009. 249 p. ISBN 978-85-89571-69-2 1. Plantas Medicinais – taxonomia. 2. Plantas Medicinais – dados etnobotânicos. 3. Plantas Medicinais – farmacologia. I. Título. CDU 663 .88 IFRN/BSF EDITORAÇÃO Samir Cristino de Souza DIAGRAMAÇÃO Tuyanne Taynnar Queiroz de Medeiros CAPA José Nivaldo Fonsêca Júnior Tuyanne Taynnar Queiroz de Medeiros CONTATOS Editora do IFRN Av.
    [Show full text]
  • Antibacterial, Antifungal, Antimycotoxigenic, and Antioxidant Activities of Essential Oils: an Updated Review
    molecules Review Antibacterial, Antifungal, Antimycotoxigenic, and Antioxidant Activities of Essential Oils: An Updated Review Aysegul Mutlu-Ingok 1 , Dilara Devecioglu 2 , Dilara Nur Dikmetas 2 , Funda Karbancioglu-Guler 2,* and Esra Capanoglu 2,* 1 Department of Food Processing, Akcakoca Vocational School, Duzce University, 81650 Akcakoca, Duzce, Turkey; [email protected] 2 Department of Food Engineering, Faculty of Chemical and Metallurgical Engineering, Istanbul Technical University, 34469 Maslak, Istanbul, Turkey; [email protected] (D.D.); [email protected] (D.N.D.) * Correspondence: [email protected] (F.K.-G.); [email protected] (E.C.); Tel.: +90-212-285-7328 (F.K.-G.); +90-212-285-7340 (E.C.) Academic Editor: Enrique Barrajon Received: 18 September 2020; Accepted: 13 October 2020; Published: 14 October 2020 Abstract: The interest in using natural antimicrobials instead of chemical preservatives in food products has been increasing in recent years. In regard to this, essential oils—natural and liquid secondary plant metabolites—are gaining importance for their use in the protection of foods, since they are accepted as safe and healthy. Although research studies indicate that the antibacterial and antioxidant activities of essential oils (EOs) are more common compared to other biological activities, specific concerns have led scientists to investigate the areas that are still in need of research. To the best of our knowledge, there is no review paper in which antifungal and especially antimycotoxigenic effects are compiled. Further, the low stability of essential oils under environmental conditions such as temperature and light has forced scientists to develop and use recent approaches such as encapsulation, coating, use in edible films, etc.
    [Show full text]
  • In Vitro Antimicrobial Activity of Anise Seed (Pimpinella Anisum L.)
    ISSN 2320-5407 International Journal of Advanced Research (2015), Volume 3, Issue 1, 359-367 Journal homepage: http://www.journalijar.com INTERNATIONAL JOURNAL OF ADVANCED RESEARCH RESEARCH ARTICLE In vitro antimicrobial activity of Anise seed (Pimpinella anisum L.) Huda S. A. A. Mohamed1, Warda S. Abdelgadir2, Aisha Z. I. Almagboul3 1 Faculty of Pharmacy, University of Science and Technology, Omdurman, Sudan 2 Food Research Centre, P. O. Box 213, Ministry of Science & Communications, Khartoum, Sudan. 3 Medicinal and Aromatic Plant Research Institute (MAPRI), National Centre for Research, Khartoum, Sudan Manuscript Info Abstract Manuscript History: Medicinal plants synthesize a vast array of secondary metabolites that are Received: 22 November 2014 important for human life. For Medicinal purpose, antimicrobial activity of Final Accepted: 26 December 2014 substances derived from plant extracts has been recognized for many years. Published Online: January 2015 The antimicrobial activity of the petroleum ether, chloroform, ethyl acetate, methanol and aqueous extracts of the seeds of Pimpinella anisum L. Key words: (Apiaceae) was tested for their potential antimicrobial activities against two Gram positive (Bacillus subtilis, Staphylococcus aureus), three Gram Pimpinella anisum, pathogenic negative (E. coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa) bacteria bacteria, pathogenic Fungi, and against two standard fungi namely Aspergillus niger and Candida gentamicin, nicin albicans using the cup-plate-agar diffusion method. The Petroleum ether, *Corresponding Author chloroform, ethyl acetate and methanol extracts of P. anisum (1:10 and 2:10) were highly active (30-40 mm) against B. subtilis. The ethyl acetate extract Huda S. A. A. Mohamed exhibited moderate activity (15 mm) against E. coli and low activity (13 mm) against Ps.
    [Show full text]
  • Facile Synthesis of Natural Anise-Based Nanoemulsions and Their Antimicrobial Activity
    polymers Article Facile Synthesis of Natural Anise-Based Nanoemulsions and Their Antimicrobial Activity Ola A. Abu Ali 1, Mehrez E. El-Naggar 2,* , Mohamed S. Abdel-Aziz 3, Dalia I. Saleh 1, Mohamed. A. Abu-Saied 4 and Wael A. El-Sayed 5,6 1 Department of Chemistry, College of Science, Taif University, P.O. Box 11099, Taif 21944, Saudi Arabia; [email protected] (O.A.A.A.); [email protected] (D.I.S.) 2 Textile Research Division, National Research Center, Dokki, Giza 12622, Egypt 3 Genetic Engineering and Biotechnology Division, National Research Centre, Dokki, Giza 12622, Egypt; [email protected] 4 Polymeric Materials Research Department, Advanced Technology and New Materials Research Institute, City of Scientific Research and Technological Applications (SRTA-CITY), New Borg El-Arab City 21934, Alexandria, Egypt; [email protected] 5 Department of Chemistry, College of Science, Qassim University, Buraidah 52571, Saudi Arabia; [email protected] 6 Photochemistry Department, National Research Centre, Dokki, Cairo 12622, Egypt * Correspondence: [email protected]; Tel.: +20-11-2601-8116; Fax: +23-345-464 Abstract: Anise oil was prepared in its nanoemulsion form to facilitate the penetration of microbial walls, causing microbe mortality. The penetration occurred easily owing to the reduction in its size (nm). Nanoemulsions with different concentrations of anise oil were prepared using lecithin as an emulsifying agent with the aid of an ultra-sonification process. Their morphological and chemical properties were then characterized. The promising constituents were l-Menthone (11.22%), Citation: Abu Ali, O.A.; El-Naggar, Gurjunene (6.78%), Geranyl acetate (4.03%), Elemene (3.93%), Geranyl tiglate (3.53%), geraniol M.E.; Abdel-Aziz, M.S.; Saleh, D.I.; (3.48%), linalool (0.17%) as well as camphene (0.12%).
    [Show full text]
  • ANISEED FRUIT - ANISI FRUCTUS Aniseed – Pimpinella Anisum L., Fam
    ANISEED FRUIT - ANISI FRUCTUS Aniseed – Pimpinella anisum L., Fam. Apiaceae. Synonym(s): Anisum vulgare Gaertn., sweet cumin. Plant. An annual herb with an erect, cylindrical, smooth stem arising to the height of about 1 m. Leaves are alternate below, opposite above, the lower long-petioled, ovate to orbicular, dentate, the upper with short dilated petioles, pinnatifid or ternately pinnate with long, entire or cut, segments. The inflorescences are compound umbels. The flowers are small, white in color, each on a long hairy pedicel. The fruit is a mouse-shaped cremocarp. Area of distribution. Anise has been cultivated in Egypt, Asia Minor and southern Europe for many centuries. It has also been cultivated in many sections of this country, in India, Mexico and South America. The drug should be collected as soon as the summits of the fruits assume a grayish-green color. In harvesting, the plants are pulled up by hand or moved down and stacked in tall heaps for about 4 or 5 days until the fruits have ripened. The fruits are then separated by thrashing and carefully cleaned. Description. The cremocarp is ovoid or pyriform and slightly compressed laterally, yellowish- green or greenish-grey, 3 mm to 5 mm long and up to 3 mm wide. The mericarps are covered with short, warty trichomes visible using a lens; the fruit shows five primary ridges, running longitudinally, comprising three dorsal ridges and two lateral ridges, non-prominent, and lighter in colour, odor is characteristically aromatic, and taste – sweet. Constituents. Volatile oils 2–6%. Major components are trans-anethole (80–95%), with smaller amounts of estragole (methyl chavicol), anise ketone (p-methoxyphenylacetone) and b- caryophyllene.
    [Show full text]
  • 1.23 Lignans (Neolignans) and Allyl/Propenyl Phenols: Biogenesis, Structural Biology, and Biological/Human Health Considerations Daniel G
    1.23 Lignans (Neolignans) and Allyl/Propenyl Phenols: Biogenesis, Structural Biology, and Biological/Human Health Considerations Daniel G. Vassa˜ o, Kye-Won Kim, Laurence B. Davin, and Norman G. Lewis, Washington State University, Pullman, WA, USA ª 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved. 1.23.1 Introduction 817 1.23.2 Definition and Nomenclature 818 1.23.2.1 Allyl-/Propenylphenols 818 1.23.2.2 Inconsistencies in Current Nomenclature of Lignans and Neolignans 818 1.23.3 Chemotaxonomical Diversity: Evolutionary Considerations 821 1.23.3.1 Allyl-/Propenylphenols and Their Derivatives 821 1.23.3.1.1 Algae 821 1.23.3.1.2 Bryophytes: liverworts, hornworts, and mosses 825 1.23.3.1.3 Pteridophytes: lycophytes, horsetails, and ferns 826 1.23.3.1.4 Spermatophytes: gymnosperms and angiosperms 826 1.23.3.2 Lignans 830 1.23.3.2.1 Bryophytes: liverworts, hornworts, and mosses 830 1.23.3.2.2 Pteridophytes: lycophytes, horsetails, and ferns 833 1.23.3.2.3 Spermatophytes: gymnosperms and angiosperms 836 1.23.3.3 Evolution of Biochemical Pathways to Allyl-/Propenylphenols and Lignans: Observations on Co-occurrence 845 1.23.4 Lignan Early Biosynthetic Steps: 8–89 Phenylpropanoid Coupling 847 1.23.4.1 Discovery of the (þ)-Pinoresinol-Forming Dirigent Protein and Encoding Gene 847 1.23.4.2 Western Red Cedar Dirigent Proteins 849 1.23.4.3 Structural and Mechanistic Studies 849 1.23.4.4 Discovery of the (À)-Pinoresinol-Forming Dirigent Protein and Encoding Gene 849 1.23.4.5 Dirigent Protein Tissue Localization and Metabolic Networks 851 1.23.4.5.1 mRNA tissue
    [Show full text]
  • Essential Oils of Anatolian Apiaceae -‐ a Profile¶
    1 Nat. Vol. Essent. Oils, 2014; 1 (1): 1-50 REVIEW Essential Oils of Anatolian Apiaceae - A Profile¶ K. Hüsnü Can Baser1,2and Neş’e Kırımer1 1 Anadolu University, Faculty of Pharmacy, Department of Pharmacognosy, 26470 Eskişehir, Turkey. 2 King Saud University, College of Science, Department of Botany and Microbiology, Riyadh, Saudi Arabia __________________________________________________________________________________________ Abstract The family Apiaceae is represented in Turkey by 101 genera belonging to 485 species included in 511 taxa comprising 181 endemics, 7 genera being monotypic. The ratio of species endemism in the family is 37.3 %. We have screened the literature for Apiaceae taxa studied for their essential oils and compiled the data in order to get a clear aromatic profile of the family. It has become obvious that our group has been very active in this matter. We have so far investigated taxa belonging to 58 genera including the monotypic genera Ekimia bornmuelleri, Olymposciadium caespitosum and published on their essential oil yields and compositions. Apiaceae is an interesting family comprising many aromatic taxa including commercialiZed Herbas and spices such as anis, fennel, cumin, caraway, coriander, chervil, parsley, carrot, asa foetida, galbanum, etc. Some are rich in essential oils. The most interesting feature of the family is that many of its members have high chemical diversity containing different aromatic chemicals in different organs. Therefore, it is advisable to study all parts (e.g., fruit, flower, stem,
    [Show full text]
  • Patterns of Essential Oil Relationships in Pimpinella (Umbelliferae) Based on Phylogenetic Relationships Using Nuclear and Chloroplast Sequences
    q NIAB 2005 Plant Genetic Resources 3(2); 149–169 ISSN 1479-2621 DOI: 10.1079/PGR200573 Patterns of essential oil relationships in Pimpinella (Umbelliferae) based on phylogenetic relationships using nuclear and chloroplast sequences Nurhayat Tabanca1, Andrew W. Douglas2, Erdal Bedir1,3, Franck E. Dayan4, Nese Kirimer5, K. Husnu Can Baser5, Zeki Aytac6, Ikhlas A. Khan1,7 and Brian E. Scheffler4* 1National Center for Natural Products Research, Research Institute of Pharmaceutical Sciences, University of Mississippi, MS 38677, USA, 2Harding Lab, New York Botanical Garden, 200th St. and Kazimiroff Blvd., Bronx, NY 10458, USA, 3Department of Bioengineering, Faculty of Engineering, Ege University, Bornova, Izmir 35100, Turkey, 4USDA-ARS-NPURU, University, MS 38677, USA, 5Department of Pharmacognosy, Faculty of Pharmacy, Anadolu University, 26470 Eskisehir, Turkey, 6Department of Biology, Faculty of Science and Letters, Gazi University, 06500 Ankara, Turkey and 7Department of Pharmacognosy, School of Pharmacy, University of Mississippi, University, MS 38677, USA Received 27 September 2004; Accepted 21 April 2005 Abstract Hydro-distilled essential oils from fruits, aerial parts (without fruits) and roots of Pimpinella species native to Turkey and their phylogenetic relationships to one another were exam- ined. Phytochemical investigation of the essential oils of 19 species resulted in isolation of 16 phenylpropanoids, four sesquiterpenes and two azulene-type norsesquiterpenes. The structures of the isolated compounds were determined primarily from 1D- and 2D- NMR experiments as well as liquid chromatography–mass spectrometry and gas chromatog- raphy–mass spectrometry. Phylogenetic relationships among 26 species were evaluated using ITS 1, ITS 4 nuclear rDNA and psbA-trnH cpDNA sequences. In this study, signifi- cance and occurrence of phenylpropanoids, azulenes and geijerenes are discussed from a phylogenetic, chemical and biosynthetic perspective.
    [Show full text]
  • Chemical Composition of the Essential Oil from Aerial Parts of Javanian Pimpinella Pruatjan Molk. and Its Molecular Phylogeny
    diversity Article Chemical Composition of the Essential Oil from Aerial Parts of Javanian Pimpinella pruatjan Molk. and Its Molecular Phylogeny Agustina D. R. Nurcahyanti 1, Issam J. Nasser 2, Frank Sporer 1, Jürgen Graf 3, Nurliani Bermawie 4, Jürgen Reichling 1 and Michael Wink 1,* 1 Institute of Pharmacy and Molecular Biotechnology, Heidelberg University, Im Neuenheimer Feld 364, Heidelberg D-69120, Germany; [email protected] (A.D.R.N.); [email protected] (F.S.); [email protected] (J.R.) 2 College of Health and Medical Technology, Middle Technical University, Baghdad 10047, Iraq; [email protected] 3 Institute of Organic Chemistry, Heidelberg University, Im Neuenheimer Feld 270, Heidelberg D-69120, Germany; [email protected] 4 Department of Plant Genetic Resources and Breeding, Indonesian Spice and Medicinal Crops Research Institute, Indonesian Agency for Agricultural Research and Development (IAARD), Jl. Tentara Pelajar No.3A, Bogor 16111, Indonesia; [email protected] * Correspondence: [email protected]; Tel.: +49-6221-544-880 Academic Editor: Ipek Kurtboke Received: 12 March 2016; Accepted: 11 July 2016; Published: 14 July 2016 Abstract: The species-rich and diverse genus Pimpinella is mainly distributed in Europe and Asia; a few species occur in Africa. Yet, the Javanian Pimpinella, P. pruatjan, which has been used as an aphrodisiac in Indonesian traditional medicine, was studied for the first time in the context of chemical composition, as well as phylogeny analysis and antimicrobial activity. We examined the chemical composition of the essential oil (EO) from aerial parts of P. pruatjan by gas liquid chromatography-mass spectrometry (GLC-MS).
    [Show full text]