Вплив Умов Отримання Посівного Матеріалу На Біосинтетичну Здатність Продуценту Рибофлавіну Eremothecium Ashbyi

Total Page:16

File Type:pdf, Size:1020Kb

Вплив Умов Отримання Посівного Матеріалу На Біосинтетичну Здатність Продуценту Рибофлавіну Eremothecium Ashbyi Science and Education a New Dimension. Natural and Technical Sciences, V(14), Issue: 132, 2017 www.seanewdim.com Вплив умов отримання посівного матеріалу на біосинтетичну здатність продуценту рибофлавіну Eremothecium ashbyi В. Ю. Поліщук*, О. М. Дуган Національний технічний університет України «Київський політехнічний інститут імені Ігоря Сікорського» *Corresponding author. E-mail: [email protected] Paper received 21.06.17; Revised 26.06.17; Accepted for publication 28.06.17. Анотація. Досліджено зміну біосинтетичної здатності аскоміцета Eremothecium ashbyi за двома показниками: накопичення рибо- флавіну та біомаси. У зв’язку зі зниженням рівня біосинтезу вітаміну В2 запропоновано використання ультрафіолетового опромі- нення міцелію для підвищення біосинтетичної здатності. Встановлено вік та кількість посівного матеріалу, що вноситься у ферме- нтаційне середовище, які відповідають найбільшому накопиченню рибофлавіну та біомаси. Ключові слова: рибофлавін, Eremothecium ashbyi, посівний матеріал, біомаса, вік інокуляту. Вступ. Eremothecium ashbyi, виділений Guilliermond Матеріали та методи. Об’єктом дослідження був M.A. у 1935 році з коробочок бавовнику, на яких він Eremothecium ashbyi Guilliermond F-340, отриманий з паразитує, є одним з відомих продуцентів рибофлавіну, Всеросійської колекції промислових мікроорганізмів який використовується у промисловості для біотехноло- (таксономічне положення відповідно до міжнародної гічного отримання вітаміну В2. E. ashbyi здатен до по- бази систематики грибів САВІ Bioscience та бази даних надсинтезу рибофлавіну, який є одним із найважливі- CBS Database of Fungal Names, даний гриб віднесений до ших ростових факторів людини і тварин. Флавонопроте- Eremotheciaceae, Saccharomycetales, Saccharomycetidae, їни грають важливу роль у метаболізмі клітини. Актив- Saccharomycetes, Saccharomycotina, Ascomycota, Fungi ними групами більшості флавопротеїнів є нековалентно [7]). зв’язані флавінові кофактори – флавінмононуклеотид Штам гриба зберігали при кімнатній температурі на (ФМН) та флавінаденіндинуклеотид (ФАД). E. ashbyi, скошеному агаризованому глюкозо-пептонно- один з небагатьох продуцентів, здатен накопичувати до дріжджовому (ГПД) середовищі складу (у %): глюкоза – 30% ФАД від загальної кількості флавінів, що синтезу- 1,0; пептон – 0,3; дріжджовий екстракт – 0,5; агар – 2,0. ються. За допомогою E. ashbyi можна отримувати як Глибинне культивування E. ashbyi на рідкому ГПД кормовий рибофлавін, так і, при застосуванні певних середовищі здійснювали при 28ºС протягом 6 діб у коні- методів виділення та очистки, рибофлавін медичного чних колбах з 50 мл середовища в умовах постійного призначення. перемішування на орбітальній качалці зі швидкістю 180 Короткий огляд публікацій за темою. При здійс- обертів/хв. Середовища у колбах інокулювались попе- ненні глибинного культивування стан інокуляту має редньо отриманою на рідкому ГПД середовищі культу- велике значення для синтезу і накопичення біологічно- рою різного віку та у різній кількості. активних речовин. Зазвичай для засіву виробничого се- Кількість біомаси визначали ваговим методом після її редовища при глибинному способі культивування посі- відділення від культуральної рідини фільтруванням та вний матеріал готують також глибинним способом. Ета- висушування до сталої маси при 105ºС [8]. пи отримання посівної культури наступні: 1) оновлення Вміст рибофлавіну у культуральній рідині визначали вихідної культури на агаризованому середовищі; 2) ви- спектрофотометрично при λ = 450 нм після попередньо- рощування культури на рідкому середовищі в колбах на го гідролізу ФАД до ФМН протягом 12 годин у 10 % калці; 3) культивування продуцента в інокуляторі. Посі- ТХО [8, 9]. вна доза при засіві глибинною культурою зазвичай порі- Для дослідження впливу УФ-опромінення на синтез вняно велика - від 1 до 25%. Для продуценту Е. ashbyi у рибофлавіну вирощену на щільному поживному середо- публікаціях наводяться суперечливі дані. вищі культуру Eremothecium ashbyi засівали в колби на Так, у роботі [1] було показано, що для досягнення 100 мл з рідким ГПД середовищем, культивували 3 доби максимальної продуктивності Е. ashbyi Guilliermond на качалці при 180 об/хв при 28°С. Після чого культура- 1935 по рибофлавіну засів ферментаційного поживного льну рідину відцентрифуговували при 3000 об./хв про- середовища повинен проводитися свіжепророслими тягом 10 хв. з наступним промиванням стерильною дис- спорами гриба. У роботі [2] зазначається, що біосинтез тильованою водою, таким чином були отримані водні рибофлавіну однаково протікає на ферментаційному суспензії міцелію культури Eremothecium ashbyi. середовищі, засіяному 1-3 добовою культурою продуце- Водна суспензія продуценту або культура продуценту нту. Рекомендована кількість посівного матеріалу, що у середовищі культивування по 3 см3 розливалися у ча- вноситься у поживне середовище, становить 0,75 – 2% шки Петрі. Суспензія розподіляється по дну чашки тон- [3]. Проте сучасні автори у своїх дослідженнях викорис- ким шаром товщиною 0,1 мм. Чашки Петрі поміщали на товують великі об’єми посівного матеріалу: найчастіше відстані 25 см від джерела УФ-променів (лампа бакте- 5 [4] та 10 % [5]. Крім дослідження впливу якості посів- рицидная 15W Electrum G13 A-FG-0495) і знімали кри- ного матеріалу на біосинтез рибофлавіну, досліджувався шки в момент включення секундоміра. Через задані вплив стану посівного матеріалу на утворення компоне- проміжки часу (1, 3, 5 хвилин) чашки закривали криш- нтів ефірної олії, що продукується Е. ashbyi [6]. ками і опромінену культуральну рідину і водну суспен- Мета. Дослідити умови отримання посівного матері- зію міцелію Eremothecium ashbyi засівали в колби на 250 алу Eremothecium ashbyi Guilliermond F-340 в активному см3 з рідким ГПД середовищем у кількості 5% [8, 10]. стані, які б забезпечували найвищу біосинтетичну здат- Результати та їх обговорення. На першому етапі ність штаму-продуценту. підготовки посівного матеріалу здійснюють оновлення 82 Science and Education a New Dimension. Natural and Technical Sciences, V(14), Issue: 132, 2017 www.seanewdim.com вихідної культури на агаризованих середовищах. Оскі- На накопичення біомаси УФ-опромінення впливу льки штам-продуцент є досить нестабільним при збері- майже не здійснює, відмінності між показниками нако- ганні, основною вимогою є розсів культури на щільні пичення біомаси не є статистично значимими. середовища, та відбір колоній, забарвлених у яскраво 3 жовтий колір, які і використовуються для подальшого 40 отримання посівного матеріалу. 35 Незважаючи на постійну підтримуючу селекцію при 30 культивування штаму у лабораторних умовах протягом 25 3 років спостерігалося поступове значне зниження рівня 20 накопичення рибофлавіну та відповідне збільшення рів- 15 ня накопичення біомаси (рис. 1). Зниження кількості 10 рибофлавіну при збільшенні кількості біомаси можна 5 пояснити тісним зв’язком біосинтезу флавінів з обміном 0 пуринів. Концентрація рибофлавіну, мг/дм контроль 1 хв КР 3 хв КР 5 хв КР 1 хв ВС 5 хв ВС 3 50 Рис. 2. Біосинтез рибофлавіну штамом E. ashbyi F-340 після 4 УФ-опромінення 45 3 3,5 (КР – культуральна рідина, ВС – водна суспензія міцелію) (до- 40 стовірність відмінностей р<0,05) 35 3 За результатами проведених досліджень запропоно- 30 2,5 вано додати до технологічної схеми отримання рибо- 25 2 флавіну стадію ультрафіолетового опромінення посівно- 20 1,5 го матеріалу для збільшення виходу рибофлавіну. 15 1 3 4,5 10 4 0,5 5 Концентрація біомаси, г/дм 3,5 Концентрація рибофлавіну, мг/дм 0 0 3 1 2 3 1 2 3 2,5 а б 2 Рис. 1. Біосинтез рибофлавіну (а) та рівень накопичення біома- 1,5 си (б) штамом E. ashbyi F-340 протягом 3 років 1 (достовірність відмінностей р<0,05) 0,5 Концентрація біомаси, г/дм 0 Значна втрата штамом здатності до синтезу рибофла- віну (більше ніж на 90%) призвела до необхідності по- контроль 1 хв КР 3 хв КР 5 хв КР 1 хв ВС 5 хв ВС шуку способів підвищення рівня синтезу рибофлавіну Рис. 3. Накопичення біомаси штамом E. ashbyi F-340 після УФ- штамом-продуцентом. З літературних джерел відомо, опромінення що понадсинтез рибофлавіну грибом E. ashbyi у природ- Результати ферментації, отримані при використанні них умовах здійснюється як захисна реакція на дію со- посівного матеріалу різного віку, наведені в табл. 1. З нячних ультрафіолетових променів. Тому нами було наведених даних видно, що сприятливим для накопи- запропоновано здійснювати УФ-опромінення продуцен- чення рибофлавіну виявилося вирощування посівного ту для підвищення синтезу рибофлавіну. Результати матеріалу протягом 3-4 діб. Мікроскопічний аналіз по- проведених досліджень наведені на рис. 2 та 3. казав, що у цей моменту міцелій гриба представлений Опромінення культуральної рідини продуценту приз- гіфами, що сильно розрослися, з великим числом вакуо- водить до збільшення синтезу рибофлавіну на 72-74%, лей та численними включеннями, що відповідає стаціо- опромінення водної суспензії міцелію штаму- нарній фазі росту культури. проте найбільша кількість продуценту - до збільшення синтезу на 80%. біомаси отримується при засіві середовища інокулятом віком 6 діб. Таблиця 1. Вплив періоду культивування посівного матеріалу на біосинтетичну активність продуценту рибофлавіну Тривалість вирощування Концентрація рибофлавіну на 6 Концентрація біомаси на 6 посівного матеріалу, діб добу культивування, мг/дм3 добу культивування, г/дм3 1 11±0,44 2,02±0,078 2 11,1±0,36 1,46±0,038 3 21,05±0,97 1,92±0,087 4 21,73±0,43 1,93±0,085 5 16,45±0,77 2,55±0,077 6 18,46±0,89 2,68±0,111 (достовірність відмінностей р<0,05) Найбільший рівень накопичення рибофлавіну був досягнутий у тих варіантах,
Recommended publications
  • Final 130607
    Jury: Prof. dr. ir. Walter Steurbaut (chairman) Prof. dr. ir. Erick Vandamme (promotor) Prof. dr. ir. Wim Soetaert (promotor) Prof. dr. ir. Nico Boon Prof. dr. ir. Monica Höfte Prof. dr. Els Van Damme Dr. Roel Bovenberg Dr. Thierry Dauvrin Promotors: Prof. dr. ir. Erick VANDAMME Prof. dr. ir. Wim SOETAERT Laboratory of Industrial Microbiology and Biocatalysis Department of Biochemical and Microbial Technology Ghent University Dean: Prof. dr. ir. Herman VAN LANGENHOVE Rector: Prof. dr. Paul VAN CAUWENBERGE S. De Maeseneire was supported by a fellowship of the Flemish Institute for the Promotion of Scientific and Technological Research in the Industry (IWT-Vlaanderen). The research was conducted at the Laboratory of Industrial Microbiology and Biocatalysis, Department of Biochemical and Microbial Technology, Ghent University. ir. Sofie De Maeseneire MYROTHECIUM GRAMINEUM AS A NOVEL FUNGAL EXPRESSION HOST Thesis submitted in fulfilment of the requirements for the degree of Doctor (PhD) in Applied Biological Sciences Cell and Gene Biotechnology Titel van het doctoraatsproefschrift in het Nederlands: Myrothecium gramineum als een nieuwe fungale expressie-gastheer Cover illustration: ‘ Myrothecium gramineum’ by Sofie De Maeseneire (June 2007) To refer to this thesis: De Maeseneire, S. L. (2007) Myrothecium gramineum as a novel fungal expression host. PhD-thesis, Faculty of Bioscience Engineering, Ghent University, Ghent, Belgium, 308 p. ISBN-number: 978-90-5989-176-0 The author and the promotors give the authorisation to consult and to copy parts of this work for personal use only. Every other use is subject to copy right laws. Permission to reproduce any material contained in this work should be obtained from the author.
    [Show full text]
  • Identification and Phylogeny of Ascomycetous Yeasts from Analysis
    Antonie van Leeuwenhoek 73: 331–371, 1998. 331 © 1998 Kluwer Academic Publishers. Printed in the Netherlands. Identification and phylogeny of ascomycetous yeasts from analysis of nuclear large subunit (26S) ribosomal DNA partial sequences Cletus P. Kurtzman∗ & Christie J. Robnett Microbial Properties Research, National Center for Agricultural Utilization Research, Agricultural Research Ser- vice, U.S. Department of Agriculture, Peoria, Illinois 61604, USA (∗ author for correspondence) E-mail: [email protected] Received 19 June 1998; accepted 19 June 1998 Key words: Ascomycetous yeasts, phylogeny, ribosomal DNA, systematics Abstract Approximately 500 species of ascomycetous yeasts, including members of Candida and other anamorphic genera, were analyzed for extent of divergence in the variable D1/D2 domain of large subunit (26S) ribosomal DNA. Divergence in this domain is generally sufficient to resolve individual species, resulting in the prediction that 55 currently recognized taxa are synonyms of earlier described species. Phylogenetic relationships among the ascomycetous yeasts were analyzed from D1/D2 sequence divergence. For comparison, the phylogeny of selected members of the Saccharomyces clade was determined from 18S rDNA sequences. Species relationships were highly concordant between the D1/D2 and 18S trees when branches were statistically well supported. Introduction lesser ranges of nDNA relatedness than those found among heterothallic species. Disadvantages of nDNA reassociation studies in- Procedures commonly used for yeast identification clude the need for pairwise comparisons of all isolates rely on the appearance of cellular morphology and dis- under study and that resolution is limited to the ge- tinctive reactions on a standardized set of fermentation netic distance of sister species, i.e., closely related and assimilation tests.
    [Show full text]
  • Phylogenetic Circumscription of Saccharomyces, Kluyveromyces
    FEMS Yeast Research 4 (2003) 233^245 www.fems-microbiology.org Phylogenetic circumscription of Saccharomyces, Kluyveromyces and other members of the Saccharomycetaceae, and the proposal of the new genera Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma and Zygotorulaspora Cletus P. Kurtzman à Microbial Genomics and Bioprocessing Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, 1815 N. University Street, Peoria, IL 61604, USA Received 22 April 2003; received in revised form 23 June 2003; accepted 25 June 2003 First published online Abstract Genera currently assigned to the Saccharomycetaceae have been defined from phenotype, but this classification does not fully correspond with species groupings determined from phylogenetic analysis of gene sequences. The multigene sequence analysis of Kurtzman and Robnett [FEMS Yeast Res. 3 (2003) 417^432] resolved the family Saccharomycetaceae into 11 well-supported clades. In the present study, the taxonomy of the Saccharomyctaceae is evaluated from the perspective of the multigene sequence analysis, which has resulted in reassignment of some species among currently accepted genera, and the proposal of the following five new genera: Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma and Zygotorulaspora. ß 2003 Federation of European Microbiological Societies. Published by Elsevier B.V. All rights reserved. Keywords: Saccharomyces; Kluyveromyces; New ascosporic yeast genera; Molecular systematics; Multigene phylogeny 1. Introduction support the maintenance of three distinct genera. Yarrow [8^10] revived the concept of three genera and separated The name Saccharomyces was proposed for bread and Torulaspora and Zygosaccharomyces from Saccharomyces, beer yeasts by Meyen in 1838 [1], but it was Reess in 1870 although species assignments were often di⁄cult.
    [Show full text]
  • Oxylipin Distribution in Eremothecium
    1 Oxylipin distribution in Eremothecium by Ntsoaki Joyce Leeuw Submitted in accordance with the requirements for the degree Magister Scientiae in the Department of Microbial, Biochemical and Food Biotechnology Faculty of Natural and Agricultural Sciences University of the Free State Bloemfontein South Africa Supervisor: Prof J.L.F. Kock Co- supervisors: Dr C.H. Pohl Prof P.W.J. Van Wyk November 2006 2 This dissertation is dedicated to the following people: My mother (Nkotseng Leeuw) My brother (Kabelo Leeuw) My cousins (Bafokeng, Lebohang, Mami, Thabang and Rorisang) Mr. Eugean Malebo 3 ACKNOWLEDGEMENTS I wish to thank and acknowledge the following: ) God, to You be the glory for the things You have done in my life. ) My family (especially my mom) – for always being there for me when I’m in need. ) Prof. J.L.F Kock for his patience, constructive criticisms and guidance during the course of this study. ) Dr. C.H. Pohl for her encouragement and assistance in the writing up of this dissertation. ) Mr. P.J. Botes for assistance with the GC-MS. ) Prof. P.W.J. Van Wyk and Miss B. Janecke for assistance with the CLSM and SEM. ) My fellow colleagues (especially Chantel and Desmond) for their assistance, support and encouragement. ) Mr. Eugean Malebo for always being there when I needed you. 4 CONTENTS Page Title page I Acknowledgements II Contents III CHAPTER 1 Introduction 1.1 Motivation 2 1.2 Definition and classification of yeasts 3 1.3 Classification of Eremothecium and related genera 5 1.4 Pathogenicity 12 1.5 Oxylipins 13 1.5.1 Definition
    [Show full text]
  • Phylogenetic Circumscription of Saccharomyces, Kluyveromyces
    FEMS Yeast Research 4 (2003) 233^245 www.fems-microbiology.org Phylogenetic circumscription of Saccharomyces, Kluyveromyces and other members of the Saccharomycetaceae, and the proposal of the new genera Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma and Zygotorulaspora Downloaded from https://academic.oup.com/femsyr/article-abstract/4/3/233/562841 by guest on 29 May 2020 Cletus P. Kurtzman à Microbial Genomics and Bioprocessing Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, 1815 N. University Street, Peoria, IL 61604, USA Received 22 April 2003; received in revised form 23 June 2003; accepted 25 June 2003 First published online Abstract Genera currently assigned to the Saccharomycetaceae have been defined from phenotype, but this classification does not fully correspond with species groupings determined from phylogenetic analysis of gene sequences. The multigene sequence analysis of Kurtzman and Robnett [FEMS Yeast Res. 3 (2003) 417^432] resolved the family Saccharomycetaceae into 11 well-supported clades. In the present study, the taxonomy of the Saccharomyctaceae is evaluated from the perspective of the multigene sequence analysis, which has resulted in reassignment of some species among currently accepted genera, and the proposal of the following five new genera: Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma and Zygotorulaspora. ß 2003 Federation of European Microbiological Societies. Published by Elsevier B.V. All rights reserved. Keywords: Saccharomyces; Kluyveromyces; New ascosporic yeast genera; Molecular systematics; Multigene phylogeny 1. Introduction support the maintenance of three distinct genera. Yarrow [8^10] revived the concept of three genera and separated The name Saccharomyces was proposed for bread and Torulaspora and Zygosaccharomyces from Saccharomyces, beer yeasts by Meyen in 1838 [1], but it was Reess in 1870 although species assignments were often di⁄cult.
    [Show full text]
  • Ashbya Gossypii Beyond Industrial Riboflavin Production
    View metadata, citation and similar papers at core.ac.uk brought to you by CORE provided by Universidade do Minho: RepositoriUM JBA-06974; No of Pages 13 Biotechnology Advances xxx (2015) xxx–xxx Contents lists available at ScienceDirect Biotechnology Advances journal homepage: www.elsevier.com/locate/biotechadv Research review paper Ashbya gossypii beyond industrial riboflavin production: A historical perspective and emerging biotechnological applications Tatiana Q. Aguiar 1,RuiSilva1, Lucília Domingues ⁎ CEB − Centre of Biological Engineering, University of Minho, 4710-057 Braga, Portugal article info abstract Article history: The filamentous fungus Ashbya gossypii has been safely and successfully used for more than two decades in the Received 28 May 2015 commercial production of riboflavin (vitamin B2). Its industrial relevance combined with its high genetic similar- Received in revised form 28 September 2015 ity with Saccharomyces cerevisiae together promoted the accumulation of fundamental knowledge that has been Accepted 4 October 2015 efficiently converted into a significant molecular and in silico toolbox for its genetic engineering. This synergy has Available online xxxx enabled a directed and sustained exploitation of A. gossypii as an industrial riboflavin producer. Although there is fl Keywords: still room for optimizing ribo avin production, the recent years have seen an abundant advance in the explora- Ashbya gossypii tion of A. gossypii for other biotechnological applications, such as the production of recombinant proteins, single Physiology cell oil and flavour compounds. Here, we will address the biotechnological potential of A. gossypii beyond ribofla- Metabolism vin production by presenting (a) a physiological and metabolic perspective over this fungus; (b) the molecular Genetic engineering toolbox available for its manipulation; and (c) commercial and emerging biotechnological applications for this Riboflavin industrially important fungus, together with the approaches adopted for its engineering.
    [Show full text]
  • Myconet Volume 14 Part One. Outine of Ascomycota – 2009 Part Two
    (topsheet) Myconet Volume 14 Part One. Outine of Ascomycota – 2009 Part Two. Notes on ascomycete systematics. Nos. 4751 – 5113. Fieldiana, Botany H. Thorsten Lumbsch Dept. of Botany Field Museum 1400 S. Lake Shore Dr. Chicago, IL 60605 (312) 665-7881 fax: 312-665-7158 e-mail: [email protected] Sabine M. Huhndorf Dept. of Botany Field Museum 1400 S. Lake Shore Dr. Chicago, IL 60605 (312) 665-7855 fax: 312-665-7158 e-mail: [email protected] 1 (cover page) FIELDIANA Botany NEW SERIES NO 00 Myconet Volume 14 Part One. Outine of Ascomycota – 2009 Part Two. Notes on ascomycete systematics. Nos. 4751 – 5113 H. Thorsten Lumbsch Sabine M. Huhndorf [Date] Publication 0000 PUBLISHED BY THE FIELD MUSEUM OF NATURAL HISTORY 2 Table of Contents Abstract Part One. Outline of Ascomycota - 2009 Introduction Literature Cited Index to Ascomycota Subphylum Taphrinomycotina Class Neolectomycetes Class Pneumocystidomycetes Class Schizosaccharomycetes Class Taphrinomycetes Subphylum Saccharomycotina Class Saccharomycetes Subphylum Pezizomycotina Class Arthoniomycetes Class Dothideomycetes Subclass Dothideomycetidae Subclass Pleosporomycetidae Dothideomycetes incertae sedis: orders, families, genera Class Eurotiomycetes Subclass Chaetothyriomycetidae Subclass Eurotiomycetidae Subclass Mycocaliciomycetidae Class Geoglossomycetes Class Laboulbeniomycetes Class Lecanoromycetes Subclass Acarosporomycetidae Subclass Lecanoromycetidae Subclass Ostropomycetidae 3 Lecanoromycetes incertae sedis: orders, genera Class Leotiomycetes Leotiomycetes incertae sedis: families, genera Class Lichinomycetes Class Orbiliomycetes Class Pezizomycetes Class Sordariomycetes Subclass Hypocreomycetidae Subclass Sordariomycetidae Subclass Xylariomycetidae Sordariomycetes incertae sedis: orders, families, genera Pezizomycotina incertae sedis: orders, families Part Two. Notes on ascomycete systematics. Nos. 4751 – 5113 Introduction Literature Cited 4 Abstract Part One presents the current classification that includes all accepted genera and higher taxa above the generic level in the phylum Ascomycota.
    [Show full text]
  • 7.5 X 11.5.Doubleline.P65
    Cambridge University Press 978-0-521-01483-0 - Introduction to Fungi, Third Edition John Webster and Roland Weber Table of Contents More information Contents Preface to the first edition page xiii Preface to the second edition xv Preface to the third edition xvii Acknowledgements xix Chapter 1 Introduction 1 1.1 What are fungi? 1 1.2 Physiology of the growing hypha 3 1.3 Hyphal aggregates 14 1.4 Spores of fungi 22 1.5 Taxonomy of fungi 32 Chapter 2 Protozoa: Myxomycota (slime moulds) 40 2.1 Introduction 40 2.2 Acrasiomycetes: acrasid cellular slime moulds 40 2.3 Dictyosteliomycetes: dictyostelid slime moulds 41 2.4 Protosteliomycetes: protostelid plasmodial slime moulds 45 2.5 Myxomycetes: true (plasmodial) slime moulds 47 Chapter 3 Protozoa: Plasmodiophoromycota 54 3.1 Introduction 54 3.2 Plasmodiophorales 54 3.3 Control of diseases caused by Plasmodiophorales 62 3.4 Haptoglossa (Haptoglossales) 64 Chapter 4 Straminipila: minor fungal phyla 67 4.1 Introduction 67 4.2 The straminipilous flagellum 68 4.3 Hyphochytriomycota 70 4.4 Labyrinthulomycota 71 Chapter 5 Straminipila: Oomycota 75 5.1 Introduction 75 5.2 Saprolegniales 79 5.3 Pythiales 95 5.4 Peronosporales 115 5.5 Sclerosporaceae 125 © Cambridge University Press www.cambridge.org Cambridge University Press 978-0-521-01483-0 - Introduction to Fungi, Third Edition John Webster and Roland Weber Table of Contents More information viii CONTENTS Chapter 6 Chytridiomycota 127 6.1 Introduction 127 6.2 Chytridiales 134 6.3 Spizellomycetales 145 6.4 Neocallimastigales (rumen fungi) 150 6.5
    [Show full text]
  • The Yeast Handbook Carlos Rosa, Gábor Péter (Eds.)
    The Yeast Handbook Carlos Rosa, Gábor Péter (Eds.) Biodiversity and Ecophysiology of Yeasts With 40 Figures and 43 Tables Dr. Gábor Péter Professor Carlos Rosa Budapest University of Economic Departmento de Microbiologia Sciences and Public Administration ICB, CP 486 Faculty of Food Sciences Universidade Federal de Minas Gerais National Collection of Agricultural and Belo Horizonte, MG Industrial Microorganisms 31270-901 Somloi út 14-16 Brazil H-1118 Budapest Hungary Cover pictures by courtesy of: Vincent Robert, Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS), The Netherlands Carlos Rosa, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil ISBN-10 3-540-26100-1 Springer Berlin Heidelberg New York ISBN-13 978-3-540-26100-1 Springer Berlin Heidelberg New York Library of Congress Control Number: 2005930628 This work is subject to copyright. All rights are reserved, whether the whole or part of the mate- rial is concerned, specifically the rights of translation, reprinting, reuse of illustrations, recita- tion, broadcasting, reproduction on microfilm or in any other way, and storage in data banks. Duplication of this publication or parts thereof is permitted only under the provisions of the German Copyright Law of September 9, 1965, in its current version, and permission for use must always be obtained from Springer. Violations are liable to prosecution under the German Copyright Law. Springer-Verlag is a part of Springer Science+Business Media springeronline.com © Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2006 Printed in Germany The use of general descriptive names, registered names, trademarks, etc. in this publication does not imply, even in the absence of a specific statement, that such names are exempt from the relevant protective laws and regulations and therefore free for general use.
    [Show full text]
  • Ashbya Gossypii Beyond Industrial Riboflavin Production
    JBA-06974; No of Pages 13 Biotechnology Advances xxx (2015) xxx–xxx Contents lists available at ScienceDirect Biotechnology Advances journal homepage: www.elsevier.com/locate/biotechadv Research review paper Ashbya gossypii beyond industrial riboflavin production: A historical perspective and emerging biotechnological applications Tatiana Q. Aguiar 1,RuiSilva1, Lucília Domingues ⁎ CEB − Centre of Biological Engineering, University of Minho, 4710-057 Braga, Portugal article info abstract Article history: The filamentous fungus Ashbya gossypii has been safely and successfully used for more than two decades in the Received 28 May 2015 commercial production of riboflavin (vitamin B2). Its industrial relevance combined with its high genetic similar- Received in revised form 28 September 2015 ity with Saccharomyces cerevisiae together promoted the accumulation of fundamental knowledge that has been Accepted 4 October 2015 efficiently converted into a significant molecular and in silico toolbox for its genetic engineering. This synergy has Available online xxxx enabled a directed and sustained exploitation of A. gossypii as an industrial riboflavin producer. Although there is fl Keywords: still room for optimizing ribo avin production, the recent years have seen an abundant advance in the explora- Ashbya gossypii tion of A. gossypii for other biotechnological applications, such as the production of recombinant proteins, single Physiology cell oil and flavour compounds. Here, we will address the biotechnological potential of A. gossypii beyond ribofla- Metabolism vin production by presenting (a) a physiological and metabolic perspective over this fungus; (b) the molecular Genetic engineering toolbox available for its manipulation; and (c) commercial and emerging biotechnological applications for this Riboflavin industrially important fungus, together with the approaches adopted for its engineering.
    [Show full text]
  • Outline of Ascomycota - 2007
    ISSN 1403-1418 VOLUME 13 DECEMBER 31, 2007 Outline of Ascomycota - 2007 H. Thorsten Lumbsch and Sabine M. Huhndorf (eds.) The Field Museum, Department of Botany, Chicago, USA Abstract Lumbsch, H. T. and S.M. Huhndorf (ed.) 2007. Outline of Ascomycota – 2007. Myconet 13: 1 - 58. The present classification contains all accepted genera and higher taxa above the generic level in phylum Ascomycota. Introduction The present classification is based in part on earlier versions published in Systema Ascomycetum and Myconet (see http://www.fieldmuseum.org/myconet/) and reflects the numerous changes made in the Deep Hypha issue of Mycologia (Spatafora et al. 2006), in Hibbett et al. (2007) and those listed in Myconet Notes Nos. 4408-4750 (Lumbsch & Huhndorf 2007). It includes all accepted genera and higher taxa of Ascomycota. New synonymous generic names are included in the outline. In future outlines attempts will be made to incorporate all synonymous generic names (for a list of synonymous generic names, see Eriksson & Hawksworth 1998). A question mark (?) indicates that the position of the taxon is uncertain. Eriksson O.E. & Hawksworth D.L. 1998. Outline of the ascomycetes - 1998. - Systema Ascomycetum 16: 83-296. Hibbett, D.S., Binder, M., Bischoff, J.F., Blackwell, M., Cannon, P.F., Eriksson, O.E., Huhndorf, S., James, T., Kirk, P.M., Lucking, R., Lumbsch, H.T., Lutzoni, F., Matheny, P.B., McLaughlin, D.J., Powell, M.J., Redhead, S., Schoch, C.L., Spatafora, J.W., Stalpers, J.A., Vilgalys, R., Aime, M.C., Aptroot, A., Bauer, R., Begerow, D.,
    [Show full text]
  • 7.5 X 11.5.Doubleline.P65
    Cambridge University Press 978-0-521-80739-5 - Introduction to Fungi, Third Edition John Webster and Roland Weber Table of Contents More information Contents Preface to the first edition page xiii Preface to the second edition xv Preface to the third edition xvii Acknowledgements xix Chapter 1 Introduction 1 1.1 What are fungi? 1 1.2 Physiology of the growing hypha 3 1.3 Hyphal aggregates 14 1.4 Spores of fungi 22 1.5 Taxonomy of fungi 32 Chapter 2 Protozoa: Myxomycota (slime moulds) 40 2.1 Introduction 40 2.2 Acrasiomycetes: acrasid cellular slime moulds 40 2.3 Dictyosteliomycetes: dictyostelid slime moulds 41 2.4 Protosteliomycetes: protostelid plasmodial slime moulds 45 2.5 Myxomycetes: true (plasmodial) slime moulds 47 Chapter 3 Protozoa: Plasmodiophoromycota 54 3.1 Introduction 54 3.2 Plasmodiophorales 54 3.3 Control of diseases caused by Plasmodiophorales 62 3.4 Haptoglossa (Haptoglossales) 64 Chapter 4 Straminipila: minor fungal phyla 67 4.1 Introduction 67 4.2 The straminipilous flagellum 68 4.3 Hyphochytriomycota 70 4.4 Labyrinthulomycota 71 Chapter 5 Straminipila: Oomycota 75 5.1 Introduction 75 5.2 Saprolegniales 79 5.3 Pythiales 95 5.4 Peronosporales 115 5.5 Sclerosporaceae 125 © Cambridge University Press www.cambridge.org Cambridge University Press 978-0-521-80739-5 - Introduction to Fungi, Third Edition John Webster and Roland Weber Table of Contents More information viii CONTENTS Chapter 6 Chytridiomycota 127 6.1 Introduction 127 6.2 Chytridiales 134 6.3 Spizellomycetales 145 6.4 Neocallimastigales (rumen fungi) 150 6.5
    [Show full text]