LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành khóa luận này, em xin cảm ơn các thầy cô trong bộ môn Công nghệ Gen và Tế bào, Viện Công Nghệ Sinh Học - Trƣờng Đại học Lâm Nghiệp Việt Nam đã tạo mọi điều kiện tốt nhất giúp em hoàn thành đề tài tốt nghiệp này. Em xin gửi lời cảm ơn chân thành và sâu sắc nhất đến Ts. Bùi Thị Mai Hƣơng ngƣời đã quan tâm, dìu dắt và tận tình hƣớng dẫn em trong suốt quá trình làm luận án tốt nghiệp. Đƣợc sự đồng ý của Nhà trƣờng, Viện Công nghệ sinh học - Trƣờng Đại học Lâm Nghiệp và sự hƣớng dẫn của T.s Bùi Thị Mai Hƣơng, em đã thực hiện khóa luận tốt nghiệp với đề tài: “Phân lập gen diacylglycerol acyltransferase (DGAT) mã hóa một enzyme đóng vai trò quan trọng trong sinh tổng hợp triacylglycerol ở loài cây Trẩu (Vernicia montana)” Đồng thời, xin gửi lời cám ơn tới tất cả các bạn sinh viên lớp K59-CNSH đã đóng góp ý kiến, giúp đỡ, động viên và khuyến khích tôi trong suốt thời gian học tập và thực hiện luận án tốt nghiệp. Em xin chân thành cảm ơn !
i
MỤC LỤC
LỜI CẢM ƠN ...... i MỤC LỤC ...... ii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ...... iii DANH MỤC CÁC BẢNG ...... iv DANH MỤC CÁC HÌNH ...... iv ĐẶT VẤN ĐỀ ...... 1 PHẦN I. TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU ...... 2 1. 1. Giới thiệu về cây Trẩu ...... 2 1.2. Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) và các nghiên cứu ứng dụng ...... 4 1.2.1. Giới thiệu về diacylglycerol acyltransferase ...... 4 1.2.2. Những nghiên cứu ứng dụng về diacylglycerol acyltransferase...... 6 PHẦN II. MỤC TIÊU, NỘI DUNG, PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU ...... 8 2.1. Mục tiêu ...... 8 2.2. Nội dung nghiên cứu ...... 8 2.3. Đối tƣợng, phƣơng pháp nghiên cứu ...... 8 2.3.1. Đối tƣợng nghiên cứu ...... 8 2.3.2. Phƣơng pháp nghiên cứu ...... 8 2.3.3. Cách tiến hành ...... 10 PHẦN III. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN ...... 14 3.1. Kết quả tách chiết ADN tổng số ...... 14 3.2. Kết quả nhân bản gen DGAT1 ở cây Trẩu nhăn nghiên cứu bằng kỹ thuật PCR……...... 14 3.3. Phân tích kết quả trình tự gen DGAT1 của cây Trẩu nhăn (Vernicia Montana) ...... 16 PHẦN IV. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ ...... 41 4.1. Kết luận ...... 41 4.2. Kiến nghị ...... 41 TÀI LIỆU THAM KHẢO
ii
DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT
Ký hiệu chữ viết tắt Viết đầy đủ
DGAT Diacylglycerol acyltransferase
g Gram
l Lít
ml Milliliter
mm Millimeter
N Nitơ
nm Nanometer
OD Optical density CTAB Hexadecyltrimet bromide hylammonium SDS Sodium dodecyl sulphate PVP Polyvinyl pyrrolidone
iii
DANH MỤC CÁC BẢNG
Bảng 2.1. Thành phần đệm tách A (100ml) ...... 9 Bảng 2.2. Thành phần đệm tách B (100ml) ...... 9
DANH MỤC CÁC HÌNH
Hình 3.1. ADN tổng số của Trẩu ...... 14 Hình 3.2. Kết quả PCR của gen và một đoạn gen DGAT1 ở cây Trẩu M: Marker ...... 15 Hình 3.3. Kết quả PCR của các đoạn gen DGAT1 ở cây Trẩu M: Marker ...... 16
iv
ĐẶT VẤN ĐỀ Cải tạo giống cây trồng bằng công nghệ gen đƣợc coi là phƣơng pháp tiên tiến nhất hiện nay và đã thành công ở rất nhiều loài cây trồng nông – lâm nghiệp (Jame, 2006). Tỷ lệ cây lâm nghiệp biến đổi gen đƣợc trồng trên thế giới ngày càng gia tăng. Bằng kỹ thuật chuyển gen các nhà nghiên cứu thuộc Biotechnology Foundation Laboratories, ĐH Thomas Jefferson, Hoa Kỳ đã xác định đƣợc phƣơng pháp làm gia tăng hàm lƣợng dầu trong lá cây thuốc lá biến đổi gen, bằng cách cho thể hiện gen của cây Arabidopsis thaliana, đó là diacylglycerol acyltransferase (DGAT). DGAT mã hóa một enzyme đóng vai trò quan trọng trong sinh tổng hợp triacylglycerol. Chính sự cải biên này đã làm gia tăng gấp 20 lần hàm lƣợng triacylglyceride tích lũy trong lá cây thuốc lá. Đặc biệt, sự cải biên gen DGAT làm cho hàm lƣợng dầu tăng 5,8% xét về trọng lƣợng khô của lá, khoảng 2 lần hàm lƣợng dầu bình thƣờng. Một trong những nguồn sản xuất NLSH có giá trị kinh tế là cây Trẩu nhăn (Vernicia montana) chiếm một tỷ lệ rất lớn lƣợng dầu. Dầu Trẩu chứa acid béo chủ yếu là α-eleostearic (70 – 80%). Đây là dạng acid béo chƣa no với 3 nối đôi có khả năng oxy hoá mạnh, nên dầu mau khô. Khi khô kết thành màng có tính chất chống ẩm chịu đƣợc thời tiết biến đổi cao, sức co giãn tốt, có tác dụng chống gỉ. Cho nên dầu Trẩu có vai trò rất quan trọng trong chế biến Sơn, keo. Ngoài ra dầu Trẩu đƣợc dùng để pha chế nhiên liệu sinh học, đó là dầu diesel sinh học. Xuất phát từ cơ sở trên, chúng tôi tiến hành xây dựng đề tài ở giai đoạn đầu đó là: “Phân lập gen diacylglycerol acyltransferase (DGAT1) mã hóa một enzyme đóng vai trò quan trọng trong sinh tổng hợp triacylglycerol ở loài cây Trẩu (Vernicia montana)”
1
PHẦN I. TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 1. 1. Giới thiệu về cây Trẩu Nguồn gốc Cây Trẩu có tên khoa học là: Vernicia montana Giới : Plantae Bộ : Malpighiales Họ : Euphorbiaceae Chi : Vernicia Loài :Vernicia montana Đặc điểm sinh học Trẩu hay còn gọi là Trẩu nhăn (danh pháp khoa học: Vernicia montana) là một loài cây mộc bản địa ở Đông Nam Á và Hoa Nam. Cây trẩu thƣờng mọc ở vùng đất khô, ráo nƣớc ở trong rừng thƣa hoặc ven rừng rậm, thƣờng đƣợc trồng nhiều ở các tỉnh phía Bắc tới Nghệ An, Hà Tĩnh để làm cây cho bóng mát và cũng để lấy hạt. Thu hái vỏ cây vào mùa xuân, hạt lấy ở quả già. Cây trung bình cao 10– 15 m. Lá trẩu to bản dài khoảng 15 cm, rộng 10 cm, có khi xòe thành ba dẻ, mặt trên có lông tơ rậm; mặt dƣới ít hơn. Hoa trẩu đơn tính, sắc trắng, ở giữa ngả màu hung đỏ tía. Hoa mọc thành chùm, khá thơm. Trái trẩu hình trứng, hơi nhọn đằng chỏm, tròn đằng cuống, lớn khoảng 5 cm. Vỏ nhăn nheo, có lông tơ; mặt vỏ có những rãnh dọc ngang. Trái trẩu chia thành 3
2
múi; khi trẩu chín thì trái ngả sang màu vàng. Mỗi trái thƣờng có ba hạt. Hạt trẩu hình bầu dục, sần sùi, dài khoảng 25 mm, rộng khoảng 20 mm. Trẩu sinh trƣởng nhanh, ở điều kiện thích hợp cây 3 tuổi có cao 4-5m. Cây bắt đầu ra hoa, kết quả ở giai đoạn sau 6-7 năm tuổi. Mùa hoa tháng 3-5, mùa quả chín tháng 9-10. Hoa thụ phấn nhờ côn trùng. Tuổi thọ của cây khoảng 35-50 năm hoặc lâu hơn, tuỳ thuộc điều kiện môi trƣờng sống và chế độ canh tác. Thành phần hóa học Nhân chiếm 50-70% trọng lƣợng hạt. Hàm lƣợng dầu trong nhân khá cao (46 – 65%). Các chỉ số lý hoá chính của dầu: Tỷ trọng (ở 150C): 0,9208-0,9450; chỉ số chiết quang (ở 350C): 1,504-1,517; chỉ số iod: 149,5-170,58; chỉ số xà phòng: 193,38-196,73; chỉ số acid: 1,4. Dầu chứa acid béo chủ yếu là axit stearic (70 – 80%). Đây là dạng acid béo chƣa no với 3 nối đôi có khả năng oxy hoá mạnh, nên dầu mau khô. Sau khi ép dầu, khô bã còn lại chứa tới 50% protein thô, 7,5% tro, 3% cellulose và một số hợp chất khác (trong đó có saponin). Giá trị sử dụng Dầu trẩu có những đặc tính quan trọng mà một số dầu khác không có đó là tính chịu nhiệt độ cao, chịu nƣớc và chịu mặn. Chính vì vậy, đây là nguyên liệu quý trong việc chế biến sơn cách nhiệt, sơn trang trí, sơn chống axit, sơn trong môi trƣờng có sức phá hủy mạnh và kể cả sơn dùng trong Quốc phòng. Do những tính chất đặc biệt và công dụng lớn nhƣ đã nêu trên, dầu trẩu là một sản phẩm rất có giá trị. Trong công nghiệp, dầu trẩu đƣợc dùng làm sơn cao cấp, (sơn ô tô, máy bay, tầu thuyền…), sơn cách điện, cách nhiệt, chất dẻo, cao su nhân tạo, xà phòng, da
3
nhân tạo, vải sơn, vải dầu, sơn mỹ thuật, mực in… Khô dầu dùng làm phân bón hoặc làm thức ăn gia súc sau khi đã khử các độc tố. Vỏ quả có thể dùng làm than hoạt tính. Gỗ màu trắng, mềm dễ bị mối mọt, nên có thể dùng làm bột giấy hoặc làm củi đun. Những nghiên cứu gần đây của Đại học Lâm nghiệp cho biết, gỗ trẩu có thể xử lý để sản xuất đồ mộc dạng ván ghép thanh. 1.2. Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) và các nghiên cứu ứng dụng 1.2.1. Giới thiệu về diacylglycerol acyltransferase Theo số liệu của Bộ Nông nghiệp Mỹ, sản lƣợng nhiên liệu sinh học toàn cầu đã tăng gấp ba lần từ 4,8 tỷ ga lông (18,16 tỷ lít) năm 2000 lên khoảng 16 tỷ ga lông (60,56 tỷ lít) năm 2007, nhƣng vẫn chỉ chiếm chƣa đến 3% lƣợng cung ứng nhiên liệu cho các phƣơng tiện giao thông toàn cầu. Thế hệ nhiên liệu sinh học hiện tại đƣợc chiết xuất từ các loại cây lƣơng thực nhƣ ngô, mía và đậu tƣơng. Mặc dù thân thiện hơn với môi trƣờng nếu so với nhiên liệu hóa thạch, nhiên liệu sinh học hiện nay đang phải đối mặt với một số hậu quả không đƣợc dự tính trƣớc. Các tác động bao gồm giá cả cao hơn trên thị trƣờng lƣơng thực toàn cầu do nhiều diện tích canh tác đƣợc chuyển sang dùng để trồng cây nhiên liệu chứ không phải là để sản xuất lƣơng thực, ngoài ra còn có sự tàn phá rừng ở Braxin và Inđônêxia để lấy đất trồng cây nhiên liệu. Các nhà khoa học đang tìm kiếm các phƣơng pháp nhằm đẩy mạnh sản lƣợng từ số cây trồng nhiên liệu sinh học hiện tại theo cách làm cho sản lƣợng dầu cao hơn. Gen DGAT1 mã hóa cho protein định vị trên màng, có khối lƣợng khoảng 20kDa (Heping Cao.,2011). DGAT mã hóa một enzyme đóng vai trò quan trọng trong sinh tổng hợp triacylglycerol (Cases et al.,1998).
4
DGAT là “một mục tiêu đầy hứa hẹn để làm tăng hàm lƣợng dầu và axit oleic ở các loại cây trồng khác nữa”.
Hình 1: Sơ đồ tổng hợp triacylglycerol
5
Hình 2: Sơ đồ tổng hợp triacylglycerol
1.2.2. Những nghiên cứu ứng dụng về diacylglycerol acyltransferase. Một trong những nghiên cứu đang đƣợc chú ý đó là Các nhà khoa học nông nghiệp tại Mỹ đã xác định đƣợc một gen then chốt quyết định hàm lƣợng dầu trong ngô, đây là một phát hiện có thể gây tác động lớn đến ngành công nghiệp nhiên liệu sinh học đang phát triển nhanh. Gen này nằm ở Nhiễm sắc thể 6 trong bộ gen của cây ngô, theo công trình nghiên cứu đƣợc đăng trên Tạp chí Nature Genetics. Nó mã hóa một enzym xúc tác mang tên DGAT1-2, là nơi thực hiện bƣớc cuối
6
cùng trong quy trình tạo ra dầu trong cây trồng (Heping Cao.,2011). Ngoài ra, một biến thể axit amin nhỏ nằm trong gen này có thể làm tăng sản lƣợng dầu và axit oleic, một loại chất béo có lợi đƣợc ƣa chuộng, tƣơng ứng là 41% và 107%. Tại Viện nghiên cứu bệnh tim mạch Gladstone, Mỹ, các nhà khoa học vừa phát hiện ra một loại enzym có liên quan đến quá trình tổng hợp chất béo trong cơ thể, đồng thời chính là yếu tố giúp kích thích sự phát triển khỏe mạnh của da và tóc ở con ngƣời. Enzym có tên gọi diacylglycerol acyltransferase 1 (DGAT1). Ở những con chuột thí nghiệm bị thiếu loại enzym này, chúng có đặc điểm bên ngoài khá kỳ lạ, chẳng hạn nhƣ: không có lông, không bao giờ bị mắc chứng béo phì và tỏ ra khá nhạy cảm với insulin và leptin. Nghiên cứu kỹ, các nhà khoa học cho biết: việc thiếu DGAT1 chính là nguyên nhân khiến cho nồng độ acid retinoic (RA) tăng nhanh đáng kể trên da. Kết quả là những con chuột bị mất hết lông. Hiện tƣợng này xảy ra tƣơng tự ở con ngƣời. Khi thiếu DGAT1, khả năng tổng hợp chất béo ở con ngƣời bị giảm đi, thay vào đó, nó khiến cho da rất dễ nhạy cảm đối với tetinol và da dễ bị nổi mụn, có thể dẫn tới ung thƣ da... đồng thời khiến cho tóc bị rụng.
7
PHẦN II. MỤC TIÊU, NỘI DUNG, PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1. Mục tiêu Phân lập gen diacylglycerol acyltransferase (DGAT) ở loài cây cây Trẩu nhăn (Vernicia montana). 2.2. Nội dung nghiên cứu - Thu thập, tìm thông tin về gen DGAT. - Thiết kế cặp mồi đặc hiệu để khuyếch đại gen DGAT. - Phân lập gen DGAT. - Xác định trình tự nucleotide của gen DGAT. 2.3. Đối tƣợng, phƣơng pháp nghiên cứu 2.3.1. Đối tượng nghiên cứu - Gen DGAT1 ở Cây Trẩu núi Luốt 2.3.2. Phương pháp nghiên cứu 2.3.2.1. Đối tượng, phạm vi nghiên cứu - Đối tƣợng nghiên cứu: loài Cây Trẩu - Phạm vi nghiên cứu: Phân lập và xác định trình tự nucleotide của gen DGAT1 của Cây Trẩu. 2.3.2.2. Dụng cụ, hóa chất sử dụng 2.3.2.2.1. Dụng cụ - Các loại pipet - Các loại tipe - Các loại eppendorf 2.3.2.2.2. Hóa chất - Các loại đệm tách A và B
8
Bảng 2.1. Thành phần đệm tách A (100ml)
STT Thành phần 1 2% (w/v) CTAB (hexadecyltrimethylammonium bromide) 2,0g 2 100mM Tris (pH 8,0) (use 1M stock) 10ml 3 20mM EDTA (use 0,5M stock) 1ml 4 1,4M NaCl 8,2g 5 4% (w/v) PVP (polyvinyl pyrrolidone) 4,0g 6 0,1% (w/v) ascorbic acid 0,1g 7 10mM β-mereaptoethanol (BME) (use 14,3M stock) 70μl
Bảng 2.2. Thành phần đệm tách B (100ml)
STT Thành phần 1 100mM Tris HCl (pH 8,0) (use 1M stock) 10ml 2 50mM EDTA (use 0,5M stock) 2,5ml 3 100mM NaCl 0,6g 4 10mM β-mereaptoethanol (BME) (use 14,3M stock) 70μl
- Các hóa chất khác: 20% SDS (sodium dodecyl sulphate) 5M CH3COOK (bảo quản ở -20°C) 3M CH3COONa (pH 5,2) 70% ethanol 100% isopropanol - Bộ hóa chất PCR: 2X PCR Master Mix solution và hóa chất sử dụng trong điện di Redsafe. - Máy PCR, máy điện di, máy ly tâm, bể ủ nhiệt, …và các trang thiết bị khác thuộc bộ môn công nghệ gen và di truyền phân tử thuộc Viện công nghệ sinh học Lâm nghiệp. 9
2.3.3. Cách tiến hành 2.3.3.1. Cách lấy mẫu 2.3.3.2. Tách chiết ADN tổng số 1. Cân 0,2g mẫu lá cho vào cối chày sứ, bổ sung 600µl Đệm tách A, 1800µl EBB và 200µl SDS, nghiền mẫu bằng cối chày sứ để phá vỡ tế bào. 2. Hút 1,5ml mẫu cho vào ống eppendorf 1,5ml sạch. 3. Ủ mẫu ở 65°C trong bể ổn nhiệt, thời gian 10 phút. 4. Ly tâm 12000vòng/ phút trong 10 phút ở 4°C. 5. Hút 1,0ml dung dịch nổi chuyển sang ống eppendorf 1,5ml. 6. Bổ sung 410µl CH3COOK. Trộn đều, đặt ống trong đá 5 phút 7. Ly tâm 12000 vòng/phút trong 15 phút ở 4°C để thu dịch nổi 8. Thu dịch nổi và bổ sung isopropanol lạnh theo tỷ lệ Vmẫu : Visopropanol = 1:1, đảo nhẹ và ủ ở -20°C trong 20 phút. 9. Ly tâm thu tủa 12000 vòng/phút trong 10 phút ở 4°C. Loại bỏ dịch nổi, thu tủa. 10. Rửa tủa bằng 500µl ethanol 70% (cồn 70% để rửa các cặn bẩn kết tủa cùng DNA). 11. Ly tâm 12000 vòng/phút trong 5 phút ở 4°C, loại bỏ dịch nổi rồi làm khô tủa (ít nhất 30 phút). 12. Hòa tan tủa trong 100µl đệm elution 13. Kiểm tra kết quả bằng điện di trên gel agarose 1%. 14.Soi gel trên máy soi gel. 15.Bảo quản mẫu ở -20°C 2.3.3.3. Tiến hành phản ứng PCR - Sử dụng bộ kit 2X PCR Master solution để thực hiện PCR. - Các cặp mồi sử dụng cho các đoạn gen cần nhân:
10
Nhiệt Gen Tên mồi Trình tự mồi độ gắn DGAT1 mồi(°C) VfF1 5’- ATG ACA ATC CCT GAA ACG-3’ 54 VfF2 5’- AGT CCG CTT AGC TCT GAT-3’
VfF3 5’ - CCG AAT TTA TAT GTC TGG CTT - 3’ 54 Cây Trẩu
VfR1 5’ - ATA GAA CTC TCT ATC ACC AAA – 3’ 54
VfR3 5’ - GAA GAT CAT GTT CCC CAC – 3’ 54
- Vị trí các mồi trên gen DGAT1 của cây Trẩu đƣợc minh họa nhƣ sau:
- Bƣớc 1: Chuẩn bị các hóa chất theo thành phần của một phản ứng PCR:
STT Thành phần Thể tích (µl) 1 Nƣớc cất 2 lần khử ion 7,0 2 2X PCR Taq buffer 10,0 Master Mix Mg2+ dNTPs Taq DNA polymerase 3 Mồi xuôi (F – Primer) 1,0 4 Mồi ngƣợc (R – Primer) 1,0 5 DNA khuôn 1,0 6 Tổng thể tích 20
11
- Bƣớc 2: Trộn đều các thành phần trên với nhau sau đó bằng pipet, sau đó làm lắng hỗn hợp đó. - Lập trình trên máy PCR theo chƣơng trình nhƣ sau: 94°C: 2 phút 94°C: 30 giây 54°C: 30 giây 72°C: 1-8 phút 35 chu kỳ 72°C: 5 phút 4°C: ∞ Sau khi thực hiện phản ứng PCR, chạy điện di để kiểm tra, so sánh với thang chuẩn marker 1 kb. Kiểm tra kết quả bằng điện di trên gel agarose 1% - Pha gel agarose 1% Cân 1g agarose cho vào 100ml TAE1X Đun nóng bằng lò vi sóng Bổ sung 5µl Redsafe sau đó lắc đều - Điện di Tra vào mỗi giếng 5µl sản phẩm PCR Chạy điện di trong dung dịch TAE 1X, 100V trong 30 phút Soi gel bằng tia UV Sản phẩm PCR phải đƣợc tinh sạch 2.2.3.4. Tinh sạch sản phẩm PCR Sản phẩm PCR đƣợc tinh sạch bằng bộ kit PCR purification kit của Norgen. Các bƣớc tinh sạch tiến hành nhƣ sau: - Thêm 5V binding solution vào sản phẩm PCR, mix và ly tâm nhẹ - Lắp cột, chuyển dịch sang cột
12
- Ly tâm 8000vòng/phút trong 1 phút - Thêm 500µl wash solution A. Ly tâm 10000 vòng/phút trong 1 phút - Loại bỏ dịch, lắp lại cột - Ly tâm 14000 vòng/phút trong 2 phút để làm khô - Lắp cột vào ống eppendorf - Bổ sung 50µl elution buffer - Ủ 1 phút ở nhiệt độ phòng - Ly tâm 14000 vòng/phút trong 2 phút - Sản phẩm PCR sau khi tinh sạch đƣợc đƣa đi giải trình tự 2.2.3.5. Phương pháp xác định trình tự DNA Sau khi tinh sạch sản phẩm PCR đƣợc gửi cho phòng thí nghiệm 1st Base ở Malaysia để giải trình tự. Trình tự nucleotide của đoạn ADN đƣợc xác định tại bằng máy giải trình tự, sử dụng bộ Kit BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing. Trình tự nucleotide của đoạn ADN đƣợc xử lý, phân tích bằng các phần mềm chuyên dụng nhƣ DNAClub, Biohit, Mega6.
13
PHẦN III. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1. Kết quả tách chiết ADN tổng số Các mẫu sau khi thu thập đƣợc tiến hành tách chiết ADN tổng số. Chúng tôi đã tách chiết thành công ADN tổng số của mẫu Trẩu. Kết quả tách chiết đƣợc điện di trên gel agarose 1% đƣợc thể hiện trên hình 3.1.
Hình 3.1. ADN tổng số của Trẩu V.montana: Trẩu Trên ảnh điện di, các mẫu ADN ở loài Trẩu sau khi tách chiết có băng sáng rõ, ADN thu đƣợc ít bị đứt gãy. Sản phẩm này đủ để tiến hành các thí nghiệm tiếp theo. 3.2. Kết quả nhân bản gen DGAT1 ở cây Trẩu nhăn nghiên cứu bằng kỹ thuật PCR ADN tổng số sau khi tách chiết đƣợc sử dụng làm khuôn để nhân gen DGAT1 bằng kỹ thuật PCR. Chúng tôi đã nhân thành công gen DGAT1 ở cây Trẩu. Kết quả của sản phẩm PCR đƣợc điện di trên gel agarose 1% đƣợc thể hiện trên hình 3.2.
14
Hình 3.2. Kết quả PCR của gen và một đoạn gen DGAT1 ở cây Trẩu M: Marker VfF1R3: Trẩu với mồi VfF1+mồi VfR3 VfF1R1: Trẩu với mồi VfF1+VfR1 Do kích thƣớc của gen DGAT1 khá lớn, ƣớc tính khoảng 8kb, do vậy chúng tôi đã thiết kế các cặp mồi để nhân thành từng đoạn gen khác nhau. Kết quả của sản phẩm PCR đƣợc điện di trên gel agarose 1% đƣợc thể hiện trên hình 3.3.
15
Hình 3.3. Kết quả PCR của các đoạn gen DGAT1 ở cây Trẩu M: Marker VfF3R1: Trẩu với mồi VfF3+mồi VfR1 VfF3R3: Trẩu với mồi VfF3+VfR3 VfF2R1: Trẩu với mồi VfF2+VfR1 Từ hình 3.2 và hình 3.3 chúng ta có thể thấy kết quả điện di cho các băng rõ nét, đặc hiệu. Đoạn gen nhân đƣợc có kích thƣớc tƣơng ứng với kích thƣớc với mồi thiết kế. Sản phẩm PCR này sẽ đƣợc tinh sạch và gửi đi đọc trình tự. 3.3. Phân tích kết quả trình tự gen DGAT1 của cây Trẩu nhăn (Vernicia Montana) Các sản phẩm PCR của cây Trẩu nhăn Vernicia Montana sau khi đƣợc tinh sạch đã đƣợc gửi đi đọc trình tự. Các trình tự chúng tôi thu đƣợc có kích thƣớc tƣơng ứng với các đoạn mồi mà chúng tôi thiết kế. Các trình tự đó đƣợc xử lý và so sánh trên ngân hàng gen quốc tế (NCBI) với loài Trẩu trơn hay còn gọi là Trẩu lùn Vernicia fordii (DQ356680.1) bằng chƣơng trình blast đƣợc thể hiện nhƣ sau: 2910344_VfF1R1_VfF1: Đoạn trình tự đƣợc nhân bởi cặp mồi VfF1+VfR1, đọc theo chiều forward. 16
Score Expect Identities Gaps Strand
1105 bits(598) 0.0 627/641(98%) 2/641(0%) Plus/Plus
Query 76 GTGCTGAGTCCTCTTCCGATCTTAGCCTTTCGCTTCGACGGAGGAGGACTGCTTCCAACT 135 |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 248 GTGCTGAGTCCTCTTCCGATCTTAACCTTTCTCTTCGACGGAGGAGGACTGCTTCAAACT 307
Query 136 CCGATGGAGCTGTCGCGGAATTGGCTTCCAAGATTGATGAGTTGGAATCTGATGCCGGAG 195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 308 CCGATGGAGCTGTCGCGGAATTGGCTTCCAAGATTGATGAGTTGGAATCTGATGCCGGAG 367
Query 196 GAGGCCAGGTGATTAAGGATCCGGGAGCAGTAATGGATTCGGGGACTTTGAAAAGTAATG 255 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 368 GAGGCCAGGTGATTAAGGATCCGGGAGCAGAAATGGATTCGGGGACTTTGAAAAGTAATG 427
Query 256 GAAAAGATTGCGGAACCAATAAGGATAGGATTGAAAATCGTGAGAATCGTGGAGGATCGG 315 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 428 GAAAAGATTGCGGAACCGTTAAGGATAGGATTGAAAATCGTGAGAATCGTGGAGGATCGG 487
Query 316 ATGTTAAATTCACGTATCGGCCGTCGGTGCCGGCTCACCGGGCGCTCAAGGAGAGTCCGC 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 488 ATGTTAAATTCACGTATCGGCCGTCGGTGCCGGCTCACCGGGCGCTCAAGGAGAGTCCGC 547
Query 376 TTAGCTCTGATAATATATTTAAAC-AAGTACGGATTTTTTAAAATAACTTTAATCGCTTC 434 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 548 TTAGCTCTGATAATATATTTAAACAAAGTATGGATTTTTTAAAATAACTTTAATCGCTTC 607
Query 435 TTATTATTAGCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGATGCATGGCAATGGGTAG 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 608 TTATTATTAGCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGATGCATGGCAATGGGTAG 667
Query 495 GTAAAAGTTCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGATTTCTTTGTTAGCTATAAATGAAAtt 554 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 668 GTAAAAGTTCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGATTTCTTTGTTATCTATAAATGAAATT 727
Query 555 tgtttaatcttttgacttttctttgttttacttttaacggaagtttatttgcatttgttt 614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 728 TGTTTAATCTTTTGACTTTTCTTTGTTTTACTTTTAACGGAAGTTTATTTGCATTTGTTT 787
17
Query 615 agattttatttttgTCTAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGAAGTTATGGTTTTGGGAC 674 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 788 AGATTTTATTTTTGTATAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGAAGTTATGGTTTTGGGAC 847
Query 675 CATTTTATTGATTTTAACCTGTTTTGGGAATCCTTAAATGA 715 ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| Sbjct 848 CATTTTATTGATTTTAAGCTGGTTTGCGAATC-TTAAATGA 887
2910346_VfF2R1_VfF2: Đoạn trình tự đƣợc nhân bởi cặp mồi VfF2+VfR1, đọc theo chiều forward.
Score Expect Identities Gaps Strand
1045 bits(1158) 0.0 822/964(85%) 21/964(2%) Plus/Plus
Query 21 TATCTTTAATCGCTTCTTATTATTAAGCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGA 80 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 592 TAACTTTAATCGCTTCTTATTATTA-GCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGA 650
Query 81 TGCATGGCAATGGGTAGGTAAAAGTTCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGATTTCTTTGT 140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 651 TGCATGGCAATGGGTAGGTAAAAGTTCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGATTTCTTTGT 710
Query 141 TAGCTATAAATGAAAtttgtttaatcttttgacttttctttgttttacttttaacggaag 200 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 711 TATCTATAAATGAAATTTGTTTAATCTTTTGACTTTTCTTTGTTTTACTTTTAACGGAAG 770
Query 201 tttatttgcatttgtttagattttatttttgTCTAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGA 260 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 771 TTTATTTGCATTTGTTTAGATTTTATTTTTGTATAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGA 830
Query 261 AGTTATGGTTTTGGGACCATTTTATTGATTTTAAGCTGTTTTGGGAATCTTAAATGATAA 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 831 AGTTATGGTTTTGGGACCATTTTATTGATTTTAAGCTGGTTTGCGAATCTTAAATGATAA 890
Query 321 CTTGAATTAAGATGGATGCATAATTCTTAATTAATTAGTATTTACATTTTATGTCAGAGT 380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 891 CTTGAATTAAGATGGATGCATAATTCTTAATTAATTAGTATTTACATTTTATGTCAGAGT 950
Query 381 CATGCAGGTCTCTTCAATCTCTGTATAGTAGTGCTTGTAGCGGTTAACAGTCGGCTTATC 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 951 CATGCAGGTCTCTTCAATCTCTGTATAGTAGTGCTTGTAGCGGTTAACAGTCGGCTTATC 1010
Query 441 ATTGAAAATATAATGAAGGTTTGTCTTTTCCATTTGCACTTTACACTTCATAGCAATACG 500 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1011 ATTGAAAACATAATGAAGGTTTGTCTTTTCCATTTGCACTTTACACTTCATAGCAGTATA 1070
Query 501 GTTGAATGGTGGTTGGTAC-ttttttttttttttttttGGTGGGGTCAGGaaaaaaaagg 559 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| | Sbjct 1071 GTTGAATGGTGGTTGGTACACTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTGGGTCAAGGAAACAAATG 1130
Query 560 cttaaaatttagggaaaaaaaggtttttgcaaaagggtgggtaaataaaaaCGGGGTTTG 619 |||| |||||| || | ||| | ||||||| | ||| ||| ||| || || |||||| Sbjct 1131 CTTACAATTTATGGTATGAAATGGTTTTGCAGTATGGTTGGTTAATTAAGACTGGGTTTT 1190
Query 620 GGTTTATTTCAAAATCGTTAAAAAACGGGCCCCTTTTAAggggggggAAAAAATACCTTT 679 |||||| ||||| |||||| | | || |||| ||| | | | | || || | ||||||| Sbjct 1191 GGTTTAGTTCAAGATCGTTGAGAGACTGGCCACTTCTTATGTGCTGGTAACATTACCTTT 1250
Query 680 GGAGttttttttCTATTCAAAGGGaaaaaaataaaaaaaaattttatttttccaaaggcg 739
18
| || ||| |||||||||| || ||| ||||| || || ||||||| | || | || Sbjct 1251 GCAGCTTTCATTCTATTCAATATGATAAAGATAAATAACAAGTTTATTTATGCATATGCT 1310
Query 740 gtttgaaatttttggggtcaaaataaatttttgatagaaaaaaGGCATAGCTTTTGGGGT 799 ||||| | |||||||| || ||| ||||||||| | | | | || || |||| || Sbjct 1311 GTTTG-AGTTTTTGGGTTC-CAATTAATTTTTGACATGAGACATGCTATGCGTTTGTGGC 1368
Query 800 TTCTGTTGAAGTTTTAcccccccAAAATTTTCCTTTGGGGGCCAATACAAATaaaaaaaa 859 |||| ||| || |||||| ||||| ||||| || | | ||| || | | | | || Sbjct 1369 TTCTATTGCTGTCTTACCCTCCCAATATTTT-CTCTTGCTGCCTAT-CTAGT-TGAGAAG 1425
Query 860 TTGGCCCTGGAAGAAAAATATAATTCTGGCCCCCCAAAAATGTTTCCTTACCCAAACAAT 919 |||| |||| ||| ||||| |||| | ||| || || ||||||| || ||| || Sbjct 1426 TTGG-CCTGTCGGAAGTATATA--TCTG--CACCCGTAAGTG-TTCCTTATCC-AACTAT 1478
Query 920 TTTGGAAAATTTTCAAAAAGAAGAAGTGGGTTATATAAAAGAATCTTTTACaaaaaaaaa 979 |||| | |||| || || || ||| | || |||||||| |||| |||||||| Sbjct 1479 TTTGTGTA--TTTCTAACAGTAG-GCTGGCT--TACTAAAGAATC--TTACGAAAAAAAA 1531
Query 980 aaaa 983 | || Sbjct 1532 ATAA 1535
2910350_VfF2R1_VfR1: Đoạn trình tự đƣợc nhân bởi cặp mồi VfF2+VfR1, đọc theo chiều Reverse.
Score Expect Identities Gaps Strand
1597 bits(1770) 0.0 1045/1136(92%) 24/1136(2%) Plus/Minus
Query 24 TGCATTTCCATATGCAACAATAATGCACCTCAAATATTGTGCCTTGGTTGAAAGAATCAA 83 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct 4106 TGCATTTCCATATGCAACAATAATGCACCTCAAATACTGTGTCTTGGTTGAAAGAATCAA 4047
Query 84 AGCTTGTATAAGAGATGAACCTAATCCTATAGTTCCTCTCTCTCTTCCTATATAAACAGC 143 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4046 AGCTTGTATAAGAGATGAACCTAATCCTATAGTTCCTCTCTCTCTTCCTAGATAAACAGT 3987
Query 144 GAATTTACACCAAATTCTACAAAGATCCCAAAATAGCATAGTTCTAATGAATTTCCCACA 203 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3986 GAATTTACACCAAATTCTACAAAGATCCCAAAATAGCGTAGTTCTAATGAATTTCCCACA 3927
Query 204 ACGGCACAACCAGAGAGGTTCACAGTTCACACACAATTCAAATTGAGTTGTTGGGTAGAA 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3926 ACGGCACAACCAGAGAGGTTCACAGTTCACACACAATTCAAATTGAGTTGTTGGTTAGAA 3867
Query 264 AAAATTTACAAGCAAATTCATTTTGGGTTAATGGTCAATTAAGTACATTATTCAATGAAG 323 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3866 AAAATTTACTAGCAAATTCATTTTGGGTTAATGGTCAATTAAGTACATTATTCAATGAAG 3807
Query 324 GATTTGCAAAACTTATTACATCAATCGATCATTATAGCCAAAACGCATAAAACTAAAAAA 383 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3806 GATTTGCAAAACTTATTACATCAATCGATCATCATAACCAAAACGCATAAAACTAAAAAA 3747
Query 384 TCAGCCAAATATATGGCACTGAGTGATCTAAGCAAGTTACCAGAATAACTAACTGCACAT 443 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3746 TCAGCCTAATATATGGCACTGAGTGATCTAAGCAAGTTACCGGAATAACTAACTGCACAT 3687
Query 444 AAAATGTA-GAGGTGaa-aaaaaTACAACTACAATAGTCCACTATCACCTCTGCGACATA 501 |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 3686 AAAATGTATGAGGTAAACAAAAATACAACTACTATAGTCCACTATCACCTC------A 3635
Query 502 CAACAACTATTAGTCTACTATTTATCTCTGCAACATCAGAAGAAAAATACAACTTTCATG 561 |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
19
Sbjct 3634 CAACAACT-TTAGTCTACTATTTACCTCTGCAACATCAGAAGAAAAATACAACTTTCATG 3576
Query 562 GCAATCATTGAAAACATTTAAAAGATGGTGAAATGTACTTCATGAGATTTAGGAAGAG-- 619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3575 GCAATCATTGAAAACATTTAAAAGATGGTGAAATGTACTTCATGAGATTTAGAAAGAGAA 3516
Query 620 aaaaaaaTAATGAACTCACCATAGGTGAAAAAAGCAGTAGAACATGCAAAGCCAGACATA 679 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3515 AAAAAAAAAATGAACTCACCATAGGTGAAAAAAGCAGTAGAACATGCAAAGCCAGACATA 3456
Query 680 TAAATTCGGAACTGAGAGCTTCAAAACCCTCTCAATGGCATATAAGAGATCCCCTTTTAA 739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3455 TAAATTCGGAACTGAGAGCTTCAAAACCCTCTCAATGGCATATAAGAGATCCCCTTTTAA 3396
Query 740 AGGATGTTGTGAATTCTGAACAATAGGATTGATATACTGCAGATGAAGCCCACAACCATG 799 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3395 AGGATGTTGTGAATTCTGAACGATAGGATTGATATACTGCAGATGAAGCCCACAACCAAG 3336
Query 800 TCAAAAATGCATGAGCCAATTTCCCAAAACAGCAAAAAGAAAAGGGAAAGCTAGTTTTGA 859 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 3335 TCAAAAATGCATGAGCCAATTTCCCAAAACAGCAAAAAGAAGATGGAAAGCTAGTTTTGA 3276
Query 860 ACATAAATTTCCCTTACTTGTTCTATGATAAATCCCAGGAATCCTGAAAATA-TATTAAC 918 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| Sbjct 3275 ACATAGATTTCTCTTACTTGTTCTATGATAAATCCCATGAATCCTGTAAATATTATTAAC 3216
Query 919 TTGACAAATTGACGAACCACCCCACCCCTTTCCAATGGATGCAGTTCGAGGAAAACTTGG 978 || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3215 TTAACAAATTGACGAACCA-CCCAACCCTTTCGAATGGATGCAGTTCGAGGATAACTTGG 3157
Query 979 CTTACATGGTCCaaaaaaaaaaaTTAAAGGCCCTTGACAATTTCAAGAAAACCAAAAGCC 1038 | |||| | |||| || | ||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||| C- Sbjct 3156 TACAATGATCAAAGAAGAGAATTAGAGGCCCTTGACAAAGTTAAGATAACC-AAAGCA 3099
Query 1039 TTTCTAAGTTTTGGGGAACACCCAAAAATTTCCATGGGACTCCCTTaaaaaaaccccctc 1098 ||| | | || ||||||| ||||| ||| | | |||| ||| | || ||| ||| Sbjct 3098 CTTC-ATATGTTAGGGAACAAACAAAACATTCTA-GTGACTACCT--ATAAGACCACCT- 3044
Query 1099 ccccaccccctatttttaaattacaaaaaaagggctggcccaaaaaattaaaaaaa 1154 |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||| || |||| || | ||||| Sbjct 3043 -CCCAACCCCTATCTTCAAATTAC-TGAAAAGGTCTGTCCTAAAATATCACAAAAA 2990
2910345_VfF3R3_VfF3: Đoạn trình tự đƣợc nhân bởi cặp mồi VfF3+VfR3, đọc theo chiều forward.
Score Expect Identities Gaps Strand
1380 bits(1530) 0.0 899/972(92%) 32/972(3%) Plus/Plus
Query 131 AGATAAATAGTAGACTAATAGTTGTTGTATGTCGCAGAGGTGATAGTGGACTATTGTAGT 190 || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3609 AGGTAAATAGTAGACTAA-AGTTGTTGT------GAGGTGATAGTGGACTATAGTAGT 3659
Query 191 TGTAttttt-ttCACCTC-TACATTTTATGTGCAGTTAGTTATTCTGGTAACTTGCTTAG 248 ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3660 TGTATTTTTGTTTACCTCATACATTTTATGTGCAGTTAGTTATTCCGGTAACTTGCTTAG 3719
Query 249 ATCACTCAGTGCCATATATTTGGCTGATTTTTTAGTTTTATGCGTTTTGGCTATAATGAT 308 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct 3720 ATCACTCAGTGCCATATATTAGGCTGATTTTTTAGTTTTATGCGTTTTGGTTATGATGAT 3779
Query 309 CGATTGATGTAATAAGTTTTGCAAATCCTTCATTGAATAATGTACTTAATTGACCATTAA 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3780 CGATTGATGTAATAAGTTTTGCAAATCCTTCATTGAATAATGTACTTAATTGACCATTAA 3839
20
Query 369 CCCAAAATGAATTTGCTTGTAAATTTTTTCTACCCAACAACTCAATTTGAATTGTGTGTG 428 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3840 CCCAAAATGAATTTGCTAGTAAATTTTTTCTAACCAACAACTCAATTTGAATTGTGTGTG 3899
Query 429 AACTGTGAACCTCTCTGGTTGTGCCGTTGTGGGAAATTCATTAGAACTATGCTATTTTGG 488 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3900 AACTGTGAACCTCTCTGGTTGTGCCGTTGTGGGAAATTCATTAGAACTACGCTATTTTGG 3959
Query 489 GATCTTTGTAGAATTTGGTGTAAATTCGCTGTTTATATAGGAAGAGAGAGAGGAACTATA 548 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3960 GATCTTTGTAGAATTTGGTGTAAATTCACTGTTTATCTAGGAAGAGAGAGAGGAACTATA 4019
Query 549 GGATTAGGTTCATCTCTTATACAAGCTTTGATTCTTTCAACCAAGGCACAATATTTGAGG 608 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 4020 GGATTAGGTTCATCTCTTATACAAGCTTTGATTCTTTCAACCAAGACACAGTATTTGAGG 4079
Query 609 TGCATTATTGTTGCATATGGAAATGCAGGTTAAATATACTTGCTGAGCTCCCTCGCTTTG 668 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4080 TGCATTATTGTTGCATATGGAAATGCAGGTTAAATATACTTGCTGAGCTCCTTCGCTTTG 4139
Query 669 GTGATAGAGAGTTCTATATAGATTGGTGGAATGCAAGGACAGTTGAGGAGGTAAAAGTTT 728 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4140 GTGATAGAGAGTTCTATAAAGATTGGTGGAATGCAAGGACAGTTGAGGAGGTAAAAGTTT 4199
Query 729 ATAATTTGGGTAGTGTTTTCCTTTGGGCATATCTTTCAACAATCCTTTGCTTATCTCAAA 788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4200 ATAATTTGGGTAGTGTTTTCCTTTGGGCATATCTTTCAACAATCCTTTGCTTATCTCAAA 4259
Query 789 TGTAAATGTTGGCATGCACCTTTGTGGA------TTCATCAGTATTGGAGAATGTGG 839 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4260 TGTAAATGTTGGCATGCACCTTTGTGGATTTGTGGCTTTCATCAGTATTGGAGAATGTGG 4319
Query 840 AATATGGTATGTTTCCTTACCTAAAAATAATGCATTTTATTAGTCTTTGCTTCTATGTAG 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4320 AATATGGTATGTTTCCTTACCTAAAAATAATGCATTTTATTAGTCTTTGC-TCTATGTAG 4378
Query 900 ATGATTGTTGTATTCATATCTTTGGCTCTTTTTACTTATTTAATATTTTGGGATGCTGAT 959 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| ||||| | Sbjct 4379 ATGATAGTTGTATTCATATCTTTGGCTCTTTTACTTTATTTTATTTTTGGGGTTGCTG-T 4437
Query 960 TGATAATATATGTAGCTTGAATATACCGCA-TTTATCACTGGCATATTCCGAAATTAAAT 1018 || |||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||| Sbjct 4438 TG-TAATATATGTAGCTTG-ATACATCGCATTTTTTCACTGGCATATTCAGATATTAAAA 4495
Query 1019 TCTGGTTGGAG-TCTAC-ACATGGCTGGTTTT--GAACCTCTAAGTTTGATCCAGCCTAA 1074 ||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||| |||| || ||| |||| |||||| | Sbjct 4496 TCTTGTTTGAGATATACTACATGCTTGGTTTTTGGAACTGCT-AGTATGAT-CAGCCT-A 4552
Query 1075 TTGAATCTGGTT 1086 | ||| ||||| Sbjct 4553 TGAAATTTGGTT 4564
2910348_VfF1R1_VfR1: Đoạn trình tự đƣợc nhân bởi cặp mồi VfF1+VfR1, đọc theo chiều Reverse.
Score Expect Identities Gaps Strand
1443 bits(1600) 0.0 919/980(94%) 25/980(2%) Plus/Minus
Query 82 CTTGTATAAGAGAGGAAAGGTGTCCTATAGGTCCTCTCTCTCTTCCTATATAAACAGCGA 141 ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 4044 CTTGTATAAGAGATGAACCTAATCCTATAGTTCCTCTCTCTCTTCCTAGATAAACAGTGA 3985
21
Query 142 ATTTACACCAAATTCTACAAAGATCCCAAAATAGCATAGTTCTAATGAATTTCCCACAAC 201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3984 ATTTACACCAAATTCTACAAAGATCCCAAAATAGCGTAGTTCTAATGAATTTCCCACAAC 3925
Query 202 GGCACAACCAGAGAGGTTCACAGTTCACACACAATTCAAATTGAGTTGTTGGGTAGAAAA 261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3924 GGCACAACCAGAGAGGTTCACAGTTCACACACAATTCAAATTGAGTTGTTGGTTAGAAAA 3865
Query 262 AATTTACAAGCAAATTCATTTTGGGTTAATGGTCAATTAAGTACATTATTCAATGAAGGA 321 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3864 AATTTACTAGCAAATTCATTTTGGGTTAATGGTCAATTAAGTACATTATTCAATGAAGGA 3805
Query 322 TTTGCAAAACTTATTACATCAATCGATCATTATAGCCAAAACGCATAAAACTAAAAAATC 381 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3804 TTTGCAAAACTTATTACATCAATCGATCATCATAACCAAAACGCATAAAACTAAAAAATC 3745
Query 382 AGCCAAATATATGGCACTGAGTGATCTAAGCAAGTTACCAGAATAACTAACTGCACATAA 441 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3744 AGCCTAATATATGGCACTGAGTGATCTAAGCAAGTTACCGGAATAACTAACTGCACATAA 3685
Query 442 AATGTA-GAGGTGaa-aaaaaTACAACTACAATAGTCCACTATCACCTCTGCGACATACA 499 |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| Sbjct 3684 AATGTATGAGGTAAACAAAAATACAACTACTATAGTCCACTATCACCTC------ACA 3633
Query 500 ACAACTATTAGTCTACTATTTATCTCTGCAACATCAGAAGAAAAATACAACTTTCATGGC 559 |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3632 ACAACT-TTAGTCTACTATTTACCTCTGCAACATCAGAAGAAAAATACAACTTTCATGGC 3574
Query 560 AATCATTGAAAACATTTAAAAGATGGTGAAATGTACTTCATGAGATTTAGGAAGAG--aa 617 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 3573 AATCATTGAAAACATTTAAAAGATGGTGAAATGTACTTCATGAGATTTAGAAAGAGAAAA 3514
Query 618 aaaaaTAATGAACTCACCATAGGTGAAAAAAGCAGTAGAACATGCAAAGCCAGACATATA 677 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3513 AAAAAAAATGAACTCACCATAGGTGAAAAAAGCAGTAGAACATGCAAAGCCAGACATATA 3454
Query 678 AATTCGGAACTGAGAGCTTCAAAACCCTCTCAATGGCATATAAGAGATCCCCTTTTAAAG 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3453 AATTCGGAACTGAGAGCTTCAAAACCCTCTCAATGGCATATAAGAGATCCCCTTTTAAAG 3394
Query 738 GATGTTGTGAATTCTGAACAATAGGATTGATATACTGCAGATGAAGCCCACAACCATGTC 797 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3393 GATGTTGTGAATTCTGAACGATAGGATTGATATACTGCAGATGAAGCCCACAACCAAGTC 3334
Query 798 AAAAATGCATGAGCCAATTTCCC-AAACAGCAAAAAGAAGATGGGAAAGCTAGTTTTGAA 856 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3333 AAAAATGCATGAGCCAATTTCCCAAAACAGCAAAAAGAAGAT-GGAAAGCTAGTTTTGAA 3275
Query 857 CATAGATTTCTCTTACTTG-TCTATGATAAATCCCATGAATCCTGT-AATATTATT-ACT 913 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 3274 CATAGATTTCTCTTACTTGTTCTATGATAAATCCCATGAATCCTGTAAATATTATTAACT 3215
Query 914 TGACAAATTGACGAACCACCC-ACCTTTTCGA--TGATGCAG-TCGAAGATTACTTGGCT 969 | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| Sbjct 3214 TAACAAATTGACGAACCACCCAACCCTTTCGAATGGATGCAGTTCGAGGATAACTTGGCT 3155
Query 970 AC-ATGATC-AAGAAGAGAATTAGAGGCCTTTGACAAGTTCAAGAT-ATCTAAGCACTTC 1026 || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | | ||||||||| Sbjct 3154 ACAATGATCAAAGAAGAGAATTAGAGGCCCTTGACAAAGTTAAGATAACCAAAGCACTTC 3095
Query 1027 ATATGTTAGGGAACCACCAA 1046 |||||||||||||| | ||| Sbjct 3094 ATATGTTAGGGAACAAACAA 3075
22
2910349_VfF3R3_VfR3: Đoạn trình tự đƣợc nhân bởi cặp mồi VfF3+VfR3, đọc theo chiều Reverse.
Score Expect Identities Gaps Strand
1139 bits(1262) 0.0 820/917(89%) 34/917(3%) Plus/Minus
Query 133 CACAAGTTaaaaaaaGGGGACACAGCATGGGAACTGAGTAACCTAAGCCGAAAAGGTGGA 192 |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 7798 CACAAGTTAAAAAA-GGGGACAGAGCATGGGAACTGAATAACCTAAGCCGAAAAGGTGGA 7740
Query 193 CATAGATAGTGACTAAGCCAAATCCCCAGAGTGAGGACAGCGAACTATACACTTCAAATA 252 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 7739 CATAGATAGTGACTAAGCCGAATTCCCAGAGTGAAGACAGTGAACTATACACTTTAAATA 7680
Query 253 TGTTATAAGCCTGGGTTTGAGCTCCATGCCTTTGCCTTTGTGTGCAAAGGCTTTCTTAGC 312 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 7679 TGTTATAAGCCTGGGTTTGAGCCCCATGCCTTTGCCTTTGTGTGCAAAGGCTTTCTTGGC 7620
Query 313 TAACTGTTGAGAAAACCACCTTGATAAGTATTAATGCTCAGTTAGCAGCGACTTTGTTCT 372 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 7619 TAACTGTTGAGAAAACCACCTTGATAAGTGTTAATGCTCAGTTAGCAGCGACTTTGCTCT 7560
Query 373 TCTATGACATTTCACTATGGTTCATTTTTGTCTCAGAAGTATGATGCTtaaaagataaat 432 ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 7559 TCTATGATATTTCACTATGGTTCACTTTTGTCTCAGAAGAATGATGCTTAAAAGACAAAT 7500
Query 433 aagctaaaataatttgggaaataagatgtgaattgtgaaaaaataaaaaCTTACCATTGA 492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7499 AAGCTAAAATAATTTGGGAAATAAGATGTGAATTGTGAAAAAATAAAAACTTACCATTGA 7440
Query 493 GCTTCTGAATTTGTTTTGAAGGTAATTTGTGATCCCGACCAAAGGAATCTGATTCAAACA 552 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7439 GCTTCTGAACTTGTTTTGAAGGTAATTTGTGATCCCGACCAAAGGAATCTGATTCAAACA 7380
Query 553 GGGAAAGCAGCAAATTTCATTGACATCATGTCCTGCATAACTTCAATCCACTCTAGAGCA 612 | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 7379 GCGAAAGCAGCAAATTTCAGTGACATCATGTCCTGTATAACTTCAAT-CACTCTAGAGC- 7322
Query 613 AAACATTTTTTCCCCTAAATCTATCAGGAGGCTCAGTGGACATGGTCCCA--GGGCCTAC 670 ||||| ||| | || | |||||||||| |||||| |||||||| | | ||| Sbjct 7321 AAACA------CCCGACAT-GAACAGGAGGCTCGGTGGACCTGGTCCCAATAGCCTTAC 7270
Query 671 ATAATAGAAGGTAGTCCCTCCACACCCACTCCACCCCACCCCAGTGGGACTTGAACCTGG 730 |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 7269 ATAATAGAAGGTAGTCCCTCCATACCCACCCTACCCCACCCCAGTGGGACTTGAACTAGG 7210
Query 731 GATCTCCATGCAG-GAACCCAAATTCTAATTAAAATAAACTT-CTT-ATAGATTACCTGA 787 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| Sbjct 7209 GATCTCCATGCAGTGAACCCAAATTCTAATTAAAATAAACTTGCTTCATAGATCACCTGA 7150
Query 788 AACATTATTCCAATAAAAGCCCAGAGCTTGAATATGTGGCAAGGAACAGCAATGCACAAC 847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7149 AACATTATTCCAATAAAAGCCCAGAGCTTGAATATGTGGCAAGGAACAGCAATGCACAAC 7090
Query 848 TGT-AATGCAAGCaaaaaaaaaaaaaCTATATTTAAAT-TCAGGAACCTTAAAAGGGCAT 905 ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||| Sbjct 7089 TGTAAATGCAAGCACAAAATAAAAAACTATAATTAAATATAAGGAA-CTTAAAA-GGCA- 7033
Query 906 TATCCCTC--TGTAATGCATAATCACAGTTAAGGTAACCTCACATGGTGGCATATACGGG 963 |||| ||| || |||| |||| ||| ||||||| ||| ||| ||| ||| | Sbjct 7032 TATCACTCTATGATATGC-TAATACAAGT--AGGTAAC--TACAAGGT-GCA-ATAACAG 6980
23
Query 964 TACGTGCCAAAATTACATTTAGTACAAATTTGTTTAGACCATGAA-ACTGGTAGCTTGGA 1022 || || ||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| | || Sbjct 6979 TAATTG-CAAAAATACATTTTCGACAAAGTTGTCTTGACCATGAAGACTGGAAGCAT-GA 6922
Query 1023 CTGGTCAGG-ATGAATG 1038 ||| |||| |||| || Sbjct 6921 CTGTGCAGGTATGAGTG 6905
Sau đó chúng tôi tiến hành blast cả gen DGAT1 của loài Trẩu nhăn Vernicia Montana mà chúng tôi nghiên cứu với loài Trẩu trơn Vernicia fordii trên ngân hàng gen quốc tế chúng tôi nhận thấy chúng tôi đã phân lập chính xác gen DGAT1 ở cây loài Trẩu nhăn mà chúng tôi cần với trình tự blast nhƣ sau:
Score Expect Identities Gaps Strand
11974 bits(6484) 0.0 7323/7705(95%) 150/7705(1%) Plus/Plus
Query 196 ATGACAATCCCTGAAACGCCGGATAATTCCACGGATGCTACCACCAGTGGCGGTGCTGAG 255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1 ATGACAATCCCTGAAACGCCGGATAATTCCACGGATGCTACCACCAGTGGCGCTGCTGAG 60
Query 256 TCCTCTTCCGATCTTAACCTTTCTCTTCGACGGAGGAGGACTGCTTCAAACTCCGATGGA 315 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 61 TCCTCTTCCGATCTTAGCCTTTCGCTTCGACGGAGGAGGACTGCTTCCAACTCCGATGGA 120
Query 316 GCTGTCGCGGAATTGGCTTCCAAGATTGATGAGTTGGAATCTGATGCCGGAGGAGGCCAG 375 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GCTGTCGCGGAATTGGCTTCCAAGATTGATGAGTTGGAATCTGATGCCGGAGGAGGCCAG 180
Query 376 GTGATTAAGGATCCGGGAGCAGAAATGGATTCGGGGACTTTGAAAAGTAATGGAAAAGAT 435 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GTGATTAAGGATCCGGGAGCAGTAATGGATTCGGGGACTTTGAAAAGTAATGGAAAAGAT 240
Query 436 TGCGGAACCGTTAAGGATAGGATTGAAAATCGTGAGAATCGTGGAGGATCGGATGTTAAA 495 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TGCGGAACCAATAAGGATAGGATTGAAAATCGTGAGAATCGTGGAGGATCGGATGTTAAA 300
Query 496 TTCACGTATCGGCCGTCGGTGCCGGCTCACCGGGCGCTCAAGGAGAGTCCGCTTAGCTCT 555 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTCACGTATCGGCCGTCGGTGCCGGCTCACCGGGCGCTCAAGGAGAGTCCGCTTAGCTCT 360
24
Query 556 GATAATATATTTAAACAAAGTATGGATTTTTTAAAATAACTTTAATCGCTTCTTATTATT 615 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GATAATATATTTAAAC-AAGTACGGATTTTTTAAAATAACTTTAATCGCTTCTTATTATT 419
Query 616 AGCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGATGCATGGCAATGGGTAGGTAAAAGT 675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 AGCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGATGCATGGCAATGGGTAGGTAAAAGT 479
Query 676 TCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGAtttctttgttatctataaatgaaatttgtttaat 735 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 480 TCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGATTTCTTTGTTAGCTATAAATGAAATTTGTTTAAT 539
Query 736 cttttgacttttctttgttttacttttaacggaagtttatttgcatttgtttagatttta 795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CTTTTGACTTTTCTTTGTTTTACTTTTAACGGAAGTTTATTTGCATTTGTTTAGATTTTA 599
Query 796 tttttgTATAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGAAGTTATGGTTTTGGGACCATTTTAT 855 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 TTTTTGTCTAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGAAGTTATGGTTTTGGGACCATTTTAT 659
Query 856 TGATTTTAAGCTGGTTTGCGAATC--T---T-AA-A----TG------ATAACTTGAATT 898 ||||||||| ||| |||| ||||| | | || | || |||||||||||| Sbjct 660 TGATTTTAACCTGTTTTGGGAATCCTTAAATGAACACCTTTGAAAATAATAACTTGAATT 719
Query 899 AAGATGGATGCATAATTCTTAATTAATTAGTATTTACATTTTATGTCAGAGTCATGCAGG 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 AAGATGGATGCATAATTCTTAATTAATTAGTATTTACATTTTATGTCAGAGTCATGCAGG 779
Query 959 TCTCTTCAATCTCTGTATAGTAGTGCTTGTAGCGGTTAACAGTCGGCTTATCATTGAAAA 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TCTCTTCAATCTCTGTATAGTAGTGCTTGTAGCGGTTAACAGTCGGCTTATCATTGAAAA 839
Query 1019 CATAATGAAGGTTTGTCTTTTCCATTTGCACTTTACACTTCATAGCAGTATAGTTGAATG 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 840 TATAATGAAGGTTTGTCTTTTCCATTTGCACTTTACACTTCATAGCAATACGGTTGAATG 899
Query 1079 GTGGTTGGTACACtttttttttttttttttGGTTGGGTCAAGGAAACAAATGCTTACAAT 1138 ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||| ||| Sbjct 900 GTGGTTGGTAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGGGGTCAGGAAAAAAAAGGCTTAAAAT 958
25
Query 1139 TTATGGTATGAAATGG-TTTTGCAGTATGGTTGGTTAATTAAGACTGGGTTTTGGTTTAG 1197 ||| || | ||| || ||||||| | ||| ||| ||| || || |||||| |||||| Sbjct 959 TTA-GGGAAAAAAAGGTTTTTGCAAAAGGGTGGGTAAATAAAAACGGGGTTTGGGTTTAT 1017
Query 1198 TTCAAGATCGTTGAGAGACTGGCCACTTCTTATGTGCTGGTAACATTACCTTTGCAGCTT 1257 ||||| |||||| | | || |||| ||| | | | | || || | |||||||| || || Sbjct 1018 TTCAAAATCGTTAAAAAACGGGCCCCTTTTAAGGGGGGGGAAAAAATACCTTTGGAGTTT 1077
Query 1258 TCATTCTATTCAATATGATAAAGATAAATAACAAGTTTATTTATGCATATGCTGTTTG-A 1316 | |||||||||| || ||| ||||| || || ||||||| | || | || ||||| | Sbjct 1078 TTTTTCTATTCAAAGGGAAAAAAATAAAAAAAAATTTTATTTTTCCAAAGGCGGTTTGAA 1137
Query 1317 GTTTTTGGGTTC-CAATTAATTTTTGACATGAGACATGCTAT-GCGTTTGTGGCTTCTAT 1374 |||||||| || ||| ||||||||| | | | | || || || |||| || |||| | Sbjct 1138 ATTTTTGGGGTCAAAATAAATTTTTGATAGAAAAAAGGC-ATAGCTTTTGGGGTTTCTGT 1196
Query 1375 TGCTGTCTTACCCTCCCAATATTTTCTCTTGCTGCCTATCTAGTTGAGAAGTTGGCCTGT 1434 || || |||||| ||||| | | || | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 TGAAGTTTTACCCCCCCAA-A----AT-TT--T--CTATCTAGTTGAGAAGTTGGCCTGT 1246
Query 1435 CGGAAGTATATATCTGCACCCGTAAGTGTTCCTTATCCAACTATTTTGTGTATTTCTAAC 1494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1247 CGGAAGTATATATCTGCACCCGTAAGTGTTCCTTATCCAACTATTTTGTGTATTTCTAAC 1306
Query 1495 AGTAGGCTGGCTTACTAAAGAATCTTACGaaaaaaaaaTAATTCCAATAAAGATATTGAA 1554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1307 AGTAGGCTGGCTTACTAAAGAATCTTACGAAAAAAAAATAATTCCAATAAAGATATTGAA 1366
Query 1555 CTGGTTTGAAATTAACTTCTACTTTGATATTGCAGACTGTTGTTTTTCTTCATATTCTTT 1614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1367 CTGGTTTGAAATTAACTTCTACTTTGATATTGCAGACTGTTGTTTTTCTTCATATTCTTT 1426
Query 1615 TCTCCTCAACAGCAGTTTTATACCCTGTTTCTGTGATTCTCAGGttttttactttgcttt 1674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1427 TCTCCTCAACAGCAGTTTTATACCCTGTTTCTGTGATTCTCAGGTTTTTTACTTTGCTTT 1486
Query 1675 gcatttttttttatttttACTGCAAAATTTAGCCACATATAGCTGTCTGTTTAAAACACT 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1487 GCATTTTTTTTTATTTTTACTGCAAAATTTAGCCACATATAGCTGTCTGTTTAAAACACT 1546
26
Query 1735 TCAAAATACTGTTGGCATATCTATTTCCTCTTGATTAAATTTCTTTATTCTATGaaaaaa 1794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1547 TCAAAATACTGTTGGCATATCTATTTCCTCTTGATTAAATTTCTTTATTCTATGAAAAAA 1606
Query 1795 aaaaTATTGAACAGTTGCATTCCACTTCAAAATCACTTAAAGAATGTGTGAAGTATGAGA 1854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1607 AAAATATTGAACAGTTGCATTCCACTTCAAAATCACTTAAAGAATGTGTGAAGTATGAGA 1666
Query 1855 AATTTGTGTTGAAAGCAAACATTGTTTATAAACACACATTTGGGTCCTGGAATGATTTTT 1914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1667 AATTTGTGTTGAAAGCAAACATTGTTTATAAACACACATTTGGGTCCTGGAATGATTTTT 1726
Query 1915 TAATAGGGAATTGAACATCTTGTAAATATTATGGTCAGTAGCCAGAGTGGCCTGCATTCC 1974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1727 TAATAGGGAATTGAACATCTTGTAAATATTATGGTCAGTAGCCAGAGTGGCCTGCATTCC 1786
Query 1975 ATAGCTTCTTTTGTGTCCCTCTCTCTGGCATTGCAAATTCTTAAGTTTTGCAAACTTTTC 2034 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1787 ATAGCTTCTTTTGTGTCCCTCTCTCTGGCATTGCAAATTCTTAAGTTTTGCAAACTTTTC 1846
Query 2035 AGTTTGCCTTTCAACATTGGATTTGGCTTCCTTGTCTCCATCTCTCTTCCTCTCTATCTA 2094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1847 AGTTTGCCTTTCAACATTGGATTTGGCTTCCTTGTCTCCATCTCTCTTCCTCTCTATCTA 1906
Query 2095 TATGTAGAACGCCAGGAAGATTATGTGATATTAGGTGTTTTGTCTGTTGCTAAATTCCtt 2154 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1907 TATGTAGAACGCCAGGAAGATTATGTGATATTAGGTGTTTTGTCTGTTGCTAAATTCCTT 1966
Query 2155 ttttttttGAGCATTATGTTAATGGAATATCTTATATTCTGCGGAGTATCATTCTTGTCT 2214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1967 TTTTTTTTGAGCATTATGTTAATGGAATATCTTATATTCTGCGGAGTATCATTCTTGTCT 2026
Query 2215 TAGTAATCAACAAGGGTGTTAAAATGCTTAATCATTCTTCTTACTGATTTTTGCAGTTGT 2274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2027 TAGTAATCAACAAGGGTGTTAAAATGCTTAATCATTCTTCTTACTGATTTTTGCAGTTGT 2086
Query 2275 GAATCTGCTGTTTTGTCCGGTGTCGCATTGATGCTCTTTGCTTGTATCGTGTGGTTGAAA 2334
27
Query 2335 TTGGTATCTTATGCACATACAAACTTTGATATGAGAGCAATTGCTAACTCAGTTGATAAG 2394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2147 TTGGTATCTTATGCACATACAAACTTTGATATGAGAGCAATTGCTAACTCAGTTGATAAG 2206
Query 2395 GTACAAAAGTAATTGTTTTGTGAACTCCATTGATGCTTGAAAATGTTCTTCAGTTTTTCT 2454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2207 GTACAAAAGTAATTGTTTTGTGAACTCCATTGATGCTTGAAAATGTTCTTCAGTTTTTCT 2266
Query 2455 TTACTAGAATTCATATTTTTCCTTGCCCACCCCCACCCAAGGAATAAATTTCTTCAGCCT 2514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2267 TTACTAGAATTCATATTTTTCCTTGCCCACCCCCACCCAAGGAATAAATTTCTTCAGCCT 2326
Query 2515 GGATGGATTTTTCCATCTGCAACAATCTTTATGAACAAAATGGCCATCACTCATTCAATG 2574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2327 GGATGGATTTTTCCATCTGCAACAATCTTTATGAACAAAATGGCCATCACTCATTCAATG 2386
Query 2575 TAGTTCTGCTTGATGGCAGGGAGATGCGCTATCCAATGCTTCGAGTGCAGAGTCCTCTCA 2634 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2387 TAGTTCTGCTTGATGGCAGGGAGATGCGCTATCCAATGCTTCGAGTGCAGAGTCCTCTCA 2446
Query 2635 TGATGTTAGCTTCAAGAGTTTGGTTTATTTCATGGTTGCTCCCACATTGTGTTACCAGGT 2694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2447 TGATGTTAGCTTCAAGAGTTTGGTTTATTTCATGGTTGCTCCCACATTGTGTTACCAGGT 2506
Query 2695 AGCTGATCATATTTCTTCCATCGATAAACGGAGAATTTTTGTATTTGCAGTTATTTAAGA 2754 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2507 AGCTGATCATATTTCTTCCATCGATAAACGGAGAATTTTTGTATTTGCAGTTATTTAAGA 2566
Query 2755 ATATCAATGCTCATTGGTCATCTTGGCATTACTTGCTCATGCTGTTTCTTTTAATTTAAC 2814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2567 ATATCAATGCTCATTGGTCATCTTGGCATTACTTGCTCATGCTGTTTCTTTTAATTTAAC 2626
Query 2815 TATTTTTGTTTGATACTTATATGCATAAGATGATTGGCACAATTATTATTCATTCAAAGC 2874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2627 TATTTTTGTTTGATACTTATATGCATAAGATGATTGGCACAATTATTATTCATTCAAAGC 2686
Query 2875 TAGTATATTTAAAATTATTAATTTGATTTCTAGCTGTACCTCATGTTTTCTAGCTCATCA 2934
28
Query 2935 TTTGACCTTTTACCACATTTTCAACAACTGAGGGGAGGCACATTTTGTCAAGTAA----T 2990 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2747 TTTGACCTTTTACCACATTTTCAACAACTGAGGGGAGGCACATTTTGTCAAGTAACTTTT 2806
Query 2991 TTTTGTGATATTTTAGGACAGACC-TTTTCAGTAATTTGAAGATAGGGG-T-TGGGAGGT 3047 |||| | || |||| || ||| || |||| ||||||| || ||||||| | |||||| Sbjct 2807 TTTTTTAATTTTTTGGGCCAGCCCTTTTTTTGTAATTTAAAAATAGGGGGTGGGGGAGGG 2866
Query 3048 GG-TCTTAT-AGGTAGTCAC-TAGAATGTTTTGTTTGTT-CCC-TAACATATGAAGTGC- 3101 || | || | ||| |||| | | ||| ||||| |||| ||| ||| || ||| || Sbjct 2867 GGTTTTTTTAAGGGAGTCCCATGGAAATTTTTGGGTGTTCCCCAAAACTTAGAAAG-GCT 2925
Query 3102 TTTGGTTATCTTAACTTTGTCAAGGGCCTCTAATTCTCTTCTTTG-ATCATTGT-AGCCA 3159 ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| | || |||| | || ||| ||||| Sbjct 2926 TTTGGTTTTCTTGAAATTGTCAAGGGCCTTTAATTTTTTTTTTTGGACCA-TGTAAGCCA 2984
Query 3160 AGTTATCCTCGAACTGCATCCATTCGAAA-GGGTTGGGTGGTTCGTCAATTTGTTAAGTT 3218 |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2985 AGTTTTCCTCGAACTGCATCCATTGGAAAGGGGTGGGGTGGTTCGTCAATTTGTCAAGTT 3044
Query 3219 AATAATATTTACAGGATTCATGGGATTTATCATAGAACAAGTAAGAGAAATCTATGTTCA 3278 ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 3045 AAT-ATATTTTCAGGATTCCTGGGATTTATCATAGAACAAGTAAGGGAAATTTATGTTCA 3103
Query 3279 AAACTAGCTTTCCATCTTCTTTTTGCTGTTTTGGGAAATTGGCTCATGCATTTTTGACTT 3338 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3104 AAACTAGCTTTCCCTTTTCTTTTTGCTGTTTTGGGAAATTGGCTCATGCATTTTTGACAT 3163
Query 3339 GGTTGTGGGCTTCATCTGCAGTATATCAATCCTATCGTTCAGAATTCACAACATCCTTTA 3398 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3164 GGTTGTGGGCTTCATCTGCAGTATATCAATCCTATTGTTCAGAATTCACAACATCCTTTA 3223
Query 3399 AAAGGGGATCTCTTATATGCCATTGAGAGGGTTTTGAAGCTCTCAGTTCCGAATTTATAT 3458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3224 AAAGGGGATCTCTTATATGCCATTGAGAGGGTTTTGAAGCTCTCAGTTCCGAATTTATAT 3283
Query 3459 GTCTGGCTTTGCATGTTCTACTGCTTTTTTCACCTATGGTGAGTTCAttttttttttttC 3518
29
Query 3519 TCTTTCTAAATCTCATGAAGTACATTTCACCATCTTTTAAATGTTTTCAATGATTGCCAT 3578 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3342 TCTTCCTAAATCTCATGAAGTACATTTCACCATCTTTTAAATGTTTTCAATGATTGCCAT 3401
Query 3579 GAAAGTTGTATTTTTCTTCTGATGTTGCAGAGGTAAATAGTAGACTAA-A---GTTGT-T 3633 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | Sbjct 3402 GAAAGTTGTATTTTTCTTCTGATGTTGCAGAGATAAATAGTAGACTAATAGTTGTTGTAT 3461
Query 3634 GT----GAGGTGATAGTGGACTATAGTAGTTGTATTTTTGTTTACCTCATACATTTTATG 3689 || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| Sbjct 3462 GTCGCAGAGGTGATAGTGGACTATTGTAGTTGTATTTTT-TTCACCTC-TACATTTTATG 3519
Query 3690 TGCAGTTAGTTATTCCGGTAACTTGCTTAGATCACTCAGTGCCATATATTAGGCTGATTT 3749 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3520 TGCAGTTAGTTATTCTGGTAACTTGCTTAGATCACTCAGTGCCATATATTTGGCTGATTT 3579
Query 3750 TTTAGTTTTATGCGTTTTGGTTATGATGATCGATTGATGTAATAAGTTTTGCAAATCCTT 3809 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3580 TTTAGTTTTATGCGTTTTGGCTATAATGATCGATTGATGTAATAAGTTTTGCAAATCCTT 3639
Query 3810 CATTGAATAATGTACTTAATTGACCATTAACCCAAAATGAATTTGCTAGTAAATTTTTTC 3869 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3640 CATTGAATAATGTACTTAATTGACCATTAACCCAAAATGAATTTGCTTGTAAATTTTTTC 3699
Query 3870 TAACCAACAACTCAATTTGAATTGTGTGTGAACTGTGAACCTCTCTGGTTGTGCCGTTGT 3929 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3700 TACCCAACAACTCAATTTGAATTGTGTGTGAACTGTGAACCTCTCTGGTTGTGCCGTTGT 3759
Query 3930 GGGAAATTCATTAGAACTACGCTATTTTGGGATCTTTGTAGAATTTGGTGTAAATTCACT 3989 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3760 GGGAAATTCATTAGAACTATGCTATTTTGGGATCTTTGTAGAATTTGGTGTAAATTCGCT 3819
Query 3990 GTTTATCTAGGAAGAGAGAGAGGAACTATAGGATTAGGTTCATCTCTTATACAAGCTTTG 4049 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3820 GTTTATATAGGAAGAGAGAGAGGAACTATAGGATTAGGTTCATCTCTTATACAAGCTTTG 3879
Query 4050 ATTCTTTCAACCAAGACACAGTATTTGAGGTGCATTATTGTTGCATATGGAAATGCA--- 4106
30
Query 4107 ------GGTTAAATATACTTGCTGAGCTCCTTCGCTTTGGTGATAG 4146 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3940 TAGACTAGCACGCATGAATCGGTTAAATATACTTGCTGAGCTCCCTCGCTTTGGTGATAG 3999
Query 4147 AGAGTTCTATAAAGATTGGTGGAATGCAAGGACAGTTGAGGAGGTAAAAGTTTATAATTT 4206 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4000 AGAGTTCTATATAGATTGGTGGAATGCAAGGACAGTTGAGGAGGTAAAAGTTTATAATTT 4059
Query 4207 GGGTAGTGTTTTCCTTTGGGCATATCTTTCAACAATCCTTTGCTTATCTCAAATGTAAAT 4266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4060 GGGTAGTGTTTTCCTTTGGGCATATCTTTCAACAATCCTTTGCTTATCTCAAATGTAAAT 4119
Query 4267 GTTGGCATGCACCTTTGTGGATTTGTGGCTTTCATCAGTATTGGAGAATGTGGAATATGG 4326 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4120 GTTGGCATGCACCTTTGTGGA------TTCATCAGTATTGGAGAATGTGGAATATGG 4170
Query 4327 TATGTTTCCTTACCTAAAAATAATGCATTTTATTAGTCTTTGC-TCTATGTAGATGATAG 4385 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 4171 TATGTTTCCTTACCTAAAAATAATGCATTTTATTAGTCTTTGCTTCTATGTAGATGATTG 4230
Query 4386 TTGTATTCATATCTTTGGCTCTTTT-ACTTTATTTTATTTTTGGGGTTGCTG-TTG-TAA 4442 ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| ||| ||||| ||| ||| Sbjct 4231 TTGTATTCATATCTTTGGCTCTTTTTAC-TTATTTAATATTTTGGGATGCTGATTGATAA 4289
Query 4443 TATATGTAGCTTGA-TACATCGCATTTTTTCACTGGCATATTCAGATATTAAAATCTTGT 4501 |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||| || Sbjct 4290 TATATGTAGCTTGAATATACCGCA-TTTATCACTGGCATATTCCGAAATTAAATTCTGGT 4348
Query 4502 TTGAGATATACTACATGCTTGGTTTTTGGAACTGCT-AGTATGAT-CAGCCT-ATGAAAT 4558 | ||| | ||| ||||| ||| ||||| | || || ||| |||| |||||| || ||| Sbjct 4349 TGGAG-TCTAC-ACATGGCTGG-TTTTGAACCT-CTAAGTTTGATCCAGCCTAATTGAAT 4404
Query 4559 TTGGTTTAAGCATCTTTGAAAATGATATATAtttttttAAAATCATGTTTAGCATTTGTC 4618 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4405 CTGGTTTAAGCATCTTTGAAAATGATATATATTTTTTTAAAATCATGTTTAGCATTTGTC 4464
Query 4619 TTTGGATTAGAGAATAATGTGCTTTACAATGTTTAAATTAAGCTACAATTCCTAAATTTT 4678
31
Query 4679 TGGTAGAATTTTACATTTCTAATAGTGTGGAGTATTCTTTGGGTTGCTTCATTAGGGGGT 4738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4525 TGGTAGAATTTTACATTTCTAATAGTGTGGAGTATTCTTTGGGTTGCTTCATTAGGGGGT 4584
Query 4739 CAAGTATCCATGTGCATGTGTACAATCATTTACAAGTGTGCTTTTATATAGGTTGTTGAG 4798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4585 CAAGTATCCATGTGCATGTGTACAATCATTTACAAGTGTGCTTTTATATAGGTTGTTGAG 4644
Query 4799 TTCTAATTGTATTGTCGAATTTGGTGATAATAAATGCCAGATATGCTGGTGTTACAGAAA 4858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4645 TTCTAATTGTATTGTCGAATTTGGTGATAATAAATGCCAGATATGCTGGTGTTACAGAAA 4704
Query 4859 GAAACATGCATGTACGCATGGCACTCACACACACATATACAAAGGGTTGGTCAATCATGT 4918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4705 GAAACATGCATGTACGCATGGCACTCACACACACATATACAAAGGGTTGGTCAATCATGT 4764
Query 4919 TACTGATGGAATCCTATTGATTGCAGCCTGTTCATAAGTGGATGGTTCGCCATATCTACT 4978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4765 TACTGATGGAATCCTATTGATTGCAGCCTGTTCATAAGTGGATGGTTCGCCATATCTACT 4824
Query 4979 TTCCATGCTTGCGGCATAAAATACCAAGGGTAATTCTGCCTCTCACTTCAGAGTTCAATG 5038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4825 TTCCATGCTTGCGGCATAAAATACCAAGGGTAATTCTGCCTCTCACTTCAGAGTTCAATG 4884
Query 5039 AGTTCTTGATTGTTGCCATGAAACTGATGTTTCCTTTTGATGTATTATTATCTCTGCATT 5098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4885 AGTTCTTGATTGTTGCCATGAAACTGATGTTTCCTTTTGATGTATTATTATCTCTGCATT 4944
Query 5099 TGTCACCATTTCATAATTTCCTTCCGGTAATCCATGATGGGAGCCTTACTGTGCGCCATA 5158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4945 TGTCACCATTTCATAATTTCCTTCCGGTAATCCATGATGGGAGCCTTACTGTGCGCCATA 5004
Query 5159 TACATGCATCAATTAGATTTCAAAATATTCTAAAACCTTGCACAGAGTTTGATGTAGGGC 5218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5005 TACATGCATCAATTAGATTTCAAAATATTCTAAAACCTTGCACAGAGTTTGATGTAGGGC 5064
Query 5219 GCATGAGAGCTTTCAAAGTTCTGAATTAACAGAGCCTCACTTCTTATTCTATTTAAGTTG 5278
32
Query 5279 GAAAGCAATGGTTTCATCTTAAAATATTCTTTCAAGGGTATTTTCAAGCTTTAAAGGCTG 5338 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5125 GAAAGCAATGGTTTCATCTTAAAATATTCTTTCAAGGGTATTTTCAAGCTTTAAAGGCTG 5184
Query 5339 GAGAATTAGGCTGAAAAGAAGAATGATGTTTCTTACAGTTTAGGGACTGTCGAGGTGTGG 5398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5185 GAGAATTAGGCTGAAAAGAAGAATGATGTTTCTTACAGTTTAGGGACTGTCGAGGTGTGG 5244
Query 5399 GTAGGATTAAAAGTGATATATACATTTCAAGGGTACATGCAAGTAACTGCTGCCGTTTTG 5458 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5245 GTAGGATTAAAAGTGATATATACATTTCAAGGGTACATGCAAGTAACTGCTGCCGTTTTG 5304
Query 5459 GCAACTGTGAAAGCTATTACAACTAAGAATTGGAAACCGTCTATGATAAATACTGGATGA 5518 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5305 GCAACTGTGAAAGCTATTACAACTAAGAATTGGAAACCGTCTATGATAAATACTGGATGA 5364
Query 5519 TATTTAATTATTTATAAATGTTGCTTTGATAACAACAGTTCTTTTAGTACATCTACATCT 5578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5365 TATTTAATTATTTATAAATGTTGCTTTGATAACAACAGTTCTTTTAGTACATCTACATCT 5424
Query 5579 GATAAATGTGCCCTGGTGTTGATTTTTACAATGTAAGGCTTTAGATTCCTCGTGAGACGA 5638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5425 GATAAATGTGCCCTGGTGTTGATTTTTACAATGTAAGGCTTTAGATTCCTCGTGAGACGA 5484
Query 5639 TGATGTTTGTCGTATAAATTaaaaaaaaaaaTGGATAGAAAATAGCAAATATAGCAGTTG 5698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5485 TGATGTTTGTCGTATAAATTAAAAAAAAAAATGGATAGAAAATAGCAAATATAGCAGTTG 5544
Query 5699 TGTCTGTTGATATTGATTTCAATTCTTTTGAAAAGGTGTTAGGTTGAAGTGTAGGCCTCT 5758 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5545 TGTCTGTTGATATTGATTTCAATTCTTTTGAAAAGGTGTTAGGTTGAAGTGTAGGCCTCT 5604
Query 5759 AGGAGTACGTATGAACCGCTGGTGTCTGAATGACTAGCTTTTATCTGTCATATCCTTAAA 5818 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5605 AGGAGTACGTATGAACCGCTGGTGTCTGAATGACTAGCTTTTATCTGTCATATCCTTAAA 5664
Query 5819 ATTGAACAACCTACATGAATCTTCGAGATTTTGATGACCTGCTTGTTATTTGACCAAACA 5878
33
Query 5879 TGTTCTTGTTGTTTTATATAGTTAAAGTCAACCTTATTACCATCTTTTTGGTTGTCGCTC 5938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5725 TGTTCTTGTTGTTTTATATAGTTAAAGTCAACCTTATTACCATCTTTTTGGTTGTCGCTC 5784
Query 5939 ACAATTGTTCCATCTTTTCGCAATGATGCAGGGGGTGGCCTTATTAATTACTTTCTTCGT 5998 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5785 ACAATTGTTCCATCTTTTCGCAATGATGCAGGGGGTGGCCTTATTAATTACTTTCTTCGT 5844
Query 5999 TTCAGCAGTATTTCATGAGGTATGGGAGGTTGACTTCTGTGTAGCAATTTTCAGTTGTCC 6058 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5845 TTCAGCAGTATTTCATGAGGTATGGGAGGTTGACTTCTGTGTAGCAATTTTCAGTTGTCC 5904
Query 6059 AGTTTATGATGTCATAGCAACAAGCTGATGTGTTGTTTCATATGTTCATTCTTATGTCCT 6118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5905 AGTTTATGATGTCATAGCAACAAGCTGATGTGTTGTTTCATATGTTCATTCTTATGTCCT 5964
Query 6119 TGCTGTACAAGAATGAAACTGTTGTTCCAATGCACATACTTCCTGTGAGATGCAACAATA 6178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5965 TGCTGTACAAGAATGAAACTGTTGTTCCAATGCACATACTTCCTGTGAGATGCAACAATA 6024
Query 6179 GATTTAGTATTGTCAAGTTTTTCTGTAGGATGTCAGGTGCTGGAGTGACTTATGTTTTGA 6238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6025 GATTTAGTATTGTCAAGTTTTTCTGTAGGATGTCAGGTGCTGGAGTGACTTATGTTTTGA 6084
Query 6239 ACTTATTAGAATCAATTTCCATTATGAAACAGGTGGTTTTGCGCAATATCATGCTTGAGA 6298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6085 ACTTATTAGAATCAATTTCCATTATGAAACAGGTGGTTTTGCGCAATATCATGCTTGAGA 6144
Query 6299 ATTGCACAAGAATCGTGATAGGATATGGAAAAGCAAGCAACCTTCCTCTGGGAACATTAT 6358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6145 ATTGCACAAGAATCGTGATAGGATATGGAAAAGCAAGCAACCTTCCTCTGGGAACATTAT 6204
Query 6359 ACAGTCAACAGCTAATGTTTGTGGATTAATTCAATAGTAGAAATGCTGGCATCTGTCAAT 6418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6205 ACAGTCAACAGCTAATGTTTGTGGATTAATTCAATAGTAGAAATGCTGGCATCTGTCAAT 6264
Query 6419 GAAGTGAATTGGTTGGTTATGATGAGGACAAAGAGAAACCCAAATGATGAATTCCCAGTA 6478
34
Query 6479 TTTGTATAATAATTGGCAGGGTTGGTGAGGGTAATGTTTtagaaataagtgaaaagggaa 6538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6325 TTTGTATAATAATTGGCAGGGTTGGTGAGGGTAATGTTTTAGAAATAAGTGAAAAGGGAA 6384
Query 6539 aaagcagagtagtagatagatagttaaaagaaaaaaaGATAGTTTGATATGCCTTTACTA 6598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6385 AAAGCAGAGTAGTAGATAGATAGTTAAAAGAAAAAAAGATAGTTTGATATGCCTTTACTA 6444
Query 6599 TTTAACATTGTAAAATATTGCATTTGACACTGACAAATGCTAGATGTTAGGATAGAGTGT 6658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6445 TTTAACATTGTAAAATATTGCATTTGACACTGACAAATGCTAGATGTTAGGATAGAGTGT 6504
Query 6659 CTTAATGCTGATCTGATTGGATAGCATGGTCATCGCCGCAAACATCAGTTGCAATTGAAA 6718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6505 CTTAATGCTGATCTGATTGGATAGCATGGTCATCGCCGCAAACATCAGTTGCAATTGAAA 6564
Query 6719 ATCATCATTTCTCTCACCTAGATTCTCATGCCCATGTCAGAGGGTAAGAAAATGGCTTTT 6778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6565 ATCATCATTTCTCTCACCTAGATTCTCATGCCCATGTCAGAGGGTAAGAAAATGGCTTTT 6624
Query 6779 GATTGCATCCTTTTCTGAACATCTCATGGAGAATATGGATCTAAGACAAGGCAACTGAAG 6838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6625 GATTGCATCCTTTTCTGAACATCTCATGGAGAATATGGATCTAAGACAAGGCAACTGAAG 6684
Query 6839 GGAAAAACATTTATAAAATGTTTTTAATAGATTGCAGTTATGACTTAGTTGAGATTAGTG 6898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6685 GGAAAAACATTTATAAAATGTTTTTAATAGATTGCAGTTATGACTTAGTTGAGATTAGTG 6744
Query 6899 GGTTCAC-ACTCATACCTGCACAGTC-ATGCTTCCAGTCTTCATGGTCAAGACAACTTTG 6956 ||||||| | |||| |||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| | |||| |||| Sbjct 6745 GGTTCACCATTCAT-CCTGACCAGTCCAAGCTACCAGT-TTCATGGTCTAAACAAATTTG 6802
Query 6957 TCGAAAATGTATTTTTG-CAATTACT-GT-TATTGCACCTTGT-AG-TTACCT-A-CT-T 7008 | ||||||| ||||| || ||| || ||| |||| ||| || |||||| | || | Sbjct 6803 TACTAAATGTAATTTTGGCACGTACCCGTATATGCCACCATGTGAGGTTACCTTAACTGT 6862
Query 7009 GTATTA-GCATATCATAGAGTGATA-TGCC-TTTTAAG-TTCCTTATATTTAATTATAGT 7064 | |||| |||| | | |||| |||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| Sbjct 6863 G-ATTATGCAT-T-ACAGAGGGATAATGCCCTTTTAAGGTTCCTGA-ATTTAAATATAGT 6918
35
Query 7065 TTTTTATTTTGTGCTTGCATTTACAGTTGTGCATTGCTGTTCCTTGCCACATATTCAAGC 7124 ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6919 TTTTTTTTTTTTGCTTGCA-TTACAGTTGTGCATTGCTGTTCCTTGCCACATATTCAAGC 6977
Query 7125 TCTGGGCTTTTATTGGAATAATGTTTCAGGTGATCTATGAAGCAAGTTTATTTTAATTAG 7184 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 6978 TCTGGGCTTTTATTGGAATAATGTTTCAGGTAATCTAT-AAG-AAGTTTATTTTAATTAG 7035
Query 7185 AATTTGGGTTCACTGCATGGAGATCCCTAGTTCAAGTCCCACTGGGGTGGGGTAGGGTGG 7244 ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 7036 AATTTGGGTTC-CTGCATGGAGATCCCAGGTTCAAGTCCCACTGGGGTGGGGTGGAGTGG 7094
Query 7245 GTATGGAGGGACTACCTTCTATTATGTAAGGCTATTGGGACCAGGTCCACCGAGCCTCCT 7304 || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 7095 GTGTGGAGGGACTACCTTCTATTATGTA-GGCCC-TGGGACCATGTCCACTGAGCCTCCT 7152
Query 7305 GTTC-ATGTCGGG------TGTTT-GCTCTAGAGT-GATTGAAGTTATACAGGACATGA 7354 | | || | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| Sbjct 7153 GATAGATTTAGGGGAAAAAATGTTTTGCTCTAGAGTGGATTGAAGTTATGCAGGACATGA 7212
Query 7355 TGTCACTGAAATTTGCTGCTTTCGCTGTTTGAATCAGATTCCTTTGGTCGGGATCACAAA 7414 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7213 TGTCAATGAAATTTGCTGCTTTCCCTGTTTGAATCAGATTCCTTTGGTCGGGATCACAAA 7272
Query 7415 TTACCTTCAAAACAAGTTCAGAAGCTCAATGGTAAGtttttattttttCACAATTCACAT 7474 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7273 TTACCTTCAAAACAAATTCAGAAGCTCAATGGTAAGTTTTTATTTTTTCACAATTCACAT 7332
Query 7475 CTTATTTCCCAAATTATTTTAGCTTATTTGTCTTTTAAGCATCATTCTTCTGAGACAAAA 7534 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 7333 CTTATTTCCCAAATTATTTTAGCTTATTTATCTTTTAAGCATCATACTTCTGAGACAAAA 7392
Query 7535 GTGAACCATAGTGAAATATCATAGAAGAGCAAAGTCGCTGCTAACTGAGCATTAACACTT 7594 |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 7393 ATGAACCATAGTGAAATGTCATAGAAGAACAAAGTCGCTGCTAACTGAGCATTAATACTT 7452
Query 7595 ATCAAGGTGGTTTTCTCAACAGTTAGCCAAGAAAGCCTTTGCACACAAAGGCAAAGGCAT 7654 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7453 ATCAAGGTGGTTTTCTCAACAGTTAGCTAAGAAAGCCTTTGCACACAAAGGCAAAGGCAT 7512
36
Query 7655 GGGGCTCAAACCCAGGCTTATAACATATTTAAAGTGTATAGTTCACTGTCTTCACTCTGG 7714 || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 7513 GGAGCTCAAACCCAGGCTTATAACATATTTGAAGTGTATAGTTCGCTGTCCTCACTCTGG 7572
Query 7715 GAATTCGGCTTAGTCACTATCTATGTCCACCTTTTCGGCTTAGGTTATTCAGTTCCCATG 7774 | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 7573 GGATTTGGCTTAGTCACTATCTATGTCCACCTTTTCGGCTTAGGTTACTCAGTTCCCATG 7632
Query 7775 CTCTGTCCCCTTTTTT-AACTTGTG 7798 || ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 7633 CTGTGTCCCCTTTTTTTAACTTGTG 7657
Nhƣ vậy, từ các kết quả blast ở trên chúng tôi đã nhận đƣợc chính xác gen DGAT1 ở cây Trẩu nhăn Vernicia Montana với hệ số tƣơng đồng là 95% so với cây Trẩu trơn Vernicia fordii (Trên ngân hàng gen quốc tế NCBI). Và trình tự của gen DGAT1 ở cây Trẩu Vernicia Montana đƣợc thể hiện nhƣ sau: ATGACAATCCCTGAAACGCCGGATAATTCCACGGATGCTACCACCAGTGGCGCTGCTGA GTCCTCTTCCGATCTTAGCCTTTCGCTTCGACGGAGGAGGACTGCTTCCAACTCCGATG GAGCTGTCGCGGAATTGGCTTCCAAGATTGATGAGTTGGAATCTGATGCCGGAGGAGGC CAGGTGATTAAGGATCCGGGAGCAGTAATGGATTCGGGGACTTTGAAAAGTAATGGAAA AGATTGCGGAACCAATAAGGATAGGATTGAAAATCGTGAGAATCGTGGAGGATCGGATG TTAAATTCACGTATCGGCCGTCGGTGCCGGCTCACCGGGCGCTCAAGGAGAGTCCGCTT AGCTCTGATAATATATTTAAACAAGTACGGATTTTTTAAAATAACTTTAATCGCTTCTT ATTATTAGCTGATTAACGCTTGAATTTTCCCATTGAATTGATGCATGGCAATGGGTAGG TAAAAGTTCATCAGGTACTGGTTTCTAAGTGGATTTCTTTGTTAGCTATAAATGAAATT TGTTTAATCTTTTGACTTTTCTTTGTTTTACTTTTAACGGAAGTTTATTTGCATTTGTT TAGATTTTATTTTTGTCTAGTGATTGATTGTACTAAGTTGGTGAAGTTATGGTTTTGGG ACCATTTTATTGATTTTAACCTGTTTTGGGAATCCTTAAATGAACACCTTTGAAAATAA TAACTTGAATTAAGATGGATGCATAATTCTTAATTAATTAGTATTTACATTTTATGTCA GAGTCATGCAGGTCTCTTCAATCTCTGTATAGTAGTGCTTGTAGCGGTTAACAGTCGGC TTATCATTGAAAATATAATGAAGGTTTGTCTTTTCCATTTGCACTTTACACTTCATAGC AATACGGTTGAATGGTGGTTGGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGGGGTCAGGAAAA AAAAGGCTTAAAATTTAGGGAAAAAAAGGTTTTTGCAAAAGGGTGGGTAAATAAAAACG GGGTTTGGGTTTATTTCAAAATCGTTAAAAAACGGGCCCCTTTTAAGGGGGGGGAAAAA ATACCTTTGGAGTTTTTTTTCTATTCAAAGGGAAAAAAATAAAAAAAAATTTTATTTTT CCAAAGGCGGTTTGAAATTTTTGGGGTCAAAATAAATTTTTGATAGAAAAAAGGCATAG CTTTTGGGGTTTCTGTTGAAGTTTTACCCCCCCAAAATTTTCTATCTAGTTGAGAAGTT GGCCTGTCGGAAGTATATATCTGCACCCGTAAGTGTTCCTTATCCAACTATTTTGTGTA TTTCTAACAGTAGGCTGGCTTACTAAAGAATCTTACGAAAAAAAAATAATTCCAATAAA
37
GATATTGAACTGGTTTGAAATTAACTTCTACTTTGATATTGCAGACTGTTGTTTTTCTT CATATTCTTTTCTCCTCAACAGCAGTTTTATACCCTGTTTCTGTGATTCTCAGGTTTTT TACTTTGCTTTGCATTTTTTTTTATTTTTACTGCAAAATTTAGCCACATATAGCTGTCT GTTTAAAACACTTCAAAATACTGTTGGCATATCTATTTCCTCTTGATTAAATTTCTTTA TTCTATGAAAAAAAAAATATTGAACAGTTGCATTCCACTTCAAAATCACTTAAAGAATG TGTGAAGTATGAGAAATTTGTGTTGAAAGCAAACATTGTTTATAAACACACATTTGGGT CCTGGAATGATTTTTTAATAGGGAATTGAACATCTTGTAAATATTATGGTCAGTAGCCA GAGTGGCCTGCATTCCATAGCTTCTTTTGTGTCCCTCTCTCTGGCATTGCAAATTCTTA AGTTTTGCAAACTTTTCAGTTTGCCTTTCAACATTGGATTTGGCTTCCTTGTCTCCATC TCTCTTCCTCTCTATCTATATGTAGAACGCCAGGAAGATTATGTGATATTAGGTGTTTT GTCTGTTGCTAAATTCCTTTTTTTTTTGAGCATTATGTTAATGGAATATCTTATATTCT GCGGAGTATCATTCTTGTCTTAGTAATCAACAAGGGTGTTAAAATGCTTAATCATTCTT CTTACTGATTTTTGCAGTTGTGAATCTGCTGTTTTGTCCGGTGTCGCATTGATGCTCTT TGCTTGTATCGTGTGGTTGAAATTGGTATCTTATGCACATACAAACTTTGATATGAGAG CAATTGCTAACTCAGTTGATAAGGTACAAAAGTAATTGTTTTGTGAACTCCATTGATGC TTGAAAATGTTCTTCAGTTTTTCTTTACTAGAATTCATATTTTTCCTTGCCCACCCCCA CCCAAGGAATAAATTTCTTCAGCCTGGATGGATTTTTCCATCTGCAACAATCTTTATGA ACAAAATGGCCATCACTCATTCAATGTAGTTCTGCTTGATGGCAGGGAGATGCGCTATC CAATGCTTCGAGTGCAGAGTCCTCTCATGATGTTAGCTTCAAGAGTTTGGTTTATTTCA TGGTTGCTCCCACATTGTGTTACCAGGTAGCTGATCATATTTCTTCCATCGATAAACGG AGAATTTTTGTATTTGCAGTTATTTAAGAATATCAATGCTCATTGGTCATCTTGGCATT ACTTGCTCATGCTGTTTCTTTTAATTTAACTATTTTTGTTTGATACTTATATGCATAAG ATGATTGGCACAATTATTATTCATTCAAAGCTAGTATATTTAAAATTATTAATTTGATT TCTAGCTGTACCTCATGTTTTCTAGCTCATCATTTGACCTTTTACCACATTTTCAACAA CTGAGGGGAGGCACATTTTGTCAAGTAACTTTTTTTTTTAATTTTTTGGGCCAGCCCTT TTTTTGTAATTTAAAAATAGGGGGTGGGGGAGGGGGTTTTTTTAAGGGAGTCCCATGGA AATTTTTGGGTGTTCCCCAAAACTTAGAAAGGCTTTTGGTTTTCTTGAAATTGTCAAGG GCCTTTAATTTTTTTTTTTGGACCATGTAAGCCAAGTTTTCCTCGAACTGCATCCATTG GAAAGGGGTGGGGTGGTTCGTCAATTTGTCAAGTTAATATATTTTCAGGATTCCTGGGA TTTATCATAGAACAAGTAAGGGAAATTTATGTTCAAAACTAGCTTTCCCTTTTCTTTTT GCTGTTTTGGGAAATTGGCTCATGCATTTTTGACATGGTTGTGGGCTTCATCTGCAGTA TATCAATCCTATTGTTCAGAATTCACAACATCCTTTAAAAGGGGATCTCTTATATGCCA TTGAGAGGGTTTTGAAGCTCTCAGTTCCGAATTTATATGTCTGGCTTTGCATGTTCTAC TGCTTTTTTCACCTATGGTGAGTTCATTATTTTTTTCTCTTCCTAAATCTCATGAAGTA CATTTCACCATCTTTTAAATGTTTTCAATGATTGCCATGAAAGTTGTATTTTTCTTCTG ATGTTGCAGAGATAAATAGTAGACTAATAGTTGTTGTATGTCGCAGAGGTGATAGTGGA CTATTGTAGTTGTATTTTTTTCACCTCTACATTTTATGTGCAGTTAGTTATTCTGGTAA CTTGCTTAGATCACTCAGTGCCATATATTTGGCTGATTTTTTAGTTTTATGCGTTTTGG CTATAATGATCGATTGATGTAATAAGTTTTGCAAATCCTTCATTGAATAATGTACTTAA TTGACCATTAACCCAAAATGAATTTGCTTGTAAATTTTTTCTACCCAACAACTCAATTT GAATTGTGTGTGAACTGTGAACCTCTCTGGTTGTGCCGTTGTGGGAAATTCATTAGAAC TATGCTATTTTGGGATCTTTGTAGAATTTGGTGTAAATTCGCTGTTTATATAGGAAGAG AGAGAGGAACTATAGGATTAGGTTCATCTCTTATACAAGCTTTGATTCTTTCAACCAAG
38
GCACAATATTTGAGGTGCATTATTGTTGCATATGGAAATGCAAGATAGACTAGCACGCA TGAATCGGTTAAATATACTTGCTGAGCTCCCTCGCTTTGGTGATAGAGAGTTCTATATA GATTGGTGGAATGCAAGGACAGTTGAGGAGGTAAAAGTTTATAATTTGGGTAGTGTTTT CCTTTGGGCATATCTTTCAACAATCCTTTGCTTATCTCAAATGTAAATGTTGGCATGCA CCTTTGTGGATTCATCAGTATTGGAGAATGTGGAATATGGTATGTTTCCTTACCTAAAA ATAATGCATTTTATTAGTCTTTGCTTCTATGTAGATGATTGTTGTATTCATATCTTTGG CTCTTTTTACTTATTTAATATTTTGGGATGCTGATTGATAATATATGTAGCTTGAATAT ACCGCATTTATCACTGGCATATTCCGAAATTAAATTCTGGTTGGAGTCTACACATGGCT GGTTTTGAACCTCTAAGTTTGATCCAGCCTAATTGAATCTGGTTTAAGCATCTTTGAAA ATGATATATATTTTTTTAAAATCATGTTTAGCATTTGTCTTTGGATTAGAGAATAATGT GCTTTACAATGTTTAAATTAAGCTACAATTCCTAAATTTTTGGTAGAATTTTACATTTC TAATAGTGTGGAGTATTCTTTGGGTTGCTTCATTAGGGGGTCAAGTATCCATGTGCATG TGTACAATCATTTACAAGTGTGCTTTTATATAGGTTGTTGAGTTCTAATTGTATTGTCG AATTTGGTGATAATAAATGCCAGATATGCTGGTGTTACAGAAAGAAACATGCATGTACG CATGGCACTCACACACACATATACAAAGGGTTGGTCAATCATGTTACTGATGGAATCCT ATTGATTGCAGCCTGTTCATAAGTGGATGGTTCGCCATATCTACTTTCCATGCTTGCGG CATAAAATACCAAGGGTAATTCTGCCTCTCACTTCAGAGTTCAATGAGTTCTTGATTGT TGCCATGAAACTGATGTTTCCTTTTGATGTATTATTATCTCTGCATTTGTCACCATTTC ATAATTTCCTTCCGGTAATCCATGATGGGAGCCTTACTGTGCGCCATATACATGCATCA ATTAGATTTCAAAATATTCTAAAACCTTGCACAGAGTTTGATGTAGGGCGCATGAGAGC TTTCAAAGTTCTGAATTAACAGAGCCTCACTTCTTATTCTATTTAAGTTGGAAAGCAAT GGTTTCATCTTAAAATATTCTTTCAAGGGTATTTTCAAGCTTTAAAGGCTGGAGAATTA GGCTGAAAAGAAGAATGATGTTTCTTACAGTTTAGGGACTGTCGAGGTGTGGGTAGGAT TAAAAGTGATATATACATTTCAAGGGTACATGCAAGTAACTGCTGCCGTTTTGGCAACT GTGAAAGCTATTACAACTAAGAATTGGAAACCGTCTATGATAAATACTGGATGATATTT AATTATTTATAAATGTTGCTTTGATAACAACAGTTCTTTTAGTACATCTACATCTGATA AATGTGCCCTGGTGTTGATTTTTACAATGTAAGGCTTTAGATTCCTCGTGAGACGATGA TGTTTGTCGTATAAATTAAAAAAAAAAATGGATAGAAAATAGCAAATATAGCAGTTGTG TCTGTTGATATTGATTTCAATTCTTTTGAAAAGGTGTTAGGTTGAAGTGTAGGCCTCTA GGAGTACGTATGAACCGCTGGTGTCTGAATGACTAGCTTTTATCTGTCATATCCTTAAA ATTGAACAACCTACATGAATCTTCGAGATTTTGATGACCTGCTTGTTATTTGACCAAAC ATGTTCTTGTTGTTTTATATAGTTAAAGTCAACCTTATTACCATCTTTTTGGTTGTCGC TCACAATTGTTCCATCTTTTCGCAATGATGCAGGGGGTGGCCTTATTAATTACTTTCTT CGTTTCAGCAGTATTTCATGAGGTATGGGAGGTTGACTTCTGTGTAGCAATTTTCAGTT GTCCAGTTTATGATGTCATAGCAACAAGCTGATGTGTTGTTTCATATGTTCATTCTTAT GTCCTTGCTGTACAAGAATGAAACTGTTGTTCCAATGCACATACTTCCTGTGAGATGCA ACAATAGATTTAGTATTGTCAAGTTTTTCTGTAGGATGTCAGGTGCTGGAGTGACTTAT GTTTTGAACTTATTAGAATCAATTTCCATTATGAAACAGGTGGTTTTGCGCAATATCAT GCTTGAGAATTGCACAAGAATCGTGATAGGATATGGAAAAGCAAGCAACCTTCCTCTGG GAACATTATACAGTCAACAGCTAATGTTTGTGGATTAATTCAATAGTAGAAATGCTGGC ATCTGTCAATGAAGTGAATTGGTTGGTTATGATGAGGACAAAGAGAAACCCAAATGATG AATTCCCAGTATTTGTATAATAATTGGCAGGGTTGGTGAGGGTAATGTTTTAGAAATAA GTGAAAAGGGAAAAAGCAGAGTAGTAGATAGATAGTTAAAAGAAAAAAAGATAGTTTGA
39
TATGCCTTTACTATTTAACATTGTAAAATATTGCATTTGACACTGACAAATGCTAGATG TTAGGATAGAGTGTCTTAATGCTGATCTGATTGGATAGCATGGTCATCGCCGCAAACAT CAGTTGCAATTGAAAATCATCATTTCTCTCACCTAGATTCTCATGCCCATGTCAGAGGG TAAGAAAATGGCTTTTGATTGCATCCTTTTCTGAACATCTCATGGAGAATATGGATCTA AGACAAGGCAACTGAAGGGAAAAACATTTATAAAATGTTTTTAATAGATTGCAGTTATG ACTTAGTTGAGATTAGTGGGTTCACCATTCATCCTGACCAGTCCAAGCTACCAGTTTCA TGGTCTAAACAAATTTGTACTAAATGTAATTTTGGCACGTACCCGTATATGCCACCATG TGAGGTTACCTTAACTGTGATTATGCATTACAGAGGGATAATGCCCTTTTAAGGTTCCT GAATTTAAATATAGTTTTTTTTTTTTTGCTTGCATTACAGTTGTGCATTGCTGTTCCTT GCCACATATTCAAGCTCTGGGCTTTTATTGGAATAATGTTTCAGGTAATCTATAAGAAG TTTATTTTAATTAGAATTTGGGTTCCTGCATGGAGATCCCAGGTTCAAGTCCCACTGGG GTGGGGTGGAGTGGGTGTGGAGGGACTACCTTCTATTATGTAGGCCCTGGGACCATGTC CACTGAGCCTCCTGATAGATTTAGGGGAAAAAATGTTTTGCTCTAGAGTGGATTGAAGT TATGCAGGACATGATGTCAATGAAATTTGCTGCTTTCCCTGTTTGAATCAGATTCCTTT GGTCGGGATCACAAATTACCTTCAAAACAAATTCAGAAGCTCAATGGTAAGTTTTTATT TTTTCACAATTCACATCTTATTTCCCAAATTATTTTAGCTTATTTATCTTTTAAGCATC ATACTTCTGAGACAAAAATGAACCATAGTGAAATGTCATAGAAGAACAAAGTCGCTGCT AACTGAGCATTAATACTTATCAAGGTGGTTTTCTCAACAGTTAGCTAAGAAAGCCTTTG CACACAAAGGCAAAGGCATGGAGCTCAAACCCAGGCTTATAACATATTTGAAGTGTATA GTTCGCTGTCCTCACTCTGGGGATTTGGCTTAGTCACTATCTATGTCCACCTTTTCGGC TTAGGTTACTCAGTTCCCATGCTGTGTCCCCTTTTTTTAACTTGTGCCGAATTTATATG TCTGGCTTCCACTTTGGTGAAGATACATGGATTCCAGTGAGGGATTCAGCCTGAAAGGG AAGGTGGCATGTCGGTCTTAGCATCAAAGGTCATAGGGTTCTACTCGTCTTGAAAGACC C
40
PHẦN IV. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
4.1. Kết luận - Đã tách chiết đƣợc ADN tổng số của các loài Trẩu nhăn Vernicia montana - Nhân bản thành công gen DGAT1 và các đoạn gen DGAT1 ở các loài Trẩu nhăn Vernicia montana. - Đã thiết kế thành công các cặp mồi để nhân gen DGAT1 ở hai mẫu Trẩu nhăn Vernicia montana. - Xác định đƣợc trình tự nucleotide của gen DGAT1 ở các loài Trẩu nhăn Vernicia montana. 4.2. Kiến nghị - Tiếp tục tiến hành xác định trình tự mARN của gen DGAT1 với loài Trẩu nhăn Vernicia Montana để xác định chính xác đoạn exon và intron của gen. - Đƣa trình tự gen DGAT1 của loài Trẩu nhăn Vernicia montana lên ngân hàng gen Quốc tế để phục vụ nghiên cứu tiếp theo.
41
TÀI LIỆU THAM KHẢO I. Tài liệu tiếng việt 1. Lê Mộng Chân, Lê Thị Huyên (2000). Thực vật rừng, NXB Nông nghiệp. 2. Phạm Xuân Hoàn, Triệu Văn Hùng, Phạm Văn Điển, Nguyễn Trung Thành, Võ Đại Hải (2004). Một số vấn đề trong lâm học nhiệt đới, NXB Nông nghiệp. II. Tài liệu tiếng anh 3. Bouvier-Nave P, Benveniste P, Oelkers P, Sturley SL, Schaller H (2000). Expression in yeast and tobacco of plant cDNAs encoding acyl CoA:diacylglycerol acyltransferase. Eur J Biochem 267:85-96. 4. Cao et al. (2011).Structure-Function Analysis of Diacylglycerol Acyltransferase Sequences from 70 Organism. BMC Research notes, 4:249. 5. Cases S, Smith S.J, Zheng Y.W, Myers H.M, Lear S.R, Sande E, Novak S, Collins C, Welch CB, Lusis AJ, Erickson SK, Farese RV Jr, (1998). Identification of gene encoding an acyl CoA:diacylglycerol acyltransferase, a key enzyme in triacylglycerol synthesis. Proc Natl Acad Sci USA, 95:13018- 13023. 6. Maud Hinchee & William Rottmann & Lauren Mullinax & Chunsheng Zhzang & Shujun Chang & Michael Cunningham & leslie Pearson & Narender Nehra(2009). Short-rotation woody crops for bioenergy and biofuels applications,In Vitro Cell.Dev.Biol.-Plant, Springerlink.com. 7. http://dx.doi.org/10.111/j.1467-7652.2009.00458.x 8. http://www.lamdong.gov.vn 9. Saha S, Enugutti B, Rajakumari S, Rajasekharan R: Cytosolic triacylglycerol biosynthetic pathway in oilseeds. (2006). Molecular cloning and expression ofpeanut cytosolic diacylglycerol acyltransferase. Plant Physiol 141 :1533-1543.
10. Sambrook, J. and Russell, D. W., (2001). Molecular Cloning, A Laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.
11. Sedjo R. A. Biotechnology in forestry. (2001).Considering the cost and benefits. Resour. Future 145: 10-12. 12. Shockey JM, Gidda SK, Chapital DC, Kuan JC, Dhanoa PK, Bland JM, Rothstein SJ, Mullen RT, Dyer JM. (2006). Tung tree DGAT1 and DGAT2 have nonredundant functions in triacylglycerol biosynthesis and are localized to different subdomains of the endoplasmic reticulum. Plant Cell 18:2294-2313. 13. Smith SJ, Cases S, Jensen DR, Chen HC, Sande E, Tow B, Sanan DA, RaberJ, Eckel RH, Farese RV Jr. (2000). Obesity resistance and multiple mechanismsof triglyceride synthesis in mice lacking Dgat. Nat Genet 25:87- 90. 14.V.M. Nieto and J. Rodriguez (2003), “Species descriptions” in J.A. Vozzo, Tropical Tree Seed Manual: 743. 15. Wang H. (2006). Preliminary review biotechnologie in forestry, including genetic modification. FAO coporate document repository (1),pp. 1-12. 16. www.tinhdauvietnam.vn 17. Xu J, Francis T, Mietkiewska E, Giblin EM, Barton DL, Zhang Y, Zhang M, Taylor DC. (2008). Cloning and characterization of an acyl-CoA- dependent diacylglycerol acyltransferase 1 (DGAT1) gene from Tropaeolum majus, and a study of the functional motifs of the DGAT protein using sitedirected mutagenesis to modify enzyme activity and oil content. Plant Biotechnol J. 6:799-818. 18. Zheng P, Allen WB, Roesler K, Williams ME, Zhang S, Li J, Glassman K, Ranch J, Nubel D, Solawetz W, Bhattramakki D, Llaca V, Deschamps S, Zhong GY, Tarczynski MC, Shen B. (2008). A phenylalanine in DGAT is a keydeterminant of oil content and composition in maize. Nat Genet, 40:367-372.