Ñáîðíèê Òåçèñîâ
Total Page:16
File Type:pdf, Size:1020Kb
ÏËÎÙÀÄÊÀ ÎÒÊÐÛÒÛÕ ÊÎÌÌÓÍÈÊÀÖÈÉ OPENBIO ÑÁÎÐÍÈÊ ÒÅÇÈÑΠVII ÌÅÆÄÓÍÀÐÎÄÍÎÉ ÊÎÍÔÅÐÅÍÖÈÈ ÌÎËÎÄÛÕ Ó×ÅÍÛÕ: ÁÈÎÔÈÇÈÊÎÂ, ÁÈÎÒÅÕÍÎËÎÃÎÂ, ÌÎËÅÊÓËßÐÍÛÕ ÁÈÎËÎÃÎÂ È ÂÈÐÓÑÎËÎÃΠÍÀÓÊÎÃÐÀÄ ÊÎËÜÖÎÂÎ - 2020 VII МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОФИЗИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И ВИРУСОЛОГОВ Сборник тезисов Новосибирск Наукоград Кольцово 2020 УДК 577.2:62.01:578+(001) ББК 28.07:30.16:28.4 М431 М431 VII Международная конференция молодых ученых: биофизи- ков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов — 2020: cб. тез. / АНО «Иннов. центр Кольцово». — Новосибирск : ИПЦ НГУ, 2020. — 642 с. ISBN 978-5-4437-1114-0 Сборник тезисов составлен на основе материалов, присланных российскими и иностранными учеными в оргкомитет Международ- ной конференции молодых ученых биотехнологов, молекулярных биологов, вирусологов и биофизиков, проходящей в рамках площад- ки открытых коммуникаций OpenBio-2020. Издание предназначено для преподавателей и научных сотруд- ников, аспирантов, магистрантов и студентов, интересующихся ак- туальными проблемами и разработками в области биотехнологии, вирусологии, молекулярной биологии и биофизики. Тезисы публикуются в авторской редакции. УДК 577.2:62.01:578+(001) ББК 28.07:30.16:28.4 © АНО «Инновационный центр ISBN 978-5-4437-1114-0 Кольцово», 2020 c 3 РАЗДЕЛ 1 БИОТЕХНОЛОГИЯ ИЗУЧЕНИЕ СВОЙСТВ И ХИМИЧЕСКОГО СОСТАВА ПАСЛЕНА ЧЕРНОГО С ЦЕЛЬЮ РАЗРАБОТКИ ПИЩЕВОГО КОНСЕРВАНТА STUDY OF THE PROPERTIES AND CHEMICAL COMPOSITION OF BLACK NIGHTSHADE (SOLANUM NIGRUM L.) FOR THE DEVELOPMENT OF FOOD PRESERVATIVE *О. В. Астафьева, З. В. Жаркова Астраханский государственный медицинский университет O. V. Astafyeva, Z. V. Zharkova Astrakhan State Medical University E-mail: [email protected] Аннотация Паслен черный (Solanum nigrum L.) — малоизученный объект в нашей стране, но нашедший широкое применение в других странах. Целью работы было исследова- ние химического состава, антибактериальных и антиоксидантных свойств экстрак- тов S. nigrum для разработки пищевого консерванта. Abstract Black nightshade (Solanum nigrum L.), a few studied object in our country, but which has found wide application in other countries. The aim of this work was to study the chem- ical composition, antibacterial and antioxidant properties of S. nigrum extracts for the de- velopment of a food preservative. *© О. В. Астафьева, З. В. Жаркова, 2020 4 Раздел 1 Plants are one of the sources of antimicrobial and antioxidant substances that can be used as preservatives. The object of this work was S. nigrum, which is few studied and not used in Russia. Extraction of biologically active substances was carried out with water and 70 % alcohol from the roots, stems and roots of S. nigrum. Then the extractants were evaporated by a rotary vacuum evaporator. The antibacterial activity was studied by the agar diffusion method and by the method of serial dilutions. Antioxidant activity was determined by DPPG test. By chromatographic methods (TLC, HPTLC, HPLC), compounds such as quercetin, aspartic, fumaric, pyruvic, acetic, citric, and succinic acids were identit- fied, which most likely cause antibacterial and antioxidant properties. The aqueous extracts of the stems had the highest antibacterial activity, but did not have an antioxidant effect. Hydroalcoholic extracts of the leaves had high antioxidant activity, but relatively low antibacterial activity. The optimal composition of extracts of leaf and stem of S. nigrum with preserving properties is a composition consisting of an aqueous extract of the stem, ethanol (70 %) extracts of the stem and leaves in a ratio of 1: 1: 1, respectively. This composition showed high both antibacterial and antioxidant activity. The results obtained are the basis for the development of a food preservative based on the compositions of S. nigrum extracts. Биотехнология 5 ОПЫТ СОЗДАНИЯ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНАТОРА В КИТАЕ * EXPERIENCE OF CREATING A HIGH-THROUGHPUT SEQUENCER IN CHINA П. К. Афоничева, Д. А. Белов, Ю. В. Белов, А. А. Евстрапов Институт аналитического приборостроения Российской академии наук P. K. Afonicheva, D. A. Belov, Yu. V. Belov, A. A. Evstrapov Institute for Analytical Instrumentation of the Russian Academy of Sciences E-mail: [email protected] Аннотация В последние годы в России значительные материальные ресурсы были направ- лены на обеспечение независимости от зарубежных поставщиков в области высоко- производительного секвенирования, а также на достижение лидирующих позиций на мировом рынке. Целью настоящего исследования является опыт китайских орга- низаций в попытке войти в список передовых компаний среди разработчиков высо- копроизводительных секвенаторов. Рассмотрены модели секвенаторов китайского производства как выпускаемые по лицензионным соглашениям, так и собственной разработки. Abstract In recent years significant material resources in Russia have been used to ensure in- dependence from foreign suppliers in high-throughput sequencing, as well as to achieve a leading position in the world market. The aim of this research is the experience of Chinese organizations in an attempt to become one of the leading companies among the high-throughput sequencer developers. Models of Chinese-made sequencers are con- sidered. Высокопроизводительное секвенирование (Next Generation Sequencing, NGS), вытеснившее классический метод секвенирования по Сэнгеру в за - дачах анализа полного генома, экзома и транскриптома за счет снижения стоимости и трудоемкости анализа, занимает более половины объема ми- © П. К. Афоничева, Д. А. Белов, Ю. В. Белов, А. А. Евстрапов, 2020 * Работа выполнена по Государственному заданию № 075-01073-20-00. 6 Раздел 1 рового рынка и консолидирован вокруг американских компаний Illumina и Thermo Fisher Scientific. Не меньший интерес представляют компании Китая, способные потеснить лидеров. Ряд NGS секвенаторов, произведенных в Китае по лицензии от других компаний, схож по характеристикам с зарубежными аналогами: – NextSeq CN500 (Berry Genomics) и NextSeq 550AR (Annoroad Gene Technology) — аналоги NextSeq 500 (Illumina); – BioelectronSeq 4000 (Boao Biological Group), использующий технологию Ion Torrent; – DA8600 (Daan Gene) — аналог Ion Proton; – два секвенатора компании BGI Genomics: BGISEQ-100, основанный на технологии Ion Torrent, и BGISEQ-1000, основанный на технологии cPAL от Complete Genomics. Пять китайских компаний заявляют о разработке своих собственных секвенаторов. Секвенатор BIGIS компании Zixin Pharmaceutical Industrial, основанный на устаревшей технологии 454, имеет мало шансов на выход даже на китай- ский рынок. Одномолекулярный секвенатор GenoCare 1600 Single Molecular Seн- quencer компании GeneMind Biosciences Company Limited успешно прошел клинические испытания в 2019 году, обладает оригинальными решениями и может выйти на рынки NGS. Секвенатор HYK-PSTAR-IIA компании Huayinkang Gene Technology исв- пользует технологию, аналогичную технологии SOLiD, которая не применяется в современных секвенаторах, но имеет некоторые преимущества по сравнению с ними. Компания утверждает о наличии оригинальных решений, однако фак- ты применения HYK-PSTAR-IIA за пределами Китая отсутствуют. Компания Anxun Biotechnology (Axbio) заявляет о разработке нанопо-A рового секвенатора AXP100. Информация о результатах его применения отсутствует, что ставит под сомнение готовность устройства. Компания BGI Genomics выпускает секвенаторы DNBSEQ-400, DNBSEQ-50, DNBSEQ-T7 и DNBSEQ Tx, которые широко используются и не уступают аналогам. Однако у компании, несмотря на их утверждениях о патентной чистоте применяемых технических решений, есть проблемы с выходом на рынки Европы и Северной Америки. Анализ опыта китайских компаний показал, что для удовлетворения собственных нужд страны целесообразно производство секвенаторов на основе известных методов, однако для выхода на мировой рынок необходи- мо создание оригинальных технологий. Биотехнология 7 СТВОЛОВЫЕ КЛЕТКИ В СОЧЕТАНИИ С НАНОСТРУКТУРИРОВАННЫМИ СМАРТ-СКАФФОЛДАМИ КАК ИНСТРУМЕНТ РЕГЕНЕРАЦИИ КОСТНОЙ ТКАНИ * STEM CELLS IN COMBINATION WITH NANOSTRUCTURED SMART- SCAFFOLDS AS A TOOL FOR BONE TISSUE REGENERATION Ф. С. Ахатова, Е. А. Науменко, И. Д. Гурьянов, Р. Ф. Фахруллин Казанский (Приволжский) федеральный университет F. S. Akhatova, E. A. Naumenko, I. D. Guryanov, R. F. Fakhrullin Kazan (Volga Region) Federal University E-mail: [email protected] Аннотация Стволовые клетки взрослого организма обладают потенциалом в формирова- нии костной ткани и могут быть использованы для ее регенерации, например, при травмах опорно-двигательного аппарата. Матриксы на основе биополимеров в со- четании с наноматериалами могут использоваться как эффективные носители для стволовых клеток и ускорять регенеративные процессы. Abstract Adult stem cells have the potential to form bone tissue and can be used for its regenera- tion, for example, in injuries of the musculoskeletal system. Matrices based on biopolymers in combination with biocompatible nanomaterials can be used as effective carriers for stem cells and accelerate regenerative processes. Modern advances in stem cell biology open up opportunities for creating new approaches to the treatment of a number of diseases, including diseases of the musculoskeletal system, both caused by dysfunctions of the body’s metabolic sysc- tems and resulting from trauma. These areas, suggesting a personalized approach to therapy and surgery, can include cell replacement therapy, drug therapy, or © Ф. С. Ахатова, Е. А. Науменко, И. Д. Гурьянов, Р. Ф. Фахруллин, 2020 * The work is performed according to the Russian Government