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Fernández, Paula Del Carmen. 2006 "Análisis

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Fernández, Paula Del Carmen. 2006 Tesis Doctoral Análisis genómico de girasol: desarrollo de colecciones de ESTs y de una plataforma bioinformática para estudios de expresión de genes candidato en respuestas a estreses abióticos Fernández, Paula del Carmen 2006 Este documento forma parte de la colección de tesis doctorales y de maestría de la Biblioteca Central Dr. Luis Federico Leloir, disponible en digital.bl.fcen.uba.ar. Su utilización debe ser acompañada por la cita bibliográfica con reconocimiento de la fuente. This document is part of the doctoral theses collection of the Central Library Dr. Luis Federico Leloir, available in digital.bl.fcen.uba.ar. It should be used accompanied by the corresponding citation acknowledging the source. Cita tipo APA: Fernández, Paula del Carmen. (2006). Análisis genómico de girasol: desarrollo de colecciones de ESTs y de una plataforma bioinformática para estudios de expresión de genes candidato en respuestas a estreses abióticos. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Cita tipo Chicago: Fernández, Paula del Carmen. "Análisis genómico de girasol: desarrollo de colecciones de ESTs y de una plataforma bioinformática para estudios de expresión de genes candidato en respuestas a estreses abióticos". Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2006. Dirección: Biblioteca Central Dr. Luis F. Leloir, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires. Contacto: [email protected] Intendente Güiraldes 2160 - C1428EGA - Tel. (++54 +11) 4789-9293 UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS Y NATURALES ANÁLISIS GENÓMICO DE GIRASOL: Desarrollo de colecciones de ESTs y de una plataforma bioinformática para estudios de expresión de genes candidato en respuestas a estreses abióticos ING. AGR. PAULA DEL CARMEN FERNANDEZ DIRECTOR: DRA. RUTH A. HEINZ TESIS PARA OPTAR POR EL TÍTULO DE DOCTOR EN CIENCIAS BIOLOGICAS INSTITUTO DE BIOTECNOLOGÍA CICVyA INTA – CASTELAR DICIEMBRE 2006 A mis papás, A Ale y a Salvador: introducción, nudo y desenlace de esta historia AGRADECIMIENTOS Como uno nunca logra nada solo, sino en grupo y con la ayuda de tantas personas necesarias en cuerpo y alma, quiero tratar de mencionarlas aquí brevemente, tratando de no olvidar a ninguna en particular… • A la Universidad de Buenos Aires, por la beca otorgada en el año 2002 para que pudiera ejecutar este trabajo de tesis, y por la posibilidad de seguir brindando educación pública, gratuita y de calidad. A toda la sociedad que la sostiene. • Al INTA, por lo que significa como institución, por su renombre y porque gracias a su gente como el Dr. Osvaldo Rossetti y la Dra. Elisa Carrillo tuve el apoyo institucional para desarrollar este trabajo. • A Ruth, por todo lo que es como persona y profesional. Por su ayuda, su confianza, su tolerancia, su esfuerzo diario en que todo salga bien y una no se sienta “a la deriva”, su buen trato. Y su valiosa experiencia y conocimiento. Una directora presente siempre. • A Norma, porque sin ella el segundo capítulo de mi tesis me hubiera desmoronado. Por aceptarme y sonreírme con tanta calidez el día de la primera entrevista, por tener más confianza en mí que yo misma, por poder contar con ella para todo. Y porque por cuestiones formales no pudo estar co- dirigiendo esta tesis pero fue co-directora a lo largo de estos años. • A Esteban por haberme permitido trabajar en su grupo tan valioso y respetado, porque para él el conocimiento tiene valor, y eso, redundantemente, vale, hoy más que nunca. • A Sergio Lew y todo su grupo de Alselec S.A. y BioAxioma (Gustavo, Darío e Iñaki). Fueron mi mano derecha en el análisis bioinformático de las secuencias y tuvieron mucha paciencia en mis largas horas que compartí la oficina con ustedes. Me sentí siempre como en casa. Gracias de corazón. • A Julio Di Rienzo por haberme ayudado con todo su expertise estadístico, siempre con tantas ganas, logrando que las horas frente a los datos vuelen. Por su pragmatismo académico. • A Diego Lijavetzky, por haberme recibido junto con Norma y Esteban, y guiarme en los primeros pasos. • A Luis porque es un AMIGO, un trabajador, una excelente persona y colaborador. Me socorriste muchas veces en todo sin necesidad casi de pedírtelo. Gracias por las “real time”de último momento. • A Caro, por tus palabras, tu contención, tu ayuda, tus tortas, tus corridas conmigo a la clínica aquel mediodía, y tu compañía. Sos un ejército de salvación. • A Paola y Dani, los remolinos del laboratorio. Por tantos diálogos “existenciales” y “mundanos”, por poder hablar de marcadores moleculares y de desigualdad social a la vez, por ayudarme a no diluir el objetivo central de todo esto. Por compartir buenos libros, buena música y las noticias por la tarde. Por ayudarme a no perder el árbol en el bosque. • A Vero Nishi. No se puede nombrar en un parrafito todo, porque es lo que vos das. Ayudás, escuchás, prestás, decís por favor y gracias todo el tiempo. Sonreís todo el tiempo. Sos un sol. • A Ana Julia y Andrea Puebla, por ser las profes del lab. Por la experiencia y meticulosidad en el trabajo que saben compartir, por enseñarme cosas, por compartir tantas otras. Por su sensibilidad. • A Maxi, que estás muy muy lejos y me ayudaste un montón en tu paso por el lab. Te quiero mucho y te agradezco todo lo que me ayudaste, compartiste y lo que seguís compartiendo en la distancia. • A Betiana por tantas ayudas luego de mi horario de corrida al jardín. • A Ariel y Flor DV por sacar geles, sacar PCRs, sacar fotos y poner buena cara, por servicio de “remis incluido”. Los aprecio un montón. • A Marisa LB , por sus diálogos francos y sinceros, por ser la madre sustituta del jardín, por el apoyo moral y técnico. • A Flor Longo, por ofrecerme su compu y tantas otras tantas cosas. • A Mariana, Ceci VR, Sebas y Fer por todo lo que supieron enseñarme. • A Julián y Carla por su excelente predisposición siempre. ¡Y por sus mates! • A Valeria Peralta por su ayuda en el invernáculo. • A Agustín y Juan por el cuidado con mis plantitas y las ganas en ayudar. • A todos los integrantes del grupo plantas que ayudan en el trabajo en equipo creando un buen clima de laburo. • A Isabel, Fabián, Vilma, Majo y Roxana, por estar siempre ayudando en todo y con tantas ganas. • A Silvio C. por transmitir conocimiento, compartirlo y ayudar en cosas del día a día. A Oscar por sus ganas de colaborar en todo. • A Rubén y Marisa Farber, espíritus imprescindibles de ánimo, ayuda y paciencia. Es buenísimo trabajar con gente así. • A Guido y Federico, por su ayuda en la PCR cuantitativa. • A Paz por su buena onda y siempre con sus ganas de dar una mano. • A Flor Lucca, por lo que pudimos compartir y la ayuda que me brindaste todo ese tiempo. • A toda la gente del Instituto de Biotecnología que sonríe al pasar, escucha al hablar y piensa con ganas y entusiasmo siempre. • A mis amigos Mariela, Liliana, Natalia, Vanesa, Jorge y tantos más. Por ser una extensión de mi pensamiento y entusiasmo. Gracias por bancarme todo este tiempo y no escucharme hablar de otra cosa. • A mis papás y a mis suegros, por estar ahí siempre, por la ayuda con Salvador. Sin ustedes esto hubiera sido demasiado empinado para los dos. • A mi tía Marta, mi segunda mamá, que a la distancia sabe todo, pregunta todo y quiere saber de mí. Su curiosidad es un mimo muy grande. Te adoro. • A mis hermanos Silvia y Roberto por tantos diálogos y momentos compartidos en familia. Y por quererme como soy. • A mi cuñada Silvina, siempre preocupándote por mí, por como me va, por lo que necesito y por lo que vos tenés y me podés brindar. Por querer saber de todo esto, al menos para hablar un rato juntas. Te quiero mucho. • A Ale, por el apoyo, el amor, la tolerancia, el respeto y todo lo que tenés para darme desde que te conozco. Por el know-how “informático” unpublished. Gracias por ayudarme a construir, siempre a mi lado. • A Salvador, que aprendió a usar la compu a fuerza de verme horas sentada allí, por entender que es para trabajar y por la constancia en su espera. Por su paciencia que me sirvió de motor estos últimos 3 años. Por enseñarme que no todo sale bien, ni cuando uno quiere. Por ser la señal más tangible de que uno aprende todo el tiempo. Y por haber decidido venir con nosotros, a formar parte de nuestro mundo, a desestructurarlo. Te amo. “Hay hombres que de su cencia tienen la cabeza llena; hay sabios de todas menas, mas digo, sin ser muy ducho: es mejor que aprender mucho el aprender cosas buenas” Consejos de un padre a su hijo De “El gaucho Martín Fierro” José Hernández, 1872 INDICE RESUMEN................................................................................................................6 SUMMARY ............................................................................................................11 I. INTRODUCCIÓN..............................................................................................15 I.1.Descripción del taxón ....................................................................................................................... 15 I.2. El girasol........................................................................................................................................... 15 I.3. El girasol en el mundo..................................................................................................................... 16 I.3.1. El girasol en Argentina .............................................................................................................. 18 I.4. El estrés abiótico y las plantas.......................................................................................................
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