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N° d’ordre : 47/2017-D/S.B République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique UNIVERSITE DES SCIENCES ET DE LA TECHNOLOGIE HOUARI BOUMEDIENE USTHB FACULTE DES SCIENCES BIOLOGIQUES THESE Présentée en vue de l’obtention du grade de Docteur en Sciences En Sciences Biologiques Spécialité: Microbiologie de l’Environnement Par Mme Yamina HADJ RABIA Epse BOUKHALFA Sujet Isolement et caractérisation de souches d’Actinobactéries mésohalophiles productrices de métabolites anti -cellulaires . Soutenue publiquement, le 14/12/2017 , devant le jury composé de : Mme LARABA DJEBARI Fatima Professeur à l’USTHB Présidente Mr HACENE Hocine Professeur à l’USTHB Directeur de thèse Mr ABDERRAHMANI Ahmed Professeur à l’USTHB Examinateur Mr CHELGHOUM Chabane Professeur à l’USTHB Examinateur Mr KECHA Mouloud Professeur à l’U.A.MBéjaia Examinateur Mr BENCHABANE Messaoud Professeur à l’U.S.D.Blida Examinateur Remerciements . Ce travail de thèse a vu le jour grâce à la contribution de plusieurs personnes de près ou de loin à qui je souhaiterais exprimer avec beaucoup d’enthousiasme mes plus vifs remerciements. Je tiens tout d’abord à exprimer ma reconnaissance et ma profonde gratitude à mon Directeur de Thèse le professeur HACENE Hocine, pour la confiance qu’il m’a accordée en me proposant ce sujet de thèse passionnant. Je tiens à le remercier pour son écoute, sa grande disponibilité et ses précieux conseils. Son vaste savoir, sa sagesse, sa rigueur et surtout sa bienveillance ont été pour moi une source d’inspiration pour la finalisation de cette thèse. Qu’il trouve dans ce travail l’expression de mon profond respect. Je tiens à remercier le professeur Robert DURAN, responsable de l’équipe Environnement et Microbiologie de l’université de Pau et des Pays de l’Adour pour sa générosité et pour m’avoir accueilli au sein de son laboratoire ainsi que le professeur Béatrice LAUGA, pour son aide et ses précieux conseils. J’ai été initiée à la biologie moléculaire grâce aux membres de cette équipe et plus particulièrement grâce à Solange KARAMA Ingénieur de laboratoire qui m’a orientée et guidée pas à pas et a été ma complice tout au long de mes stages. Je vous en suis très reconnaissante pour tout ce que vous m’avez apporté scientifiquement et humainement. Je remercie vivement le professeur Hans-Peter KLENK, Doyen du School of Biology de l’université de Newcastle au Royaume Uni, un systématicien de renommée internationale pour sa grande générosité, sa modestie et sa précieuse collaboration. Qu’il trouve ici l’expression de ma grande gratitude pour m’avoir accueilli au sein de son laboratoire et de m’avoir permis d’élargir mes connaissances dans le domaine de la « Systématique Bactérienne » auprès des membres de son équipe particulièrement Dr Maria Del Carmen Montero-Calasanz et Imen Nouioui. J’adresse également mes remerciements les plus sincères au Dr Véronique EPARVIER, Directeur de Recherche à l’ICSN-CNRS de Gif sur Yvette pour son inestimable aide à la concrétisation de ce travail, sa grande disponibilité, sa gentillesse ainsi que pour ses grandes qualités scientifiques et humaines. Mon accueil au sein de son laboratoire a permis de m’initier à la chimie des substances naturelles ainsi qu’à l’utilisation d’une technologie de pointe en chimie analytique. Je lui suis très reconnaissante et sa contribution a été déterminante pour la finalisation de ce travail de thèse. Merci beaucoup Véronique tout ce que je pourrais t’écrire ne suffira pas pour exprimer ce que je ressens intérieurement. J’adresse particulièrement mes remerciements à Mme le professeur Fatima LARABA- DJEBARI, Doyenne de la Faculté des Sciences Biologiques, de me faire l’honneur de présider le jury de ma soutenance de thèse après celui du mémoire de magister et pour l’intérêt qu’elle porte à ce travail en dépit de ses nombreuses occupations. Qu’elle reçoive l’expression de ma profonde gratitude. Je suis particulièrement touchée et honorée par la présence du Professeur Ahmed ABDERRAHMANI en qualité d’examinateur au sein de ce jury de soutenance. Vous êtes un modèle pour moi et auprès de qui j’ai appris énormément de choses dans l’enseignement et la pédagogie ainsi que dans la recherche scientifique. Je vous en suis profondément reconnaissante pour tout. Je remercie également les professeurs Chabane CHELGHOUM, Mouloud KECHA ainsi que Messaoud BENCHABANE d’avoir bien accepté d’évaluer ce travail de thèse. Je vous en suis reconnaissante. Un grand merci s’adresse également au : Professeur Farida NATECHE qui a été à mes côtés depuis mon intégration au sein du laboratoire. Merci de m’avoir toujours soutenue surtout pendant les moments difficiles que j’ai pu avoir, merci de m’avoir toujours protégée et tout le temps défendue et d’avoir été comme une deuxième maman pour moi, je n’oublierai jamais ce que tu as pu faire pour moi. Docteur Amel Nabila BOUANANE-DARENFED pour sa grande disponibilité, son soutien ainsi que ses encouragements incessants qui ont été pour moi une source de force et de courage pour mener à bien ce travail de thèse. Merci Amel pour tout ce que tu as pu me procurer et merci d’être ma complice dans notre chaleureux petit box. Au docteur Inès QUADRI-TOUNSI, merci pour ton soutien, pour ta précieuse aide, tu as su m’accompagner et m’épauler ces derniers mois sans retenue. Sache que je n’oublierai jamais ce que tu as fait pour moi. Au docteur Ikram HASSANI-BELKACEM, merci pour ta disponibilité et merci pour avoir toujours répondu positivement à mes sollicitations. Ton sourire et tes encouragements ont été pour moi une force qui m’aidait à aller de l’avant. Merci au Docteur Rima MEKNACI-MENAD pour avoir été ma grande complice pendant plusieurs années et de m’avoir accompagné sur la paillasse en rendant les difficultés du travail moins pénibles à supporter. Ces grands moments de complicité se font rares de nos jours Rima…… Je remercie également Dr Okba SELAMA, pour son inestimable aide et accompagnement surtout pour les analyses bioinformatiques. Tu as été à mon secours à chaque fois que j’en avais besoin, sache que je te suis profondément reconnaissante. Un grand merci pour mon amie et collègue le Dr Kenza ANTRI, pour tous ses encouragements et sa disponibilité. Une pensée particulière au Professeur Yahia KACI pour son écoute attentive ainsi que pour tous ses encouragements. Mes chaleureux remerciements s’adressent aussi aux autres membres du laboratoire de microbiologie de la FSB, Dr Yamina BENMALEK, Lila MADOUR, Dr Amina Abbas, Dr Meriem Amziane, Dr Lydia Djouadi, Dr khelifa Bouacem et Lynda Bentayeb sans oublier bien sûr tous mes anciens étudiants actuellement doctorants au sein du laboratoire : Fairouz, IKram, Sara, Hanane et Faouzi. Merci pour votre bonne humeur et pour tous vos encouragements. Une mention spéciale pour Assia Ameur, notre ingénieur de laboratoire de Microbiologie de la FSB, pour toute la convivialité et les très jolis moments de partage qu’elle nous procure depuis son arrivée au laboratoire. Je voudrais également remercier mes ami(e)s et collègues, Aicha, Nesrine, Nadia, Lineda et Khadidja. Je ne pourrai pas finir sans adresser mes remerciements à tout le personnel de la Faculté des Sciences Biologiques Responsables, Enseignants et Administrateurs ainsi qu’à tous mes enseignants qui ont participé à ma formation académique. Que toute personne que j’ai omis de remercier me pardonne ce n’est qu’un oubli…….. Merci à tous Dédicaces Je dédie ce modeste travail : À la mémoire de mes grands-parents maternels et paternels. À mes très chers parents sans qui je ne serai jamais arrivée au stade auquel j’y suis aujourd’hui. Je ne les remercierai jamais assez pour leur soutien, leurs encouragements, leurs sacrifices et surtout pour l’amour qu’ils m’apportent tous les jours. Maman et Papa tout ce que je pourrais vous écrire ne pourra pas exprimer toute la reconnaissance et l’estime que j’ai envers vous. Vous êtes les meilleurs parents qu’un enfant rêverait d’avoir. Que dieu vous garde le plus longtemps possible à mes côtés et vous procure bonne santé Inchaa Allah. Ce travail est également dédié à : Ma très chère sœur Souad. Merci de partager mes joies et mes peines petite sœurette, de toujours m’encourager et me soutenir. Que dieu te protège ainsi que ta petite famille avec une pensée particulière pour mon adorable petit neveu Amine Mes chers frères : Mohammed Riad. Je te serai toujours reconnaissante d’avoir tout le temps cru en moi et de me rassurer pendant les moments de doute que j’ai pu avoir pendant la réalisation de cette thèse ainsi que pour ton inestimable aide et disponibilité quand j’en avais besoin. Je te souhaite toute la réussite et le bonheur que tu mérites aux côtés de ton épouse Linda et de mes adorables petite nièces Manel et Fadia. Et Lotfi à qui je souhaite une vie pleine de réussite et de persévérance. Je te remercie pour tout ce que tu as fait pour moi, pour ta disponibilité à mes côtés et d’avoir toujours répondu présent à mes sollicitations. A mon époux, Fayçal, merci pour ton soutien, ton aide et tes encouragements mais surtout pour ton amour qui me donne la force et le courage de mener à bien tout ce que j’entreprends dans la vie. Merci de me faire sentir au quotidien que je suis une personne capable et je te remercie également pour ta patience et ton intelligence car le déroulement de cette thèse n’a pas été un long fleuve tranquille….. A mon petit chéri, Mohamed Ilyes âgé aujourd’hui de 4 ans, la prunelle de mes yeux.